Name: trajectory data analyses for pedestrian space-time activity study
Uploaded: 2013-02-25T12:03:00
Description: Watch this Scientific Journal Video about Trajectory Data Analyses for Pedestrian Space-time Activity Study at JoVE.com

Dette arbejde er finansieret af NIH tilskud 1R03AI090465.

1. Kom data <ol><li> Trajectory data kan indsamles med håndholdte GPS-enheder, GPS-aktiverede smart telefon tracking applikationer, såvel som A-GPS (Assisted GPS) enheder, såsom den, der anvendes i vores undersøgelse, en kommerciel barn tracker enhed. </li><li> Trajectory data er som regel gemt i tid-bredde-længde records. En ønsket tidsinterval bør fastsættes på grundlag af ansøgning behov. Ofte den hyppigste interval er ønsket for rum-tid aktivitet undersøgelser. </li><li> Konvertere data til kommasepare...

<ol>
	<li>Stoddard, S. T., Morrison, A. C., et al. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/query.fcgi?db=PubMed&cmd=Search&doptcmdl=Citation&defaultField=Title+Word&term=The+role+of+human+movement+in+the+transmission+of+vector-borne+pathogens.">The role of human movement in the transmission of vector-borne pathogens.</a> PLoS Negl. Trop. Dis. 3 (7), e10 (2009).</li><li>Morens, D. M., Folkers, G. K., et al. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/query.fcgi?db=PubMed&cmd=Search&doptcmdl=Citation&defaultField=Title+Word&term=The+challenge+of+emerging+and+re-emerging+infectious+diseases.">The challenge of emerging and re-emerging infectious diseases.</a> Nature. 430, 242-249 (2004).</li><li>Viboud, C., Bjornstad, O. N., et al. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/query.fcgi?db=PubMed&cmd=Search&doptcmdl=Citation&defaultField=Title+Word&term=Synchrony,+waves,+and+spatial+hierarchies+in+the+spread+of+influenza.">Synchrony, waves, and spatial hierarchies in the spread of influenza.</a> Science. 312, 447-451 (2006).</li><li>Shoval, N., Isaacson, M. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/query.fcgi?db=PubMed&cmd=Search&doptcmdl=Citation&defaultField=Title+Word&term=The+Application+of+tracking+technologies+to+the+study+of+pedestrian+spatial+behaviour.">The Application of tracking technologies to the study of pedestrian spatial behaviour.</a> The Professional Geographer. 58 (2), 172-183 (2006).</li><li>Yu, H. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/query.fcgi?db=PubMed&cmd=Search&doptcmdl=Citation&defaultField=Title+Word&term=Spatio-temporal+GIS+design+for+exploring+interactions+of+human+activities.">Spatio-temporal GIS design for exploring interactions of human activities.</a> Cartography and Geographic Information Science. 33 (1), 3-19 (2006).</li><li>Kwan, M. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/query.fcgi?db=PubMed&cmd=Search&doptcmdl=Citation&defaultField=Title+Word&term=Interactive+geovisualization+of+activity-travel+patterns+using+three-dimensional+geographical+information+systems:+a+methodological+exploration+with+a+large+data+set.">Interactive geovisualization of activity-travel patterns using three-dimensional geographical information systems: a methodological exploration with a large data set.</a> Transportation Research Part C. 8, 185-203 (2000).</li><li>Dem&#353;ar, U., Virrantaus, K. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/query.fcgi?db=PubMed&cmd=Search&doptcmdl=Citation&defaultField=Title+Word&term=Space-time+density+of+trajectories:+exploring+spatio-temporal+patterns+in+movement+data.">Space-time density of trajectories: exploring spatio-temporal patterns in movement data.</a> International Journal of Geographical Information Science. 24 (10), 1527-1542 (2010).</li><li>Kraak, M., Koussoulakous, A., Fisher, P. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/query.fcgi?db=PubMed&cmd=Search&doptcmdl=Citation&defaultField=Title+Word&term=.">.</a> A visualization environment for the space-time cube. , 189-200 (2004).</li><li>MacEachren, A. M., Polsky, C., et al. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/query.fcgi?db=PubMed&cmd=Search&doptcmdl=Citation&defaultField=Title+Word&term=Visualizing+spatial+relationships+among+health,+environmental,+and+demographic+statistics:+interface+design+issues.">Visualizing spatial relationships among health, environmental, and demographic statistics: interface design issues.</a> , 880-887 (1997).</li><li>Levory, M. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/query.fcgi?db=PubMed&cmd=Search&doptcmdl=Citation&defaultField=Title+Word&term=Display+of+surfaces+from+volume+data.">Display of surfaces from volume data.</a> IEEE Computer Graphics and Application. 8 (5), 29-37 (1998).</li><li>Drebin, R. A., Carpenter, L., et al. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/query.fcgi?db=PubMed&cmd=Search&doptcmdl=Citation&defaultField=Title+Word&term=Volume+Rendering.">Volume Rendering.</a> Computer Graphics. , (1998).</li><li>Lee, W., Krumm, J., Zheng, Y., Zhou, X. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/query.fcgi?db=PubMed&cmd=Search&doptcmdl=Citation&defaultField=Title+Word&term=Trajectory+preprocessing.">Trajectory preprocessing.</a> Computing with Spatial Trajectories. , 3-34 (2011).</li><li>Han, B., Comaniciu, D., et al. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/query.fcgi?db=PubMed&cmd=Search&doptcmdl=Citation&defaultField=Title+Word&term=Sequential+kernel+density+approximation+and+its+application+to+real-time+visual+tracking.">Sequential kernel density approximation and its application to real-time visual tracking.</a> IEEE Transactions on Pattern Analysis and Machine Intelligence. , (2007).</li></ol>

