Name: purification of pathogen vacuoles from legionella-infected phagocytes
Uploaded: 2012-06-19T13:00:00
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우리 연구실의 연구는 맥스 폰 Pettenkofer 연구소, 루드비히 Maximilians 대학 뮌헨, 독일 연구 재단 (DFG, HI 1511/3-1)와 Bundesministerium FÜR Bildung 깨물어 Forschung (BMBF) &quot;의료 감염 지노 믹스&quot;이니셔티브에 의해 지원되었다 ( 0315834C).

1. LCV 절연을위한 준비 <ol><li> Legionella pneumophila는 LCV 절연 전에 5 μg / ML chloramphenicol (캠) 4 일 동안 CYE 한천 플레이트에 글리세롤 주식에서 DsRed-Express에서 13,14 생산 밖으로 행진. 37 세균을 품어 ° C. </li><li> 1 × 10 7 종자 디 GFP-calnexin 또는 75cm 두 조직 문화에 RAW264.7 murine macrophages를 생산 discoideum 언젠가 전에 감염을 flasks. 20 μg / 디위한 ML G418처럼 1...

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	<li>Hilbi, H., Hoffmann, C., Harrison, C. F. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/query.fcgi?db=PubMed&cmd=Search&doptcmdl=Citation&defaultField=Title+Word&term=Legionella+spp.+outdoors:+colonization,+communication+and+persistence.">Legionella spp. outdoors: colonization, communication and persistence.</a> Environ. Microbiol. Rep. 3, 286-296 (2011).</li><li>Zhu, W. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/query.fcgi?db=PubMed&cmd=Search&doptcmdl=Citation&defaultField=Title+Word&term=Comprehensive+identification+of+protein+substrates+of+the+Dot/Icm+type+IV+transporter+of+Legionella+pneumophila.">Comprehensive identification of protein substrates of the Dot/Icm type IV transporter of Legionella pneumophila.</a> PLoS ONE. 6, e17638 (2011).</li><li>Hilbi, H., Weber, S., Finsel, I. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/query.fcgi?db=PubMed&cmd=Search&doptcmdl=Citation&defaultField=Title+Word&term=Anchors+for+effectors:+subversion+of+phospho-inositide+lipids+by+Legionella.">Anchors for effectors: subversion of phospho-inositide lipids by Legionella.</a> Front Microbiol. 2, 91 (2011).</li><li>Hubber, A., Roy, C. R. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/query.fcgi?db=PubMed&cmd=Search&doptcmdl=Citation&defaultField=Title+Word&term=Modulation+of+host+cell+function+by+Legionella+pneumophila+type+IV+effectors.">Modulation of host cell function by Legionella pneumophila type IV effectors.</a> Annu. Rev. Cell Dev. Biol. 26, 261-283 (2010).</li><li>Kima, P. E., Dunn, W. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/query.fcgi?db=PubMed&cmd=Search&doptcmdl=Citation&defaultField=Title+Word&term=Exploiting+calnexin+expression+on+phagosomes+to+isolate+Leishmania+parasitophorous+vacuoles.">Exploiting calnexin expression on phagosomes to isolate Leishmania parasitophorous vacuoles.</a> Microb. Pathog. 38, 139-145 (2005).</li><li>L&#252;hrmann, A., Haas, A. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/query.fcgi?db=PubMed&cmd=Search&doptcmdl=Citation&defaultField=Title+Word&term=A+method+to+purify+bacteria-containing+phagosomes+from+infected+macrophages.">A method to purify bacteria-containing phagosomes from infected macrophages.</a> Methods Cell Sci. 22, 329-341 (2000).</li><li>Sturgill-Koszycki, S., Haddix, P. L., Russell, D. G. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/query.fcgi?db=PubMed&cmd=Search&doptcmdl=Citation&defaultField=Title+Word&term=The+interaction+between+Mycobacterium+and+the+macrophage+analyzed+by+two-dimensional+polyacrylamide+gel+electrophoresis.">The interaction between Mycobacterium and the macrophage analyzed by two-dimensional polyacrylamide gel electrophoresis.</a> Electrophoresis. 18, 2558-2565 (1997).</li><li>Fernandez-Mora, E., Polidori, M., L&#252;hrmann, A., Schaible, U. E., Haas, A. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/query.fcgi?db=PubMed&cmd=Search&doptcmdl=Citation&defaultField=Title+Word&term=Maturation+of+Rhodococcus+equi-containing+vacuoles+is+arrested+after+completion+of+the+early+endosome+stage.">Maturation of Rhodococcus equi-containing vacuoles is arrested after completion of the early endosome stage.</a> Traffic. 6, 635-653 (2005).</li><li>Mills, S. D., Finlay, B. B. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/query.fcgi?db=PubMed&cmd=Search&doptcmdl=Citation&defaultField=Title+Word&term=Isolation+and+characterization+of+Salmonella+typhimurium+and+Yersinia+pseudotuberculosis-containing+phagosomes+from+infected+mouse+macrophages:+Y.+pseudotuberculosis+traffics+to+terminal+lysosomes+where+they+are+degraded.">Isolation and characterization of Salmonella typhimurium and Yersinia pseudotuberculosis-containing phagosomes from infected mouse macrophages: Y. pseudotuberculosis traffics to terminal lysosomes where they are degraded.</a> Eur. J. Cell Biol. 77, 35-47 (1998).</li><li>Shevchuk, O. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/query.fcgi?db=PubMed&cmd=Search&doptcmdl=Citation&defaultField=Title+Word&term=Proteomic+analysis+of+Legionella-containing+phagosomes+isolated+from+Dictyostelium.">Proteomic analysis of Legionella-containing phagosomes isolated from Dictyostelium.</a> Int. J. Med. Microbiol. 299, 489-508 (2009).</li><li>Brombacher, E. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/query.fcgi?db=PubMed&cmd=Search&doptcmdl=Citation&defaultField=Title+Word&term=Rab1+guanine+nucleotide+exchange+factor+SidM+is+a+major+phosphatidylinositol+4-phosphate-binding+effector+protein+of+Legionella+pneumophila.">Rab1 guanine nucleotide exchange factor SidM is a major phosphatidylinositol 4-phosphate-binding effector protein of Legionella pneumophila.</a> J. Biol. Chem. 284, 4846-4856 (2009).</li><li>Urwyler, S., Finsel, I., Ragaz, C., Hilbi, H. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/query.fcgi?db=PubMed&cmd=Search&doptcmdl=Citation&defaultField=Title+Word&term=Isolation+of+Legionella-containing+vacuoles+by+immuno-magnetic+separation.">Isolation of Legionella-containing vacuoles by immuno-magnetic separation.</a> Curr. Protoc. Cell Biol. Chapter 3, Unit 3 (2010).</li><li>Urwyler, S. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/query.fcgi?db=PubMed&cmd=Search&doptcmdl=Citation&defaultField=Title+Word&term=Proteome+analysis+of+Legionella+vacuoles+purified+by+magnetic+immunoseparation+reveals+secretory+and+endosomal+GTPases.">Proteome analysis of Legionella vacuoles purified by magnetic immunoseparation reveals secretory and endosomal GTPases.</a> Traffic. 10, 76-87 (2009).</li><li>Mampel, J. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/query.fcgi?db=PubMed&cmd=Search&doptcmdl=Citation&defaultField=Title+Word&term=Planktonic+replication+is+essential+for+biofilm+formation+by+Legionella+pneumophila+in+a+complex+medium+under+static+and+dynamic+flow+conditions.">Planktonic replication is essential for biofilm formation by Legionella pneumophila in a complex medium under static and dynamic flow conditions.</a> Appl. Environ. Microbiol. 72, 2885-2895 (2006).</li></ol>

이전에 다음 ID로 출판 메소드와는 달리,이 프로토콜은 두 단계 먼저 immuno-마그네틱 방식에 의한 LCVs의 분리, 둘째, 밀도 기울기 원심 분리에 의한 LCVs의 정화를 기준으로합니다. LCV 절연 쉽게 fluorescently 분류 박테리아와 GFP 생산 세포 또는 항체 염색법 중 하나를 사용하는 형광 현미경, 다음에 할 수 있습니다. 여기에서 설명한 프로토콜은 높은 순도와 LCVs의 농축에 결과 단순 스트레이트 포워드 방...

