Name: two methods of heterokaryon formation to discover hcv restriction factors
Uploaded: 2012-07-16T12:00:00
Description: Watch this Scientific Journal Video about Two Methods of Heterokaryon Formation to Discover HCV Restriction Factors at JoVE.com

Biz Takaji Wakita sırasıyla JFH1 ve J6CF izolatlar için Jens Bukh, minnettarız. Ayrıca biz Charles Huh-7.5 hücreler için Rice ve 9E10 antikor, E2-spesifik antikor CBH-23 Steven Foung ve Deneysel Viroloji, faydalı öneri ve tartışmalar için Twincore Bölümü tüm üyelerine teşekkür ediyorum.

PEG ile Hücre Fusion 1. Hücre Kültürü <ol><li> Kültür Huh-7.5, HeLa ve DMEM komple (DMEM cplt) orta 15 cm hücre kültüründe yemekler naif veya ambalaj hücre hatları 12 Hep56.1D, DMEM 2 mM L-glutamin, 1x olmayan amino asitler, 100 ile takviye U / mL penisilin, 100 ug / ml streptomisin ve% 10 fetal dana serumu. Tablo 1&#39;de belirtilen stabil hücre hatları uygun seçimi uygulayın. </li></ol> 2. HCV RNA Transfeksiyon <ol><li> ...

