Name: glycan profiling of plant cell wall polymers using microarrays
Uploaded: 2012-12-17T13:00:00
Description: Watch this Scientific Journal Video about Glycan Profiling of Plant Cell Wall Polymers using Microarrays at JoVE.com

IEM skulle vilja erkänna det danska forskningsrådet (FTP och FNU) för finansiering. ERL erkänner stöd av en ARC DP bidrag. AB erkänner stöd av ARC Centre of Excellence i Plant cellväggar bidrag.

1. Tissue Insamling och förberedelse <ol><li> Samla 100 mg färskvikt av växtvävnader (minst 10 mg torrvikt) i minst tre exemplar för varje vävnad av intresse. Följande steg beskriver framställningen av cellväggen material från vegetativa vävnader. När det gäller lagring vävnader är oönskad stärkelse enzymatiskt bort innan du fortsätter med utvinning av polymerer cellväggen som tidigare beskrivits 13. </li><li> Homogenisera proverna till ett fint pulver med flytande kväve med användning ...

<ol>
	<li>Carpita, N. C., Gibeaut, D. M. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/query.fcgi?db=PubMed&cmd=Search&doptcmdl=Citation&defaultField=Title+Word&term=Structural+models+of+primary+cell+walls+in+flowering+plants:+consistency+of+molecular+structure+with+the+physical+properties+of+the+walls+during+growth.">Structural models of primary cell walls in flowering plants: consistency of molecular structure with the physical properties of the walls during growth.</a> Plant J. 3, 1-30 (1993).</li><li>Somerville, C. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/query.fcgi?db=PubMed&cmd=Search&doptcmdl=Citation&defaultField=Title+Word&term=Biofuels.">Biofuels.</a> Curr. Biol. 17, 115-119 (2007).</li><li>Willats, W. G., Orfila, C., Limberg, G., et al. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/query.fcgi?db=PubMed&cmd=Search&doptcmdl=Citation&defaultField=Title+Word&term=Modulation+of+the+degree+and+pattern+of+methyl-esterification+of+pectic+homogalacturonan+in+plant+cell+walls.+implications+for+pectin+methyl+esterase+action,+matrix+properties,+and+cell+adhesion.">Modulation of the degree and pattern of methyl-esterification of pectic homogalacturonan in plant cell walls. implications for pectin methyl esterase action, matrix properties, and cell adhesion.</a> J. Biol. Chem. 276, 19404-19413 (2001).</li><li>Doblin, M. S., Pettolino, F., Bacic, A. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/query.fcgi?db=PubMed&cmd=Search&doptcmdl=Citation&defaultField=Title+Word&term=Plant+cell+walls:+the+skeleton+of+the+plant+world.">Plant cell walls: the skeleton of the plant world.</a> Functional Plant Biology. 37, 357-381 (2010).</li><li>Carpita, N., Tierney, M., Campbell, M. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/query.fcgi?db=PubMed&cmd=Search&doptcmdl=Citation&defaultField=Title+Word&term=Molecular+biology+of+the+plant+cell+wall:+searching+for+the+genes+that+define+structure,+architecture+and+dynamics.">Molecular biology of the plant cell wall: searching for the genes that define structure, architecture and dynamics.</a> Plant Molecular Biology. 47, 1-5 (2001).</li><li>Sarria, R., Wagner, T. A., O'Neill, M. A., Faik, A., et al. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/query.fcgi?db=PubMed&cmd=Search&doptcmdl=Citation&defaultField=Title+Word&term=Characterization+of+a+family+of+Arabidopsis+genes+related+to+xyloglucan+fucosyltransferase1.">Characterization of a family of Arabidopsis genes related to xyloglucan fucosyltransferase1.</a> Plant Physiol. 127, 1595-1606 (2001).</li><li>Somerville, C., Bauer, S., Brininstool, G. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/query.fcgi?db=PubMed&cmd=Search&doptcmdl=Citation&defaultField=Title+Word&term=Toward+a+systems+approach+to+understanding+plant+cell+walls.">Toward a systems approach to understanding plant cell walls.</a> Science. 306, 2206-2211 (2004).</li><li>Willats, W. G. T., Knox, J. P., Rose, J. K. C. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/query.fcgi?db=PubMed&cmd=Search&doptcmdl=Citation&defaultField=Title+Word&term=Molecules+in+context:+probes+for+cell+wall+analysis.">Molecules in context: probes for cell wall analysis.</a> The Plant Cell Wall. , 92-110 (2003).</li><li>Pattathil, S., Avci, U., Baldwin, D., et al. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/query.fcgi?db=PubMed&cmd=Search&doptcmdl=Citation&defaultField=Title+Word&term=A+Comprehensive+Toolkit+of+Plant+Cell+Wall+Glycan-Directed+Monoclonal+Antibodies.">A Comprehensive Toolkit of Plant Cell Wall Glycan-Directed Monoclonal Antibodies.</a> Plant Physiology. 153, 514-525 (2010).</li><li>Moller, I. E., S&#248;rensen, I., Bernal, A. J., et al. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/query.fcgi?db=PubMed&cmd=Search&doptcmdl=Citation&defaultField=Title+Word&term=High-throughput+mapping+of+cell-wall+polymers+within+and+between+plants+using+novel+microarrays.">High-throughput mapping of cell-wall polymers within and between plants using novel microarrays.</a> The Plant J. 50, 1118-1128 (2007).</li><li>S&#248;rensen, I., Willats, W. G. T. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/query.fcgi?db=PubMed&cmd=Search&doptcmdl=Citation&defaultField=Title+Word&term=Screening+and+characterization+of+plant+cell+walls+using+carbohydrate+microarrays.">Screening and characterization of plant cell walls using carbohydrate microarrays.</a> Methods Mol. Biol. 715, 115-121 (2011).</li><li>Moller, I. E., Licht, D. e. F. i. n. e., Harholt, H. H., J, , et al. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/query.fcgi?db=PubMed&cmd=Search&doptcmdl=Citation&defaultField=Title+Word&term=The+dynamics+of+plant+cell-wall+polysaccharide+decomposition+in+leaf-cutting+ant+fungus+gardens.">The dynamics of plant cell-wall polysaccharide decomposition in leaf-cutting ant fungus gardens.</a> PLoS One. 6 (3), e17506 (2011).</li><li>Pettolino, F. A., Walsh, C., Fincher, G. B. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/query.fcgi?db=PubMed&cmd=Search&doptcmdl=Citation&defaultField=Title+Word&term=Chemical+procedures+for+the+determination+of+polysaccharide+composition+of+plant+cell+walls.">Chemical procedures for the determination of polysaccharide composition of plant cell walls.</a> Nature Protocols. , (2012).</li><li>Clausen, M. H., Willats, W. G. T., Knox, J. P. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/query.fcgi?db=PubMed&cmd=Search&doptcmdl=Citation&defaultField=Title+Word&term=Synthetic+methyl+hexagalacturonate+hapten+inhibitors+of+anti-homogalacturonan+monoclonal+antibodies+LM7,+JIM5+and+JIM7.">Synthetic methyl hexagalacturonate hapten inhibitors of anti-homogalacturonan monoclonal antibodies LM7, JIM5 and JIM7.</a> Carbohydrate Res. 338, 1797-1800 (2003).</li><li>Verhertbruggen, Y., Marcus, S. E., Haeger, A., et al. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/query.fcgi?db=PubMed&cmd=Search&doptcmdl=Citation&defaultField=Title+Word&term=Developmental+complexity+of+arabinan+polysaccharides+and+their+processing+in+plant+cell+walls.">Developmental complexity of arabinan polysaccharides and their processing in plant cell walls.</a> Plant J. 59, 413-425 (2009).</li><li>Heimburg-Molinaro, J., Song, X., Smith, D. F. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/query.fcgi?db=PubMed&cmd=Search&doptcmdl=Citation&defaultField=Title+Word&term=UNIT+12.10+Preparation+and+Analysis+of+Glycan+Microarray.">UNIT 12.10 Preparation and Analysis of Glycan Microarray.</a> Current Protocols in Protein Science. , (2011).</li><li>McCartney, L., Blake, A., Flint, J., et al. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/query.fcgi?db=PubMed&cmd=Search&doptcmdl=Citation&defaultField=Title+Word&term=Differential+recognition+of+plant+cell+walls+by+microbial+xylan-specific+carbohydrate-binding+modules.">Differential recognition of plant cell walls by microbial xylan-specific carbohydrate-binding modules.