Name: analysis of the solvent accessibility of cysteine residues on maize rayado fino virus virus-like particles produced in nicotiana benthamiana plants and cross-linking of peptides to vlps
Uploaded: 2013-02-14T12:00:00
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1. Nicotiana benthamiana 식물에서 바이러스 접종과 VLPs 정화 <ol><li> 감자 바이러스 X (PVX) 기반 들고 벡터 plasmids의 상한선 T7-RNA 기록을 생산 MRFV 야생 타입 (중량) 및 Cys-변이 코트 단백질 (CP) 유전자 12 Ambion의 T7-mMessage mMachine 키트를 사용합니다. </li><li> 각 T7의 성적 반응의 경우, N.의 두 완전히 확장 잎의 예방 10 μl 반응과 25에서 빛 (25,000-30,000 룩스) 16 시간 60 %의 습도에서 ?...

<ol>
	<li>Barnhill, H., Reuther, R., Ferguson, P. L., Dreher, T. W., Wang, Q. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/query.fcgi?db=PubMed&cmd=Search&doptcmdl=Citation&defaultField=Title+Word&term=Turnip+yellow+mosaic+virus+as+a+chemoaddressable+bionanoparticle.">Turnip yellow mosaic virus as a chemoaddressable bionanoparticle.</a> Bioconj. Chem. 18, 852-859 (2007).</li><li>Chapman, S., Kavanagh, T., Baulcombe, D. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/query.fcgi?db=PubMed&cmd=Search&doptcmdl=Citation&defaultField=Title+Word&term=Potato+virus+X+as+a+vector+for+gene+expression+in+plants.">Potato virus X as a vector for gene expression in plants.</a> Plant J. 2, 549-557 (1992).</li><li>Chen, C., Kwak, E. S., Stein, B., Kao, C. 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Sci. 297, 554-560 (2006).</li><li>Lvov, Y., Haas, H., Decher, G., Mohwald, H., Mikhailov, A., Mtchedlishvily, B., Morgunova, E., Vainshtein, B. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/query.fcgi?db=PubMed&cmd=Search&doptcmdl=Citation&defaultField=Title+Word&term=Successive+deposition+of+alternate+layers+of+polyelectrolytes+and+a+charged+virus.">Successive deposition of alternate layers of polyelectrolytes and a charged virus.</a> Langmuir. 10, 4232-4236 (1994).</li><li>Natilla, A., Hammond, R. W. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/query.fcgi?db=PubMed&cmd=Search&doptcmdl=Citation&defaultField=Title+Word&term=Maize+rayado+fino+virus+virus-like+particles+expressed+in+tobacco+plants:+a+new+platform+for+cysteine+selective+bioconjugation+peptide+display.">Maize rayado fino virus virus-like particles expressed in tobacco plants: a new platform for cysteine selective bioconjugation peptide display.</a> J. Virol. Methods. 178, 209-215 (2011).</li><li>Rae, C. S., Khor, I. W., Wang, Q., Destito, G., Gonzalez, M. J., Singh, P., Thomas, D. M., Estrada, M. N., Powell, E., Finn, M. G., Manchester, M. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/query.fcgi?db=PubMed&cmd=Search&doptcmdl=Citation&defaultField=Title+Word&term=Systemic+trafficking+of+plant+virus+nanoparticles+in+mice+via+the+oral+route.">Systemic trafficking of plant virus nanoparticles in mice via the oral route.</a> Virology. 343, 2224-2235 (2005).</li><li>Raja, K. S., Wang, Q., Gonzalez, M. J., Manchester, M., Johnson, J. E., Finn, M. G. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/query.fcgi?db=PubMed&cmd=Search&doptcmdl=Citation&defaultField=Title+Word&term=Hybrid+virus-polymer+materials.+Synthesis+and+properties+of+PEG-decorated+Cowpea+mosaic+virus.">Hybrid virus-polymer materials. Synthesis and properties of PEG-decorated Cowpea mosaic virus.</a> Biomacromolecules. 4, 472-476 (2003).</li><li>Royston, E., Lee, S. Y., Culver, J. N., Harris, M. T. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/query.fcgi?db=PubMed&cmd=Search&doptcmdl=Citation&defaultField=Title+Word&term=Characterization+of+silica-coated+Tobacco+mosaic+virus.">Characterization of silica-coated Tobacco mosaic virus.</a> J. Colloid Interface Sci. 298, 706-712 (2006).</li><li>Schlick, T. L., Ding, Z., Kovacs, E. W., Francis, M. B. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/query.fcgi?db=PubMed&cmd=Search&doptcmdl=Citation&defaultField=Title+Word&term=Dual-surface+modification+in+the+Tobacco+mosaic+virus.">Dual-surface modification in the Tobacco mosaic virus.</a> J. Am. Chem. 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여기에 제시된 방법은 공장 제작 VLPs의 표면에뿐만 아니라 다른 단백질 단지에 존재 반응 cysteine​​s 매우 민감하고 빠른 분석이 가능합니다. Maleimides 안정적인 thioether 채권을 형성하기 위해 무료로 설프 하이 드릴 함유 분자와 반응하여 thiol 특정 시약입니다. 이 방법은 다른 아미노산과 상호 작용에 관여하지 설프 하이 드릴 그룹과 반응 할 수있는 maleimides의 특이성에 그립니다. VLPs의 기본 구조...

