Name: split-and-pool synthesis and characterization of peptide tertiary amide library
Uploaded: 2014-06-20T13:00:00
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लेखकों बहुमूल्य सहायता के लिए डॉ. Jumpei Morimoto और डॉ. टोड Doran धन्यवाद देना चाहूंगा. इस काम NHLBI (NO1-HV-00242) से एक अनुबंध द्वारा समर्थित किया गया.

1. भाजित और पूल संश्लेषण की मूल बातें कुशलतापूर्वक ठोस चरण पर यौगिकों की एक बड़ी संख्या उत्पन्न करने के लिए, विभाजन और पूल संश्लेषण अक्सर एक सामान्य रणनीति के रूप में कार्यरत है. चित्रा 4...

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	<li>Xiao, X., Yu, P., Lim, H. -. S., Sikder, D., Kodadek, T. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/query.fcgi?db=PubMed&cmd=Search&doptcmdl=Citation&defaultField=Title+Word&term=Design+and+Synthesis+of+a+Cell-Permeable+Synthetic+Transcription+Factor+Mimic.">Design and Synthesis of a Cell-Permeable Synthetic Transcription Factor Mimic.</a> Journal of Combinatorial Chemistry. 9, 592-600 (2007).</li><li>Miller, S. M., et al. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/query.fcgi?db=PubMed&cmd=Search&doptcmdl=Citation&defaultField=Title+Word&term=Proteolytic+Studies+of+Homologous+Peptide+and+N-Substituted+Glycine+Peptoid+Oligomers.">Proteolytic Studies of Homologous Peptide and N-Substituted Glycine Peptoid Oligomers.</a> Bioorganic &amp; Medicinal Chemistry Letters. 4, 2657-2662 (1994).</li><li>Grauer, A., Konig, B. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/query.fcgi?db=PubMed&cmd=Search&doptcmdl=Citation&defaultField=Title+Word&term=Peptidomimetics+-+A+Versatile+Route+to+Biologically+Active+Compounds.">Peptidomimetics - A Versatile Route to Biologically Active Compounds.</a> European Journal of Organic Chemistry. 30, 5099-5111 (2009).</li><li>Zuckermann, R. N., Kerr, J. M., Kent, S. B. H., Moos, W. H. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/query.fcgi?db=PubMed&cmd=Search&doptcmdl=Citation&defaultField=Title+Word&term=Efficient+method+for+the+preparation+of+peptoids+[oligo(N-substituted+glycines)]+by+submonomer+solid-phase+synthesis.">Efficient method for the preparation of peptoids [oligo(N-substituted glycines)] by submonomer solid-phase synthesis.</a> Journal of the American Chemical Society. 114, 10646-10647 (1992).</li><li>Figliozzi, G. M., Goldsmith, R., Ng, S. C., Banville, S. C., Zuckermann, R. N. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/query.fcgi?db=PubMed&cmd=Search&doptcmdl=Citation&defaultField=Title+Word&term=Synthesis+of+N-substituted+glycine+peptoid+libraries.">Synthesis of N-substituted glycine peptoid libraries.</a> Methods in Enzymology. 267, 437-447 (1996).</li><li>Seebach, D., et al. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/query.fcgi?db=PubMed&cmd=Search&doptcmdl=Citation&defaultField=Title+Word&term=beta-peptides:+Synthesis+by+Arndt-Eistert+homologation+with+concomitant+peptide+coupling.+Structure+determination+by+NMR+and+CD+spectroscopy+and+by+X-ray+crystallography.+Helical+secondary+structure+of+a+beta-hexapeptide+in+solution+and+its+stability+towards+pepsin.">beta-peptides: Synthesis by Arndt-Eistert homologation with concomitant peptide coupling. Structure determination by NMR and CD spectroscopy and by X-ray crystallography. Helical secondary structure of a beta-hexapeptide in solution and its stability towards pepsin.</a> Helv Chim Acta. 79, 913-941 (1996).</li><li>Lam, K. S., et al. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/query.fcgi?db=PubMed&cmd=Search&doptcmdl=Citation&defaultField=Title+Word&term=A+New+Type+of+Synthetic+Peptide+Library+for+Identifying+Ligand-Binding+Activity.">A New Type of Synthetic Peptide Library for Identifying Ligand-Binding Activity.