Name: small and wide angle x-ray scattering studies of biological macromolecules in solution
Uploaded: 2013-01-08T12:00:00
Description: Watch this Scientific Journal Video about Small and Wide Angle X-Ray Scattering Studies of Biological Macromolecules in Solution at JoVE.com

Мы хотели бы поблагодарить д-р Манфред Kriechbaum из XRS Hecus и Института биофизики и наносистем исследований Австрийской академии наук в Граце, Австрия. LL и XW была частично поддержана Министерством энергетики США, под NERI-C решение № DE-FG07-07ID14889 и США Комиссия по ядерному регулированию, под решение № СРН-38-08-950. Прибор SWAXS также при частичной поддержке Министерства энергетики США, под решение № DE-NE0000325.

1. Подготовка образца <ol><li> Используйте иглу для удаления некоторых образцов из образца контейнера *. </li><li> Используйте иглу для заполнения капилляра (максимальный диаметр 2,2 мм) с образцом. Капиллярной должны быть заполнены между 2 и 3 см от дна. </li><li> Закрыть капилляра плавления воска на...

<ol>
	<li>Bernad&#243;, P., Blackledge, M. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/query.fcgi?db=PubMed&cmd=Search&doptcmdl=Citation&defaultField=Title+Word&term=Structural+biology:+Proteins+in+dynamic+equilibrium.">Structural biology: Proteins in dynamic equilibrium.</a> Nature. 468, 1046-1048 (2010).</li><li>Zhang, F., Skoda, M. W. A., Jacobs, R. M. J., Martin, R. A., Martin, C. M., Schreiber, F. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/query.fcgi?db=PubMed&cmd=Search&doptcmdl=Citation&defaultField=Title+Word&term=Protein+Interactions+Studied+by+SAXS:+Effect+of+Ionic+Strength+and+Protein+Concentration+for+BSA+in+Aqueous+Solutions.">Protein Interactions Studied by SAXS: Effect of Ionic Strength and Protein Concentration for BSA in Aqueous Solutions.</a> J. Phys. Chem. B. 111, 251-259 (2007).</li><li>Maranas, J. K. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/query.fcgi?db=PubMed&cmd=Search&doptcmdl=Citation&defaultField=Title+Word&term=The+effect+of+environment+on+local+dynamics+of+macromolecules.">The effect of environment on local dynamics of macromolecules.</a> Current Opinion in Colloid &amp; Interface Science. 12, 29-42 (2007).</li><li>Stribeck, N. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/query.fcgi?db=PubMed&cmd=Search&doptcmdl=Citation&defaultField=Title+Word&term=.">.</a> X-Ray Scattering of Soft Matter. , (2007).</li><li>Mertens, H. D., Svergun, D. I. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/query.fcgi?db=PubMed&cmd=Search&doptcmdl=Citation&defaultField=Title+Word&term=Structural+characterization+of+proteins+and+complexes+using+small-angle+X-ray+solution+scattering.">Structural characterization of proteins and complexes using small-angle X-ray solution scattering.</a> J. Struct. Biol. 172 (1), 128 (2010).</li><li>Svergun, D. I. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/query.fcgi?db=PubMed&cmd=Search&doptcmdl=Citation&defaultField=Title+Word&term=Small-angle+X-ray+and+neutron+scattering+as+a+tool+for+structural+systems+biology.">Small-angle X-ray and neutron scattering as a tool for structural systems biology.</a> Biol. Chem. 391 (7), 737 (2010).</li><li>Putnam, C. D., Hammel, M., Hura, G. L., Tainer, J. A. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/query.fcgi?db=PubMed&cmd=Search&doptcmdl=Citation&defaultField=Title+Word&term=X-ray+solution+scattering+(SAXS)+combined+with+crystallography+and+computation:+defining+accurate+macromolecular+structures,+conformations+and+assemblies+in+solution.">X-ray solution scattering (SAXS) combined with crystallography and computation: defining accurate macromolecular structures, conformations and assemblies in solution.</a> Quat. Rev. Biophys. 40, 191-285 (2007).</li><li>Bonini, M., Fratini, E., Baglioni, P. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/query.fcgi?db=PubMed&cmd=Search&doptcmdl=Citation&defaultField=Title+Word&term=SAXS+study+of+chain-like+structures+formed+by+magnetic+nanoparticles.">SAXS study of chain-like structures formed by magnetic nanoparticles.</a> Materials Science &amp; Engineering C-Biomimetic and Supramolecular Systems. 27 (5-8), 1377-1381 (2007).</li><li>Falletta, E., Ridi, F., Fratini, E., Vannucci, C., Canton, P., Bianchi, S., Castelvetro, V., Baglioni, P. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/query.fcgi?db=PubMed&cmd=Search&doptcmdl=Citation&defaultField=Title+Word&term=A+tri-block+copolymer+templated+synthesis+of+gold+nanostructures.">A tri-block copolymer templated synthesis of gold nanostructures.</a> Journal of Colloid and Interface Science. 357 (1), 88-94 (2011).</li><li>Glatter, O., Scherf, G., Schillen, K., Brown, W. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/query.fcgi?db=PubMed&cmd=Search&doptcmdl=Citation&defaultField=Title+Word&term=Characterization+of+a+Poly(ethylene+oxide)+Poly(propylene+oxide)+Triblock+Copolymer+(EO(27)-PO39-EO(27))+in+Aqueous-Solution.">Characterization of a Poly(ethylene oxide) Poly(propylene oxide) Triblock Copolymer (EO(27)-PO39-EO(27)) in Aqueous-Solution.</a> Macromolecules. 27 (21), 6046-6054 (1994).</li><li>Mittelbach, R., Glatter, O. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/query.fcgi?db=PubMed&cmd=Search&doptcmdl=Citation&defaultField=Title+Word&term=Direct+structure+analysis+of+small-angle+scattering+data+from+polydisperse+colloidal+particles.">Direct structure analysis of small-angle scattering data from polydisperse colloidal particles.</a> Journal of Applied Crystallography. 31, 600-608 (1998).</li></ol>

