Name: embryo microinjection and electroporation in the chordate ciona intestinalis
Uploaded: 2016-10-16T15:00:00
Duration: 9 min 38 s
Description: Watch this Scientific Journal Video about Embryo Microinjection and Electroporation in the Chordate Ciona intestinalis at JoVE.com

This work was supported by the University of Innsbruck, Austria, and the Austrian Academy of Sciences (&#214;AW).

Ciona卵と接合体におけるマイクロインジェクションやエレクトロポレーション1.準備<ol><li>胚の培養にHEPES（ASWH）と10 L人工海水を準備します。 420 mMのNaClを、9のKClを溶解し、10mMの塩化カルシウム2・2H 2 O、24.5のMgCl 2・6H 2 O、25.5ミリモルのMgSO 4・7H 2 O、および2.15 mMの二重蒸留水中のNaHCO 3（のddH 2 O）一晩攪拌することによって。 5 mMのHEPES pHが8.0を追加し、確認してください/ 8.0にpHを調整します。 4℃でASWHを保管してください。 18°Cにそれをウォームアップし、使用前にろ紙でそれをフィルタリングします。 </li><li> 20％のチオグリコール酸ナトリウム、ASWHの1％プロナーゼ：20倍、不活性化dechorionation溶液を調製します。 -20℃で500μlのアリコートを保存し、使用前に10ミリリットルASWHの最終体積に希釈します。 </li><li>卵/胚のために15〜20培養皿を準備します。 1〜2ミリメートル薄い層でそれらを被覆し、3.5、5、9または15センチメートルペトリ皿にASWH内の溶融1％アガロースを注ぎます。アガロースが固化し、ASWHでプレートをカバーしてみましょう。 1〜2週間の最大のために4℃でそれらを買いだめ。使用前にASWHを交換してください。 </li><li>特殊な注射料理を準備します。 <ol><li>アガロース5センチメートルペトリ皿に溶け1％5-7 mm厚の層を注ぎ、そしてアガロースの凝固時にインデントを生成する（例えば、プラスチックカバースリップに接着開閉ジップロックなど）アガロースに金型を配置それは、卵を保持することができます。 5注入皿に4を用意し、ASWHでカバー。 4℃で保存し、使用前に新鮮なASWHと交換します。 （最大1日齢）注射のための唯一の新鮮なプレートを使用してください。 </li></ol></li><li> 1mMのMgCl 2・6H 2 O、3 mMのK 4 [Fe（CN）6]を・3H 2 O、3 mMのK 3 [Fe（CN）6]をリン酸緩衝中：βガラクトシダーゼ（LacZの）染色バッファーを準備しますツイーン（PBT）（137ミリモルのNaCl、2.7ミリモルのKCl、10mMののNa 2 HPO 4、2mMのKH 2 PO 4、0.05％ツイーン）と食塩水（PBS）。ショップInは4℃で暗いです。するまで-20℃で40 mg / mlとでジメチルホルムアミド（DMF）のアリコートと店舗在庫でのLacZ基質5-ブロモ-4-クロロ-3-インドリルβ-D-ガラクトピラノシド（X-galを、10 U / ml）を調製つかいます。 </li><li>くっつくの胚を防止するために、水道水に一晩パスツールピペットを浸します。 </li><li>注射針を準備します。 <ol><li> （415のフィラメントランプテストから）、75速度75と時刻200を引き出し、そのような熱425のような条件でマイクロピペットプラーを設定します。 </li><li>通常、先端に閉じ8〜10長い、細い針を製造するために4〜5フィラメント含有ガラスキャピラリーを引き出します。ヒントを破る避けるために、高架支持体上に粘着テープを倍に付着したゴミを無料ニードルボックスに針を格納し、針の充填に便利です。 注：緑の重要な色素で、いくつかの卵を注入することにより得られた針をテストします（セクション6で説明したように）と微調整を可能にする先端形状を得るための条件を引っ張って針とrepetitを調整6.6で説明したように、注射をアイブ。 </li></ol></li><li>注射液を準備します。注射液の4μLを準備し、 例えば 、2 mMのMO、を10μg/μlの緑生体色素と1μlののddH 2 Oの2μlに1μlので構成される0.05〜0.5μgの/μlのキャップされたmRNAまたは実験的な質問に応じたプラスミドDNAの20 ngの/μlの最終濃度を追加します。よく混ぜます。解決策は、mRNAが含まれている場合は、氷上で保管してください。 </li></ol>配偶子の2コレクション<ol><li> 18°CでCiona大人の解剖は、胚の部屋を冷却します。小さなハサミを使用して、（短い）卵管と精子ダクトランその下でサイフォン呼気の側にサイフォンと対向する端から開始します。 </li><li>卵管を露出させ、微妙にハサミの先端を使用して、卵管の切開を行います。優しく例えば剥離閉じたハサミで卵管を押してASWHを含む6ウェルプレートに直接流出卵をドロップGS。パスツールピペットASWHで予めすすいで、残りの卵を移します。 </li><li>異なるウェルに異なる動物から卵を付着させます。解剖顕微鏡下で卵の品質を確認します。 注：まあ開発卵の色がわずかに黄色へのラウンドとピンクです。これらは、非細胞卵黄コート、卵の周りに明確に定義された卵黄周囲の空間を形成する絨毛膜に囲まれています。絨毛膜は、その外側に、その内側と星型包細胞で試験細胞と関連しています。低品質の卵は、多くの場合、囲卵腔または包細胞を欠いています。彼らはより少ないラウンド、より細かいまたは色が異なって表示されます。未成熟卵母細胞は小さく、銀白色を持っています。 </li><li>はさみで精子ダクトをカットし、独立したパスツールピペットを用いて、1.5mlチューブに濃縮された精子を集めます。同じチューブに（少なくとも二つ）の異なる動物から精子をプール。数日間、4℃で保存精子。 </li></ol> 3。受精<ol><li>ステップ2で説明したように18℃で精子と卵を収集します。 </li><li>精子をアクティブにします。 <ol><li> 1.5mlチューブに1ミリリットルASWHを準備し、1 MトリスpH9.5の50μlのミックス。その後、濃縮された精子の20μlを添加し、穏やかにチューブを転倒混和。 </li><li>小さなペトリ皿のカバーやスライドガラス上に配置された精子のドロップで精子活性化を確認し、解剖顕微鏡下で観察します。 spermatozoidsは必死に泳いする必要があります。 </li></ol></li><li> （100〜1,000卵の間含む）卵の各ウェルに活性化精子液の100から200μl加え、ピペッティングによりよく混ぜので、卵は培地中に浮遊しています。胚を移動させずに10分間待ちます。 </li></ol>卵や胚の4 Dechorionation <ol><li> ASWHで10ミリリットルに20倍dechorionation溶液500μlのアリコートを希釈します。 2の滴下200μlのを追加することにより、dechorionationソリューションをアクティブにします。10ミリリットルの1x dechorionation溶液に5 M NaOHで。乳白色の沈殿物が形成されます。静かにチューブを転倒混和。 </li><li> （10分は、ステップ3.3で待機した後に）パスツールピペットを用いて、ガラス管の中に卵や接合体を収集します。 （1,000〜5,000卵/管の周りに）一本のチューブに2〜3匹の動物から卵をプール。チューブの底に胚ペレットを形成するために、約20秒間高速（1200 XG）で回転することにより、手の遠心分離機で土砂。ゆっくりと遠心機を停止し、パスツールピペットでASWHを削除します。 </li><li>各チューブ内のペレット化の卵/接合体に活性化dechorionation液の4ミリリットルを追加します。卵をサスペンド/静かにそれらをピペッティング水道水で処理したパスツールピペットを用いて、接合体は、小さなゴム梨をトッピング。解決策は、1-3分後に黄色がかっ有効にしてください。 </li><li>パスツールピペットを使用してdechorionating卵/接合体懸濁液の小アリコートを除去することによってdechorionationに従ってください。スライド上のドロップを堆積し、解剖の下で観察します対処。上下の卵/接合体をピペット保ち、毎20〜30秒を確認してください。 注記：ファースト包細胞を切り離し、その後、絨毛膜は、黄色と不透明になり、最終的にはそれが接合体から切り離します。ピンクの卵/接合体は、ガラス管の底に沈んでしまうdechorionated。 dechorionationは最大以上かかるべきではありません。 5分。 </li><li>卵/接合体の50％がdechorionatedされるとASWHでチューブを埋めます。 注：非常に軽く遠心（8 XG）だけで十分なdechorionated卵/胚を沈降することは非常に低速に相当する約10〜15秒間。チューブの底に卵/接合体のペレットを混乱しないようにゆっくりと遠心分離機を停止します。 </li><li>不完全dechorionated卵/接合体と浮遊物質を含むガラス管からほぼすべての液体を除去し、ASWHと交換します。