Name: in situ characterization of hydrated proteins in water by salvi and tof-sims
Uploaded: 2016-02-15T15:00:00
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We are grateful to the Pacific Northwest National Laboratory (PNNL) Chemical Imaging Initiative-Laboratory Directed Research and Development (CII-LDRD) and Materials Synthesis and Simulation across Scales (MS3) Initiative LDRD fund for support. Instrumental access was provided through a W. R. Wiley Environmental Molecular Sciences Laboratory (EMSL) Science Themed Proposal. EMSL is a national scientific user facility sponsored by the Office of Biological and Environmental Research (BER) at PNNL. The authors thank Mr. Xiao Sui, Mr. Yuanzhao Ding, and Ms. Juan Yao for proof reading the manuscript and providing useful feedback. PNNL is operated by Battelle for the DOE under Contract DE-AC05-76RL01830.

1. सफाई और साल्वी Microchannel का बंध्याकरण <ol><li> सालवी में Microchannel का बंध्याकरण <ol><li> एक सिरिंज में 70% इथेनॉल के जलीय समाधान के 2 मिलीलीटर ड्रा, साल्वी के इनलेट अंत के साथ सिरिंज कनेक्ट है, और धीरे-धीरे 10 मिनट में तरल के 1 ?...

<ol>
	<li>Tompa, K., Bokor, M., Verebelyi, T., Tompa, P. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/query.fcgi?db=PubMed&cmd=Search&doptcmdl=Citation&defaultField=Title+Word&term=Water+rotation+barriers+on+protein+molecular+surfaces.">Water rotation barriers on protein molecular surfaces.</a> Chem. Phys. 448, 15-25 (2015).</li><li>Maruyama, Y., Harano, Y. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/query.fcgi?db=PubMed&cmd=Search&doptcmdl=Citation&defaultField=Title+Word&term=Does+water+drive+protein+folding?.">Does water drive protein folding?.</a> Chem. Phys. Lett. 581, 85-90 (2013).</li><li>Chaplin, M. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/query.fcgi?db=PubMed&cmd=Search&doptcmdl=Citation&defaultField=Title+Word&term=Opinion+-+Do+we+underestimate+the+importance+of+water+in+cell+biology.">Opinion - Do we underestimate the importance of water in cell biology.</a> Nat. Rev. Mol. Cell Biol. 7 (11), 861-866 (2006).</li><li>Zhang, L., et al. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/query.fcgi?db=PubMed&cmd=Search&doptcmdl=Citation&defaultField=Title+Word&term=Mapping+hydration+dynamics+around+a+protein+surface.">Mapping hydration dynamics around a protein surface.</a> Proc. Natl. Acad. Sci. U. S. A. 104 (47), 18461-18466 (2007).</li><li>Xia, N., May, C. J., McArthur, S. L., Castner, D. G. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/query.fcgi?db=PubMed&cmd=Search&doptcmdl=Citation&defaultField=Title+Word&term=Time-of-flight+secondary+ion+mass+spectrometry+analysis+of+conformational+changes+in+adsorbed+protein+films.">Time-of-flight secondary ion mass spectrometry analysis of conformational changes in adsorbed protein films.</a> Langmuir. 18 (10), 4090-4097 (2002).</li><li>Gray, J. J. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/query.fcgi?db=PubMed&cmd=Search&doptcmdl=Citation&defaultField=Title+Word&term=The+interaction+of+proteins+with+solid+surfaces.">The interaction of proteins with solid surfaces.</a> Curr. Opin. Struct. Biol. 14 (1), 110-115 (2004).</li><li>Wagner, M. S., Horbett, T. A., Castner, D. G. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/query.fcgi?db=PubMed&cmd=Search&doptcmdl=Citation&defaultField=Title+Word&term=Characterization+of+the+structure+of+binary+and+ternary+adsorbed+protein+films+using+electron+spectroscopy+for+chemical+analysis,+time-of-flight+secondary+ion+mass+spectrometry,+and+radiolabeling.">Characterization of the structure of binary and ternary adsorbed protein films using electron spectroscopy for chemical analysis, time-of-flight secondary ion mass spectrometry, and radiolabeling.</a> Langmuir. 19 (5), 1708-1715 (2003).</li><li>Yang, L., Yu, X. -. Y., Zhu, Z., Iedema, M. J., Cowin, J. P. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/query.fcgi?db=PubMed&cmd=Search&doptcmdl=Citation&defaultField=Title+Word&term=Probing+liquid+surfaces+under+vacuum+using+SEM+and+and+ToF-SIMS.">Probing liquid surfaces under vacuum using SEM and and ToF-SIMS.</a> Lab Chip. 11 (15), 2481-2484 (2011).</li><li>Yang, L., Yu, X. -. Y., Zhu, Z. H., Thevuthasan, T., Cowin, J. P. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/query.fcgi?db=PubMed&cmd=Search&doptcmdl=Citation&defaultField=Title+Word&term=Making+a+hybrid+microfluidic+platform+compatible+for+in+situ+imaging+by+vacuum-based+techniques.">Making a hybrid microfluidic platform compatible for in situ imaging by vacuum-based techniques.