Name: high-throughput protein expression generator using a microfluidic platform
Uploaded: 2012-08-23T12:00:00
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1. 장치 제작 <ol><li> 스탠포드 Microfluidics 주조 (에서 DTPA-D SU-8 제어 금형 및 SPR220-7 흐름 금형 구입 <a href="http://www.stanford.edu/group/foundry" target="_blank">www.stanford.edu / 그룹 / 주물을</a> ). </li><li> 베이킹 단계 9시 엘라스토머 자료를 홍보하기 위해 10 분 동안 chlorotrimethylsilane (TMCS) 증기로 실리콘 금형을 쉽게받을 수 있습니다. </li><li> 두 개의 서로 다른 비율 각각 5시 1분과 제어 및 흐름 금형에 대...

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	<li>Maerkl, S. J. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/query.fcgi?db=PubMed&cmd=Search&doptcmdl=Citation&defaultField=Title+Word&term=Integration+column:+Microfluidic+high-throughput+screening.">Integration column: Microfluidic high-throughput screening.</a> Integrative biology quantitative biosciences from nano to macro. 1, 19-29 (2009).</li><li>Hong, J. W., Quake, S. R. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/query.fcgi?db=PubMed&cmd=Search&doptcmdl=Citation&defaultField=Title+Word&term=Integrated+nanoliter+systems.">Integrated nanoliter systems.</a> Nature. 21, 1179-1183 (2003).</li><li>Unger, M. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/query.fcgi?db=PubMed&cmd=Search&doptcmdl=Citation&defaultField=Title+Word&term=A+Monolithic+Microfabricated+Valves+and+Pumps+by+Multilayer+Soft+Lithography.">A Monolithic Microfabricated Valves and Pumps by Multilayer Soft Lithography.</a> Science. 288, 113-116 (2000).</li><li>Gerber, D., Maerkl, S. J., Quake, S. R. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/query.fcgi?db=PubMed&cmd=Search&doptcmdl=Citation&defaultField=Title+Word&term=An+in+vitro+microfluidic+approach+to+generating+protein-interaction+networks.">An in vitro microfluidic approach to generating protein-interaction networks.</a> Nature. 6, 71-74 (2009).</li><li>Einav, S. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/query.fcgi?db=PubMed&cmd=Search&doptcmdl=Citation&defaultField=Title+Word&term=Discovery+of+a+hepatitis+C+target+and+its+pharmacological+inhibitors+by+microfluidic+affinity+analysis.">Discovery of a hepatitis C target and its pharmacological inhibitors by microfluidic affinity analysis.</a> Nature. 26, 1019-1027 (2008).</li><li>Fordyce, P. M. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/query.fcgi?db=PubMed&cmd=Search&doptcmdl=Citation&defaultField=Title+Word&term=De+novo+identification+and+biophysical+characterization+of+transcription-factor+binding+sites+with+microfluidic+affinity+analysis.">De novo identification and biophysical characterization of transcription-factor binding sites with microfluidic affinity analysis.</a> Nature Biotechnology. 28, 962-967 (2010).</li><li>Zhu, H. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/query.fcgi?db=PubMed&cmd=Search&doptcmdl=Citation&defaultField=Title+Word&term=Global+analysis+of+protein+activities+using+proteome+chips.">Global analysis of protein activities using proteome chips.</a> Science (New York, N.Y.). 293, 2101-2105 (2001).</li><li>Ramachandran, N. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/query.fcgi?db=PubMed&cmd=Search&doptcmdl=Citation&defaultField=Title+Word&term=Self-assembling+protein+microarrays.">Self-assembling protein microarrays.</a> Science (New York, N.Y.). 305, 86-90 (2004).</li><li>Zhong, J. F. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/query.fcgi?db=PubMed&cmd=Search&doptcmdl=Citation&defaultField=Title+Word&term=A+microfluidic+processor+for+gene+expression+profiling+of+single+human+embryonic+stem+cells.">A microfluidic processor for gene expression profiling of single human embryonic stem cells.</a> Lab on a chip. 8, 68-74 (2008).</li><li>Kusnezow, W., Hoheisel, J. D. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/query.fcgi?db=PubMed&cmd=Search&doptcmdl=Citation&defaultField=Title+Word&term=Solid+supports+for+microarray+immunoassays.">Solid supports for microarray immunoassays.</a> Journal of molecular recognition JMR. 16, 165-176 (2003).</li><li>Lundin, M., Monne, M., Widell, A., Von Heijne, G., Persson, M. A. A. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/query.fcgi?db=PubMed&cmd=Search&doptcmdl=Citation&defaultField=Title+Word&term=Topology+of+the+membrane-associated+hepatitis+C+virus+protein+NS4B.">Topology of the membrane-associated hepatitis C virus protein NS4B.</a> Journal of virology. 77, 5428 (2003).</li></ol>

이 논문에서 우리는 마이크로 유체 플랫폼을 사용 높은 처리량의 생성 단백질 배열을위한 방법을 제시한다. 배열 생성은 DNA 템플릿 microarray 인쇄와 마이크로 유체 장치 내의 DNA에서 체외 단백질 발현에 기반을두고 있습니다. 우리 소설 마이크로 유체 플랫폼은 단백질 체학을위한 유망 및 일반 툴을 만들 현재 사용 방법을 통해 몇 가지 중요한 장점을 가지고 있습니다....