ゆっくりピペットと洗い流し、ゆっくりとステップ4.2のように再び遠心分離します。また、重力によって落ち着く接合体を待ちます。何の絨毛膜の破片がlでなくなるまでもう一度洗いますEFT。 </li><li>転送卵/接合体を新たにパスツールピペットを用いて培養皿をすすぎ洗いします。一緒に粘着するのを避けるために（10cmディッシュあたり200の胚の周りの）低密度で接合体（ない卵）を保管してください。培養13と20℃の間の温度で所望の段階までの胚。また、接合体（ステップ5）、エレクトロポレーションまたは未受精卵（ステップ6）を注入します。 </li></ol> 5.エレクトロポレーション<ol><li>卵を受精し、セクション3と4のように18℃の接合体をdechorionateエレクトロポレーションサンプルあたり50〜400卵の間に提供します。 </li><li> 1.5ミリリットルチューブ（最大のddH 2 O50μl中100μgのプラスミドDNA）で50μlのプラスミドDNAを調製し、200μlの0.95 Mマンニトールを追加します。ボルテックスでよく混ぜます。 </li><li>発送と重力がシリコン処理1.5ミリリットルチューブでdechorionated接合体を沈降します。チューブに100μlのマークまでASWHを削除します。 </li><li>次のように各接合体管のために、連続して、続行します。addパスツールピペットを用いて、DNA /マンニトール溶液。静か接合体と混合し、瞬時に、4mmのエレクトロポレーションキュベットにDNA /マンニトール/接合体懸濁液と転送を取ります。 </li><li>エレクトロポレーションホルダーにすぐにキュベットを置き、50 Vで16ミリ秒の単一パルスを与えます</li><li>同じパスツールピペットを用いてキュベットから接合体を取り外し、新鮮な、そして濾過ASWHを含む培養皿上にそれらを広げ。彼らは18℃で約1時間後に受精（HPF）の切断を開始する前に、接合体をピペット。 </li><li> ASWHのビーカー内のサンプル間のピペットを洗浄します。 </li><li>文化10cmディッシュあたり約200の胚の十分に低い密度で15-20℃の接合体は、一緒に粘着するのを避けるために。 </li></ol> 6.マイクロインジェクション<ol><li>注射用Dechorionated卵を準備します。 <ol><li>セクション4に記載のように、2-4の動物から、別に卵をDechorionate未受精とdechorionated電子メールをください別の小さなアガロースコーティングした培養皿でGGS。破片を除去するために皿に卵を数回洗浄します。 </li><li>テストは、各個体から（50前後）dechorionated卵の小さなバッチを肥やします。各バッチのための独立した5cmのディッシュを使用し、2μlの活性化された精子（ステップ3.2）を適用します。料理を渦巻くことでよく混ぜ、横料理を動かすことによって、皿に卵を広げます。移動せずに約10分間精子と卵を一緒に保管してください。 </li><li>次のように精子の最大の排除：新鮮な培養皿に受精卵を転送したり、新鮮なASWHで二回すすいでください。 （約3時間後の受精のために18℃で）32細胞期までの非摂動切断胚を残します。マイクロインジェクションのために最良の開発バッチ（受精の最高の割合とほとんどの定期的な切断パターン）から卵を選択してください。 </li></ol></li><li>注射針を設定します。 <ol><li> FL重力を可能にするために垂直位置で4注射針を埋め戻しフィラメントに沿ってOW。針は先端を下に配置されている針のバックエンドで緑色の生体色素を含む預金は0.5μlの注射液（ステップ1.8）。下部に針の先端を埋めるために、液体のを待ちます。 </li><li>水平方向の針の位置を変更し、罰金と長い金属またはプラスチックピペットチップを使用して、鉱物油でそれらを埋め戻します。ゆっくり針を充填しながら、すべての気泡を排出鉱油で注射液をオーバーレイ。 </li></ol></li><li>セットアップ18°Cでのマニピュレーターは、部屋を冷却しました。 <ol><li>鉱物油が充填された10mlのガラスシリンジに針ホルダのプラスチックチューブを接続します。オイルとチューブと針ホルダを埋め戻し、任意の気泡を追い出します。 </li><li>ニードルホルダーに針を挿入し、マイクロマニピュレーターにホルダーを配置します。 </li><li>表面に対して45°の角度で直線に沿って針ホルダの動きを調整します。 </li></ol></li><li>オリエントdechoriona卵を解剖顕微鏡下で一つずつ注入することができるように、注射皿のアガロースインデント沿っテッド卵。 </li><li>必要に応じて、そっとアガロースに対するまたはアガロース上に配置されたガラスカバースリップの一部に対して針を押して、針の先端を破ります。わずかに針の先端が開いた（緑の針の内容が追放されます）であることを確認するために、シリンジのノブに圧力をかけます。 </li><li>最初の卵に針を導入し、わずかに注射した卵膜を破壊するために吸引することにより、1により未受精卵の1を注入します。セル径の1/3の最大の卵の中央に緑の注射液を注入します。 （これは、140ミクロンの卵の直径は約30 PLに相当します）。 </li><li>新鮮な培養皿に注入された未受精卵を転送し、受精するまで15-18℃でそれらをインキュベートします。 </li><li>テスト受精（ステップ6.1.2）のように新たに活性化した精子を注入した卵を受精。 Eliminat新鮮な培養皿に接合体を転送することにより、精子のEAの最大。胚を広げ、（32細胞期まで）の切断段階でそれらを混乱しないでください。 </li><li>培養13と20℃の間の温度で所望の段階までの胚。 </li><li>プレートの中央にそれらを旋回し、シリコン処理1.5ミリリットルチューブにそれらを転送することにより胚を収集します。修正し、汚れ、またはマウント（ステップ7,8）。 </li><li>制御注入された胚に得られる表現型を比較。 注：同一の表現型を得るために、同一の転写産物を標的とする第二の、非重複MOを注入。修正されたmRNAは、目的のタンパク質をコードするが、それは、MOSによって認識されないと、特定のMO表現型（複数可）を救出。何の表現型を与えない対照MOを注入します。 </li></ol> 7.のLacZ染色<ol><li>シリコン処理1.5ミリリットルチューブ内の所望の段階で胚を収集し、15のために1ミリリットルASWH中の0.2％グルタルアルデヒド中でそれらを修正30分最大。 </li><li> 1ミリリットル1X PBTでの洗浄2回10分。 </li><li> 500μlのLacZ染色バッファーで一度すすいでください。 X-gal基質を補充した1ミリリットル染色バッファーを交換してください（10μL/ 40ミリグラムのミリリットルを使用/ mlのX-Galをストック）。染色のよりよい観察のために12ウェルプレートに胚を移します。 </li><li>暗闇の中でインキュベートします。 0.5時間のインキュベーションを変化させるために一晩4℃でのLacZを発現しているドライバの強さに応じて、室温でまたは37℃で。 </li><li>染色緩衝液を除去するために1ミリリットル1X PBTで4倍に胚を洗浄します。 </li><li> 1ミリリットル中の2％パラホルムアルデヒド（PFA）1X PBTまたは染色された胚の解釈および視覚化のために1ミリリットル中の0.2％グルタルアルデヒド1X PBTを用いて室温で10分間ポスト修正。 </li></ol>蛍光標識Wmbryos 8.取り付け<ol><li> 1ミリリットルASWH 2％PFAで20分間希望の発達段階の胚を修正しました。 </li><li>胚は1ミリリットル1X PBTで2倍洗います。任意の光エキスポを避けます暗いところでの胚を保つことによってURE。 </li><li> 1のスライドに50胚まで転送します。ペーパータオルで最初にピペットで、慎重にPBTの最大値を削除します。 </li><li> 20〜25μlのマウンティング培地を追加します。 </li><li> （第1の側から）の角度でそれを配置することによってカバースリップを追加し、ゆっくりとサンプルが覆われているまで、泡を避け先のとがっ（針、鉗子、ピペットチップ）でそれを下げます。透明なマニキュアのドットを使用して、その縁でカバーガラスを固定してください。 </li><li>乾燥後のマニキュアと全体カバースリップを封印。 -20℃の暗所で保管してください。 </li></ol>

<ol>