<ol>
	<li>Zhu, Q., Guo, J. T., Seeger, C. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/query.fcgi?db=PubMed&cmd=Search&doptcmdl=Citation&defaultField=Title+Word&term=Replication+of+hepatitis+C+virus+subgenomes+in+nonhepatic+epithelial+and+mouse+hepatoma+cells.">Replication of hepatitis C virus subgenomes in nonhepatic epithelial and mouse hepatoma cells.</a> J. Virol. 77, 9204-9210 (2003).</li><li>Kato, T. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/query.fcgi?db=PubMed&cmd=Search&doptcmdl=Citation&defaultField=Title+Word&term=Nonhepatic+cell+lines+HeLa+and+293+support+efficient+replication+of+the+hepatitis+C+virus+genotype+2a+subgenomic+replicon.">Nonhepatic cell lines HeLa and 293 support efficient replication of the hepatitis C virus genotype 2a subgenomic replicon.</a> J. Virol. 79, 592-596 (2005).</li><li>Ali, S., Pellerin, C., Lamarre, D., Kukolj, G. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/query.fcgi?db=PubMed&cmd=Search&doptcmdl=Citation&defaultField=Title+Word&term=Hepatitis+C+virus+subgenomic+replicons+in+the+human+embryonic+kidney+293+cell+line.">Hepatitis C virus subgenomic replicons in the human embryonic kidney 293 cell line.</a> J. Virol. 78, 491-501 (2004).</li><li>Date, T. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/query.fcgi?db=PubMed&cmd=Search&doptcmdl=Citation&defaultField=Title+Word&term=Genotype+2a+hepatitis+C+virus+subgenomic+replicon+can+replicate+in+HepG2+and+IMY-N9+cells.">Genotype 2a hepatitis C virus subgenomic replicon can replicate in HepG2 and IMY-N9 cells.</a> J. Biol. Chem. 279, 22371-22376 (2004).</li><li>Chang, K. S. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/query.fcgi?db=PubMed&cmd=Search&doptcmdl=Citation&defaultField=Title+Word&term=Replication+of+hepatitis+C+virus+(HCV)+RNA+in+mouse+embryonic+fibroblasts:+protein+kinase+R+(PKR)-dependent+and+PKR-independent+mechanisms+for+controlling+HCV+RNA+replication+and+mediating+interferon+activities.">Replication of hepatitis C virus (HCV) RNA in mouse embryonic fibroblasts: protein kinase R (PKR)-dependent and PKR-independent mechanisms for controlling HCV RNA replication and mediating interferon activities.</a> J. Virol. 80, 7364-7374 (2006).</li><li>Zhong, J. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/query.fcgi?db=PubMed&cmd=Search&doptcmdl=Citation&defaultField=Title+Word&term=Robust+hepatitis+C+virus+infection+in+vitro.">Robust hepatitis C virus infection in vitro.</a> Proc. Natl. Acad. Sci. U.S.A. 102, 9294-9299 (2005).</li><li>Lindenbach, B. D. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/query.fcgi?db=PubMed&cmd=Search&doptcmdl=Citation&defaultField=Title+Word&term=Complete+replication+of+hepatitis+C+virus+in+cell+culture.">Complete replication of hepatitis C virus in cell culture.</a> Science. 309, 623-626 (2005).</li><li>Wakita, T. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/query.fcgi?db=PubMed&cmd=Search&doptcmdl=Citation&defaultField=Title+Word&term=Production+of+infectious+hepatitis+C+virus+in+tissue+culture+from+a+cloned+viral+genome.">Production of infectious hepatitis C virus in tissue culture from a cloned viral genome.</a> Nat. Med. 11, 791-796 (2005).</li><li>Witteveldt, J. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/query.fcgi?db=PubMed&cmd=Search&doptcmdl=Citation&defaultField=Title+Word&term=CD81+is+dispensable+for+hepatitis+C+virus+cell-to-cell+transmission+in+hepatoma+cells.">CD81 is dispensable for hepatitis C virus cell-to-cell transmission in hepatoma cells.</a> J. Gen. Virol. 90, 48-58 (2009).</li><li>Bitzegeio, J. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/query.fcgi?db=PubMed&cmd=Search&doptcmdl=Citation&defaultField=Title+Word&term=Adaptation+of+hepatitis+C+virus+to+mouse+CD81+permits+infection+of+mouse+cells+in+the+absence+of+human+entry+factors.">Adaptation of hepatitis C virus to mouse CD81 permits infection of mouse cells in the absence of human entry factors.</a> PLoS Pathog. 6, e1000978 (2010).</li><li>Lindemann, D., Goepfert, P. A. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/query.fcgi?db=PubMed&cmd=Search&doptcmdl=Citation&defaultField=Title+Word&term=The+foamy+virus+envelope+glycoproteins.">The foamy virus envelope glycoproteins.</a> Curr Top Microbiol Immunol. 277, 111-129 (2003).</li><li>Brohm, C. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/query.fcgi?db=PubMed&cmd=Search&doptcmdl=Citation&defaultField=Title+Word&term=Characterization+of+determinants+important+for+hepatitis+C+virus+p7+function+in+morphogenesis+by+using+trans-complementation.">Characterization of determinants important for hepatitis C virus p7 function in morphogenesis by using trans-complementation.</a> J. Virol. 83, 11682-11693 (2009).</li><li>Steinmann, E., Brohm, C., Kallis, S., Bartenschlager, R., Pietschmann, T. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/query.fcgi?db=PubMed&cmd=Search&doptcmdl=Citation&defaultField=Title+Word&term=Efficient+trans-encapsidation+of+hepatitis+C+virus+RNAs+into+infectious+virus-like+particles.">Efficient trans-encapsidation of hepatitis C virus RNAs into infectious virus-like particles.</a> J. Virol. 82, 7034-7046 (2008).</li><li>Koutsoudakis, G. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/query.fcgi?db=PubMed&cmd=Search&doptcmdl=Citation&defaultField=Title+Word&term=Characterization+of+the+early+steps+of+hepatitis+C+virus+infection+by+using+luciferase+reporter+viruses.">Characterization of the early steps of hepatitis C virus infection by using luciferase reporter viruses.</a> J. Virol. 80, 5308-5320 (2006).</li><li>Frentzen, A. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/query.fcgi?db=PubMed&cmd=Search&doptcmdl=Citation&defaultField=Title+Word&term=Completion+of+hepatitis+C+virus+replication+cycle+in+heterokaryons+excludes+dominant+restrictions+in+human+non-liver+and+mouse+liver+cell+lines.">Completion of hepatitis C virus replication cycle in heterokaryons excludes dominant restrictions in human non-liver and mouse liver cell lines.</a> PLoS Pathog. 7, e1002029 (2011).</li><li>Lindemann, D. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/query.fcgi?db=PubMed&cmd=Search&doptcmdl=Citation&defaultField=Title+Word&term=A+particle-associated+glycoprotein+signal+peptide+essential+for+virus+maturation+and+infectivity.">A particle-associated glycoprotein signal peptide essential for virus maturation and infectivity.</a> J. Virol. 75, 5762-5771 (2001).</li><li>Blight, K. J., McKeating, J. A., Rice, C. M. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/query.fcgi?db=PubMed&cmd=Search&doptcmdl=Citation&defaultField=Title+Word&term=Highly+permissive+cell+lines+for+subgenomic+and+genomic+hepatitis+C+virus+RNA+replication.">Highly permissive cell lines for subgenomic and genomic hepatitis C virus RNA replication.</a> J. Virol. 76, 13001-13014 (2002).</li></ol>

