Name: diffusion tensor magnetic resonance imaging in the analysis of neurodegenerative diseases
Uploaded: 2013-07-28T14:00:00
Description: Watch this Scientific Journal Video about Diffusion Tensor Magnetic Resonance Imaging in the Analysis of Neurodegenerative Diseases at JoVE.com

Delar av detta arbete, dvs studiet av QC och korrigering för skadade lutning riktningar i ansökan till data från patienter med hyperkinetiska störningar, stöddes av Europeiska HD nätverket (EHDN projekt 070). De MRT i denna viss studie förvärvades som en del av London webbplatsen TRACK-HD kohorten.

Analysmetoder: Pre-och efterbehandling Uppgiften för följande protokoll är att analysera diffusionsegenskaper voxelwise inom vita substans som kan vara - på grund av voxelwise upptäckt - antingen isotropa eller anisotropa, vilket resulterar i prolate eller oval diffusion spännare för respektive voxlarna. Parametrering av voxeln spännare används antingen för beräkning av FA-kartor eller identifiering av fibertracts (figur 1). För att erh...

Inter-föremål utjämning av DTI data kan uppnås med avseende på diffusion amplitud (genom användning av FA information) och diffusion riktning (baserat på FT), respektive. Medelvärde av FA kartor möjliggör statistisk jämförelse av ämnesgrupper från WBSS och TFAs. Denna metodologiska ramverk ger en introduktion till DTI tekniker med inter-ämne medelvärdesbildning och grupp jämförelse. Stereotaxic normalisering och jämförelse av FA kartor på gruppnivå medger flera möjligheter att kvantifiera skillnad...