	<li>Holland, P. W., Garcia-Fernandez, J., Williams, N. A., Sidow, A. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/query.fcgi?db=PubMed&cmd=Search&doptcmdl=Citation&defaultField=Title+Word&term=Gene+duplications+and+the+origins+of+vertebrate+development.">Gene duplications and the origins of vertebrate development.</a> Dev Suppl. 120 (1), 125-133 (1994).</li><li>Simmen, M. W., Leitgeb, S., Clark, V. H., Jones, S. J., Bird, A. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/query.fcgi?db=PubMed&cmd=Search&doptcmdl=Citation&defaultField=Title+Word&term=Gene+number+in+an+invertebrate+chordate,+Ciona+intestinalis.">Gene number in an invertebrate chordate, Ciona intestinalis.</a> Proc Natl Acad Sci U S A. 95 (8), 4437-4440 (1998).</li><li>Dehal, P., et al. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/query.fcgi?db=PubMed&cmd=Search&doptcmdl=Citation&defaultField=Title+Word&term=The+draft+genome+of+Ciona+intestinalis:+insights+into+chordate+and+vertebrate+origins.">The draft genome of Ciona intestinalis: insights into chordate and vertebrate origins.</a> Science. 298 (5601), 2157-2167 (2002).</li><li>Satoh, N., Satou, Y., Davidson, B., Levine, M. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/query.fcgi?db=PubMed&cmd=Search&doptcmdl=Citation&defaultField=Title+Word&term=Ciona+intestinalis:+an+emerging+model+for+whole-genome+analyses.">Ciona intestinalis: an emerging model for whole-genome analyses.</a> Trends Genet. 19 (7), 376-381 (2003).</li><li>Delsuc, F., Brinkmann, H., Chourrout, D., Philippe, H. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/query.fcgi?db=PubMed&cmd=Search&doptcmdl=Citation&defaultField=Title+Word&term=Tunicates+and+not+cephalochordates+are+the+closest+living+relatives+of+vertebrates.">Tunicates and not cephalochordates are the closest living relatives of vertebrates.</a> Nature. 439 (7079), 965-968 (2006).</li><li>Lemaire, P. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/query.fcgi?db=PubMed&cmd=Search&doptcmdl=Citation&defaultField=Title+Word&term=Unfolding+a+chordate+developmental+program,+one+cell+at+a+time:+invariant+cell+lineages,+short-range+inductions+and+evolutionary+plasticity+in+ascidians.">Unfolding a chordate developmental program, one cell at a time: invariant cell lineages, short-range inductions and evolutionary plasticity in ascidians.</a> Dev Biol. 332 (1), 48-60 (2009).</li><li>Hikosaka, A., Satoh, N., Makabe, K. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/query.fcgi?db=PubMed&cmd=Search&doptcmdl=Citation&defaultField=Title+Word&term=Regulated+spatial+expression+of+fusion+gene+constructs+with+the+5&#8242;+upstream+region+of+Halocynthia+roretzi+muscle+actin+gene+in+Ciona+savignyi+embryos.">Regulated spatial expression of fusion gene constructs with the 5&#8242; upstream region of Halocynthia roretzi muscle actin gene in Ciona savignyi embryos.</a> Roux's Arch Dev Biol. 203 (1-2), 104-112 (1993).</li><li>Corbo, J. C., Levine, M., Zeller, R. W. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/query.fcgi?db=PubMed&cmd=Search&doptcmdl=Citation&defaultField=Title+Word&term=Characterization+of+a+notochord-specific+enhancer+from+the+Brachyury+promoter+region+of+the+ascidian,+Ciona+intestinalis.">Characterization of a notochord-specific enhancer from the Brachyury promoter region of the ascidian, Ciona intestinalis.</a> Development. 124 (3), 589-602 (1997).</li><li>Zeller, W. R. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/query.fcgi?db=PubMed&cmd=Search&doptcmdl=Citation&defaultField=Title+Word&term=Generation+and+use+of+transgenic+ascidian+embryos.">Generation and use of transgenic ascidian embryos.</a> Methods Cell Biol. 74 (74), 13-30 (2004).</li><li>Satou, Y., Imai, K. S., Satoh, N. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/query.fcgi?db=PubMed&cmd=Search&doptcmdl=Citation&defaultField=Title+Word&term=Action+of+morpholinos+in+Ciona+embryos.">Action of morpholinos in Ciona embryos.</a> Genesis. 30 (3), 103-106 (2001).</li><li>Imai, K. S., Levine, M., Satoh, N., Satou, Y. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/query.fcgi?db=PubMed&cmd=Search&doptcmdl=Citation&defaultField=Title+Word&term=Regulatory+blueprint+for+a+chordate+embryo.">Regulatory blueprint for a chordate embryo.</a> Science. 312 (5777), 1183-1187 (2006).</li><li>Tassy, O., et al. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/query.fcgi?db=PubMed&cmd=Search&doptcmdl=Citation&defaultField=Title+Word&term=The+ANISEED+database:+digital+representation,+formalization,+and+elucidation+of+a+chordate+developmental+program.">The ANISEED database: digital representation, formalization, and elucidation of a chordate developmental program.