Vi brugte add-in mekanisme af ArcGIS at udvikle interface. Alle de interaktive operationer blev gennemført ved hjælp af C + +. Alle de automatisk behandling og analyse funktioner blev udviklet ved hjælp af Python. AGPS data eller GPS-data indsamlet af fodgænger præsenterer unik udfordring i forbehandling, da fejl kan være massiv pga. naboskab til bygninger og hyppige indendørs stop. Desuden bør fokus for forbehandling ikke være datareduktion som hvad sker normalt for køretøjer GPS...

<table border="1"><tbody><tr><td> Navn på reagenset </td><td> Firma </td><td> Katalognummer </td><td> Kommentarer (valgfrit) </td></tr><tr><td> WorldTracker GPRS </td><td> Sporing The World </td><td></td><td></td></tr><tr><td> En personlig computer for analysen udføres </td><td></td><td></td><td></td></tr><tr><td> ArcGIS-software </td><td> ESRI </td><td></td><td></td></tr><tr><td> Trajectory Analyzer Extension </td><td></td><td></td><td></td></tr></tbody></table>

trajectory data analyses for pedestrian space-time activity study

Det er velkendt, at menneskelig bevægelse i de rumlige og tidslige dimensioner har direkte indflydelse på sygdomsoverførsel 1-3. En smitsom sygdom typisk spredes via kontakt mellem smittede og modtagelige individer i deres overlappede aktivitet rum. Derfor kan daglig mobilitet-aktivitet information kan anvendes som en indikator for at måle eksponering for risikofaktorer for infektion. Men en stor vanskelighed og dermed årsagen til mangel på studier af smitsomme sygdomme transmission på mikroskala skyldes manglen på detaljerede individuelle mobilitet data. Tidligere i transport og turisme forskning detaljerede rum-tid aktivitetsdata ofte påberåbt sig tid-rum dagbog teknik, som kræver emner til aktivt at registrere deres aktiviteter i tid og rum. Dette er meget krævende for deltagerne og samarbejde fra deltagerne i høj grad påvirker kvaliteten af data 4. Moderneteknologier såsom GPS og mobilkommunikation har gjort det muligt at automatisk opsamling af flyvevejsbaserede data. De indsamlede data er imidlertid ikke ideel til modellering af menneskelige rum-tid aktiviteter, begrænset af de nøjagtigheder af eksisterende enheder. Der er heller ingen let tilgængelige værktøj til effektiv behandling af data for human adfærd undersøgelse. Vi præsenterer her en suite af metoder og en integreret ArcGIS desktop-baseret visuel grænseflade til forbehandling og Spatiotemporal analyser af flyvevejsbaserede data. Vi giver eksempler på, hvordan en sådan behandling kan bruges til at modellere humane rum-tid aktiviteter, især med fejl-rige fodgængere flyvevejsbaserede data, der kan være nyttige i undersøgelser på folkesundhedsområdet, såsom smitsomme sygdomme transmission modellering. Den fremlagte procedure omfatter forbehandling, bane segmentering, aktivitet space karakterisering, tæthed estimering og visualisering, og et par andre sonderende analysemetoder. Pre-processing er rengøring af støjende rå flyvevejsbaserede data. Vi indfører en interaktiv visuel forbehandling grænseflade samt en automatisk modul. Trajectory segmentering 5 omfatter identifikation af indendørs og udendørs dele fra forbehandlede rumtids spor. Igen er både interaktiv visuel segmentering og automatisk segmentering understøttes. Segmenteret rum-tids spor er derefter analyseret for at udlede kendetegn for en aktivitet plads, såsom aktivitet radius osv. Density estimation og visualisering anvendes til at undersøge store mængder flyvevejsbaserede data for at beregne hot spots og interaktioner. Vi viser begge densitet overflade kortlægning 6 og densitet volumengengivelse 7. Vi har også et par andre sonderende dataanalyse (EDA) og visualiseringer værktøjer, såsom Google Earth animation støtte og tilslutning analyse. Pakken af ​​analytisk samt visuelle metoder i dette papir kan anvendes på enhver flyvevejsbaserede data for rtempo-time aktivitet undersøgelser.

