Name: chromatin interaction analysis with paired-end tag sequencing (chia-pet) for mapping chromatin interactions and understanding transcription regulation
Uploaded: 2012-04-30T13:00:00
Duration: 21 min 55 s
Description: Watch this Scientific Journal Video about Chromatin Interaction Analysis with Paired-End Tag Sequencing ChIA-PET for Mapping Chromatin Interactions and Understanding Transcription Regulation at JoVE.c

Les auteurs sont pris en charge par A * STAR de Singapour. En outre, MJF est soutenu par une bourse d&#39;études A * STAR National Science, un Oréal For Women in Science National Fellowship et un Lee Kuan Yew de postdoctorat. YR est soutenu par le NIH ENCODE subventions (R01-01 et HG004456 R01 HG003521-01). Les auteurs remercient également l&#39;équipe de la vidéographie de Productions Pixels 8, Singapour, en particulier Issey M. Kelvin, M. Chang Kai Xiang et M. Sherwin Gan pour le tournage des scènes, Mme Siti Rahim pour le montage vidéo et de Mme Michelle Teo pour le voice-over.

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Sci. 20, 500-506 (1995).</li><li>Schoenfelder, S., Sexton, T. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/query.fcgi?db=PubMed&cmd=Search&doptcmdl=Citation&defaultField=Title+Word&term=Preferential+associations+between+co-regulated+genes+reveal+a+transcriptional+interactome+in+erythroid+cells.">Preferential associations between co-regulated genes reveal a transcriptional interactome in erythroid cells.</a> Nat. Genet. 42, 53-61 (2010).</li><li>Zeng, P. Y., Vakoc, C. R. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/query.fcgi?db=PubMed&cmd=Search&doptcmdl=Citation&defaultField=Title+Word&term=In+vivo+dual+cross-linking+for+identification+of+indirect+DNA-associated+proteins+by+chromatin+immunoprecipitation.">In vivo dual cross-linking for identification of indirect DNA-associated proteins by chromatin immunoprecipitation.</a> Biotechniques. 41, 694-698 (2006).</li></ol>

Pas de conflits d&#39;intérêt déclarés.

