Name: glycan profiling of plant cell wall polymers using microarrays
Uploaded: 2012-12-17T13:00:00
Description: Watch this Scientific Journal Video about Glycan Profiling of Plant Cell Wall Polymers using Microarrays at JoVE.com

IEM finansman Danimarka Araştırma Konseyi (FTP ve FNU) kabul etmek istiyorum. ERL bir ARC DP hibe desteği kabul etmektedir. AB Bitki hücre duvarları hibe Mükemmellik ARC Merkezi&#39;nin desteği ile hazırlanmıştır.

1. Doku Toplama ve Hazırlama <ol><li> Ilgi her doku için en az üç nüsha halinde bitki dokularının 100 mg taze ağırlık (10 mg kuru ağırlığının minimum) toplayın. Aşağıdaki adımları vejetatif doku hücre duvarı malzemesinin hazırlanması açıklanmaktadır. Depolama dokularının durumunda, un istenen nişasta enzimatik olarak daha önce 13 açıklandığı gibi hücre duvarı polimerlerin ekstraksiyon işlemine devam etmeden önce kaldırılır. </li><li> 24 boru adaptörü kümeleri ...

<ol>
	<li>Carpita, N. C., Gibeaut, D. M. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/query.fcgi?db=PubMed&cmd=Search&doptcmdl=Citation&defaultField=Title+Word&term=Structural+models+of+primary+cell+walls+in+flowering+plants:+consistency+of+molecular+structure+with+the+physical+properties+of+the+walls+during+growth.">Structural models of primary cell walls in flowering plants: consistency of molecular structure with the physical properties of the walls during growth.</a> Plant J. 3, 1-30 (1993).</li><li>Somerville, C. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/query.fcgi?db=PubMed&cmd=Search&doptcmdl=Citation&defaultField=Title+Word&term=Biofuels.">Biofuels.</a> Curr. Biol. 17, 115-119 (2007).</li><li>Willats, W. G., Orfila, C., Limberg, G., et al. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/query.fcgi?db=PubMed&cmd=Search&doptcmdl=Citation&defaultField=Title+Word&term=Modulation+of+the+degree+and+pattern+of+methyl-esterification+of+pectic+homogalacturonan+in+plant+cell+walls.+implications+for+pectin+methyl+esterase+action,+matrix+properties,+and+cell+adhesion.">Modulation of the degree and pattern of methyl-esterification of pectic homogalacturonan in plant cell walls. implications for pectin methyl esterase action, matrix properties, and cell adhesion.</a> J. Biol. Chem. 276, 19404-19413 (2001).</li><li>Doblin, M. S., Pettolino, F., Bacic, A. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/query.fcgi?db=PubMed&cmd=Search&doptcmdl=Citation&defaultField=Title+Word&term=Plant+cell+walls:+the+skeleton+of+the+plant+world.">Plant cell walls: the skeleton of the plant world.</a> Functional Plant Biology. 37, 357-381 (2010).</li><li>Carpita, N., Tierney, M., Campbell, M. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/query.fcgi?db=PubMed&cmd=Search&doptcmdl=Citation&defaultField=Title+Word&term=Molecular+biology+of+the+plant+cell+wall:+searching+for+the+genes+that+define+structure,+architecture+and+dynamics.">Molecular biology of the plant cell wall: searching for the genes that define structure, architecture and dynamics.</a> Plant Molecular Biology. 47, 1-5 (2001).</li><li>Sarria, R., Wagner, T. A., O'Neill, M. A., Faik, A., et al. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/query.fcgi?db=PubMed&cmd=Search&doptcmdl=Citation&defaultField=Title+Word&term=Characterization+of+a+family+of+Arabidopsis+genes+related+to+xyloglucan+fucosyltransferase1.">Characterization of a family of Arabidopsis genes related to xyloglucan fucosyltransferase1.</a> Plant Physiol. 127, 1595-1606 (2001).</li><li>Somerville, C., Bauer, S., Brininstool, G. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/query.fcgi?db=PubMed&cmd=Search&doptcmdl=Citation&defaultField=Title+Word&term=Toward+a+systems+approach+to+understanding+plant+cell+walls.">Toward a systems approach to understanding plant cell walls.</a> Science. 306, 2206-2211 (2004).</li><li>Willats, W. G. T., Knox, J. P., Rose, J. K. C. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/query.fcgi?db=PubMed&cmd=Search&doptcmdl=Citation&defaultField=Title+Word&term=Molecules+in+context:+probes+for+cell+wall+analysis.">Molecules in context: probes for cell wall analysis.</a> The Plant Cell Wall. , 92-110 (2003).</li><li>Pattathil, S., Avci, U., Baldwin, D., et al. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/query.fcgi?db=PubMed&cmd=Search&doptcmdl=Citation&defaultField=Title+Word&term=A+Comprehensive+Toolkit+of+Plant+Cell+Wall+Glycan-Directed+Monoclonal+Antibodies.">A Comprehensive Toolkit of Plant Cell Wall Glycan-Directed Monoclonal Antibodies.</a> Plant Physiology. 153, 514-525 (2010).</li><li>Moller, I. E., S&#248;rensen, I., Bernal, A. J., et al. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/query.fcgi?db=PubMed&cmd=Search&doptcmdl=Citation&defaultField=Title+Word&term=High-throughput+mapping+of+cell-wall+polymers+within+and+between+plants+using+novel+microarrays.">High-throughput mapping of cell-wall polymers within and between plants using novel microarrays.</a> The Plant J. 50, 1118-1128 (2007).</li><li>S&#248;rensen, I., Willats, W. G. T. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/query.fcgi?db=PubMed&cmd=Search&doptcmdl=Citation&defaultField=Title+Word&term=Screening+and+characterization+of+plant+cell+walls+using+carbohydrate+microarrays.">Screening and characterization of plant cell walls using carbohydrate microarrays.</a> Methods Mol. Biol. 715, 115-121 (2011).</li><li>Moller, I. E., Licht, D. e. F. i. n. e., Harholt, H. H., J, , et al. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/query.fcgi?db=PubMed&cmd=Search&doptcmdl=Citation&defaultField=Title+Word&term=The+dynamics+of+plant+cell-wall+polysaccharide+decomposition+in+leaf-cutting+ant+fungus+gardens.">The dynamics of plant cell-wall polysaccharide decomposition in leaf-cutting ant fungus gardens.</a> PLoS One. 6 (3), e17506 (2011).</li><li>Pettolino, F. A., Walsh, C., Fincher, G. B. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/query.fcgi?db=PubMed&cmd=Search&doptcmdl=Citation&defaultField=Title+Word&term=Chemical+procedures+for+the+determination+of+polysaccharide+composition+of+plant+cell+walls.">Chemical procedures for the determination of polysaccharide composition of plant cell walls.</a> Nature Protocols. , (2012).</li><li>Clausen, M. H., Willats, W. G. T., Knox, J. P. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/query.fcgi?db=PubMed&cmd=Search&doptcmdl=Citation&defaultField=Title+Word&term=Synthetic+methyl+hexagalacturonate+hapten+inhibitors+of+anti-homogalacturonan+monoclonal+antibodies+LM7,+JIM5+and+JIM7.">Synthetic methyl hexagalacturonate hapten inhibitors of anti-homogalacturonan monoclonal antibodies LM7, JIM5 and JIM7.</a> Carbohydrate Res. 338, 1797-1800 (2003).</li><li>Verhertbruggen, Y., Marcus, S. E., Haeger, A., et al. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/query.fcgi?db=PubMed&cmd=Search&doptcmdl=Citation&defaultField=Title+Word&term=Developmental+complexity+of+arabinan+polysaccharides+and+their+processing+in+plant+cell+walls.">Developmental complexity of arabinan polysaccharides and their processing in plant cell walls.</a> Plant J. 59, 413-425 (2009).</li><li>Heimburg-Molinaro, J., Song, X., Smith, D. F. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/query.fcgi?db=PubMed&cmd=Search&doptcmdl=Citation&defaultField=Title+Word&term=UNIT+12.10+Preparation+and+Analysis+of+Glycan+Microarray.">UNIT 12.10 Preparation and Analysis of Glycan Microarray.</a> Current Protocols in Protein Science. , (2011).</li><li>McCartney, L., Blake, A., Flint, J., et al. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/query.fcgi?db=PubMed&cmd=Search&doptcmdl=Citation&defaultField=Title+Word&term=Differential+recognition+of+plant+cell+walls+by+microbial+xylan-specific+carbohydrate-binding+modules.">Differential recognition of plant cell walls by microbial xylan-specific carbohydrate-binding modules.