Biz HCV çoğaltma engel dominant negatif kısıtlamaların analizi için kültür hücreleri heterokaryon oluşumunu uyarmak için iki yöntem sunuyoruz. Bu prosedürler kullanılarak çeşitli insan olmayan karaciğer ve murin karaciğer hücre çizgileri baskın bir yapısal olarak ifade edilen veya virüs kaynaklı faktörü varlığında bırakıldı. Kısıtlama faktörler bulaşıcı döl HCV montaj ve salınımını önlemek eğer ilk testi öncelikle analiz eder. Bu durumda ambalaj hücreleri HCV replikon hücr...

<table border="1"><tbody><tr><td> Reaktif Adı </td><td> Şirket </td><td> Katalog numarası </td></tr><tr><td> DMEM </td><td> Invitrogen, Karlsruhe, Almanya </td><td> 41965-039 </td></tr><tr><td> L-glutamin </td><td> Invitrogen, Karlsruhe, Almanya </td><td> 25030-024 </td></tr><tr><td> Olmayan amino asitler </td><td> Invitrogen, Karlsruhe, Almanya </td><td> 11140-035 </td></tr><tr><td> Penisilin / streptomisin </td><td> Invitrogen, Karlsruhe, Almanya </td><td> 15140-122 </td></tr><tr><td> Fetal buzağı serumu </td><td> PAA, Cölbe, Almanya </td><td> A15151 </td></tr><tr><td> α-E2 (CBH23) </td><td> nazik Steven Foung 10 tarafından sağlanan </td><td></td></tr><tr><td> ATP </td><td> Sigma, Steinheim, Almanya </td><td> A2833-106 </td></tr><tr><td> Glutatyon </td><td> Sigma, Steinheim, Almanya </td><td&gt; G4251-1G </td></tr><tr><td> Blasticidin </td><td> İnvivo Gen, San Diego, ABD </td><td> Ant-bl-1 </td></tr><tr><td> G418 (genetisin) </td><td> Invitrogen, Karlsruhe, Almanya </td><td> 11811-064 </td></tr><tr><td> Polietilen glikol-1500 </td><td> Roche, Mannheim, Almanya </td><td> 10783641001 </td></tr><tr><td> Paraformaldehyde </td><td> Roth, Karlsruhe, Almanya </td><td> 0335.3 </td></tr><tr><td> Triton X-100 </td><td> Roth, Karlsruhe, Almanya </td><td> 3051.2 </td></tr><tr><td> Keçi serumu </td><td> Sigma, Steinheim, Almanya </td><td> G9023-5ml </td></tr><tr><td> α-NS5A (9E10) </td><td> Nazik Charles Rice 7 tarafından sağlanan </td><td></td></tr><tr><td> DAPI (4 &#39;, 6&#39;-diamidino-2-fenilindol dihidroklorür) </td><td> Invitrogen </td><td> D1306 </td></tr><tr><td> Alexa-Fluor 546 - keçi anti-insan IgG </td><td> Invitrogen, Karlsruhe, Almanya </td><td> A21089 </td&gt; </tr><tr><td> Alexa-Fluor 488 - keçi anti-fare IgG </td><td> Invitrogen, Karlsruhe, Almanya </td><td> A10680 </td></tr><tr><td> Lipofektamin 2000 </td><td> Invitrogen, Karlsruhe, Almanya </td><td> 11668-019 </td></tr><tr><td> CellTracker CMTMR </td><td> Invitrogen, Karlsruhe, Almanya </td><td> C2927 </td></tr><tr><td> CellTracker CMFDA </td><td> Invitrogen, Karlsruhe, Almanya </td><td> C2925 </td></tr><tr><td> Fluoromount </td><td> Sigma, Steinheim, Almanya </td><td> F4680-25ml </td></tr><tr><td> Tüm diğer kimyasal maddeler </td><td> Roth, Karlsruhe, Almanya </td><td></td></tr><tr><td> Hücre kültürü malzemeleri </td><td> Sarstedt, Nümbrecht, Almanya </td><td></td></tr></tbody></table>