</a> PNAS. 103, 4765-4770 (2006).</li><li>Ca&#241;o-Delgado, A. I., Metzlaff, K., Bevan, M. W. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/query.fcgi?db=PubMed&cmd=Search&doptcmdl=Citation&defaultField=Title+Word&term=The+eli1+mutation+reveals+a+link+between+cell+expansion+and+secondary+cell+wall+formation+in+Arabidopsis+thaliana.">The eli1 mutation reveals a link between cell expansion and secondary cell wall formation in Arabidopsis thaliana.</a> Development. 127, 3395-3405 (2000).</li><li>Manabe, Y., Nafisi, M., Verhertbruggen, Y., et al. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/query.fcgi?db=PubMed&cmd=Search&doptcmdl=Citation&defaultField=Title+Word&term=Loss-of-Function+Mutation+of+REDUCED+WALL+ACETYLATION2+in+Arabidopsis+Leads+to+Reduced+Cell+Wall+Acetylation+and+Increased+Resistance+to+Botrytis+cinerea.">Loss-of-Function Mutation of REDUCED WALL ACETYLATION2 in Arabidopsis Leads to Reduced Cell Wall Acetylation and Increased Resistance to Botrytis cinerea.</a> Plant Physiology. 155, 1068-1078 (2011).</li><li>Updegraff, D. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/query.fcgi?db=PubMed&cmd=Search&doptcmdl=Citation&defaultField=Title+Word&term=Semimicro+determination+of+cellulose+in+biological+materials.">Semimicro determination of cellulose in biological materials.</a> Anal. Biochem. 32, 420-424 (1969).</li><li>21Moller, I., Marcus, S. E., Haeger, A., et al. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/query.fcgi?db=PubMed&cmd=Search&doptcmdl=Citation&defaultField=Title+Word&term=High-throughput+screening+of+monoclonal+antibodies+against+plant+cell+wall+glycans+by+hierarchial+clustering+of+their+carbohydrate+microarray+binding+profiles.">High-throughput screening of monoclonal antibodies against plant cell wall glycans by hierarchial clustering of their carbohydrate microarray binding profiles.</a> Glycoconjugate Journal. 25, 37-48 (2007).</li><li>S&#248;rensen, I., Pettolino, F. A., Wilson, S. M., et al. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/query.fcgi?db=PubMed&cmd=Search&doptcmdl=Citation&defaultField=Title+Word&term=Mixed+linkage+(1&#8594;3),(1&#8594;4)-&#946;-D-glucan+is+not+unique+to+the+Poales+and+is+an+abundant+component+of+Equisetum+arvense+cell+walls.">Mixed linkage (1&#8594;3),(1&#8594;4)-&#946;-D-glucan is not unique to the Poales and is an abundant component of Equisetum arvense cell walls.</a> Plant J. 54 (13), 510-521 (2008).</li><li>Domozych, D. S., S&#248;rensen, I., Willats, W. G. T. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/query.fcgi?db=PubMed&cmd=Search&doptcmdl=Citation&defaultField=Title+Word&term=The+distribution+of+cell+wall+polymers+during+antheridium+development+and+spermatogenesis+in+the+Charophycean+green+alga,+Chara.">The distribution of cell wall polymers during antheridium development and spermatogenesis in the Charophycean green alga, Chara.</a> 2104, 1045-1056 (2009).</li><li>Singh, B., Avci, U., Eichler Inwood, S. E. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/query.fcgi?db=PubMed&cmd=Search&doptcmdl=Citation&defaultField=Title+Word&term=A+specialized+outer+layer+of+the+primary+cell+wall+joins+elongating+cotton+fibers+into+tissue-like+bundles.">A specialized outer layer of the primary cell wall joins elongating cotton fibers into tissue-like bundles.</a> Plant Physiol. 150, 684-699 (2009).</li><li>&#216;bro, J., S&#248;rensen, I., Derkx, P., et al. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/query.fcgi?db=PubMed&cmd=Search&doptcmdl=Citation&defaultField=Title+Word&term=High-throughput+screening+of+Erwinia+chrysanthemi+pectin+methylesterase+variants+using+carbohydrate+microarrays.">High-throughput screening of Erwinia chrysanthemi pectin methylesterase variants using carbohydrate microarrays.</a> Proteomics. 9, 1861-1868 (2009).</li></ol>