</a> PNAS. 103, 4765-4770 (2006).</li><li>Ca&#241;o-Delgado, A. I., Metzlaff, K., Bevan, M. W. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/query.fcgi?db=PubMed&cmd=Search&doptcmdl=Citation&defaultField=Title+Word&term=The+eli1+mutation+reveals+a+link+between+cell+expansion+and+secondary+cell+wall+formation+in+Arabidopsis+thaliana.">The eli1 mutation reveals a link between cell expansion and secondary cell wall formation in Arabidopsis thaliana.</a> Development. 127, 3395-3405 (2000).</li><li>Manabe, Y., Nafisi, M., Verhertbruggen, Y., et al. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/query.fcgi?db=PubMed&cmd=Search&doptcmdl=Citation&defaultField=Title+Word&term=Loss-of-Function+Mutation+of+REDUCED+WALL+ACETYLATION2+in+Arabidopsis+Leads+to+Reduced+Cell+Wall+Acetylation+and+Increased+Resistance+to+Botrytis+cinerea.">Loss-of-Function Mutation of REDUCED WALL ACETYLATION2 in Arabidopsis Leads to Reduced Cell Wall Acetylation and Increased Resistance to Botrytis cinerea.</a> Plant Physiology. 155, 1068-1078 (2011).</li><li>Updegraff, D. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/query.fcgi?db=PubMed&cmd=Search&doptcmdl=Citation&defaultField=Title+Word&term=Semimicro+determination+of+cellulose+in+biological+materials.">Semimicro determination of cellulose in biological materials.</a> Anal. Biochem. 32, 420-424 (1969).</li><li>21Moller, I., Marcus, S. E., Haeger, A., et al. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/query.fcgi?db=PubMed&cmd=Search&doptcmdl=Citation&defaultField=Title+Word&term=High-throughput+screening+of+monoclonal+antibodies+against+plant+cell+wall+glycans+by+hierarchial+clustering+of+their+carbohydrate+microarray+binding+profiles.">High-throughput screening of monoclonal antibodies against plant cell wall glycans by hierarchial clustering of their carbohydrate microarray binding profiles.</a> Glycoconjugate Journal. 25, 37-48 (2007).</li><li>S&#248;rensen, I., Pettolino, F. A., Wilson, S. M., et al. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/query.fcgi?db=PubMed&cmd=Search&doptcmdl=Citation&defaultField=Title+Word&term=Mixed+linkage+(1&#8594;3),(1&#8594;4)-&#946;-D-glucan+is+not+unique+to+the+Poales+and+is+an+abundant+component+of+Equisetum+arvense+cell+walls.">Mixed linkage (1&#8594;3),(1&#8594;4)-&#946;-D-glucan is not unique to the Poales and is an abundant component of Equisetum arvense cell walls.</a> Plant J. 54 (13), 510-521 (2008).</li><li>Domozych, D. S., S&#248;rensen, I., Willats, W. G. T. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/query.fcgi?db=PubMed&cmd=Search&doptcmdl=Citation&defaultField=Title+Word&term=The+distribution+of+cell+wall+polymers+during+antheridium+development+and+spermatogenesis+in+the+Charophycean+green+alga,+Chara.">The distribution of cell wall polymers during antheridium development and spermatogenesis in the Charophycean green alga, Chara.</a> 2104, 1045-1056 (2009).</li><li>Singh, B., Avci, U., Eichler Inwood, S. E. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/query.fcgi?db=PubMed&cmd=Search&doptcmdl=Citation&defaultField=Title+Word&term=A+specialized+outer+layer+of+the+primary+cell+wall+joins+elongating+cotton+fibers+into+tissue-like+bundles.">A specialized outer layer of the primary cell wall joins elongating cotton fibers into tissue-like bundles.</a> Plant Physiol. 150, 684-699 (2009).</li><li>&#216;bro, J., S&#248;rensen, I., Derkx, P., et al. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/query.fcgi?db=PubMed&cmd=Search&doptcmdl=Citation&defaultField=Title+Word&term=High-throughput+screening+of+Erwinia+chrysanthemi+pectin+methylesterase+variants+using+carbohydrate+microarrays.">High-throughput screening of Erwinia chrysanthemi pectin methylesterase variants using carbohydrate microarrays.</a> Proteomics. 9, 1861-1868 (2009).</li></ol>

