Name: trajectory data analyses for pedestrian space-time activity study
Uploaded: 2013-02-25T12:03:00
Description: Watch this Scientific Journal Video about Trajectory Data Analyses for Pedestrian Space-time Activity Study at JoVE.com

Detta arbete är finansierat av NIH bidrag 1R03AI090465.

1. Få data <ol><li> Bana data kan samlas in med handhållen GPS-enheter, GPS-aktiverade smartphones applikationer spårning samt A-GPS (Assisted GPS) enheter såsom en anställd i vår studie, en kommersiell barn tracker enhet. </li><li> Bandata sparas vanligtvis i termer av tid-latitud-longitud poster. En önskad tidsintervall bör ställas utifrån applikationsbehov. Ofta den vanligaste intervallet är önskvärd för rumtiden aktivitet studier. </li><li> Konvertera data till kommaseparerade värden eller. Csv-file...

<ol>
	<li>Stoddard, S. T., Morrison, A. C., et al. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/query.fcgi?db=PubMed&cmd=Search&doptcmdl=Citation&defaultField=Title+Word&term=The+role+of+human+movement+in+the+transmission+of+vector-borne+pathogens.">The role of human movement in the transmission of vector-borne pathogens.</a> PLoS Negl. Trop. Dis. 3 (7), e10 (2009).</li><li>Morens, D. M., Folkers, G. K., et al. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/query.fcgi?db=PubMed&cmd=Search&doptcmdl=Citation&defaultField=Title+Word&term=The+challenge+of+emerging+and+re-emerging+infectious+diseases.">The challenge of emerging and re-emerging infectious diseases.</a> Nature. 430, 242-249 (2004).</li><li>Viboud, C., Bjornstad, O. N., et al. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/query.fcgi?db=PubMed&cmd=Search&doptcmdl=Citation&defaultField=Title+Word&term=Synchrony,+waves,+and+spatial+hierarchies+in+the+spread+of+influenza.">Synchrony, waves, and spatial hierarchies in the spread of influenza.</a> Science. 312, 447-451 (2006).</li><li>Shoval, N., Isaacson, M. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/query.fcgi?db=PubMed&cmd=Search&doptcmdl=Citation&defaultField=Title+Word&term=The+Application+of+tracking+technologies+to+the+study+of+pedestrian+spatial+behaviour.">The Application of tracking technologies to the study of pedestrian spatial behaviour.</a> The Professional Geographer. 58 (2), 172-183 (2006).</li><li>Yu, H. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/query.fcgi?db=PubMed&cmd=Search&doptcmdl=Citation&defaultField=Title+Word&term=Spatio-temporal+GIS+design+for+exploring+interactions+of+human+activities.">Spatio-temporal GIS design for exploring interactions of human activities.</a> Cartography and Geographic Information Science. 33 (1), 3-19 (2006).</li><li>Kwan, M. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/query.fcgi?db=PubMed&cmd=Search&doptcmdl=Citation&defaultField=Title+Word&term=Interactive+geovisualization+of+activity-travel+patterns+using+three-dimensional+geographical+information+systems:+a+methodological+exploration+with+a+large+data+set.">Interactive geovisualization of activity-travel patterns using three-dimensional geographical information systems: a methodological exploration with a large data set.</a> Transportation Research Part C. 8, 185-203 (2000).</li><li>Dem&#353;ar, U., Virrantaus, K. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/query.fcgi?db=PubMed&cmd=Search&doptcmdl=Citation&defaultField=Title+Word&term=Space-time+density+of+trajectories:+exploring+spatio-temporal+patterns+in+movement+data.">Space-time density of trajectories: exploring spatio-temporal patterns in movement data.</a> International Journal of Geographical Information Science. 24 (10), 1527-1542 (2010).</li><li>Kraak, M., Koussoulakous, A., Fisher, P. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/query.fcgi?db=PubMed&cmd=Search&doptcmdl=Citation&defaultField=Title+Word&term=.">.</a> A visualization environment for the space-time cube. , 189-200 (2004).</li><li>MacEachren, A. M., Polsky, C., et al. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/query.fcgi?db=PubMed&cmd=Search&doptcmdl=Citation&defaultField=Title+Word&term=Visualizing+spatial+relationships+among+health,+environmental,+and+demographic+statistics:+interface+design+issues.">Visualizing spatial relationships among health, environmental, and demographic statistics: interface design issues.</a> , 880-887 (1997).</li><li>Levory, M. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/query.fcgi?db=PubMed&cmd=Search&doptcmdl=Citation&defaultField=Title+Word&term=Display+of+surfaces+from+volume+data.">Display of surfaces from volume data.</a> IEEE Computer Graphics and Application. 8 (5), 29-37 (1998).</li><li>Drebin, R. A., Carpenter, L., et al. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/query.fcgi?db=PubMed&cmd=Search&doptcmdl=Citation&defaultField=Title+Word&term=Volume+Rendering.">Volume Rendering.</a> Computer Graphics. , (1998).</li><li>Lee, W., Krumm, J., Zheng, Y., Zhou, X. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/query.fcgi?db=PubMed&cmd=Search&doptcmdl=Citation&defaultField=Title+Word&term=Trajectory+preprocessing.">Trajectory preprocessing.</a> Computing with Spatial Trajectories. , 3-34 (2011).</li><li>Han, B., Comaniciu, D., et al. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/query.fcgi?db=PubMed&cmd=Search&doptcmdl=Citation&defaultField=Title+Word&term=Sequential+kernel+density+approximation+and+its+application+to+real-time+visual+tracking.">Sequential kernel density approximation and its application to real-time visual tracking.</a> IEEE Transactions on Pattern Analysis and Machine Intelligence. , (2007).</li></ol>