Diffusion tensor imaging i den mänskliga hjärnan Den vita substansen (WM) skrifter i det centrala nervsystemet består av tätt packade axoner förutom olika typer av neuroglia och andra små populationer av celler. Den axonal membran liksom de väl löpande fiber protein inom en axon begränsar vinkelrät vattendiffusion till fiberorienteringen, vilket leder till anisotropisk vatten diffusion i hjärnan WM 1. Myelinskidor runt axoner kan också bidra till anisotropi för både intra-och extracellulära vatten 2. Den kvantitativa beskrivningen av denna anisotropi kunde detekteras genom diffusion tensor imaging (DTI). DTI ger bilder av vävnader viktas med de lokala mikrostrukturella egenskaper vatten diffusion. Bilden-intensiteter vid varje position dämpas, beroende på styrkan och riktningen av den så kallade magnetiska diffusionsgradient (representerad ib-värde), såväl som på den lokala mikrostruktur i vilken vattenmolekylerna diffunderar 3, diffusionskoefficienten D, ett skalärt värde: <img alt="Ekvation 1" fo:src="/files/ftp_upload/50427/50427eq1highres.jpg" src="/files/ftp_upload/50427/50427eq1.jpg" /> Men i närvaro av anisotropi i WM, kan diffusion inte längre präglas av ett enda skalär koefficient, men kräver en tensor <img alt="Ekvation 3" fo:src="/files/ftp_upload/50427/50427eq3highres.jpg" src="/files/ftp_upload/50427/50427eq3.jpg" /> som i första approximation beskriver molekylär rörlighet längs varje riktning och korrelationen mellan dessa riktningar 4. Diffusion anisotropi orsakas främst av orienteringen av fiberområden i WM och påverkas av sin mikro-och makrostrukturella funktioner. Av de mikrostrukturella egenskaper, förefaller intraaxonal organisation vara av störst betydelse för diffusion anisotropi, förutom densitet fiber ennd cell packning, grad av myelination och enskild fiber diameter. På en makroskopisk skala, påverkar variationen i orienteringen av alla WM skrifter i en avbildning voxeln dess grad av anisotropi 5. I typiska DTI mätningar, voxeln mått är i storleksordningen millimeter. Således innehåller en voxel alltid den genomsnittliga uppgifter av vattenmolekyler inuti detekterade volym som oftast omfattar flera axoner samt omgivande vattenmolekyler. Trots denna flera riktningar miljö är DTI känslig för orienteringen av största huvudaxel som ligger i linje till den dominerande axonal riktning, dvs axonal bidrag dominerar den uppmätta signalen 2. DTI erbjuder två typer av information om fastigheten för vatten diffusion: första, orientering-oberoende grad av diffusion anisotropi 5 och den andra, den dominerande inriktningen av vatten diffusion i image voxels, dvs diffusion orientering 6. De nuvarande protokoll är tänkta att ge en ram för DTI analys tekniker för kvantitativ jämförelse av ämnesgrupper på gruppnivå, som beskrivs i det följande. Kvantifiering av diffusionsegenskaper - analysparametrar De delar av den symmetriska tensor kan mätas genom diffusions gradienter längs åtminstone sex icke-kolinjära och icke-samma plan riktningar så att b (ekvation 1) har blivit en tensor, vilket resulterar i signaldämpning <img alt="Ekvation 2" fo:src="/files/ftp_upload/50427/50427eq2highres.jpg" src="/files/ftp_upload/50427/50427eq2.jpg" /> Denna ekvation kräver redovisning av eventuella interaktioner mellan avbildning och gradienter spridning som tillämpas i vinkelräta riktningar (kors termer) och även mellan avbildning gradienter som tillämpasi ortogonala riktningar 4. Den näst-rank diffusionstensoren <img alt="Ekvation 3" fo:src="/files/ftp_upload/50427/50427eq3highres.jpg" src="/files/ftp_upload/50427/50427eq3.jpg" /> kan alltid diagonaliseras lämnar endast tre icke-noll element utmed huvuddiagonalen av tensor, dvs egenvärdena ( <img alt="Ekvation 4" fo:src="/files/ftp_upload/50427/50427eq4highres.jpg" src="/files/ftp_upload/50427/50427eq4.jpg" /> ). Egenvärdena återspegla formen eller konfigurationen av ellipsoiden. Den matematiska förhållandet mellan den huvudsakliga koordinaterna för ellipsoiden och laboratoriet ram beskrivs av egenvektorerna <img alt="Ekvation 5" fo:src="/files/ftp_upload/50427/50427eq5highres.jpg" src="/files/ftp_upload/50427/50427eq5.jpg" /> Eftersom det finns flera utmaningar visning tensor uppgifter, har begreppet diffusion ellipsoids föreslagits 3. De Eigendiffusivities av dessa ellipsoids representerar de endimensionella diffusionskoefficienterna i den huvudsakliga inriktningen av diffusiviteter av mediet, dvs huvudaxel ellipsoiden representerar den huvudsakliga diffusion riktning i voxel som sammanfaller med riktningen för fibrerna, medan excentriciteten hos ellipsoiden ger information om grad av anisotropi och dess symmetri. Därför kunde diffusion anisotropi variabler som till exempel fraktionerad anisotropi (FA) definieras 7. <img alt="Ekvation 6" fo:src="/files/ftp_upload/50427/50427eq6highres.jpg" src="/files/ftp_upload/50427/50427eq6.jpg" /> <img alt="Ekvation 7" fo:src="/files/ftp_upload/50427/50427eq7highres.jpg" src="/files/ftp_upload/50427/50427eq7.jpg" /> är det aritmetiska medelvärdet av alla Egenvärden. En ytterligare metod är att använda den huvudsakliga inriktningen av diffusionstensoren att ta itu med WM-anslutning av hjärnan, som svarar mot tractography approalm som har för avsikt att undersöka vilka delar av hjärnan är anslutna till varandra. Med antagande av att orienteringen av huvudkomponenten i diffusionstensoren representerar orienteringen av de dominerande axonala skrifter, är en 3-D vektorfältet tillhandahålls där varje vektor representerar fiberorienteringen. För närvarande finns det flera olika