Name: c. elegans chemotaxis assay
Uploaded: 2013-04-27T14:00:00
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我们感谢生命科学与艺术和科学学院在皇后大学为这项工作提供资金。同时，我们感谢钦生实验室提供必要的试剂，设备和技术支持。我们也感谢2011年QGEM，尤其是托尼，他为他的贡献的讨论。

1。准备/洗涤蠕虫<ol><li>同步蠕虫年轻成人11。 </li><li>吸取2毫升到5厘米的趋化板的S基础上演OP50 E.刚刚清除草坪蠕虫大肠杆菌 。倾斜板，根据需要，以确保到缓冲区中的板面从洗涤蠕虫。 </li><li>吸取1毫升离心管蠕虫-S基础的解决方案。 </li><li> ，持续10秒使用PicoFuge，在6,600 rpm转速下离心。 </li><li>吸的S基础，离开颗粒蠕虫不受干扰的。 </li><li> ML小号基础的解决方案添加到?...

<ol>
	<li>Bargmann, C. I., Hartwieg, E., Horvitz, H. R. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/query.fcgi?db=PubMed&cmd=Search&doptcmdl=Citation&defaultField=Title+Word&term=Odorant-selective+genes+and+neurons+mediate+olfaction+in+C.+elegans.">Odorant-selective genes and neurons mediate olfaction in C. elegans.</a> Cell. 74, 515-527 (1993).</li><li>Bargmann, C. I., Horvitz, H. R. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/query.fcgi?db=PubMed&cmd=Search&doptcmdl=Citation&defaultField=Title+Word&term=Chemosensory+neurons+with+overlapping+functions+direct+chemotaxis+to+multiple+chemicals+in+C.+elegans.">Chemosensory neurons with overlapping functions direct chemotaxis to multiple chemicals in C. elegans.</a> Neuron. 7, 729-742 (1991).</li><li>Lee, J., Jee, C., McIntire, S. L. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/query.fcgi?db=PubMed&cmd=Search&doptcmdl=Citation&defaultField=Title+Word&term=Ethanol+preference+in+C.+elegans.">Ethanol preference in C. elegans.</a> Genes Brain Behav. 8, 578-585 (2009).</li><li>Swierczek, N. A., Giles, A. C., Rankin, C. H., Kerr, R. A. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/query.fcgi?db=PubMed&cmd=Search&doptcmdl=Citation&defaultField=Title+Word&term=High-throughput+behavioral+analysis+in+C.+elegans.">High-throughput behavioral analysis in C. elegans.</a> Nat. Methods. 8, 592-598 (2011).</li><li>Ward, S. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/query.fcgi?db=PubMed&cmd=Search&doptcmdl=Citation&defaultField=Title+Word&term=Chemotaxis+by+the+nematode+Caenorhabditis+elegans:+identification+of+attractants+and+analysis+of+the+response+by+use+of+mutants.">Chemotaxis by the nematode Caenorhabditis elegans: identification of attractants and analysis of the response by use of mutants.</a> Proc. Natl. Acad. Sci. U.S.A. 70, 817-821 (1973).</li><li>Colbert, H. A., Bargmann, C. I. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/query.fcgi?db=PubMed&cmd=Search&doptcmdl=Citation&defaultField=Title+Word&term=Odorant-specific+adaptation+pathways+generate+olfactory+plasticity+in+C.+elegans.">Odorant-specific adaptation pathways generate olfactory plasticity in C. elegans.