</a> J. Vac. Sci. Technol. A. 29 (6), 061101 (2011).</li><li>Yu, X. -. Y., Yang, L., Zhu, Z. H., Cowin, J. P., Iedema, M. J. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/query.fcgi?db=PubMed&cmd=Search&doptcmdl=Citation&defaultField=Title+Word&term=Probing+aqueous+surfaces+by+ToF-SIMS.">Probing aqueous surfaces by ToF-SIMS.</a> LC GC N. Am. (Oct), 34-38 (2011).</li><li>Yu, X. -. Y., Yang, L., Cowin, J., Iedema, M., Zhu, Z. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/query.fcgi?db=PubMed&cmd=Search&doptcmdl=Citation&defaultField=Title+Word&term=Systems+and+methods+for+analyzing+liquids+under+vacuum.">Systems and methods for analyzing liquids under vacuum.</a> US patent. , (2013).</li><li>Yu, X. -. Y., Liu, B., Yang, L., Zhu, Z., Marshall, M. J. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/query.fcgi?db=PubMed&cmd=Search&doptcmdl=Citation&defaultField=Title+Word&term=Microfluidic+electrochemical+device+and+process+for+chemical+imaging+and+electrochemical+analysis+at+the+electrode-liquid+interface+in+situ.">Microfluidic electrochemical device and process for chemical imaging and electrochemical analysis at the electrode-liquid interface in situ.</a> US patent. , (2014).</li><li>Yang, L., Zhu, Z., Yu, X. -. Y., Thevuthasan, S., Cowin, J. P. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/query.fcgi?db=PubMed&cmd=Search&doptcmdl=Citation&defaultField=Title+Word&term=Performance+of+a+microfluidic+device+for+in+situ+ToF-SIMS+analysis+of+selected+organic+molecules+at+aqueous+surfaces.">Performance of a microfluidic device for in situ ToF-SIMS analysis of selected organic molecules at aqueous surfaces.</a> Anal. Methods. 5 (10), 2515-2522 (2013).</li><li>Yang, L., et al. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/query.fcgi?db=PubMed&cmd=Search&doptcmdl=Citation&defaultField=Title+Word&term=In+situ+SEM+and+ToF-SIMS+analysis+of+IgG+conjugated+gold+nanoparticles+at+aqueous+surfaces.">In situ SEM and ToF-SIMS analysis of IgG conjugated gold nanoparticles at aqueous surfaces.</a> Surf. Interface Anal. 46 (4), 224-228 (2014).</li><li>Hua, X., et al. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/query.fcgi?db=PubMed&cmd=Search&doptcmdl=Citation&defaultField=Title+Word&term=In+situ+molecular+imaging+of+hydrated+biofilm+in+a+microfluidic+reactor+by+ToF-SIMS.">In situ molecular imaging of hydrated biofilm in a microfluidic reactor by ToF-SIMS.</a> Analyst. 139 (7), 1609-1613 (2014).</li><li>Hua, X., et al. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/query.fcgi?db=PubMed&cmd=Search&doptcmdl=Citation&defaultField=Title+Word&term=Two-dimensional+and+three-dimensional+dynamic+imaging+of+live+biofilms+in+a+microchannel+by+time-of-flight+secondary+ion+mass+spectrometry.">Two-dimensional and three-dimensional dynamic imaging of live biofilms in a microchannel by time-of-flight secondary ion mass spectrometry.</a> Biomicrofluidics. 9 (3), 031101 (2015).</li><li>Liu, B., et al. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/query.fcgi?db=PubMed&cmd=Search&doptcmdl=Citation&defaultField=Title+Word&term=In+situ+chemical+probing+of+the+electrode-electrolyte+interface+by+ToF-SIMS.">In situ chemical probing of the electrode-electrolyte interface by ToF-SIMS.</a> Lab Chip. 14 (5), 855-859 (2014).</li><li>Pankov, R., Yamada, K. M. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/query.fcgi?db=PubMed&cmd=Search&doptcmdl=Citation&defaultField=Title+Word&term=Fibronectin+at+a+glance.">Fibronectin at a glance.</a> J. Cell Sci. 115 (20), 3861-3863 (2002).</li><li>Pierschbacher, M. D., Hayman, E. G., Ruoslahti, E. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/query.fcgi?db=PubMed&cmd=Search&doptcmdl=Citation&defaultField=Title+Word&term=Location+of+the+cell-attachment+site+in+fibronectin+with+monoclonal+antibodies+and+proteolytic+fragments+of+the+molecule.">Location of the cell-attachment site in fibronectin with monoclonal antibodies and proteolytic fragments of the molecule.</a> Cell. 26 (2), 259-267 (1981).</li><li>Engvall, E., Ruoslahti, E. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/query.fcgi?db=PubMed&cmd=Search&doptcmdl=Citation&defaultField=Title+Word&term=Binding+of+soluble+form+of+fibroblast+surface+protein,+fibronectin,+to+collagen.">Binding of soluble form of fibroblast surface protein, fibronectin, to collagen.