Chia-PET est une méthode mise au point pour identifier les interactions à longue portée dans régulation de la transcription. Un des facteurs critiques qui déterminent la qualité d&#39;une bibliothèque Chia-PET est la qualité du matériel ChIP. Le protocole présenté dans la vidéo incorpore l&#39;utilisation de biens et services environnementaux et de formaldéhyde pour réticuler les cellules. L&#39;utilisation du formaldéhyde combiné avec un deuxième réactif de réticulation portant un bras espaceur plus peut aider à la fixation de protéines qui ne pouvaient pas être liés par le formaldéhyde seul 3,11,15. Nous avons construit des bibliothèques avec cette méthode, qui ont démontré de solides sites de liaison et à long terme des interactions 9. Toutefois, la réticulation et les conditions de puce devrait être optimisé pour chaque facteur d&#39;intérêt, et il est important de ne pas trop réticulation comme trop réticulation se traduira par des difficultés dans la fragmentation par ultrasons, et peut éventuellement mener à des interactions parasites chromatine . Interactions chromatineidentifié par Chia-PET doit être validé par une méthode différente, telles que la fluorescence par hybridation in situ 4. Nous recommandons un minimum de 100 ng de matériel chromatine. Alors que nous avons construit des bibliothèques de bonne qualité à partir de 50 ng de matériel chromatine, nous avons observé que de grandes quantités de matériau de départ a permis la construction de Chia-PET bibliothèques avec des cycles de PCR de moins de 16, réduisant ainsi au minimum amplicons et la redondance de chaque bibliothèque. Cette baisse de la redondance en corrélation avec plus uniques balises cartographiés et également un pourcentage élevé de données utilisables, ce qui permet une carte plus complète chromatine interaction avec moins de voies de séquençage. Le volume final emballé de perles dans chaque tube devrait être de 50 pi et 100 pi de billes magnétiques et Sépharose respectivement. Si le volume emballé perle est inférieure à celle indiquée, mettre le volume au minimum emballé avec même pré-autorisé vierges billes magnétiques ou Sepharose pour minimiser la perte de l&#39;ADN porteur de billess dans les étapes ultérieures. À canon scié de conseil ou grand-core des conseils devraient être utilisés pour le pipetage des billes de Sépharose. Les modifications suivantes ont été intégrées à la suite du déjà publié Chia-PET protocole 5. Tout d&#39;abord, billes magnétiques G ont été utilisés pour minimiser la perte de l&#39;échantillon pendant les lavages. En outre, nous avons identifié bandes non spécifiques avec la taille approximative de 100 pb et 138 pb pour être amplicons de l&#39;auto-ligaturés demi-linkers ou / et des adaptateurs. Par conséquent, nous avons réduit la concentration de biotinylés demi-linkers et 454 GS20 adaptateurs pour minimiser bandes non spécifiques lors de l&#39;amplification PCR. Le volume ligature de proximité a été réduit de 50 ml à 10 ml pour minimiser la perte d&#39;échantillon au cours des étapes ultérieures de purification et aussi économiser sur les coûts des réactifs. Nous avons également augmenté le temps d&#39;incubation pour immobiliser Chia-PET ADN à des billes pour assurer la capture maximale de Chia-PET ADN sur les billes de streptavidine. Au cours de l&#39;étape de ligation de proximité, la ligature des chimères that ne représentent pas vrai dans les interactions in vivo chromatine sont inévitablement générés d&#39;une manière non-spécifique et aléatoire. Par conséquent, pour évaluer la qualité des données provenant de n&#39;importe quelle expérience Chia-PET, le taux de chimérisme est estimée à partir de l&#39;utilisation de deux différents demi-linkers avec nucléotidique spécifique TAAG codes à barres et ATGT 5. Après séquençage à haut débit, les séquences Chia-PET sont d&#39;abord analysés pour leur composition code-barres de liaison et des séquences dérivées de produits de ligature et des produits spécifiques ligature non-spécifiques peuvent être distinguées 8. Le pourcentage de chimères connus (c.-à-hétérodimères linkers AB) présents dans notre propre MCF-7 ARN polymérase II Chia-PET bibliothèques est inférieure à 15%. Chia-PET séquences sont ensuite classées en deux catégories, à savoir l&#39;auto-ligature animaux de compagnie et inter-ligature ANIMAUX DE COMPAGNIE. Auto-ligature PET sont obtenues à partir d&#39;auto-circularisation ligature des fragments de chromatine tandis entre ligature PET sont dérivées à partir de inter-ligature entre deux fragments d&#39;ADN différents. Ce dernier est alors sous-divisé en trois catégories différentes en fonction de la distance génomique de chaque étiquette sur le même chromosome (intrachromosomiques inter-ligature PET) ou que les deux balises sont mappées à deux chromosomes différents (interchromosomiques inter-ligature PET). Nous avons développé un package Chia-PET outil logiciel pour trier les différentes catégories 8. Ce sera basé sur des fragments d&#39;ADN qui sont dans la bibliothèque. En règle générale, des fragments plus petits ChIP donnera une résolution plus élevée et la couper pour ces ARN polymérase II Chia-PET bibliothèques est d&#39;environ 4 ko. En outre, les interactions réelles chromatine peuvent être distingués du bruit aléatoire en comptant le nombre d&#39;inter-ligature vie privée dans un cluster interaction; en d&#39;autres termes, un groupe de comptage PET haute est dit d&#39;avoir une plus grande probabilité d&#39;être une interaction réelle chromatine 8 . Pour filtrer nos faux positifs unepassera de points d&#39;ancrage hautement enrichi qui peuvent former des inter-ligature vie privée par hasard, un cadre d&#39;analyse statistique a également été formulées pour tenir compte de la formation aléatoire de toute vie privée inter-ligature entre deux ancres 8. En conclusion, la technique de Chia-PET permet de cartographier les réseaux d&#39;interaction chromatine à l&#39;échelle mondiale. La mise en œuvre de la puce en Chia-PET permet la réduction de la complexité de bibliothèque et le bruit de fond. En outre, ajoute-t-ChIP spécificité des interactions chromatine, permettant l&#39;examen des interactions spécifiques associés à la chromatine facteurs de transcription particuliers 5.

