Name: patient-specific modeling of the heart: estimation of ventricular fiber orientations
Uploaded: 2013-01-08T13:00:00
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我々は博士に感謝します。レイモンウィンズロー、エリオット·マクベイ、 および ex vivo のデータセットonline.Thisリサーチを提供するためのジョンズ·ホプキンス大学のパトリック·ヘルムは、保健助成金の国立研究所R01-HL082729、国立科学財団助成CBET-0933029によってサポートされていました。

1。繊維配向推定<ol><li> 1ミリメートル3の解像度で、拡張期に正常な成人の人間の心の構造的MRIやDTMRI画像を取得する。フィッティングによりアトラス構造画像から心室心筋を抽出し、ImageJを使用して、各短軸スライスに対して、スライスで心外膜と心内膜の境界（ 図2Aおよび図2B）に沿って配置されたランドマーク点のセットを介してスプラインを閉じた。...

<ol>
	<li>Trayanova, N. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/query.fcgi?db=PubMed&cmd=Search&doptcmdl=Citation&defaultField=Title+Word&term=Whole+Heart+Modeling:+Applications+to+Cardiac+Electrophysiology+and+Electromechanics.">Whole Heart Modeling: Applications to Cardiac Electrophysiology and Electromechanics.</a> Circulation Research. 108, 113-128 .</li><li>Vadakkumpadan, F., Arevalo, H., Ceritoglu, C., Miller, M., Trayanova, N. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/query.fcgi?db=PubMed&cmd=Search&doptcmdl=Citation&defaultField=Title+Word&term=Image-Based+Estimation+of+Ventricular+Fiber+Orientations+for+Personalized+Modeling+of+Cardiac+Electrophysiology.">Image-Based Estimation of Ventricular Fiber Orientations for Personalized Modeling of Cardiac Electrophysiology.</a> IEEE Transactions on Medical Imaging. 31 (5), 1051-1060 .</li><li>Vadakkumpadan, F., Gurev, V., Constantino, J., Arevalo, H., Trayanova, N., Kerckhoffs, R. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/query.fcgi?db=PubMed&cmd=Search&doptcmdl=Citation&defaultField=Title+Word&term=Modeling+of+Whole-Heart+Electrophysiology+and+Mechanics:+Towards+Patient-Specific+Simulations.">Modeling of Whole-Heart Electrophysiology and Mechanics: Towards Patient-Specific Simulations.</a> Patient-Specific Modeling of the Cardiovascular System: Technology-Driven Personalized Medicine. , 145-165 (2010).</li><li>Buxton, A. 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Multicenter Unsustained Tachycardia Trial Investigators.</a> The New England Journal of Medicine. 342 (26), 1937-1945 (2000).</li><li>Wei, D., Okazaki, O., Harumi, K., Harasawa, E., Hosaka, H. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/query.fcgi?db=PubMed&cmd=Search&doptcmdl=Citation&defaultField=Title+Word&term=Comparative+simulation+of+excitation+and+body+surface+electrocardiogram+with+isotropic+and+anisotropic+computer+heart+models.">Comparative simulation of excitation and body surface electrocardiogram with isotropic and anisotropic computer heart models.</a> IEEE Transactions on Biomedical Engineering. 42 (4), 343-357 (1995).</li><li>Leon, L. J., Horacek, B. 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R., Ayache, N. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/query.fcgi?db=PubMed&cmd=Search&doptcmdl=Citation&defaultField=Title+Word&term=A+Computational+Framework+for+the+Statistical+Analysis+of+Cardiac+Diffusion+Tensors:+Application+to+a+Small+Database+of+Canine+Hearts.">A Computational Framework for the Statistical Analysis of Cardiac Diffusion Tensors: Application to a Small Database of Canine Hearts.</a> IEEE Transactions on Medical Imaging. 26, 1500-1514 (2007).</li><li>Chen, J., Song, S. -. K., Liu, W., McLean, M., Allen, S. J., Tan, J., Wickline, S. A., Yu, X. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/query.fcgi?db=PubMed&cmd=Search&doptcmdl=Citation&defaultField=Title+Word&term=Remodeling+of+cardiac+fiber+structure+after+infarction+in+rats+quantified+with+diffusion+tensor+MRI.">Remodeling of cardiac fiber structure after infarction in rats quantified with diffusion tensor MRI.</a> American Journal of Physiology - Heart and Circulatory Physiology. 285 (3), H946-H954 (2003).</li><li>Stecker, E. C., Chugh, S. S. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/query.fcgi?db=PubMed&cmd=Search&doptcmdl=Citation&defaultField=Title+Word&term=Prediction+of+sudden+cardiac+death:+next+steps+in+pursuit+of+effective+methodology.">Prediction of sudden cardiac death: next steps in pursuit of effective methodology.</a> Journal of Interventional Cardiac Electrophysiolog. 31 (2), 101-107 (2011).</li></ol>