Vi använde tillägg mekanism ArcGIS för att utveckla gränssnittet. Alla interaktiva verksamheten genomfördes med C + +. All automatisk behandling och analysfunktioner har utvecklats med hjälp av Python. AGPS data eller GPS-data som samlats in av fotgängare innebär en unik utmaning i förbehandling eftersom fel kan vara massiva grund närhet till byggnader och täta inomhus stopp. Dessutom bör fokus förbehandling inte datareduktion som vad görs vanligen för fordon GPS bana data på...

<table border="1"><tbody><tr><td> Namnet av reagenset </td><td> Företag </td><td> Katalognummer </td><td> Kommentarer (tillval) </td></tr><tr><td> WorldTracker GPRS </td><td> Spårning Världen </td><td></td><td></td></tr><tr><td> En persondator för att köra analysen </td><td></td><td></td><td></td></tr><tr><td> ArcGIS </td><td> ESRI </td><td></td><td></td></tr><tr><td> Trajectory Analyzer Extension </td><td></td><td></td><td></td></tr></tbody></table>

trajectory data analyses for pedestrian space-time activity study

Det är väl känt att människans rörelse i de rumsliga och tidsmässiga dimensioner har direkt inflytande på smittspridning 1-3. En infektionssjukdom sprids vanligtvis via kontakt mellan smittade och mottagliga individer i deras överlappande verksamhet utrymmen. Därför kan daglig rörlighet-aktivitetsinformation användas som en indikator för att mäta exponering för riskfaktorer för infektion. Men en stor svårighet och därmed orsaken till bristen på studier av infektionssjukdomar överföring på mikro uppstår brist på detaljerade individuell rörlighet data. Tidigare i transport och turism forskning detaljerade rymd-tidsdata aktivitet ofta åberopats i tid och rymd dagbok teknik, som kräver individer att aktivt registrera sin verksamhet i tid och rum. Detta är mycket krävande för deltagarna och samarbete från deltagarna kraftigt påverkar kvaliteten på uppgifterna 4. Moderntekniker som GPS och mobil kommunikation har gjort det möjligt att automatiskt samla bandata. De insamlade uppgifterna är dock inte idealiskt för modellering människor rumtiden verksamhet begränsas av noggrannheten hos befintliga enheter. Det finns heller inga tillgängliga verktyg för effektiv behandling av uppgifterna för mänskligt beteende studie. Vi presenterar här en uppsättning metoder och en integrerad ArcGIS Desktop-baserade visuellt gränssnitt för förbehandling och Spatiotemporal analyser av bana data. Vi ger exempel på hur en sådan behandling kan användas för att modellera mänskliga rumtiden aktiviteter, särskilt med fel-rika uppgifter fotgängare bana, som kan vara användbar i folkhälsan studier som infektionssjukdomar överföring modellering. Förfarandet som presenteras inkluderar förbehandling, bana segmentering, aktivitet utrymme karakterisering, densitet uppskattning och visualisering, och några andra undersökande analysmetoder. Pre-processing är rengöring av bullriga rå bandata. Vi introducerar en interaktiv visuell förbehandling gränssnitt samt en automatisk modul. Trajectory segmentering 5 innebär identifiering av inomhus och utomhus delar från förbearbetade rumtiden spår. Återigen är både interaktiv visuell segmentering och automatisk segmentering stöds. Segmenterade rumtiden spåren analyseras sedan för att härleda egenskaper hos en aktivitet utrymme såsom aktivitet radie mm Densitet uppskattning och visualisering används för att undersöka stora mängder bandata att modellera värmefläckar och interaktioner. Vi visar både kartläggning densitet yta 6 och densitet volymåtergivning 7. Vi har även ett par andra förberedande dataanalyser (EDA) och visualiseringar verktyg, såsom Google Earth animering stöd och anslutning analys. Sviten av analytisk samt visuella metoder som presenteras i detta dokument kan tillämpas på alla bandata för stakt-time aktivitet studier.