metoder för att rekonstruera WM områden som kan delas in i två typer: den första kategorin bygger på algoritmer line förökning med hjälp av lokala tensor för varje steg av fibern tarmkanalen förökning 2,8,9. Den andra kategorin är baserad på global energiminimering att hitta det energimässigt mest gynnsamma vägen mellan två WM regionerna, vilket resulterar i den strategi för tarmkanalen-baserade spatial statistik (TBSS) 10, som har använts i andra algoritmer såsom tractwise fraktionerad anisotropi statistik (TFAs - se protokoll text, avsnitt 2.4).. Omvandling till stereotaxic stativard utrymme Liksom i andra avancerade MR metoder, DTI-och FT-baserade studier i ett kliniskt sammanhang fullfölja det slutliga målet att kategorisera enskilda patientens hjärna morfologi för att underlätta den diagnostiska processen baserat på någon diskriminering metric 11. Studier på gruppnivå är mest relevant om den gemensamma kliniska fenotypen är tänkt att vara på grund av skada på ett eller flera specifika områden i hjärnan eller en specifik neuroanatomisk nätverk. Här, i genomsnitt av resultaten för olika ämnen är användbar för att bedöma gemensamma mönster av mikrostrukturella förändringar. Varje enskild hjärna måste överföras till stereotaktisk utrymme så att, i ett andra steg, det aritmetiska medelvärdet av resultaten på en Voxel-för-Voxel nivå är möjlig. Spatial normalisering tillåtet för aritmetisk medelvärdesbildning av de resultat som erhållits från olika ämnen för att förbättra signal-till-brusförhållandet (SNR) och för att göra en jämförelse av prover av patienter och fortsRols för att analysera den beräkningsmässiga pathoanatomy av en specifik störning, t.ex. en neurodegenerativ sjukdom som är associerad med att stödet påverkar ett specifikt hjärnsystemet. Den tidiga tillvägagångssätt normalisering till en standardiserad stereotaktisk utrymme med 12 föreslog en omvandling algoritm för att en vanlig kartbok innefattar identifikation av olika hjärnan landmärken och styckevis uppskalning av hjärnan kvadranter. Numera är de flesta av de avancerade MRI dataanalys paket använda normalisering till Montreal neurologiska institutet (MNI) stereotaktisk utrymme 13. För denna omvandling var halvautomatiska och automatiska hjärnan registrering algoritmer använder studera specifika mallar utvecklade 14,15. I DTI, har särskild uppmärksamhet dras för att bevara den riktade informationen under normaliseringsprocessen 16,17. Tillämpningen av rumsliga transformationer till DT-MR-bilder som krävs för rumslig normaliseringav samlingar av dataset är, i motsats till bilder skevhet skalära, kompliceras av det faktum att DTs innehåller orienterande informationen som återigen påverkas av transformation. Denna effekt måste redovisas för att säkerställa den anatomiska riktigheten i den transformerade bilden. Här är tekniker för att tillämpa affina transformationer till DTI dataset presenteras. Tillämpning av DTI till hjärnsjukdomar Jämförelsen av longitudinella DTI uppgifter krävs en anpassning / registrering av ett föremål data mellan varandra. I detta sammanhang är bevarandet av den riktade information som krävs (dvs. rotation av diffusionstensoren under affina transformationer). Möjliga tillämpningar till neurodegenerativa sjukdomar har rapporterats tidigare (t.ex. 18,19). DTI har etablerats som en robust non-invasiv tekniska verktyg för att undersöka in vivo Neuropatholnik för WM neuronala skrifter (t.ex. 11,20,21,22). DTI-baserade kvantitativa mått på diffusion process, t.ex. FA, har redan visat sig vara känsliga markörer för att studera ett brett spektrum av WM sjukdomar, såsom stroke 20, multipel skleros 23, amyotrofisk lateralskleros 24, 25, Alzheimers sjukdom 26 , och flera andra WM störningar 27,28. Dessutom kan DTI med FT användas för att identifiera WM skrifter 23. Denna teknik, men ändå inte i rutinmässig klinisk användning, framstår som ett kraftfullt instrument för bedömning av väg-specifika avvikelser i neurologisk sjukdom. Inom de identifierade områden, olika kvantitativa MRI index härrör från DTI och ytterligare förvärv (t.ex. T2-viktade bilder och / eller magnetiseringsöverföring (MT) imaging) som är anatomiskt coregistered till DTI uppgifterna kunde mätas. Härigenom skulle varje index vara calculpade som en funktion av position inom området, med hänvisning till tomter som skildrar deras rumsliga variation som tarmkanalen profiler. I det följande humana DTI genomsökningar som utfördes på 1,5 Tesla MR-skannrar (Siemens Medical, Erlangen, Tyskland) användes för att undersöka möjligheterna för olika analystekniker för detektering vita substansen avvikelser i patientgrupper samt hos individer. Efter en automatisk kvalitetskontroll för eliminering av rörelse-korrupta volymer och volymer med andra typer av artefakter, standardiserade efterbearbetningsåtgärder förfaranden förbereda DTI data för rad analys. Olika analyser metoder kommer att belysas i det följande, dvs första, hela hjärnan baserad spatial statistik (WBSS), andra, FT, och tredje, Tractwise fraktionerad statistik anisotropi (TFAs). WBSS är en metod som körs i analogi med Voxel-baserad morfometri (VBM) som brukar kallas voxel-baserad morfometri / statistik på DTI uppgifter (VBM / DTI) <em&gt;. VBM är en metod som ursprungligen körs på kontrastrika bilder där kontrastmedel olikheter i enskilda skanningar måste lösas medan WBSS är en metod som använder voxelwise jämförelse av en fysikalisk parameter. Därför, även algoritmiskt liknande, kommer en terminologi som är att skilja WBSS och VBM användas i det följande.