two methods of heterokaryon formation to discover hcv restriction factors

Hepatit C virüsü (HCV), insan ve şempanze sınırlı bir ana-aralığı ile hepatotropic virüstür. HCV RNA çoğaltma insan olmayan karaciğer ve fare hücre hatlarında gözlenmiştir rağmen, verimliliği çok düşük olduğunu ve HCV replikon kullanarak gerekli uzun vadeli seçim prosedürleri baskın antibiyotik seçilebilir işaretleri 1-5 ifade oluşturur. In vitro araştırma HCV nedenle virüs ömrü çevrimi ile virüs girişi ve tamamlanması için ılımlı insan hepatoma hücre çizgileri ile sınırlıdır. Dar türler tropizm HKH&#39;lerinin nedeniyle, tam HCV replikasyon siklusu 6-8 ayakta kullanılabilen bir bağışıklık küçük bir hayvan modeli yoktur. Fare kökenli örneğin insan olmayan hücrelerin HCV verimsiz çoğaltma olasılıkla önemli konak bağımlılık faktörleri ve / veya kısıtlama faktörlerin ifade genetik uyumsuzluk eksikliğinden kaynaklanmaktadır. Biz HCV yayılım baskın kısıtlama fa tarafından bastırılmış olup olmadığını araştırmaknon-hepatik dokulardan veya fare karaciğer hücre hatlarında edilen insan hücre dizileri ya da ctors. Bu amaçla, somatik hücre füzyonu dayanarak iki bağımsız koşullu trans-tümleme yöntemleri geliştirdi. Her iki durumda da, viral döngüsü tamamlanmasından heterokaryonlar de mümkündür. Sonuç olarak, bulaşıcı döl viral de novo üretiminin ölçülmesi ile tespit edilir başarılı bir trans-tümleme, baskın bir kısıtlama olmadığı gösterir. Spesifik olarak, bir lusiferaz transgeni taşıyan alt genomik HCV Replikon çok ılımlı insan hepatoma hücreleri (Ha-7,5 hücreleri) içine transfekte edildi. Daha sonra, bu hücreler kültürlendi ve co-HCV yapısal proteinler çekirdek, zarfı 1 ve 2 (E1 ve E2) ve yardımcı proteinler p7 ve NS2 eksprese eden çeşitli insan ve fare hücrelere kaynaşmıştır. Hücre füzyon polietilen-glikol (PEG) ile muamele ile başlatılmıştır koşuluyla, kültür bulaşıcı virüs pa serbestbir reseptör bağımlı bir tarzda naif hücreleri enfekte rticles. Hücreye girişi, RNA çeviri, çoğaltma ve virüs montaj dahil tam viral yaşam döngüsü baskın kısıtlamaların etkisini değerlendirmek için, biz, CD81 endojen ifade yoksun bir insan karaciğer hücre dizisi (Huh-7 Lunet N hücreler 9) yararlandı HCV temel bir giriş faktörü. Ektopik ifade edilen CD81 yokluğunda, bu hücrelerin HCV enfeksiyonu 10 esasen refrakter vardır. Daha da önemlisi, ortak kültüre ve insan CD81 ancak eksikliği en azından önemli bir başka hücreye girişi faktörü (örneğin SR-BI, CLDN1, OCLN) ifade hücreleri ile kaynaşmış, yalnızca ortaya çıkan heterokaryonlar enfeksiyonu için gerekli HCV giriş faktörlerin komple set gösterilecek. Bu nedenle, egemen kısıtlama faktörler HCV çoğaltma döngüsü tamamlanmasından bastırmak olmadığını analiz etmek, biz yukarıda belirtilen crit yerine fare ve insan kaynaklı çeşitli hücreleri Lunet N hücreleri eritilireria. Co-kültürlenmiş hücrelerde prototipi köpüksü virüs mutantı yüksek bir füzojenik Viral zarfın protein (PFV 11) ile transfekte edilmiş ve daha sonra bulaşıcı parçacıklar HCV (HCVcc) ile karşılaştırılan edildiğinde, bulaşıcı virüsün üretimini de novo gözlenmiştir. Bu HCV başarıyla böylece bu hücre hatları hakim kısıtlama faktörlerin ifadesi ortadan heterokaryonlar kendi çoğaltma döngüsü tamamlanmış olduğunu gösterir. Bu yeni şartlı trans-tümleme yöntemleri HCV-özgü baskın kısıtlama faktörlerin ifadesi için hücre hatları ve birincil hücreler büyük bir paneli taramak için yararlı olacaktır.

