Name: trajectory data analyses for pedestrian space-time activity study
Uploaded: 2013-02-25T12:03:00
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この作品は、NIHの助成金1R03AI090465によって賄われています。

1。データの取得<ol><li>軌跡データはハンドヘルドGPSユニット、GPS対応スマートフォントラッキングアプリケーションだけでなく、A-GPS（GPSを支援）など、我々の研究で使用されている1つ、商業子トラッカー装置などの装置を使用して収集することができます。 </li><li>軌跡データは、通常の時間緯度経度レコードの条件で保存されます。所望の時間間隔は、アプリケーションのニーズに基づ...

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	<li>Stoddard, S. T., Morrison, A. C., et al. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/query.fcgi?db=PubMed&cmd=Search&doptcmdl=Citation&defaultField=Title+Word&term=The+role+of+human+movement+in+the+transmission+of+vector-borne+pathogens.">The role of human movement in the transmission of vector-borne pathogens.</a> PLoS Negl. Trop. Dis. 3 (7), e10 (2009).</li><li>Morens, D. M., Folkers, G. K., et al. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/query.fcgi?db=PubMed&cmd=Search&doptcmdl=Citation&defaultField=Title+Word&term=The+challenge+of+emerging+and+re-emerging+infectious+diseases.">The challenge of emerging and re-emerging infectious diseases.</a> Nature. 430, 242-249 (2004).</li><li>Viboud, C., Bjornstad, O. N., et al. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/query.fcgi?db=PubMed&cmd=Search&doptcmdl=Citation&defaultField=Title+Word&term=Synchrony,+waves,+and+spatial+hierarchies+in+the+spread+of+influenza.">Synchrony, waves, and spatial hierarchies in the spread of influenza.</a> Science. 312, 447-451 (2006).</li><li>Shoval, N., Isaacson, M. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/query.fcgi?db=PubMed&cmd=Search&doptcmdl=Citation&defaultField=Title+Word&term=The+Application+of+tracking+technologies+to+the+study+of+pedestrian+spatial+behaviour.">The Application of tracking technologies to the study of pedestrian spatial behaviour.</a> The Professional Geographer. 58 (2), 172-183 (2006).</li><li>Yu, H. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/query.fcgi?db=PubMed&cmd=Search&doptcmdl=Citation&defaultField=Title+Word&term=Spatio-temporal+GIS+design+for+exploring+interactions+of+human+activities.">Spatio-temporal GIS design for exploring interactions of human activities.</a> Cartography and Geographic Information Science. 33 (1), 3-19 (2006).</li><li>Kwan, M. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/query.fcgi?db=PubMed&cmd=Search&doptcmdl=Citation&defaultField=Title+Word&term=Interactive+geovisualization+of+activity-travel+patterns+using+three-dimensional+geographical+information+systems:+a+methodological+exploration+with+a+large+data+set.">Interactive geovisualization of activity-travel patterns using three-dimensional geographical information systems: a methodological exploration with a large data set.</a> Transportation Research Part C. 8, 185-203 (2000).</li><li>Dem&#353;ar, U., Virrantaus, K. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/query.fcgi?db=PubMed&cmd=Search&doptcmdl=Citation&defaultField=Title+Word&term=Space-time+density+of+trajectories:+exploring+spatio-temporal+patterns+in+movement+data.">Space-time density of trajectories: exploring spatio-temporal patterns in movement data.</a> International Journal of Geographical Information Science. 24 (10), 1527-1542 (2010).</li><li>Kraak, M., Koussoulakous, A., Fisher, P. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/query.fcgi?db=PubMed&cmd=Search&doptcmdl=Citation&defaultField=Title+Word&term=.">.</a> A visualization environment for the space-time cube. , 189-200 (2004).</li><li>MacEachren, A. M., Polsky, C., et al. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/query.fcgi?db=PubMed&cmd=Search&doptcmdl=Citation&defaultField=Title+Word&term=Visualizing+spatial+relationships+among+health,+environmental,+and+demographic+statistics:+interface+design+issues.">Visualizing spatial relationships among health, environmental, and demographic statistics: interface design issues.</a> , 880-887 (1997).</li><li>Levory, M. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/query.fcgi?db=PubMed&cmd=Search&doptcmdl=Citation&defaultField=Title+Word&term=Display+of+surfaces+from+volume+data.">Display of surfaces from volume data.</a> IEEE Computer Graphics and Application. 8 (5), 29-37 (1998).</li><li>Drebin, R. A., Carpenter, L., et al. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/query.fcgi?db=PubMed&cmd=Search&doptcmdl=Citation&defaultField=Title+Word&term=Volume+Rendering.">Volume Rendering.</a> Computer Graphics. , (1998).</li><li>Lee, W., Krumm, J., Zheng, Y., Zhou, X. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/query.fcgi?db=PubMed&cmd=Search&doptcmdl=Citation&defaultField=Title+Word&term=Trajectory+preprocessing.">Trajectory preprocessing.</a> Computing with Spatial Trajectories. , 3-34 (2011).</li><li>Han, B., Comaniciu, D., et al. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/query.fcgi?db=PubMed&cmd=Search&doptcmdl=Citation&defaultField=Title+Word&term=Sequential+kernel+density+approximation+and+its+application+to+real-time+visual+tracking.">Sequential kernel density approximation and its application to real-time visual tracking.</a> IEEE Transactions on Pattern Analysis and Machine Intelligence. , (2007).</li></ol>