<table border="1"><tbody><tr><td> Nom du réactif </td><td> Entreprise </td><td> Numéro de catalogue </td><td> Commentaires </td></tr><tr><td> Gradient 4-20% TBE gel </td><td> Invitrogen </td><td> EC6225BOX </td><td> Étape B, 6,3 </td></tr><tr><td> 5 x tampon T4 ADN ligase avec le PEG </td><td> Invitrogen </td><td> 46300018 </td><td> Etape B, 2,2 </td></tr><tr><td> 6% de gel TBE </td><td> Invitrogen </td><td> EC6263BOX </td><td> Étape B, 6,8 </td></tr><tr><td> Agilent ADN 100 Assay </td><td> Agilent Technologies </td><td> 5067-1504 </td><td rowspan="3"> Etape B, 7,1 </td></tr><tr><td> Agilent test ADN de haut Sensibilité </td><td> Agilent Technologies </td><td> 5067-4626 </td></tr><tr><td> Agilent Bioanalyzer 2100 </td><td> Agilent Technologies </td><td> G2940CA </td></tr><tr><td> Centrifuger Filtres Tube (Spin-X) </td><td> Corning &lt;/ Td&gt; <td> CLS8160 </td><td> Étape B, 3,7 et 6,9 </td></tr><tr><td> Transilluminateur lecteur foncé </td><td> Clare Chemical Research </td><td> DR46B </td><td> Étape B, 6,8 </td></tr><tr><td> Numérique portable Sonifier Disrupter </td><td> Branson </td><td> 450D-0101063591 </td><td> Étape A, 4,3 </td></tr><tr><td> Dynamag-2 aimant (concentrateur de particules magnétiques) </td><td> Invitrogen </td><td> 123-21D </td><td> Étape A, B, étape 7.5.1, pour tous les billes magnétiques des étapes de lavage </td></tr><tr><td> Dynamag-15 Aimant (concentrateur de particules magnétiques) </td><td> Invitrogen </td><td> 123.01D </td><td> Etape A, 5 et 6 </td></tr><tr><td> Dynamag-PCR (concentrateur de particules magnétiques) </td><td> Invitrogen </td><td> 49-2025 </td><td> Étape B, 6,5 </td></tr><tr><td> Polymérase ADN d&#39;Escherichia coli </td><td> ONÉ </td><td> M0209 </td><td> Étape B, 5,6 </td></tr><tr><td> GlycoBlue </td><td> Ambion </td><td> AM9516 </td&gt; <td> Étape A, B Étape 7.5.1, 4.3 et 6.5 </td></tr><tr><td> Illumina cbot Generation System Cluster </td><td> Illumina </td><td> SY-301-2002 </td><td> Etape B, 7,4 </td></tr><tr><td> Illumina Genome Analyzer IIx </td><td> Illumina </td><td> SY-301-1301 </td><td> Etape B, 7,5 </td></tr><tr><td> Illumina PE amorces </td><td> Illumina </td><td> PE-102-1004 </td><td> Etape B, 5.4 (si nécessaire) </td></tr><tr><td> Intelli-Mixer </td><td> Palico Biotech </td><td> RM-2L </td><td> Étape B, toutes les incubations avec rotation </td></tr><tr><td> LightCycler 480 Real-Time System PCR </td><td> Roche </td><td> 04 640 268 001 </td><td> Étape A, B 7.5.3 Étape, 7,3 </td></tr><tr><td> LightCycler480 ADN SYBR Green I MasterMix </td><td> Roche </td><td> 03 752 186 001 </td><td> Etape B, 7.5.3 </td></tr><tr><td> M-280 Streptavidin Dynabeads </td><td> Invitrogen </td><td> 11206D </td><td> Étape B, 5,2 </td></tr> &lt;tr&gt; <td> Magnétique protéines (Dynabeads) G </td><td> Invitrogen </td><td> 100.03D </td><td> Étape A, 5.1.1 et 5.2.1 </td></tr><tr><td> MaXtract haute densité (2ml) </td><td> Qiagen </td><td> 129056 </td><td> Étape A 7.5.1, </td></tr><tr><td> MaXtract haute densité (50ml) </td><td> Qiagen </td><td> 129073 </td><td> Etape B, 4,2 </td></tr><tr><td> MmeI </td><td> ONÉ </td><td> R0637 </td><td> R0637 </td></tr><tr><td> RNase ONE Ribonuclease </td><td> Promega </td><td> M426C </td><td> Etape B, 4,8 </td></tr><tr><td> L&#39;ARN polymérase II (8WG16) anticorps monoclonal </td><td> Covance </td><td> MMS-126R </td><td> Étape A, 5.2.4 </td></tr><tr><td> Tubes à centrifuger Oak Ridge (polypropylène) </td><td> Nalgene </td><td> 3119-0050 </td><td> Étape A, 3,1 </td></tr><tr><td> Tubes à centrifuger Oak Ridge (Téflon FEP) </td><td> Nalgene </td><td> 3114-0050 </td><td> Etape B, 4,3 </td></tr><tr><td> Adolpheion haute fidélité Master Mix </td><td> Finnzymes </td><td> F-531 </td><td> Étape B, 6 </td></tr><tr><td> Picogreen (Quant-iT) Réactif ADNdb </td><td> Invitrogen </td><td> P11495 </td><td> Étape A, 7.5.2 </td></tr><tr><td> Polystyrène Tube ronde test Bas </td><td> BD Biosciences </td><td> 352057 </td><td> Etape A, 4,1 </td></tr><tr><td> Comprimés inhibiteurs de la protéase à cocktails (complet, EDTA-free) </td><td> Roche </td><td> 11873580001 </td><td> Étape A partir de 1.6, </td></tr><tr><td> Protéinase K Solution (20mg/ml) </td><td> Fermentas </td><td> E00491 </td><td> Étape A, 4.4, 7.5.1 Etape B, 4,1 </td></tr><tr><td> ADN ligase T4 </td><td> Fermentas </td><td> EL0013 </td><td> Etape B, 2,2, 3,9 et 5,4 </td></tr><tr><td> T4 