Name: using high resolution computed tomography to visualize the three dimensional structure and function of plant vasculature
Uploaded: 2013-04-05T13:00:00
Description: Watch this Scientific Journal Video about Using High Resolution Computed Tomography to Visualize the Three Dimensional Structure and Function of Plant Vasculature at JoVE.com

فإن الكتاب أود أن أشكر S Castorani، [إيوستيس] AJ، GAMBETTA GA، Manuck CM، النسفي Z، وزيدان A. وقد تم تمويل هذا العمل من قبل: وزارة الزراعة الأمريكية، بحوث الزراعية التمويل الخدمة البحثية الحالية نظام المعلومات (مشروع بحثي لا 5306-21220-004-00؛ ويدعم مصدر الضوء المتقدم من قبل مدير مكتب العلوم ومكتب الأساسية. علوم الطاقة، وزارة الطاقة في الولايات المتحدة بموجب العقد رقم DE-AC02-05CH11231)؛ وNIFA بحوث المحاصيل الاختصاص مبادرة منحة لAJM.

كتبت تفاصيل بروتوكول موضح أدناه خصيصا للعمل في beamline الضوء المتقدم 8.3.2 المصدر. قد تكون هناك حاجة للعمل تعديلات في مرافق السنكروترون أخرى. مطلوب السلامة المناسبة والتدريب للإشعاع استخدام هذه المرافق. 1. تحضير العينة للنباتات لايف ...

