Name: viability assays for cells in culture
Uploaded: 2014-01-20T13:45:00
Description: Watch this Scientific Journal Video about Viability Assays for Cells in Culture at JoVE.com

Biz ATP deneyinde reaktiflerin hacimleri üzerindeki tasarruf fikri Juliann Jaumotte kabul. Biz bu çalışmalar için mali destek sağlayan Mary Caruso, Deb Willson ve Jackie Farrer ve Eczacılık Mylan Okulu muhteşem idari destek için gönülden teşekkür ederiz. Teşekkür de Hunkele korkunç Hastalıkları Vakfı ve Parkinson ve Hareket Bozuklukları birincil nöronal çalışmaların mali destek Vakfı kaynaklanmaktadır.

Protokollerin bir şematik Şekil 1 &#39;de gösterilmiştir. 1.. Hücre Kaplama Farklı kaplama yoğunlukları (Şekil 2), 96 oyuklu plakalar içinde Plate hücreler. N2a nöroblastom hücre hattı, plaka 2.5K, 5K, 10K, ve 3 veya 6 kuyu / grubunda kuyu başına 15k hücreleri üzerinde doğrusallık kontroller için. Birincil fare kortikal nöronlarda, plaka 25k, 50k, 100K, ve 3 veya 6 kuyu / grubunda kuyu başına 200k hücreleri...

Tüm üç canlılığı deneylerde sinyal gücü, doğrusal ve kaplama yoğunluğu ile ilişkili olduğunu bulmuşlardır. Ancak, tüm deneyler, 2-kat veya kaplama yoğunluğu 1.5 kat değişikliklere karşı eşit ölçüde hassastır. N2a hücreleri için, kızılötesi deneyler özellikle düşük kaplama yoğunluklarında, ATP deneyi daha az duyarlıdır. Kızılötesi deneyler ATP daha az duyarlı olan, ancak DRAQ5 + Safir deneyler ve α-tubulin deneyleri ki bunlar, N-asetil sistein ve yüksek ölçüde koruyucu bi...