</a> Int. J. Cancer. 20 (1), 1-5 (1977).</li><li>Green, F. M., Gilmore, I. S., Seah, M. P. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/query.fcgi?db=PubMed&cmd=Search&doptcmdl=Citation&defaultField=Title+Word&term=TOF-SIMS:+Accurate+mass+scale+calibration.">TOF-SIMS: Accurate mass scale calibration.</a> J. Am. Soc. Mass Spectrom. 17 (4), 514-523 (2006).</li><li>Yu, X. -. Y., Liu, B., Yang, L. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/query.fcgi?db=PubMed&cmd=Search&doptcmdl=Citation&defaultField=Title+Word&term=Imaging+liquids+using+microfluidic+cells.">Imaging liquids using microfluidic cells.</a> Microfluid. Nanofluid. 15 (6), 725-744 (2013).</li><li>Shi, H., Lercher, J. A., Yu, X. -. Y. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/query.fcgi?db=PubMed&cmd=Search&doptcmdl=Citation&defaultField=Title+Word&term=Sailing+into+uncharted+waters:+recent+advances+in+the+in+situ+monitoring+of+catalytic+processes+in+aqueous+environments.">Sailing into uncharted waters: recent advances in the in situ monitoring of catalytic processes in aqueous environments.</a> Catal. Sci. Technol. 5 (6), 3035-3060 (2015).</li><li>Deleu, M., Crowet, J. M., Nasir, M. N., Lins, L. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/query.fcgi?db=PubMed&cmd=Search&doptcmdl=Citation&defaultField=Title+Word&term=Complementary+biophysical+tools+to+investigate+lipid+specificity+in+the+interaction+between+bioactive+molecules+and+the+plasma+membrane:+A+review.">Complementary biophysical tools to investigate lipid specificity in the interaction between bioactive molecules and the plasma membrane: A review.</a> Biochim. Biophys. Acta-Biomembr. 1838 (12), 3171-3190 (2014).</li><li>Kraft, M. L., Klitzing, H. A. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/query.fcgi?db=PubMed&cmd=Search&doptcmdl=Citation&defaultField=Title+Word&term=Imaging+lipids+with+secondary+ion+mass+spectrometry.">Imaging lipids with secondary ion mass spectrometry.</a> Biochim. Biophys. Acta Mol. Cell Biol. Lipids. 1841 (8), 1108-1119 (2014).</li><li>Gilmore, I. S. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/query.fcgi?db=PubMed&cmd=Search&doptcmdl=Citation&defaultField=Title+Word&term=SIMS+of+organics-Advances+in+2D+and+3D+imaging+and+future+outlook.">SIMS of organics-Advances in 2D and 3D imaging and future outlook.</a> J. Vac. Sci. Technol. A. 31 (5), 050819 (2013).</li><li>Muramoto, S., et al. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/query.fcgi?db=PubMed&cmd=Search&doptcmdl=Citation&defaultField=Title+Word&term=ToF-SIMS+Analysis+of+Adsorbed+Proteins:+Principal+Component+Analysis+of+the+Primary+Ion+Species+Effect+on+the+Protein+Fragmentation+Patterns.">ToF-SIMS Analysis of Adsorbed Proteins: Principal Component Analysis of the Primary Ion Species Effect on the Protein Fragmentation Patterns.</a> J. Phys. Chem. C. 115 (49), 24247-24255 (2011).</li><li>Br&#252;ning, C., Hellweg, S., Dambach, S., Lipinsky, D., Arlinghaus, H. F. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/query.fcgi?db=PubMed&cmd=Search&doptcmdl=Citation&defaultField=Title+Word&term=Improving+the+interpretation+of+ToF-SIMS+measurements+on+adsorbed+proteins+using+PCA.">Improving the interpretation of ToF-SIMS measurements on adsorbed proteins using PCA.</a> Surf. Interface Anal. 38 (4), 191-193 (2006).</li><li>Gustavsson, J., et al. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/query.fcgi?db=PubMed&cmd=Search&doptcmdl=Citation&defaultField=Title+Word&term=Surface+modifications+of+silicon+nitride+for+cellular+biosensor+applications.">Surface modifications of silicon nitride for cellular biosensor applications.</a> J. Mater. Sci.-Mater. Med. 19 (4), 1839-1850 (2008).</li><li>Deng, J., Ren, T. C., Zhu, J. Y., Mao, Z. W., Gao, C. Y. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/query.fcgi?db=PubMed&cmd=Search&doptcmdl=Citation&defaultField=Title+Word&term=Adsorption+of+plasma+proteins+and+fibronectin+on+poly(hydroxylethyl+methacrylate)+brushes+of+different+thickness+and+their+relationship+with+adhesion+and+migration+of+vascular+smooth+muscle+cells.">Adsorption of plasma proteins and fibronectin on poly(hydroxylethyl methacrylate) brushes of different thickness and their relationship with adhesion and migration of vascular smooth muscle cells.</a> Regen Biomater. , 17-25 (2014).</li></ol>