ADN ligase tampon (ONE) </td><td> ONÉ </td><td> B0202S </td><td> Etape B, 3,3 et 3,9 </td></tr><tr><td> ADN polymérase T4 </td><td> Promega </td><td> M4215 </td><td>Etape B, 1,2 </td></tr><tr><td> T4 polynucléotide kinase ADN </td><td> ONÉ </td><td> M0201 </td><td> Étape B, 3,3 </td></tr><tr><td> TruSeq SBS Kit v5-GA </td><td> Illumina </td><td> FC-104-5001 </td><td> Regents pour Illumina Genome Analyzer IIx système </td></tr><tr><td> TruSeq PE Cluster Kit v2-CBOT-GA </td><td> Illumina </td><td> PE-300-2001 </td><td> à utiliser avec Illumina cbot Generation System Cluster </td></tr><tr><td> SYBR Green I </td><td> Invitrogen </td><td> S-7585 </td><td> Etape B, 6,3 et 6,8 </td></tr><tr><td> XCell SureLock Système d&#39;électrophorèse Mini-Cell </td><td> Invitrogen </td><td> EI0001 </td><td> Etape B, 6,3 et 6,8 </td></tr></tbody></table><table border="1"><tbody><tr><td> Nom </td><td colspan="2"> Séquence </td><td> Commentaires </td></tr><tr><td rowspan="2"> Biotinylé demi-lieurs A (200ng/μl) </td><td> Haut </td><td> 5 &#39;GG GCC CGA / iBiodT / ATC TTA STC AAC 3&#39; </td><td> 250 nmoles échelle purifiée par HPLC interne Biotine dT (9) </td></tr><tr><td> Bot </td><td> 5 &#39;GTT GGA TAA GAT ATC GC 3&#39; </td><td> 250 nmoles échelle purifiée par HPLC </td></tr><tr><td rowspan="2"> Biotinylé demi-linkers B (200ng/μl) </td><td> Haut </td><td> 5 &#39;GGC CCG GA / iBiodT / ATA CAT TCC CAA 3&#39; </td><td> 250 nmoles échelle purifiée par HPLC interne Biotine dT (9) </td></tr><tr><td> Bot </td><td> 5 &#39;GTT GGA ATG TAT ATC GC 3&#39; </td><td> 250 nmoles échelle purifiée par HPLC </td></tr><tr><td rowspan="2"> Non-biotinylés demi-linkers (200ng/μl) </td><td> Haut </td><td> 5 &#39;GGC CCG CAG ATC GGA TCC CAA 3&#39; </td><td> 250 nmoles échelle PCR grade </td></tr><tr><td> Bot </td><td> 5 &#39;GTT GGA TCC CAG ATC GC 3&#39; </td><td> 250 nmoles échelle PCR grade </td></tr><tr><td rowspan="2"> GS20 Adaptateur A (200ng/μl) </td><td> Haut </td><td> 5 &#39;CCA TCT CAT CCC GTG TGC TCC CATCTG TTC CCT CCC TGT CCT AGN N 3 &#39; </td><td> 250 nmoles échelle PCR grade </td></tr><tr><td> Bot </td><td> 5&#39;CTG AGA GGA GGG CAG AAC AGA TGG GAC ACG ACG GGA GAT TGA GG 3 &#39; </td><td> 250 nmoles échelle PCR grade </td></tr><tr><td rowspan="2"> GS20 Adaptateur B (200ng/μl) </td><td> Haut </td><td> 5 &#39;CTG AGA CAC GCA ACA GGG GAT AGG CAA GGC CAG ACA GGG GG ATA 3&#39; </td><td> 250 nmoles échelle PCR grade </td></tr><tr><td> Bot </td><td> 5 &#39;ATC CCC CCT TGT GTG CCT TGC CTA TCC CCT GCG GTT TGT CCT AGN N 3&#39; </td><td> 250 nmoles échelle PCR grade </td></tr><tr><td rowspan="2"> Illumina-NN adaptateurs </td><td> Haut </td><td> 5 &#39;ACA CCT TTT CCC ACG ACG TAC CCT TTC CGA TC 3&#39; </td><td> 250 nmoles échelle purifiée par HPLC Voir l&#39;étape B, 5,4 </td></tr><tr><td> Bot </td><td> 5 &#39;phos - GAT CGG AAG CAG GGT TCA GCA GGA ATG GCC AG 3&#39; </td><td> 250 nmoles échelle purifiée par HPLC phosphorylée extrémité 5 &#39;Voir l&#39;étape B, 5,4 </td></tr><tr><td> Illumina 1-454 (en avant) amorce (10 uM) </td><td colspan="2"> 5 &#39;AAT GAT GCG ACG ACC ACC ACC GAG ATC TAC TCC CTA GTG CCT TGC CTT G 3&#39; </td><td> 250 nmoles échelle PCR grade </td></tr><tr><td> Illumina 2-454 (inverse) amorce (10 uM) </td><td colspan="2"> 5 &#39;CAA GCA GAA GAC GGC GAT CGG ATA CGA TCC ATC TCA TCC CTG CGT GTC 3&#39; </td><td> 250 nmoles échelle PCR grade </td></tr><tr><td> Primer qPCR 1.1 (10 uM) </td><td colspan="2"> 5 &#39;AAT GAT ACG GCG CAC GAG ACC À 3&#39; </td><td> 10nmole échelle PCR grade </td></tr><tr><td> Primer qPCR 2.1 (10 uM) </td><td colspan="2"> 5 &#39;CAA GCA GAA GAC GGC CGA ATA 3&#39; </td><td> 10nmole échelle PCR grade </td></tr><tr><td> Illumina 3-454 amorce de séquençage (100 uM) </td><td colspan="2"> 5&#39;TGC GTG TCC CAT CTG TTC CCT CCC TGT CCT AG 3 &#39; </td><td> 100nmole échelle purifiée par HPLC </td></tr><tr><td> Illumina 4-454 amorce de séquençage (100 uM) </td><td colspan="2"> 5&#39;GTG CCT TGC CTA TCC CCT GCG GTT TGT CCT AG 3 &#39; </td><td> Échelle 100nmolePurifiée par HPLC </td></tr></tbody></table> Oligos commander les Tables des oligos et adaptateurs. De Integrated DNA Technologies (IDT) et de préparer les linkers et adaptateurs de la même manière que décrit précédemment 10. Demi-linkers et adaptateurs peut être préparé à l&#39;avance et stockés pendant plusieurs mois à -20 ° C.