Сравнительный порядок системы SWAXS позволяет многочисленными переменными, которые будут определены по экспериментальным анализом. Параметров, которые достигаются в результате анализа могут быть использованы для различных целей, в соответствии с образцом и экспериментальной установ?...

<table border="1"><tbody><tr><td> Наименование продукции </td><td> Компания </td></tr><tr><td> System3 малого и широким углом рассеяния рентгеновских лучей (SWAXS) камеры </td><td> Hecus XRS и IBN, Грац, Австрия </td></tr><tr><td> ГНОМ </td><td> ATSAS 2,3 пакета Д. Свергун EMBL-Гамбург </td></tr></tbody></table>

small and wide angle x-ray scattering studies of biological macromolecules in solution

В этой статье малого и широкий угол рентгеновское рассеяние (SWAXS) анализ макромолекул продемонстрировал экспериментальным путем. SWAXS это техника, где Х-лучей упруго рассеянного неоднородного образца в нм-диапазона на малые углы (как правило, 0,1 - 5 °) и широкими углами (обычно&gt; 5 °). Этот метод дает информацию о форме, размере и распределении макромолекулы, характерные расстояния частично упорядоченных материалов, размеров пор и поверхности к объему. Малый угол рентгеновского рассеяния (МУР) способен обеспечить структурную информацию макромолекул между 1 и 200 нм, в то время как широкий угол рентгеновское рассеяние (WAXS) может решить еще меньше брэгговских расстояние между образцами 0,33 нм и 0,49 нм на основе конкретные настройки системы и детектор. Расстояние определяется по закону Брэгга и зависит от длины волны и угла падения. В эксперименте SWAXS, материалы могут быть твердымиили жидкой и может содержать твердых, жидких или газообразных области (так называемые частицы) того же или другого материала, в любой комбинации. SWAXS применения очень широк и включает коллоидов всех типов: металлы, композитные материалы, цемент, нефть, полимеры, пластмассы, белков, пищевых продуктов и лекарственных препаратов. Для твердых образцов, толщина ограничен примерно 5 мм. Использование лаборатория контрольно-измерительных SWAXS подробно описано в этой статье. С доступного программного обеспечения (например, ГНОМ-ATSAS 2,3 пакета Д. Свергун EMBL-Гамбург и EasySWAXS программного обеспечения) для системы SWAXS, эксперимент может быть проведен для определения некоторых параметров, представляющих интерес для данного образца. Одним из примеров биологического эксперимента макромолекулы является анализ 2 мас лизоцима% в водной основе водного буфера, которые могут быть выбраны и подготовлены с помощью многочисленных методов. Подготовка образца следующим рекомендациям, указанным ниже в Подготовка образца раздел. Благодаря экспериментам SWAXS,важным структурным параметрам лизоцима, например, радиус инерции, могут быть проанализированы.

SAXS и WAXS в целом может обеспечить структурную информацию образца с помощью следующих параметров: радиус инерции, размер и форма частиц, коэффициент структуры решения, конкретные внутренней поверхности и размера пор, решетка типа и размера, а также электронная плотность 1. SAXS и WAXS т?...