CoMPP birkaç gün içinde yüzlerce bitkisel kaynaklı numunelerin glukanıdır kompozisyonu profilleme için hızlı ve hassas bir yöntemdir. Bu yöntem, lektinler, reseptörleri ve antikorları 16 gibi glukanıdır-bağlayıcı proteinler ile karbohidrat etkileşimleri yüksek verimli tarama zaten mevcut bakteriyel veya memeli glukanıdır dizi platformlar tamamlar. Hücre duvarı glukanlardır tespit etmek için kullanılabilir probları geniş bir çeşitliliği ile, bitki hücre duvarı 8,9 ...

<table border="1"><tbody><tr><td> Reaktif Adı </td><td> Şirket </td><td> Katalog numarası </td><td> Yorumlar (isteğe bağlı) </td></tr><tr><td> 3 mm Tungsten Karbür boncuk </td><td> Qiagen </td><td> 69997 </td><td></td></tr><tr><td> Koleksiyon mikrotüpler (1,2 mm) </td><td> Qiagen </td><td> 19560 </td><td> 1.5 ml mikrofüj tüpler de kullanılabilir </td></tr><tr><td> Qiagen TissueLyser II </td><td> Qiagen </td><td> 85300 </td><td></td></tr><tr><td> 3 mm cam boncuklar </td><td> Sigma Aldrich </td><td> Z143928 </td><td></td></tr><tr><td> CDtA </td><td> Sigma Aldrich </td><td> 34588 </td><td></td></tr><tr><td> Oksit Kadmiyum </td><td> Sigma Aldrich </td><td> 202894 </td><td></td></tr><tr><td> 1,2-diaminoetan </td><td> Sigma Aldrich </td><td> 03550 </td><td></td></<html> tr&gt; <tr><td> Nitroselüloz membranı (0.22 mikron gözenek boyutu) </td><td> GE-su ve proses teknolojileri </td><td> EP2HY00010 </td><td> farklı gözenek boyutlu membranlar farklı pin tipleri için uygundur </td></tr><tr><td> Xact II microarrayer robot </td><td> Labnext </td><td> 001A </td><td> Xact II robot nitroselüloz membran bağlı olduğu özel bir 20 x 20 cm seramik plaka takıldı </td></tr><tr><td> RM mikroarray işaretçilerine Xtend </td><td> Labnext </td><td> 0037-350 </td><td> işaretçilerine zarlarında tespit için uygun olmalıdır </td></tr><tr><td> 384 oyuklu plakalar (polipropilen) </td><td> Greiner </td><td> 781207 </td><td></td></tr><tr><td> Anti-glikan monoklonal antikor </td><td> / Bitki Probları CarboSource / Biosupplies </td><td></td><td> Web siteleri; PlantProbes ( <a href="http://www.plantprobes.net" target="_blank">www.plantprobes.net</a> ), Carbosource (ww.carbosource.net &quot;target =&quot; _blank &quot;&gt; www.carbosource.net) ve Biosupplies ( <a href="http://www.biosupplies.com.au" target="_blank">www.biosupplies.com.au</a> ). </td></tr><tr><td> Anti-sıçan IgG (tüm molekül) - keçi üretilen peroksidaz antikor. </td><td> Sigma </td><td> A9037 </td><td> İkincil antikor tipi (örneğin fare, sıçan, keçi vb yükseltilmiş) kullanılan birincil antikor bağlıdır. </td></tr><tr><td> SIGMA FAST 3,3 &#39;-diaminobenzidin tablet </td><td> Sigma </td><td> D4293 </td><td> reaktif geliştirilmesi tipi, kullanılan ikincil antikorlar ve tespit yöntemi (colourmetric, ya da chemiluminecent) bağlıdır. </td></tr><tr><td> SuperSignal West Pico Chemiluminescent Yüzey </td><td> Thermoscientific </td><td> 34080 </td><td> yukarıya bakın </td></tr><tr><td> Görüntü İşleme Yazılımları Xplore </td><td> LabNext </td><td> 008 </td><td> Otomatik gridding araçları ile birçok yazılım türleri mevcutturmikroarray noktalar piksel değerini ölçmek için. </td></tr><tr><td> Bitki polisakkaritler </td><td> Sigma / Megazyme </td><td></td><td></td></tr></tbody></table>

