Name: detecting, visualizing and quantitating the generation of reactive oxygen species in an amoeba model system
Uploaded: 2013-11-05T18:30:00
Description: Watch this Scientific Journal Video about Detecting, Visualizing and Quantitating the Generation of Reactive Oxygen Species in an Amoeba Model System at JoVE.com

Agradecemos a los Dres Karl-Heinz Krause y Vincent Jaquet ayuda y consejo para establecer estos protocolos, y también gracias a Christoph Bauer y Jérôme Bosset de la Plataforma Bioimaging del NCCR y el Dr. Navin Gopaldass por su apoyo técnico. La investigación es apoyada por una beca ProDoc de la Fundación Nacional de Ciencia de Suiza.

1. La visualización y valoración cualitativa de ROS producción en Fagosomas Las perlas recubiertas con OBG deben estar preparados de antemano. Los procedimientos de revestimiento cuentas y técnica de superposición de agar fueron adaptadas de referencias publicadas 5,14. <ol><li> Añadir 1 ml de suspensión de 3,0 micras perlas de sílice carboxilados (alrededor de 1,8 x 10 9 bolas) a un tubo de 1,5 ml, se lavan las perlas 3 veces con 1 ml de PBS por vuelta rápid...

<ol>
	<li>Bedard, K., Krause, K. H. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/query.fcgi?db=PubMed&cmd=Search&doptcmdl=Citation&defaultField=Title+Word&term=The+NOX+family+of+ROS-generating+NADPH+oxidases:+physiology+and+pathophysiology.">The NOX family of ROS-generating NADPH oxidases: physiology and pathophysiology.</a> Physiol. Rev. 87, 245-313 (2007).</li><li>West, A. P., et al. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/query.fcgi?db=PubMed&cmd=Search&doptcmdl=Citation&defaultField=Title+Word&term=TLR+signalling+augments+macrophage+bactericidal+activity+through+mitochondrial+ROS.">TLR signalling augments macrophage bactericidal activity through mitochondrial ROS.</a> Nature. 472, 476-480 (2011).</li><li>Fey, P., Gaudet, P., Pilcher, K. E., Franke, J., Chisholm, R. 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Physiol. 112, 3905-3911 (2012).</li><li>Peng, D., et al. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/query.fcgi?db=PubMed&cmd=Search&doptcmdl=Citation&defaultField=Title+Word&term=Glutathione+peroxidase+7+protects+against+oxidative+DNA+damage+in+oesophageal+cells.">Glutathione peroxidase 7 protects against oxidative DNA damage in oesophageal cells.</a> Gut. 61, 1250-1260 (2012).</li><li>Walk, A., et al. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/query.fcgi?db=PubMed&cmd=Search&doptcmdl=Citation&defaultField=Title+Word&term=Lipopolysaccharide+enhances+bactericidal+activity+in+Dictyostelium+discoideum+cells.">Lipopolysaccharide enhances bactericidal activity in Dictyostelium discoideum cells.</a> Dev. Comp. Immunol. 35, 850-856 (2011).</li><li>Fukui, Y., Yumura, S., Yumura, T. K. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/query.fcgi?db=PubMed&cmd=Search&doptcmdl=Citation&defaultField=Title+Word&term=Agar-overlay+immunofluorescence:+high-resolution+studies+of+cytoskeletal+components+and+their+changes+during+chemotaxis.">Agar-overlay immunofluorescence: high-resolution studies of cytoskeletal components and their changes during chemotaxis.</a> Methods Cell Biol. 28, 347-356 (1987).</li><li>Fey, P., Kowal, A. S., Gaudet, P., Pilcher, K. E., Chisholm, R. L. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/query.fcgi?db=PubMed&cmd=Search&doptcmdl=Citation&defaultField=Title+Word&term=Protocols+for+growth+and+development+of+Dictyostelium+discoideum.">Protocols for growth and development of Dictyostelium discoideum.</a> Nat. Protoc. 2, 1307-1316 (2007).</li><li>Bloomfield, G., Pears, C. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/query.fcgi?db=PubMed&cmd=Search&doptcmdl=Citation&defaultField=Title+Word&term=Superoxide+signalling+required+for+multicellular+development+of+Dictyostelium.">Superoxide signalling required for multicellular development of Dictyostelium.</a> J. Cell. Sci. 116, 3387-3397 (2003).</li><li>Dieckmann, R., Gopaldass, N., Escalera, C., Soldati, T., Deretic, V. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/query.fcgi?db=PubMed&cmd=Search&doptcmdl=Citation&defaultField=Title+Word&term=Autophagosomes+and+Phagosomes.">Autophagosomes and Phagosomes.</a> Methods in Molecular Biology. 445, 317-328 (2008).</li><li>Amir, Y., Edward, O. -. A., Utpal, B. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/query.fcgi?db=PubMed&cmd=Search&doptcmdl=Citation&defaultField=Title+Word&term=A+protocol+for+in+vivo+detection+of+reactive+oxygen+species.">A protocol for in vivo detection of reactive oxygen species.</a> Proto. Exch. , (2008).</li><li>Neuhaus, E. M., Soldati, T. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/query.fcgi?db=PubMed&cmd=Search&doptcmdl=Citation&defaultField=Title+Word&term=A+myosin+I+is+involved+in+membrane+recycling+from+early+endosomes.">A myosin I is involved in membrane recycling from early endosomes.</a> J. Cell Biol. 150, 1013-1026 (2000).</li></ol>