Watch this Scientific Journal Video about Small and Wide Angle X-Ray Scattering Studies of Biological Macromolecules in Solution at JoVE.com

Small and Wide Angle X-Ray Scattering Studies of Biological Macromolecules in Solution

Демонстрация малого и широкий угол рассеяния рентгеновских лучей (SWAXS) процедура стала роль в изучении биологических макромолекул. Благодаря использованию приборов и процедур, специфических методов угол и подготовки, экспериментальные данные из SWAXS отображает атомного и нано-характеристика макромолекул.

Малый и широкий угол рассеяния рентгеновских лучей исследования биологических макромолекул в растворе

In this paper, Small and Wide Angle X-ray Scattering (SWAXS) analysis of macromolecules is demonstrated through experimentation. SWAXS is a technique ...

Research

Education

JoVE Journal

JoVE Core

Biology

Bioengineering

Fundamentals

Macromolecules

SCIENTISTS IN ACTION

Electrospinning Fundamentals: Optimizing Solution and Apparatus Parameters

Электропрядения Основы: Оптимизация решений и аппараты Параметры

Electrospun nanofiber scaffolds have been shown to accelerate the maturation, improve the growth, and direct the migration of cells in vitro. ...

Fabrication of Electrochemical-DNA Biosensors for the Reagentless Detection of Nucleic Acids, Proteins and Small Molecules

Изготовление Электрохимические ДНК-биосенсоры для Безреагентная Обнаружение нуклеиновых кислот, белков и малых молекул

As medicine is currently practiced, doctors send specimens to a central laboratory for testing and thus must wait hours or days to 
receive the results. ...

Millifluidics for Chemical Synthesis and Time-resolved Mechanistic Studies

Millifluidics для химического синтеза и с временным разрешением механистических исследований

Procedures utilizing millifluidic devices for chemical synthesis and time-resolved mechanistic studies are described by taking three examples. In the ...

Characterization Of Multi-layered Fish Scales (Atractosteus spatula) Using Nanoindentation, X-ray CT, FTIR, and SEM

Characterization Of Multi-layered Fish Scales Atractosteus spatula Using Nanoindentation, X-ray CT, FTIR, and SEM

Характеристика многослойных рыбьей чешуи (<em&gt; Atractosteus шпатель</em&gt;) Использование Наноиндентирование, РКТ, Фурье-ИК и SEM

The hierarchical architecture of protective biological materials such as mineralized fish scales, gastropod shells, ram&#8217;s horn, antlers, and turtle ...

Studying Soft-matter and Biological Systems over a Wide Length-scale from Nanometer and Micrometer Sizes at the Small-angle Neutron Diffractometer KWS-2

Изучение Soft-материи и биологических систем в широком масштабе длины от нанометра и микрометра Размеры на малоуглового нейтронного дифрактометра KWS-2

The KWS-2 SANS diffractometer is dedicated to the investigation of soft matter and biophysical systems covering a wide length scale, from nm to &#181;m. ...

The Arteriovenous (AV) Loop in a Small Animal Model to Study Angiogenesis and Vascularized Tissue Engineering

The Arteriovenous AV Loop in a Small Animal Model to Study Angiogenesis and Vascularized Tissue Engineering

Loop Arteriovenous (AV) в модели мелких животных для изучения ангиогенеза и васкуляризированных тканевой инженерии

A functional blood vessel network is a prerequisite for the survival and growth of almost all tissues and organs in the human body. Moreover, in ...

A Novel Technique for Generating and Observing Chemiluminescence in a Biological Setting

Новый метод для генерации и наблюдения хемилюминесценции в биологическом Окружение

Intraoperative imaging techniques have the potential to make surgical interventions safer and more effective; for these reasons, such techniques are ...

Patterning Bioactive Proteins or Peptides on Hydrogel Using Photochemistry for Biological Applications

Кучность биоактивные белки или пептидов на гидрогеля с помощью фотохимии биологических приложений

There are many biological stimuli that can influence cell behavior and stem cell differentiation. General cell culture approaches rely on soluble factors ...

Using Nanoplasmon-Enhanced Scattering and Low-Magnification Microscope Imaging to Quantify Tumor-Derived Exosomes

Использование Наноплазмона-усиленного рассеяния и Низкоувеличенного микроскопа визуализации для количественной оценки опухоли-производные Exosomes

Infected or malignant cells frequently secrete more exosomes, leading to elevated levels of disease-associated exosomes in the circulation. These exosomes ...

Use of Micro X-ray Computed Tomography with Phosphotungstic Acid Preparation to Visualize Human Fibromuscular Tissue

Использование микрорентгенй компьютерной томографии с фосхотунгстовой кислотой Препарат для визуализации человека фибромышечной ткани

Manual dissection and histological observation are common methods used to investigate human tissues. However, manual dissection can damage delicate ...