<table border="1">
 <tbody>
 <tr>
 <td>MR scanner</td>
 <td></td>
 <td></td>
 <td>Siemens 1.5 T Magnetom Symphony</td>
 </tr>
 <tr>
 <td>analysis software </td>
 <td></td>
 <td></td>
 <td>TIFT - Tensor Imaging and Fiber Tracking</td>
 </tr>
 </tbody>
 </table>

diffusion tensor magnetic resonance imaging in the analysis of neurodegenerative diseases

Diffusion tensor imaging (DTI) teknik ger information om de mikrostrukturella processer i vit hjärnvävnad (WM) in vivo. Föreliggande program är utformade för att undersöka skillnader i WM engagemang mönster i olika hjärnsjukdomar, speciellt neurodegenerativa sjukdomar genom användning av olika DTI analyser jämfört med matchade kontroller. DTI dataanalys utförs i en variate mode, dvs voxelwise jämförelse av regionala diffusion riktning-baserade mätmetoder såsom fraktionerad anisotropi (FA), tillsammans med fiber spårning (FT) åtföljs av tractwise fraktionerad anisotropi statistik (TFAs) på gruppnivå i syfte att identifiera skillnader i FA längs WM strukturer, som syftar till definitionen av regionala mönster WM förändringar på gruppnivå. Omvandling till en stereotaktisk standard utrymme är en förutsättning för gruppens studier och kräver noggranna databehandling för att bevara directional inter-beroenden. De aktuella ansökningarna visar optimerade tekniska metoder för bevarande av kvantitativa och riktad information under rumslig normalisering i dataanalyser på gruppnivå. På denna grundval, kan FT tekniker tillämpas på koncernen var i genomsnitt data för att kvantifiera mått uppgifter enligt definitionen i FT. Dessutom tillämpningen av DTI metoder, det vill säga skillnader i FA-kartorna efter stereotaktisk inriktning, i en longitudinell analys på en individ basis avslöja information om utvecklingen av neurologiska sjukdomar. Ytterligare förbättringar av kvaliteten på DTI-baserade resultat kan erhållas vid förbehandling genom tillämpning av en kontrollerad eliminering av lutning riktningar med höga bullernivåer. Sammanfattningsvis är DTI används för att definiera en tydlig WM pathoanatomy av olika hjärnsjukdomar genom kombinationen av hela hjärnan-baserade och tarmkanalen-baserade DTI analys.

Ett. QC och korrigering för skadade lutning riktningar i ansökan till data från patienter med hyperkinetiska störningar Som ett exempel för effekten av tillämpningen av QC och efterföljande volymavskiljningsmedel (som en följd av korrigeringen för skadade GD), visar figur 8 skillnader i hela hjärnan baserade spatial statistik med och utan volymavskiljningsmedel för grupp jämförelse av 29 premanifest Huntingtons sjukdom försökspersoner vs 30 ålder och kön matcha...

