Name: candida albicans biofilm chip (cabchip) for high-throughput antifungal drug screening
Uploaded: 2012-07-18T11:00:00
Description: Watch this Scientific Journal Video about Candida albicans Biofilm Chip CaBChip for High-throughput Antifungal Drug Screening at JoVE.com

وقد تم تمويل هذا العمل في جزء من المنح المقدمة من إدارة تقنية جنوب ولاية تكساس (POCrr 2009.041)، ومعهد للتكامل الطب والعلوم من المركز الوطني للبحوث الموارد (UL 1RR025767)، و من المعهد الوطني لأبحاث طب الأسنان والجمجمة ( 5R21DE017294).

1. إعداد الشرائح Functionalized <ol style=";text-align:right;direction:rtl"><li style=";text-align:right;direction:rtl"> وضع شرائح المجهر في رفوف الشريحة القابلة للإزالة، ويغسل مرتين من تخبط في وعاء يحتوي على تلطيخ الايثانول 99٪ (الصف النسيجية). مسح الشرائح تنظيف استخدام المناديل الورقية (لضمان عدم تولد الغبار ور?...

<ol>
	<li>Edmond, M. B. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/query.fcgi?db=PubMed&cmd=Search&doptcmdl=Citation&defaultField=Title+Word&term=Nosocomial+bloodstream+infections+in+United+States+hospitals:+a+three-year+analysis.">Nosocomial bloodstream infections in United States hospitals: a three-year analysis.</a> Clin. Infect. Dis. 29, 239-244 (1999).</li><li>Ramage, G., Bachmann, S., Patterson, T. F., Wickes, B. L., Lopez-Ribot, J. L. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/query.fcgi?db=PubMed&cmd=Search&doptcmdl=Citation&defaultField=Title+Word&term=Investigation+of+multidrug+efflux+pumps+in+relation+to+fluconazole+resistance+in+Candida+albicans+biofilms.">Investigation of multidrug efflux pumps in relation to fluconazole resistance in Candida albicans biofilms.</a> J. Antimicrob. Chemother. 49, 973-980 (2002).</li><li>Srinivasan, A., Uppuluri, P., Lopez-Ribot, J., Ramasubramanian, A. K. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/query.fcgi?db=PubMed&cmd=Search&doptcmdl=Citation&defaultField=Title+Word&term=Development+of+a+High-Throughput+Candida+albicans+Biofilm+Chip.">Development of a High-Throughput Candida albicans Biofilm Chip.</a> PLoS ONE. 6, 19036-19036 (2011).</li><li>Ramage, G., Vandewalle, K., Wickes, B. L., Lopez-Ribot, J. L. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/query.fcgi?db=PubMed&cmd=Search&doptcmdl=Citation&defaultField=Title+Word&term=Characteristics+of+biofilm+formation+by+Candida+albicans.">Characteristics of biofilm formation by Candida albicans.</a> Rev. Iberoam. Micol. 18, 163-170 (2001).</li><li>Pierce, C. G. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/query.fcgi?db=PubMed&cmd=Search&doptcmdl=Citation&defaultField=Title+Word&term=A+simple+and+reproducible+96-well+plate-based+method+for+the+formation+of+fungal+biofilms+and+its+application+to+antifungal+susceptibility+testing.">A simple and reproducible 96-well plate-based method for the formation of fungal biofilms and its application to antifungal susceptibility testing.</a> Nat. Protoc. 3, 1494-1500 (2008).</li><li>Lee, M. Y. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/query.fcgi?db=PubMed&cmd=Search&doptcmdl=Citation&defaultField=Title+Word&term=Three-dimensional+cellular+microarray+for+high-throughput+toxicology+assays.">Three-dimensional cellular microarray for high-throughput toxicology assays.</a> Proc. Natl. Acad. Sci. U.S.A. 105, 59-63 (2008).</li><li>Meyerhofer, D. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/query.fcgi?db=PubMed&cmd=Search&doptcmdl=Citation&defaultField=Title+Word&term=Characteristics+of+resist+films+produced+by+spinning.">Characteristics of resist films produced by spinning.</a> Journal of Applied Physics. 49, (1978).</li><li>Ramage, G., Vande Walle, K., Wickes, B. L., Lopez-Ribot, J. L. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/query.fcgi?db=PubMed&cmd=Search&doptcmdl=Citation&defaultField=Title+Word&term=Standardized+method+for+in+vitro+antifungal+susceptibility+testing+of+Candida+albicans+biofilms.">Standardized method for in vitro antifungal susceptibility testing of Candida albicans biofilms.</a> Antimicrob. Agents Chemother. 45, 2475-2479 (2001).</li><li>Chandra, J. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/query.fcgi?db=PubMed&cmd=Search&doptcmdl=Citation&defaultField=Title+Word&term=Biofilm+formation+by+the+fungal+pathogen+Candida+albicans:+Development,+architecture,+and+drug+resistance.">Biofilm formation by the fungal pathogen Candida albicans: Development, architecture, and drug resistance.</a> Journal of Bacteriology. 183, 5385-5394 (2001).</li><li>Jabra-Rizk, M. A., Falkler, W. A., Meiller, T. F. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/query.fcgi?db=PubMed&cmd=Search&doptcmdl=Citation&defaultField=Title+Word&term=Fungal+biofilms+and+drug+resistance.">Fungal biofilms and drug resistance.</a> Emerg. Infect. Dis. 10, 14-19 (2004).</li><li>Tobudic, S., Lassnigg, A., Kratzer, C., Graninger, W., Presterl, E. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/query.fcgi?db=PubMed&cmd=Search&doptcmdl=Citation&defaultField=Title+Word&term=Antifungal+activity+of+amphotericin+B,+caspofungin+and+posaconazole+on+Candida+albicans+biofilms+in+intermediate+and+mature+development+phases.">Antifungal activity of amphotericin B, caspofungin and posaconazole on Candida albicans biofilms in intermediate and mature development phases.</a> Mycoses. 53, 208-214 (2010).</li></ol>