本研究ではDTMRIの非存在下では、正常および失敗心室の心筋の繊維配向が心臓電気生理学のシミュレーションで使用するためにそれらのジオメトリの体内画像から推定することができる、ことを定量的に示しています。提案された方法論は 、in vivo CTデータ内に示したが、それが直接患者繊維配向を獲得する能力の欠如に対処する、心室ジオメトリーの in vivoでのMR <...

<html>計算論的アプローチは、健康と疾患における心臓の機能の理解の進歩の中心になりつつあります。電気生理学および電気機械技術の最先端の全心臓モデルは現在、通常の心室伝播、不整脈、除細動、電気機械結合、および心臓再同期1などの現象の広い範囲を勉強するために使用されている。しかし、臨床環境で直接適用可能であることが計算論的アプローチのために、それはモデルが患者に特化したものが、モデルが特定のアーキテクチャと、患者の疾患のある心臓の電気生理学的または電気機械的特性に基づいている必要がありますつまりことが不可欠です。そのようなモデルを用いたシミュレーションは、それによって劇的に心臓医療2-4改善、電気生理学的な介入だけでなく、予防のために高度にパーソナライズされた決定に到達するために医師を支援するでしょう。 内容は、 &quot;現実的な心臓モデルの&gt;作成は繊維配向は、心臓に電気伝播とひずみ分布の方向を決定し、患者の心臓の形状と繊維構造の取得を必要とし、したがって、それらを取得することは心臓のモデリング5,6に不可欠です。で医用イメージングの最近の進歩は、それが今では磁気共鳴イメージング（MRI）やコンピューター断層撮影（CT）技術を用いて高分解能で生体内での患者の心、そのような梗塞などincludingstructural改造、の幾何学的形状を得ることが可能ではありません。ただし、特定の設置生体内での患者の心臓の繊維構造体を取得するための実用的な方法。拡散テンソル（DT）のMRI検査7,8、そのまま心臓の繊維の向きを取得する唯一の手法では、9特定の制限のため、生体内で広く利用可能ではありません。簡単な説明臨床の現場にDTMRIを翻訳する前の努力がelsewhを見つけることができるのERE 2。このような繊維配向のルールベースの割り当てなどの方法論がDTMRIに代わるものを提供していますが、これらの方法論は、特定の重大な制限2、10を持っています。したがって、in vivoで心臓繊維構造を取得することが困難で、現在臨床現場での電気生理学的および電気機械心臓シミュレーションの適用を妨げる。本研究の目的は、直接、このニーズに対応することでした。 私たちは、心臓の心室繊維配向が正確に心臓やアトラスは、ジオメトリと繊維配向可能です心臓部であるアトラスのジオメトリに対して予測することができるという仮説を立てた。したがって、我々は、in vivoで心臓繊維の向きを推定するための方法論を開発するために従来技術の状態を使用し、ノーマルと失敗イヌ心室2に仮説を検証した。当社繊維見積もり手法の中心的な考え方は、similaritieを利用することである唯一のジオメトリ情報が提供されている（ターゲット）の心のおおよその繊維構造するために、さまざまな心の間でジオメトリを基準に、繊維配向、のs。私達の見積もり手法の中心には、大変形微分同相メトリックマッピング（LDDMM）11と、主成分（PPD）の2、12の保存を使用して、アトラスの繊維配向のモーフィングを使用して、ターゲットジオメトリを持つアトラスジオメトリの登録です。diffeomorphicpropertyはそれによってintegrityof解剖学的構造を維持するアトラスは、変形中に&quot;foldover&quot;自体をしないことを保証LDDMM、の図1は、我々の方法の処理パイプラインを示しています。プロトコルテキストセクション§1推定例の患者のために行うことができますどのように実証することにより、パイプラインのさまざまなコンポーネントについて説明します。 図1のブロックのいくつかの中の数字は、対応するを参照してください。セクションの下のサブセクション§プロトコルテキストの1。 我々は、計算的に地域の電気活性化マップと同様に擬似心電図（擬似心電図）をシミュレートすることにより、推定誤差を定量化し、心臓電気生理学のこのエラーonsimulationsの効果を測定することにより、提案手法の性能を評価した。人間の心の使用不能に起因する、性能評価は、13から15までの先行研究から利用可能なイヌの心臓を用いて行った。推定誤差は傾斜角度16、角度測定がepicardialsurfaceに平行にカットされperformedon組織切片の組織学アールのfollowingthe伝統によって算出した。 anglebetween繊維方向および心外膜接平面がgenerallysmall 17、18であるので、その傾斜角を使用して完全にfiberdirectionを記述する上で情報の損失は軽微であります。 comput用モデルで以前に19,20、および心臓組織が ​​確立数学的手法と実験データ21から25に基づいて表現されて報告されているようにationalシミュレーション、画像ベースのモデルが構築されました。洞調律は、S1-S2ペーシングプロトコル27でプルキンエネットワーク26、および心室頻拍、由来の複製活性化によるシミュレーションを行った。擬似心電図は28を計算し、平均絶対偏差（MAD）メトリック29を用いて比較した。