CoMPP är en snabb och känslig metod för profilering av glykan sammansättningen av hundratals vegetabiliska prover i några dagar. Denna metod kompletterar de redan tillgängliga bakterie-eller däggdjursceller glykan array plattformar för high-throughput screening av kolhydrater interaktioner med glykan-bindande proteiner såsom lektiner, receptorer och antikroppar 16. Med en stor mångfald av prober tillgängliga för detektion glykaner cellväggen, är det möjligt att få detaljerad information om gly...

<table border="1"><tbody><tr><td> Namnet av reagenset </td><td> Företag </td><td> Katalognummer </td><td> Kommentarer (tillval) </td></tr><tr><td> 3 mm Tungsten Carbide pärlor </td><td> Qiagen </td><td> 69.997 </td><td></td></tr><tr><td> Collection mikrorör (1,2 mm) </td><td> Qiagen </td><td> 19.560 </td><td> 1,5 ml mikrofugrör kan också användas </td></tr><tr><td> Qiagen TissueLyser II </td><td> Qiagen </td><td> 85.300 </td><td></td></tr><tr><td> 3 mm glaspärlor </td><td> Sigma Aldrich </td><td> Z143928 </td><td></td></tr><tr><td> CDTA </td><td> Sigma Aldrich </td><td> 34.588 </td><td></td></tr><tr><td> Kadmiumoxid </td><td> Sigma Aldrich </td><td> 202.894 </td><td></td></tr><tr><td> 1,2-diaminoetan </td><td> Sigma Aldrich </td><td> 03.550 </td><td></td></<html> tr&gt; <tr><td> Nitrocellulosamembran (0,22 fim porstorlek) </td><td> GE-vatten och processteknik </td><td> EP2HY00010 </td><td> olika porer stora membran är lämpliga för olika typer av stift </td></tr><tr><td> Xact II microarrayer robot </td><td> Labnext </td><td> 001A </td><td> XACT II roboten försågs med en anpassad 20 x 20 cm keramisk platta som nitrocellulosamembranet är fäst </td></tr><tr><td> Xtend RM microarray stift </td><td> Labnext </td><td> 0037-350 </td><td> stift måste vara lämpliga för observation på membran </td></tr><tr><td> 384 brunnars mikrotiterplattor (polypropen) </td><td> Greiner </td><td> 781.207 </td><td></td></tr><tr><td> Anti-glykan monoklonala antikroppar </td><td> Växt Sonder / CarboSource / Biosupplies </td><td></td><td> Hemsidor, PlantProbes ( <a href="http://www.plantprobes.net" target="_blank">www.plantprobes.net</a> ), Carbosource (ww.carbosource.net &quot;target =&quot; _blank &quot;&gt; www.carbosource.net) och Biosupplies ( <a href="http://www.biosupplies.com.au" target="_blank">www.biosupplies.com.au</a> ). </td></tr><tr><td> Anti-rått-IgG (hel molekyl) - peroxidas antikropp producerad i get. </td><td> Sigma </td><td> A9037 </td><td> typen av sekundära antikroppar beror på den primära antikropp som används (t.ex. upp i råtta, mus, get etc.). </td></tr><tr><td> SIGMA FAST 3,3 &#39;-diaminobensidin tabletter </td><td> Sigma </td><td> D4293 </td><td> typen av framkallningsreagens beror på de använda sekundära antikropparna och detektionsmetoden (colourmetric eller chemiluminecent). </td></tr><tr><td> Supersignalen West Pico kemiluminescerande substrat </td><td> Thermoscientific </td><td> 34.080 </td><td> se ovan </td></tr><tr><td> Xplore bildbehandlingsprogram </td><td> LabNext </td><td> 008 </td><td> många program typer med automatisk gridding verktyg finns tillgängligaatt mäta pixelvärde på microarray fläckar. </td></tr><tr><td> Växt polysackarider </td><td> Sigma / Megazyme </td><td></td><td></td></tr></tbody></table>