وقد وضعنا خلية مقرها عالية الكثافة ميكروأري]، كاليفورنيا BChip، ويتألف من وحدات التخزين نانولتر من الأغشية الحيوية المبيضات البيض. تم طباعة ميكروأري على تعديل ركائز الزجاج، والذي سمح لمرفق قوي من بقع جل الكولاجين في الوقت الذي توفر hydrophobicity اللازمة للمادة هل?...

<table border="1" style=";text-align:right;direction:rtl"><tbody><tr><td> اسم كاشف </td><td> شركة </td><td> فهرس العدد </td></tr><tr><td> 3-aminopropyltriethoxysilane (APTES) </td><td> سيغما الدريخ </td><td> 440140 </td></tr><tr><td> البوليسترين-CO-هيدرازيد الاندريد (PS-MA) </td><td> سيغما الدريخ </td><td> 426946 </td></tr><tr><td> الشرائح الزجاجية المجهر </td><td> فيشر العلمية </td><td> 12-549-3 </td></tr><tr><td> نوع الفئران الكولاجين الذيل أنا </td><td> العلوم البيولوجية دينار بحريني </td><td> 354236 </td></tr><tr><td> الروبوتية Microarrayer </td><td> Omnigrid مايكرو </td><td> MICROSYS4000/4100A </td></tr><tr><td> [ميكروأري] ماسحة </td><td> Genepix الشخصية 4100A </td><td> GENEPIX4100A </td></tr><tr><td> تهجين كاسيت </td><td> ArrayIt شركة </td><td> AHCXD </td></tr><tr><td> FUN1 [2-chloRO-4-(2،3-ثنائي هيدرو-3-الميثيل (بنزو -1،3-thiazol-2-YL)-methylidene)-1-فينيل quinoliniumiodide] </td><td> إينفيتروجن كورب </td><td> F-7030 </td></tr><tr><td> فلوكونازول </td><td> Sicor أدوية، وشركة </td><td> J02AC01 </td></tr><tr><td> الأمفوتريسين B </td><td> سيغما </td><td> A2411 </td></tr><tr><td> RPMI-1640 </td><td> Mediatech، المؤتمر الوطني العراقي. </td><td> 50-020-PC </td></tr><tr><td> السيراميك فوهة نصيحة ميكرون 190 </td><td> Digilab </td><td> 60020441-00 </td></tr><tr><td> GraphPad برامج بريزم </td><td> GraphPad البرمجيات، المؤتمر الوطني العراقي. </td><td></td></tr><tr><td> Genepix برو v4.1 لل </td><td> الجزيئية الأجهزة </td><td></td></tr></tbody></table>

candida albicans biofilm chip (cabchip) for high-throughput antifungal drug screening