<ol>
	<li>Brodersen, C. R., McElrone, A. J., Choat, B., Matthews, M. A., Shackel, K. A. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/query.fcgi?db=PubMed&cmd=Search&doptcmdl=Citation&defaultField=Title+Word&term=The+dynamics+of+embolism+repair+in+xylem:+in+vivo+visualizations+using+high+resolution+computed+tomography.">The dynamics of embolism repair in xylem: in vivo visualizations using high resolution computed tomography.</a> Plant Physiology. 154, 1088-1095 (2010).</li><li>Brodersen, C. R., Lee, E., Choat, B., Jansen, S., Phillips, R. J., Shackel, K. A., McElrone, A. J., Matthews, M. A. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/query.fcgi?db=PubMed&cmd=Search&doptcmdl=Citation&defaultField=Title+Word&term=Automated+analysis+of+3D+xylem+networks+using+high+resolution+computed+tomography+(HRCT).">Automated analysis of 3D xylem networks using high resolution computed tomography (HRCT).</a> New Phytologist. 191 (4), 1168-1179 (2011).</li><li>Brodersen, C., Roark, L., Pittermann, J. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/query.fcgi?db=PubMed&cmd=Search&doptcmdl=Citation&defaultField=Title+Word&term=The+physiological+implications+of+primary+xylem+organization+in+two+ferns.">The physiological implications of primary xylem organization in two ferns.</a> Plant, Cell &amp; Environment. , (2012).</li><li>Brodersen, C., Choat, B., Chatelet, D., Shackel, K. A., Matthews, M. A., McElrone, A. J. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/query.fcgi?db=PubMed&cmd=Search&doptcmdl=Citation&defaultField=Title+Word&term=Conductive+xylem+bridges+contribute+differentially+to+radial+connectivity+in+grapevine+stems+(Vitis+vinifera+and+V.+arizonica).">Conductive xylem bridges contribute differentially to radial connectivity in grapevine stems (Vitis vinifera and V. arizonica).</a> American Journal of Botany. , (2012).</li><li>McElrone, A. J., Jackson, S., Habdas, P. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/query.fcgi?db=PubMed&cmd=Search&doptcmdl=Citation&defaultField=Title+Word&term=Hydraulic+disruption+and+passive+migration+by+a+bacterial+pathogen+in+oak+tree+xylem.">Hydraulic disruption and passive migration by a bacterial pathogen in oak tree xylem.</a> Journal of Experimental Botany. 59, 2649-2657 (2008).</li><li>McElrone, A. J., Grant, J., Kluepfel, D. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/query.fcgi?db=PubMed&cmd=Search&doptcmdl=Citation&defaultField=Title+Word&term=The+role+of+ethylene-induced+tyloses+in+canopy+hydraulic+failure+of+mature+walnut+trees+afflicted+with+apoplexy+disorder.">The role of ethylene-induced tyloses in canopy hydraulic failure of mature walnut trees afflicted with apoplexy disorder.</a> Tree Physiology. 30, 761-772 (2010).</li><li>Tyree, M., Sperry, J. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/query.fcgi?db=PubMed&cmd=Search&doptcmdl=Citation&defaultField=Title+Word&term=Vulnerability+of+xylem+to+cavitation+and+embolism.">Vulnerability of xylem to cavitation and embolism.</a> Annual Review of Plant Biology. 40 (1), 19-36 (1989).</li><li>Tyree, M., Zimmermann, M. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/query.fcgi?db=PubMed&cmd=Search&doptcmdl=Citation&defaultField=Title+Word&term=.">.</a> Xylem structure and the ascent of sap. , (2002).</li><li>Holbrook, N. M., Zwienieck, M. A. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/query.fcgi?db=PubMed&cmd=Search&doptcmdl=Citation&defaultField=Title+Word&term=.">.</a> Vascular Transport in Plants. , (2005).</li><li>Mayo, S. C., Chen, F., Evans, F. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/query.fcgi?db=PubMed&cmd=Search&doptcmdl=Citation&defaultField=Title+Word&term=Micron-scale+3D+imaging+of+wood+and+plant+microstructure+using+high-resolution+x-ray+phase-contrast+microtomography.">Micron-scale 3D imaging of wood and plant microstructure using high-resolution x-ray phase-contrast microtomography.</a> Journal of Structural Biology. 171, 182-188 (2010).</li><li>Mannes, D., Marone, F., et al. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/query.fcgi?db=PubMed&cmd=Search&doptcmdl=Citation&defaultField=Title+Word&term=Application+areas+of+synchrotron+radiation+tomographic+microscopy+for+wood+research.">Application areas of synchrotron radiation tomographic microscopy for wood research.</a> Wood Science and Technology. 44, 67-84 (2010).</li><li>Maeda, E., Miyake, H. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/query.fcgi?db=PubMed&cmd=Search&doptcmdl=Citation&defaultField=Title+Word&term=A+non-destructive+tracing+with+an+x-ray+micro+ct+scanner+of+vascular+bundles+in+the+ear+axes+at+the+base+of+the+lower+level+rachis-branches+in+japonica+type+rice+(oryza+sativa.">A non-destructive tracing with an x-ray micro ct scanner of vascular bundles in the ear axes at the base of the lower level rachis-branches in japonica type rice (oryza sativa.</a> Japanese Journal of Crop Science. 78 (3), 382-386 (2009).</li><li>Steppe, K., Cnudde, V., et al. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/query.fcgi?db=PubMed&cmd=Search&doptcmdl=Citation&defaultField=Title+Word&term=Use+of+x-ray+computed+microtomography+for+non-invasive+determination+of+wood+anatomical+characteristics.">Use of x-ray computed microtomography for non-invasive determination of wood anatomical characteristics.</a> Journal of Structural Biology. 148 (1), 11-21 (2004).</li><li>Zimmermann, M. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/query.fcgi?db=PubMed&cmd=Search&doptcmdl=Citation&defaultField=Title+Word&term=Dicotyledonous+wood+structure+(made+apparent+by+sequential+sections).">Dicotyledonous wood structure (made apparent by sequential sections).</a> Encyclopaedia Cinematographica. , (1971).</li><li>Lee, E. F., Brodersen, C. R., McElrone, A. J., et al. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/query.fcgi?db=PubMed&cmd=Search&doptcmdl=Citation&defaultField=Title+Word&term=Analysis+of+HRCT-derived+xylem+network+reveals+reverse+flow+in+some+vessels.">Analysis of HRCT-derived xylem network reveals reverse flow in some vessels.</a> , (2013).</li><li>McDowell, N. G., Pockman, W. T., et al. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/query.fcgi?db=PubMed&cmd=Search&doptcmdl=Citation&defaultField=Title+Word&term=Mechanisms+of+plant+survival+and+mortality+during+drought:+why+do+some+plants+survive+while+others+succumb.">Mechanisms of plant survival and mortality during drought: why do some plants survive while others succumb.</a> New Phytologist. 178, 719-739 (2008).</li><li>McElrone, A. J., Brodersen, C. R., et al. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/query.fcgi?db=PubMed&cmd=Search&doptcmdl=Citation&defaultField=Title+Word&term=Centrifuge+technique+consistently+overestimates+vulnerability+to+water-stress+induced+cavitation+in+grapevines+as+confirmed+with+high+resolution+computed+tomography.">Centrifuge technique consistently overestimates vulnerability to water-stress induced cavitation in grapevines as confirmed with high resolution computed tomography.</a> New Phytologist. , (2012).</li><li>Lee, K., Avondo, J., et al. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/query.fcgi?db=PubMed&cmd=Search&doptcmdl=Citation&defaultField=Title+Word&term=Visualizing+plant+development+and+gene+expression+in+three+dimensions+using+optical+projection+tomography.">Visualizing plant development and gene expression in three dimensions using optical projection tomography.</a> Plant Cell. 18, 2145-2156 (2006).</li><li>Truernit, E., Bauby, H., et al. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/query.fcgi?db=PubMed&cmd=Search&doptcmdl=Citation&defaultField=Title+Word&term=High-resolution+whole-mount+imaging+of+three-dimensional+tissue+organization+and+gene+expression+enables+the+study+of+phloem+development+and+structure+in+Arabidopsis.">High-resolution whole-mount imaging of three-dimensional tissue organization and gene expression enables the study of phloem development and structure in Arabidopsis.</a> Plant Cell. 20, 1494-1503 (2008).</li><li>Jahnke, S., Menzel, M. I., et al. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/query.fcgi?db=PubMed&cmd=Search&doptcmdl=Citation&defaultField=Title+Word&term=Combined+MRI-PET+dissects+dynamic+changes+in+plant+structures+and+functions.">Combined MRI-PET dissects dynamic changes in plant structures and functions.</a> The Plant Journal. 59, 634-644 (2009).</li><li>Iyer-Pascuzzi, A. S., Symonova, O., et al. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/query.fcgi?db=PubMed&cmd=Search&doptcmdl=Citation&defaultField=Title+Word&term=Imaging+and+analysis+platform+for+automatic+phenotyping+and+trait+ranking+of+plant+root+systems.">Imaging and analysis platform for automatic phenotyping and trait ranking of plant root systems.</a> , (2010).</li></ol>

