Name: protein misfolding cyclic amplification of prions
Uploaded: 2012-11-07T12:00:00
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हम पांडुलिपि के महत्वपूर्ण पढ़ने के लिए डॉ. संध्या Fe मैरी रामोस का शुक्रिया अदा करना चाहते हैं. यह काम अनुसंधान संसाधन के लिए राष्ट्रीय केंद्र (RR0115635 P20-6, C06 RR17417-01 और G20RR024001) और मस्तिष्क संबंधी विकार के लिए राष्ट्रीय संस्थान और स्ट्रोक (NS052609 2R01) द्वारा समर्थित किया गया.

1. उपकरण की तैयारी <ol><li> एक Misonix 3000 या Misonix 4000 (Farmingdale, एनवाई) का sonicator थर्मो इलेक्ट्रॉन Neslab EX-7 पानी स्नान (Newington, NH) से जुड़े 37 की एक निरंतर तापमान रखने डिग्री सेल्सियस का उपयोग करें 200 μl गुंबददार थर्मो वैज्ञानिक (Waltham, एमए) से ?...

<ol>
	<li>Ayers, J. I., Schutt, C. R., Shikiya, R. A., Aguzzi, A., Kincaid, A. E., Bartz, J. C. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/query.fcgi?db=PubMed&cmd=Search&doptcmdl=Citation&defaultField=Title+Word&term=The+strain-encoded+relationship+between+PrP+replication,+stability+and+processing+in+neurons+is+predictive+of+the+incubation+period+of+disease.">The strain-encoded relationship between PrP replication, stability and processing in neurons is predictive of the incubation period of disease.</a> PLoS pathogens. 7, e1001317 (2011).</li><li>Barria, M. A., Mukherjee, A., Gonzalez-Romero, D., Morales, R., Soto, C. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/query.fcgi?db=PubMed&cmd=Search&doptcmdl=Citation&defaultField=Title+Word&term=De+novo+generation+of+infectious+prions+in+vitro+produces+a+new+disease+phenotype.">De novo generation of infectious prions in vitro produces a new disease phenotype.</a> PLoS Pathog. 5, e1000421 (2009).</li><li>Bessen, R. A., Marsh, R. F. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/query.fcgi?db=PubMed&cmd=Search&doptcmdl=Citation&defaultField=Title+Word&term=Biochemical+and+physical+properties+of+the+prion+protein+from+two+strains+of+the+transmissible+mink+encephalopathy+agent.">Biochemical and physical properties of the prion protein from two strains of the transmissible mink encephalopathy agent.</a> J. Virol. 66, 2096-2101 (1992).</li><li>Bessen, R. A., Marsh, R. F. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/query.fcgi?db=PubMed&cmd=Search&doptcmdl=Citation&defaultField=Title+Word&term=Distinct+PrP+properties+suggest+the+molecular+basis+of+strain+variation+in+transmissible+mink+encephalopathy.">Distinct PrP properties suggest the molecular basis of strain variation in transmissible mink encephalopathy.</a> J. Virol. 68, 7859-7868 (1994).</li><li>Bessen, R. A., Marsh, R. F. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/query.fcgi?db=PubMed&cmd=Search&doptcmdl=Citation&defaultField=Title+Word&term=Identification+of+two+biologically+distinct+strains+of+transmissible+mink+encephalopathy+in+hamsters.">Identification of two biologically distinct strains of transmissible mink encephalopathy in hamsters.</a> J. Gen. Virol. 73, 329-334 (1992).</li><li>Castilla, J., Gonzalez-Romero, D., Saa, P., Morales, R., De Castro, J., Soto, C. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/query.fcgi?db=PubMed&cmd=Search&doptcmdl=Citation&defaultField=Title+Word&term=Crossing+the+species+barrier+by+PrP(Sc)+replication+in+vitro+generates+unique+infectious+prions.">Crossing the species barrier by PrP(Sc) replication in vitro generates unique infectious prions.</a> Cell. 134, 757-768 (2008).</li><li>Castilla, J., Morales, R., Saa, P., Barria, M., Gambetti, P., Soto, C. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/query.fcgi?db=PubMed&cmd=Search&doptcmdl=Citation&defaultField=Title+Word&term=Cell-free+propagation+of+prion+strains.">Cell-free propagation of prion strains.</a> EMBO J. 27, 2557-2566 (2008).</li><li>Caughey, B., Raymond, G. J. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/query.fcgi?db=PubMed&cmd=Search&doptcmdl=Citation&defaultField=Title+Word&term=The+scrapie-associated+form+of+PrP+is+made+from+a+cell+surface+precursor+that+is+both+protease-+and+phospholipase-sensitive.">The scrapie-associated form of PrP is made from a cell surface precursor that is both protease- and phospholipase-sensitive.</a> J. Biol. Chem. 266, 18217-18223 (1991).</li><li>Deleault, N. R., Harris, B. T., Rees, J. R., Supattapone, S. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/query.fcgi?db=PubMed&cmd=Search&doptcmdl=Citation&defaultField=Title+Word&term=Formation+of+native+prions+from+minimal+components+in+vitro.">Formation of native prions from minimal components in vitro.</a> Proceedings of the National Academy of Sciences of the United States of America. 104, 9741-9746 (2007).</li><li>Dickinson, A. G., Fraser, H., Meikle, V. M., Outram, G. W. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/query.fcgi?db=PubMed&cmd=Search&doptcmdl=Citation&defaultField=Title+Word&term=Competition+between+different+scrapie+agents+in+mice.">Competition between different scrapie agents in mice.</a> Nat. New Biol. 237, 244-245 (1972).</li><li>Gonzalez-Romero, D., Barria, M. A., Leon, P., Morales, R., Soto, C. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/query.fcgi?db=PubMed&cmd=Search&doptcmdl=Citation&defaultField=Title+Word&term=Detection+of+infectious+prions+in+urine.">Detection of infectious prions in urine.</a> FEBS Lett. 582, 3161-3166 (2008).</li><li>Green, K. M., Castilla, J., Seward, T. S., Napier, D. L., Jewell, J. E., Soto, C., Telling, G. C. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/query.fcgi?db=PubMed&cmd=Search&doptcmdl=Citation&defaultField=Title+Word&term=Accelerated+high+fidelity+prion+amplification+within+and+across+prion+species+barriers.">Accelerated high fidelity prion amplification within and across prion species barriers.</a> PLoS Pathog. 4, e1000139 (2008).</li><li>Hadlow, W. J., Race, R. E., Kennedy, R. C. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/query.fcgi?db=PubMed&cmd=Search&doptcmdl=Citation&defaultField=Title+Word&term=Temporal+distribution+of+transmissible+mink+encephalopathy+virus+in+mink+inoculated+subcutaneously.">Temporal distribution of transmissible mink encephalopathy virus in mink inoculated subcutaneously.</a> J. Virol. 61, 3235-3240 (1987).</li><li>Kocisko, D. A., Come, J. H., Priola, S. A., Chesebro, B., Raymond, G. J., Lansbury, P. T., Caughey, B. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/query.fcgi?db=PubMed&cmd=Search&doptcmdl=Citation&defaultField=Title+Word&term=Cell-free+formation+of+protease-resistant+prion+protein.">Cell-free formation of protease-resistant prion protein.</a> Nature. 370, 471-474 (1994).</li><li>Kurt, T. D., Telling, G. C., Zabel, M. D., Hoover, E. A. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/query.fcgi?db=PubMed&cmd=Search&doptcmdl=Citation&defaultField=Title+Word&term=Trans-species+amplification+of+PrP(CWD)+and+correlation+with+rigid+loop+170N.">Trans-species amplification of PrP(CWD) and correlation with rigid loop 170N.</a> Virology. 387, 3235-3240 (2009).</li><li>Maddison, B. C., Baker, C. A., Terry, L. A., Bellworthy, S. J., Thorne, L., Rees, H. C., Gough, K. C. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/query.fcgi?db=PubMed&cmd=Search&doptcmdl=Citation&defaultField=Title+Word&term=Environmental+sources+of+scrapie+prions.">Environmental sources of scrapie prions.</a> J. Virol. 84, 11560-11562 (2010).</li><li>Nichols, T. A., Pulford, B., Wyckoff, A. C., Meyerett, C., Michel, B., Gertig, K., Hoover, E. A., Jewell, J. E., Telling, G. C., Zabel, M. D. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/query.fcgi?db=PubMed&cmd=Search&doptcmdl=Citation&defaultField=Title+Word&term=Detection+of+protease-resistant+cervid+prion+protein+in+water+from+a+CWD-endemic+area.">Detection of protease-resistant cervid prion protein in water from a CWD-endemic area.</a> Prion. 3, 171-183 (2009).</li><li>Prusiner, S. B. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/query.fcgi?db=PubMed&cmd=Search&doptcmdl=Citation&defaultField=Title+Word&term=Novel+proteinaceous+infectious+particles+cause+scrapie.">Novel proteinaceous infectious particles cause scrapie.</a> Science. 216, 136-144 (1982).</li><li>Saborio, G. P., Permanne, B., Soto, C. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/query.fcgi?db=PubMed&cmd=Search&doptcmdl=Citation&defaultField=Title+Word&term=Sensitive+detection+of+pathological+prion+protein+by+cyclic+amplification+of+protein+misfolding.">Sensitive detection of pathological prion protein by cyclic amplification of protein misfolding.</a> Nature. 411, 810-813 (2001).</li><li>Saunders, S. E., Bartz, J. C., Vercauteren, K. C., Bartelt-Hunt, S. L. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/query.fcgi?db=PubMed&cmd=Search&doptcmdl=Citation&defaultField=Title+Word&term=An+enzymatic+treatment+of+soil-bound+prions+effectively+inhibits+replication.">An enzymatic treatment of soil-bound prions effectively inhibits replication.</a> Appl. Environ. Microbiol. 77, 4313-4317 (2011).</li><li>Saunders, S. E., Shikiya, R. A., Langenfeld, K., Bartelt-Hunt, S. L., Bartz, J. C. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/query.fcgi?db=PubMed&cmd=Search&doptcmdl=Citation&defaultField=Title+Word&term=Replication+efficiency+of+soil-bound+prions+varies+with+soil+type.">Replication efficiency of soil-bound prions varies with soil type.</a> Journal of virology. , (2011).</li><li>Schutt, C. R., Bartz, J. C. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/query.fcgi?db=PubMed&cmd=Search&doptcmdl=Citation&defaultField=Title+Word&term=Prion+interference+with+multiple+prion+isolates.">Prion interference with multiple prion isolates.</a> Prion. 2, 61-63 (2008).</li><li>Shikiya, R. A., Ayers, J. I., Schutt, C. R., Kincaid, A. E., Bartz, J. C. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/query.fcgi?db=PubMed&cmd=Search&doptcmdl=Citation&defaultField=Title+Word&term=Co-infecting+prion+strains+compete+for+a+limiting+cellular+resource.">Co-infecting prion strains compete for a limiting cellular resource.</a> Journal of. 84, 5706-5714 (2010).</li><li>Shikiya, R. A., Bartz, J. C. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/query.fcgi?db=PubMed&cmd=Search&doptcmdl=Citation&defaultField=Title+Word&term=In+vitro+generation+of+high+titer+prions.">In vitro generation of high titer prions.</a> Journal of virology. , (2011).</li><li>Weber, P., Giese, A., Piening, N., Mitteregger, G., Thomzig, A., Beekes, M., Kretzschmar, H. A. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/query.fcgi?db=PubMed&cmd=Search&doptcmdl=Citation&defaultField=Title+Word&term=Generation+of+genuine+prion+infectivity+by+serial+PMCA.">Generation of genuine prion infectivity by serial PMCA.</a> Veterinary microbiology. 123, 346-357 (2007).</li></ol>