En comparación con los métodos descritos anteriormente, el ensayo de OBG visualiza dinámicamente el proceso de phagosomal la generación de ROS en el nivel de células individuales, en lugar de medir una señal promedio de ROS de una población de células. Tales métodos población de promediación tienden a oscurecer la información crítica causada por la fagocitosis no sincrónico. Se adaptó con éxito los ensayos DHE y AUR a Dictyostelium y optimizado los protocolos. Lo más importante es que hemos esp...

Especies reactivas de oxígeno (ROS) están involucrados en una amplia variedad de procesos biológicos tales como la defensa del huésped, señalización, el desarrollo del tejido y la respuesta a la lesión, así como la hipertensión y el cáncer. La maquinaria de la oxidasa NADPH phagosomal bien estudiado se dedica a la generación de ROS rápida, conocida como la explosión oxidativa, para matar las bacterias ingeridas en los fagosomas neutrófilos &#39;1. Además, la fuga de electrones como un subproducto de la cadena respiratoria mitocondrial se pensaba que ser responsable sólo de una fuente no regulada de ROS. Sin embargo, recientemente, se identificó como un importante mecanismo para contribuir a la muerte intraphagosomal de bacterias en macrófagos de ratón 2. En los últimos años, la ameba sociales, Dictyostelium, se ha convertido en un modelo de gran alcance y popular para estudiar mecanismos celulares intrínsecas de la respuesta inmune innata. De hecho, Dictyostelium y fagocitos humanos comparten un sorprendente alto nivel de conservación en moleculamaquinarias r responsables de las bacterias de detección, inmersión y matando a 3,4. Los homólogos de proteínas y enzimas relacionadas con la producción o la desintoxicación de ROS, tales como NADPH oxidasas, catalasas, superóxido dismutasas, se pueden encontrar en humanos y Dictyostelium. A medida que la ameba mejor estudiado, Dictyostelium presenta varias ventajas únicas sobre modelo de sistema de los mamíferos. Crecen a temperatura ambiente sin la necesidad de CO 2, con un tiempo de duplicación de 8-10 horas. Se pueden mantener fácilmente como cultivos adherentes o de suspensión. Además, gracias a su genoma haploide totalmente secuenciado y anotado, y a la manipulación genética fácil, Dictyostelium se ha convertido en un muy atractivo organismo modelo experimental. En estudios anteriores, diversos derivados clorados y fluorados de fluoresceína (conocidos colectivamente como OxyBurst verde, OBG) que emite fluorescencia después de la oxidación por ROS, se han utilizado como un reportero de ROS. Est Cell-permeantderivados erified se utilizan para medir citoplasmática de ROS, mientras que o dextrano-derivados de células impermeable acoplados a proteínas se utilizan para medir extracelular ROS. En particular, perlas recubiertas con BSA OBG ya han sido utilizados para detectar la producción de ROS en células de mamífero phagosomal 5. Sin embargo, el enfoque basado en el lector de microplacas sólo puede dar una curva de generación de ROS promedio de una población de células. Con el presente protocolo, mediante el uso de Dictyostelium, un fagocito profesional, y condiciones experimentales optimizadas, obtenemos la fagocitosis estable y eficiente, sin conjugar cualquier opsonina sobre las perlas. DHE se ha utilizado en diversos sistemas modelo, como los neutrófilos y los macrófagos de mamíferos, para detectar la producción de ROS 6-9. Mientras tanto, existen algunas controversias acerca de la especificidad y sensibilidad del método de 8,10. Como una versión mejorada de Amplex Red, la intensidad de fluorescencia de AUR es menos sensible al pH, que lo hace más adecuado para medirROS en ambientes no neutrales o ligeramente ácidos. AUR se ha aplicado recientemente en varios sistemas de mamíferos 11,12, pero su uso en modelos no mamíferos, que muy a menudo requieren medios de crecimiento débilmente ácido, no se ha informado todavía. Además, no hay ningún protocolo publicado para medir cuantitativamente y dinámicamente la producción de ROS y la localización en la ameba social de Dictyostelium. El objetivo del conjunto de protocolos presentado es proporcionar una solución sencilla y versátil para controlar diversos ROS y su localización, y además dar una visión de los mecanismos celulares relacionados con el ROS. Para el ensayo de OBG, se utilizó la microscopía en vivo para supervisar todo el proceso de generación de ROS phagosomal después de la absorción de perlas revestidas de OBG por células de Dictyostelium, y nos proporcionó un nuevo enfoque para estudiar el mecanismo de la muerte intraphagosomal de bacterias. Hemos optimizado DHE y AUR ensayos de mediano rendimiento en Dictyostelium, para medir superóxido intracelularIDE y H extracelular 2 O 2 de producción, respectivamente, mediante el uso de LPS como un estimulador potente de ROS. Tenga en cuenta que el LPS se demostró recientemente para aumentar la actividad bactericida de Dictyostelium hacia bacterias fagocitadas 13. Además, el tratamiento con DEDTC y catalasa confirmó explícitamente que estos dos métodos de medir específicamente los diferentes tipos y localizaciones subcelulares de ROS en Dictyostelium. Por último, el ensayo de OBG se puede adaptar a cualquier célula fagocítica adherente, por opsonizantes aún más las perlas con ligandos para receptores de células fagocíticas animales. En principio, los ensayos DHE y AUR también puede ser ajustado para mediciones en cualquier celular adherente o no adherente en condiciones experimentales adecuadas.