</a> Nature. 354, 82-84 (1991).</li><li>Simon, R. J., et al. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/query.fcgi?db=PubMed&cmd=Search&doptcmdl=Citation&defaultField=Title+Word&term=Peptoids+-+a+Modular+Approach+to+Drug+Discovery.">Peptoids - a Modular Approach to Drug Discovery.</a> Proceedings of the National Academy of Sciences of the United States of America. 89, 9367-9371 (1992).</li><li>Burkoth, T. S., et al. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/query.fcgi?db=PubMed&cmd=Search&doptcmdl=Citation&defaultField=Title+Word&term=Toward+the+synthesis+of+artificial+proteins:+the+discovery+of+an+amphiphilic+helical+peptoid+assembly.">Toward the synthesis of artificial proteins: the discovery of an amphiphilic helical peptoid assembly.</a> Chem Biol. 9, 647-654 (2002).</li><li>Alluri, P. G., Reddy, M. M., Bachhawat-Sikder, K., Olivos, H. J., Kodadek, T. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/query.fcgi?db=PubMed&cmd=Search&doptcmdl=Citation&defaultField=Title+Word&term=Isolation+of+protein+ligands+from+large+peptoid+libraries.">Isolation of protein ligands from large peptoid libraries.</a> Journal of the American Chemical Society. 125, 13995-14004 (2003).</li><li>Lim, H. S., Archer, C. T., Kodadek, T. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/query.fcgi?db=PubMed&cmd=Search&doptcmdl=Citation&defaultField=Title+Word&term=Identification+of+a+peptoid+inhibitor+of+the+proteasome+19S+regulatory+particle.">Identification of a peptoid inhibitor of the proteasome 19S regulatory particle.</a> Journal of the American Chemical Society. 129, 7750-7751 (2007).</li><li>Wrenn, S. J., Weisinger, R. M., Halpin, D. R., Harbury, P. B. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/query.fcgi?db=PubMed&cmd=Search&doptcmdl=Citation&defaultField=Title+Word&term=Synthetic+ligands+discovered+by+in+vitro+selection.">Synthetic ligands discovered by in vitro selection.</a> Journal of the American Chemical Society. 129, 13137-13143 (2007).</li><li>Aina, O. H., Marik, J., Liu, R. W., Lau, D. H., Lam, K. S. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/query.fcgi?db=PubMed&cmd=Search&doptcmdl=Citation&defaultField=Title+Word&term=Identification+of+novel+targeting+peptides+for+human+ovarian+cancer+cells+using+&amp;#34;one-bead+one-compound&amp;#34;+combinatorial+libraries.">Identification of novel targeting peptides for human ovarian cancer cells using &amp;#34;one-bead one-compound&amp;#34; combinatorial libraries.</a> Mol Cancer Ther. 4, 806-813 (2005).</li><li>Udugamasooriya, D. G., Dineen, S. P., Brekken, R. A., Kodadek, T. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/query.fcgi?db=PubMed&cmd=Search&doptcmdl=Citation&defaultField=Title+Word&term=A+Peptoid+&#8220;Antibody+Surrogate&#8221;+That+Antagonizes+VEGF+Receptor+2+Activity.">A Peptoid &#8220;Antibody Surrogate&#8221; That Antagonizes VEGF Receptor 2 Activity.</a> Journal of the American Chemical Society. 130, 5744-5752 (2008).</li><li>Shah, N. H., et al. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/query.fcgi?db=PubMed&cmd=Search&doptcmdl=Citation&defaultField=Title+Word&term=Oligo(+N-aryl+glycines):+A+New+Twist+on+Structured+Peptoids.">Oligo( N-aryl glycines): A New Twist on Structured Peptoids.</a> Journal of the American Chemical Society. 130, 16622-16632 (2008).</li><li>Chongsiriwatana, N. P., et al. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/query.fcgi?db=PubMed&cmd=Search&doptcmdl=Citation&defaultField=Title+Word&term=Peptoids+that+mimic+the+structure,+function,+and+mechanism+of+helical+antimicrobial+peptides.">Peptoids that mimic the structure, function, and mechanism of helical antimicrobial peptides.