</a> Neuron. 14, 803-812 (1995).</li><li>Kauffman, A., Parsons, L., Stein, G., Wills, A., Kaletsky, R., Murphy, C. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/query.fcgi?db=PubMed&cmd=Search&doptcmdl=Citation&defaultField=Title+Word&term=C.+elegans+Positive+Butanone+Learning,+Short-term,+and+Long-term+Associative+Memory+Assays.">C. elegans Positive Butanone Learning, Short-term, and Long-term Associative Memory Assays.</a> J. Vis. Exp. (49), e2490 (2011).</li><li>Troemel, E. R., Kimmel, B. E., Bargmann, C. I. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/query.fcgi?db=PubMed&cmd=Search&doptcmdl=Citation&defaultField=Title+Word&term=Reprogramming+chemotaxis+responses:+sensory+neurons+define+olfactory+preferences+in+C.+elegans.">Reprogramming chemotaxis responses: sensory neurons define olfactory preferences in C. elegans.</a> Cell. 91, 161-169 (1997).</li><li>Pierce-Shimomura, J. T., Morse, T. M., Lockery, S. R. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/query.fcgi?db=PubMed&cmd=Search&doptcmdl=Citation&defaultField=Title+Word&term=The+fundamental+role+of+pirouettes+in+Caenorhabditis+elegans+chemotaxis.">The fundamental role of pirouettes in Caenorhabditis elegans chemotaxis.</a> J Neurosci. 19, 9557-9569 (1999).</li><li>Frokjaer-Jensen, C., Ailion, M., Lockery, S. R. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/query.fcgi?db=PubMed&cmd=Search&doptcmdl=Citation&defaultField=Title+Word&term=Ammonium-acetate+is+sensed+by+gustatory+and+olfactory+neurons+in+Caenorhabditis+elegans.">Ammonium-acetate is sensed by gustatory and olfactory neurons in Caenorhabditis elegans.</a> PLoS One. 3, e2467 (2008).</li><li>Porta-de-la-Riva, M., Fontrodona, L., Villanueva, A., Cer&#243;n, J. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/query.fcgi?db=PubMed&cmd=Search&doptcmdl=Citation&defaultField=Title+Word&term=Basic+Caenorhabditis+elegans+Methods:+Synchronization+and+Observation.">Basic Caenorhabditis elegans Methods: Synchronization and Observation.</a> J. Vis. Exp. (64), e4019 (2012).</li><li>Sengupta, P., Bargmann, C. I. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/query.fcgi?db=PubMed&cmd=Search&doptcmdl=Citation&defaultField=Title+Word&term=Cell+fate+specification+and+differentiation+in+the+nervous+system+of+Caenorhabditis+elegans.">Cell fate specification and differentiation in the nervous system of Caenorhabditis elegans.</a> Dev. Genet. 18, 73-80 (1996).</li><li>Hart, A. C. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/query.fcgi?db=PubMed&cmd=Search&doptcmdl=Citation&defaultField=Title+Word&term=Behavior.">Behavior.</a> WormBook. , (1895).</li></ol>

