Name: trajectory data analyses for pedestrian space-time activity study
Uploaded: 2013-02-25T12:03:00
Description: Watch this Scientific Journal Video about Trajectory Data Analyses for Pedestrian Space-time Activity Study at JoVE.com

Dit werk wordt gefinancierd door NIH subsidie ​​1R03AI090465.

1. Aan de gegevens <ol><li> Traject gegevens kunnen worden verzameld met handheld GPS-apparaten, GPS-enabled smartphone tracking-toepassingen, evenals A-GPS (Assisted GPS)-apparaten, zoals die werkzaam zijn in onze studie, een commercieel kind tracker apparaat. </li><li> Baangegevens is gewoonlijk opgeslagen in termen van tijd-breedte en lengte records. Een gewenste tijdsinterval moet worden ingesteld op basis van toepassingen. Vaak zijn de meest voorkomende interval is gewenst voor de ruimte-tijd-activiteit studies. ...

<ol>
	<li>Stoddard, S. T., Morrison, A. C., et al. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/query.fcgi?db=PubMed&cmd=Search&doptcmdl=Citation&defaultField=Title+Word&term=The+role+of+human+movement+in+the+transmission+of+vector-borne+pathogens.">The role of human movement in the transmission of vector-borne pathogens.</a> PLoS Negl. Trop. Dis. 3 (7), e10 (2009).</li><li>Morens, D. M., Folkers, G. K., et al. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/query.fcgi?db=PubMed&cmd=Search&doptcmdl=Citation&defaultField=Title+Word&term=The+challenge+of+emerging+and+re-emerging+infectious+diseases.">The challenge of emerging and re-emerging infectious diseases.</a> Nature. 430, 242-249 (2004).</li><li>Viboud, C., Bjornstad, O. N., et al. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/query.fcgi?db=PubMed&cmd=Search&doptcmdl=Citation&defaultField=Title+Word&term=Synchrony,+waves,+and+spatial+hierarchies+in+the+spread+of+influenza.">Synchrony, waves, and spatial hierarchies in the spread of influenza.</a> Science. 312, 447-451 (2006).</li><li>Shoval, N., Isaacson, M. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/query.fcgi?db=PubMed&cmd=Search&doptcmdl=Citation&defaultField=Title+Word&term=The+Application+of+tracking+technologies+to+the+study+of+pedestrian+spatial+behaviour.">The Application of tracking technologies to the study of pedestrian spatial behaviour.</a> The Professional Geographer. 58 (2), 172-183 (2006).</li><li>Yu, H. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/query.fcgi?db=PubMed&cmd=Search&doptcmdl=Citation&defaultField=Title+Word&term=Spatio-temporal+GIS+design+for+exploring+interactions+of+human+activities.">Spatio-temporal GIS design for exploring interactions of human activities.</a> Cartography and Geographic Information Science. 33 (1), 3-19 (2006).</li><li>Kwan, M. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/query.fcgi?db=PubMed&cmd=Search&doptcmdl=Citation&defaultField=Title+Word&term=Interactive+geovisualization+of+activity-travel+patterns+using+three-dimensional+geographical+information+systems:+a+methodological+exploration+with+a+large+data+set.">Interactive geovisualization of activity-travel patterns using three-dimensional geographical information systems: a methodological exploration with a large data set.</a> Transportation Research Part C. 8, 185-203 (2000).</li><li>Dem&#353;ar, U., Virrantaus, K. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/query.fcgi?db=PubMed&cmd=Search&doptcmdl=Citation&defaultField=Title+Word&term=Space-time+density+of+trajectories:+exploring+spatio-temporal+patterns+in+movement+data.">Space-time density of trajectories: exploring spatio-temporal patterns in movement data.</a> International Journal of Geographical Information Science. 24 (10), 1527-1542 (2010).</li><li>Kraak, M., Koussoulakous, A., Fisher, P. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/query.fcgi?db=PubMed&cmd=Search&doptcmdl=Citation&defaultField=Title+Word&term=.">.</a> A visualization environment for the space-time cube. , 189-200 (2004).</li><li>MacEachren, A. M., Polsky, C., et al. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/query.fcgi?db=PubMed&cmd=Search&doptcmdl=Citation&defaultField=Title+Word&term=Visualizing+spatial+relationships+among+health,+environmental,+and+demographic+statistics:+interface+design+issues.">Visualizing spatial relationships among health, environmental, and demographic statistics: interface design issues.</a> , 880-887 (1997).</li><li>Levory, M. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/query.fcgi?db=PubMed&cmd=Search&doptcmdl=Citation&defaultField=Title+Word&term=Display+of+surfaces+from+volume+data.">Display of surfaces from volume data.</a> IEEE Computer Graphics and Application. 8 (5), 29-37 (1998).</li><li>Drebin, R. A., Carpenter, L., et al. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/query.fcgi?db=PubMed&cmd=Search&doptcmdl=Citation&defaultField=Title+Word&term=Volume+Rendering.">Volume Rendering.</a> Computer Graphics. , (1998).</li><li>Lee, W., Krumm, J., Zheng, Y., Zhou, X. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/query.fcgi?db=PubMed&cmd=Search&doptcmdl=Citation&defaultField=Title+Word&term=Trajectory+preprocessing.">Trajectory preprocessing.</a> Computing with Spatial Trajectories. , 3-34 (2011).</li><li>Han, B., Comaniciu, D., et al. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/query.fcgi?db=PubMed&cmd=Search&doptcmdl=Citation&defaultField=Title+Word&term=Sequential+kernel+density+approximation+and+its+application+to+real-time+visual+tracking.">Sequential kernel density approximation and its application to real-time visual tracking.</a> IEEE Transactions on Pattern Analysis and Machine Intelligence. , (2007).</li></ol>