</a> Proceedings of the National Academy of Sciences of the United States of America. 105, 2794-2799 (2008).</li><li>Paul, B., et al. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/query.fcgi?db=PubMed&cmd=Search&doptcmdl=Citation&defaultField=Title+Word&term=N-Naphthyl+Peptoid+Foldamers+Exhibiting+Atropisomerism.">N-Naphthyl Peptoid Foldamers Exhibiting Atropisomerism.</a> Organic Letters. 14, 926-929 (2012).</li><li>Crapster, J. A., Guzei, I. A., Blackwell, H. E. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/query.fcgi?db=PubMed&cmd=Search&doptcmdl=Citation&defaultField=Title+Word&term=A+peptoid+ribbon+secondary+structure.">A peptoid ribbon secondary structure.</a> Angewandte Chemie. 52, 5079-5084 (2013).</li><li>Gorske, B. C., Stringer, J. R., Bastian, B. L., Fowler, S. A., Blackwell, H. E. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/query.fcgi?db=PubMed&cmd=Search&doptcmdl=Citation&defaultField=Title+Word&term=New+strategies+for+the+design+of+folded+peptoids+revealed+by+a+survey+of+noncovalent+interactions+in+model+systems.">New strategies for the design of folded peptoids revealed by a survey of noncovalent interactions in model systems.</a> J Am Chem Soc. 131, 16555-16567 (2009).</li><li>Stringer, J. R., Crapster, J. A., Guzei, I. A., Blackwell, H. E. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/query.fcgi?db=PubMed&cmd=Search&doptcmdl=Citation&defaultField=Title+Word&term=Extraordinarily+robust+polyproline+type+I+peptoid+helices+generated+via+the+incorporation+of+alpha-chiral+aromatic+N-1-naphthylethyl+side+chains.">Extraordinarily robust polyproline type I peptoid helices generated via the incorporation of alpha-chiral aromatic N-1-naphthylethyl side chains.</a> J Am Chem Soc. 133, 15559-15567 (2011).</li><li>Huang, K., et al. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/query.fcgi?db=PubMed&cmd=Search&doptcmdl=Citation&defaultField=Title+Word&term=A+threaded+loop+conformation+adopted+by+a+family+of+peptoid+nonamers.">A threaded loop conformation adopted by a family of peptoid nonamers.</a> Journal of the American Chemical Society. 128, 1733-1738 (2006).</li><li>Lee, J. H., Kim, H. S., Lim, H. S. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/query.fcgi?db=PubMed&cmd=Search&doptcmdl=Citation&defaultField=Title+Word&term=Design+and+Facile+Solid-Phase+Synthesis+of+Conformationally+Constrained+Bicyclic+Peptoids.">Design and Facile Solid-Phase Synthesis of Conformationally Constrained Bicyclic Peptoids.</a> Organic Letters. 13, 5012-5015 (2011).</li><li>Gao, Y., Kodadek, T. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/query.fcgi?db=PubMed&cmd=Search&doptcmdl=Citation&defaultField=Title+Word&term=Synthesis+and+Screening+of+Stereochemically+Diverse+Combinatorial+Libraries+of+Peptide+Tertiary+Amides.">Synthesis and Screening of Stereochemically Diverse Combinatorial Libraries of Peptide Tertiary Amides.</a> Chem Biol. 20, 360-369 (2013).</li><li>Urban, J., Vaisar, T., Shen, R., Lee, M. S. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/query.fcgi?db=PubMed&cmd=Search&doptcmdl=Citation&defaultField=Title+Word&term=Lability+of+N-alkylated+peptides+towards+TFA+cleavage.">Lability of N-alkylated peptides towards TFA cleavage.</a> Int J Pept Protein Res. 47, 182-189 (1996).</li><li>Rzuczek, S. G., Gao, Y., Tang, Z., Thornton, C. A., Kodadek, T., Disney, M. D. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/query.fcgi?db=PubMed&cmd=Search&doptcmdl=Citation&defaultField=Title+Word&term=Features+of+Modularly+Assembled+Compounds+That+Impart+Bioactivity+Against+an+RNA+Target.">Features of Modularly Assembled Compounds That Impart Bioactivity Against an RNA Target.