趋化，虽然控制的一组复杂的神经元和细胞机制，能够容易且客观的定量使用趋化实验。为了获得最佳的检测结果，必须采取某些关键步骤。首先，举办蠕虫产生一致的实验结果是必不可少的。蠕虫在不同的人生阶段有不同的行为13，所以混合阶段蠕虫可能会歪斜实验结果。其次，确保所有E.大肠杆菌洗掉的蠕虫是至关重要的，因为残留的细菌可能会干扰检测。同样重要的是，要注?...

沃德第一次在1973年5开发的趋化实验，并从那时起，它有深远的应用。神经生物学是一个领域，受惠于使用各种趋化实验。 C.嗅觉适应，学习和记忆的一种简单形式，已被证明在线虫趋化实验6。它们也被用来表明C。线虫可以开发乙醇耐受性的结果不仅展现了蠕虫的行为可塑性，但也表明，蠕虫可以是非常有用的，在研究酒精依赖人类3。检测甚至已经发展到展示的能力C.线虫短期和长期记忆存储协会是由趋化因子之间的蠕虫和食品（OP50）7。此外，由于广泛的信息，目前有关C.线虫基因组，chemotaxiC.行为已经改变了无数次的线虫进行基因突变1,8。这使得许多令人兴奋的工程的可能性，如发展C.线虫作为一个生物修复工具。因此，在1973年以来的初步发展的趋化实验，已经频繁地改变，用来阐明多种学科的奥秘。 某些实验旨在发现蠕虫朝着一个目标所采取的具体路线。这种原型试验是由沃德5。三虫熔化的琼脂上放置15分钟。他们的运动跟踪它们留下的印记，因为他们从一个梯度板在板的中心引诱的周边。盘上的所有蠕虫病毒被逮捕用氯仿在每次试验结束。这种方法的一个后裔在板中间放置一个单一的蠕虫的引诱和控制从原点2吨的距离相等，方向相反。 皮尔斯下村等 。开发了一个试验，以观察在趋化9所涉及的移动的确切性质。个人蠕虫放置在9厘米的培养皿中可以含有引诱剂或径向形状的梯度均匀的浓度，最终在源的引诱剂。确认该蠕虫的计算机软件程序，是用来记录所观察到的行为。一种摄像机连接到显微镜一起工作的阶段来调整培养皿中，自动检测运行，以确保保持在视场中的蠕虫。由此看来，更详细的信息被发现的原因下所显示的回旋线虫 。 其他检测，更类似于此处所述，测试一个人口众多的蠕虫病毒测试化合物的反应。二象限趋化实验已经用于探索各种神经细胞，受体和信号转导分子的角色时播放C.线虫暴露于各种化合物1。 20-50之间水洗蠕虫被放置在板的中心附近与引诱剂，麻醉剂，叠氮化钠（NaN 3的）一起在极性端和一个控制。 60分钟后，趋化指数值从-1.0到1.0，产生多少蠕虫贴的引诱剂或控制之间的差异的基础上。类似的趋化指数是用于测定在这篇文章中报道，虽然未能严格评估非能动的蠕虫早期检测。此法进一步趋化测试神经消融的影响。 进行上述测定法的另一种变化，其中含有四个象限3的板的中心被放置在100-200蠕虫。相邻象限包含测试或控制物质。在以前的实验中，蠕虫叠氮化钠的作用被固定之前被拿下。这里描述的类似的方法作为一种评价的反应C.线虫的各种化合物。但是，下面的方法有额外的好处，仅评估已通过阈值距离分离手机动的蠕虫蠕虫。 其他实验已纳入忽略不动的蠕虫类似指引。 frøkjær-Jensen 等 。开发出一种通用的检测，可以用来测试易失性和水溶性化合物10。培养皿分为四个象限。顶部和底部的象限内不含有溶剂。左象限包含水，以及所载的权利，引诱剂。测试时，挥发性的气味中，分析物被放置在盖子上的菜，在适当的象限，而水溶性化合物被直接放置在琼脂糖河目前存在一种方法，用于评估下的趋化反应线虫正在不断地被改进，以优化其便于使用，效率和准确性。所以，虽然这里描述的检测有能力评估的最大数量的蠕虫（最大吞吐量：250的蠕虫/小时每板，略大于由Lee 等人表现出的吞吐量）;这种方法是真正的实力简洁的高潮许多早期检测（ 表1）的属性。

