Name: growth assays to assess polyglutamine toxicity in yeast
Uploaded: 2012-03-05T12:00:00
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Duennwald प्रयोगशाला में काम एजिंग रिसर्च (दूर), वंशानुगत रोग फाउंडेशन (HDF) और विलियम वुड फाउंडेशन के लिए अमेरिकी संघ से अनुदान द्वारा समर्थित है.

1. खमीर के में विषाक्त PolyQ के विस्तार प्रोटीन की अभिव्यक्ति एक व्यवस्थित विश्लेषण सटीक polyQ विस्तार है कि के खमीर 7 में विषाक्तता का उत्पादन करने के लिए आवश्यक है एक प्रोटीन के अमीनो एसिड अनुक...

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	<li>Soto, C., Estrada, L. D. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/query.fcgi?db=PubMed&cmd=Search&doptcmdl=Citation&defaultField=Title+Word&term=Protein+misfolding+and+neurodegeneration.">Protein misfolding and neurodegeneration.</a> Arch. Neurol. 65, 184-189 (2008).</li><li>Ross, C. A., Tabrizi, S. J. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/query.fcgi?db=PubMed&cmd=Search&doptcmdl=Citation&defaultField=Title+Word&term=Huntington's+disease:+from+molecular+pathogenesis+to+clinical+treatment.">Huntington's disease: from molecular pathogenesis to clinical treatment.</a> Lancet Neurol. 10, 83-98 (2011).</li><li>Zoghbi, H. Y., Orr, H. T. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/query.fcgi?db=PubMed&cmd=Search&doptcmdl=Citation&defaultField=Title+Word&term=Glutamine+repeats+and+neurodegeneration.">Glutamine repeats and neurodegeneration.</a> Annu. Rev. Neurosci. 23, 217-247 (2000).</li><li>Meriin, A. B. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/query.fcgi?db=PubMed&cmd=Search&doptcmdl=Citation&defaultField=Title+Word&term=Endocytosis+machinery+is+involved+in+aggregation+of+proteins+with+expanded+polyglutamine+domains.">Endocytosis machinery is involved in aggregation of proteins with expanded polyglutamine domains.</a> FASEB J. 21, 1915-1925 (2007).</li><li>Giorgini, F., Guidetti, P., Nguyen, Q., Bennett, C. S., Muchowski, P. J. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/query.fcgi?db=PubMed&cmd=Search&doptcmdl=Citation&defaultField=Title+Word&term=A+genomic+screen+in+yeast+implicates+kynurenine+3-monooxygenase+as+a+therapeutic+target+for+Huntington+disease.">A genomic screen in yeast implicates kynurenine 3-monooxygenase as a therapeutic target for Huntington disease.</a> Nat. Genet. 37, 526-5231 (2005).</li><li>Duennwald, M. L., Lindquist, S. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/query.fcgi?db=PubMed&cmd=Search&doptcmdl=Citation&defaultField=Title+Word&term=Impaired+ERAD+and+ER+stress+are+early+and+specific+events+in+polyglutamine+toxicity.">Impaired ERAD and ER stress are early and specific events in polyglutamine toxicity.</a> Genes Dev. 22, 3308-3319 (2008).</li><li>Duennwald, M. L., Jagadish, S., Muchowski, P. J., Lindquist, S. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/query.fcgi?db=PubMed&cmd=Search&doptcmdl=Citation&defaultField=Title+Word&term=Flanking+sequences+profoundly+alter+polyglutamine+toxicity+in+yeast.">Flanking sequences profoundly alter polyglutamine toxicity in yeast.