<table border="1"><tbody><tr><td> 시약의 이름 </td><td> 회사 </td><td> 카탈로그 번호 </td><td> 코멘트 </td></tr><tr><td> Thinwall, 울트라 클리어 튜브 </td><td> Beckman </td><td> 344059 </td><td></td></tr><tr><td> mMESSAGE mMACHINE T7 키트 </td><td> 생활 Tecnologies </td><td> AM1344M </td><td></td></tr><tr><td> Fluorescein-5-Maleimide </td><td> 온도 과학 생활 기술 </td><td> 46,130 F150 </td><td> 46130은 F150와 함께 주문 대신 부족합니다 </td></tr><tr><td> 피어스 비오틴의 Quantitation 키트 </td><td> 열 과학 </td><td> 28,005 </td><td></td></tr><tr><td> EZ-링크 Maleimide - PEG2 - 비오틴, 형식 없음 - 체중 </td><td> 열 과학 </td><td> 21,901 </td><td></td></tr><tr><td> SM (PEG) N Crosslinkers </td><td> 열 과학 </td><td> 22,107 </td><td></td></tr><tr><td> 10-20% 트리스 - 글리신 젤 </td><td> Invitrogen </td><td> EC61352 </td><td></td></tr><tr><td> Laemmli 버퍼 </td><td> 바이오 RAD </td><td> 1610737 </td><td></td></tr><tr><td> 트리스 글리신 SDS는 버퍼를 실행 </td><td> Invitrogen </td><td> LC2675 </td><td></td></tr><tr><td> 트리스 글리신 전송 버퍼 </td><td> Invitrogen </td><td> LC3675 </td><td></td></tr><tr><td> 니트로 셀룰로스 막 필터 종이 샌드위치 </td><td> Invitrogen </td><td> LC2001 </td><td></td></tr><tr><td> 토끼 IgG에 항체를 정제 인산 가수 분해 효소 레이블 선호도 </td><td> Kirkegaard 및 페리 연구소 </td><td> 0751516 </td><td></td></tr><tr><td> NBT / BCIP 인산 가수 분해 효소 기판 </td><td> Kirkegaard 및 페리 연구소 </td><td> 508107 </td><td></td></tr></tbody></table>

analysis of the solvent accessibility of cysteine residues on maize rayado fino virus virus-like particles produced in nicotiana benthamiana plants and cross-linking of peptides to vlps