<table border="1">
	<tbody>
		<tr>
			<td></td>
			<td></td>
			<td></td>
			<td>REAGENTS</td>
		</tr>
		<tr>
			<td>OxyBURST Green H2HFF BSA</td>
			<td>Invitrogen</td>
			<td>O-13291</td>
			<td></td>
		</tr>
		<tr>
			<td>Alexa Fluor 594</td>
			<td>Invitrogen</td>
			<td>A-20004</td>
			<td></td>
		</tr>
		<tr>
			<td>Carboxylated silica beads</td>
			<td>Kisker Biotech</td>
			<td>PSi-3.0COOH</td>
			<td></td>
		</tr>
		<tr>
			<td>HL5C medium</td>
			<td>ForMedium</td>
			<td>HLC0102</td>
			<td></td>
		</tr>
		<tr>
			<td>LoFlo medium</td>
			<td>ForMedium</td>
			<td>LF1001</td>
			<td></td>
		</tr>
		<tr>
			<td>Bacto agar</td>
			<td>BD</td>
			<td>204010</td>
			<td></td>
		</tr>
		<tr>
			<td>Dihydroethidium</td>
			<td>Sigma</td>
			<td>37291-25MG</td>
			<td></td>
		</tr>
		<tr>
			<td>Amplex UltraRed</td>
			<td>Invitrogen</td>
			<td>A36006</td>
			<td></td>
		</tr>
		<tr>
			<td>Horseradish peroxidase</td>
			<td>Roche</td>
			<td>10108090001</td>
			<td></td>
		</tr>
		<tr>
			<td>Diethyldithiocarbamate (DEDTC)</td>
			<td>Sigma</td>
			<td>D3506-100G</td>
			<td></td>
		</tr>
		<tr>
			<td>Catalase</td>
			<td>Sigma</td>
			<td>C9322-1G</td>
			<td></td>
		</tr>
		<tr>
			<td>Cyanamide</td>
			<td>Sigma</td>
			<td>187364-25G</td>
			<td></td>
		</tr>
		<tr>
			<td>Lipopolysaccharides</td>
			<td>Sigma</td>
			<td>L2630-25G</td>
			<td></td>
		</tr>
		<tr>
			<td></td>
			<td></td>
			<td></td>
			<td>EQUIPMENT</td>
		</tr>
		<tr>
			<td>ibidi &#956;-Dish 35 mm, high</td>
			<td>ibidi</td>
			<td>81156</td>
			<td>Bottom made of optically clear plastic</td>
		</tr>
		<tr>
			<td>MatTek dish 35 mm</td>
			<td>MatTek corporation</td>
			<td>P35G-1.5-14-C</td>
			<td>Bottom made of a glass coverslip</td>
		</tr>
		<tr>
			<td>Scepter Cell Counter</td>
			<td>Merck Millipore</td>
			<td>PHCC00000</td>
			<td></td>
		</tr>
		<tr>
			<td>White 96 well plate</td>
			<td>Nunc</td>
			<td>236108</td>
			<td></td>
		</tr>
		<tr>
			<td>Centrifuge</td>
			<td>SORVALL</td>
			<td>Legend RT</td>
			<td></td>
		</tr>
		<tr>
			<td>Microplate reader</td>
			<td>BioTek</td>
			<td>Synergy Mx</td>
			<td></td>
		</tr>
	</tbody>
</table>

detecting, visualizing and quantitating the generation of reactive oxygen species in an amoeba model system

