Rilevazione di batteri utilizzando DNAzimi fluorogenici

Abbiamo recentemente riportato un nuovo approccio per generare sonde DNAzyme fluorogenici che possono essere applicati per impostare un semplice, "mix-e-leggere" test di fluorescenza per la rilevazione batterica. Queste sonde di DNA specifiche catalizzare il clivaggio di un cromoforo-modificato DNA-RNA chimerico substrato in presenza della miscela grezza extracellulare (CEM) prodotta da un batterio specifico, così traducendo rilevamento batterica nella generazione del segnale di fluorescenza. In questa relazione si descrivono principali procedure sperimentali in cui è occupato di una sonda specifica indicata DNAzyme "RFD-EC1" per il rilevamento del batterio del modello, Escherichia coli (E. coli).