Synchotron HRCT يقدم علماء الأحياء النباتية مع أداة قوية غير مدمرة، لاستكشاف ما يدور بداخل الأوعية الدموية محطة بالتفصيل لا يصدق. وقد استخدمت هذه التكنولوجيا مؤخرا لتحديد الهياكل التشريحية لم يسبق وصفه في الخشب الكرمة التي تغير تفاضلي الخشب اتصال الشبكة في مختلف أنواع الع...

ويتم نقل المياه من جذور النباتات إلى الأوراق في الأنسجة الوعائية ودعا الخشب - شبكة من خطوط الأنابيب مترابطة، والألياف، وعملية الأيض نشطة الخلايا الحية. يجب الحفاظ على وظيفة نقل الخشب مصنع لتوريد المواد الغذائية والمياه إلى أوراق لعملية التمثيل الضوئي والنمو والبقاء في نهاية المطاف. يمكن أن تتعطل النقل المائي في قنوات الخشب عندما يتم اختراق شبكة عن طريق الخشب الكائنات المسببة للأمراض. ردا على النباتات الإصابات غالبا ما تنتج هذه المواد الهلامية، واللثة، وtyloses كوسيلة لعزل انتشار العوامل المسببة للأمراض (مثل McElrone وآخرون 2008؛ 2010). يمكن الضغط الجفاف أيضا إلى الحد من نقل المياه في الخشب. كما تفقد النباتات الماء خلال الجفاف الذي طال أمده، والتوتر يبني في SAP الخشب. المياه تحت التوتر هو متبدل الاستقرار (أي في عتبة معينة التوتر يصبح التجويف كبيرة بما يكفي لأعمدة المياه الواردة في قنوات الخشب). بعد التجويف يحدث، يمكن للفقاعة الغاز (الانسداد) تشكيل وملء كوندUIT، ومنع بشكل فعال حركة المياه (Tyree وسبيري 1989)، وهي ظاهرة مشابهة لمرض الضغط (أي &quot;ينحني&quot;) في أعماق البحار الغواصين. على الرغم من أهمية المياه النقل الخشب مصنع لوظيفة الأمثل كما هو موضح من قبل هيئة واسعة من المؤلفات التاريخية والمعاصرة حول هذا الموضوع (Tyree وزيمرمان، 2002؛ هولبروك وآخرون، 2005)، لا تزال هناك جوانب شبكات الخشب التي لا تزال بعيدة المنال . وقد بدأت العديد من المجموعات البحثية مؤخرا باستخدام عالية الجودة الأشعة السينية التصوير المقطعي المحوسب الدقيقة (HRCT) لتقييم التفاصيل الدقيقة للتشريح الخشب والأنسجة الوعائية (مثل مايو كلينيك وآخرون؛ 2010، 2008؛ Mannes وآخرون 2010؛ برودرسن وآخرون 2010. ، 2011، 2012a، ب؛ مايدا ومياكي، 2009؛ السهوب وآخرون 2004). HRCT هي تقنية تستخدم لتصور غير تدميري الميزات في الداخل من الأجسام الصلبة والحصول على معلومات رقمية على خصائص 3-D على الهيكلية. HRCTيختلف عن التقليدية الطبية مسح-CAT في قدرتها على حل تفاصيل صغيرة مثل ميكرون في الحجم، حتى بالنسبة للكائنات ذات الكثافة العالية. وقد تحسنت التطورات الحديثة في تكنولوجيا HRCT السنكروترون دقة وضوح الصورة وإشارة إلى نسبة الضوضاء حتى بما فيه الكفاية أن شبكات اتصالات سفينة النباتية وintervessel يمكن تصور، تعيين إحداثيات 3D، وتصديرها لنماذج المحاكاة الهيدروليكية. برودرسن وآخرون (2011) تقدمت مؤخرا هذه التقنية من خلال الجمع بين عمليات إعادة البناء التي تم إنشاؤها بواسطة 3D HRCT السنكروترون مع نموذج فورتران الذي يستخرج البيانات تلقائيا من الشبكة الخشب في قرار أعلى بكثير من أي وقت مضى كان ممكنا بالوسائل التشريحية التقليدية (أي تقطيع المسلسل مع مشراح والتقاط الصور مع المجهر الضوئي، على سبيل المثال زيمرمان 1971). كما تم استخدام هذا العمل لتحسين النماذج الهيدروليكية لنظام الخشب وتحديد الخصائص الفريدة للنقل (أي التدفق العكسي في بعض هاءssels خلال فترات الذروة من النتح) (لي وآخرون، في الاستعراض). ويمكن الآن أن تستخدم السنكروترون HRCT