Amplifying संक्रामक prion प्रोटीन की चुनौतियां लंबी ऊष्मायन vivo प्रयोग में समय और खर्च कर रहे हैं. PMCA तकनीक संक्रामक prion एजेंट बढ़ाना एक लागत प्रभावी साधन है. कई प्रयोगशालाओं PMCA की क्षमता के लिए सही है कि इन व?...

<table border="1"><tbody><tr><td> / अभिकर्मक और उपकरण </td><td> निर्माता </td><td> बिल्ली. संख्या </td></tr><tr><td> Misonix 3000 </td><td> Misonix </td><td> S-3000 </td></tr><tr><td> 4000 Misonix </td><td> Misonix </td><td> S-4000 </td></tr><tr><td> Tenbroeck ऊतक चक्की </td><td> Kontes </td><td> 885000-0007 </td></tr><tr><td> Neslab EX-7 जल स्नान </td><td> थर्मो इलेक्ट्रॉन </td><td> EX-7 Neslab </td></tr><tr><td> 0.2 मिलीलीटर पीसीआर ट्यूब स्ट्रिप्स </td><td> थर्मो वैज्ञानिक </td><td> अटल बिहारी 0,451 </td></tr><tr><td> X-100 ट्राइटन </td><td> सिग्मा Aldrich </td><td> T9284-100ml </td></tr><tr><td> पूरा protease अवरोध </td><td> Roche </td><td> 11 498 001 697 </td></tr><tr><td> EDTA </td><td> JT BAKER </td><td> 4040-00 </td></tr><tr><td> DPBS </td><td> Mallinckrodt बेकर Mediatech </td><td> 21-031-CV </td></tr><tr><td> Versi सूखी लैब Soakers </td><td> फिशर साइंटिफिक </td><td> 14 28 +२०६ </td></tr><tr><td> Repti थेर्म हीटर </td><td> चिड़ियाघर मेड लेबोरेटरीज इंक, </td><td> आरएच-4 </td></tr></tbody></table>

protein misfolding cyclic amplification of prions

Prions संक्रामक एजेंटों है कि पशुओं और मनुष्यों 9,18 में अनिवार्य रूप से घातक संक्रामक spongiform encephalopathy (त्से) कारण हैं. prion प्रोटीन दो अलग isoforms, गैर संक्रामक मेजबान इनकोडिंग प्रोटीन (पीआरपी सी) और संक्रामक प्रोटीन (पीआरपी एससी), पीआरपी 8 सी के एक असामान्य रूप से जोड़ isoform है. एक prion एजेंटों के साथ काम करने की चुनौतियों की एक लंबी ऊष्मायन पूर्व की अवधि के बाद मेजबान टीका 13 नैदानिक ​​लक्षण के विकास के लिए है. यह परंपरागत लंबी और महंगी पशु bioassay अध्ययन अनिवार्य है. इसके अलावा, पीआरपी सुप्रीम कोर्ट के जैव रासायनिक और biophysical गुणों खराब उनके असामान्य रचना और एकत्रीकरण राज्यों के कारण विशेषता है. पीआरपी SC बीज पीआरपी सी 14 में इन विट्रो पीआरपी अ.जा. रूपांतरण कर सकते हैं. PMCA एक में इन विट्रो तकनीक कि adva लेता हैइस sonication और ऊष्मायन चक्र का उपयोग करने के लिए पीआरपी सुप्रीम कोर्ट के बड़ी मात्रा में उत्पादन करने के लिए, एक त्वरित दर पर एक पीआरपी सी और पीआरपी एससी 19 बीज की मात्रा मिनट की अधिक मात्रा से युक्त प्रणाली से करने की क्षमता के ntage. इस तकनीक को प्रभावी ढंग से पीआरपी सी से पीआरपी एससी रूपांतरण की प्रजातियों और तनाव विशिष्टता पुनरावृत्ति करना, prion तनाव हस्तक्षेप का अनुकरण करने के लिए और संक्रमित ऊतकों, तरल पदार्थ, और पर्यावरण 6,7,16 नमूनों से पीआरपी एससी का स्तर बहुत कम बढ़ाना साबित हो गया है, 23. इस कागज संदूषण को कम करने, अनुरूप परिणाम पैदा करने, और उन परिणामों को बढ़ाता के लिए सिफारिशें सहित PMCA प्रोटोकॉल विवरण,. हम भी पीढ़ी और संक्रामक prion उपभेदों, prion तनाव हस्तक्षेप, और पर्यावरण में prions का पता लगाने के लक्षण वर्णन सहित कई PMCA अनुप्रयोगों, पर चर्चा की.

प्रोटीन misfolding चक्रीय प्रवर्धन (PMCA) इन विट्रो में पीआरपी एससी 7, 12, 14, 19, 24 बढ़ाना करने के लिए प्रयोग किया जाता है. एक सफल पीआरपी एससी प्रवर्धन पीके प्रतिरोधी prion प्रोटीन (हम्सटर व्युत्पन्न prion उपभेदों ...

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Protein Misfolding Cyclic Amplification of Prions

प्रोटीन misfolding चक्रीय प्रवर्धन (PMCA) prion रूपांतरण और बाधाओं तनाव और प्रजातियों के अध्ययन के लिए एक में इन विट्रो परख है. यह भी एक prion परख का पता लगाने के रूप में इस्तेमाल किया जा सकता है.