We add-mechanisme van ArcGIS de interface te ontwikkelen. Alle interactieve handelingen werden uitgevoerd met behulp van C + +. Alle automatische verwerking en analyse functies werden ontwikkeld met behulp van Python. AGPS gegevens, of GPS-gegevens verzameld door voetgangers presenteert unieke uitdaging in preprocessing als de fouten kunnen worden massaal als gevolg van nabijheid van gebouwen en frequente indoor stopt. Bovendien moet de focus van preprocessing niet datareductie als wat meest...

<table border="1"><tbody><tr><td> Naam van het reagens </td><td> Vennootschap </td><td> Catalogusnummer </td><td> Opmerkingen (optioneel) </td></tr><tr><td> WorldTracker GPRS </td><td> Tracking De Wereld </td><td></td><td></td></tr><tr><td> Een personal computer voor het uitvoeren van de analyse </td><td></td><td></td><td></td></tr><tr><td> ArcGIS software </td><td> ESRI </td><td></td><td></td></tr><tr><td> Traject Analyzer Extension </td><td></td><td></td><td></td></tr></tbody></table>

trajectory data analyses for pedestrian space-time activity study

Het is algemeen erkend dat de menselijke beweging in het ruimtelijke en temporele dimensies directe invloed op de overdracht van ziekten een-drie heeft. Een besmettelijke ziekte verspreidt zich meestal via contact tussen geïnfecteerde en gevoelige individuen in hun overlappende activiteiten ruimtes. Daarom kan de dagelijkse mobiliteit-activiteit informatie worden gebruikt als een indicator om de blootstelling te meten aan factoren van infectie riskeren. Een groot probleem en zo de reden voor gebrek aan studies overdracht van besmettelijke ziekten op microschaal voort uit het gebrek aan gedetailleerde individuele mobiliteit data. Eerder in het transport en toerisme onderzoek gedetailleerde ruimte-tijd gegevens over de activiteiten vaak gebaseerd op de tijd-ruimte dagboek techniek, die vereist dat proefpersonen om actief hun activiteiten noteren in tijd en ruimte. Dit is zeer veeleisend voor de deelnemers en de samenwerking van de deelnemers grote invloed op de kwaliteit van de gegevens 4. Moderntechnologieën zoals GPS en mobiele communicatie mogelijk hebben gemaakt de automatische verzameling van baangegevens. De verzamelde gegevens, echter, is niet ideaal voor het modelleren van de menselijke ruimte-tijd-activiteiten, beperkt door de nauwkeurigheid van bestaande apparaten. Er is ook geen gemakkelijk beschikbaar instrument voor een efficiënte verwerking van de gegevens voor het menselijk gedrag studie. We presenteren hier een suite van methoden en een geïntegreerde ArcGIS desktop-gebaseerde visuele interface voor de pre-processing en spatiotemporele analyses van baangegevens. We geven voorbeelden van hoe dergelijke verwerking kan worden gebruikt om menselijke ruimte-tijd-activiteiten te modelleren, in het bijzonder met fout-rijke voetgangers baangegevens, die nuttig zou kunnen zijn in de volksgezondheid studies, zoals besmettelijke ziekten transmissie modellering. De gepresenteerde procedure omvat pre-processing, traject segmentatie, activiteit ruimte karakterisering, dichtheid schatting en visualisatie, en een paar andere verkennende analyse methoden. Pre-processing is het reinigen van luidruchtige ruwe baangegevens. We introduceren een interactieve visuele pre-processing interface en een automatische module. Traject segmentatie 5 betreft de identificatie van binnen en buiten onderdelen uit behandeld ruimte-tijd tracks. Opnieuw worden zowel interactieve visuele segmentatie en automatische segmentatie ondersteund. Gesegmenteerde tijdruimte tracks worden vervolgens geanalyseerd worden afgeleid zijn van een activiteit ruimte zoals actieradius etc. Density schatting en visualisatie worden gebruikt om grote hoeveelheden gegevens traject hot spots en interacties model te onderzoeken. We tonen zowel de dichtheid oppervlak in kaart brengen 6 en dichtheid volume rendering 7. Wij bieden tevens een paar andere verkennende data-analyses (EDA) en visualisaties tools, zoals Google Earth animatie ondersteuning en verbinding analyse. De suite van analytische en visuele methoden die in dit document worden toegepast op elke baangegevens voor stempo-time activiteit studies.