바이러스 속성과 물리 및 물리적 특성을 모방하고 활용하는 것은 세계에서 가장 급박 한 문제 중 일부에 대한 해결책을 제공 할 약속을 보유하고 있습니다. 깎아 지른듯한 범위와 자신의 흥미 특성과 결합 바이러스의 종류는 잠재적으로 바이러스 기반 기술의 응용 프로그램 끊임없는 기회를 제공합니다. 바이러스는 온도와 pH의 조건의 다양한 미만의 이산 모양과 크기, 대칭의 특이성, polyvalence, 안정적인 특성을 가진 입자로 자기 조립 할 수있는 능력을 갖추고 있습니다. 당연히, 속성의 이러한 놀라운 범위, 바이러스는 biomaterials 9, 백신 14, 15, 전자 재료, 화학 도구 및 분자 전자 컨테이너 4, 5, 10, 11, 16, 18, ​​12에 사용하기 위해 제안합니다. 나노 기술에 바이러스를 이용하기 위해, 그들은 새로운 기능을 가르친다하기 위해 자연적인 형태에서 수정해야합니다. 이 도전 홍보ocess는 유전 바이러스 게놈의 수정 및 화학적으로 바이러스 입자 반응 그룹 8 외국인 또는 원하는 분자를 부착 등 여러 가지 메커니즘을 통해 수행 할 수 있습니다. 바이러스를 수정하는 기능은 주로 바이러스의 physiochemical과 물리적 특성에 따라 달라집니다. 또한, 유전자 또는 physiochemical 수정에 나쁜 바이러스 기본 구조 및 바이러스 기능에 영향을주지 않고 수행해야합니다. 옥수수 rayado fino 바이러스 (MRFV) 코트 단백질은 단백질 단백질에 의해 안정화 아르 안정적이고 빈 VLPs을 생산 대장균에 자기 조립 상호 작용하고는 바이러스 기반 기술 응용 프로그램 8에서 사용할 수 있습니다. 담배 공장에서 생산 VLPs는 펩티드의 다양한 종류의 covalently 13 표시 할 수있는 발판으로 조사되었다. 여기, 우리는 바이러스 capsid에있는 용매의 접근이 cysteine​​s 어떤이 modifi 사용할 수 있습니다 결정) 1 단계를 설명양이온, 그리고 2) 수정 capsids에 펩티드를 bioconjugate. 네이티브 또는 mutationally - 삽입 아미노산 잔류 물 및 표준 커플 링 기술을 사용하여 재료의 다양한 종류 등 Brome 모자이크 바이러스 3, 카네이션의 반점 바이러스 12 Cowpea chlorotic 반점 바이러스 6, 담배 모자이크와 같은 식물 바이러스의 표면에 표시되어 바이러스 17, 순무 대가리 노란색 모자이크 바이러스 1, MRFV 13.

N.의 돌연변이 MRFV 코트 단백질 (CP) 유전자의 일시적 표현 PVX 기반의 벡터 생산 VLPs의 benthamiana 공장은 그림 1에 설명되어 있습니다. 수정 MRFV 코트 단백질 유전자는 PVX 기반 벡터, pP2C2S 2, (D. Baulcombe, 세 인스 베리 연구소, 노리치, 영국의 선물)에서 중복 subgenomic의 CP 프로모터의 전사 제어 PCR에 의해 증폭 한 후 배치됩니다.에서가 체외 RNA 전사는 N.을 ?...

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Analysis of the Solvent Accessibility of Cysteine Residues on Maize rayado fino virus Virus-like Particles Produced in Nicotiana benthamiana Plants and Cross-linking of Peptides to VLPs

의 시스테인 잔류의 thiol 그룹의 용매 접근성을 분석하는 방법<em&gt; 옥수수 rayado fino 바이러스</em펩타이드 가교 반응에 이어&gt; (MRFV) 바이러스 같은 입자 (VLPs)이 설명되어 있습니다. 방법은 특정 반응에 타겟이 될 수있는 VLPs의 표면에 여러 화학 그룹의 가용성을 활용합니다.

시스테인 잔류 물을 용매 접근성에 대한 분석<em&gt; 옥수수 rayado fino 바이러스</em에서 생산&gt; 바이러스 같은 입자<em&gt; Nicotiana benthamiana</emVLPs에 펩티드의&gt; 식물과 교차 연결

Mimicking  and exploiting virus properties and physicochemical and physical  characteristics holds promise to provide solutions to some of  the world's ...