<table border="1"><tbody><tr><td> LDDMM </td><td>ジョンズ·ホプキンス大学</td><td></td><td> <a href="http://cis.jhu.edu/software/lddmm-volume/index.php" target="_blank">http://cis.jhu.edu/software/lddmm-volume/index.php</a> </td></tr><tr><td> MATLAB </td><td> The MathWorks、Inc。社</td><td> R2011b </td><td> <a href="http://www.mathworks.com/products/matlab/" target="_blank">http://www.mathworks.com/products/matlab/</a> </td></tr><tr><td> ImageJの</td><td>国立衛生研究所</td><td></td><td> <a href="http://rsbweb.nih.gov/ij/" target="_blank">http://rsbweb.nih.gov/ij/</a> </td></tr><tr><td>タランチュラ</td><td> CAEソフトウェアソリューション</td><td></td><td> <a href="http://www.meshing.at/Spiderhome/Tarantula.html" target="_blank">http://www.meshing.at/Spiderhome/Tarantula.html</a> </td></tr><tr><td> CARP </td><td> CardioSolv</td><td></td><td> <a href="http://cardiosolv.com/" target="_blank">http://cardiosolv.com/</a> </td></tr><tr><td>犬の画像</td><td>ジョンズ·ホプキンス大学</td><td></td><td> <a href="http://www.ccbm.jhu.edu/research/DTMRIDS.php" target="_blank">http://www.ccbm.jhu.edu/research/DTMRIDS.php</a> </td></tr></tbody></table>

patient-specific modeling of the heart: estimation of ventricular fiber orientations

心臓治療をパーソナライズすることを目的と心臓（DYS）関数の患者固有のシミュレーションは、臨床的に心筋の繊維の向きを取得するためのin vivoイメージング技術の存在しないことによって妨げられている。このプロジェクトの目的は、患者の心臓形状の体内画像から心臓の繊維の向きを推定するための方法論を開発することでした。心室ジオメトリーと繊維配向の正確な表現は、アトラスと呼ばれ、高解像度のex vivoでの構造的磁気共鳴（MR）と、通常の人間の心の拡散テンソル（DT）のMR画像から、それぞれ再建された。患者の心臓の心室ジオメトリは生体コンピュータ断層撮影（CT）画像でから、半自動セグメンテーションを経由して 、抽出した。画像変換アルゴリズムを使用して、アトラス心室ジオメトリーは、患者のそれと一致するように変形した。最後に、変形場はアトラス繊維orientatに適用されたイオン患者繊維配向の推定値を求める。繊維上の見積りの精度は通常の6と3障害のある犬の心を用いて評価した。獲得したと推定繊維配向の傾斜角度との間の平均の差の絶対値は15.4°であった。プロジェクトから得られた臨床的に観察level.The新しい洞察と見積もられ、取得された繊維配向の間に有意な差がないことが示された洞調律および心室頻拍中の心室興奮マップと擬似心電図の計算シミュレーションは、開発のための道を開く電気生理学的介入についてのパーソナライズされた診断の医師と意思決定を支援することができ、心臓の患者固有のモデル。

図11は 、ACはノーマルと失敗の心の中だけでなく、推定DTMRI由来の繊維配向の合理化された視覚化を表示します。定性検査は、推定された繊維配向がDTMRI由来のものとよく合っていることを示しています。パネルDは心臓1の幾何学的に重ね、示し、正常な心 &#39;の傾斜角度の誤差の分布は、すべての5つの推計値を平均。パネルEは心臓1の幾何学的に重ね、心 &#39;の傾斜角度を失敗?...

