Name: high-throughput protein expression generator using a microfluidic platform
Uploaded: 2012-08-23T12:00:00
Description: Watch this Scientific Journal Video about High-throughput Protein Expression Generator Using a Microfluidic Platform at JoVE.com

وأيد هذا العمل من قبل منحة ماري كوري لإعادة الإدماج.

1. جهاز التصنيع <ol style=";text-align:right;direction:rtl"><li style=";text-align:right;direction:rtl"> اشترى DTPA SU-D-8 العفن والعفن تحكم SPR220-7 من تدفق الموائع الدقيقة microfluidics مسبك ستانفورد ( <a href="http://www.stanford.edu/group/foundry" target="_blank">www.stanford.edu / مجموعة / مسبك</a> ). </li><li style=";text-align:right;direction:rtl"> كشف قوالب سيليكون لchlorotrimethylsi...

<ol>
	<li>Maerkl, S. J. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/query.fcgi?db=PubMed&cmd=Search&doptcmdl=Citation&defaultField=Title+Word&term=Integration+column:+Microfluidic+high-throughput+screening.">Integration column: Microfluidic high-throughput screening.</a> Integrative biology quantitative biosciences from nano to macro. 1, 19-29 (2009).</li><li>Hong, J. W., Quake, S. R. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/query.fcgi?db=PubMed&cmd=Search&doptcmdl=Citation&defaultField=Title+Word&term=Integrated+nanoliter+systems.">Integrated nanoliter systems.</a> Nature. 21, 1179-1183 (2003).</li><li>Unger, M. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/query.fcgi?db=PubMed&cmd=Search&doptcmdl=Citation&defaultField=Title+Word&term=A+Monolithic+Microfabricated+Valves+and+Pumps+by+Multilayer+Soft+Lithography.">A Monolithic Microfabricated Valves and Pumps by Multilayer Soft Lithography.</a> Science. 288, 113-116 (2000).</li><li>Gerber, D., Maerkl, S. J., Quake, S. R. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/query.fcgi?db=PubMed&cmd=Search&doptcmdl=Citation&defaultField=Title+Word&term=An+in+vitro+microfluidic+approach+to+generating+protein-interaction+networks.">An in vitro microfluidic approach to generating protein-interaction networks.</a> Nature. 6, 71-74 (2009).</li><li>Einav, S. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/query.fcgi?db=PubMed&cmd=Search&doptcmdl=Citation&defaultField=Title+Word&term=Discovery+of+a+hepatitis+C+target+and+its+pharmacological+inhibitors+by+microfluidic+affinity+analysis.">Discovery of a hepatitis C target and its pharmacological inhibitors by microfluidic affinity analysis.</a> Nature. 26, 1019-1027 (2008).</li><li>Fordyce, P. M. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/query.fcgi?db=PubMed&cmd=Search&doptcmdl=Citation&defaultField=Title+Word&term=De+novo+identification+and+biophysical+characterization+of+transcription-factor+binding+sites+with+microfluidic+affinity+analysis.">De novo identification and biophysical characterization of transcription-factor binding sites with microfluidic affinity analysis.</a> Nature Biotechnology. 28, 962-967 (2010).</li><li>Zhu, H. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/query.fcgi?db=PubMed&cmd=Search&doptcmdl=Citation&defaultField=Title+Word&term=Global+analysis+of+protein+activities+using+proteome+chips.">Global analysis of protein activities using proteome chips.</a> Science (New York, N.Y.). 293, 2101-2105 (2001).</li><li>Ramachandran, N. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/query.fcgi?db=PubMed&cmd=Search&doptcmdl=Citation&defaultField=Title+Word&term=Self-assembling+protein+microarrays.">Self-assembling protein microarrays.</a> Science (New York, N.Y.). 305, 86-90 (2004).</li><li>Zhong, J. F. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/query.fcgi?db=PubMed&cmd=Search&doptcmdl=Citation&defaultField=Title+Word&term=A+microfluidic+processor+for+gene+expression+profiling+of+single+human+embryonic+stem+cells.">A microfluidic processor for gene expression profiling of single human embryonic stem cells.</a> Lab on a chip. 8, 68-74 (2008).</li><li>Kusnezow, W., Hoheisel, J. D. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/query.fcgi?db=PubMed&cmd=Search&doptcmdl=Citation&defaultField=Title+Word&term=Solid+supports+for+microarray+immunoassays.">Solid supports for microarray immunoassays.</a> Journal of molecular recognition JMR. 16, 165-176 (2003).</li><li>Lundin, M., Monne, M., Widell, A., Von Heijne, G., Persson, M. A. A. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/query.fcgi?db=PubMed&cmd=Search&doptcmdl=Citation&defaultField=Title+Word&term=Topology+of+the+membrane-associated+hepatitis+C+virus+protein+NS4B.">Topology of the membrane-associated hepatitis C virus protein NS4B.</a> Journal of virology. 77, 5428 (2003).</li></ol>

في هذه الورقة نقدم طريقة لتوليد البروتين صفائف في الإنتاجية العالية باستخدام منصة ميكروفلويديك. ويستند الجيل مجموعة على الطباعة من القوالب ميكروأري DNA والبروتين في التعبير عن DNA داخل جهاز ميكروفلويديك. برنامجنا ميكروفلويد?...