<table border="1">
 <tbody>
 <tr>
 <td>Name of Reagent/Material</td>
 <td>Company</td>
 <td>Catalogue Number</td>
 <td>Comments</td>
 </tr>
 <tr>
 <td>S Basal (- cholesterol) [5.8 g NaCl; 1 M K phosphate buffer, pH 6.0; dH2O to 1 liter.] Autoclave</td>
 <td>&nbsp;</td>
 <td>&nbsp;</td>
 <td>&nbsp;</td>
 </tr>
 <tr>
 <td>PicoFuge</td>
 <td>Stratagene</td>
 <td>400552</td>
 <td>&nbsp;</td>
 </tr>
 <tr>
 <td>Microscopes</td>
 <td>Leica</td>
 <td>&nbsp;</td>
 <td>&nbsp;</td>
 </tr>
 <tr>
 <td>Dissecting</td>
 <td>Leica</td>
 <td>&nbsp;</td>
 <td>&nbsp;</td>
 </tr>
 <tr>
 <td>P1000 Pipette</td>
 <td>Gilson</td>
 <td>&nbsp;</td>
 <td>&nbsp;</td>
 </tr>
 <tr>
 <td>P10 Pipette</td>
 <td>Gilson</td>
 <td>&nbsp;</td>
 <td>&nbsp;</td>
 </tr>
 <tr>
 <td>0.5 M Sodium Azide</td>
 <td>&nbsp;</td>
 <td>&nbsp;</td>
 <td>&nbsp;</td>
 </tr>
 <tr>
 <td>Chemotaxis Agar [1.6% BBL-agar (Benton-Dickinson) or 2% Difco-agar. Autoclave. Add 5 mM potassium phosphate, pH 6.0; 1 mM CaCl2, 1 mM MgSO4]</td>
 <td>&nbsp;</td>
 <td>&nbsp;</td>
 <td>&nbsp;</td>
 </tr>
 <tr>
 <td>Ethanol/Distilled Water</td>
 <td>&nbsp;</td>
 <td>&nbsp;</td>
 <td>&nbsp;</td>
 </tr>
 <tr>
 <td>Test Compounds (eg. 0.5% diacetyl)</td>
 <td>&nbsp;</td>
 <td>&nbsp;</td>
 <td>&nbsp;</td>
 </tr>
 <tr>
 <td>Agar</td>
 <td>Bio-Rad</td>
 <td>166-0600</td>
 <td>&nbsp;</td>
 </tr>
 <tr>
 <td>NH4Cl</td>
 <td>Amresco</td>
 <td>CA97062-046</td>
 <td>&nbsp;</td>
 </tr>
 <tr>
 <td>MOPS</td>
 <td>VWR</td>
 <td>CA12001-120</td>
 <td>&nbsp;</td>
 </tr>
 <tr>
 <td>NH4OH</td>
 <td>BDH</td>
 <td>CABDH8641-2</td>
 <td>&nbsp;</td>
 </tr>
 <tr>
 <td>0.25% Tween 20</td>
 <td>Bio-Rad</td>
 <td>170-6531</td>
 <td>&nbsp;</td>
 </tr>
 </tbody>
</table>

c. elegans chemotaxis assay

许多生物都使用趋化寻求食物来源，避免有毒物质，并寻找配偶。 线虫具有令人印象深刻的趋化行为。 后面测试蠕虫的加臭剂的反应的前提是将它们放置在一个区域，并观察响应的加臭剂诱发的运动。即使有许多可用的检测，优化蜗杆相对于起始位置的控 ​​制和测试区，同时最大限度地减少与对方，同时保持了显着的样本大小的相互作用蠕虫仍然正在进行中的1-10项的工作。这里描述的方法的目的是为解决这些问题，通过修改巴格曼等人开发的测定。甲培养皿分为四个象限，两个相对的象限标记为“测试”和两个被指定为“控制”。麻醉是摆在所有的测试和控制的网站。蠕虫放置在板的中心与精华É围绕原点标记，以确保非能动的蠕虫将被忽略。利用一个四象限系统，而不是一个或两个1消除偏置蠕虫的运动，因为它们是从试验组和对照样品的距离相等，而不管他们开始的哪一侧的起源。这就避免蠕虫被迫穿越其他蠕虫的集群，以应对气味，可延缓蠕虫或迫使他们采取更迂回的路线，其拟定的路径产生一个不正确的解释的问题。这种方法也显示了实用的优点，具有较大样本的大小和允许研究员无人值守运行分析和得分蠕虫一旦在规定的时间已过期。

比较野生型（N2）C. ODR-10（KY10）突变的线虫 。 我们使用的丁二酮，公知的C。线虫趋化双乙酰1,12缺乏受体的突变，比较野生型蠕虫。对于野生型（N2）蠕虫的趋化指数为（0.100±0.066）乙醇和0.839±0.031至0.5％的二乙酰。正如预期的那样，二乙酰引出一个显着chemoattractive的野生型蠕虫（P &lt;0.003）的响应。与此相反，在ODR-10（KY10）突变体缺?...