</a> Proc. Natl. Acad. Sci. U.S.A. 103, 11045-1150 (2006).</li><li>Duennwald, M. L., Jagadish, S., Giorgini, F., Muchowski, P. J., Lindquist, S. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/query.fcgi?db=PubMed&cmd=Search&doptcmdl=Citation&defaultField=Title+Word&term=A+network+of+protein+interactions+determines+polyglutamine+toxicity.">A network of protein interactions determines polyglutamine toxicity.</a> Proc. Natl. Acad. Sci. U.S.A. 103, 11051-116 (2006).</li><li>Meriin, A. B. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/query.fcgi?db=PubMed&cmd=Search&doptcmdl=Citation&defaultField=Title+Word&term=Huntington+toxicity+in+yeast+model+depends+on+polyglutamine+aggregation+mediated+by+a+prion-like+protein+Rnq1.">Huntington toxicity in yeast model depends on polyglutamine aggregation mediated by a prion-like protein Rnq1.</a> J. Cell. Biol. 157, 997-1004 (2002).</li><li>Murakami, C., Kaeberlein, M. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/query.fcgi?db=PubMed&cmd=Search&doptcmdl=Citation&defaultField=Title+Word&term=Quantifying+Yeast+Chronological+Life+Span+by+Outgrowth+of+Aged+Cells.">Quantifying Yeast Chronological Life Span by Outgrowth of Aged Cells.</a> J. Vis. Exp. (27), e1156-e1156 (2009).</li><li>Gitler, A. D. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/query.fcgi?db=PubMed&cmd=Search&doptcmdl=Citation&defaultField=Title+Word&term=Beer+and+bread+to+brains+and+beyond:+can+yeast+cells+teach+us+about+neurodegenerative+disease.">Beer and bread to brains and beyond: can yeast cells teach us about neurodegenerative disease.</a> Neurosignals. 16, 52-62 (2008).</li><li>Giorgini, F., Muchowski, P. J. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/query.fcgi?db=PubMed&cmd=Search&doptcmdl=Citation&defaultField=Title+Word&term=Screening+for+genetic+modifiers+of+amyloid+toxicity+in+yeast.">Screening for genetic modifiers of amyloid toxicity in yeast.</a> Methods Enzymol. 412, 201-222 (2006).</li><li>Ehrnhoefer, D. E. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/query.fcgi?db=PubMed&cmd=Search&doptcmdl=Citation&defaultField=Title+Word&term=Green+tea+(-)-epigallocatechin-gallate+modulates+early+events+in+huntingtin+misfolding+and+reduces+toxicity+in+Huntington's+disease+models.">Green tea (-)-epigallocatechin-gallate modulates early events in huntingtin misfolding and reduces toxicity in Huntington's disease models.</a> Hum. Mol. Genet. 15, 2743-2751 (2006).</li><li>Cashikar, A. G., Duennwald, M., Lindquist, S. L. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/query.fcgi?db=PubMed&cmd=Search&doptcmdl=Citation&defaultField=Title+Word&term=A+chaperone+pathway+in+protein+disaggregation.+Hsp26+alters+the+nature+of+protein+aggregates+to+facilitate+reactivation+by+Hsp104.">A chaperone pathway in protein disaggregation. Hsp26 alters the nature of protein aggregates to facilitate reactivation by Hsp104.</a> J. Biol. Chem. 280, 23869-2375 (2005).</li></ol>