</a> Genome Res. 20 (10), 1459-1468 (2010).</li><li>Brozovic, M., et al. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/query.fcgi?db=PubMed&cmd=Search&doptcmdl=Citation&defaultField=Title+Word&term=ANISEED+2015:+a+digital+framework+for+the+comparative+developmental+biology+of+ascidians.">ANISEED 2015: a digital framework for the comparative developmental biology of ascidians.</a> Nucleic Acids Res. , (2015).</li><li>Kubo, A., et al. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/query.fcgi?db=PubMed&cmd=Search&doptcmdl=Citation&defaultField=Title+Word&term=Genomic+cis-regulatory+networks+in+the+early+Ciona+intestinalis+embryo.">Genomic cis-regulatory networks in the early Ciona intestinalis embryo.</a> Development. 137 (10), 1613-1623 (2010).</li><li>Rothb&#228;cher, U., Bertrand, V., Lamy, C., Lemaire, P. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/query.fcgi?db=PubMed&cmd=Search&doptcmdl=Citation&defaultField=Title+Word&term=A+combinatorial+code+of+maternal+GATA,+Ets+and+&#946;-catenin-TCF+transcription+factors+specifies+and+patterns+the+early+ascidian+ectoderm.">A combinatorial code of maternal GATA, Ets and &#946;-catenin-TCF transcription factors specifies and patterns the early ascidian ectoderm.</a> Development. 134 (22), 4023-4032 (2007).</li><li>Segal, E., et al. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/query.fcgi?db=PubMed&cmd=Search&doptcmdl=Citation&defaultField=Title+Word&term=A+genomic+code+for+nucleosome+positioning.">A genomic code for nucleosome positioning.</a> Nature. 442 (7104), 772-778 (2006).</li><li>Khoueiry, P., et al. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/query.fcgi?db=PubMed&cmd=Search&doptcmdl=Citation&defaultField=Title+Word&term=A+cis-regulatory+signature+in+ascidians+and+flies,+independent+of+transcription+factor+binding+sites.">A cis-regulatory signature in ascidians and flies, independent of transcription factor binding sites.</a> Curr Biol. 20 (9), 792-802 (2010).</li><li>Gilchrist, M. J., et al. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/query.fcgi?db=PubMed&cmd=Search&doptcmdl=Citation&defaultField=Title+Word&term=A+pipeline+for+the+systematic+identification+of+non-redundant+full-ORF+cDNAs+for+polymorphic+and+evolutionary+divergent+genomes:+Application+to+the+ascidian+Ciona+intestinalis.">A pipeline for the systematic identification of non-redundant full-ORF cDNAs for polymorphic and evolutionary divergent genomes: Application to the ascidian Ciona intestinalis.</a> Dev Biol. 404 (2), 149-163 (2015).</li><li>Roure, A., et al. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/query.fcgi?db=PubMed&cmd=Search&doptcmdl=Citation&defaultField=Title+Word&term=A+multicassette+Gateway+vector+set+for+high+throughput+and+comparative+analyses+in+ciona+and+vertebrate+embryos.">A multicassette Gateway vector set for high throughput and comparative analyses in ciona and vertebrate embryos.</a> PLoS One. 2 (9), e916 (2007).</li><li>Kumano, G., Takatori, N., Negishi, T., Takada, T., Nishida, H. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/query.fcgi?db=PubMed&cmd=Search&doptcmdl=Citation&defaultField=Title+Word&term=A+maternal+factor+unique+to+ascidians+silences+the+germline+via+binding+to+P-TEFb+and+RNAP+II+regulation.">A maternal factor unique to ascidians silences the germline via binding to P-TEFb and RNAP II regulation.</a> Curr Biol. 21 (15), 1308-1313 (2011).</li><li>Sasaki, H., Yoshida, K., Hozumi, A., Sasakura, Y. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/query.fcgi?db=PubMed&cmd=Search&doptcmdl=Citation&defaultField=Title+Word&term=CRISPR/Cas9-mediated+gene+knockout+in+the+ascidian+Ciona+intestinalis.">CRISPR/Cas9-mediated gene knockout in the ascidian Ciona intestinalis.</a> Dev Growth Differ. 56 (7), 499-510 (2014).</li><li>Stolfi, A., Gandhi, S., Salek, F., Christiaen, L. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/query.fcgi?db=PubMed&cmd=Search&doptcmdl=Citation&defaultField=Title+Word&term=Tissue-specific+genome+editing+in+Ciona+embryos+by+CRISPR/Cas9.">Tissue-specific genome editing in Ciona embryos by CRISPR/Cas9.</a> Development. 141 (21), 4115-4120 (2014).</li></ol>

The authors declare that they have no competing financial interests.