Bandata samlades genom volontärarbete studenter från Kean University (NJ, USA) under våren 2010. Syftet var att studera aktivitet mönster av studenter som fångats influensa (diagnostiserad av läkare eller egenföretagare diagnostiserad) i jämförelse med dem som inte gjorde det. För att illustrera de metoder och förfaranden som presenteras i detta dokument tog vi banorna som samlas in inom förorts campusområdet för att generera representativa resultat. Banor inom campusområdet är mestadels fotgängare bano...

Watch this Scientific Journal Video about Trajectory Data Analyses for Pedestrian Space-time Activity Study at JoVE.com

Trajectory Data Analyses for Pedestrian Space-time Activity Study

En svit av Spatiotemporal bearbetningsmetoder presenteras för att analysera mänskliga bana data, såsom att samlas med hjälp av en GPS-enhet, för att rumtiden modellering fotgängare aktiviteter.

Bandata Analyser för fotgängare Space-time studieboken

It is well recognized that human movement in the  spatial and temporal dimensions has direct influence on disease transmission1-3.  An infectious disease ...

Research

JoVE Journal

Biology

Testing Visual Sensitivity to the Speed and Direction of Motion in Lizards

Testa Visual Känsligheten för hastighet och rörelseriktning i Ödlor

Testing visual sensitivity in any species provides basic information regarding behaviour, evolution, and ecology. However, testing specific features of ...

Computer-Generated Animal Model Stimuli

Datorgenererade djurmodell Stimuli

Communication between animals is diverse and complex. Animals may communicate using auditory, seismic, chemosensory, electrical, or visual signals. In ...

Bioelectric Analyses of an Osseointegrated Intelligent Implant Design System for Amputees

Bioelektrisk Analyser av en osseointegreras intelligent Implant Design System för amputerade

The projected number of American amputees is expected to rise to 3.6 million by 2050.  Many of these individuals depend on artificial limbs to perform ...

Isolation and Purification of Drosophila Peripheral Neurons by Magnetic Bead Sorting

Isolation and Purification of Drosophila Peripheral Neurons by Magnetic Bead Sorting

Isolering och rening av Drosophila Kringutrustning Nervceller av magnetiska Bead Sortering

The Drosophila peripheral nervous system (PNS) is a powerful model for investigating the complex processes of neuronal development and dendrite ...

Evisceration of Mouse Vitreous and Retina for Proteomic Analyses

Urtagning av Mouse glaskroppen och näthinnan för proteomik analyser

While the mouse retina has emerged as an important genetic model for inherited retinal disease, the mouse vitreous remains to be explored. The vitreous is ...

Do-It-Yourself Device for Recovery of Cryopreserved Samples Accidentally Dropped into Cryogenic Storage Tanks

Gör-det-själv Device för återhämtning av kryokonserverade prover Tappade misstag i Kryogena Lagringstankar

Liquid nitrogen is colorless, odorless, extremely cold (-196 &deg;C) liquid kept under pressure. It is commonly used as a cryogenic fluid for long term ...

Nanogold Labeling of the Yeast Endosomal System for Ultrastructural Analyses

Nanoguld Märkning av jäst endosomal System för Ultra Analyser

Endosomes are one of the major membrane sorting checkpoints in eukaryotic cells and they regulate recycling or destruction of proteins mostly from the ...

Improved Swiss-rolling Technique for Intestinal Tissue Preparation for Immunohistochemical and Immunofluorescent Analyses

Förbättrad Swiss-rullande Teknik för tarmvävnad Förberedelse för immunhistokemisk och immunofluorescens Analyser

Understanding the role of factors that regulate intestinal epithelial homeostasis and response to injury and regeneration is important. The current ...

In Vitro SUMOylation Assay to Study SUMO E3 Ligase Activity

In Vitro SUMOylation Assay to Study SUMO E3 Ligase Activity

In Vitro SUMOylation Assay att studera SUMO E3 Ligase aktivitet

Small ubiquitin-like modifier (SUMO) modification is an important post-translational modification (PTM) that mediates signal transduction primarily ...

Application of Electrophysiology Measurement to Study the Activity of Electro-Neutral Transporters

Tillämpningen av elektrofysiologi mätning av att studera aktiviteten av Electro-Neutral transportörer

The transport of ions through cell membranes ensures the fine control of ion content within and outside the cell that is indispensable for cell survival. ...