</a> ACS Chemical Biology. 8 (10), 2312-2321 (2013).</li><li>Thern, B., Rudolph, J., Jung, G. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/query.fcgi?db=PubMed&cmd=Search&doptcmdl=Citation&defaultField=Title+Word&term=Triphosgene+as+highly+efficient+reagent+for+the+solid-phase+coupling+of+N-alkylated+amino+acids&#8212;total+synthesis+of+cyclosporin+O.">Triphosgene as highly efficient reagent for the solid-phase coupling of N-alkylated amino acids&#8212;total synthesis of cyclosporin O.</a> Tetrahedron Letters. 43, 5013-5016 (2002).</li><li>Sleebs, M. M., Scanlon, D., Karas, J., Maharani, R., Hughes, A. B. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/query.fcgi?db=PubMed&cmd=Search&doptcmdl=Citation&defaultField=Title+Word&term=Total+Synthesis+of+the+Antifungal+Depsipeptide+Petriellin+A.">Total Synthesis of the Antifungal Depsipeptide Petriellin A.</a> J Org Chem. 76, 6686-6693 (2011).</li><li>Vaisar, T., Urban, J. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/query.fcgi?db=PubMed&cmd=Search&doptcmdl=Citation&defaultField=Title+Word&term=Gas-phase+fragmentation+of+protonated+mono-N-methylated+peptides.+Analogy+with+solution-phase+acid-catalyzed+hydrolysis.">Gas-phase fragmentation of protonated mono-N-methylated peptides. Analogy with solution-phase acid-catalyzed hydrolysis.</a> Journal of Mass Spectrometry. 33, 505-524 (1998).</li><li>Creighton, C. J., Romoff, T. T., Bu, J. H., Goodman, M. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/query.fcgi?db=PubMed&cmd=Search&doptcmdl=Citation&defaultField=Title+Word&term=Mechanistic+studies+of+an+unusual+amide+bond+scission.">Mechanistic studies of an unusual amide bond scission.</a> Journal of the American Chemical Society. 121, 6786-6791 (1999).</li><li>Sewald, N., Sewald, N. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/query.fcgi?db=PubMed&cmd=Search&doptcmdl=Citation&defaultField=Title+Word&term=Efficient,+racemization-free+peptide+coupling+of+N-alkyl+amino+acids+by+using+amino+acid+chlorides+generated+in+situ--total+syntheses+of+the+cyclopeptides+cyclosporin+O+and+omphalotin+A.">Efficient, racemization-free peptide coupling of N-alkyl amino acids by using amino acid chlorides generated in situ--total syntheses of the cyclopeptides cyclosporin O and omphalotin A.</a> Angewandte Chemie (International ed. in English). 41, 4661-4663 (2002).</li><li>Astle, J. M., et al. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/query.fcgi?db=PubMed&cmd=Search&doptcmdl=Citation&defaultField=Title+Word&term=Seamless+Bead+to+Microarray+Screening:+Rapid+Identification+of+the+Highest+Affinity+Protein+Ligands+from+Large+Combinatorial+Libraries.">Seamless Bead to Microarray Screening: Rapid Identification of the Highest Affinity Protein Ligands from Large Combinatorial Libraries.</a> Chem Biol. 17, 38-45 (2010).</li><li>Strohalm, M., Kavan, D., Novak, P., Volny, M., Havlicek, V. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/query.fcgi?db=PubMed&cmd=Search&doptcmdl=Citation&defaultField=Title+Word&term=mMass+3:+a+cross-platform+software+environment+for+precise+analysis+of+mass+spectrometric+data.">mMass 3: a cross-platform software environment for precise analysis of mass spectrometric data.</a> Anal Chem. 82, 4648-4651 (2010).</li></ol>

पेप्टाइड तृतीयक amides (पीटीए) peptidomimetic oligomers की एक superfamily हैं. अच्छी तरह से अध्ययन पेप्टाइड्स, peptoids और एन methylated पेप्टाइड्स इसके अलावा, इस परिवार के भीतर यौगिकों का एक बड़ा हिस्सा एक किराए के कारण जनरल एन alkylated पेप्टाइड्?...