RNAまたはDNAのマイクロインジェクションおよびDNAのエレクトロポレーション：トランスジェニックCionaの胚を生成するための2つの主要な技術があります。 Ciona胚における遺伝子摂動のためのこれらの技術は、最初の7,8、1990年代に、その後に連続的に改善され、現在、世界Ciona（および他のホヤ属）20で利用から使用されました。 プロトコルにおける重要なステップ簡単に大人の動物から採取されたCionaの配偶子に成功した遺伝子導入は重要な要素の数によって異なります。配偶子の品質は（大人2〜4週間健康維持、正しい塩分で）水族館で海の水質で、（水温や酸素とともに変化し、北部大西洋で、一般的に月〜12月）産卵期に依存します、そして最終的に大人からの抽出時の配偶子の正しい取り扱い上、のさまざまなステップについては、以下に詳述するようにプロトコル。 準備段階中に、水道水でパスツールピペットをインキュベートすると、アガロースから放出された有害物質を除去するアガロースでコーティングされたペトリ皿の水のプレインキュベーションを貼付し、海から胚を防ぐことができます。一般に、皿は、細菌の増殖を防ぐために4℃で保存し、使用前に2週間までに調製されてもよいし、使用前に新たにすすぎました。生後1日、小皿は、注射のために最善のようです。 dechorionationの効率性と長さは、開発に悪影響を与えるだろう卵/胚の長期の治療などのプロトコルにおける重要なステップです。 （1週間まで4℃で）慎重な準備（なし振とう）し、正しいストレージdechorionationソリューションの品質を維持。いずれかの混合あまりにも激しく準備時または時間をかけた場合、溶液中のプロテアーゼは長い時間/日間室温に保たれ、特に場合は、効率を失います。私たちは便利な新鮮dechorionation溶液を用いて、この重要なステップを最適化しました20×ストック溶液の凍結アリコートから調製しました。 ピペッティングが有害になりながら、壊れやすいdechorionated卵/胚の正しい取り扱いが不可欠とせん断または胚の刺すようです。ピペッティング、胚は、懸濁液中の水平方向の位置ではなく、縦にガラスピペットを保持しながら、（軽く滑らかなしかし迅速なピペッティングに続いてそれらを旋回する液体を「吹く」による）を可能な限り維持されている場合。このようなケアは、固定前と後、洗浄、再懸濁およびチューブ、キュベットまたはプレートの内と外の卵/胚を転送するためのすべてのピペッティング操作に適用されます。固定時には、特別なケアはまた、固定剤の遺跡から任意の毒性を回避するために、固定された胚に対して、ライブ用に別々のピペット装置に取られるべきです。 マイクロインジェクションはそのサイズが小さいと卵黄膜の弾力性に起因するCionaの卵/胚にかなりトリッキーであると批判の最適化された先端サイズに依存します注射針、注射の完全な角度（卵の半径に沿って1ラインの針の動き、）と（前の注射のための吸引に吸引によって）卵黄膜の微調整、手動の破壊。気泡が完全に吸引/注入圧力を平滑化するための鉱油を含有する注入チューブから除去される場合、後者のみが可能です。また、ほこりや卵破片の最小ピースが針を詰まらせるだろう、と簡単にきれいな労働条件と注入皿に移す前に卵のためのすすぎ工程によって回避されます。ポスト噴射は、新鮮な皿に卵の転送は、注入手順を生き延びた死んでいない胚からの毒性作用を避けることができます。 トラブルシューティング手順の潜在的な問題は、以下の解決策によって対処することができます。低受精率が不十分な精子活性化、低卵の清浄度や大きな受精・ボリュームから生じる可能性があります。 freshl使用yはプールし、少ない精子を希釈しました。活性化の際に精子の動きを確認してください。ステップ4.2で説明したように、受精前にASWHで卵を洗います。水量を減らし、/よく受精皿当たりの卵の量を減らします。製造工程中の胚を失うことは、より効率的にundechorionated卵/胚下遠心分離機にdechorionation溶液の滴を添加することによって回避することができます。 Dechorionation時間がない堆積物と延長dechorionationは、有毒である胚を爆発させるだろう、部分的にdechorionated卵のように最適化されるべきです。 非同期開発は解剖の際に放出残留精子から生じ得ます。制御不能なクロス受精を回避するために、異なる動物から分離された卵のバッチを保管してください。異常な発達は、さまざまな原因が考えられます。冒頭シーズンの終わりに、分離された別の個体由来の胚を保持した後、最高のバッチを選択してもよいです。以下のための胚を乱す避けます彼らの卵細胞質の分離との干渉を避けるために受精に従って10分。ピペッティングは、部分的な胚における姉妹割球と結果を分離として転送されながら胚を除起動しなかったことを確認してください。多精子受精を回避するために、dechorionated卵のためのより少ない精子を使用してください。新たに調製したが、すすぎアガロース料理をご使用ください。ピペット装置は、固定剤自由であることを確認してください。 dechorionatedないと破壊されたステップの開発で検出するために、エレクトロポレーションされていなかった対照胚を保管してください。汚染や分解が発生した場合、抗生物質との胚を補います。 注入装置は、「目詰まり、 &#39;ている場合、注射針の開口部は、染色されたコンテンツの一部を排出することによって確認することができます。目詰まり物質は慎重にアガロースを介して針の先端をドラッグすることで拭き取ることができます。空気が注入チューブ内の気泡および/または針を削除する必要があります。旧姓のように注入量のより良好な制御のための針を変更DLE先端が破損したり、注射に沿って詰まることがあります。卵をすすぎ、破片が皿の中で蓄積してきた場合は、クリーン注入皿に配置します。どんな小さな粒子または結晶を沈殿させるために、新鮮な針を充填する前に注射液を遠心。また、役立つだけで生体色素の注射を実践されています。注入および非注入卵を受精することによって注入技術を確認します。最後に、経験豊富な同僚と相談すると、注入技術を改善するのに役立つことができます。 オフターゲット効果を制御するために第二の非重複忠実Cionaで非特異的表現型効果を除外することができたMOによって認識されていない変更されたmRNAとMOと救助を。 マイクロインジェクション：意義と限界 Cionaにおけるマイクロインジェクションは、脊索動物11で全胚遺伝子調節ネットワーク（GRN）の最初の青写真を生成するために利用されました。しかしながら、このようなREMAにもかかわらずCiona胚におけるrkable達成、マイクロインジェクションが原因Cionaの卵の比較的小さいサイズ（直径0.14ミリメートル）に、制限があります。外来DNA / mRNAを微量注入によって導入された他の脊索動物種のものと比較すると、Cionaの卵は、取り扱いが比較的困難であり、実験当たりの注射Ciona胚の割合は、定量分析を妨げる、（実験あたりの平均30〜50の胚に）低いまま。それにもかかわらず、Cionaに母体の要因を摂動するために、MOSのマイクロインジェクションは、16〜32細胞期15から開発の接合体発症への関与を研究するために選択される方法です。また、はるかに難しいが、16から32細胞期までの個々の割球を顕微注入するためにかかわらず可能です。最後に、マイクロインジェクションはの完全optimi、Ciona以外のホヤの種で（mRNAまたはDNAの注射による）トランスジェニック胚を生成するための最も効率的な技術のままZEDエレクトロポレーションプロトコルは存在しません。 エレクトロポレーション：意義と限界それはツェラーらによって開発され、最適化され、標準化されたプロトコルとして公開されて以来の低い数字およびマイクロインジェクションの他の制約を克服するために、Cionaコミュニティのほとんどは、プラスミドDNAのエレクトロポレーションを使用しています。2004年9で。確かに、トランスジェニックCiona胚の数千人同時に16ミリ秒の単一の50 Vのパルスを使用して、1つのキュベットにエレクトロ最大500の胚を用いて1時間以内に生成することができます。トランスジェニック胚の膨大な数を生成するアプローチは、依然として脊索動物のモデル生物の中でユニークです。すぐに生体内で実行するための強力なモデルシステムとして認識されるように、ここで例示したようにこれは、潜在的なシス -regulatory領域および細胞内/細胞内局在の解析Cionaを率いていました。 electroporatiが、Ciona接合体で基本的に脊索動物GRNの研究分野に革命をもたらした上で、技術はそれにもかかわらず、いくつかの限界に直面しています。まず、プラスミドを一過Cionaの胚に導入され、最も可能性の高い投機的なエレクトロポレーションプラスミドDNAの安定性を作り、染色体外アレイとして継承されます。また、このようにして表現型の変動を生じ、接合体あたりに取り込まれるエレクトロプラスミドのコピーを制御するために、おそらく不可能な、非常に困難です。