glycan profiling of plant cell wall polymers using microarrays

Växt cellväggar är komplexa matriser av heterogena glykaner som spelar en viktig roll i fysiologi och utveckling av växter och ge råvaror för mänskliga samhällen (t.ex. trä, papper, textil-och biobränsle industri) 1,2. Men förstå biosyntes och funktion av dessa komponenter förblir utmanande. Cellvägg glykaner är kemiskt och konformationellt olika beroende på komplexiteten i deras byggstenar, de glykosylrester. Dessa bildar bindningar vid flera positioner och skiljer sig i ringstruktur, isomer eller anomeriska konfigurationen, och dessutom är substituerade med en grupp av icke-sockerrester. Glykan sammansättning varierar i olika cell-och / eller typer vävnad eller sub-domäner av en enda cell vägg 3. Dessutom är deras sammansättning också ändras under utveckling 1, eller som svar på miljö-signaler 4. I excess av 2.000 gener har växt cellväggar är komplexa matriser av heterogena glykaner förutsagts vara inblandade i cellväggen glykan biosyntes och modifiering i Arabidopsis 5. Emellertid har relativt få av de biosyntetiska gener funktionellt karaktäriseras 4,5. Omvänd genetik metoder är svårt eftersom generna ofta är differentiellt uttryckta, ofta vid låga nivåer, mellan celltyper 6. Dessutom är muterade studier ofta hindras av gen redundans eller kompenserande mekanismer för att garantera lämplig cellväggen funktion bibehålls 7. Således nya metoder behövs för att snabbt karakterisera många olika glykanstrukturer och underlätta funktionsgenomiska metoder för att förstå cellväggsbiosyntes och modifiering. Monoklonala antikroppar (mAbs) 8,9 har dykt upp som ett viktigt verktyg för att bestämma glykan struktur och fördelning i växter. Dessa erkänner distINCT epitoper som finns inom huvudklasser av växtcellväggnedbrytande glykaner, inklusive pektiner, xyloglucans, xylaner, mannaner, glukaner och arabinogalactans. Nyligen deras användning har utvidgats till storskalig screening experiment för att bestämma den relativa förekomsten av glykaner i ett brett spektrum av växt-och vävnadstyper samtidigt 9,10,11. Här presenterar vi en microarray-baserade glykan screening metod som kallas Omfattande Microarray Polymer Profilering (CoMPP) (figur 1 och 2) 10,11 som gör att flera prover (100 sek) kan ses med en miniatyriserad microarray-plattform med minskad reagens och volymerna prov. De platsen signaler på microarray formellt kan kvantifieras för att ge semi-kvantitativa data om glykan epitop händelse. Detta tillvägagångssätt är väl lämpad att spåra glykan förändringar i komplexa biologiska system 12 och ger en helhetsbild av cellväggen sammansättning särskilt när förkunskaper of detta är tillgänglig.

Den relativa förekomsten av glykaner i sex vävnadstyper (anther filament, pollen, äggstockar, kronblad, foderblad och stigma) från Nicotiana alata blommor bestämdes med användning CoMPP. Figur 3A visar en representativ mikromatris som har undersöktes med mAb JIM5 specifik för partiellt (låg) methylesterified homogalacturonan (HG), en epitop som uppträder på pektin polysackarider 14. Den JIM5 epitopen detekteras i CDTA extrakt av alla blommor vävnader är dock högst i pollen och lägst i ...

Watch this Scientific Journal Video about Glycan Profiling of Plant Cell Wall Polymers using Microarrays at JoVE.com

Glycan Profiling of Plant Cell Wall Polymers using Microarrays

En teknik som kallas<strong&gt; C</strong&gt; Omprehensive<strong&gt; M</strong&gt; Icroarray<strong&gt; P</strong&gt; Olymer Profilering (CoMPP) för karakterisering av växtcellväggnedbrytande glykaner beskrivs. Denna metod kombinerar för monoklonala antikroppar riktade mot definierade glykan-epitoper med en miniatyr microarray analys plattform möjliggör screening av glykan händelse i ett brett spektrum av biologiska sammanhang.