لتصور وظيفة الخشب، القابلية للالتجويف، وقدرة النباتات على اصلاح قنوات embolized. الفشل في إعادة التدفق في قنوات embolized يقلل القدرة الهيدروليكية، والتمثيل الضوئي حدود، والنتائج في موت النباتات في الحالات القصوى (ماكدويل وآخرون 2008). يمكن للنباتات التعامل مع الصمات من خلال تحويل المياه حول انسداد قنوات الاتصال عبر حفر الوظيفية المجاورة، والتي تنمو جديدة لتحل محل الخشب القدرة الهيدروليكية المفقودة. بعض النباتات تمتلك القدرة على إصلاح فواصل الأعمدة في الماء، ولكن تفاصيل هذه العملية في الخشب تحت التوتر ظلت غير واضحة على مدى عقود. برودرسن وآخرون (2010) تصور مؤخرا وكميا عملية إعادة تعبئتها في الكرمة الحية باستخدام HRCT. كان ناجحا السفينة تعتمد على تدفق إعادة تعبئة المياه من الخلايا الحية المحيطة xylأجبرت قنوات م، حيث قطرات الماء الفردية توسعت مع مرور الوقت، والأوعية شغلها، وتفكك الغاز شرك. يتم حاليا قدرة النباتات المختلفة لإصلاح السفن للخطر والخشب آليات السيطرة على هذه الإصلاحات التي يجري التحقيق فيها. وصف للمرفق ALS Beamline 8.3.2 وقد أجريت عملنا حتى الآن على Beamline الصلب الصغرى، التصوير المقطعي بالأشعة السينية 8.3.2 في مصدر الضوء متقدمة في مختبر لورانس بيركلي الوطني (بيركلي CA USA). توضع العينات النباتية في قفص متر الرصاص مبطنة 20 يقع من مصدر الأشعة السينية، التي تم إنشاؤها بواسطة مغناطيس فائق التوصيل تسلا 6 منحنى ثنائي القطب في مصدر الضوء المتقدم التشغيل الإلكترون خاتم تخزين الطاقة الحرجة في قدرها 11.5 كيلو. ويرد التخطيطي لمحطة النهاية في الشكل 1. والأشعة السينية يدخل القفص مع حجم 40X شعاع من ~ 4.6 ملم وتمر من خلال العينة التي يتم تركيبه على آلية المرحلة الدورية. الالمنقولة الأشعة السينية تؤثر على ماض الكريستال (اثنان المواد المستخدمة شيوعا هي LuAG أو CdWO 4) التي تحول الأشعة السينية إلى الضوء المرئي التي يتم ترحيل عبر العدسات في الصعود إلى CCD لجمع الصور. وترد الكاميرا، وماض والبصريات في مربع ضيق الضوء الذي هو على القضبان التي تسمح ليكون الأمثل المسافة عينة إلى ماض للتصوير النقيض المرحلة. هي التي شنت جميع العينات على المسرح بقطر 10 سم الدوارة والتي بدورها هي التي شنت على مراحل الترجمة الأفقي والرأسي لتحديد المواقع العينة. ويمكن الاطلاع على عينة النباتية الحية، مع نظام الجذر التي تقام في بناء مصنع مخصص عاء حامل وأوراق الشجر الواردة في أنبوب الاكريليك، في الشكل 2. يمكن التعرض مرات نموذجية تتراوح 1-0،1 ثانية باستخدام 10-18 كيلو، وفترات الفحص وتتراوح 5-40 دقيقة اعتمادا على إعدادات الأمثل لعينة معينة. لعينات طويل القامة (نموذجي من الخشب المصنع الشبكات)، ويمكن مسح البيانات تكونمبلطة بتكرار القياس مع العينة على ارتفاعات مختلفة، والتي يتم التحكم تلقائيا، مما يتيح أقسام المسلسل سلس جنبا إلى جنب على ارتفاع الحد الأقصى لعينة 10 سم ~. أقصى عرض عينة عند التصوير في القرار ميكرومتر ~ 4.5 هو 1 سم للعينات التي هي مثالية تقريبا في اتجاه رأسي. اكتمال البيانات وتجهيز جيل باستخدام بروتوكول المذكورة أدناه. بسبب الفرق في توهين الأشعة السينية بين الهواء والماء، يمكن الحصول على تباين الصورة ممتازة في النباتات دون استخدام الحلول النموذجية النقيض من نظم CT الطبية. التجويف سفينة مليئة بالهواء يمكن تمييزها بسهولة من الأنسجة المحيطة مملوءة بالماء في النباتات المائية.