我々は、インターフェースを開発するために、ArcGISのアドインのメカニズムを使用していました。すべての対話的な操作を使用して実装されたC + +です。すべて自動処理と分析機能がPythonを使って開発されました。 エラーが原因で建物や頻繁な屋内停留所に隣接する大規模なことができるように歩行者が収集したAGPSデータ、またはGPSデータは、前処理に特有の課題を提?...

<table border="1"><tbody><tr><td> 試薬の名称 </td><td> 会社 </td><td> カタログ番号 </td><td> コメント（オプション） </td></tr><tr><td> WorldTracker GPRS </td><td>世界のトラッキング</td><td></td><td></td></tr><tr><td>分析を実行するためのパソコン</td><td></td><td></td><td></td></tr><tr><td> ArcGISソフトウェア</td><td> ESRI </td><td></td><td></td></tr><tr><td>軌道アナライザ拡張</td><td></td><td></td><td></td></tr></tbody></table>

trajectory data analyses for pedestrian space-time activity study

これはよく空間的および時間的な次元における人間の運動は病気伝送1-3直接的な影響力を持っていることが認識されている。感染症は、通常、それらの重なり活動空間における感染と感受性個体間の接触を介して広がっています。したがって、毎日のモビリティアクティビティ情報は、感染の危険因子への曝露を測定するための指標として使用することができる。しかし、このように大きな難題とミクロスケールでの感染症伝播の研究が不足している理由は、詳細な個人のモビリティデータの不足から生じる。以前はしばしば被験者が積極的に時間と空間での活動を記録するために必要な時間空間日記技術、に依存していた交通、観光研究の詳細な時空間活動データインチこれは非常に参加者からの参加者とのコラボレーションを求めている大幅にデータ4の品質に影響を与える。 現代のGPSやモバイル通信などの技術が可能軌跡データの自動収集を行っている。収集されたデータは、しかし、既存の機器の精度によって制限され、人間の時空間活動をモデル化するための理想的ではありません。人間行動研究のためのデータの効率的な処理のための容易に利用可能なツールもありません。私たちはここでのメソッドのスイートと軌跡データの前処理、時空間解析のための統合されたArcGISのデスクトップベースのビジュアルなインターフェイスを提示。我々は、特にそのような感染症の伝送モデリングなど、公衆衛生学に有用である可能性のあるエラーの豊富な歩行者の軌跡データと、人間の時空間活動をモデル化するために使用されるかもしれないか、このような処理の例を示します。 提示の手順では、前処理、軌道セグメンテーション、活動空間の特性、密度推定と可視化、および他のいくつかの予備的な解析手法を含む。プリprocessingがうるさい生の軌道データのクリーニングです。私たちは、対話型のビジュアル前処理インタフェースと同様に自動モジュールをご紹介します。軌道セグメンテーション5は前処理された時空のトラックから、屋内と屋外の部品の識別を必要とする。繰り返しになりますが、インタラクティブな視覚的セグメンテーションと自動セグメンテーションの両方がサポートされています。セグメント化された時空のトラックはその後派生するために分析されるような活動半径等密度推定と可視化など、1つの活動領域の特性は、ホットスポットとの相互作用をモデル化するために軌道に大量のデータを調べるために使用されます。我々は、密度表面マッピング6および密度ボリュームレンダリング7の両方を示しています。我々はまた、Google Earthのアニメーションをサポートし、接続の分析など、他の探索的データ解析（EDA）と視覚化ツールのカップルが含まれています。分析のスイートだけでなく、この論文で提示ビジュアルメソッドはsの任意の軌道データに適用してもよいペースタイム活性研究。

