Name: skeletal muscle gender dimorphism from proteomics
Uploaded: 2011-12-14T12:00:00
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हम चित्रा 3 का उपयोग करने के लिए Yutian गण मन धन्यवाद. यह काम राष्ट्रीय विज्ञान फाउंडेशन 0420971 द्वारा समर्थित किया गया था, स्मिथ कॉलेज Blakeslee, Wilens और होम्स धन, और हॉवर्ड ह्यूजेस मेडिकल इंस्टीट्यूट.

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	<li>Fehrenbach, E., Mooren, F. C., V&#246;lker, K. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/query.fcgi?db=PubMed&cmd=Search&doptcmdl=Citation&defaultField=Title+Word&term=.">.</a> Molecular and Cellular Exercise Physiology. , 199-217 (2005).</li><li>Mooren, F. C., Mooren, F. C., V&#246;lker, K. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/query.fcgi?db=PubMed&cmd=Search&doptcmdl=Citation&defaultField=Title+Word&term=The+Cell.">The Cell.</a> Molecular and Cellular Exercise Physiology. , 3-18 (2005).</li><li>Thompson, H. S., Clarkson, P. M., Scordilis, S. P. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/query.fcgi?db=PubMed&cmd=Search&doptcmdl=Citation&defaultField=Title+Word&term=The+repeated+bout+effect+and+heat+shock+proteins:+intra-muscular+HSP27+and+HSP70+expression+following+two+bouts+of+eccentric+exercise+in+humans.">The repeated bout effect and heat shock proteins: intra-muscular HSP27 and HSP70 expression following two bouts of eccentric exercise in humans.</a> Acta. Physiol. Scand. 174, 47-56 (2002).</li><li>McHugh, M. P. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/query.fcgi?db=PubMed&cmd=Search&doptcmdl=Citation&defaultField=Title+Word&term=Recent+advances+in+the+understanding+of+the+repeated+bout+effect:+the+protective+effect+against+muscle+damage+from+a+single+bout+of+eccentric+exercise.">Recent advances in the understanding of the repeated bout effect: the protective effect against muscle damage from a single bout of eccentric exercise.</a> Scand. J. Med. Sci. Sports. 13, 88-97 (2003).</li><li>Metskas, L. A., Kulp, M., Scordilis, S. P. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/query.fcgi?db=PubMed&cmd=Search&doptcmdl=Citation&defaultField=Title+Word&term=Gender+Dimorphism+in+the+Exercise-Naïve+Murine+Skeletal+Muscle+Proteome.">Gender Dimorphism in the Exercise-Naïve Murine Skeletal Muscle Proteome.</a> Cell Molec. Biol. Lett. 15, 507-516 (2010).</li><li>Lopez, J. L. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/query.fcgi?db=PubMed&cmd=Search&doptcmdl=Citation&defaultField=Title+Word&term=Two-dimensional+electrophoresis+in+proteome+expression+analysis.">Two-dimensional electrophoresis in proteome expression analysis.</a> J. Chromatogr. B. 849, 190-202 (2007).</li><li>Lowry, O. H., Rosenburg, N. J., Farr, A. L., Randall, R. J. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/query.fcgi?db=PubMed&cmd=Search&doptcmdl=Citation&defaultField=Title+Word&term=Protein+measurement+with+the+Folin+phenol+reagent.">Protein measurement with the Folin phenol reagent.</a> J. Biol. Chem. 193, 265-275 (1951).</li><li>Smith, P. K., Krohn, R. I., Hermanson, G. T., Mallia, A. K., Gartner, F. H., Provenzano, M. D., Fujimoto, E. K., Goeke, N. M., Olson, B. J., Klenk, D. C. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/query.fcgi?db=PubMed&cmd=Search&doptcmdl=Citation&defaultField=Title+Word&term=Measurement+of+Protein+Using+Bicinchoninic+Acid.">Measurement of Protein Using Bicinchoninic Acid.</a> Anal. Biochem. 150, 76-85 (1985).</li><li>Norton, J. P., Clarkson, P. M., Graves, J. E., Litchfield, P. L., Kirwan, J. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/query.fcgi?db=PubMed&cmd=Search&doptcmdl=Citation&defaultField=Title+Word&term=Serum+creatine+kinase+activity+and+body+composition+in+males+and+females.">Serum creatine kinase activity and body composition in males and females.</a> Hum. Biol. 57, 591-598 (1985).</li><li>Amelink, G. J., Kamp, H. H., B&#228;r, P. R. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/query.fcgi?db=PubMed&cmd=Search&doptcmdl=Citation&defaultField=Title+Word&term=Creatine+kinase+isoenzyme+profiles+after+exercise+in+the+rat:+sex-linked+differences+in+leakage+of+CK-MM.">Creatine kinase isoenzyme profiles after exercise in the rat: sex-linked differences in leakage of CK-MM.</a> Pfl&#252;gers. Arch. 412, 417-421 (1988).</li><li>Kendall, B., Eston, R. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/query.fcgi?db=PubMed&cmd=Search&doptcmdl=Citation&defaultField=Title+Word&term=Exercise-induced+muscle+damage+and+the+potential+protective+role+of+estrogen.">Exercise-induced muscle damage and the potential protective role of estrogen.</a> Sports Med. 32 (2), 103-123 (2002).</li><li>Tiidus, P. M. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/query.fcgi?db=PubMed&cmd=Search&doptcmdl=Citation&defaultField=Title+Word&term=Can+oestrogen+influence+skeletal+muscle+damage,+inflammation,+and+repair?.">Can oestrogen influence skeletal muscle damage, inflammation, and repair?.</a> Br. J. Sports Med. 39, 251-253 (2005).</li></ol>