Trajectory data blev indsamlet ved frivilligt bachelorstuderende fra Kean University (NJ, USA) i foråret 2010. Formålet var at undersøge aktivitet mønstre af studerende, der fangede influenza (diagnosticeret af læge eller selvstændig diagnosticeret) i forhold til dem, der ikke gjorde. For at illustrere de metoder og den procedure, der præsenteres i dette papir, vi tog banerne indsamlet som led i forstæder campusområde at generere repræsentative resultater. Baner på campusområdet er for det meste fodgængere ...

Watch this Scientific Journal Video about Trajectory Data Analyses for Pedestrian Space-time Activity Study at JoVE.com

Trajectory Data Analyses for Pedestrian Space-time Activity Study

En suite af Spatiotemporal forarbejdningsmetoder præsenteres til at analysere menneskers flyvevejsbaserede data, såsom der er indsamlet ved hjælp af en GPS-enhed, med henblik på modellering fodgænger rumtids aktiviteter.

Trajectory data Analyser for fodgængere Space-time Aktivitet Study

It is well recognized that human movement in the  spatial and temporal dimensions has direct influence on disease transmission1-3.  An infectious disease ...

Research

JoVE Journal

Biology

Testing Visual Sensitivity to the Speed and Direction of Motion in Lizards

Testing visual sensitivity in any species provides basic information regarding behaviour, evolution, and ecology. However, testing specific features of ...

Computer-Generated Animal Model Stimuli

Communication between animals is diverse and complex. Animals may communicate using auditory, seismic, chemosensory, electrical, or visual signals. In ...

Bioelectric Analyses of an Osseointegrated Intelligent Implant Design System for Amputees

The projected number of American amputees is expected to rise to 3.6 million by 2050.  Many of these individuals depend on artificial limbs to perform ...

Isolation and Purification of Drosophila Peripheral Neurons by Magnetic Bead Sorting

Isolation and Purification of Drosophila Peripheral Neurons by Magnetic Bead Sorting

The Drosophila peripheral nervous system (PNS) is a powerful model for investigating the complex processes of neuronal development and dendrite ...

Evisceration of Mouse Vitreous and Retina for Proteomic Analyses

While the mouse retina has emerged as an important genetic model for inherited retinal disease, the mouse vitreous remains to be explored. The vitreous is ...

Do-It-Yourself Device for Recovery of Cryopreserved Samples Accidentally Dropped into Cryogenic Storage Tanks

Gør-det-selv enhed for inddrivelse af Kryopræserverede Prøver uheld faldt i Kryogene lagertanke

Liquid nitrogen is colorless, odorless, extremely cold (-196 &deg;C) liquid kept under pressure. It is commonly used as a cryogenic fluid for long term ...

Nanogold Labeling of the Yeast Endosomal System for Ultrastructural Analyses

Nanogold Mærkning af Gær endosomale System for Ultrastrukturelle Analyser

Endosomes are one of the major membrane sorting checkpoints in eukaryotic cells and they regulate recycling or destruction of proteins mostly from the ...

Improved Swiss-rolling Technique for Intestinal Tissue Preparation for Immunohistochemical and Immunofluorescent Analyses

Forbedret Swiss-rullende Teknik for tarmvæv Forberedelse til immunhistokemisk og Immunofluorescerende Analyser

Understanding the role of factors that regulate intestinal epithelial homeostasis and response to injury and regeneration is important. The current ...

In Vitro SUMOylation Assay to Study SUMO E3 Ligase Activity

In Vitro SUMOylation Assay to Study SUMO E3 Ligase Activity

In Vitro SUMOylation analyse at studere SUMO E3 Ligase aktivitet

Small ubiquitin-like modifier (SUMO) modification is an important post-translational modification (PTM) that mediates signal transduction primarily ...

Application of Electrophysiology Measurement to Study the Activity of Electro-Neutral Transporters

Anvendelse af Elektrofysiologi måling at studere aktiviteten af elektro-neutrale transportvirksomheder

The transport of ions through cell membranes ensures the fine control of ion content within and outside the cell that is indispensable for cell survival. ...