المبيضات البيض يبقى العامل الرئيسي المسبب لداء المبيضات، والتي تمثل في الوقت الراهن رابع أكثر شيوعا عدوى المستشفيات مجرى الدم في مستشفيات الولايات المتحدة 1. هذه العدوى الانتهازية تشكل تهديدا متزايدا بالنسبة لعدد متزايد من الأفراد للخطر، وتحمل معدلات وفيات مرتفعة بشكل غير مقبول. هذا ويرجع ذلك جزئيا إلى ترسانة محدودة من الأدوية المضادة للفطريات، ولكن أيضا إلى ظهور مقاومة ضد وكلاء ومضاد للفطريات الأكثر شيوعا. يزيد من تعقيد العلاج هو حقيقة أن ترتبط غالبية مظاهر المبيضات مع تشكيل الأغشية الحيوية، وخلايا داخل هذه الأغشية الحيوية تظهر زيادة مستويات المقاومة للمضادات الفطور معظم سريريا المستخدمة 2. نحن هنا وصف وضع ميكروأري عالية الكثافة التي تتكون من C. المبيضة البيضاء نانو الأغشية الحيوية، والتي قمنا اسمه كا BChip 3. لفترة وجيزة، يتم استخدام microarrayer الروبوتية تيس خلايا الخميرة الطباعة من C. المبيضة البيضاء على ركيزة صلبة. أثناء الطباعة، يتم تضمين خلايا الخميرة في مصفوفة ثلاثية الأبعاد باستخدام حجم ما يصل الى 50 NL ويجمد على ركيزة الزجاج بطلاء مناسب. بعد الطباعة الأولية، وحضنت الشرائح على 37 درجة مئوية لمدة 24 ساعة للسماح للتنمية بيوفيلم. خلال هذه الفترة بقع تنمو لتصبح كاملة النمو &quot;نانو الأغشية الحيوية&quot; الذي عرض نموذجي الخصائص الهيكلية والمظهري المرتبطة جيم ناضجة المبيضة البيضاء الأغشية الحيوية (أي تعقيد الصرفية، وثلاثة الأبعاد والهندسة المعمارية المقاومة للأدوية) 4. وبشكل عام، يتكون BChip الكالسيوم من الأغشية الحيوية ما يعادل 750 ~ ومميزة مكانيا، مع ميزة إضافية التي يمكن طباعتها رقائق متعددة ومعالجتها في وقت واحد. ويقدر بقاء الخلية عن طريق قياس كثافة فلوري من FUN1 التمثيل الغذائي وصمة باستخدام ماسح ضوئي ميكروأري. يعتبر مثاليا هذه الشريحة الفطرية لأجلك ..سراج الدين في الفرز الفائق الإنتاجية الحقيقية لاكتشاف الأدوية المضادة للفطريات. بالمقارنة مع المعايير الحالية (أي لوحة microtiter 96-جيدا نموذج من تشكيل بيوفيلم 5)، والمزايا الرئيسية للرقاقة بيوفيلم الفطرية والتشغيل الآلي، والتصغير، وفورات في حجم وتكاليف الكواشف ووقت التحليلات، فضلا عن القضاء على عمل خطوات مكثفة. ونحن نعتقد أن مثل هذه رقاقة تسريع كبيرة في اكتشاف دواء مضاد للفطريات عملية.

Watch this Scientific Journal Video about Candida albicans Biofilm Chip CaBChip for High-throughput Antifungal Drug Screening at JoVE.com

Candida albicans Biofilm Chip CaBChip for High-throughput Antifungal Drug Screening

وقد وضعنا برنامجا ميكروأري عالية الكثافة التي تتألف من 3D نانو الأغشية الحيوية من<em&gt; C. المبيضة البيضاء</em&gt; دعا<em&gt; كاليفورنيا</em&gt; BChip. ملف حساسية من الأدوية اختبار على<em&gt; كاليفورنيا</em&gt; BChip هو مشابه للنموذج التقليدي لوحة 96-جيد، مما يوحي بأن يعتبر مثاليا للرقاقة الفطرية للفحص عالية الإنتاجية الحقيقية من الأدوية المضادة للفطريات.