सालवी एक microfluidic इंटरफेस है कि इस तरह के TOF-एस और स्कैनिंग इलेक्ट्रॉन माइक्रोस्कोपी (SEM) के रूप में वैक्यूम आधारित उपकरणों, गतिशील द्वारा तरल सतह और तरल ठोस इंटरफेस विश्लेषण की अनुमति देता है। कारण छोटे छिद?...

जलयोजन संरचना, 1 रचना, 2 और प्रोटीन की जैविक गतिविधि 3 के लिए महत्वपूर्ण है। उन्हें आसपास के पानी के अणुओं के बिना प्रोटीन व्यवहार्य जैविक गतिविधियों के लिए नहीं होता। विशेष रूप से, पानी के अणुओं को सतह और प्रोटीन की आंतरिक संरचना के साथ बातचीत, और प्रोटीन के विभिन्न राज्यों हाइड्रेशन ऐसी बातचीत अलग बनाते हैं। 4 ठोस सतहों के साथ प्रोटीन की बातचीत नैनो, biomaterials और ऊतक इंजीनियरिंग प्रक्रियाओं में प्रभाव के साथ एक मौलिक घटना है। अध्ययनों से पता लंबे समय से एक प्रोटीन के रूप में एक सतह का सामना करना पड़ता गठनात्मक परिवर्तन हो सकता है कि संकेत दिया है। TOF-एस तकनीक प्रोटीन ठोस इंटरफेस का अध्ययन करने की क्षमता है कि के रूप में कल्पना की गई है। यह ठोस सतहों 5-7, जो संभवतः उनकी संरचना की व्यवस्था की एक बुनियादी समझ प्रदान करता है पर प्रोटीन के हाइड्रेशन समझने के लिए महत्वपूर्ण है, रचना, और जीवविज्ञानअल गतिविधि। हालांकि, प्रमुख सतह विश्लेषणात्मक तकनीकों ज्यादातर वैक्यूम आधारित होते हैं और वाष्पशील तरल के अध्ययन के लिए सीधे आवेदन निर्वात वातावरण के तहत अस्थिर तरल का तेजी से वाष्पीकरण के कारण मुश्किल हो जाता है। हम एक निर्वात संगत microfluidic इंटरफेस प्रणाली विश्लेषण के लिए तरल वैक्यूम इंटरफेस (सालवी) में, तरल सतहों और तरल ठोस बातचीत समय की उड़ान माध्यमिक आयन मास स्पेक्ट्रोमेट्री (TOF-एस) का उपयोग करने का सीधा टिप्पणियों सक्षम करने के लिए विकसित की है,। 8 , 2) सतह तनाव, एपर्चर के भीतर तरल धारण करने के लिए प्रयोग किया जाता है 1) का पता लगाने खिड़की तरल सतह के प्रत्यक्ष इमेजिंग की अनुमति के व्यास में 2-3 माइक्रोन का एक छेद है और 3) सालवी है: 11 अद्वितीय पहलुओं में निम्नलिखित शामिल कई विश्लेषणात्मक प्लेटफार्मों के बीच पोर्टेबल। 11,12 सालवी का पता लगाने क्षेत्र और एक microchannel polydimethylsiloxane (PDMS) से बना के रूप में एक सिलिकॉन नाइट्राइड (पाप) झिल्ली से बना है। यह fabr हैसाफ कमरे में icated, और निर्माण और महत्वपूर्ण डिजाइन कारकों पिछले कागजात और पेटेंट में विस्तृत किया गया है। 