Peptidomimetics प्राकृतिक पेप्टाइड्स की संरचना की नकल है कि यौगिक हैं. वे proteolysis 1-3 खिलाफ सेल पारगम्यता और स्थिरता सहित प्राकृतिक पेप्टाइड्स, से जुड़ी समस्याओं में से कुछ पर काबू पाने, जबकि bioactivity बनाए रखने के लिए तैयार कर रहे हैं. कारण इन यौगिकों के oligomeric प्रकृति को, बड़े सिंथेटिक पुस्तकालयों आसानी मोनोमेरिक या उप मोनोमेरिक सिंथेटिक मार्गों 4-7 के माध्यम से पहुँचा जा सकता है. Peptidomimetics की सबसे अधिक अध्ययन वर्गों में से एक peptoids है. Peptoids एक उप मोनोमर रणनीति 8, 9 का उपयोग आसानी से संश्लेषित किया जा सकता है कि एन alkylated glycines की oligomers हैं. कई उपयोगी प्रोटीन ligands सफलतापूर्वक प्रोटीन लक्ष्य 1, 10-14 के खिलाफ बड़े सिंथेटिक peptoid पुस्तकालयों स्क्रीनिंग से पहचान की गई है. बहरहाल, peptoid पुस्तकालयों से पहचान की &#39;हिट&#39; शायद ही कभी प्रोटीन लक्ष्य 1,10-14,22 की दिशा में बहुत अधिक समानता संग्रह. एक माjor peptoids और प्राकृतिक पेप्टाइड्स के बीच अंतर peptoids की सबसे आम तौर पर कारण chiral केन्द्रों और गठनात्मक की कमी की कमी के लिए माध्यमिक संरचना के रूप में करने की क्षमता की कमी है. इस समस्या को हल करने के लिए, कई रणनीतियों काफी हद तक मुख्य श्रृंखला नाइट्रोजन परमाणुओं 15-22 पर निहित पक्ष श्रृंखला के संशोधन पर ध्यान केंद्रित, पिछले एक दशक में विकसित किया गया. हाल ही में, हम पेप्टाइड तृतीयक amides 23 बनाने के लिए एक peptoid रीढ़ की हड्डी पर प्राकृतिक एमिनो एसिड पक्ष श्रृंखला शुरू करने की एक नई सिंथेटिक मार्ग विकसित किया है. पेप्टाइड तृतीयक amides (पीटीए) शामिल हैं, लेकिन पेप्टाइड (नि. = 2 एच), peptoids (नि. = 1 एच) और एन methylated पेप्टाइड्स तक सीमित नहीं हैं कि peptidomimetics की एक सुपर परिवार हैं (आर 1 ≠ एच, 2 आर मुझे =) . हमारे सिंथेटिक मार्ग स्वाभाविक रूप पर दाहिनी ओर और पक्ष श्रृंखला के स्रोत के रूप में एमिनो एसिड होने वाली रोजगार (चित्रा 1 देखें)45, कार्बन, और एन प्रतिस्थापन प्रदान करने के लिए व्यावसायिक रूप से उपलब्ध प्राथमिक amines. इसलिए, सरल पेप्टाइड्स, peptoids या एन methylated पेप्टाइड्स की तुलना में एक बड़ा रासायनिक अंतरिक्ष का पता लगाया जा सकता है. परिपत्र dichroism स्पेक्ट्रा कि पीटीए अणुओं अत्यधिक समाधान में संरचित कर रहे हैं पता चला है. पीटीए प्रोटीन परिसरों में से एक की विशेषता स्पष्ट रूप से पीटीए के गठनात्मक की कमी बाइंडिंग के लिए आवश्यक हैं कि पता चलता है. हाल ही में, हम भी पीटीए अणुओं में से कुछ उनके peptoid और पेप्टाइड समकक्षों की तुलना में सुधार सेल पारगम्यता के अधिकारी उस खोज की है. हम इन पीटीए पुस्तकालयों प्रोटीन लक्ष्य के लिए उच्च आत्मीयता ligands का एक अच्छा स्रोत हो सकता है. इस पत्र में, हम एक नमूना इन यौगिकों के युग्मन और दरार के लिए कुछ सुधार शर्तों के साथ विवरण में एक मनका एक यौगिक (OBOC) पीटीए पुस्तकालय का संश्लेषण पर चर्चा करेंगे.

<table border="0" cellpadding="0" cellspacing="0" width="889">
	<tbody>
		<tr height="21">
			<td height="21" style="height:21px;width:249px;">2,4,6 trimethylpyridine</td>
			<td style="width:169px;">ACROS</td>
			<td style="width:160px;">161950010</td>
			<td style="width:311px;">CAS:108-75-8</td>
		</tr>
		<tr height="21">
			<td height="21" style="height:21px;width:249px;">2-morpholinoethanamine</td>
			<td style="width:169px;">Sigma-Aldrich</td>
			<td style="width:160px;">06680&#160;</td>
			<td>CAS:2038-03-1&#160;&#160;</td>
		</tr>
		<tr height="21">
			<td height="21" style="height:21px;width:249px;">48% HBr Water solution</td>
			<td style="width:169px;">ALFA AESAR</td>
			<td style="width:160px;">AA14036AT</td>
			<td>CAS:10035-10-6</td>
		</tr>
		<tr height="21">
			<td height="21" style="height:21px;width:249px;">Acetaldehyde</td>
			<td style="width:169px;">Sigma-Aldrich</td>