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Patient-specific Modeling of the Heart: Estimation of Ventricular Fiber Orientations

パーソナライズされたモデリングのための患者の心臓形状の体内画像から心室繊維配向を推定するための方法論が説明されています。通常の使用およびイヌの心を失敗実行方法論の検証は、臨床的に観察可能なレベルで推定し、取得した繊維配向の間に有意な差がないことがあることを示している。

ハートの患者固有のモデリング：心室繊維配向の推定

Patient-specific  simulations of heart (dys)function aimed at personalizing cardiac therapy are hampered  by the absence of in vivo imaging technology for ...

Research

JoVE Journal

Bioengineering

High-resolution Fiber-optic Microendoscopy for in situ Cellular Imaging

High-resolution Fiber-optic Microendoscopy for in situ Cellular Imaging

高分解能光ファイバMicroendoscopy用その場で細胞イメージング

Many biological and clinical studies require the longitudinal study and analysis of morphology and function with cellular level resolution.  ...

Multiparametric Optical Mapping of the Langendorff-perfused Rabbit Heart

ランゲンドルフ灌流ウサギの心臓のMultiparametric光学マッピング

Optical imaging and fluorescent probes have significantly advanced research methodology in the field of cardiac electrophysiology in ways that could not ...

Targeting Neuronal Fiber Tracts for Deep Brain Stimulation Therapy Using Interactive, Patient-Specific Models

対話型、患者固有のモデルを用いた脳深部刺激療法の神経繊維の管を対象と

Deep brain stimulation (DBS), which involves insertion of an electrode to deliver stimulation to a localized brain region, is an established therapy for ...

Light-sheet Fluorescence Microscopy for the Study of the Murine Heart

マウス心臓の研究のための光シート蛍光顕微鏡

Light-sheet fluorescence microscopy has been widely used for rapid image acquisition with a high axial resolution from micrometer to millimeter scale. ...

Biaxial Mechanical Characterizations of Atrioventricular Heart Valves

房室弁の二軸の機械特性

Extensive biaxial mechanical testing of the atrioventricular heart valve leaflets can be utilized to derive&#160;optimal parameters used in constitutive ...

Optical Imaging of Isolated Murine Ventricular Myocytes

単離マウス心室筋細胞の光学イメージング

The ability to isolate adult cardiac myocytes has permitted researchers to study a variety of cardiac pathologies at the single cell level. While advances ...

Evaluation of Left Ventricular Structure and Function using 3D Echocardiography

3D心エコーを用いた左心室構造と機能の評価

Three-dimensional (3D) quantification of the left ventricle (LV) provides significant added value in terms of diagnostic accuracy and precise risk ...

Patient-Specific Polyvinyl Alcohol Phantom Fabrication with Ultrasound and X-Ray Contrast for Brain Tumor Surgery Planning

超音波による患者特異的ポリビニルアルコールファントム作製法とX線コントラストによる脳腫瘍手術計画

Phantoms are essential tools for clinical training, surgical planning and the development of novel medical devices. However, it is challenging to create ...

Evaluating Regional Pulmonary Deposition using Patient-Specific 3D Printed Lung Models

患者固有の3Dプリント肺モデルを用いた局所肺堆積の評価

Development of targeted therapies for pulmonary diseases is limited by the availability of preclinical testing methods with the ability to predict ...

Quantification of Mouse Heart Left Ventricular Function, Myocardial Strain, and Hemodynamic Forces by Cardiovascular Magnetic Resonance Imaging

心臓血管磁気共鳴画像法によるマウス心左心室機能、心筋緊張、血行力の定量化

Mouse models have contributed significantly to understanding genetic and physiological factors involved in healthy cardiac function, how perturbations ...