8-12 एक विश्लेषणात्मक उपकरण के रूप में TOF-एस के आवेदनों जलीय समाधान और जटिल तरल मिश्रण, कुछ की एक किस्म का उपयोग प्रदर्शन किया गया जो नैनोकणों निहित। 13-17 विशेष रूप से, साल्वी तरल TOF-एस को लाइव जैविक प्रणालियों (यानी, biofilms), एकल कक्षों, और ठोस इलेक्ट्रोलाइट इंटरफेस के तरल ठोस इंटरफेस की जांच कर रही गतिशील अनुमति देता है, सीटू सघन चरण में के लिए नए अवसर खोलने TOF-एस का उपयोग कर तरल पदार्थ सहित अध्ययन करता है। हालांकि, मौजूदा डिजाइन अभी तक गैस तरल बातचीत की अनुमति नहीं देता। यह भविष्य के विकास के लिए एक दिशा है। साल्वी ने पहली बार इस काम में हाइड्रेटेड प्रोटीन फिल्म अध्ययन करने के लिए इस्तेमाल किया गया है। फ़ाइब्रोनेक्टिन आमतौर पर इस्तेमाल किया प्रोटीन डिमर है, दो लगभग समान डाइसल्फ़ाइड बांड की एक जोड़ी से जुड़े monomers, 18 से मिलकर जो मैंकोशिकाओं के लिए बाध्य करने की क्षमता के लिए जाना जाता रहा है। 19,20 यह एक मॉडल प्रणाली के रूप में चुना गया था वर्णन करने के लिए है कि हाइड्रेटेड प्रोटीन फिल्म गतिशील सालवी तरल TOF-एस दृष्टिकोण का उपयोग कर जांच की जा सकती है। प्रोटीन समाधान microchannel में पेश किया गया था। 12 घंटे के लिए incubating के बाद, एक हाइड्रेटेड प्रोटीन फिल्म पाप झिल्ली के पीछे की ओर का गठन। विआयनीकृत (डीआई) पानी प्रोटीन शुरूआत के बाद चैनल बंद कुल्ला करने के लिए इस्तेमाल किया गया था। सूचना हाइड्रेटेड गतिशील TOF-एस का उपयोग कर सालवी microchannel में फ़ाइब्रोनेक्टिन प्रोटीन अणुओं से एकत्र किया गया था। डि पानी भी एक नियंत्रण हाइड्रेटेड फ़ाइब्रोनेक्टिन पतली फिल्म से प्राप्त परिणामों के साथ तुलना करने के लिए के रूप में अध्ययन किया गया था। स्पष्ट मतभेद हाइड्रेटेड प्रोटीन फिल्म और डि पानी के बीच मनाया गया। इस काम को दर्शाता है कि तरल वातावरण में सतह पर प्रोटीन सोखना उपन्यास साल्वी और तरल TOF-एस दृष्टिकोण का उपयोग कर अध्ययन किया जा सकता है। वीडियो प्रोटोकॉल लोग हैं, जो रुचि रखते हैं के लिए तकनीकी मार्गदर्शन प्रदान करने का इरादा हैTOF-एस के साथ सालवी की विभिन्न अनुप्रयोगों के लिए इस नए विश्लेषणात्मक उपकरण के उपयोग और TOF-एस डाटा अधिग्रहण और विश्लेषण के रूप में के रूप में अच्छी तरह से तरल से निपटने में अनावश्यक गलतियों को कम करने में।