Biyolojik bilimlerde en yaygın canlılığı tahlil hücre sayıları içerir. Bu 2013/04/29 ve 2013/04/30 üzerinde anahtar kelime ya &quot;in vitro&quot; veya &quot;kültür&quot; ile PubMed&#39;de çıktı üst (en son) 200 yayınların analizi ile kanıtlanır. Bu yayınların, manuel hücre sayısı sayımı dahil olmak üzere% 23.5 kullanılan hücre sayımı tahlilleri, otomatik hücre sayısı görüntüleme yazılımı ile sayar ve Trypan mavi dışlama. Canlı / Ölü deney, bu yayınların% 1 kullanılmıştır. MTT (3 - (4,5-dimetiltiazol-2-il) -2,5-difeniltetrazolyum bromür) kullanılarak yayın sayısı metabolik canlılığı için tahlil% 11 idi. Edebiyat Bu anket aynı zamanda hücre sayımı tahlilleri ile birlikte böyle MTT gibi analizleri kullanılarak yayın sayısı sadece% 3.5 olduğunu göstermektedir. Hücre sayısı ile birlikte hücresel fonksiyonunun değerlendirilmesinde, tek başına bir canlılık deneyi kullanmak için eğilim hücresel i değerlendirmek için iyi bir seçim gibi görünüyor rağmenntegrity. Geriye kalan hücreler fonksiyonel ya da 1,2 kuyu içinde mevcut olmasına rağmen sağlıklı olmayabilir, çünkü kendi başına hücre sayımları yeterli değildir. Bunun tersine, ATP gibi fonksiyonel önlemler artırmak veya hücre sayısındaki paralel değişikliklerle yokluğunda azaltabilir. Hücre sayısı metabolik okumalanna ayrılması ATP ve MTT testleri tek canlılık deneyi olarak asla kullanılmamalıdır gerektiğini göstermektedir. Bu raporda, hücresel yapılar ve metabolik fonksiyonu hem de anket üç canlılığı deneyleri gelemez kendisi tarafından herhangi bir tahlil daha hücresel bütünlüğü daha kapsamlı bir görünüm için, tarif edilmektedir. Bizim deneylerinin iki 700 ve 800 nm kanallarda floresan ölçen bir enfraruj görüntüleyici gerektirir. Gürültü daha yüksek sinyal-gürültü oranı 3 yol açan, kızılötesi dalga boyu düşüktür. Kullandığımız Odyssey kamera, 4.5 günlük dinamik aralık ve 16, TRANSLATIN bir bit derinliğe sahipkızılötesi 2 16 veya 65.536 tonları g. Bu sadece her dalga boyu için renk 2 8 veya 256 tonunu tanıyor 8-bit renk görüntüleme, tezat olabilir. Böylece, 16-bit görüntüleme ince çözünürlüğe sahiptir. Bu orijinal kızılötesi genellikle görsel sunumu için yayınlanmış olan raporlarda (800 nm) ve kırmızı (700 nm), yeşil yalancı olduğu not edilmelidir. Odyssey kameralar genellikle Western blot ve In-Hücre Batılıların 4-7 hem de kullanılmaktadır. In-Cell formaldehit sabit hücreleri üzerinde Western ilgi duyulan herhangi bir protein karşı birincil antikor kullanımı ve kızıl ötesi floresan ikincil antikorlarla da etiketleyin. Bu teknik, fosforilasyon uç noktalar 6 için özellikle yararlı olduğu da bilinmektedir. Bizim In-Cell Western olarak, sitoskeletal proteinler α-tübülin ya da 800 nm kanalda nöronal mikrotübül ilişkili protein 2 (MAP2) için sabit hücreleri boyamak. Bu proteinler yüksek sinyal-gürültü oranı elde etmek için yeteri kadar bol miktarda bulunmaktadır. Biz de 700 yılında bizim plakaları lekeDRAQ5 leke ile ve safir leke ile sitoplazmada için çekirdekleri için nm kanalı. Sitoskeletal proteinler ve DRAQ5 + Sapphire lekeleri Hem böylece hücresel yapılarını yansıtmaktadır. Üçüncü canlılığı deneyi, metabolik fonksiyonu büyüklüğüne ve adı &quot;Hücre Titer Glo.&quot;, Bu lusiferaz bazlı tahlilde, parlaklık değerleri ATP seviyeleri doğrudan orantılıdır. ATP tahliller genel olarak canlı hücreler 8-12 ölçmek için kullanılır. Hücre başına ATP çıkış toksin tedaviler bir fonksiyonu olarak değişebilir Ancak, tahlilin adına kelime &quot;titre&quot; da dahil olmak üzere bir yanlış isim biraz ve hücre sayısı 8 ile orantılı olarak, bu nedenle her zaman değil. ATP düzeyleri de sirkadyan ritim 13 ve 14, hücre bölünmesi ve hücre farklılaşması 15 etkilenebilir. ATP metabolik sağlam bir ölçüsüdür çünkü Bununla birlikte, burada gösterilen ATP deneyi gerçekleştirmek için basit ve faydalıdırcanlılığı 16-21, başına numara hücre değilse. Batılıların bu nedenle tek başına herhangi bir deneyde daha hücresel bütünlüğün daha kapsamlı bir resmini verir In-Cell kızılötesi tamamlamak için bu tahlil kullanma.