			<td style="width:160px;">402788</td>
			<td>CAS:75-07-0&#160;&#160;</td>
		</tr>
		<tr height="21">
			<td height="21" style="height:21px;width:249px;">Acetonitrile</td>
			<td style="width:169px;">Fisher</td>
			<td style="width:160px;">SR015AA-19PS</td>
			<td>CAS:75-05-8</td>
		</tr>
		<tr height="21">
			<td height="21" style="height:21px;width:249px;">Anhydrous Tetrahydrofuran (THF)</td>
			<td style="width:169px;">EMD</td>
			<td style="width:160px;">EM-TX0277-6&#160;</td>
			<td>CAS:109-99-9</td>
		</tr>
		<tr height="21">
			<td height="21" style="height:21px;width:249px;">Benzylamine</td>
			<td style="width:169px;">Sigma-Aldrich</td>
			<td style="width:160px;">185701</td>
			<td>CAS:100-46-9</td>
		</tr>
		<tr height="21">
			<td height="21" style="height:21px;width:249px;">bis(trichloromethyl) carbonate (BTC)</td>
			<td style="width:169px;">ACROS</td>
			<td style="width:160px;">258950050</td>
			<td>CAS:32315-10-9</td>
		</tr>
		<tr height="21">
			<td height="21" style="height:21px;width:249px;">Bromoacetic acid</td>
			<td style="width:169px;">ACROS</td>
			<td style="width:160px;">106570010</td>
			<td>CAS:79-08-3</td>
		</tr>
		<tr height="21">
			<td height="21" style="height:21px;width:249px;">Chloranil</td>
			<td style="width:169px;">Sigma-Aldrich</td>
			<td style="width:160px;">23290</td>
			<td>CAS:118-75-2</td>
		</tr>
		<tr height="21">
			<td height="21" style="height:21px;width:249px;">Cyclohexanemethylamine</td>
			<td style="width:169px;">Sigma-Aldrich</td>
			<td style="width:160px;">101842</td>
			<td>CAS:3218-02-8</td>
		</tr>
		<tr height="20">
			<td height="20" style="height:21px;">D2O</td>
			<td style="width:169px;">Cambridge Isotope</td>
			<td style="width:160px;">DLM-4-99.8-1000</td>
			<td>CAS:7789-20-0</td>
		</tr>
		<tr height="20">
			<td height="20" style="height:21px;width:249px;">D-alanine</td>
			<td style="width:169px;">Anaspec</td>
			<td style="width:160px;">61387-100</td>
			<td>CAS:338-69-2&#160;&#160;</td>
		</tr>
		<tr height="20">
			<td height="20" style="height:21px;width:249px;">Dichloromethane (DCM)</td>
			<td style="width:169px;">Fisher</td>
			<td style="width:160px;">BJ-NS300-20</td>
			<td>CAS:75-09-2</td>
		</tr>
		<tr height="20">
			<td height="20" style="height:21px;width:249px;">Dimethylformamide (DMF)</td>
			<td style="width:169px;">Fisher</td>
			<td style="width:160px;">BJ-076-4</td>
			<td>CAS:68-12-2</td>
		</tr>
		<tr height="20">
			<td height="20" style="height:21px;width:249px;">Ethylene glycol</td>
			<td style="width:169px;">Oakwood</td>
			<td style="width:160px;">44710</td>
			<td>CAS:107-21-1</td>
		</tr>
		<tr height="20">
			<td height="20" style="height:21px;width:249px;">Isopentylamine</td>
			<td style="width:169px;">Sigma-Aldrich</td>
			<td style="width:160px;">W321907</td>
			<td>CAS:107-85-7</td>
		</tr>
		<tr height="20">
			<td height="20" style="height:21px;width:249px;">KBr</td>
			<td style="width:169px;">ACROS</td>
			<td style="width:160px;">424070025</td>
			<td>CAS:7758-02-3</td>
		</tr>
		<tr height="20">
			<td height="20" style="height:21px;width:249px;">L-alanine</td>
			<td style="width:169px;">Anaspec</td>
			<td style="width:160px;">61385-100</td>
			<td>CAS:56-41-7&#160;</td>
		</tr>
		<tr height="20">
			<td height="20" style="height:21px;width:249px;">3-Methoxypropylamine</td>
			<td style="width:169px;">Sigma-Aldrich</td>
			<td style="width:160px;">M25007</td>
			<td>CAS:5332-73-0</td>