इस पांडुलिपि तीन पूरक प्रयोगात्मक मॉडल जीव खमीर खमीर कोशिकाओं को विषाक्त polyQ विस्तार प्रोटीन व्यक्त की कम वृद्धि पर आधारित में polyQ विषाक्तता को मापने के दृष्टिकोण की रूपरेखा. खमीर में काम प्रोटीन misfolding क?...

<table border="1"><tbody><tr><td> साधन के नाम </td><td> कंपनी </td><td> सूचीपत्र संख्या </td></tr><tr><td> Frogger (6x8 पिंस) </td><td> वी पी एंड वैज्ञानिक, सैन डिएगो </td><td> 407 एएच उपाध्यक्ष </td></tr><tr><td> BioscreenC </td><td> Growthcurves संयुक्त राज्य अमेरिका </td><td> 5101370 </td></tr><tr><td> 100 अच्छी तरह मधुकोश प्लेटें </td><td> Growthcurves संयुक्त राज्य अमेरिका </td><td> 9602550 </td></tr></tbody></table>

growth assays to assess polyglutamine toxicity in yeast

प्रोटीन misfolding कई मानव रोगों, अल्जाइमर रोग, पार्किंसंस रोग, और हंटिंगटन 1 बीमारी के रूप में विशेष रूप से neurodegenerative रोगों, के साथ जुड़ा हुआ है. है Huntington रोग (HD) प्रोटीन huntingtin भीतर एक पॉलीग्लुटामाइन क्षेत्र के (polyQ) के असामान्य विस्तार के कारण होता है. polyQ-विस्तारित huntingtin प्रोटीन एक न्यायपालिका रचना (यानी यह misfolds) के उपलब्ध हो जाता है और सेलुलर विषाक्तता 2 का कारण बनता है. कम से कम आठ आगे neurodegenerative रोगों Spinocerebellar ataxias और कैनेडी 3 रोग सहित polyQ विस्तार, की वजह से कर रहे हैं. मॉडल जीव खमीर polyQ विषाक्तता के सेलुलर और आणविक आधार में महत्वपूर्ण अंतर्दृष्टि में मदद की है polyQ-विषाक्तता का अंतर और अंतर - आणविक कारकों के प्रभाव है, और सेलुलर मार्ग है कि कोशिकाओं में प्रभावित कर रहे हैं की पहचान polyQ विस्तार व्यक्त सहित, 3-8 प्रोटीन. महत्वपूर्णly, polyQ विषाक्तता के कई पहलुओं है कि खमीर में पाया गया है अन्य प्रायोगिक प्रणाली में और HD रोगियों से नमूनों में कुछ हद तक reproduced रहे थे, इस प्रकार polyQ विषाक्तता अंडरपाईनिंग बुनियादी तंत्र की खोज के लिए खमीर मॉडल के महत्व का प्रदर्शन. एक प्रत्यक्ष और अपेक्षाकृत सरल खमीर में polyQ विषाक्तता का निर्धारण करने के लिए व्यक्त polyQ विस्तार प्रोटीन खमीर कोशिकाओं की वृद्धि दोष उपाय है. इस पांडुलिपि तीन पूरक प्रयोगात्मक खमीर में polyQ विस्तार प्रोटीन व्यक्त खमीर कोशिकाओं के विकास को मापने के द्वारा polyQ विषाक्तता का निर्धारण दृष्टिकोण का वर्णन करता है. पहले दो प्रयोगात्मक दृष्टिकोण प्लेटों पर खमीर विकास की निगरानी, ​​तीसरे दृष्टिकोण तरल खमीर BioscreenC साधन का उपयोग संस्कृतियों के विकास पर नज़र रखता है. इसके अलावा, इस पांडुलिपि प्रायोगिक कठिनाइयों का वर्णन है कि जब खमीर polyQ मॉडल से निपटने हो सकता है और रणनीति है कि या बचने में मदद मिलेगी रूपरेखाइन कठिनाइयों को कम से कम. यहाँ वर्णित प्रोटोकॉल की पहचान करने और आनुवंशिक रास्ते और छोटे अणुओं है कि polyQ विषाक्तता मिलाना विशेषताएँ इस्तेमाल किया जा सकता है. इसके अलावा, वर्णित assays के खमीर मॉडल में अन्य रोग संबद्ध misfolded प्रोटीन की वजह से विषाक्तता की सटीक विश्लेषण के लिए टेम्पलेट के रूप में सेवा कर सकता है.

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Growth Assays to Assess Polyglutamine Toxicity in Yeast

इस पांडुलिपि खमीर में पॉलीग्लुटामाइन की विषाक्तता (polyQ) विस्तार प्रोटीन का आकलन करने के लिए तीन पूरक प्रोटोकॉल का वर्णन<em&gt; Saccharomyces cerevisiae</em&gt;. इन प्रोटोकॉल को आसानी से खमीर में अन्य misfolded प्रोटीन की विषाक्तता पर नजर रखने के लिए संशोधित किया जा सकता है.

खमीर में वृद्धि Assays पॉलीग्लुटामाइन विषाक्तता आकलन करने के लिए

Protein misfolding is associated with many human diseases, particularly neurodegenerative diseases, such as Alzheimer&#x2019;s disease, Parkinson's ...

Research

JoVE Journal

Biology

Identification of Growth Inhibition Phenotypes Induced by Expression of Bacterial Type III Effectors in Yeast

खमीर में बैक्टीरियल प्रकार III effectors की अभिव्यक्ति से प्रेरित विकास निषेध phenotypes की पहचान

Many Gram-negative pathogenic bacteria use a type III secretion system to translocate a suite of effector proteins into the cytosol of host cells. Within ...