<table border="1" style=";text-align:right;direction:rtl"><tbody><tr><td> كاشف / معدات </td><td> شركة </td><td> كتالوج رقم </td></tr><tr><td> PDMS-184 SYLGARD </td><td> داو كورنينج USA </td><td> ESSEX-DC </td></tr><tr><td> Chlorotrimethylsilane (TMCS </td><td> سيغما الدريخ </td><td> C72854 </td></tr><tr><td> ركائز الزجاج المطلي الايبوكسي </td><td> CEL المنتسبين USA </td><td> VEPO-25C </td></tr><tr><td> البولي إثيلين glycole (PEG) </td><td> سيغما الدريخ </td><td> 81260 </td></tr><tr><td> D-طرهالوز تبلور </td><td> سيغما الدريخ </td><td> T9531 </td></tr><tr><td> المعقدة البيروكسيديز-BSA </td><td> خرق </td><td> PIR-29130 </td></tr><tr><td> Neutravidin </td><td> خرق </td><td> 31050 </td></tr><tr><td> خماسي صاحب-البيوتين </td><td> QIAGEN </TD&gt; <td> 34440 </td></tr><tr><td> HEPES </td><td> <a href="http://www.bioind.com/htmls/article.aspx?c0=741&amp;bsp=13384" target="_blank">صناعات البيولوجية</a> </td><td> 03-025-1B </td></tr><tr><td> TNT-T7 </td><td> Promega </td><td> L5540 </td></tr><tr><td> C-MYC Cy3 الأجسام المضادة </td><td> سيغما الدريخ </td><td></td></tr><tr><td> تحكم مربع </td><td> ستانفورد على microfluidics مسبك </td><td></td></tr><tr><td> قالب </td><td> ستانفورد على microfluidics مسبك </td><td></td></tr><tr><td> دبوس </td><td> نيو انغلاند الصغيرة أنابيب شركة </td><td></td></tr><tr><td> Tygon microbore أنابيب </td><td> Tygon </td><td> S-54-HL </td></tr><tr><td> Microarrayer </td><td> الروبوتات الحيوية </td><td> MicroGrid 610 </td></tr><tr><td> سيليكون دبابيس </td><td> بالتوازي SYNأطروحة </td><td> SMT-S75 </td></tr></tbody></table>

high-throughput protein expression generator using a microfluidic platform

الحقول يتزايد بسرعة، مثل علم الأحياء النظم، تتطلب وضع وتنفيذ تكنولوجيات جديدة، وتمكين قياسات عالية الإنتاجية وارتفاع الإخلاص، نظم كبيرة. على microfluidics وعود لتحقيق العديد من هذه المتطلبات، مثل إجراء التجارب الفرز الفائق الإنتاجية على الرقاقة، والتي تشمل فحوصات الكيمياء الحيوية، والفيزياء الحيوية، ومقرها الخلية-1. منذ الأيام الأولى من أجهزة على microfluidics، وقد تطورت بشكل كبير هذا المجال، مما يؤدي إلى تطوير التكامل على نطاق واسع ميكروفلويديك 2،3. هذه التكنولوجيا تسمح لإدماج الآلاف من الصمامات الميكرو ميكانيكية على جهاز واحد مع بصمة البريد الحجم (الشكل 1). قمنا بتطوير منصة عالية الإنتاجية لتوليد ميكروفلويديك في المختبر من صفائف التعبير البروتين (الشكل 2) اسمه PING (مولد الشبكة بروتين التفاعل). يمكن لهذه المصفوفات تخدم كنموذج لتجارب العديد منمثل البروتين البروتين 4، البروتين RNA 5 أو 6 DNA البروتين التفاعلات. الجهاز يتكون من آلاف من غرف رد فعل، والتي مبرمجة بشكل فردي باستخدام microarrayer. التوفيق بين هذه المطبوعة إلى ميكروأرس برامج الأجهزة على microfluidics كل غرفة مع بقعة واحدة القضاء على التلوث المحتملة أو عبر التفاعل-علاوة على ذلك، باستخدام تقنيات توليد ميكروأرس ميكروأري القياسية اكتشاف هو أيضا وحدات للغاية، مما يسمح للarraying من البروتينات 7، DNA 8، جزيئات صغيرة، والمعلقات حتى الغروية. الأثر المحتمل للعلوم البيولوجية على microfluidics على أمر مهم. وقد قدم عدد من فحوصات على microfluidics القائمة بالفعل رؤى جديدة في هيكل ووظيفة النظم البيولوجية، وميدان على microfluidics سوف تظل تؤثر البيولوجيا.