ब्याज की कोई संघर्ष की घोषणा की.

नियंत्रण रेखा / एमएस प्रोटिओमिक्स यहाँ प्रस्तुत विधि कंकाल की मांसपेशी proteome के पहले के स्तर की एक तेजी से विश्लेषण के लिए एक सबसे विश्वसनीय और प्रतिलिपि प्रस्तुत करने योग्य प्रोटोकॉल है. यह लिंग विशिष्टता के एक यथोचित समीचीन तुलना के लिए अनुमति देता है. कम बहुतायत प्रोटीन मांसपेशियों के नमूने के एक fractionation के रूप में संभव के रूप में सिकुड़ा प्रोटीन के कई दूर करने के लिए, जिससे कम बहुतायत प्रोटीन में वृद्धि की आवश्यकता होगी. Proteome प्रोफ़ाइल सिलाई भिन्न पीएच रेंज IPG स्ट्रिप्स और वैकल्पिक प्रतिशत ढाल जैल के साथ पूरा किया जा सकता है अगर वांछित. अधिक संवेदनशील फ्लोरोसेंट दाग मौजूद हैं, लेकिन हम अनुशंसा करते हैं कि प्रत्येक प्रयोगशाला आपके सिस्टम में इन दाग के linearity निर्धारित है. प्रोटीन अभिव्यक्ति का एक और अधिक कठोर विश्लेषण के लिए DIGE प्रणाली (दो आयामी जेल वैद्युतकणसंचलन प्रणाली में, जीई हेल्थकेयर लाइफ साइंसेज) में इस्तेमाल किया जा सकता है, लेकिन इस पद्धति के लिए जटिलता का एक स्तर जोड़ने करता है. इसके अलावा, इस के साथ साथ वर्णित प्रोटोकॉल सबसे ani के साथ इस्तेमाल किया जा सकता हैमल ऊतकों जिसके लिए एक जीनोम अनुक्रम निर्धारण किया गया है, के रूप में डी किसी भी स्रोत से एक प्रोटीन की नोवो अनुक्रमण के रूप में अच्छी तरह से, के रूप में के रूप में लंबे समय से यह एक दो आयामी जेल पर हल किया जा सकता है, क्योंकि अतिव्यापी एंजाइमी टुकड़े इसके अलावा में उच्च शुद्धता एंजाइमों का उपयोग कर उत्पन्न किया जा सकता है trypsin करने के लिए. अन्य ऊतकों के स्रोतों से नमूने निष्कर्षण कार्यप्रणाली में कुछ परिवर्तन की आवश्यकता है, झिल्ली और hydrophobic प्रोटीन के लिए देख रहे हैं, खासकर यदि तथापि, हम अच्छे परिणाम हृदय, जिगर, गुर्दे, और मस्तिष्क के ऊतकों के साथ इस प्रोटोकॉल का उपयोग किया है हो सकता है. अन्य बाद translational संशोधनों जन स्पेक्ट्रम डेटाबेस खोज मापदंड को संशोधित करके पता लगाया जा सकता है. संक्षेप में, हम एक हद तक विस्तृत विश्लेषण proteome रूपरेखा के लिए प्रारंभिक प्रोटोकॉल प्रस्तुत किया है.