Watch this Scientific Journal Video about Two Methods of Heterokaryon Formation to Discover HCV Restriction Factors at JoVE.com

Two Methods of Heterokaryon Formation to Discover HCV Restriction Factors

Biz, koşullu için iki yöntem tarif<em&gt; Trans</emHepatit C virüsü (HCV) montaj ve heterokaryon oluşumu itimat tam viral yaşam döngüsü, tamamlanması&gt;-tamamlayamamakta. Bu teknikler bulaşıcı HCV döl üretimi engel baskın kısıtlama faktörler, ifade hücre hatları için ekran uygundur.

Heterokaryon Oluşumu İki Yöntemleri HCV Sınırlayıcı Etkenler Discover

Hepatitis C virus (HCV) is a hepatotropic virus with a host-range restricted to humans and chimpanzees. Although HCV RNA replication has been observed in ...

Research

JoVE Journal

Immunology and Infection

Methods to Assess Beta Cell Death Mediated by Cytotoxic T Lymphocytes

Sitotoksik T Lenfositler Beta Hücre Ölümü aracılığı ile değerlendirin yöntemleri

Type 1 diabetes (T1D) is a T cell mediated autoimmune disease.  During the pathogenesis, patients become progressively more insulinopenic as 
insulin ...

A Restriction Enzyme Based Cloning Method to Assess the In vitro Replication Capacity of HIV-1 Subtype C Gag-MJ4 Chimeric Viruses

A Restriction Enzyme Based Cloning Method to Assess the In vitro Replication Capacity of HIV-1 Subtype C Gag-MJ4 Chimeric Viruses

Bir Kısıtlama Enzim Temelli Klonlama Yöntemi değerlendirin<em&gt; In vitro</em&gt; HIV-1 Tipi C Gag-MJ4 Kimerik Virüslerin Çoğaltma Kapasitesi

The protective effect of many HLA class I alleles on HIV-1 pathogenesis and disease progression is, in part, attributed to their ability to target ...