<table border="0" cellpadding="0" cellspacing="0" width="821">
	<colgroup>
		<col />
		<col />
		<col />
		<col />
	</colgroup>
	<tbody>
		<tr height="42">
			<td height="42" style="height:43px;width:109px;">Cell Titer Glo</td>
			<td style="width:112px;">Promega</td>
			<td style="width:93px;">G7572</td>
			<td style="width:507px;">Buy in 100 ml quantities and aliquot, instead of purchasing the more expensive 10 ml quantity. Reconstituted, unused reagents can be refrozen at -20 &#176;C for at least 21 weeks</td>
		</tr>
		<tr height="42">
			<td height="42" style="height:43px;width:109px;">18% Formalin</td>
			<td style="width:112px;">Thermo-Shandon</td>
			<td style="width:93px;">9990244</td>
			<td style="width:507px;">Buying this fixative avoids the weighing out of formaldehyde powders and boiling of the solution; exposure to vapors is thereby minimized</td>
		</tr>
		<tr height="42">
			<td height="42" style="height:43px;width:109px;">Sucrose</td>
			<td style="width:112px;">Sigma-Aldrich</td>
			<td style="width:93px;">S0389</td>
			<td style="width:507px;">It is not essential to add this to formaldehyde solutions but it improves the appearance of the fixed cells</td>
		</tr>
		<tr height="42">
			<td height="42" style="height:43px;width:109px;">Odyssey Block</td>
			<td style="width:112px;">LI-COR</td>
			<td style="width:93px;">927-40003</td>
			<td style="width:507px;">This fish serum can be bought in bulk and frozen at -20 &#176;C for long term use</td>
		</tr>
		<tr height="42">
			<td height="42" style="height:43px;width:109px;">Triton-X 100</td>
			<td style="width:112px;">Sigma-Aldrich</td>
			<td style="width:93px;">21568</td>
			<td style="width:507px;">We store a stock solution of 10% Triton-X 100 in sterile water at 4 &#176;C</td>
		</tr>
		<tr height="42">
			<td height="42" style="height:43px;width:109px;">Sodium Phosphate Monobasic</td>
			<td style="width:112px;">Fisher</td>
			<td style="width:93px;">S468</td>
			<td style="width:507px;">One can also buy PBS tablets or 10x PBS solutions, but they are more expensive</td>
		</tr>
		<tr height="42">
			<td height="42" style="height:43px;width:109px;">Sodium Phosphate Dibasic</td>
			<td style="width:112px;">Fisher</td>
			<td style="width:93px;">S373</td>
			<td style="width:507px;">See above</td>
		</tr>
		<tr height="42">
			<td height="42" style="height:43px;width:109px;">Sodium Azide (250x)</td>
			<td style="width:112px;">Ricca Chemical Company</td>
			<td style="width:93px;">7144.8-16</td>
			<td style="width:507px;">Do not buy the powder because sodium azide is very toxic. We store all our used antibodies in 1x sodium azide at 4 &#176;C until they become contaminated with debris</td>
		</tr>
		<tr height="42">
			<td height="42" style="height:43px;width:109px;">Mouse anti-&#945;-tubulin</td>
			<td style="width:112px;">Sigma-Aldrich</td>
			<td style="width:93px;">T5168</td>
			<td style="width:507px;">This antibody is expensive but can be greatly diluted and is highly specific</td>
		</tr>
		<tr height="42">
			<td height="42" style="height:43px;width:109px;">Mouse anti-MAP2</td>
			<td style="width:112px;">Sigma-Aldrich</td>
			<td style="width:93px;">M9942</td>
			<td style="width:507px;">This antibody is expensive but is highly specific (a prerequisite for In-Cell Westerns)</td>
		</tr>
		<tr height="42">
			<td height="42" style="height:43px;width:109px;">800 nm Goat anti-mouse IgG</td>
			<td style="width:112px;">LI-COR</td>
			<td style="width:93px;">926-32210</td>
			<td style="width:507px;">Other companies also sell infrared secondary antibodies. Be sure to purchase the highly cross-adsorbed antibodies and note that concentrations of IgGs may vary with the source</td>
		</tr>
		<tr height="42">
			<td height="42" style="height:43px;width:109px;">DRAQ5</td>
			<td style="width:112px;">Biostatus</td>
			<td style="width:93px;">DR50200</td>
			<td style="width:507px;">This compound used to be sold by LI-COR at 1 mM</td>
		</tr>
		<tr height="42">
			<td height="42" style="height:43px;width:109px;">Sapphire</td>
			<td style="width:112px;">LI-COR</td>
			<td style="width:93px;">928-40022</td>
			<td style="width:507px;"></td>
		</tr>
		<tr height="42">
			<td height="42" style="height:43px;width:196px;">Luminometer</td>
			<td style="width:129px;">PerkinElmer</td>
			<td style="width:189px;">VICTOR3 1420 multilabel counter</td>
			<td></td>
		</tr>
		<tr height="42">
			<td height="42" style="height:43px;width:196px;">Odyssey Imager</td>
			<td style="width:129px;">LI-COR</td>
			<td style="width:189px;">9201-01</td>
			<td></td>
		</tr>
		<tr height="42">
			<td height="42" style="height:43px;width:196px;">Shaker/Mixer</td>
			<td style="width:129px;">Research Products International</td>
			<td style="width:189px;">248555</td>
			<td></td>
		</tr>
	</tbody>
</table>