エレクトロポレーションの結果を解釈することを困難にさらなる問題は、我々はモザイクを呼ぶ現象です。エレクトロポレーションのプラスミドDNAは、1細胞期胚の異なる位置に取り込まれ得ます。その子孫割球によって継承されるようにすると、接合体の各方面がプラスミドを受け取る方法を決定します。このような変形例は明らかに、定量的な効果の解釈をより難しくします。しかし、ほとんどの問題electroporaが付属していますション変動性はカウントし、単一のバッチで容易に入手されたLacZ（またはGFP）陽性細胞の統計で、生物学的サンプルの適切な量によって解決されます。 遺伝子工学のためのエレクトロポレーションの多様性と潜在的なエレクトロポレーションは、最終的には潜在的なシス -regulatory地域と一度レポーターまたは発現プラスミドにクローニングされた遺伝子機能の定量分析の中間スループットスクリーニングを可能にします。コンパクトCionaゲノムに、識別し、潜在的な調節領域のクローニングは、3非常に簡単です。コミュニティの豊富なデータを使用するための戦略は、 図2Aに示されています。レポーター遺伝子をコードするプラスミドのクローニングをさらにCionaの発生により適応促進され、GATEWAY適合性ベクタースイート19と互換性のある完全長ORFライブラリー18。どちらのツールは、コミュニティに利用可能であり、図2Bに示すように、規制ドライバおよびコード領域の効率的な、制限酵素を含まない組換えを可能にします。 近年では、エレクトロポレーションが正常組織固有のドライバ21,22の制御下にCRISPR / Cas9コンポーネントのような遺伝子編集ツールを発現するプラスミドを持つ組織標的遺伝子操作を実現するようになりました。このようなアプローチは、迅速GRNsのダイナミクスと組織形成及び多能性から段階的に終了に関与する転写因子コードを含む潜在的に保存されたシグナル伝達機構の理解を進めます。さらに、エレクトロポレーションを用いて、組織特異的loss-がまたは（CRISPR / Cas9によって、または過剰発現による）機能獲得型のアプローチは、ヒト疾患関連遺伝子のCionaオルソログを研究する手段になります。実際、ヒトの疾患遺伝子のCionaオルソログのカタログとその全長ORFをコードクローンは容易にご利用できますされていますルCiona 1 8での分析のために。脊椎動物のゲノムワイド重複のために、ほとんどのヒト遺伝子は、遺伝子機能1の分析を複雑に機能的に重複パラログを有している。Cionaは 、このような重要なことは、多くの場合、機能的に保存された遺伝子の基本的な役割を明らかにする必要があります幼虫における典型的な脊索動物の組織に構成されたシンプルなシステムです。

最近では、ゲノム配列および転写遺伝子レパートリーは、モデル生物の数がアクセス可能となっています。しかし、遺伝子機能のリンクを決定し、これらの接続は、胚の時間と空間全体の転写活性を実行するためのDNAにハードワイヤードされているか、特に脊椎動物では、主要な課題のまま。特に脊椎動物における規制の相互作用の複雑さとゲノム1,2の複雑さは、in vivoでの DNAレベルで特に効率的な機能解析を、スローダウン。確かに、何GRNは、現在開発生物の最後の、最終分化状態に受精から分析されていません。 ホヤC.腸管は、そのような完全なGRNは可能かもしれない解析モデル生物を表します。これは、少しの遺伝子の冗長性と無脊椎動物の典型的な重複しないゲノムを持っています。脊椎動物では、対照的に、肝炎ゲノム重複の2ラウンドを受けましたeは、より大きな遺伝子ファミリーと機能の多様化だけでなく、パラログ間の冗長性を生成しました。 C.のコンパクトなシス -regulatoryシーケンス（GRNsの制御ユニット） 腸管 、および少数の細胞で不変の胚系統は、Cを連想させますエレガンス 。さらに、脊索動物内の脊椎動物への無脊椎動物の姉妹グループとして独自の系統学的位置が形成脊索動物のボディープラン3-6で、セルラー解像度で、発達の観察を可能にします。 モデル生物における機能ゲノミクスの将来の成功を保証する重要な問題は、定量的なin vivoでの摂動のための胚の多数の生成です。 Ciona卵 7におけるマイクロインジェクション技術の開発、および迅速Ciona接合体8,9の何百ものin vivoエレクトロポレーションにより多くの一過性トランスジェニック動物を得る可能性がで突破口となっています<em&gt; Ciona機能ゲノミクス。ここでは、まず、特に母性転写産物の、モルホリノ（MO）媒介遺伝子ノックダウンのための選択の方法のまま個々の遺伝子を標的とするため、より面倒なマイクロインジェクション技術を提示します。 MOオリゴは、典型的には、イニシエーターATGまたはRNAのスプライス部位をターゲットにしてタンパク質翻訳を妨害します。私たちは、その後、このように、 生体内および組織特異的gain-または関数アプローチ喪失の促進剤の効率的な解析の道を開く、Cionaの受精卵でのエレクトロポレーションは、定量的な方法で分析することが胚の多数を可能にする方法を示しています同時操作および分析のための可能性。我々はさらにCionaコミュニティツールが調節領域および発現ベクターで完全なオープンリーディングフレーム（ORF）の効率的なクローニングのインシリコ予測にするために利用される方法を示します。最後に、タグ付けされた蛍光の差動細胞内の局在化を実証しますまたはエレクトロポレーションによって過剰発現時にタンパク質を標識しました。

<table border="0" cellpadding="0" cellspacing="0" width="913">
	<colgroup>
		<col />
		<col />
		<col />
		<col />
	</colgroup>
	<tbody>
		<tr height="21">
			<td height="21" style="height:21px;width:227px;">Lab with constant temp. (~ 18&#176;C)&#160;</td>
			<td style="width:348px;"></td>
			<td style="width:83px;"></td>
			<td style="width:255px;">For embryo work</td>
		</tr>
		<tr height="61">
			<td height="61" style="height:61px;width:227px;">Ciona intestinalis adults</td>
			<td style="width:348px;">UPMC - Station Biologique, 
			Roscoff, France</td>
			<td style="width:83px;"></td>
			<td style="width:255px;">For collecting gametes</td>
		</tr>
		<tr height="21">
			<td height="21" style="height:21px;width:227px;">NaCl</td>
			<td style="width:348px;">Roth</td>
			<td style="width:83px;">3957.1</td>
			<td style="width:255px;">For ASWH</td>
		</tr>
		<tr height="21">
			<td height="21" style="height:21px;width:227px;">KCl</td>
			<td style="width:348px;">Roth</td>
			<td style="width:83px;">6781.1</td>
			<td style="width:255px;">For ASWH</td>
		</tr>
		<tr height="25">
			<td height="25" style="height:25px;width:227px;">CaCl2x2H2O</td>
			<td style="width:348px;">Roth</td>
			<td style="width:83px;">A119.1</td>
			<td style="width:255px;">For ASWH</td>
		</tr>
		<tr height="25">
			<td height="25" style="height:25px;width:227px;">MgCl2x6H2O</td>
			<td style="width:348px;">Roth</td>
			<td style="width:83px;">2189.1</td>
			<td style="width:255px;">For ASWH</td>
		</tr>
		<tr height="25">
			<td height="25" style="height:25px;width:227px;">MgS04x7H2O</td>
