Name: trajectory data analyses for pedestrian space-time activity study
Uploaded: 2013-02-25T12:03:00
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Este trabajo está financiado por el NIH subvención 1R03AI090465.

1. Obtención de datos <ol><li> Trayectoria de datos se pueden recoger con unidades GPS portátiles, GPS habilitados para aplicaciones de rastreo de teléfonos inteligentes, así como A-GPS (GPS asistido) dispositivos como el empleado en nuestro estudio, un dispositivo secundario de seguimiento comercial. </li><li> Trayectoria de datos se suelen guardar en términos de registros de tiempo de latitud y longitud. Un intervalo de tiempo deseado debe establecerse en función de las necesidades de la aplicación. A menudo,...

<ol>
	<li>Stoddard, S. T., Morrison, A. C., et al. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/query.fcgi?db=PubMed&cmd=Search&doptcmdl=Citation&defaultField=Title+Word&term=The+role+of+human+movement+in+the+transmission+of+vector-borne+pathogens.">The role of human movement in the transmission of vector-borne pathogens.</a> PLoS Negl. Trop. Dis. 3 (7), e10 (2009).</li><li>Morens, D. M., Folkers, G. K., et al. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/query.fcgi?db=PubMed&cmd=Search&doptcmdl=Citation&defaultField=Title+Word&term=The+challenge+of+emerging+and+re-emerging+infectious+diseases.">The challenge of emerging and re-emerging infectious diseases.</a> Nature. 430, 242-249 (2004).</li><li>Viboud, C., Bjornstad, O. N., et al. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/query.fcgi?db=PubMed&cmd=Search&doptcmdl=Citation&defaultField=Title+Word&term=Synchrony,+waves,+and+spatial+hierarchies+in+the+spread+of+influenza.">Synchrony, waves, and spatial hierarchies in the spread of influenza.</a> Science. 312, 447-451 (2006).</li><li>Shoval, N., Isaacson, M. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/query.fcgi?db=PubMed&cmd=Search&doptcmdl=Citation&defaultField=Title+Word&term=The+Application+of+tracking+technologies+to+the+study+of+pedestrian+spatial+behaviour.">The Application of tracking technologies to the study of pedestrian spatial behaviour.</a> The Professional Geographer. 58 (2), 172-183 (2006).</li><li>Yu, H. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/query.fcgi?db=PubMed&cmd=Search&doptcmdl=Citation&defaultField=Title+Word&term=Spatio-temporal+GIS+design+for+exploring+interactions+of+human+activities.">Spatio-temporal GIS design for exploring interactions of human activities.</a> Cartography and Geographic Information Science. 33 (1), 3-19 (2006).</li><li>Kwan, M. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/query.fcgi?db=PubMed&cmd=Search&doptcmdl=Citation&defaultField=Title+Word&term=Interactive+geovisualization+of+activity-travel+patterns+using+three-dimensional+geographical+information+systems:+a+methodological+exploration+with+a+large+data+set.">Interactive geovisualization of activity-travel patterns using three-dimensional geographical information systems: a methodological exploration with a large data set.</a> Transportation Research Part C. 8, 185-203 (2000).</li><li>Dem&#353;ar, U., Virrantaus, K. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/query.fcgi?db=PubMed&cmd=Search&doptcmdl=Citation&defaultField=Title+Word&term=Space-time+density+of+trajectories:+exploring+spatio-temporal+patterns+in+movement+data.">Space-time density of trajectories: exploring spatio-temporal patterns in movement data.</a> International Journal of Geographical Information Science. 24 (10), 1527-1542 (2010).</li><li>Kraak, M., Koussoulakous, A., Fisher, P. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/query.fcgi?db=PubMed&cmd=Search&doptcmdl=Citation&defaultField=Title+Word&term=.">.</a> A visualization environment for the space-time cube. , 189-200 (2004).</li><li>MacEachren, A. M., Polsky, C., et al. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/query.fcgi?db=PubMed&cmd=Search&doptcmdl=Citation&defaultField=Title+Word&term=Visualizing+spatial+relationships+among+health,+environmental,+and+demographic+statistics:+interface+design+issues.">Visualizing spatial relationships among health, environmental, and demographic statistics: interface design issues.</a> , 880-887 (1997).</li><li>Levory, M. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/query.fcgi?db=PubMed&cmd=Search&doptcmdl=Citation&defaultField=Title+Word&term=Display+of+surfaces+from+volume+data.">Display of surfaces from volume data.</a> IEEE Computer Graphics and Application. 8 (5), 29-37 (1998).</li><li>Drebin, R. A., Carpenter, L., et al. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/query.fcgi?db=PubMed&cmd=Search&doptcmdl=Citation&defaultField=Title+Word&term=Volume+Rendering.">Volume Rendering.</a> Computer Graphics. , (1998).</li><li>Lee, W., Krumm, J., Zheng, Y., Zhou, X. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/query.fcgi?db=PubMed&cmd=Search&doptcmdl=Citation&defaultField=Title+Word&term=Trajectory+preprocessing.">Trajectory preprocessing.</a> Computing with Spatial Trajectories. , 3-34 (2011).</li><li>Han, B., Comaniciu, D., et al. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/query.fcgi?db=PubMed&cmd=Search&doptcmdl=Citation&defaultField=Title+Word&term=Sequential+kernel+density+approximation+and+its+application+to+real-time+visual+tracking.">Sequential kernel density approximation and its application to real-time visual tracking.</a> IEEE Transactions on Pattern Analysis and Machine Intelligence. , (2007).</li></ol>

