Name: trajectory data analyses for pedestrian space-time activity study
Uploaded: 2013-02-25T12:03:00
Description: Watch this Scientific Journal Video about Trajectory Data Analyses for Pedestrian Space-time Activity Study at JoVE.com

Dette arbeidet er finansiert av NIH stipend 1R03AI090465.

1. Få data <ol><li> Banen data kan samles med håndholdte GPS-enheter, GPS-aktiverte smarttelefoner sporing applikasjoner, samt A-GPS (assistert GPS) enheter slik som den ansatte i vår studie, en kommersiell barn tracker enhet. </li><li> Banen data lagres vanligvis i form av tid-breddegrad-lengdegrad poster. En ønsket tidsintervall bør settes basert på behov. Ofte de mest hyppige intervall er ønskelig for space-time aktivitet studier. </li><li> Konvertere data til kommadelte verdier, eller. CSV-filer med egne ko...

<ol>
	<li>Stoddard, S. T., Morrison, A. C., et al. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/query.fcgi?db=PubMed&cmd=Search&doptcmdl=Citation&defaultField=Title+Word&term=The+role+of+human+movement+in+the+transmission+of+vector-borne+pathogens.">The role of human movement in the transmission of vector-borne pathogens.</a> PLoS Negl. Trop. Dis. 3 (7), e10 (2009).</li><li>Morens, D. M., Folkers, G. K., et al. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/query.fcgi?db=PubMed&cmd=Search&doptcmdl=Citation&defaultField=Title+Word&term=The+challenge+of+emerging+and+re-emerging+infectious+diseases.">The challenge of emerging and re-emerging infectious diseases.</a> Nature. 430, 242-249 (2004).</li><li>Viboud, C., Bjornstad, O. N., et al. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/query.fcgi?db=PubMed&cmd=Search&doptcmdl=Citation&defaultField=Title+Word&term=Synchrony,+waves,+and+spatial+hierarchies+in+the+spread+of+influenza.">Synchrony, waves, and spatial hierarchies in the spread of influenza.</a> Science. 312, 447-451 (2006).</li><li>Shoval, N., Isaacson, M. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/query.fcgi?db=PubMed&cmd=Search&doptcmdl=Citation&defaultField=Title+Word&term=The+Application+of+tracking+technologies+to+the+study+of+pedestrian+spatial+behaviour.">The Application of tracking technologies to the study of pedestrian spatial behaviour.</a> The Professional Geographer. 58 (2), 172-183 (2006).</li><li>Yu, H. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/query.fcgi?db=PubMed&cmd=Search&doptcmdl=Citation&defaultField=Title+Word&term=Spatio-temporal+GIS+design+for+exploring+interactions+of+human+activities.">Spatio-temporal GIS design for exploring interactions of human activities.</a> Cartography and Geographic Information Science. 33 (1), 3-19 (2006).</li><li>Kwan, M. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/query.fcgi?db=PubMed&cmd=Search&doptcmdl=Citation&defaultField=Title+Word&term=Interactive+geovisualization+of+activity-travel+patterns+using+three-dimensional+geographical+information+systems:+a+methodological+exploration+with+a+large+data+set.">Interactive geovisualization of activity-travel patterns using three-dimensional geographical information systems: a methodological exploration with a large data set.</a> Transportation Research Part C. 8, 185-203 (2000).</li><li>Dem&#353;ar, U., Virrantaus, K. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/query.fcgi?db=PubMed&cmd=Search&doptcmdl=Citation&defaultField=Title+Word&term=Space-time+density+of+trajectories:+exploring+spatio-temporal+patterns+in+movement+data.">Space-time density of trajectories: exploring spatio-temporal patterns in movement data.</a> International Journal of Geographical Information Science. 24 (10), 1527-1542 (2010).</li><li>Kraak, M., Koussoulakous, A., Fisher, P. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/query.fcgi?db=PubMed&cmd=Search&doptcmdl=Citation&defaultField=Title+Word&term=.">.</a> A visualization environment for the space-time cube. , 189-200 (2004).</li><li>MacEachren, A. M., Polsky, C., et al. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/query.fcgi?db=PubMed&cmd=Search&doptcmdl=Citation&defaultField=Title+Word&term=Visualizing+spatial+relationships+among+health,+environmental,+and+demographic+statistics:+interface+design+issues.">Visualizing spatial relationships among health, environmental, and demographic statistics: interface design issues.</a> , 880-887 (1997).</li><li>Levory, M. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/query.fcgi?db=PubMed&cmd=Search&doptcmdl=Citation&defaultField=Title+Word&term=Display+of+surfaces+from+volume+data.">Display of surfaces from volume data.</a> IEEE Computer Graphics and Application. 8 (5), 29-37 (1998).</li><li>Drebin, R. A., Carpenter, L., et al. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/query.fcgi?db=PubMed&cmd=Search&doptcmdl=Citation&defaultField=Title+Word&term=Volume+Rendering.">Volume Rendering.</a> Computer Graphics. , (1998).</li><li>Lee, W., Krumm, J., Zheng, Y., Zhou, X. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/query.fcgi?db=PubMed&cmd=Search&doptcmdl=Citation&defaultField=Title+Word&term=Trajectory+preprocessing.">Trajectory preprocessing.</a> Computing with Spatial Trajectories. , 3-34 (2011).</li><li>Han, B., Comaniciu, D., et al. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/query.fcgi?db=PubMed&cmd=Search&doptcmdl=Citation&defaultField=Title+Word&term=Sequential+kernel+density+approximation+and+its+application+to+real-time+visual+tracking.">Sequential kernel density approximation and its application to real-time visual tracking.</a> IEEE Transactions on Pattern Analysis and Machine Intelligence. , (2007).</li></ol>