			<td style="width:348px;">Roth</td>
			<td style="width:83px;">P027.2</td>
			<td style="width:255px;">For ASWH</td>
		</tr>
		<tr height="25">
			<td height="25" style="height:25px;width:227px;">NaHCO3</td>
			<td style="width:348px;">Roth</td>
			<td style="width:83px;">6885.1</td>
			<td style="width:255px;">For ASWH</td>
		</tr>
		<tr height="21">
			<td height="21" style="height:21px;width:227px;">Hepes&#160;</td>
			<td style="width:348px;">Roth</td>
			<td style="width:83px;">HN78.3</td>
			<td style="width:255px;">For ASWH</td>
		</tr>
		<tr height="21">
			<td height="21" style="height:21px;width:227px;">Sodium thioglycolate&#160;</td>
			<td style="width:348px;">Sigma</td>
			<td style="width:83px;">MZ-6</td>
			<td style="width:255px;">For Dechorionation</td>
		</tr>
		<tr height="42">
			<td height="42" style="height:42px;width:227px;">Pronase&#160;</td>
			<td style="width:348px;">Sigma</td>
			<td style="width:83px;">T0632-100G</td>
			<td style="width:255px;">For Dechorionation</td>
		</tr>
		<tr height="42">
			<td height="42" style="height:42px;width:227px;">D-Mannitol&#160;</td>
			<td style="width:348px;">Sigma Aldrich</td>
			<td style="width:83px;">M9546-250G</td>
			<td style="width:255px;">For electroporation</td>
		</tr>
		<tr height="21">
			<td height="21" style="height:21px;width:227px;">Plasmid DNA (prep &#62;1&#181;g/&#181;l)</td>
			<td style="width:348px;">Macherey-Nagel</td>
			<td style="width:83px;">740410.100</td>
			<td style="width:255px;">For electroporation or microinjection</td>
		</tr>
		<tr height="21">
			<td height="21" style="height:21px;width:227px;">Agarose</td>
			<td style="width:348px;">any supplier</td>
			<td style="width:83px;"></td>
			<td style="width:255px;">For coating embryo culture dishes</td>
		</tr>
		<tr height="42">
			<td height="42" style="height:42px;width:227px;">Plastic petri dishes</td>
			<td style="width:348px;">VWR</td>
			<td style="width:83px;">612-2079</td>
			<td style="width:255px;">Coated with 1% Agarose in ASWH, covered with ASWH</td>
		</tr>
		<tr height="21">
			<td height="21" style="height:21px;width:227px;">Small scissors</td>
			<td style="width:348px;">any supplier</td>
			<td style="width:83px;"></td>
			<td style="width:255px;">For dissecting gametes</td>
		</tr>
		<tr height="42">
			<td height="42" style="height:42px;width:227px;">NaOH&#160;</td>
			<td style="width:348px;">Roth</td>
			<td style="width:83px;">6771.1</td>
			<td style="width:255px;">For activating dechorionation solution</td>
		</tr>
		<tr height="21">
			<td height="21" style="height:21px;width:227px;">Tris&#160;</td>
			<td style="width:348px;">Roth</td>
			<td style="width:83px;">5429.3</td>
			<td style="width:255px;">1M pH9.5, for sperm activation</td>
		</tr>
		<tr height="42">
			<td height="42" style="height:42px;width:227px;">Pasteur pipettes&#160;</td>
			<td style="width:348px;">VWR</td>
			<td style="width:83px;">612-1701</td>
			<td style="width:255px;">Treated by immersion in tap water for at least 12h</td>
		</tr>
		<tr height="21">
			<td height="21" style="height:21px;width:227px;">Hand centrifuge</td>
			<td style="width:348px;">Hettich Zentrifugen</td>
			<td style="width:83px;">1011</td>
			<td style="width:255px;">Use glass centrifuge tubes</td>
		</tr>
		<tr height="42">
			<td height="42" style="height:42px;width:227px;">1.5ml Eppendorf tubes</td>
			<td style="width:348px;">Sigma</td>
			<td style="width:83px;">T3406-250EA</td>
			<td style="width:255px;"></td>
		</tr>
		<tr height="42">
			<td height="42" style="height:42px;width:227px;">2ml Eppendorf tubes</td>
			<td style="width:348px;">Sigma</td>
			<td style="width:83px;">T3531-200EA</td>
			<td style="width:255px;"></td>
		</tr>
		<tr height="21">
			<td height="21" style="height:21px;width:227px;">Square electroporator</td>
			<td style="width:348px;">Bio Rad Gene Pulser Xcell</td>
			<td style="width:83px;"></td>
			<td style="width:255px;"></td>
		</tr>
		<tr height="21">