<table border="1"><tbody><tr><td> 시약 / 장비 </td><td> 회사 </td><td> 카탈로그 번호 </td></tr><tr><td> PDMS-SYLGARD 184 </td><td> 다우 코닝 USA </td><td> 섹스-DC </td></tr><tr><td> Chlorotrimethylsilane (TMCS </td><td> 시그마 - 알드리치 </td><td> C72854 </td></tr><tr><td> 에폭시 코팅 유리 기판 </td><td> CEL 제휴 USA </td><td> VEPO-25C </td></tr><tr><td> 폴리 에틸렌 glycole (PEG) </td><td> 시그마 - 알드리치 </td><td> 81,260 </td></tr><tr><td> D-trehalose 이수화 </td><td> 시그마 - 알드리치 </td><td> T9531 </td></tr><tr><td> Biotinylated-BSA </td><td> 찌르다 </td><td> PIR-29130 </td></tr><tr><td> Neutravidin </td><td> 찌르다 </td><td> 31,050 </td></tr><tr><td> 펜타 - 그의 - 비오틴 </td><td> Qiagen </TD&gt; <td> 34,440 </td></tr><tr><td> Hepes </td><td> <a href="http://www.bioind.com/htmls/article.aspx?c0=741&amp;bsp=13384" target="_blank">생물 산업</a> </td><td> 03-025 - 1B </td></tr><tr><td> TNT-T7 </td><td> Promega </td><td> L5540 </td></tr><tr><td> C-myc Cy3 항체 </td><td> 시그마 - 알드리치 </td><td></td></tr><tr><td> 컨트롤 박스 </td><td> 스탠포드 Microfluidics 주조 </td><td></td></tr><tr><td> 곰팡이 </td><td> 스탠포드 Microfluidics 주조 </td><td></td></tr><tr><td> 핀 </td><td> 뉴 잉글랜드 작은 튜브 주식회사 </td><td></td></tr><tr><td> Tygon microbore 관 </td><td> Tygon </td><td> S-54-HL </td></tr><tr><td> Microarrayer </td><td> 바이오 로봇 </td><td> MicroGrid 610 </td></tr><tr><td> 실리콘 핀 </td><td> 병렬 SYN명제 </td><td> SMT-S75 </td></tr></tbody></table>

high-throughput protein expression generator using a microfluidic platform

이러한 시스템 생물학 등 급속도로 증가 분야는 대규모 시스템의 높은 처리량 및 고 충실도 측정을 가능하게하는 새로운 기술의 개발과 구현을 필요로합니다. Microfluidics는 생화학 biophysical 및 셀 기반 assays에게 1 포괄 같은 칩에 높은 처리량 검사 실험을 수행으로 이러한 요구 사항의 많은 부분을 수행하기 위해 약속드립니다. microfluidics 장치의 초기부터,이 필드는 크게 마이크로 대규모 통합 2,3의 개발로 이어지는, 발전하고 있습니다. 이 기술은 우표 크기의 풋 프린트 (그림 1) 단일 장치에 micromechanical 밸브의 수천의 통합 할 수 있습니다. 우리는 PING (단백질 상호 작용 네트워크 생성기)이라는 단백질 어레이 (그림 2)의 체외 식에 생성하기위한 높은 처리량 마이크로 유체 플랫폼을 개발했습니다. 이러한 배열은 많은 실험을위한 템플릿으로 제공 할 수같은 단백질 단백질 4, 단백질 RNA 5 단백질 DNA 상호 작용 6. 이 장치는 개별적으로 microarrayer를 사용하여 프로그램되어 반응 챔버의 수천으로 구성되어 있습니다. 표준 microarray 야생 기술을 사용하여 microarrays를 생성, 또한 잠재적 인 오염 또는 교차 반응성을 제거 하나의 장소로 microfluidics 장치 프로그램에 이러한 인쇄 microarrays의 각 방을 정렬하면, 단백질 7, DNA 8, 작은 분자의 arraying을 허용하는, 매우 모듈입니다 심지어 콜로이드 현탁액. 생물 과학에 microfluidics의 잠재적 인 영향은 중요하다. microfluidics 기반 assays의 수는 이미 생물학적 시스템의 구조와 기능에 새로운 통찰력을 제공하고, microfluidics 분야는 생물에 영향을 할 것입니다.