Modified Yeast-Two-Hybrid System to Identify Proteins Interacting with the Growth Factor Progranulin

संशोधित खमीर दो हाइब्रिड ग्रोथ फैक्टर progranulin के साथ बातचीत प्रोटीन की पहचान प्रणाली

Progranulin (PGRN), also known as granulin epithelin precursor (GEP), is a 593-amino-acid autocrine growth factor. PGRN is known to play a critical role ...

Long-term Lethal Toxicity Test with the Crustacean Artemia franciscana

Long-term Lethal Toxicity Test with the Crustacean Artemia franciscana

Crustacean साथ लंबी अवधि के घातक विषाक्तता टेस्ट Artemia franciscana</em

Our research activities target the use of biological methods for the evaluation of environmental quality, with particular reference to saltwater/brackish ...

Methods to Assess Subcellular Compartments of Muscle in C. elegans

Methods to Assess Subcellular Compartments of Muscle in C. elegans

तरीके में पेशी के subcellular डिब्बों का आकलन करने के लिए<em&gt; सी. एलिगेंस</em

Muscle is a dynamic tissue that responds to changes in nutrition, exercise, and disease state. The loss of muscle mass and function with disease and age ...

Comparative Analysis of Human Growth Hormone in Serum Using SPRi, Nano-SPRi and ELISA Assays

SPRI, नैनो SPRI और एलिसा assays का उपयोग सीरम में मानव विकास हार्मोन का तुलनात्मक विश्लेषण

Sensitive and selective methods for the detection of human growth hormone (hGH) over a wide range of concentrations (high levels of 50-100 ng ml&#8722;1 ...

Gap Junctional Intercellular Communication: A Functional Biomarker to Assess Adverse Effects of Toxicants and Toxins, and Health Benefits of Natural Products

गैप junctional कहनेवाला संचार: एक कार्यात्मक Biomarker विषैले पदार्थ और विषाक्त पदार्थों के प्रतिकूल प्रभाव का आकलन करने के लिए, और स्वास्थ्य प्राकृतिक उत्पादों के लाभ

This protocol describes a scalpel loading-fluorescent dye transfer (SL-DT) technique that measures intercellular communication through gap junction ...

ODELAY: A Large-scale Method for Multi-parameter Quantification of Yeast Growth

ओडेलेय: खमीर विकास के बहु-पैरामीटर मात्राकरण के लिए एक बड़े पैमाने पर विधि

Growth phenotypes of microorganisms are a strong indicator of their underlying genetic fitness and can be segregated into 3 growth regimes: lag-phase, ...

Effect of Fluorescent Proteins on Fusion Partners Using Polyglutamine Toxicity Assays in Yeast

फ्यूजन भागीदारों पर फ्लोरोसेंट प्रोटीन का प्रभाव खमीर में Polyglutamine विषाक्तता परख का उपयोग

For the investigation of protein localization and trafficking using live cell imaging, researchers often rely on fusing their protein of interest to a ...

Medium-throughput Screening Assays for Assessment of Effects on Ca2+-Signaling and Acrosome Reaction in Human Sperm

Medium-throughput Screening Assays for Assessment of Effects on Ca2+-Signaling and Acrosome Reaction in Human Sperm

Ca पर प्रभाव के आकलन के लिए मध्यम throughput स्क्रीनिंग assays2 +-सिग्नलिंग और मानव शुक्राणु में acrosome प्रतिक्रिया

Ca2+-signaling is essential to normal sperm cell function and male fertility. Similarly, the acrosome reaction is vital for the ability of a human sperm ...

Examination of Mitotic and Meiotic Fission Yeast Nuclear Dynamics by Fluorescence Live-cell Microscopy

फ्लोरेसेंस लाइव-सेल माइक्रोस्कोपी द्वारा मिट्रोटिक और मीओटिक फिसेशन खमीर न्यूक्लियर डायनामिक्स की परीक्षा

Live-cell imaging is a microscopy technique used to examine cell and protein dynamics in living cells. This imaging method is not toxic, generally does ...