Vi brukte tillegget mekanisme ArcGIS å utvikle grensesnittet. Alle de interaktive operasjoner ble gjennomført ved hjelp av C + +. Alle automatisk behandling og analyse funksjoner ble utviklet ved hjelp av Python. AGPS data, eller GPS-data samlet inn av fotgjenger presenterer unik utfordring i forbehandling som feilene kan være massive grunn tilstøter bygninger og hyppige innendørs stopper. Videre bør fokus for preprosessering ikke være data reduksjon som det som vanligvis gjøres for ...

<table border="1"><tbody><tr><td> Navnet på reagensen </td><td> Selskapet </td><td> Katalognummer </td><td> Kommentarer (valgfritt) </td></tr><tr><td> WorldTracker GPRS </td><td> Sporing The World </td><td></td><td></td></tr><tr><td> En personlig datamaskin for å kjøre analysen </td><td></td><td></td><td></td></tr><tr><td> ArcGIS programvare </td><td> ESRI </td><td></td><td></td></tr><tr><td> Mønsterhastighet Analyzer Extension </td><td></td><td></td><td></td></tr></tbody></table>

trajectory data analyses for pedestrian space-time activity study

Det er velkjent at menneskelig bevegelse i rom og tid dimensjoner har direkte innflytelse på smitteoverføring 1-3. En smittsom sykdom sprer typisk via kontakt mellom smittede og utsatt enkeltpersoner i deres overlappende aktivitet mellomrom. Derfor kan daglig mobilitet-aktivitet informasjon brukes som en indikator for å måle eksponeringer mot risikofaktorer av infeksjon. Imidlertid, en stor vanskelighet og dermed årsaken til mangelen på studier av smittsomme sykdomsoverføring ved mikro skala oppstår fra mangel på detaljerte individuelle mobilitet data. Tidligere i transport og turisme forskning detaljerte space-time aktivitet data ofte stolt på tid-rom dagbok teknikk, som krever fag å aktivt registrere sin aktivitet i tid og rom. Dette er svært krevende for deltakerne og samarbeid fra deltakerne i stor grad påvirker kvaliteten på data 4. Moderneteknologier som GPS og mobilkommunikasjon har gjort det mulig å automatisk innhenting av banen data. De innsamlede data er imidlertid ikke ideelt for modellering humane plass fritidsaktiviteter, begrenset av de nøyaktighet på eksisterende enheter. Det er også ikke lett tilgjengelig verktøy for effektiv behandling av dataene for menneskelig adferd studien. Vi presenterer her en rekke metoder og en integrert ArcGIS desktop-baserte visuelt grensesnitt for pre-prosessering og Spatiotemporal analyser av banen data. Vi gir eksempler på hvordan en slik behandling kan brukes for å modellere humane plass fritidsaktiviteter, spesielt med feil-rike fotgjenger banen data, som kan være nyttige i folkehelsen studier som smittsomme smitteoverføring modellering. Prosedyren presentert inkluderer pre-prosessering, bane segmentering, aktivitet plass karakterisering, tetthet estimering og visualisering, og noen få andre utforskende analysemetoder. Pre-processing er rengjøring av bråkete rå bane data. Vi introduserer en interaktiv visuell forbehandlende grensesnitt samt en automatisk modul. Mønsterhastighet segmentering 5 innebærer identifisering av innendørs og utendørs deler fra pre-behandlet rom-tid spor. Igjen, blir både interaktive visuell segmentering og automatisk segmentering støttes. Segmenterte rom-tid spor blir deretter analysert for å utlede egenskapene til en aktivitet plass, for eksempel aktivitet radius etc. Tetthet estimering og visualisering brukes til å undersøke store mengder banen data å modellere heteflekker og interaksjoner. Vi viser både tetthet overflaten kartlegging 6 og tetthet volumgjengivelse 7. Vi inkluderer også et par andre utforskende dataanalyser (EDA) og visualiseringer verktøy, for eksempel Google Earth animasjon støtte og tilknytning analyse. Suiten av analytiske samt visuelle metoder presenteres i denne artikkelen kan brukes til noen bane data for stempo-time aktivitet studier.