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C. elegans Chemotaxis Assay

定量评价的趋化反应的方法<em&gt;线虫</em&gt;进行说明。趋化指数（CI）作为一种能够精确地评估蠕虫的反应到一定的目标，并作为一个平台之间的比较利益的菌株和化合物。

线虫趋含量的

Many organisms use chemotaxis to seek out food sources, avoid noxious substances, and find mates.  Caenorhabditis elegans has impressive chemotaxis ...

Research

JoVE Journal

Biology

C. elegans Chemotaxis Assay

Generation of Stable Transgenic C. elegans Using Microinjection

产生稳定的转基因C.使用微量注射线虫

Transgenic Caenorhabditis elegans can be readily created via microinjection of a DNA plasmid solution into the gonad 1.  The plasmid DNA rearranges to ...

科研

生物学

Application of a C. elegans Dopamine Neuron Degeneration Assay for the Validation of Potential Parkinson's Disease Genes

一个线虫多巴胺神经元退化含量的应用验证潜在的帕金森氏症基因

Improvements to the diagnosis and treatment of Parkinson's disease (PD) are dependent upon knowledge about susceptibility factors that render populations ...

Paradigms for Pharmacological Characterization of C. elegans Synaptic Transmission Mutants

为线虫突触传递的突变体的药理特性的范式

The nematode, Caenorhabditis elegans, has become an expedient model for studying neurotransmission. C. elegans is unique among animal models, as the ...

Dissecting and Recording from The C. Elegans Neuromuscular Junction

线虫神经肌肉交界处的解剖和录制

Neurotransmission is the process by which neurons transfer information via chemical signals to their post-synaptic targets, on a rapid time scale.   This ...

Generation of Transgenic C. elegans by Biolistic Transformation

Generation of Transgenic C. elegans by Biolistic Transformation

生成的基因 C。线虫通过基因枪转化

The number of laboratories using the free living nematode C. elegans is rapidly growing. The popularity of this biological model is attributed to a rapid ...

RNAi Screening to Identify Postembryonic Phenotypes in C. elegans

RNAi Screening to Identify Postembryonic Phenotypes in C. elegans

RNAi筛选识别胚后的表型 C。线虫</em

C. elegans has proven to be a valuable model system for the discovery and functional characterization of many genes and gene pathways1. More sophisticated ...

Basic Caenorhabditis elegans Methods: Synchronization and Observation

Basic Caenorhabditis elegans Methods: Synchronization and Observation

基本的<em&gt;线虫</em&gt;方法：同步和观察

Research into the molecular and developmental biology of the nematode Caenorhabditis elegans was begun in the early seventies by Sydney Brenner and it has ...

A Method for Culturing Embryonic C. elegans Cells

A Method for Culturing Embryonic C. elegans Cells

一种用于培养胚胎<em&gt; C。线虫</em&gt;细胞

C. elegans is a powerful model system, in which genetic and molecular techniques are easily applicable. Until recently though, techniques that require ...

Antibody Staining in C. Elegans Using &quot;Freeze-Cracking&quot;

Antibody Staining in C. Elegans Using "Freeze-Cracking"

抗体在染色<em&gt; C。线虫</em&gt;使用“冻结开裂”

To stain C.  elegans with antibodies, the relatively impermeable cuticle must be  bypassed by chemical or mechanical methods.  "Freeze-cracking" is one ...

Measuring the Effects of Bacteria on C. Elegans Behavior Using an Egg Retention Assay

Measuring the Effects of Bacteria on C. Elegans Behavior Using an Egg Retention Assay

测量细菌的影响<em&gt; C。线虫</em&gt;行为使用一个鸡蛋保留含量

C. elegans egg-laying behavior is  affected by environmental cues such as osmolarity1 and  vibration2. In the total absence of food C. elegans also cease ...