Watch this Scientific Journal Video about Diffusion Tensor Magnetic Resonance Imaging in the Analysis of Neurodegenerative Diseases at JoVE.com

Diffusion Tensor Magnetic Resonance Imaging in the Analysis of Neurodegenerative Diseases

Diffusion tensor imaging (DTI) fungerar i princip som en MR-baserat verktyg för att identifiera<em&gt; In vivo</em&gt; Mikrostrukturen av hjärnan och patologiska processer till följd av neurologiska sjukdomar inom vit hjärnvävnad. DTI-baserade analyser möjliggör ansökan till hjärnsjukdomar både på koncernnivå och i fristående uppgifter.

Diffusion Tensor Magnetic Resonance Imaging i Analys av neurodegenerativa sjukdomar

Diffusion tensor imaging (DTI) techniques provide information on the microstructural processes of the cerebral white matter (WM) in vivo. The present ...

Research

JoVE Journal

Medicine

Magnetic Resonance Derived Myocardial Strain Assessment Using Feature Tracking

Magnetic Resonance Härledda Myocardial Sila Uppskattning med hjälp av funktionen Spåra

Purpose: An accurate and practical method to measure parameters like strain in myocardial tissue is of great clinical value, since it has been shown, that ...

Probing the Brain in Autism Using fMRI and Diffusion Tensor Imaging

Sondering hjärnan i Autism Med fMRI och diffusion tensor imaging

Newly emerging theories suggest that the brain does not function as a cohesive unit in autism, and this discordance is reflected in the behavioral ...

High Content Screening in Neurodegenerative Diseases

Hög halt Screening vid neurodegenerativa sjukdomar

The functional annotation of genomes, construction of molecular networks and novel drug target identification, are important challenges that need to be ...

The Use of Primary Human Fibroblasts for Monitoring Mitochondrial Phenotypes in the Field of Parkinson's Disease

Användning av primära humana fibroblaster för övervakning Mitokondriella fenotyper inom området för Parkinsons sjukdom

Parkinson's disease (PD) is the second most  common movement disorder and affects 1% of people over the age of 60 1. Because ageing is  the most important ...

Tracking the Mammary Architectural Features and Detecting Breast Cancer with Magnetic Resonance Diffusion Tensor Imaging

Spårning bröst arkitektoniska särdrag och upptäcka bröstcancer med Magnetic Resonance Diffusion Tensor Imaging

Breast cancer is the most common cause of cancer among women worldwide. Early detection of breast cancer has a critical role in improving the quality of ...

Quantitative Magnetic Resonance Imaging of Skeletal Muscle Disease

Kvantitativ Magnetic Resonance Imaging av skelettmuskulatur sjukdom

Quantitative magnetic resonance imaging (qMRI) describes the development and use of MRI to quantify physical, chemical, and/or biological properties of ...

Simultaneous PET/MRI Imaging During Mouse Cerebral Hypoxia-ischemia

Samtidig PET / MR Imaging Under Mouse Cerebral Hypoxi-ischemi

Dynamic changes in tissue water diffusion and glucose metabolism occur during and after hypoxia in cerebral hypoxia-ischemia reflecting a bioenergetics ...

Cardiac Magnetic Resonance Imaging at 7 Tesla

Hjärt magnetisk resonanstomografi på 7 Tesla

CMR at an ultra-high field (magnetic field strength B0&#160;&#8805; 7 Tesla) benefits from the signal-to-noise ratio (SNR) advantage inherent at higher ...

Phase Contrast Magnetic Resonance Imaging in the Rat Common Carotid Artery

Magnetröntgen i fas kontrast i den gemensamma halspulsådern råtta

Phase contrast magnetic resonance imaging (PC-MRI) is a noninvasive approach that can quantify flow-related parameters such as blood flow. Previous ...

Cardiac Magnetic Resonance for the Evaluation of Suspected Cardiac Thrombus: Conventional and Emerging Techniques

Hjärtmagnetisk resonans för utvärdering av misstänkt Hjärttromb: konventionell och framväxande teknik

We present the conventional cardiac magnetic resonance (CMR) protocol for evaluating a suspected thrombus and highlight emerging techniques.&#160;The ...