<table border="1"><tbody><tr><th> अभिकर्मक के नाम </th><th> टाइप </th><th> कंपनी </th><th> सूचीपत्र संख्या </th><th> टिप्पणियाँ </th></tr><tr><td> PepClean सी 18-स्पिन स्तंभ </td><td> उपभोज्य </td><td> ThermoFisher वैज्ञानिक </td><td> PI-89,870 </td><td></td></tr><tr><td> अखंड Pepswift स्तंभ (100um एक्स 5 सेमी) </td><td> उपभोज्य </td><td> Dionex </td><td> 162348 </td><td></td></tr><tr><td> पूर्व डाली मानदंड 10.5% -14% एसडीएस Tris - एचसीएल polyacrylamide जैल </td><td> उपभोज्य </td><td> BioRad </td><td> 345-0106 </td><td></td></tr><tr><td> IPG स्ट्रिप्स Readystrip </td><td> उपभोज्य </td><td> BioRad </td><td> पीएच परिवर्तनीय पर्वतमाला </td><td></td></tr><tr><td> एसिटिक एसिड </td><td> अभिकर्मक </td><td> फिशर साइंटिफिक </td><td> A465-1 </td><td></td></tr><tr><td> एसीटोन </td><td> अभिकर्मक </td><td> Pharmco </td><td> 329000 </td><td></td></tr><tr><td> मिथाइल सायनाइड, एक पदार्थ जो तीन या अधिक सिगरेट रोज पीने वाले व्यक्तियों के मूत्र में अधिक मात्रा में पाया जाता है </td><td> अभिकर्मक </td><td> फिशर साइंटिफिक </td><td> A955 </td><td></td></tr><tr><td> एकgarose </td><td> अभिकर्मक </td><td> BioRad </td><td> 163-2111 </td><td> उपरिशायी समाधान </td></tr><tr><td> अमोनियम बिकारबोनिट </td><td> अभिकर्मक </td><td> Fluka </td><td> 40867 </td><td></td></tr><tr><td> Bromophenol नीले </td><td> अभिकर्मक </td><td> फिशर साइंटिफिक </td><td> BP114 </td><td></td></tr><tr><td> जैव - Lyte Ampholytes </td><td> अभिकर्मक </td><td> BioRad </td><td></td><td> पीएच परिवर्तनीय पर्वतमाला </td></tr><tr><td> Chaps </td><td> अभिकर्मक </td><td> यूएसबी </td><td> 13361 </td><td></td></tr><tr><td> Commassie आर 250 - नीला </td><td> अभिकर्मक </td><td> ThermoFisher वैज्ञानिक </td><td> 20278 </td><td></td></tr><tr><td> Dithiothreitol (डीटीटी) </td><td> अभिकर्मक </td><td> यूएसबी </td><td> 15395 </td><td></td></tr><tr><td> चींटी एसिड </td><td> अभिकर्मक </td><td> ThermoFisher वैज्ञानिक </td><td> 28905 </td><td></td></tr><tr><td> ग्लिसरोल </td><td> अभिकर्मक </td><td> सिग्मा Aldrich </td><td> G6279 </td><td></td></tr><tr><td> Glycine </td><td> अभिकर्मक </td><td> यूएसबी </td><td> 16407 </td><td></td&gt; </tr><tr><td> Iodoacetamide </td><td> अभिकर्मक </td><td> सिग्मा Aldrich </td><td> I6125 </td><td></td></tr><tr><td> मेथनॉल </td><td> अभिकर्मक </td><td> फिशर साइंटिफिक </td><td> A452 </td><td></td></tr><tr><td> खनिज तेल </td><td> अभिकर्मक </td><td> BioRad </td><td> 163-2129 </td><td></td></tr><tr><td> सोडियम dodecyl सल्फेट </td><td> अभिकर्मक </td><td> सिग्मा Aldrich </td><td> L6026 </td><td></td></tr><tr><td> Tris आधार </td><td> अभिकर्मक </td><td> सिग्मा Aldrich </td><td> 93349 </td><td></td></tr><tr><td> Tris [2-carboexyethyl] phosphine </td><td> अभिकर्मक </td><td> ThermoFisher वैज्ञानिक </td><td> 77720 </td><td></td></tr><tr><td> Trypsin Endoproteinase TPCK इलाज, एमएस ग्रेड </td><td> अभिकर्मक </td><td> पियर्स </td><td> 90055 </td><td> संशोधित </td></tr><tr><td> यूरिया </td><td> अभिकर्मक </td><td> यूएसबी </td><td> 75826 </td><td></td></tr><tr><td> पानी </td><td> अभिकर्मक </td><td> Burdick और जैक्सन </td><td> 365 </td><td></td></tr><tr><td> Centrivap Concentrator </td><td> टीool </td><td> Labconco </td><td></td><td></td></tr><tr><td> Exquest हाजिर कटर </td><td> उपकरण </td><td> BioRad </td><td></td><td></td></tr><tr><td> LCQ Deca XP अधिकतम आयन जाल मास स्पेक्ट्रोमीटर </td><td> उपकरण </td><td> ThermoFisher वैज्ञानिक </td><td></td><td></td></tr><tr><td> Motorized मूसल </td><td> उपकरण </td><td> Kontes कॉर्प </td><td></td><td></td></tr><tr><td> सरगर्मी Polypropylene </td><td> उपकरण </td><td> BioSpec प्रॉड </td><td></td><td></td></tr><tr><td> छड़ </td><td></td><td></td><td></td><td></td></tr><tr><td> बहुरूपिया IEF सेल </td><td> उपकरण </td><td> BioRad </td><td></td><td></td></tr><tr><td> Sonicator </td><td> उपकरण </td><td> ब्रैंसन </td><td></td><td></td></tr><tr><td> सर्वेयर प्लस HPLC प्रणाली </td><td> उपकरण </td><td> ThermoFisher वैज्ञानिक </td><td></td><td></td></tr><tr><td> VersaDoc इमेजिंग प्रणाली </td><td> उपकरण </td><td> BioRad </td><td></td><td></td></tr></tbody></table>