Se utilizó complemento en el mecanismo de ArcGIS para desarrollar la interfaz. Todas las operaciones se llevaron a cabo utilizando interactivas C + +. Todo el procesamiento automático y funciones de análisis se desarrollaron usando Python. AGPS datos, o los datos recogidos por GPS peatonal presenta desafío único en el preprocesamiento ya que los errores pueden ser masivas debido a la adyacencia a los edificios y las frecuentes paradas interiores. Además, el enfoque de procesamiento pre...

<table border="1"><tbody><tr><td> Nombre del reactivo </td><td> Empresa </td><td> Número de catálogo </td><td> Comentarios (opcional) </td></tr><tr><td> WorldTracker GPRS </td><td> Seguimiento del mundo </td><td></td><td></td></tr><tr><td> Una computadora personal para ejecutar el análisis </td><td></td><td></td><td></td></tr><tr><td> ArcGIS software </td><td> ESRI </td><td></td><td></td></tr><tr><td> Trayectoria Extensión Analizador </td><td></td><td></td><td></td></tr></tbody></table>

trajectory data analyses for pedestrian space-time activity study

Es bien reconocido que el movimiento humano en las dimensiones espacial y temporal tiene influencia directa en la transmisión de enfermedades 1-3. Una enfermedad infecciosa generalmente se propaga a través de contacto entre personas infectadas y susceptibles en sus espacios de actividad superpuestas. Por lo tanto, la movilidad cotidiana-actividad de información se puede utilizar como un indicador para medir la exposición a factores de riesgo de infección. Sin embargo, una dificultad importante y por lo tanto la razón de la escasez de estudios sobre la transmisión de enfermedades infecciosas a escala micro derivarse de la falta de datos detallados de movilidad individual. Anteriormente, en el transporte y el turismo detallados de la investigación del espacio-tiempo los datos de actividad a menudo se basó en la técnica de diario del tiempo-espacio, que requiere que los sujetos para registrar activamente sus actividades en el tiempo y el espacio. Esto es muy exigente para los participantes y la colaboración de los participantes afecta en gran medida la calidad de los datos 4. Modernotecnologías como el GPS y las comunicaciones móviles han hecho posible la recopilación automática de datos de trayectoria. Los datos recogidos, sin embargo, no es ideal para el modelado de humanos de espacio-tiempo, las actividades limitadas por la precisión de los dispositivos existentes. Tampoco hay una herramienta disponible para un procesamiento eficiente de los datos para estudiar el comportamiento humano. Presentamos aquí una serie de métodos y un sistema integrado de ArcGIS desktop basado en interfaz visual para el análisis de pre-procesamiento y espacio-temporal de los datos de trayectoria. Proporcionamos ejemplos de cómo este tratamiento se puede utilizar para modelar humanos del espacio-tiempo actividades, especialmente con error ricos en datos peatonales trayectoria, que podrían ser útiles en los estudios de salud pública tales como el modelado de la transmisión de enfermedades infecciosas. El procedimiento presentado incluye pre-procesamiento, segmentación de trayectoria, la caracterización de la actividad espacial, la estimación de la densidad y la visualización, y algunos otros métodos de análisis exploratorios. Pre-procesamieng es la limpieza de ruidosos datos de trayectoria primas. Se introduce una visual interactiva pre-procesamiento de interfaz, así como un módulo automático. Trayectoria 5 segmentación consiste en la identificación de las partes interiores y exteriores de pre-procesado de espacio-tiempo seco. Una vez más, tanto la segmentación interactiva visual y segmentación automática son compatibles. Segmentados de espacio-tiempo pistas se analizan luego para derivar características de espacio de la propia actividad tales como la estimación actividad radio de densidad, etc y la visualización se utilizan para examinar gran cantidad de datos de trayectoria para modelar los puntos calientes y las interacciones. Demostramos tanto mapeo de la superficie ganadera 6 y renderizado densidad de volumen 7. También incluimos un par de otros análisis de datos exploratorios (EDA) y las herramientas visuales reducidas, como el apoyo animación Google Earth y análisis conexión. El conjunto de análisis, así como métodos visuales presentados en este documento se pueden aplicar a los datos de trayectoria para stiempo-ritmo estudios de actividad.