Watch this Scientific Journal Video about High-throughput Protein Expression Generator Using a Microfluidic Platform at JoVE.com

High-throughput Protein Expression Generator Using a Microfluidic Platform

نقدم نهج ميكروفلويديك للتعبير عن المصفوفات البروتين. الجهاز يتكون من آلاف من الدوائر التي تسيطر عليها رد فعل الصغيرة الميكانيكية الصمامات. تزاوج الجهاز ميكروفلويديك إلى مكتبة الجينات ميكروأري المطبوعة. وكتب بعد ذلك هذه الجينات وترجمتها على الرقاقة، مما أدى إلى مجموعة البروتين جاهزة للاستخدام التجريبي.

عالية الإنتاجية مولد بروتين تعبير باستخدام منصة ميكروفلويديك

Rapidly increasing fields, such as systems biology, require the development and implementation of new technologies, enabling high-throughput and ...

Research

JoVE Journal

Bioengineering

CometChip: A High-throughput 96-Well Platform for Measuring DNA Damage in Microarrayed Human Cells

CometChip: إنتاجية عالية منصة 96-حسنا لقياس الحمض النووي من التلف في خلايا الإنسان Microarrayed

DNA damaging agents can promote aging, disease and cancer and they are ubiquitous in the environment and produced within human cells as normal cellular ...

High Throughput Microfluidic Rapid and Low Cost Prototyping Packaging Methods

عالية الإنتاجية ميكروفلويديك السريع وانخفاض تكلفة النماذج طرق التعبئة والتغليف

In this work, 3 different packaging and assembly techniques are presented. They can be classified into two categories: one-time use and reusable packaging ...

Cell Squeezing as a Robust, Microfluidic Intracellular Delivery Platform

الضغط خلية باعتبارها قوية، ميكروفلويديك بين الخلايا توصيل منصة

Rapid mechanical deformation of cells has emerged as a promising, vector-free method for intracellular delivery of macromolecules and nanomaterials. This ...

Use of a High-throughput In Vitro Microfluidic System to Develop Oral Multi-species Biofilms

Use of a High-throughput In Vitro Microfluidic System to Develop Oral Multi-species Biofilms

استخدام إنتاجية عالية<em&gt; في المختبر</em&gt; نظام ميكروفلويديك لتطوير الأغشية الحيوية متعدد الأنواع عن طريق الفم

There are few high-throughput in vitro systems which facilitate the development of multi-species biofilms that contain numerous species commonly detected ...

A Microfluidic Platform for High-throughput Single-cell Isolation and Culture

ومنصة ميكروفلويديك لعزل وحيدة الخلية عالية الإنتاجية والثقافة

Studying the heterogeneity of single cells is crucial for many biological questions, but is technically difficult. Thus, there is a need for a simple, yet ...

A High-throughput Cell Microarray Platform for Correlative Analysis of Cell Differentiation and Traction Forces

وإنتاجية عالية منصة ميكروأري الخليوي لتحليل مترابط من تمايز الخلايا وقوات الجر

Microfabricated cellular microarrays, which consist of contact-printed combinations of biomolecules on an elastic hydrogel surface, provide a tightly ...

A Microfluidic Platform for Longitudinal Imaging in Caenorhabditis elegans

A Microfluidic Platform for Longitudinal Imaging in Caenorhabditis elegans

منصة موائع جزيئية "التصوير الطولي" في ايليجانس كاينورهابديتيس

In the last decade, microfluidic techniques have been applied to study small animals, including the nematode Caenorhabditis elegans, and have proved ...

A Multilayer Microfluidic Platform for the Conduction of Prolonged Cell-Free Gene Expression

منصة ميكروفلويدريك متعددة الطبقات لتوصيل التعبير الجيني الخالي من الخلايا لفترات طويلة

The limitations of cell-based synthetic biology are becoming increasingly apparent as researchers aim to develop larger and more complex synthetic genetic ...

A Microfluidic Platform for Stimulating Chondrocytes with Dynamic Compression

منصة ميكروفلويديك لتحفيز الخلايا الغضروفية مع الضغط الديناميكي

Mechanical stimuli are known to modulate biological functions of cells and tissues. Recent studies have suggested that compressive stress alters growth ...

High-Throughput Identification of Resistance to Pseudomonas syringae pv. Tomato in Tomato using Seedling Flood Assay

High-Throughput Identification of Resistance to Pseudomonas syringae pv. Tomato in Tomato using Seedling Flood Assay

تعريف عالي الإنتاجية للمقاومة لـ Pseudomonas syringae pv. الطماطم في الطماطم باستخدام الشتلات الفيضانات أساي

Tomato is an agronomically important crop that can be infected by Pseudomonas syringae, a Gram-negative bacterium, resulting in bacterial speck disease. ...