المبيضات البيض بيوفيلم رقاقة (كاليفورنيا BChip) لالفرز الفائق الإنتاجية مضاد للمخدرات

Candida  albicans remains the main etiological agent of candidiasis, which  currently represents the fourth most common nosocomial bloodstream infection ...

Research

JoVE Journal

Bioengineering

Candida albicans Biofilm Chip (CaBChip) for High-throughput Antifungal Drug Screening

Cell-based Calcium Assay for Medium to High Throughput Screening of TRP Channel Functions using FlexStation 3

الخلية المستندة إلى الفحص الكالسيوم لمتوسطة إلى فحص وظائف إنتاجية عالية باستخدام قناة الحزب FlexStation 3

The Molecular Devices' FlexStation 3 is a benchtop multi-mode microplate reader capable of automated fluorescence measurement in multi-well plates.  It is ...

Polymer Microarrays for High Throughput Discovery of Biomaterials

[ميكروأرس] البوليمر لاكتشاف إنتاجية عالية من المواد الحيوية

The discovery of novel biomaterials that are optimized for a specific biological application is readily achieved using polymer microarrays, which allows a ...

A Rapid and Quantitative Fluorimetric Method for Protein-Targeting Small Molecule Drug Screening

A السريع والكمية Fluorimetric طريقة لاستهداف البروتين جزيء صغير فحص المخدرات

We demonstrate a new drug screening method for determining the binding affinity of small drug molecules to a target protein by forming fluorescent gold ...

Using Tomoauto: A Protocol for High-throughput Automated Cryo-electron Tomography

باستخدام Tomoauto: بروتوكول لإنتاجية عالية الآلي البرد الإلكترون التصوير المقطعي

Cryo-electron tomography (Cryo-ET) is a powerful three-dimensional (3-D) imaging technique for visualizing macromolecular complexes in their native ...

A Microfluidic Platform for High-throughput Single-cell Isolation and Culture

ومنصة ميكروفلويديك لعزل وحيدة الخلية عالية الإنتاجية والثقافة

Studying the heterogeneity of single cells is crucial for many biological questions, but is technically difficult. Thus, there is a need for a simple, yet ...

High-throughput Identification of Bacteria Repellent Polymers for Medical Devices

عالية الإنتاجية تحديد البكتيريا البوليمرات طارد للمستلزمات الطبية

Medical devices are often associated with hospital-acquired infections, which place enormous strain on patients and the healthcare system as well as ...

Automated Contraction Analysis of Human Engineered Heart Tissue for Cardiac Drug Safety Screening

تحليل الآلي تقلص الإنسان المهندسة القلب الأنسجة للفحص القلب سلامة الأدوية

Cardiac tissue engineering describes techniques to constitute three dimensional force-generating engineered tissues. For the implementation of these ...

3D Microtissues for Injectable Regenerative Therapy and High-throughput Drug Screening

ميكروتيسويس 3D للعلاج عن طريق الحقن بالتجدد وفحص المخدرات الفائق

To upgrade traditional 2D cell culture to 3D cell culture, we have integrated microfabrication with cryogelation technology to produce macroporous ...

Use of High-Throughput Automated Microbioreactor System for Production of Model IgG1 in CHO Cells

نظام ميكروبيوريكتور لإنتاج IgG1 النموذجي في الخلايا شو الآلي استخدام الفائق

Automated microscale bioreactors (15 mL) can be a useful tool for cell culture engineers. They facilitate the simultaneous execution of a wide variety of ...

Applications for Open Source Microplate-Compatible Illumination Panels

تطبيقات للواح الاضاءه المتوافقة مع اللوحة المفتوحة المصدر

Microplates are commonly used in the modern laboratory environment for a wide variety of tasks both in small-scale laboratory benchtop operations as well ...