chromatin interaction analysis with paired-end tag sequencing (chia-pet) for mapping chromatin interactions and understanding transcription regulation

Les génomes sont organisés en structures tridimensionnelles, l&#39;adoption d&#39;un ordre supérieur conformations à l&#39;intérieur des espaces de taille micronique nucléaires 7, 2, 12. De telles architectures ne sont pas aléatoires et font intervenir des interactions entre les promoteurs des gènes et des éléments régulateurs 13. La liaison des facteurs de transcription à des séquences régulatrices spécifiques provoque un réseau de régulation de la transcription et la coordination 1, 14. Analyse de l&#39;interaction de la chromatine par Tag appariés Fin de séquençage (Chia-PET) a été développé pour identifier ces structures chromatiniennes d&#39;ordre supérieur 5,6. Les cellules sont fixées et en interaction locus sont capturés par covalentes ADN-protéine liaisons transversales. Pour minimiser la non-spécifique du bruit et de réduire la complexité, ainsi que d&#39;augmenter la spécificité de l&#39;analyse de l&#39;interaction de la chromatine, immunoprécipitation de la chromatine (ChIP) est utilisé contre les facteurs protéiques spécifiques pour enrichir des fragments de chromatine d&#39;intérêt avant la ligature de proximité. La ligature impliquant demi-linkers fait suite liaisons covalentes entre des paires de fragments d&#39;ADN attachés ensemble au sein de complexes chromatiniens individuels. Les sites d&#39;accompagnement MmeI enzymes de restriction dans les linkers demi-permettre l&#39;extraction de paires de balise de fin-linker-tag constructions (PET) sur la digestion MmeI. Comme les linkers sont des demi-biotinylé, ces constructions en PET sont purifiés en utilisant la streptavidine-billes magnétiques. Les PET purifiés sont ligués avec des adaptateurs de séquençage de nouvelle génération et un catalogue des fragments d&#39;interaction est généré par l&#39;intermédiaire de la prochaine génération des séquenceurs tels que l&#39;analyseur de Génome Illumina. Cartographie et analyse bioinformatique est ensuite réalisée afin d&#39;identifier ChIP-enrichi sites de liaison et de ChIP-enrichis interactions chromatine 8. Nous avons produit une vidéo pour démontrer les aspects critiques du protocole de Chia-PET, en particulier la préparation de la puce comme la qualité de ChIP joue un rôle majeur dans l&#39;issue d&#39;une bibliothèque Chia-PET. Comme les protocoles sonttrès longtemps, seules les étapes critiques sont montrées dans la vidéo.

