I modsætning til det, der ses for eukaryoter, er der en mangel på undersøgelser, der detaljeret membrandepolarisering og ionkoncentration ændringer i bakterier, primært som deres lille størrelse gør konventionelle målemetoder vanskelig. Her har vi detalje protokoller for overvågning af sådanne begivenheder i den betydelige Gram-positive patogen Streptococcus pneumoniae udnytte fluorescens teknikker.