skeletal muscle gender dimorphism from proteomics

कंकाल की मांसपेशी में सकल संकुचन मुख्य रूप से सिकुड़ा प्रोटीन की एक अपेक्षाकृत छोटी संख्या के द्वारा निर्धारित किया जाता है, लेकिन इस ऊतक भी उल्लेखनीय प्रतिरोध व्यायाम और अप्रचार द्वारा शोष द्वारा अतिवृद्धि जैसे पर्यावरणीय कारकों एक अनुकूलनीय है. यह इस प्रकार तनाव (गर्मी, ischemia, भारी धातुओं, आदि.) 2,3 करने के लिए remodeling और रूपांतरों को दर्शाती है. मांसपेशियों को नुकसान की मांसपेशियों exerting बल द्वारा होते हैं, जबकि लंबी कर सकते हैं, तथाकथित सनकी संकुचन 4. सिकुड़ा प्रोटीन जैसे exertions में क्षतिग्रस्त हो सकता है और करने के लिए, अपमानित और / या resynthesized मरम्मत की जरूरत है, इन कार्यों सिकुड़ा प्रोटीन का हिस्सा नहीं हैं, लेकिन सेल में अन्य बहुत कम प्रचुर मात्रा में प्रोटीन की. यह निर्धारित करने के लिए क्या प्रोटीन का सबसेट क्षति के इस प्रकार के सुधार में शामिल है, एक वैश्विक proteome पहले स्थापित किया जाना चाहिए करने के लिए 5 व्यायाम और तब व्यायाम के बाद पीछा अंतर निर्धारित करने के लिएप्रोटीन अभिव्यक्ति और जिससे रूपांतरों में नुकसान और इसकी मरम्मत के लिए उम्मीदवार प्रोटीन पर प्रकाश डाला. इसके अलावा, प्रजातियों के नर कंकाल की मांसपेशी के सबसे अधिक अध्ययन आयोजित किया गया है और इसलिए महिला की मांसपेशी के प्रतिनिधि नहीं हो सकता है. इस अनुच्छेद में हम प्रोटीन reproducibly पुरुष और महिला की मांसपेशियों से निकालने और उन्हें दो आयामी जेल उच्च संकल्प डिजिटल इमेजिंग 6 द्वारा पीछा वैद्युतकणसंचलन द्वारा अलग करने के लिए एक विधि प्रस्तुत करते हैं. यह स्पॉट (और बाद में पहचान प्रोटीन) है कि इस शो के लिए एक प्रोटोकॉल है एक सांख्यिकीय महत्वपूर्ण (पी &lt;0.05) दो गुना वृद्धि या कमी दिखाई देते हैं, या नियंत्रण राज्य से गायब है. प्रदान करता है ये तो, excised trypsin के साथ पचा और उच्च दबाव तरल क्रोमैटोग्राफी प्रोटीन (नियंत्रण रेखा / एमएस / एमएस) की पहचान 5 के लिए एक मास स्पेक्ट्रोमीटर (नियंत्रण रेखा / एमएस) के लिए मिलकर द्वारा अलग. इस पद्धति (चित्रा 1) कोई संशोधन के लिए थोड़ा के साथ कई ऊतकों पर इस्तेमाल किया जा सकता है (लीवर, मस्तिष्क, सुनआदि.) टी.

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Skeletal Muscle Gender Dimorphism from Proteomics

तरीकों का एक सेट सीधे आगे के लिए अलग और सबसे प्रचुर मात्रा में प्रोटीन के कंकाल की मांसपेशी में व्यक्त पहचान निर्धारित है. 800 स्पॉट के बारे में 10 मिलीग्राम मांसपेशियों से एक दो आयामी जेल पर discerned हैं, यह लिंग विशिष्ट प्रोटीन अभिव्यक्ति का निर्धारण करने के लिए अनुमति देता है. इन विधियों सबसे ऊतकों में बराबर परिणाम दे देंगे.

प्रोटिओमिक्स से कंकाल की मांसपेशी लैंगिक द्विरूपता

Gross contraction in skeletal muscle is primarily determined by a relatively small number of contractile proteins, however this tissue is also remarkably ...

Research

JoVE Journal

Medicine

Myo-mechanical Analysis of Isolated Skeletal Muscle

Myo यांत्रिक पृथक कंकाल की मांसपेशी का विश्लेषण

To assess the in vivo effects of therapeutic interventions for the treatment of muscle disease 1,2,3, quantitative methods are needed that measure force ...