		</tr>
		<tr height="20">
			<td height="20" style="height:21px;width:249px;">2-Methoxyethylamine</td>
			<td style="width:169px;">Sigma-Aldrich</td>
			<td style="width:160px;">143693</td>
			<td>CAS:109-85-3</td>
		</tr>
		<tr height="20">
			<td height="20" style="height:21px;width:249px;">N-(3-Aminopropyl)-2-pyrrolidinone</td>
			<td style="width:169px;">Sigma-Aldrich</td>
			<td style="width:160px;">136565&#160;</td>
			<td>CAS:7663-77-6&#160;</td>
		</tr>
		<tr height="20">
			<td height="20" style="height:21px;width:249px;">N,N&#39;-Diisopropylcarbodiimide (DIC)</td>
			<td style="width:169px;">ACROS</td>
			<td style="width:160px;">115211000</td>
			<td>CAS:693-13-0</td>
		</tr>
		<tr height="20">
			<td height="20" style="height:21px;width:249px;">N,N-Diisopropylethylamine (DIPEA)</td>
			<td style="width:169px;">Sigma-Aldrich</td>
			<td style="width:160px;">D125806</td>
			<td>CAS:7087-68-5</td>
		</tr>
		<tr height="20">
			<td height="20" style="height:21px;">NaNO2</td>
			<td style="width:169px;">ACROS</td>
			<td style="width:160px;">424340010</td>
			<td>CAS:7631-99-4</td>
		</tr>
		<tr height="20">
			<td height="20" style="height:21px;width:249px;">NAOD 40% solution in water</td>
			<td style="width:169px;">ACROS</td>
			<td style="width:160px;">200058-506</td>
			<td>CAS:7732-18-5</td>
		</tr>
		<tr height="21">
			<td height="21" style="height:21px;width:249px;">Piperidine</td>
			<td style="width:169px;">ALFA AESAR</td>
			<td style="width:160px;">A12442-AE</td>
			<td>CAS:110-89-4</td>
		</tr>
		<tr height="21">
			<td height="21" style="height:21px;width:249px;">Piperonylamine</td>
			<td style="width:169px;">Sigma-Aldrich</td>
			<td style="width:160px;">P49503&#160;</td>
			<td>CAS:2620-50-0</td>
		</tr>
		<tr height="21">
			<td height="21" style="height:21px;width:249px;">Propylamine</td>
			<td style="width:169px;">Sigma-Aldrich</td>
			<td style="width:160px;">240958</td>
			<td>CAS:107-10-8</td>
		</tr>
		<tr height="21">
			<td height="21" style="height:21px;width:249px;">Trifluoroacetic acid</td>
			<td style="width:169px;">Sigma-Aldrich</td>
			<td style="width:160px;">299537</td>
			<td>CAS:76-05-1</td>
		</tr>
		<tr height="21">
			<td height="21" style="height:21px;width:249px;">&#945;-Cyano-4-hydroxycinnamic acid&#160;</td>
			<td style="width:169px;">Sigma-Aldrich</td>
			<td style="width:160px;">39468</td>
			<td>CAS:28166-41-8&#160;&#160;</td>
		</tr>
		<tr height="21">
			<td height="21" style="height:21px;width:249px;">&#945;-ketoglutarate</td>
			<td style="width:169px;">ALFA AESAR</td>
			<td style="width:160px;">AAA10256-22</td>
			<td style="width:311px;">CAS:328-50-7</td>
		</tr>
		<tr height="21">
			<td height="21" style="height:21px;width:249px;">Tentagel Resin with RINK linker</td>
			<td style="width:169px;">Rapp-Polymere</td>
			<td style="width:160px;">S30023</td>
			<td></td>
		</tr>
		<tr height="21">
			<td height="21" style="height:21px;width:249px;">Alanine transaminase</td>
			<td style="width:169px;">Roche</td>
			<td style="width:160px;">10105589001</td>
			<td>AKA: Glutamate-Pyruvate Transaminase (GPT)</td>
		</tr>
		<tr height="42">
			<td height="42" style="height:42px;width:249px;">Incubator</td>
			<td style="width:169px;">New Brunswick Scientific</td>
			<td style="width:160px;">Innova44</td>
			<td></td>
		</tr>
		<tr height="21">
			<td height="21" style="height:21px;width:249px;">NMR</td>
			<td style="width:169px;">Bruker</td>