<table border="1">
 <tbody>
 <tr>
 <td>Material Name/Equipment </td>
 <td>Company</td>
 <td>Catalogue Number</td>
 <td>Comments (optional)</td>
 </tr>
 <tr>
 <td></td>
 <td></td>
 <td></td>
 <td>See specifics listed above regarding equipment at the Advanced Light Source beamline 8.3.2</td>
 </tr>
 </tbody>
</table>

using high resolution computed tomography to visualize the three dimensional structure and function of plant vasculature

عالية الدقة الأشعة السينية التصوير المقطعي (HRCT) هو غير مدمرة تقنية التصوير التشخيصي مع القدرة على القرار شبه ميكرون التي يجري الآن استخدامها لتقييم بنية ووظيفة شبكة الخشب المصنع في ثلاثة أبعاد (3D) (على سبيل المثال برودرسن وآخرون . عام 2010؛ 2011؛ ​​2012a، ب). ويستند HRCT التصوير على نفس المبادئ نظم CT الطبية، ولكن النتائج ارتفاع كثافة السنكروترون مصدر الأشعة السينية في دقة أعلى المكانية وانخفض الصورة اكتساب الوقت. هنا، علينا أن نبرهن بالتفصيل كيف السنكروترون القائم الذي يتم استخدامه HRCT (أجريت في بيركلي المصدر، LBNL الضوء المتقدم، CA، الولايات المتحدة الأمريكية) بالاشتراك مع برنامج Avizo (VSG شركة، برلنغتون، MA، الولايات المتحدة الأمريكية) لاستكشاف الخشب المصنع في رفعه الأنسجة والنباتات الحية. هذه الأداة تتيح للمستخدمين تصوير جديدة لتجاوز التقليدية الخفيفة، ثابت 2D أو micrographs الإلكترون وعينات الدراسة باستخدام مقاطع مسلسل الظاهري في أي طائرة. عدد لا حصر له من شرائح في أي اتجاه جيتم إجراء على نفس العينة، وهي الميزة التي من المستحيل جسديا باستخدام أساليب المجهر التقليدية. النتائج تظهر التي يمكن تطبيقها على كل من HRCT العشبية والنباتات الخشبية، ومجموعة من أجهزة النبات (أوراق أي أعناق، وينبع، جذوع وجذور). الأرقام الواردة هنا مساعدة في توضيح كل مجموعة من النباتات التشريح ممثل الأوعية الدموية ونوع من التفاصيل المستخرجة من قواعد البيانات HRCT، بما في ذلك المسح الضوئي للساحل الخشب الأحمر (سيكويا sempervirens)، والجوز (جاجلانس النيابة.)، والبلوط (البلوط SPP)، والقيقب ( شتلات شجرة أيسر النيابة.) لعباد الشمس (هيليانثوث)، الكرمة (كرمة SPP)، والسراخس (Pteridium aquilinum والخملية Woodwardia). عينات رفعه وتجفيفها من الأنواع الخشبية هي أسهل لمسح وتسفر عادة أفضل الصور. ومع ذلك، فقد جعلت التحسينات الأخيرة (أي أكثر سرعة المسح الضوئي والاستقرار عينة) من POSSible لاستخدام هذه التقنية التصور على الأنسجة الخضراء (مثل أعناق) والنباتات الحية. في بعض الأحيان فإن بعض انكماش الأنسجة النباتية الخضراء رطب تسبب طمس الصور إلى وسائل لتجنب وصفها هذه القضايا. هذه التطورات الأخيرة مع HRCT تقديم رؤى جديدة واعدة في وظائف الاوعية الدموية النبات.

تم مسح Synchotron HRCT تنفيذها بنجاح على مجموعة واسعة من الأنسجة النباتية والأنواع باستخدام beamline 8.3.2 (الشكل 5)، وقدمت أفكارا جديدة في بنية ووظيفة الخشب المصنع في قرار لم يسبق له مثيل في 3D. قدرات التصور والتنقيب التي قدمتها اعادة البناء 3D (كما هو موضح في الأرقام 6-8...

Watch this Scientific Journal Video about Using High Resolution Computed Tomography to Visualize the Three Dimensional Structure and Function of Plant Vasculature at JoVE.com

Using High Resolution Computed Tomography to Visualize the Three Dimensional Structure and Function of Plant Vasculature

عالية الدقة الأشعة السينية التصوير المقطعي (HRCT) هو غير مدمرة تقنية التصوير التشخيصي التي يمكن استخدامها لدراسة بنية ووظيفة الأوعية الدموية النباتية في 3D. نحن لشرح كيفية HRCT يسهل استكشاف شبكات الخشب عبر مجموعة واسعة من الأنسجة النباتية والأنواع.

باستخدام التصوير المقطعي عالي الدقة لتصور البنية الثلاثية وظيفة الأوعية الدموية النباتية

High resolution x-ray computed tomography (HRCT) is a non-destructive diagnostic imaging technique with sub-micron resolution capability that is now being ...