glycan profiling of plant cell wall polymers using microarrays

Bitki hücre duvarları fizyolojisi ve bitki gelişmesinde önemli bir rol oynar ve insan topluluklarının (örneğin tahta, kağıt, tekstil ve biyoyakıt endüstrisi) 1,2 için hammadde sağlamak heterojen glukanlardır karmaşık matrisler vardır. Bununla birlikte, bu bileşenlerin biyosentezini ve işlevlerini anlamada zorlu kalır. Hücre duvarı glukanlardır kimyasal ve yapı taşları, glikozil kalıntılarının karmaşıklığı nedeniyle conformationally çeşitlidir. Bu formu çoklu pozisyonlarda bağlar ve halka yapısı farklı, izomerik ya da anomerik konfigürasyon, ve ek olarak, non-şeker artıkları bir dizi ile sübstitüe edilmiştir. Glukanıdır kompozisyonu hatta farklı hücre ve / veya doku tipleri veya tek bir hücre duvarı 3 alt alan adları değişir. Ayrıca, bunların bileşimi, aynı zamanda 1 geliştirme sırasında, ya da çevresel işaret 4 yanıt olarak modifiye edilir. Ex2.000 genlerin cess Bitki hücre duvarlarının heterojen glukanlardır karmaşık matrisler Arabidopsis 5 hücre duvarı glukanıdır biyosentezi ve modifikasyonu yer alacağı öngörülmüştür olanlarıdır. Bununla birlikte, biyosentez genlerinin göreceli olarak az sayıda işlevsel olarak 4,5 karakterize edilmiştir. Genlerin çoğu zaman farklı olarak hücre tipleri 6 arasında, sık sık düşük seviyelerde ifade edilir çünkü karşıt genetik yaklaşım zordur. Ayrıca, mutant çalışmalar genellikle uygun hücre duvarı işlevi 7 korunmasını sağlamak için gen fazlalık veya telafi edici mekanizmalar tarafından engellenmiştir. Böylece yeni yaklaşımları hızla glukanıdır yapıların çeşitli karakterize etmek ve anlayış hücre duvarı biyosentezi ve modifikasyonu fonksiyonel genomik yaklaşımlar kolaylaştırmak için ihtiyaç vardır. Monoklonal antikor (mAb) 8,9 Bitkilerde glukanıdır yapısı ve dağılımı belirlenmesi için önemli bir araç olarak ortaya çıkmıştır. Bu dist tanımakpektinler, xyloglucans, xylans, mannans, glukan ve arabinogalactans gibi bitki hücre duvarının glukanlardır ana sınıfları, içinde bulunan inct epitoplar. Son zamanlarda bunların kullanımı bitki ve doku tipleri eşzamanlı 9,10,11 geniş bir yelpazede glukanlardır göreli bolluğu belirlemek için geniş çaplı tarama deneyler kadar uzatılmıştır. Burada düşük reaktif ve numune hacimleri ile minyatür bir mikroarray platformu kullanarak ekranlı olması (100 sn) çoklu örnekleri sağlar Kapsamlı Mikroarray Polimer Profiling (CoMPP) (Şekil 1 ve 2) 10,11 adlı bir mikroarray tabanlı glukanıdır tarama yöntemi sunuyoruz. Mikroarray üzerinde nokta işaretleri resmen glukanıdır epitop oluşumu hakkında yarı-nicel veri vermek için ölçülebilir. Bu yaklaşım karmaşık biyolojik sistemlerin 12 glukanıdır değişiklikleri izleme ve hücre duvarı kompozisyonları küresel bir bakış sağlamak için uygundur, özellikle önceki bilgilerif Bu kullanılamıyor.

Nicotiana alata çiçeklerden altı doku tipleri (anter filamentler, polen, yumurtalıklar, yaprakları, sepals ve stigma) olarak glukanlardır göreli bolluğu CoMPP kullanılarak belirlendi. Şekil 3A kısmen (düşük) methylesterified homogalacturonan (HG), pektik polisakkaritler 14 oluşur bir epitopu için mAb JIM5 özel ile probed edilmiş bir temsilcisi mikroarray gösterir. JIM5 epitopunu çiçek dokuların CDtA özleri algılanırsa ancak mercek dokusu (Şekil 3A ve 4A) pol...

Watch this Scientific Journal Video about Glycan Profiling of Plant Cell Wall Polymers using Microarrays at JoVE.com

Glycan Profiling of Plant Cell Wall Polymers using Microarrays

Denilen bir tekniği<strong&gt; C</strong&gt; Omprehensive<strong&gt; M</strong&gt; Icroarray<strong&gt; P</strongBitki hücre çeperi glukanlardır karakterizasyonu için&gt; olymer profil (CoMPP) tarif edilir. Bu yöntem, biyolojik bağlamlarda geniş bir aralıkta glikan geçtiği tarama izin veren bir minyatür mikrodizi analitik platformu ile tanımlanan glikan-epitoplara karşı yönelik monoklonal antikorlar özgüllük birleştirir.