Trayectoria datos fueron recogidos por el voluntariado a los estudiantes de pregrado de la Universidad de Kean (Nueva Jersey, EE.UU.) en la primavera de 2010. El objetivo fue estudiar los patrones de actividad de los estudiantes que contrajeron la gripe (diagnosticada por el médico o por cuenta propia diagnostica-) en comparación con aquellos que no lo hicieron. Con el fin de ilustrar los métodos y procedimientos presentados en este trabajo tomamos las trayectorias recogidas en la zona del campus suburbano de generar...

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Trajectory Data Analyses for Pedestrian Space-time Activity Study

Un conjunto de métodos de procesamiento espaciotemporales se presentan para analizar los datos de trayectoria humanos, tales como la recogida usando un dispositivo GPS, con el fin de modelar peatonales de espacio-tiempo actividades.

Los análisis de trayectoria de datos para el estudio de peatones Actividad espacio-tiempo

It is well recognized that human movement in the  spatial and temporal dimensions has direct influence on disease transmission1-3.  An infectious disease ...

Research

JoVE Journal

Biology

Testing Visual Sensitivity to the Speed and Direction of Motion in Lizards

Prueba de sensibilidad visual a la velocidad y dirección del movimiento en lagartos

Testing visual sensitivity in any species provides basic information regarding behaviour, evolution, and ecology. However, testing specific features of ...

Investigación

Biología

Computer-Generated Animal Model Stimuli

Los estímulos generados por ordenador Modelo animal

Communication between animals is diverse and complex. Animals may communicate using auditory, seismic, chemosensory, electrical, or visual signals. In ...

Bioelectric Analyses of an Osseointegrated Intelligent Implant Design System for Amputees

Los análisis bioeléctricos de una osteointegrados Sistema Inteligente diseño de los implantes para Amputados

The projected number of American amputees is expected to rise to 3.6 million by 2050.  Many of these individuals depend on artificial limbs to perform ...

Isolation and Purification of Drosophila Peripheral Neurons by Magnetic Bead Sorting

Isolation and Purification of Drosophila Peripheral Neurons by Magnetic Bead Sorting

Aislamiento y purificación de Drosophila Clasificación de las neuronas periféricas por bolas magnéticas

The Drosophila peripheral nervous system (PNS) is a powerful model for investigating the complex processes of neuronal development and dendrite ...

Evisceration of Mouse Vitreous and Retina for Proteomic Analyses

Evisceración de vítreo y retina del ratón para análisis proteómico

While the mouse retina has emerged as an important genetic model for inherited retinal disease, the mouse vitreous remains to be explored. The vitreous is ...

Do-It-Yourself Device for Recovery of Cryopreserved Samples Accidentally Dropped into Cryogenic Storage Tanks

Do-It-Yourself de dispositivos para la recuperación de las muestras criopreservadas de caída accidental en los tanques de almacenamiento criogénicos

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Understanding the role of factors that regulate intestinal epithelial homeostasis and response to injury and regeneration is important. The current ...

In Vitro SUMOylation Assay to Study SUMO E3 Ligase Activity

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In Vitro Ensayo de la sumoilación estudiar SUMO E3 ligasa actividad

Small ubiquitin-like modifier (SUMO) modification is an important post-translational modification (PTM) that mediates signal transduction primarily ...

Application of Electrophysiology Measurement to Study the Activity of Electro-Neutral Transporters

Aplicación de medición de electrofisiología para estudiar la actividad de transportadores de Electro-neutro

The transport of ions through cell membranes ensures the fine control of ion content within and outside the cell that is indispensable for cell survival. ...