Research

Education

JoVE Journal

JoVE Core

Biology

Plant Biology

Plant Structure, Growth, and Nutrition

SCIENTISTS IN ACTION

Hi-C: A Method to Study the Three-dimensional Architecture of Genomes.

مرحبا - C : طريقة لدراسة الهندسة المعمارية ثلاثي الأبعاد للخريطة جينوم.

The three-dimensional folding of chromosomes compartmentalizes the genome and and can bring distant functional elements, such as promoters and enhancers, ...

Functional Reconstitution and Channel Activity Measurements of Purified Wildtype and Mutant CFTR Protein

إعادة إعماره الوظيفية وآخر قناة قياسات تنقية Wildtype والمسخ CFTR البروتين

The Cystic Fibrosis Transmembrane Conductance Regulator (CFTR) is a unique channel-forming member of the ATP Binding Cassette (ABC) superfamily of ...

High Resolution Quantification of Crystalline Cellulose Accumulation in Arabidopsis Roots to Monitor Tissue-specific Cell Wall Modifications

High Resolution Quantification of Crystalline Cellulose Accumulation in Arabidopsis Roots to Monitor Tissue-specific Cell Wall Modifications

قرار الكمي عال من بلوري السليلوز تراكم في<em&gt; نبات الأرابيدوبسيس</em&gt; جذور لرصد الأنسجة محددة جدار الخلية تعديلات

Plant cells are surrounded by a cell wall, the composition of which determines their final size and shape. The cell wall is composed of a complex matrix ...

High-resolution Respirometry to Assess Mitochondrial Function in Permeabilized and Intact Cells

عالية الدقة قياس التنفس لتقييم وظيفة الميتوكوندريا في Permeabilized وخلايا سليمة

A high-resolution oxygraph is a device for measuring cellular oxygen consumption in a closed-chamber system with very high resolution and sensitivity in ...

Sample Preparation and Imaging of Exosomes by Transmission Electron Microscopy

نموذج إعداد وتصوير اكسوسوميس مجهر إلكتروني

Exosomes are nano-sized extracellular vesicles secreted by body fluids and are known to represent the characteristics of cells that secrete them. The ...

High-resolution Respirometry to Measure Mitochondrial Function of Intact Beta Cells in the Presence of Natural Compounds

ريسبيروميتري عالية الدقة لقياس الوظيفة المتقدرية سليمة من خلايا بيتا حضور المركبات الطبيعية

High-resolution respirometry allows for the measurement of oxygen consumption of isolated mitochondria, cells and tissues. Beta cells play a critical role ...

Analysis of Beta-cell Function Using Single-cell Resolution Calcium Imaging in Zebrafish Islets

تحليل وظيفة خلايا بيتا باستخدام تصوير الكالسيوم القرار خلية واحدة في الجزيرات الزرد

Pancreatic beta-cells respond to increasing blood glucose concentrations by secreting the hormone insulin. The dysfunction of beta-cells leads to ...

Adipo-Clear: A Tissue Clearing Method for Three-Dimensional Imaging of Adipose Tissue

أديبو--واضحة: منديل مسح طريقة لتصوير ثلاثي الأبعاد للأنسجة الدهنية

Adipose tissue plays a central role in energy homeostasis and thermoregulation. It is composed of different types of adipocytes, as well as adipocyte ...

Single-Cell Resolution Three-Dimensional Imaging of Intact Organoids

وحيد الخلية القرار التصوير ثلاثي الأبعاد من organoids سليمة

Organoid technology, in vitro 3D culturing of miniature tissue, has opened a new experimental window for cellular processes that govern organ development ...

Assessment of Global Ocular Structure Following Spaceflight Using a Micro-Computed Tomography (Micro-CT) Imaging Method

Assessment of Global Ocular Structure Following Spaceflight Using a Micro-Computed Tomography Micro-CT Imaging Method

تقييم الهيكل العالمي للرّيّة بعد الرحلات الفضائية باستخدام طريقة التصوير المقطعي المحوسبة الدقيقة (الدقيقة CT)

Reports show that prolonged exposure to a spaceflight environment produces morphologic and functional ophthalmic changes in astronauts during and after an ...