Name: small and wide angle x-ray scattering studies of biological macromolecules in solution
Uploaded: 2013-01-08T12:00:00
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Vorremmo ringraziare il Dott. Manfred Kriechbaum di XRS Hecus e l&#39;Istituto di Biofisica e della Ricerca Nanosystems presso l&#39;Accademia Austriaca delle Scienze a Graz, in Austria. LL e XW sono stati sostenuti in parte da US Department of Energy, sotto NERI-C Award No. DE-FG07-07ID14889, e US Nuclear Regulatory Commission, sotto Award n NRC-38-08-950. Lo strumento SWAXS è supportato anche in parte da US Department of Energy, sotto Award No. DE-NE0000325.

1. Preparazione del campione <ol><li> Utilizzare un ago per rimuovere una porzione del campione dal contenitore. * </li><li> Utilizzare l&#39;ago per riempire il capillare (diametro massimo di 2,2 mm) con il campione. Il capillare deve essere riempito tra 2 e 3 cm dal fondo. </li><li> Chiudere il capillare di fusione della cera sulla punta. </li><li> Svitare il supporto del campione vuoto dal sistema. </li><li> Prendere la capillare entro la fine fuso (fine cera) e inserire il non-fuso estremità nel supporto del camp...

<ol>
	<li>Bernad&#243;, P., Blackledge, M. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/query.fcgi?db=PubMed&cmd=Search&doptcmdl=Citation&defaultField=Title+Word&term=Structural+biology:+Proteins+in+dynamic+equilibrium.">Structural biology: Proteins in dynamic equilibrium.</a> Nature. 468, 1046-1048 (2010).</li><li>Zhang, F., Skoda, M. W. A., Jacobs, R. M. J., Martin, R. A., Martin, C. M., Schreiber, F. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/query.fcgi?db=PubMed&cmd=Search&doptcmdl=Citation&defaultField=Title+Word&term=Protein+Interactions+Studied+by+SAXS:+Effect+of+Ionic+Strength+and+Protein+Concentration+for+BSA+in+Aqueous+Solutions.">Protein Interactions Studied by SAXS: Effect of Ionic Strength and Protein Concentration for BSA in Aqueous Solutions.</a> J. Phys. Chem. B. 111, 251-259 (2007).</li><li>Maranas, J. K. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/query.fcgi?db=PubMed&cmd=Search&doptcmdl=Citation&defaultField=Title+Word&term=The+effect+of+environment+on+local+dynamics+of+macromolecules.">The effect of environment on local dynamics of macromolecules.</a> Current Opinion in Colloid &amp; Interface Science. 12, 29-42 (2007).</li><li>Stribeck, N. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/query.fcgi?db=PubMed&cmd=Search&doptcmdl=Citation&defaultField=Title+Word&term=.">.</a> X-Ray Scattering of Soft Matter. , (2007).</li><li>Mertens, H. D., Svergun, D. I. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/query.fcgi?db=PubMed&cmd=Search&doptcmdl=Citation&defaultField=Title+Word&term=Structural+characterization+of+proteins+and+complexes+using+small-angle+X-ray+solution+scattering.">Structural characterization of proteins and complexes using small-angle X-ray solution scattering.</a> J. Struct. Biol. 172 (1), 128 (2010).</li><li>Svergun, D. I. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/query.fcgi?db=PubMed&cmd=Search&doptcmdl=Citation&defaultField=Title+Word&term=Small-angle+X-ray+and+neutron+scattering+as+a+tool+for+structural+systems+biology.">Small-angle X-ray and neutron scattering as a tool for structural systems biology.</a> Biol. Chem. 391 (7), 737 (2010).</li><li>Putnam, C. D., Hammel, M., Hura, G. L., Tainer, J. A. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/query.fcgi?db=PubMed&cmd=Search&doptcmdl=Citation&defaultField=Title+Word&term=X-ray+solution+scattering+(SAXS)+combined+with+crystallography+and+computation:+defining+accurate+macromolecular+structures,+conformations+and+assemblies+in+solution.">X-ray solution scattering (SAXS) combined with crystallography and computation: defining accurate macromolecular structures, conformations and assemblies in solution.</a> Quat. Rev. Biophys. 40, 191-285 (2007).</li><li>Bonini, M., Fratini, E., Baglioni, P. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/query.fcgi?db=PubMed&cmd=Search&doptcmdl=Citation&defaultField=Title+Word&term=SAXS+study+of+chain-like+structures+formed+by+magnetic+nanoparticles.">SAXS study of chain-like structures formed by magnetic nanoparticles.</a> Materials Science &amp; Engineering C-Biomimetic and Supramolecular Systems. 27 (5-8), 1377-1381 (2007).</li><li>Falletta, E., Ridi, F., Fratini, E., Vannucci, C., Canton, P., Bianchi, S., Castelvetro, V., Baglioni, P. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/query.fcgi?db=PubMed&cmd=Search&doptcmdl=Citation&defaultField=Title+Word&term=A+tri-block+copolymer+templated+synthesis+of+gold+nanostructures.">A tri-block copolymer templated synthesis of gold nanostructures.</a> Journal of Colloid and Interface Science. 357 (1), 88-94 (2011).</li><li>Glatter, O., Scherf, G., Schillen, K., Brown, W. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/query.fcgi?db=PubMed&cmd=Search&doptcmdl=Citation&defaultField=Title+Word&term=Characterization+of+a+Poly(ethylene+oxide)+Poly(propylene+oxide)+Triblock+Copolymer+(EO(27)-PO39-EO(27))+in+Aqueous-Solution.">Characterization of a Poly(ethylene oxide) Poly(propylene oxide) Triblock Copolymer (EO(27)-PO39-EO(27)) in Aqueous-Solution.</a> Macromolecules. 27 (21), 6046-6054 (1994).</li><li>Mittelbach, R., Glatter, O. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/query.fcgi?db=PubMed&cmd=Search&doptcmdl=Citation&defaultField=Title+Word&term=Direct+structure+analysis+of+small-angle+scattering+data+from+polydisperse+colloidal+particles.">Direct structure analysis of small-angle scattering data from polydisperse colloidal particles.</a> Journal of Applied Crystallography. 31, 600-608 (1998).</li></ol>