Traject gegevens werden verzameld door vrijwilligerswerk undergraduate studenten van Kean University (New Jersey, VS) in het voorjaar van 2010. Het doel was om de activiteit patronen van studenten die betrapt influenza (diagnose door arts of zelf-diagnose) in vergelijking met degenen die niet studeren. Met het oog op de regels en procedures die in dit artikel illustreren we met de trajecten verzameld in het suburbane campus gebied om representatieve resultaten te genereren. Trajecten binnen de campus gebied zijn meestal...

Watch this Scientific Journal Video about Trajectory Data Analyses for Pedestrian Space-time Activity Study at JoVE.com

Trajectory Data Analyses for Pedestrian Space-time Activity Study

Een reeks tijdruimtelijke verwerkingsmethoden worden aan menselijke baangegevens, zoals verzameld met een GPS, met het oog op modellering voetgangersruimte-time te analyseren.

Baangegevens Analyses voor voetgangers Ruimte-tijd Activiteit Study

It is well recognized that human movement in the  spatial and temporal dimensions has direct influence on disease transmission1-3.  An infectious disease ...

Research

JoVE Journal

Biology

Testing Visual Sensitivity to the Speed and Direction of Motion in Lizards

Het testen van visuele gevoeligheid voor de snelheid en richting van de beweging in Lizards

Testing visual sensitivity in any species provides basic information regarding behaviour, evolution, and ecology. However, testing specific features of ...

Computer-Generated Animal Model Stimuli

Door de computer gegenereerde Animal Model Stimuli

Communication between animals is diverse and complex. Animals may communicate using auditory, seismic, chemosensory, electrical, or visual signals. In ...

Bioelectric Analyses of an Osseointegrated Intelligent Implant Design System for Amputees

Bio-elektrische Analyses van een Osseointegrated Intelligent Design System Implantaat voor geamputeerden

The projected number of American amputees is expected to rise to 3.6 million by 2050.  Many of these individuals depend on artificial limbs to perform ...

Isolation and Purification of Drosophila Peripheral Neurons by Magnetic Bead Sorting

Isolation and Purification of Drosophila Peripheral Neurons by Magnetic Bead Sorting

Isolatie en zuivering van Drosophila Perifere neuronen door Magnetic Bead sorteren

The Drosophila peripheral nervous system (PNS) is a powerful model for investigating the complex processes of neuronal development and dendrite ...

Evisceration of Mouse Vitreous and Retina for Proteomic Analyses

Verwijderen van de ingewanden van de muis glasvocht en het netvlies voor Proteoom Analyses

While the mouse retina has emerged as an important genetic model for inherited retinal disease, the mouse vitreous remains to be explored. The vitreous is ...

Do-It-Yourself Device for Recovery of Cryopreserved Samples Accidentally Dropped into Cryogenic Storage Tanks

Doe-het-zelf-Inrichting voor Herstel van gecryopreserveerde monsters per ongeluk laat vallen in cryogene opslagtanks

Liquid nitrogen is colorless, odorless, extremely cold (-196 &deg;C) liquid kept under pressure. It is commonly used as a cryogenic fluid for long term ...

Nanogold Labeling of the Yeast Endosomal System for Ultrastructural Analyses

Nanogold Labeling van de Gist endosomale systeem voor Ultrastructurele Analyses

Endosomes are one of the major membrane sorting checkpoints in eukaryotic cells and they regulate recycling or destruction of proteins mostly from the ...

Improved Swiss-rolling Technique for Intestinal Tissue Preparation for Immunohistochemical and Immunofluorescent Analyses

Verbeterde Swiss-rolling Techniek voor darmweefsel Voorbereiding voor Immunohistochemische en Immunofluorescentie Analyses

Understanding the role of factors that regulate intestinal epithelial homeostasis and response to injury and regeneration is important. The current ...

In Vitro SUMOylation Assay to Study SUMO E3 Ligase Activity

In Vitro SUMOylation Assay to Study SUMO E3 Ligase Activity

In Vitro SUMOylation Assay te studeren SUMO E3 Ligase activiteit

Small ubiquitin-like modifier (SUMO) modification is an important post-translational modification (PTM) that mediates signal transduction primarily ...

Application of Electrophysiology Measurement to Study the Activity of Electro-Neutral Transporters

Toepassing van electrofysiologie meting op het bestuderen van de activiteit van Electro-neutrale Transporters

The transport of ions through cell membranes ensures the fine control of ion content within and outside the cell that is indispensable for cell survival. ...