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High-throughput Protein Expression Generator Using a Microfluidic Platform

우리는 단백질 배열의 표현을위한 마이크로 유체 접근 방식을 제시한다. 이 장치는 마이크로 기계 밸브에 의해 제어 반응 챔버의 수천으로 구성되어 있습니다. 마이크로 유체 장치는 microarray 인쇄 유전자 도서관에 결합되어 있습니다. 이러한 유전자 그런 다음 베꼈 및 실험 사용할 준비가 단백질 배열의 결과로, 칩에 번역되어 있습니다.

마이크로 유체 플랫폼을 사용하여 높은 처리량 단백질 표현 생성기

Rapidly increasing fields, such as systems biology, require the development and implementation of new technologies, enabling high-throughput and ...

Research

JoVE Journal

Bioengineering

CometChip: A High-throughput 96-Well Platform for Measuring DNA Damage in Microarrayed Human Cells

CometChip : Microarrayed 인간의 세포에서 DNA 손상을 측정하기위한 높은 처리량 96 글쎄 플랫폼

DNA damaging agents can promote aging, disease and cancer and they are ubiquitous in the environment and produced within human cells as normal cellular ...

연구

생체공학

High Throughput Microfluidic Rapid and Low Cost Prototyping Packaging Methods

높은 처리량 마이크로 유체 신속하고 저렴한 비용으로 프로토 타입 포장 방법

In this work, 3 different packaging and assembly techniques are presented. They can be classified into two categories: one-time use and reusable packaging ...

Cell Squeezing as a Robust, Microfluidic Intracellular Delivery Platform

강력한, 미세 유체 세포 내 전달 플랫폼으로 휴대 뒤쪽에서

Rapid mechanical deformation of cells has emerged as a promising, vector-free method for intracellular delivery of macromolecules and nanomaterials. This ...

Use of a High-throughput In Vitro Microfluidic System to Develop Oral Multi-species Biofilms

Use of a High-throughput In Vitro Microfluidic System to Develop Oral Multi-species Biofilms

높은 처리량의 사용<em&gt; 체외</em&gt; 미세 유체 시스템 구강 다중 종의 바이오 필름을 개발하는

There are few high-throughput in vitro systems which facilitate the development of multi-species biofilms that contain numerous species commonly detected ...

A Microfluidic Platform for High-throughput Single-cell Isolation and Culture

높은 처리량 단일 세포의 분리 및 문화를위한 미세 유체 플랫폼

Studying the heterogeneity of single cells is crucial for many biological questions, but is technically difficult. Thus, there is a need for a simple, yet ...

A High-throughput Cell Microarray Platform for Correlative Analysis of Cell Differentiation and Traction Forces

세포 분화 및 견인 힘의 상관 관계 분석을위한 높은 처리량 세포 마이크로 어레이 플랫폼

Microfabricated cellular microarrays, which consist of contact-printed combinations of biomolecules on an elastic hydrogel surface, provide a tightly ...

A Microfluidic Platform for Longitudinal Imaging in Caenorhabditis elegans

A Microfluidic Platform for Longitudinal Imaging in Caenorhabditis elegans

꼬마 선 충 에 경도 이미징을 위한 미세 플랫폼

In the last decade, microfluidic techniques have been applied to study small animals, including the nematode Caenorhabditis elegans, and have proved ...

A Multilayer Microfluidic Platform for the Conduction of Prolonged Cell-Free Gene Expression

장기간 무세포 유전자 발현의 전도를 위한 다층 미세유체 플랫폼

The limitations of cell-based synthetic biology are becoming increasingly apparent as researchers aim to develop larger and more complex synthetic genetic ...

A Microfluidic Platform for Stimulating Chondrocytes with Dynamic Compression

동적 압축으로 연골 세포 자극을 위한 미세 유체 플랫폼

Mechanical stimuli are known to modulate biological functions of cells and tissues. Recent studies have suggested that compressive stress alters growth ...

High-Throughput Identification of Resistance to Pseudomonas syringae pv. Tomato in Tomato using Seedling Flood Assay

High-Throughput Identification of Resistance to Pseudomonas syringae pv. Tomato in Tomato using Seedling Flood Assay

슈도모나스 주사기 pv에 대한 저항의 높은 처리량 식별. 모종 홍수 분석을 사용하여 토마토토마토

Tomato is an agronomically important crop that can be infected by Pseudomonas syringae, a Gram-negative bacterium, resulting in bacterial speck disease. ...