Banen data ble samlet ved frivillig studenter fra Kean University (NJ, USA) våren 2010. Hensikten var å studere aktivitet mønstre av studenter som fanget influensa (diagnostisert av lege eller selv-diagnostisert) i forhold til de som ikke gjorde det. For å illustrere de metoder og prosedyrer presenteres i denne artikkelen vi tok baner samlet i forstads campus-området for å generere representative resultater. Baner innenfor campus-området er det meste fotgjenger baner, med bare en liten del som følge av kjøring ...

Watch this Scientific Journal Video about Trajectory Data Analyses for Pedestrian Space-time Activity Study at JoVE.com

Trajectory Data Analyses for Pedestrian Space-time Activity Study

En pakke med Spatiotemporal bearbeidingsmetoder presenteres å analysere menneskelige banen data, for eksempel som samlet ved hjelp av en GPS-enhet, i den hensikt å modellering fotgjenger plass fritidsaktiviteter.

Banen data Analyser for Fotgjenger Space-time Aktivitet Study

It is well recognized that human movement in the  spatial and temporal dimensions has direct influence on disease transmission1-3.  An infectious disease ...

Research

JoVE Journal

Biology

Testing Visual Sensitivity to the Speed and Direction of Motion in Lizards

Testing visual sensitivity in any species provides basic information regarding behaviour, evolution, and ecology. However, testing specific features of ...

Computer-Generated Animal Model Stimuli

Communication between animals is diverse and complex. Animals may communicate using auditory, seismic, chemosensory, electrical, or visual signals. In ...

Bioelectric Analyses of an Osseointegrated Intelligent Implant Design System for Amputees

The projected number of American amputees is expected to rise to 3.6 million by 2050.  Many of these individuals depend on artificial limbs to perform ...

Isolation and Purification of Drosophila Peripheral Neurons by Magnetic Bead Sorting

Isolation and Purification of Drosophila Peripheral Neurons by Magnetic Bead Sorting

The Drosophila peripheral nervous system (PNS) is a powerful model for investigating the complex processes of neuronal development and dendrite ...

Evisceration of Mouse Vitreous and Retina for Proteomic Analyses

While the mouse retina has emerged as an important genetic model for inherited retinal disease, the mouse vitreous remains to be explored. The vitreous is ...

Do-It-Yourself Device for Recovery of Cryopreserved Samples Accidentally Dropped into Cryogenic Storage Tanks

Gjør-det-selv Enhet for gjenoppretting av Cryopreserved Prøver uhell falt inn Kryogeniske lagertanker

Liquid nitrogen is colorless, odorless, extremely cold (-196 &deg;C) liquid kept under pressure. It is commonly used as a cryogenic fluid for long term ...

Nanogold Labeling of the Yeast Endosomal System for Ultrastructural Analyses

Nanogold Merking av gjær endosomal System for Ultrastructural Analyser

Endosomes are one of the major membrane sorting checkpoints in eukaryotic cells and they regulate recycling or destruction of proteins mostly from the ...

Improved Swiss-rolling Technique for Intestinal Tissue Preparation for Immunohistochemical and Immunofluorescent Analyses

Forbedret Swiss-rullende teknikk for tarmvevet Forberedelse til Immunhistokjemisk og Immunofluorescent Analyser

Understanding the role of factors that regulate intestinal epithelial homeostasis and response to injury and regeneration is important. The current ...

In Vitro SUMOylation Assay to Study SUMO E3 Ligase Activity

In Vitro SUMOylation Assay to Study SUMO E3 Ligase Activity

In Vitro SUMOylation analysen å studere SUMO E3 Ligase aktivitet

Small ubiquitin-like modifier (SUMO) modification is an important post-translational modification (PTM) that mediates signal transduction primarily ...

Application of Electrophysiology Measurement to Study the Activity of Electro-Neutral Transporters

Anvendelse av elektrofysiologi mål å studere aktiviteten til elektro-nøytral transportører

The transport of ions through cell membranes ensures the fine control of ion content within and outside the cell that is indispensable for cell survival. ...