viability assays for cells in culture

Bir mikroskop Manual hücre sayımları hücre canlılığının değerlendirilmesinde hassas bir yoludur, ancak zaman alıcı ve bu nedenle pahalıdır. Bilgisayarlı canlılığı deneyleri ekipman açısından pahalı ama daha hızlı ve daha objektif manuel hücre sayımları daha olabilir. Bu rapor, bu tür üç canlılığı tahlillerin kullanımını tarif eder. Bu tahlillerin ikisi kızılötesi ve bir parlak olan. Her iki kızılötesi tahlilleri bir 16 bit Odyssey Imager güveniyor. Bir kızılötesi deney sitosol için safir leke ile kombine çekirdekleri için DRAQ5 leke kullanır ve 700 nm kanalında görüntülenmiştir. Diğer kızılötesi deney, bir In-Cell Western, sitoskeletal proteinler (α-tubulin veya mikrotübül ilişkili protein 2) karşı antikorlar kullanır ve 800 nm kanal bunları etiketler. Üçüncü canlılık deneyi ATP için yaygın olarak kullanılan bir ışıldayan deney, ama biz maliyet tasarruf için önerilen hacminin dörtte kullanın. Bu ölçümler her doğrusaldır ve ce sayısı ile ilişkiliLLS kaplama, ancak duyarlılık değişir. Tüm deneyler üç zaman alıcı mikroskobu aşmak ve tüm kaynak örnek, bu şekilde, örnekleme hatasının azaltılması. Son olarak, bütün deneylerde kolayca kısa zaman dilimleri içinde yapılması gereken deney daha fazla sayıda izin veren, deney sonunda bir gün içinde tamamlanabilir. Ancak, hepsi hücre sayıları tedaviler, bazen özellikle hücresel ATP için bir araya geldi değil, bir varsayım sonra sinyal gücü orantılı kalması varsayımına dayanmasıdır. Hücreler artırmak veya tedavi sonrası boyutunda azalma Ayrıca, eğer, bu hücre sayısı etkilemeden sinyal gücünü etkileyebilir. Biz manuel sayıları dahil tüm canlılığı deneyleri, uyarılar bir dizi muzdarip olduğu sonucuna, ancak bilgisayarlı canlılığı deneyleri ilk yatırım değer. Her üç deneyleri kullanılarak birlikte hücresel yapısı ve fonksiyonu kapsamlı bir görünümünü verir.

Bu deneylerde oran sınırlayıcı bir faktör ATP deney süresi nispeten kısa olduğu için, kızılötesi boyama olduğunu. Kızılötesi tahlilleri için, sekiz 96-yuvalı plakalar (bkz. Şekil 1) dört plakaların her biri iki seri tarafından şaşırtıcı bir gün içinde, lekeli ve taranabilir tahmin ediyoruz. Bu tahmin, tespit bölgesinin 20 dakika varsayar, yıkama 30 dakika, yıkama 30 dakika, ardından 2 saat primer antikor inkübasyon bloke 30 dakika, yıkama 30 dakika süre ile 1 saat kul...