Prions प्रोटीन misfolding चक्रीय प्रवर्धन

Prions  are infectious agents that cause the inevitably fatal transmissible spongiform  encephalopathy (TSE) in animals and humans9,18. The prion protein ...

Research

JoVE Journal

Immunology and Infection

A Comparative Approach to Characterize the Landscape of Host-Pathogen Protein-Protein Interactions

मेजबान पैथोजन प्रोटीन से प्रोटीन सहभागिता के लैंडस्केप विशेषताएँ एक तुलनात्मक दृष्टिकोण

Significant efforts were gathered to generate  large-scale comprehensive protein-protein interaction network maps. This is  instrumental to understand the ...

Procedures for Identifying Infectious Prions After Passage Through the Digestive System of an Avian Species

एक एवियन प्रजातियों की पाचन प्रणाली के माध्यम से पारित होने के बाद संक्रामक prions की पहचान के लिए प्रक्रिया

Infectious prion (PrPRes) material is likely the cause of fatal, neurodegenerative transmissible spongiform encephalopathy (TSE) diseases1. Transmission ...

Demonstrating a Multi-drug Resistant Mycobacterium tuberculosis Amplification Microarray

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एक बहु दवा प्रतिरोधी दिखाते<em&gt; माइकोबैक्टीरियम क्षयरोग</em&gt; प्रवर्धन माइक्रोएरे

Simplifying microarray workflow is a necessary first step for creating MDR-TB microarray-based diagnostics that can be routinely used in lower-resource ...

Loop-mediated Isothermal Amplification (LAMP) Assays for the Species-specific Detection of Eimeria that Infect Chickens

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की प्रजाति विशिष्ट पहचान के लिए लूप की मध्यस्थता इज़ोटेर्माल प्रवर्धन (दीपक) Assays<em&gt; Eimeria</em&gt; मुर्गियों को संक्रमित करते हैं

Eimeria species parasites, protozoa which cause the enteric disease coccidiosis, pose a serious threat to the production and welfare of chickens. In the ...

The Development of Lyophilized Loop-mediated Isothermal Amplification Reagents for the Detection of Coxiella burnetii

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की जांच के लिए Lyophilized लूप की मध्यस्थता इज़ोटेर्माल प्रवर्धन अभिकर्मकों का विकास<em&gt; Coxiella burnetii</em

Coxiella burnetii, the agent causing Q fever, is an obligate intracellular bacterium. PCR based diagnostic assays have been developed for detecting C. ...

Real-time Quaking-induced Conversion Assay for Detection of CWD Prions in Fecal Material

मल सामग्री में CWD Prions का पता लगाने के लिए वास्तविक समय तड़पनेवाला-प्रेरित रूपांतरण परख

The RT-QuIC technique is a sensitive in vitro cell-free prion amplification assay based mainly on the seeded misfolding and aggregation of recombinant ...

Building Up a High-throughput Screening Platform to Assess the Heterogeneity of HER2 Gene Amplification in Breast Cancers

स्तन कैंसर में HER2 जीन प्रवर्धन की विविधता का आकलन करने के लिए एक उच्च प्रवाह जांच मंच का निर्माण

Targeted therapies against the human epidermal growth factor receptor 2 (HER2) have radically changed the outcome of patients with HER2-positive breast ...

Dissecting Multi-protein Signaling Complexes by Bimolecular Complementation Affinity Purification (BiCAP)

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Bimolecular पूरित अपनत्व शुद्धि (BiCAP) द्वारा विदारक मल्टी प्रोटीन सिगनल कॉम्प्लेक्स

The assembly of protein complexes is a central mechanism underlying the regulation of many cell signaling pathways. A major focus of biomedical research ...

Automated Behavioral Analysis of Large C. elegans Populations Using a Wide Field-of-view Tracking Platform

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एक व्यापक क्षेत्र के दृश्य ट्रैकिंग मंच का उपयोग कर बड़ी सी एलिगेंस आबादी का स्वचालित व्यवहार विश्लेषण

Caenorhabditis elegans is a well-established animal model in biomedical research, widely employed in functional genomics and ageing studies. To assess the ...

Generation, Amplification, and Titration of Recombinant Respiratory Syncytial Viruses

पीढ़ी, प्रवर्धन, और पुनः संयोजक श्वसन Syncytial वायरस के टाइट्रेट

The use of recombinant viruses has become crucial in basic or applied virology. Reverse genetics has been proven to be an extremely powerful technology, ...