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Chromatin Interaction Analysis with Paired-End Tag Sequencing ChIA-PET for Mapping Chromatin Interactions and Understanding Transcription Regulation

Analyse de l&#39;interaction de la chromatine par Tag appariés Fin de séquençage (Chia-PET) est une méthode pour<em&gt; De novo</em&gt; Détection des interactions chromatine, pour une meilleure compréhension du contrôle de la transcription.

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Generation of High Quality Chromatin Immunoprecipitation DNA Template for High-throughput Sequencing (ChIP-seq)

Generation of High Quality Chromatin Immunoprecipitation DNA Template for High-throughput Sequencing ChIP-seq

Génération de haute qualité Immunoprécipitation de la chromatine Patron de l&#39;ADN pour le séquençage à haut débit (ChIP-seq)

ChIP-sequencing (ChIP-seq) methods directly  offer whole-genome coverage, where combining chromatin immunoprecipitation  (ChIP) and massively parallel ...

Generation and Purification of Human INO80 Chromatin Remodeling Complexes and Subcomplexes

Production et purification des droits de INO80 remodelage de la chromatine Complexes et Subcomplexes

INO80 chromatin remodeling complexes regulate nucleosome dynamics and DNA accessibility by catalyzing ATP-dependent nucleosome remodeling. Human INO80 ...

Biochemical Assays for Analyzing Activities of ATP-dependent Chromatin Remodeling Enzymes

Les dosages biochimiques pour l&#39;analyse des activités de l&#39;ATP-dépendant remodelage de la chromatine enzymes

Members of the SNF2 family of ATPases often function as components of multi-subunit chromatin remodeling complexes that regulate nucleosome dynamics and ...

Chromatin Immunoprecipitation Assay for the Identification of Arabidopsis Protein-DNA Interactions In Vivo

Chromatin Immunoprecipitation Assay for the Identification of Arabidopsis Protein-DNA Interactions In Vivo

Immunoprécipitation de la chromatine test pour l&#39;identification de Arabidopsis interactions protéine-ADN<em&gt; In Vivo</em

Intricate gene regulatory networks orchestrate biological processes and developmental transitions in plants. Selective transcriptional activation and ...

Isolation of Specific Genomic Regions and Identification of Associated Molecules by enChIP

Isolement des régions génomiques spécifiques et l&#39;identification des molécules associées par enChIP

The identification of molecules associated with specific genomic regions of interest is required to understand the mechanisms of regulation of the ...