Glykan Profilering av växtcellväggnedbrytande Polymerer med Microarrays

Plant cell walls are complex matrixes of heterogeneous glycans which play an important role in the physiology and development of plants and provide the ...

Research

JoVE Journal

Biology

Bacterial Gene Expression Analysis Using Microarrays

Bakteriell Gene Expression Analysis Använda Microarrays

Measuring Plant Cell Wall Extension (Creep) Induced by Acidic pH and by Alpha-Expansin

Measuring Plant Cell Wall Extension Creep Induced by Acidic pH and by Alpha-Expansin

Mätning Plant Cell Wall Extension (Creep) induceras av surt pH-värde och Alpha-Expansin

Growing plant cell walls characteristically exhibit a property known as 'acid growth', by which we mean they are more extensible at low pH (&lt; 5) 1. The ...

Investigating Tissue- and Organ-specific Phytochrome Responses using FACS-assisted Cell-type Specific Expression Profiling in Arabidopsis thaliana

Investigating Tissue- and Organ-specific Phytochrome Responses using FACS-assisted Cell-type Specific Expression Profiling in Arabidopsis thaliana

Undersöka Tissue-och orgel-specifika Phytochrome Svar med FACS-assisterad Cell-typspecifika expression profiling i Arabidopsis thaliana</em

Light mediates an array of developmental and adaptive processes throughout the life cycle of a plant. Plants utilize light-absorbing molecules called ...

Genome-wide Analysis of Aminoacylation (Charging) Levels of tRNA Using Microarrays

Genome-wide Analysis of Aminoacylation Charging Levels of tRNA Using Microarrays

Genomvid Analys av Aminoacylation (laddning) Nivåerna av tRNA Använda Microarrays

tRNA aminoacylation, or charging, levels can rapidly change within a cell in response to the environment[1]. Changes in tRNA charging levels in both ...

OLIgo Mass Profiling (OLIMP) of Extracellular Polysaccharides

OLIgo Mass Profiling OLIMP of Extracellular Polysaccharides

Oligo Mass profilering (OLIMP) av Extracellulär Polysackarider

The direct contact of cells to the environment is mediated in many organisms by an extracellular matrix. One common aspect of extracellular matrices is ...

Profiling Thiol Redox Proteome Using Isotope Tagging Mass Spectrometry

Profilering Tiol Redox Proteome Användning Isotope spektrometri Taggning Mäss

Pseudomonas syringae pv. tomato strain DC3000 not only causes bacterial speck disease in Solanum lycopersicum but also on Brassica species, as well as on ...

Histochemical Staining of Arabidopsis thaliana Secondary Cell Wall Elements

Histochemical Staining of Arabidopsis thaliana Secondary Cell Wall Elements

Histokemisk fargning av<em&gt; Arabidopsis thaliana</em&gt; Sekundär cell Väggelement

Arabidopsis thaliana is a model organism commonly used to understand and manipulate various cellular processes in plants, and it has been used extensively ...

High Resolution Quantification of Crystalline Cellulose Accumulation in Arabidopsis Roots to Monitor Tissue-specific Cell Wall Modifications

High Resolution Quantification of Crystalline Cellulose Accumulation in Arabidopsis Roots to Monitor Tissue-specific Cell Wall Modifications

Högupplöst Kvantifiering av kristallin cellulosa Ackumulering i<em&gt; Arabidopsis</em&gt; Roots att övervaka Vävnadsspecifik cellvägg Ändringar

Plant cells are surrounded by a cell wall, the composition of which determines their final size and shape. The cell wall is composed of a complex matrix ...

Laser-assisted Microdissection (LAM) as a Tool for Transcriptional Profiling of Individual Cell Types

Laser-assisted Microdissection LAM as a Tool for Transcriptional Profiling of Individual Cell Types

Laser-assisted Microdissection (LAM) som ett verktyg för transkriptions Profilering av enskilda celltyper

The understanding of developmental processes at the molecular level requires insights into transcriptional regulation, and thus the transcriptome, at the ...

An Easy Method for Plant Polysome Profiling

En enkel metod för växt polysom ​​Profiling

Translation of mRNA to protein is a fundamental and highly regulated biological process. Polysome profiling is considered as a gold standard for the ...