La procedura comparativa del sistema SWAXS consente numerose variabili che devono essere determinati da analisi sperimentale. I parametri che vengono raggiunti dalla analisi può essere utilizzato per scopi diversi a seconda del campione e la configurazione sperimentale. SAXS fornisce informazioni su scala nanometrica dimensioni e la forma dell&#39;oggetto, mentre WAXS si concentra sulla struttura atomica e micro-scala (ad esempio reticolo molecolare, cellulare simmetria unità di misura). Più specificamente, ...

<table border="1"><tbody><tr><td> Nome dei prodotti </td><td> Azienda </td></tr><tr><td> Il System3 piccole e Wide-Angle X-Ray Scattering (SWAXS) Camera </td><td> Hecus XRS e IBN, Graz, Austria </td></tr><tr><td> GNOM </td><td> ATSAS 2,3 pacchetto D. Svergun EMBL-Amburgo </td></tr></tbody></table>

small and wide angle x-ray scattering studies of biological macromolecules in solution

In questo lavoro, piccole e Wide Angle X-ray Scattering (SWAXS) analisi delle macromolecole è dimostrata attraverso la sperimentazione. SWAXS è una tecnica in cui i raggi X sono elasticamente sparsi da un campione disomogeneo nel nm-gamma a piccoli angoli (tipicamente 0.1 - 5 °) e angoli di larghezza (in genere&gt; 5 °). Questa tecnica fornisce informazioni circa la forma, le dimensioni e la distribuzione di macromolecole, distanze caratteristici di materiali parzialmente ordinati, dimensioni dei pori, e superficie-volume di rapporto. Piccolo angolo X-ray Scattering (SAXS) è in grado di fornire informazioni strutturali di macromolecole tra 1 e 200 nm, mentre Wide Angle X-ray Scattering (WAXS) può risolvere ancora minore spaziatura Bragg di campioni tra 0,33 e 0,49 nm nm basata sulla configurazione del sistema specifico e rivelatore. La distanza è determinata dalla legge di Bragg e dipende dalla lunghezza d&#39;onda e angolo incidente. In un esperimento SWAXS, i materiali possono essere solidio liquido e può contenere solidi, liquidi o gassosi domini (cosiddette particelle) dello stesso materiale o di un altro in qualsiasi combinazione. Applicazioni SWAXS sono molto ampie e comprendono colloidi di tutti i tipi: metalli, materiali compositi, cemento, olio, polimeri, materie plastiche, proteine, alimenti e prodotti farmaceutici. Per campioni solidi, lo spessore è limitata a circa 5 mm. L&#39;utilizzo di un laboratorio strumento basato SWAXS è dettagliata in questo articolo. Con il software a disposizione (ad esempio, GNOM-ATSAS 2,3 pacchetto D. Svergun EMBL-Amburgo e software EasySWAXS) per il sistema SWAXS, un esperimento può essere condotto per determinare alcuni parametri di interesse per il campione dato. Un esempio di un esperimento macromolecola biologica è l&#39;analisi del 2% in peso di lisozima in una base di acqua tampone acquoso che possono essere scelti e preparati con numerosi metodi. La preparazione del campione segue le istruzioni riportate nella sezione Preparazione dei campioni. Attraverso la sperimentazione SWAXS,importanti parametri strutturali di lisozima, ad esempio, il raggio di girazione, possono essere analizzati.

SAXS e WAXS complessivamente possono fornire informazioni strutturali del campione attraverso i seguenti parametri: il raggio di girazione, dimensione delle particelle e la forma, la struttura fattore soluzione, specifica superficie interna e la dimensione dei pori, tipo lattice e dimensione e densità elettronica 1. SAXS e WAXS può essere applicato anche allo studio della dinamica delle proteine ​​2. L&#39;informazione strutturale di esperimenti SWAXS viene ottenu...

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Small and Wide Angle X-Ray Scattering Studies of Biological Macromolecules in Solution

La dimostrazione dell&#39;angolo piccolo e grande X-ray scattering (SWAXS) procedura è diventato determinante per lo studio delle macromolecole biologiche. Attraverso l&#39;uso della strumentazione e procedure di metodi angolari specifici e preparazione, i dati sperimentali dei SWAXS visualizza la caratterizzazione atomica e nano-scala di macromolecole.

Piccole e Wide Angle X-Ray Scattering Studi di macromolecole biologiche in soluzione

In this paper, Small and Wide Angle X-ray Scattering (SWAXS) analysis of macromolecules is demonstrated through experimentation. SWAXS is a technique ...

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As medicine is currently practiced, doctors send specimens to a central laboratory for testing and thus must wait hours or days to 
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Procedures utilizing millifluidic devices for chemical synthesis and time-resolved mechanistic studies are described by taking three examples. In the ...

Characterization Of Multi-layered Fish Scales (Atractosteus spatula) Using Nanoindentation, X-ray CT, FTIR, and SEM

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