Especies reactivas de oxígeno (ROS) comprenden una gama de, moléculas que contienen oxígeno reactivas y de corta duración, que se interconvertir o eliminarse ya sea catalíticamente o espontáneamente dinámicamente. Debido a los cortos ciclos de vida de la mayoría de ROS y la diversidad de sus fuentes y localizaciones subcelulares, una imagen completa se puede obtener sólo por medio de mediciones cuidadosas usando una combinación de protocolos. A continuación, presentamos un conjunto de tres protocolos diferentes utilizando OxyBurst Green (OBG) recubierto con perlas, o dihydroethidium (DHE) y Amplex UltraRed (AUR), para controlar cualitativa y cuantitativamente diferentes ROS en fagocitos profesionales como Dictyostelium. Hemos optimizado los procedimientos de revestimiento cuentas y perlas revestidas de OBG usados ​​y microscopía en vivo para visualizar dinámicamente intraphagosomal la generación de ROS en el nivel de células individuales. Se identificaron lipopolisacárido (LPS) de E. coli como un potente estimulador de la generación de ROS en Dictyostelium. Además, Dtiempo real eveloped, ensayos de mediano rendimiento utilizando DHE y AUR para medir cuantitativamente superóxido intracelular y extracelular H 2 O 2 de producción, respectivamente.

La generación de ROS en los fagosomas se puede visualizar cualitativa y dinámicamente por microscopía (S1 del archivo). La fluorescencia roja emitida por Alexa Fluor 594-es insensible al pH y se mantiene constante en el medio ambiente phagosomal, mientras que la oxidación de OBG aumenta su fluorescencia en el canal verde. Los espectros de emisión de in vitro oxida y perlas recubiertas con OBG no oxidado se comparan en la Figura 1B, que muestra un aumento significativo de l...

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Detecting, Visualizing and Quantitating the Generation of Reactive Oxygen Species in an Amoeba Model System

Se adaptó un conjunto de protocolos para la medición de especies reactivas de oxígeno (ROS) que se pueden aplicar en varios modelos celulares de ameba y de mamíferos para estudios cualitativos y cuantitativos.

La detección, la visualización y cuantificación de la generación de especies reactivas de oxígeno en un sistema modelo de la ameba

Reactive oxygen species (ROS) comprise a range of reactive and short-lived, oxygen-containing molecules, which are dynamically interconverted or ...

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