Watch this Scientific Journal Video about Viability Assays for Cells in Culture at JoVE.com

Viability Assays for Cells in Culture

Terapötik bileşikler genellikle ilk canlılığı deneyleri ile in vitro incelenmiştir. Bir insan gözlemci tarafından kör hücre sayımları hücre sayısındaki küçük değişikliklere son derece hassas olabilir ama fonksiyonunu değerlendirmek yok. Bilgisayarlı canlılığı deneyleri, burada açıklandığı gibi, objektif bir şekilde yapı ve fonksiyon hem de değerlendirebilir.

Kültür hücreleri için Canlılık Tahliller

Manual cell counts on a microscope are a sensitive means of assessing cellular viability but are time-consuming and therefore expensive. Computerized ...

Research

JoVE Journal

Biology

Counting and Determining the Viability of Cultured Cells

Doku ve Hücre Sayım ve Canlılık Belirlenmesi

Determining the number of cells in culture is important in standardization of culture conditions and in performing accurate quantitation experiments. A ...

Neurocircuit Assays for Seizures in Epilepsy Mutants of Drosophila

Neurocircuit Assays for Seizures in Epilepsy Mutants of Drosophila

, Epilepsi Mutants Nöbetler Neurocircuit Tahliller Drosophila</em

Drosophila melanogaster is a useful tool for studying seizure like activity. A variety of mutants in which seizures can be induced through either physical ...

Analysis of Schwann-astrocyte Interactions Using In Vitro Assays

Analysis of Schwann-astrocyte Interactions Using In Vitro Assays

Schwann-astrosit Etkileşimleri Analizi In Vitro Tahliller

Schwann cells are one of the commonly used cells in repair strategies following spinal cord injuries. Schwann cells are capable of supporting axonal ...

Isolation and Primary Culture of Rat Hepatic Cells

Sıçan Karaciğer Hücreleri İzolasyon ve İlköğretim Kültür

Primary hepatocyte culture is a valuable tool that has been extensively used in basic research of liver function, disease, pathophysiology, pharmacology ...

Assessment of Mitochondrial Functions and Cell Viability in Renal Cells Overexpressing Protein Kinase C Isozymes

Böbrek Hücreleri aşırı eksprese eden protein kinaz C izozimlerinin Mitokondriyal Fonksiyonlar ve Hücre Canlılık Değerlendirilmesi

The protein kinase C (PKC) family of isozymes is involved in numerous physiological and pathological processes. Our recent data demonstrate that PKC ...

Coupled Assays for Monitoring Protein Refolding in Saccharomyces cerevisiae

Coupled Assays for Monitoring Protein Refolding in Saccharomyces cerevisiae

İzlenmesi protein refolding için birleştiğinde Tahliller<em&gt; Saccharomyces cerevisiae</em

Proteostasis, defined as the combined processes of protein folding/biogenesis, refolding/repair, and degradation, is a delicate cellular balance that must ...

Efficient Generation Human Induced Pluripotent Stem Cells from Human Somatic Cells with Sendai-virus

Sendai-virüs ile İnsan Somatik Verimli Üretimi İnsan uyarılmış pluripotent kök hücrelerin

A few years ago, the establishment of human induced pluripotent stem cells (iPSCs) ushered in a new era in biomedicine. Potential uses of human iPSCs ...

Massively Parallel Reporter Assays in Cultured Mammalian Cells

Kültürlenmiş memeli hücrelerinde büyük çapta paralel Raportör Tahliller

The genetic reporter assay is a well-established and powerful tool for dissecting the relationship between DNA sequences and their gene regulatory ...

Nephrotoxin Microinjection in Zebrafish to Model Acute Kidney Injury

Zebra balığı Nephrotoxin Mikroenjeksiyon Akut Böbrek Yaralanması Model

The kidneys are susceptible to harm from exposure to chemicals they filter from the bloodstream. This can lead to organ injury associated with a rapid ...

Assays for the Degradation of Misfolded Proteins in Cells

Hücreler yanlış katlanmış proteinlerle degradasyonundan Tahliller

Protein misfolding and aggregation are associated with various neurodegenerative diseases. Cellular mechanisms that recognize and degrade misfolded ...