Establishment and Optimization of a High Throughput Setup to Study Staphylococcus epidermidis and Mycobacterium marinum Infection as a Model for Drug Discovery

Establishment and Optimization of a High Throughput Setup to Study Staphylococcus epidermidis and Mycobacterium marinum Infection as a Model for Drug Discovery

Kuruluş ve Eğitim için bir Yüksek Verimli Kur Optimizasyonu<em&gt; Staphylococcus epidermidis</em&gt; Ve<em&gt; Mycobacterium marinum</em&gt; Enfeksiyon İlaç Keşif için bir model olarak

Zebrafish are becoming a valuable tool in the preclinical phase of drug discovery screenings as a whole animal model with high throughput screening ...

Methods to Evaluate Cytotoxicity and Immunosuppression of Combustible Tobacco Product Preparations

Yöntem Yanıcı Tütün Ürün Müstahzarların Sitotoksisite ve immünosupresyonun değerlendirin

Among other pathophysiological changes, chronic exposure to cigarette smoke causes inflammation and immune suppression, which have been linked to ...

Long Term Intravital Multiphoton Microscopy Imaging of Immune Cells in Healthy and Diseased Liver Using CXCR6.Gfp Reporter Mice

CXCR6.Gfp Muhabir Fare kullanma Sağlıklı ve hastalıklı Karaciğer Bağışıklık Hücreleri Uzun Vadeli intravital multiphoton Mikroskopi Görüntüleme

Liver inflammation as a response to injury is a highly dynamic process involving the infiltration of distinct subtypes of leukocytes including monocytes, ...

Methods to Increase the Sensitivity of High Resolution Melting Single Nucleotide Polymorphism Genotyping in Malaria

Yöntemler sıtma Tek Nükleotid Polimorfizm Genotipleme Erime Yüksek Çözünürlük Duyarlılığının Artırma

Despite decades of eradication efforts, malaria remains a global burden. Recent renewed interest in regional elimination and global eradication has been ...

Applying an Inducible Expression System to Study Interference of Bacterial Virulence Factors with Intracellular Signaling

Bir uyarılabilir İfade Sistemi uygulamak Hücre içi Sinyali ile Bakteriyel Virulans Faktörler Girişim Eğitim için

The technique presented here allows one to analyze at which step a target protein, or alternatively a small molecule, interacts with the components of a ...

Methods to Inhibit Bacterial Pyomelanin Production and Determine the Corresponding Increase in Sensitivity to Oxidative Stress

Yöntemler Bakteriyel Pyomelanin Üretim ønhibe ve Oksidatif Stres Duyarlılık içinde tekabül eden artış belirleme

Pyomelanin is an extracellular red-brown pigment produced by several bacterial and fungal species. This pigment is derived from the tyrosine catabolism ...

Deciphering and Imaging Pathogenesis and Cording of Mycobacterium abscessus in Zebrafish Embryos

Deciphering and Imaging Pathogenesis and Cording of Mycobacterium abscessus in Zebrafish Embryos

Görüntüleme Patogenez ve Cording Deşifre ve<em&gt; Mycobacterium abscessus</em&gt; Zebra balığı Embriyolar

Zebrafish (Danio rerio) embryos are increasingly used as an infection model to study the function of the vertebrate innate immune system in host-pathogen ...

Methods to Investigate the Regulatory Role of Small RNAs and Ribosomal Occupancy of Plasmodium falciparum

Methods to Investigate the Regulatory Role of Small RNAs and Ribosomal Occupancy of Plasmodium falciparum

Yöntemler Küçük RNA&#39;ların ve Ribosomal doluluk Düzenleyici Rolü Araştırma<em&gt; Plasmodium falciparum</em

The genetic variation responsible for the sickle cell allele (HbS) enables erythrocytes to resist infection by the malaria parasite, P. falciparum. The ...