Research

JoVE Journal

Immunology and Infection

Analysis of the Solvent Accessibility of Cysteine Residues on Maize rayado fino virus Virus-like Particles Produced in Nicotiana benthamiana Plants and Cross-linking of Peptides to VLPs

Isolation and Genome Analysis of Single Virions using 'Single Virus Genomics'

&#39;단일 바이러스 게놈&#39;을 사용하여 단일 비리의 분리 및 유전체 분석

Whole genome amplification and sequencing of single microbial cells enables genomic characterization without the need of cultivation 1-3. Viruses, which ...

연구

면역학 및 감염병학

Analysis of the Epithelial Damage Produced by Entamoeba histolytica Infection

Analysis of the Epithelial Damage Produced by Entamoeba histolytica Infection

에 의해 제작 상피 손상의 분석<em&gt; Entamoeba 아메바</em&gt; 감염

Entamoeba histolytica is the causative agent of human amoebiasis, a major cause of diarrhea and hepatic abscess in tropical countries. Infection is ...

In Vitro Analysis of Myd88-mediated Cellular Immune Response to West Nile Virus Mutant Strain Infection

In Vitro Analysis of Myd88-mediated Cellular Immune Response to West Nile Virus Mutant Strain Infection

웨스트 나일 바이러스 돌연변이 균주의 감염에에서 MyD88 매개 세포 면역 반응의 생체 외 분석

An attenuated West Nile virus (WNV), a nonstructural (NS) 4B-P38G mutant, induced higher innate cytokine and T cell responses than the wild-type WNV in ...

Modeling The Lifecycle Of Ebola Virus Under Biosafety Level 2 Conditions With Virus-like Particles Containing Tetracistronic Minigenomes

Tetracistronic Minigenomes를 포함하는 바이러스 입자와 바이오 안전성 수준이 조건에서 에볼라 바이러스의 수명주기를 모델링

Ebola viruses cause severe hemorrhagic fevers in humans and non-human primates, with case fatality rates as high as 90%. There are no approved vaccines or ...

Neutrophil Isolation and Analysis to Determine their Role in Lymphoma Cell Sensitivity to Therapeutic Agents

호중구의 분리 및 분석 치료제에 림프종 세포 감도에서 자신의 역할을 확인하는 방법

Neutrophils are the most abundant (40% to 75%) type of white blood cells and among the first inflammatory cells to migrate towards the site of ...

Development of Stem Cell-derived Antigen-specific Regulatory T Cells Against Autoimmunity

자가 면역 대해 줄기 세포 유래의 항원 특이 적 조절 T 세포의 발달

Autoimmune diseases arise due to the loss of immunological self-tolerance. Regulatory T cells (Tregs) are important mediators of immunologic ...

Use of the Soft-agar Overlay Technique to Screen for Bacterially Produced Inhibitory Compounds

소프트 한천 오버레이 기법의 사용은 세균 생산 억제 화합물에 대한 화면으로

The soft-agar overlay technique was originally developed over 70 years ago and has been widely used in several areas of microbiological research, ...

Combining Analysis of DNA in a Crude Virion Extraction with the Analysis of RNA from Infected Leaves to Discover New Virus Genomes

새로운 바이러스 게놈을 발견 감염 된 잎에서 RNA 분석 원유 Virion 추출에 DNA의 결합 분석

This metagenome approach is used to identify plant viruses with circular DNA genomes and their transcripts. Often plant DNA viruses that occur in low ...

Rapid, Safe, and Simple Manual Bedside Nucleic Acid Extraction for the Detection of Virus in Whole Blood Samples

전체 혈액 샘플에서 바이러스의 검출, 안전, 신속 하 고 간단한 수동 침대 핵 산 추출

The rapid diagnosis of an infection is essential for the outbreak management, risk containment, and patient care. We have previously shown a method for ...

Establishment of Viral Infection and Analysis of Host-Virus Interaction in Drosophila Melanogaster

Establishment of Viral Infection and Analysis of Host-Virus Interaction in Drosophila Melanogaster

바이러스 성 감염 및 초파리 Melanogaster 상호 작용 호스트-바이러스의 분석의 설립

Virus spreading is a major cause of epidemic diseases. Thus, understanding the interaction between the virus and the host is very important to extend our ...