purification of pathogen vacuoles from legionella-infected phagocytes

기회 병원체 Legionella pneumophila도 따라서 중증 폐렴 &#39;Legionnaires&#39;병 &quot;1 원인이 폐포 macrophages에 복제 아메바에 강한 세균이다. protozoan과 포유류의 phagocytes에서, L. pneumophila는 구체적이고 복제 허용 구획, &quot;Legionella 함유 공포를&quot;(LCV) 결성 보존 메커니즘을 고용합니다. LCV 형성은 호스트 세포에 많은 275으로 &quot;이펙터&quot;단백질 translocates 세균성 ICM / 도트 타입 IV 분비 시스템 (T4SS)를 필요로합니다. effectors는 호스트 단백질뿐만 아니라 lipids를 조작하고 분비, endosomal 및 mitochondrial organelles 2-4와 통신합니다. LCVs의 형성은 reductionist의 방식으로 이해하기 어려운 복잡한 강력하고 중복 프로세스를 나타냅니다. 통합 접근 방식은 종합적 경로의 세계적인 분석을 포함하여 LCV 형성을 이해하는 데 필요한ogen - 호스트 요소의 상호 작용과 그 시간적 및 공간적 역학. 이러한 목표를 향한 첫 단계로서 그대로 LCVs이 정화되고 proteomics와 lipidomics으로 분석했다. 조성과 병원균 함유 vacuoles 형성은 액체 크로마 토그래피 또는 대량 분석법에 결합하여 2-D 겔 전기 영동을 사용 proteomic 분석에 의해 조사되었다. 사회적 토양 아메바 Dictyostelium의 discoideum이나 포유 동물 phagocytes 중 격리 Vacuoles는 Leishmania 5, 리스테리아 6,은 Mycobacterium 7, Rhodococcus 8, 살모넬라균 9 Legionella SPP을 숨겨두고. 10. 그들은 예를 들어 전자 현미경은 LCV의 형태, 무결성 및 순도를 분석할 필요로하지만, 이러한 연구들에서 사용된 정화 프로토콜은 시간이 오래 걸릴 지루한입니다. 또한 이러한 프로토콜은 실내의 병원균 공포의 특정 기능을 이용하지richment. 여기에 제시된 방법은 시각을 채용하여 이러한 한계를 극복 형광 LCV 마커를 생산 discoideum 및 세균성 효과기 단백질 SidC을 대상으로하여 어떤 선택 (PtdIns (4) P) 4 - 인산 phosphatidylinositol에 3,11을 바인딩하여 LCV 막에 앵커. LCVs는 고전 Histodenz 밀도 기울기 원심 분리 12,13 (그림 1)에 의해 두 번째 단계에 따라 SidC와 자기 구슬로 결합된 이차 항체, 대한 친화력 - 정화 일차 항체를 이용한 immuno-자성 분리에 의한 첫 번째 단계에서 풍부하고 . D.으로부터 격리된 LCVs의 프로테옴 연구 discoideum 13 전에 LCV 형성에 연루되지 않았 phagocytic vesicles, mitochondria, 응급실 및 잠돌군 Zz뿐만 아니라 여러 GTPases와 관련된 단백질을 포함한 560 개 이상의 숙주 세포 단백질을 발표했다. LCVs이 풍부하고 함께 정화프로토콜은 더욱 현미경 (immunofluorescence, 전자 현미경), 생화 학적 방법 (서양 얼룩) 및 proteomic이나 lipidomic 접근하여 분석할 수있다 여기서 설명했다.

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Purification of Pathogen Vacuoles from Legionella-infected Phagocytes

이 문서 그대로의 고립과 정화하는 방법을 설명합니다<em&gt; Legionella</em아메바와 macrophages에서&gt; 함유 vacuoles (LCVs). 두 단계 프로토콜은 밀도 기울기 원심 분리에 의한 세균성 LCV 표시 나아가 정화에 대한 항체를 이용한 immuno-자성 분리함으로써 LCV 농축 구성되어있다.

병원체 Vacuoles의 정제에서<em&gt; Legionella</em&gt; - 감염된 Phagocytes

The opportunistic pathogen Legionella pneumophila is an amoeba-resistant bacterium, which also replicates in alveolar macrophages thus causing the severe ...