軌跡データは、2010年春にキーン大学（ニュージャージー州、米国）からの学部学生をボランティアにより収集した。目的はなかった人と比較して（医師によって診断や自己診断）がインフルエンザをひいた生徒の行動パターンを研究することであった。本稿で提案手法や手順を説明するために、我々は代表的な結果を生成するために郊外キャンパスエリア内で収集軌道を取った。キャンパス...

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Trajectory Data Analyses for Pedestrian Space-time Activity Study

時空間処理方法のスイートは、モデリング·歩行者の時空間活動の目的のため、GPSデバイスを使用して収集されたものと人間の軌道データを分析するために提示されています。

歩行者空間·時間·アクティビティ·研究のための軌道データ解析

It is well recognized that human movement in the  spatial and temporal dimensions has direct influence on disease transmission1-3.  An infectious disease ...

Research

JoVE Journal

Biology

Testing Visual Sensitivity to the Speed and Direction of Motion in Lizards

トカゲの運動の速度と方向の視覚感度のテスト

Testing visual sensitivity in any species provides basic information regarding behaviour, evolution, and ecology. However, testing specific features of ...

Computer-Generated Animal Model Stimuli

コンピュータによって生成された動物モデルの刺激

Communication between animals is diverse and complex. Animals may communicate using auditory, seismic, chemosensory, electrical, or visual signals. In ...

Bioelectric Analyses of an Osseointegrated Intelligent Implant Design System for Amputees

切断者のためのOsseointegratedインテリジェントインプラント設計システムの生体電気分析

The projected number of American amputees is expected to rise to 3.6 million by 2050.  Many of these individuals depend on artificial limbs to perform ...

Isolation and Purification of Drosophila Peripheral Neurons by Magnetic Bead Sorting

Isolation and Purification of Drosophila Peripheral Neurons by Magnetic Bead Sorting

の単離と精製ショウジョウバエ</em磁気ビーズソート別>末梢ニューロン

The Drosophila peripheral nervous system (PNS) is a powerful model for investigating the complex processes of neuronal development and dendrite ...

Evisceration of Mouse Vitreous and Retina for Proteomic Analyses

プロテオーム解析のためのマウスの硝子体と網膜の内臓摘出

While the mouse retina has emerged as an important genetic model for inherited retinal disease, the mouse vitreous remains to be explored. The vitreous is ...

Do-It-Yourself Device for Recovery of Cryopreserved Samples Accidentally Dropped into Cryogenic Storage Tanks

凍結保存サンプルの回復のための日曜大工のデバイスが誤って低温貯蔵タンクに落とし

Liquid nitrogen is colorless, odorless, extremely cold (-196 &deg;C) liquid kept under pressure. It is commonly used as a cryogenic fluid for long term ...

Nanogold Labeling of the Yeast Endosomal System for Ultrastructural Analyses

超微細構造解析のための酵母エンドソーム系のナノゴールドラベル付け

Endosomes are one of the major membrane sorting checkpoints in eukaryotic cells and they regulate recycling or destruction of proteins mostly from the ...

Improved Swiss-rolling Technique for Intestinal Tissue Preparation for Immunohistochemical and Immunofluorescent Analyses

免疫組織化学および免疫蛍光分析のための腸組織の調製のための改良されたスイス・ローリングテクニック

Understanding the role of factors that regulate intestinal epithelial homeostasis and response to injury and regeneration is important. The current ...

In Vitro SUMOylation Assay to Study SUMO E3 Ligase Activity

In Vitro SUMOylation Assay to Study SUMO E3 Ligase Activity

体外相撲 E3 リガーゼ活性を研究する sumo 化アッセイ

Small ubiquitin-like modifier (SUMO) modification is an important post-translational modification (PTM) that mediates signal transduction primarily ...

Application of Electrophysiology Measurement to Study the Activity of Electro-Neutral Transporters

電気生理学測定の電気中立運送者の活動を研究への応用

The transport of ions through cell membranes ensures the fine control of ion content within and outside the cell that is indispensable for cell survival. ...