<table border="0" cellpadding="0" cellspacing="0" width="1170">
	<tbody>
		<tr height="20">
			<td height="20" style="height:20px;width:389px;">ToF-SIMS</td>
			<td style="width:260px;">IONTOF</td>
			<td style="width:121px;">TOF.SIMS 5</td>
			<td style="width:400px;">Resolution: &#62; 10,000 m/&#916;m for mass resolution; &#62; 4,000 m/&#916;m for high spatial resolution&#160;</td>
		</tr>
		<tr height="20">
			<td height="20" style="height:20px;width:389px;">System for Analysis at the Liquid Vacuum Interface (SALVI)</td>
			<td style="width:260px;">Pacific Northwest National Laboratory</td>
			<td style="width:121px;">N/A</td>
			<td style="width:400px;">SALVI is a unique, self-contained, portable analytical tool that, for the first time, enables vacuum-based scientific instruments such as time-of-flight secondary ion mass spectrometry (ToF-SIMS) to analyze liquid surfaces in their natural state at the molecular level.</td>
		</tr>
		<tr height="20">
			<td height="20" style="height:20px;width:389px;">PEEK Union</td>
			<td style="width:260px;">Valco</td>
			<td style="width:121px;">ZU1TPK</td>
			<td>for connecting the inlet and outlet of SALVI</td>
		</tr>
		<tr height="20">
			<td height="20" style="height:20px;width:389px;">5 Axes Sample Stage</td>
			<td style="width:260px;">IONTOF</td>
			<td style="width:121px;">N/A</td>
			<td>Stage is self-made for mounting SALVI in ToF-SIMS</td>
		</tr>
		<tr height="20">
			<td height="20" style="height:20px;width:389px;">Barnstead Nanopure Water Purification System</td>
			<td style="width:260px;">Thermo Fisher Scientific</td>
			<td style="width:121px;">D11921</td>
			<td>ROpure LP Reverse Osmosis filtration module (D2716)</td>
		</tr>
		<tr height="20">
			<td height="20" style="height:20px;width:389px;">Syringe</td>
			<td style="width:260px;">BD</td>
			<td style="width:121px;">309659</td>
			<td style="width:400px;">1 mL</td>
		</tr>
		<tr height="20">
			<td height="20" style="height:20px;width:389px;">Pipette</td>
			<td style="width:260px;">Thermo Fisher Scientific</td>
			<td style="width:121px;">21-377-821</td>
			<td>Range: 100 to 1000 mL</td>
		</tr>
		<tr height="20">
			<td height="20" style="height:20px;width:389px;">Pipette Tip</td>
			<td style="width:260px;">Neptune</td>
			<td style="width:121px;">2112.96.BS</td>
			<td>1000 &#181;L</td>
		</tr>
		<tr height="20">
			<td height="20" style="height:20px;width:389px;">Centrifuge Tube</td>
			<td style="width:260px;">Corning</td>
			<td style="width:121px;">430791</td>
			<td>15 mL</td>
		</tr>
		<tr height="20">
			<td height="20" style="height:20px;width:389px;">Fibronectin</td>
			<td style="width:260px;">Sigma-Aldrich</td>
			<td style="width:121px;">F1141</td>
			<td>1 mg/mL</td>
		</tr>
		<tr height="20">
			<td height="20" style="height:20px;width:389px;">Ethanol</td>
			<td style="width:260px;">Thermo Fisher Scientific</td>
			<td style="width:121px;">S25310A</td>
			<td>95% Denatured</td>
		</tr>
		<tr height="20">
			<td height="20" style="height:20px;width:389px;">Gibco PBS</td>
			<td style="width:260px;">Thermo Fisher Scientific</td>
			<td style="width:121px;">10010-023</td>
			<td>pH 7.4</td>
		</tr>
	</tbody>
</table>