Research

JoVE Journal

Immunology and Infection

Purification of Pathogen Vacuoles from Legionella-infected Phagocytes

Invasion of Human Cells by a Bacterial Pathogen

세균성 병원체에 의해 인간의 세포의 침략

Here we will describe how we study the invasion of human endothelial cells by bacterial pathogen Staphylococcus aureus . The general protocol can be ...

연구

면역학 및 감염병학

One-day Workflow Scheme for Bacterial Pathogen Detection and Antimicrobial Resistance Testing from Blood Cultures

혈액 배양에서 세균 병원체 탐지 및 항균 저항 테스트를위한 하루 워크플로 계획

Bloodstream infections are associated with high mortality rates because of the probable manifestation of sepsis, severe sepsis and septic shock1. ...

Purification and Visualization of Lipopolysaccharide from Gram-negative Bacteria by Hot Aqueous-phenol Extraction

핫 수성 - 페놀 추출에 의한 그람 음성 박테리아에서 정화와 Lipopolysaccharide의 시각화

Lipopolysaccharide (LPS)  is a major component of Gram-negative bacterial outer membranes. It is a tripartite molecule consisting of  lipid A, which is ...

Affinity Purification of Influenza Virus Ribonucleoprotein Complexes from the Chromatin of Infected Cells

감염된 세포의 염색질에서 인플루엔자 바이러스 Ribonucleoprotein 컴플렉스의 동질 정제

Like all negative-strand RNA viruses, the genome of influenza viruses is packaged in the form of viral ribonucleoprotein complexes (vRNP), in which the ...

Live-cell Video Microscopy of Fungal Pathogen Phagocytosis

곰팡이 병원체 Phagocytosis의 라이브 셀 비디오 현미경

Phagocytic clearance of fungal pathogens, and microorganisms more generally, may be considered to consist of four distinct stages: (i) migration of ...

Loop-mediated Isothermal Amplification (LAMP) Assays for the Species-specific Detection of Eimeria that Infect Chickens

Loop-mediated Isothermal Amplification LAMP Assays for the Species-specific Detection of Eimeria that Infect Chickens

의 종 특이 검출을위한 루프 - 매개 등온 증폭 (LAMP) 분석 실험<em&gt; 에이 메리아</em&gt; 닭을 감염이

Eimeria species parasites, protozoa which cause the enteric disease coccidiosis, pose a serious threat to the production and welfare of chickens. In the ...

RNA Purification from Intracellularly Grown Listeria monocytogenes in Macrophage Cells

RNA Purification from Intracellularly Grown Listeria monocytogenes in Macrophage Cells

RNA 정제는 세포 내에서 재배<em&gt; 리스테리아</em&gt; 식세포 세포에

Analysis of the transcriptome of bacterial pathogens during mammalian infection is a valuable tool for studying genes and factors that mediate infection. ...

Isolation, Characterization, and Purification of Macrophages from Tissues Affected by Obesity-related Inflammation

절연, 특성화 및 비만 관련 염증에 의해 영향을 받는 조직에서 세포의 정화

Obesity promotes a chronic inflammatory state that is largely mediated by tissue-resident macrophages as well as monocyte-derived macrophages. ...

Identification of Virulence Markers of Mycobacterium abscessus for Intracellular Replication in Phagocytes

Identification of Virulence Markers of Mycobacterium abscessus for Intracellular Replication in Phagocytes

식 세포에서 세포내 복제에 대 한의 진 균 abscessus 독성 마커의 식별

What differentiates Mycobacterium abscessus from other saprophytic mycobacteria is the ability to resist phagocytosis by human macrophages and the ability ...

Purification of Extracellular Trypanosomes, Including African, from Blood by Anion-Exchangers (Diethylaminoethyl-cellulose Columns)

Purification of Extracellular Trypanosomes, Including African, from Blood by Anion-Exchangers Diethylaminoethyl-cellulose Columns

음이온 교환기 (Diethylaminoethyl-셀 루 로스 열)에 의해 혈액에서 아프리카를 포함 한 세포 외 Trypanosomes의 정화

This method allows the separation of trypanosomes, parasites responsible for animal and human African trypanosomiasis (HAT), from infected blood. This is ...