Mikroarray&#39;ler kullanarak Bitki Hücre Duvarı Polimerlerin glukanıdır Profilleme

Plant cell walls are complex matrixes of heterogeneous glycans which play an important role in the physiology and development of plants and provide the ...

Research

JoVE Journal

Biology

Bacterial Gene Expression Analysis Using Microarrays

Bakteriyel Gen İfadesi Analizi Mikroarray&#39;ler Kullanımı

Measuring Plant Cell Wall Extension (Creep) Induced by Acidic pH and by Alpha-Expansin

Measuring Plant Cell Wall Extension Creep Induced by Acidic pH and by Alpha-Expansin

Asidik pH ve Alpha-Expansin İndüklenmiş Ölçüm Bitki Hücre Duvarı Uzantısı (Creep)

Growing plant cell walls characteristically exhibit a property known as 'acid growth', by which we mean they are more extensible at low pH (&lt; 5) 1. The ...

Investigating Tissue- and Organ-specific Phytochrome Responses using FACS-assisted Cell-type Specific Expression Profiling in Arabidopsis thaliana

Investigating Tissue- and Organ-specific Phytochrome Responses using FACS-assisted Cell-type Specific Expression Profiling in Arabidopsis thaliana

Hücre tipi Özgül gösterilmeden FACS yardımlı kullanarak Doku ve Organ spesifik Fitokrom Yanıtları incelenmesi Arabidopsis thaliana</em

Light mediates an array of developmental and adaptive processes throughout the life cycle of a plant. Plants utilize light-absorbing molecules called ...

Genome-wide Analysis of Aminoacylation (Charging) Levels of tRNA Using Microarrays

Genome-wide Analysis of Aminoacylation Charging Levels of tRNA Using Microarrays

Mikroarray&#39;ler kullanarak tRNA Aminoacylation (Şarj) Seviyeler genom Analizi

tRNA aminoacylation, or charging, levels can rapidly change within a cell in response to the environment[1]. Changes in tRNA charging levels in both ...

OLIgo Mass Profiling (OLIMP) of Extracellular Polysaccharides

OLIgo Mass Profiling OLIMP of Extracellular Polysaccharides

Ekstrasellüler polisakkaritler Oligo Kitle Profil (Olimp)

The direct contact of cells to the environment is mediated in many organisms by an extracellular matrix. One common aspect of extracellular matrices is ...

Profiling Thiol Redox Proteome Using Isotope Tagging Mass Spectrometry

İzotop Etiketleme kütle spektrometresi kullanarak Tiyol Redoks Proteom profil

Pseudomonas syringae pv. tomato strain DC3000 not only causes bacterial speck disease in Solanum lycopersicum but also on Brassica species, as well as on ...

Histochemical Staining of Arabidopsis thaliana Secondary Cell Wall Elements

Histochemical Staining of Arabidopsis thaliana Secondary Cell Wall Elements

Histokimyasal boyama<em&gt; Arabidopsis thaliana</em&gt; Ortaöğretim Hücre Duvar Elemanları

Arabidopsis thaliana is a model organism commonly used to understand and manipulate various cellular processes in plants, and it has been used extensively ...

High Resolution Quantification of Crystalline Cellulose Accumulation in Arabidopsis Roots to Monitor Tissue-specific Cell Wall Modifications

High Resolution Quantification of Crystalline Cellulose Accumulation in Arabidopsis Roots to Monitor Tissue-specific Cell Wall Modifications

Kristalin Selüloz Birikimin Yüksek Çözünürlüklü Niceleme<em&gt; Arabidopsis</em&gt; Kökler Doku spesifik Hücre Duvarı Değişiklikler Monitör

Plant cells are surrounded by a cell wall, the composition of which determines their final size and shape. The cell wall is composed of a complex matrix ...

Laser-assisted Microdissection (LAM) as a Tool for Transcriptional Profiling of Individual Cell Types

Laser-assisted Microdissection LAM as a Tool for Transcriptional Profiling of Individual Cell Types

Bireysel Hücre Tiplerinin transkripsiyonel Profiling için bir alet olarak lazer destekli mikrodiseksiyon (LAM)

The understanding of developmental processes at the molecular level requires insights into transcriptional regulation, and thus the transcriptome, at the ...

An Easy Method for Plant Polysome Profiling

Bitki Polizom Profiling için bir Kolay Yöntem

Translation of mRNA to protein is a fundamental and highly regulated biological process. Polysome profiling is considered as a gold standard for the ...