in situ characterization of hydrated proteins in water by salvi and tof-sims

इस काम तरल वैक्यूम इंटरफेस (सालवी) और समय की उड़ान माध्यमिक आयन मास स्पेक्ट्रोमेट्री (TOF-एस) के विश्लेषण के लिए प्रणाली का उपयोग करते हुए जलीय घोल में प्रोटीन biomolecules के लक्षण वर्णन में सीटू को दर्शाता है। फ़ाइब्रोनेक्टिन प्रोटीन फिल्म सिलिकॉन नाइट्राइड (पाप) झिल्ली है कि सालवी का पता लगाने क्षेत्र रूपों पर स्थिर था। TOF-एस विश्लेषण के दौरान, विश्लेषण के तीन मोड उच्च स्थानिक संकल्प मास स्पेक्ट्रोमेट्री, दो आयामी (2 डी) इमेजिंग, और गहराई रूपरेखा सहित आयोजित की गई। जन स्पेक्ट्रा सकारात्मक और नकारात्मक दोनों मोड में हासिल किया गया। विआयनीकृत पानी भी एक संदर्भ के रूप में नमूना विश्लेषण किया गया था। हमारे परिणाम है कि पानी में फ़ाइब्रोनेक्टिन फिल्म अकेले पानी की तुलना में अधिक विशिष्ट और मजबूत पानी क्लस्टर चोटियों है दिखाने के लिए। एमिनो एसिड के टुकड़े की विशेषता चोटियों भी हाइड्रेटेड प्रोटीन TOF-एस स्पेक्ट्रा में प्रत्यक्ष कर रहे हैं। इन परिणामों के उदाहरण देकर स्पष्ट करना है कि एक सतह पर प्रोटीन अणु सोखना Dynamica अध्ययन किया जा सकताlly पहली बार के लिए तरल वातावरण में साल्वी और TOF-एस का उपयोग कर।

प्रतिनिधि परिणामों के एक जोड़े को प्रस्तावित प्रोटोकॉल के फायदे प्रदर्शित करने के लिए प्रस्तुत कर रहे हैं। सालवी microfluidic इंटरफ़ेस का उपयोग करके, प्राथमिक आयन बीम (द्विपक्षीय 3 +) सीधे...

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In Situ Characterization of Hydrated Proteins in Water by SALVI and ToF-SIMS

इस काम के बगल में समय की उड़ान माध्यमिक आयन मास स्पेक्ट्रोमेट्री प्रोटीन biomolecules के एक जलीय घोल में विश्लेषण के लिए एक microchannel के लिए तरल से निपटने और नमूना परिचय के लिए एक प्रोटोकॉल प्रस्तुत करता है।

साल्वी और TOF-एस द्वारा पानी में हाइड्रेटेड प्रोटीन की सीटू लक्षण वर्णन में

This work demonstrates in situ characterization of protein biomolecules in the aqueous solution using the System for Analysis at the Liquid Vacuum ...

Research

JoVE Journal

Chemistry

In Situ Characterization of Hydrated Proteins in Water by SALVI and ToF-SIMS

Submillisecond Conformational Changes in Proteins Resolved by Photothermal Beam Deflection

Photothermal बीम नीचे को झुकाव द्वारा हल प्रोटीन में Submillisecond गठनात्मक परिवर्तन

Photothermal beam deflection together with photo-acoustic calorimetry and thermal grating belongs to the family of photothermal methods that monitor the ...