Tibial Nerve Transection - A Standardized Model for Denervation-induced Skeletal Muscle Atrophy in Mice

Tibial तंत्रिका transection - चूहे में वितंत्रीभवन प्रेरित कंकाल की मांसपेशी शोष के लिए एक मानकीकृत मॉडल

The tibial nerve transection model is a well-tolerated, validated, and reproducible model of denervation-induced skeletal muscle atrophy in rodents. ...

Human Skeletal Muscle Biopsy Procedures Using the Modified Bergstr&#246;m Technique

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संशोधित Bergstrom तकनीक का प्रयोग मानव कंकाल की मांसपेशी बायोप्सी प्रक्रियाओं

The percutaneous biopsy technique enables researchers and clinicians to collect skeletal muscle tissue samples. The technique is safe and highly ...

Preparation and Respirometric Assessment of Mitochondria Isolated from Skeletal Muscle Tissue Obtained by Percutaneous Needle Biopsy

Percutaneous सुई बायोप्सी से प्राप्त कंकाल की मांसपेशियों के ऊतकों से अलग mitochondria की तैयारी और Respirometric आकलन

Respirometric profiling of isolated mitochondria is commonly used to investigate electron transport chain function. We describe a method for obtaining ...

Quantitative Magnetic Resonance Imaging of Skeletal Muscle Disease

कंकाल की मांसपेशी रोग के मात्रात्मक चुंबकीय अनुनाद इमेजिंग

Quantitative magnetic resonance imaging (qMRI) describes the development and use of MRI to quantify physical, chemical, and/or biological properties of ...

Human Vastus Lateralis Skeletal Muscle Biopsy Using the Weil-Blakesley Conchotome

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मानव<em&gt; उत्तर lateralis</em&gt; कंकाल की मांसपेशी बायोप्सी वेल-Blakesley Conchotome का प्रयोग

Percutaneous muscle biopsy using the Weil-Blakesley conchotome is well established in both clinical and research practice. It is a safe, effective and ...

Induction and Assessment of Exertional Skeletal Muscle Damage in Humans

प्रेरण और मनुष्यों में एक्सर्शनल कंकाल मांसपेशियों की क्षति का आकलन

Contraction-induced muscle damage via voluntary eccentric (lengthening) contractions offers an excellent model for studying muscle adaptation and recovery ...

Phosphorus-31 Magnetic Resonance Spectroscopy: A Tool for Measuring In Vivo Mitochondrial Oxidative Phosphorylation Capacity in Human Skeletal Muscle

Phosphorus-31 Magnetic Resonance Spectroscopy: A Tool for Measuring In Vivo Mitochondrial Oxidative Phosphorylation Capacity in Human Skeletal Muscle

फास्फोरस-31 चुंबकीय अनुनाद स्पेक्ट्रोस्कोपी: मापने के लिए एक उपकरण<em&gt; Vivo</em&gt; मानव कंकाल की मांसपेशी में Mitochondrial ऑक्सीडेटिव Phosphorylation क्षमता

Skeletal muscle mitochondrial oxidative phosphorylation (OXPHOS) capacity, which is critically important in health and disease, can be measured in vivo ...

Semi-automated Analysis of Mouse Skeletal Muscle Morphology and Fiber-type Composition

माउस कंकाल मांसपेशियों आकृति विज्ञान और फाइबर प्रकार की रचना के अर्द्ध स्वचालित विश्लेषण

For years, distinctions between skeletal muscle fiber types were best visualized by myosin-ATPase staining. More recently, immunohistochemical staining of ...

Skeletal Muscle Neurovascular Coupling, Oxidative Capacity, and Microvascular Function with 'One Stop Shop' Near-infrared Spectroscopy

कंकाल मांसपेशी Neurovascular युग्मन, ऑक्सीडेटिव क्षमता, और Microvascular समारोह ' के साथ एक बंद दुकान ' के पास अवरक्त स्पेक्ट्रोस्कोपी

Exercise represents a major hemodynamic stress that demands a highly coordinated neurovascular response in order to match oxygen delivery to metabolic ...