			<td style="width:160px;">400MHz</td>
			<td></td>
		</tr>
		<tr height="21">
			<td height="21" style="height:21px;width:249px;">MALDI mass spectrometer</td>
			<td style="width:169px;">Applied Biosystems&#160;</td>
			<td style="width:160px;">4800 MALDI-TOF/TOF</td>
			<td></td>
		</tr>
		<tr height="21">
			<td height="21" style="height:21px;width:249px;">Lyophilizer</td>
			<td style="width:169px;">SP Scientific</td>
			<td style="width:160px;">VirTis benchtop K</td>
			<td></td>
		</tr>
		<tr height="21">
			<td height="21" style="height:21px;width:249px;">Syringe reactor</td>
			<td style="width:169px;">INTAVIS&#160;</td>
			<td style="width:160px;">Reaction Column</td>
			<td>3ml, 5ml, 10ml, 20ml</td>
		</tr>
		<tr height="21">
			<td height="21" style="height:21px;width:249px;">Vacuum manifold&#160;</td>
			<td style="width:169px;">Promega</td>
			<td style="width:160px;">A7231</td>
			<td>Vac-Man</td>
		</tr>
	</tbody>
</table>

split-and-pool synthesis and characterization of peptide tertiary amide library

Peptidomimetics प्रोटीन ligands के महान स्रोत हैं. इन यौगिकों के oligomeric प्रकृति मिश्रित रसायन का उपयोग करके ठोस चरण पर बड़ी सिंथेटिक पुस्तकालयों का उपयोग करने के लिए सक्षम बनाता है. Peptidomimetics की सबसे अच्छी तरह से अध्ययन वर्गों में से एक peptoids है. Peptoids synthesize करने के लिए आसान कर रहे हैं और proteolysis प्रतिरोधी और सेल पारगम्य होना दिखाया गया है. पिछले दशक के दौरान, कई उपयोगी प्रोटीन ligands peptoid पुस्तकालयों की स्क्रीनिंग के माध्यम से पहचान की गई है. हालांकि, peptoid पुस्तकालयों से पहचान ligands की सबसे दुर्लभ अपवाद के साथ, उच्च आत्मीयता प्रदर्शित नहीं करते. इस peptoid अणुओं में chiral केन्द्रों और गठनात्मक की कमी की कमी के हिस्से में होने के कारण हो सकता है. हाल ही में, हम पेप्टाइड तृतीयक amides (पीटीए) का उपयोग करने के लिए एक नई सिंथेटिक मार्ग का वर्णन किया. पीटीए शामिल हैं, लेकिन पेप्टाइड्स, peptoids और एन methylated पेप्टाइड्स तक सीमित नहीं हैं कि peptidomimetics की एक superfamily हैं. Α कार्बन और मुख्य श्रृंखला नाइट्रोजन परमाणुओं दोनों पर पक्ष श्रृंखला के साथ,इन अणुओं की रचना बहुत sterical बाधा और allylic 1,3 तनाव से विवश कर रहे हैं. (चित्रा 1) हमारे अध्ययन से इन पीटीए अणुओं अत्यधिक समाधान में संरचित कर रहे हैं और प्रोटीन ligands की पहचान करने के लिए इस्तेमाल किया जा सकता है. हम इन अणुओं उच्च आत्मीयता प्रोटीन ligands की एक भविष्य स्रोत हो सकता है. यहाँ हम एक नमूना पीटीए की एक मनका एक यौगिक (OBOC) पुस्तकालय synthesize करने के लिए विभाजन और पूल और उप मोनोमर रणनीतियों दोनों की शक्ति के संयोजन कृत्रिम विधि का वर्णन है.

यहाँ हम linker के साथ एक पीटीए trimer से तीन प्रतिनिधि MALDI स्पेक्ट्रम दिखा. चित्रा 6A में दिखाया गया है 50% TFA / डीसीएम समाधान का उपयोग कर कमरे के तापमान के तहत cleaved जब, महत्वपूर्ण गिरावट मनाया जाता है. चित्रा 6A</st...

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Split-and-pool Synthesis and Characterization of Peptide Tertiary Amide Library

पेप्टाइड तृतीयक amides (पीटीए) शामिल हैं, लेकिन पेप्टाइड्स, peptoids और एन methylated पेप्टाइड्स तक सीमित नहीं हैं कि peptidomimetics की एक superfamily हैं. यहाँ हम पीटीए की एक एक मनका एक यौगिक पुस्तकालय synthesize करने के लिए विभाजन और पूल और उप मोनोमर रणनीतियों दोनों को जोड़ती है जो एक कृत्रिम विधि का वर्णन है.

भाजित और पूल संश्लेषण और पेप्टाइड तृतीयक Amide लाइब्रेरी की विशेषता

Peptidomimetics are great sources of protein ligands. The oligomeric nature of these compounds enables us to access large synthetic libraries on solid ...

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