In Situ SIMS and IR Spectroscopy of Well-defined Surfaces Prepared by Soft Landing of Mass-selected Ions

In Situ SIMS and IR Spectroscopy of Well-defined Surfaces Prepared by Soft Landing of Mass-selected Ions

जन चयनित आयनों की नरम लैंडिंग द्वारा तैयार अच्छी तरह से परिभाषित सतहों सीटू एस और आईआर स्पेक्ट्रोस्कोपी

Soft landing of mass-selected ions onto surfaces is a powerful approach for the highly-controlled preparation of materials that are inaccessible using ...

Water in Oil Emulsions: A New System for Assembling Water-soluble Chlorophyll-binding Proteins with Hydrophobic Pigments

तेल emulsions में पानी: जल विरोधी पिगमेंट के साथ पानी में घुलनशील क्लोरोफिल बाध्यकारी प्रोटीन के संयोजन के लिए एक नई प्रणाली

Chlorophylls (Chls) and bacteriochlorophylls (BChls) are the primary cofactors that carry out photosynthetic light harvesting and electron transport. ...

Assessment of Boron Doped Diamond Electrode Quality and Application to In Situ Modification of Local pH by Water Electrolysis

Assessment of Boron Doped Diamond Electrode Quality and Application to In Situ Modification of Local pH by Water Electrolysis

बोरान Doped डायमंड इलेक्ट्रोड गुणवत्ता और आवेदन करने का आकलन<em&gt; बगल में</em&gt; पानी इलेक्ट्रोलीज़ द्वारा स्थानीय पीएच का संशोधन

Boron doped diamond (BDD) electrodes have shown considerable promise as an electrode material where many of their reported properties such as extended ...

Radiolabeling and Quantification of Cellular Levels of Phosphoinositides by High Performance Liquid Chromatography-coupled Flow Scintillation

उच्च प्रदर्शन तरल क्रोमैटोग्राफी मिलकर प्रवाह जगमगाहट से radiolabeling और Phosphoinositides की सेलुलर स्तर की मात्रा

Phosphoinositides (PtdInsPs) are essential signaling lipids responsible for recruiting specific effectors and conferring organelles with molecular ...

In Situ Characterization of Shewanella oneidensis MR1 Biofilms by SALVI and ToF-SIMS

In Situ Characterization of Shewanella oneidensis MR1 Biofilms by SALVI and ToF-SIMS

सीटू में Shewanella oneidensis MR1 की विलक्षण फिल्म ने सालवी और तोफ-सिम्स द्वारा

Bacterial biofilms are surface-associated communities that are vastly studied to understand their self-produced extracellular polymeric substances (EPS) ...

In Situ Characterization of Boehmite Particles in Water Using Liquid SEM

In Situ Characterization of Boehmite Particles in Water Using Liquid SEM

सीटू में तरल SEM का उपयोग कर पानी में Boehmite कणों का लक्षण वर्णन

In situ imaging and elemental analysis of boehmite (AlOOH) particles in water is realized using the System for Analysis at the Liquid Vacuum Interface ...

DNA-magnetic Particle Binding Analysis by Dynamic and Electrophoretic Light Scattering

डीएनए-चुंबकीय कण गतिशील और Electrophoretic प्रकाश कैटरिंग द्वारा बाध्यकारी विश्लेषण

Isolation of DNA using magnetic particles is a field of high importance in biotechnology and molecular biology research. This protocol describes the ...

Rapid Nanoprobe Signal Enhancement by In Situ Gold Nanoparticle Synthesis

Rapid Nanoprobe Signal Enhancement by In Situ Gold Nanoparticle Synthesis

सीटू गोल्ड Nanoparticle संश्लेषण में तेजी से Nanoprobe संकेत बढोतरी

The use of nanoprobes such as gold, silver, silica or iron-oxide nanoparticles as detection reagents in bioanalytical assays can enable high sensitivity ...

Photoelectron Imaging of Anions Illustrated by 310 Nm Detachment of F&#8722;

Photoelectron Imaging of Anions Illustrated by 310 Nm Detachment of FÃƒÆ’Ã‚Â¢Ãƒâ€¹Ã¢â‚¬Â '

F− की ३१० एनएम टुकड़ी द्वारा सचित्र ॠणायन की Photoelectron इमेजिंग

Anion photoelectron imaging is a very efficient method for the study of energy states of bound negative ions, neutral species and interactions of unbound ...