Name: quantitative comparison of cis-regulatory element (cre) activities in transgenic drosophila melanogaster
Uploaded: 2011-12-19T12:00:00
Description: Watch this Scientific Journal Video about Quantitative Comparison of cis-Regulatory Element CRE Activities in Transgenic Drosophila melanogaster at JoVE.com

我々は感謝：ニコラスGompelとこのプロトコルの発展への貢献に対してベンジャミンPrud&#39;homme、メリッサウィリアムズと原稿についてのコメントの4つの匿名の査読、WARへの研究フェローシップのためのデイトン大学院大学、およびデイトン生物学の大学をTMWのための研究支援のための部門と研究所（UDRI）。この作品は、米国心臓協会グラントTMWに11BGIA7280000によってサポートされていました。

概要： このビデオでは、定量的にショウジョウバエ（D.）ショウジョウバエにおけるシス調節エレメント（CRE）のシーケンスのために遺伝子調節の活動を測定することができるプロトコルを示しています。野生型と変異型CREフォーム、天然に存在するCREの種に見られる対立遺伝子、または分岐した種間でオーソログCRES：このプロトコルは、が保有する規制活動を比?...

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シス調節エレメントは、遺伝子発現パターンと、それによって開発1のプロセスを指定するゲノムプログラムをエンコード、および形態学的進化2-4および人間の特徴を5,6,19のための表現型変異の基礎となる両方の突然変異のための目立つ場所です。この重要性にもかかわらず、CRESの規制ロジックがよく分かっていないままです。このような理解の赤字のための?...

quantitative comparison of cis-regulatory element (cre) activities in transgenic drosophila melanogaster

遺伝子発現パターンは、エンハンサーまたはシス調節モジュールと呼ばれるシス調節エレメント（CRE）のシーケンスで指定されています。典型的なCREは、どこで、どのレベルで安定化された遺伝子（s）が発現されるとき、指定の規制論理を与えるいくつかの転写因子のタンパク質の結合部位の配列を有している。動物のゲノム内でCRESのフルセットは、開発1生物のプログラムを符号化し、経験だけでなく、理論的な研究は、CRESの変異が形態学的進化2-4に顕著な役割を果たしたことを示している。また、人間のゲノムワイド関連研究では、CRESでその遺伝的変異が表現型変異5,6に大きく貢献して示している。従って、規制の論理を理解し、どのように変異がそのようなロジックに影響を与えることは遺伝学の中心的な目標です。 レポーター遺伝子は生体機能の研究に強力な方法を提供するCRESのる。ここに、既知または疑われるCREのシーケンスは、異種プロモーターと容易に観察可能なタンパク質産物をコードするレポーター遺伝子のコード配列に結合されている。レポーター遺伝子は、宿主生物に挿入されると、CREの活動は、エンコードされたレポータータンパク質の形で見えるようになります。導入遺伝子のゲノム配置はランダムですがショウジョウバエ種ショウジョウバエ（D.）ショウジョウバエ 7のP要素媒介形質転換は、このモデル生物にレポータートランスジーンを導入するために何十年も使用されています。従って、レポーター遺伝子の活性を強くされて定性的にCREの比較を制限し、地元のクロマチンと遺伝子の環境によって左右される。近年では、phiC31ベースの統合システムは、特定のゲノムの着陸地点8-10に導入遺伝子を挿入するキイロショウジョウバエでの使用に適応されました。この機能により、定量的な遺伝子の測定と、関連するここで、CREの活動11月13日 FEを行っているasible。トランスジェニックショウジョウバエの生産は、高価な機器を購入および/または専門的な導入遺伝子の注入プロトコルでの能力を持っている必要がなくなり、phiC31ベースの統合を含め、外部委託することができます。 ここで、我々は定量的にCREの活動を評価する一般的なプロトコルを提示し、このアプローチは、CREの活性に対する変異の導入の効果を測定するとオルソロガスCRESの活動を比較するために使用することができる方法を示します。与えられた例はショウジョウバエの変態中にCREアクティブのためですが、アプローチは他の発達段階、ミバエの種、またはモデル生物に適用することができます。最終的には、CRESを研究するためにこのアプローチのより広範な使用は規制の論理の理解を進める必要があり、どのようにロジック変化し、進化させることができます。

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Quantitative Comparison of cis-Regulatory Element CRE Activities in Transgenic Drosophila melanogaster

形質の表現型変異は、シス調節エレメント（CRE）のシーケンスを制御する遺伝子の発現パターンの変異に起因することができます。キイロショウジョウバエで使用するために派生メソッドは、定量的に変更されたり、天然に存在するCREの亜種によって媒介遺伝子発現の空間的および時間的パターンのレベルを比較することができます。

の定量的比較シス</emトランスジェニックで> -調節エレメント（CRE）の活動キイロショウジョウバエ</em

Gene expression patterns are specified by cis-regulatory element (CRE) sequences, which are also called enhancers or cis-regulatory modules. A typical CRE ...

Research

JoVE Journal

Biology

Quantitative Comparison of cis-Regulatory Element (CRE) Activities in Transgenic Drosophila melanogaster

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