			<td height="21" style="height:21px;width:227px;">Electroporation cuvettes 4 mm</td>
			<td style="width:348px;">Eurogentec</td>
			<td style="width:83px;">CE-0004-50</td>
			<td style="width:255px;"></td>
		</tr>
		<tr height="42">
			<td height="42" style="height:42px;width:227px;">Coverslips</td>
			<td style="width:348px;">Sto Premium</td>
			<td style="width:83px;">PR248212600</td>
			<td style="width:255px;"></td>
		</tr>
		<tr height="42">
			<td height="42" style="height:42px;width:227px;">Glass slides</td>
			<td style="width:348px;">VWR</td>
			<td style="width:83px;">ECN 613-1551</td>
			<td style="width:255px;"></td>
		</tr>
		<tr height="42">
			<td height="42" style="height:42px;width:227px;">Glutaraldehyde</td>
			<td style="width:348px;">Sigma</td>
			<td style="width:83px;">G6257-10ML</td>
			<td style="width:255px;">For fixation in LacZ staining</td>
		</tr>
		<tr height="42">
			<td height="42" style="height:42px;width:227px;">Paraformaldehyde</td>
			<td style="width:348px;">Sigma&#160;</td>
			<td style="width:83px;">P6148-500G</td>
			<td style="width:255px;">For fixation of fluorescent samples</td>
		</tr>
		<tr height="21">
			<td height="21" style="height:21px;width:227px;">Vectashield</td>
			<td style="width:348px;">Vector</td>
			<td style="width:83px;">H-1000</td>
			<td style="width:255px;">For mounting of fluorescent samples</td>
		</tr>
		<tr height="42">
			<td height="42" style="height:42px;width:227px;">X-Gal (5-Bromo-4-chloro-3-indolyl &#223;-D-Galactopyranoside)</td>
			<td style="width:348px;">Roth</td>
			<td style="width:83px;">2315.2</td>
			<td style="width:255px;">LacZ substrate; stock in 40mg/ml DMF (Dimethylformamide)</td>
		</tr>
		<tr height="25">
			<td height="25" style="height:25px;width:227px;">K5Fe(CN)6</td>
			<td style="width:348px;">Merck</td>
			<td style="width:83px;">4984</td>
			<td style="width:255px;">For LacZ staining buffer</td>
		</tr>
		<tr height="25">
			<td height="25" style="height:25px;width:227px;">K3Fe(CN)6</td>
			<td style="width:348px;">Merck</td>
			<td style="width:83px;">4973</td>
			<td style="width:255px;">For LacZ staining buffer</td>
		</tr>
		<tr height="25">
			<td height="25" style="height:25px;width:227px;">Na22HPO4</td>
			<td style="width:348px;">Roth</td>
			<td style="width:83px;">4984.2</td>
			<td style="width:255px;">For PBT</td>
		</tr>
		<tr height="25">
			<td height="25" style="height:25px;width:227px;">KH2PO4</td>
			<td style="width:348px;">Roth</td>
			<td style="width:83px;">3904.2</td>
			<td style="width:255px;">For PBT</td>
		</tr>
		<tr height="21">
			<td height="21" style="height:21px;width:227px;">Tween&#160;</td>
			<td style="width:348px;">Sigma</td>
			<td style="width:83px;">SLBJ5103V</td>
			<td style="width:255px;">For PBT</td>
		</tr>
		<tr height="21">
			<td height="21" style="height:21px;width:227px;">Mineral Oil</td>
			<td style="width:348px;">Sigma</td>
			<td style="width:83px;">M8410</td>
			<td style="width:255px;">Embryo culture tested</td>
		</tr>
		<tr height="21">
			<td height="21" style="height:21px;width:227px;">Green Vital Dye</td>
			<td style="width:348px;">Fast Green Sigma&#160;</td>
			<td style="width:83px;">F7251</td>
			<td style="width:255px;">for microinjection; 10&#181;g/&#181;l</td>
		</tr>
		<tr height="42">
			<td height="42" style="height:42px;width:227px;">Micropipette Puller (Flaming/Brown)</td>
			<td style="width:348px;">Sutter Instruments</td>
			<td style="width:83px;">Model P-97</td>
			<td style="width:255px;">For pulling injection needles</td>
		</tr>
		<tr height="62">
			<td height="62" style="height:63px;width:227px;">Borosilicate glass capillaries GC100TF-10</td>
			<td style="width:348px;">Harvard Apparatus Ltd. UK</td>
			<td style="width:83px;">30-0038</td>
			<td style="width:255px;">1.0mm O.D. x0.78mm I.D., containing filament, for microinjection</td>
		</tr>
		<tr height="42">
			<td height="42" style="height:42px;width:227px;">Micromanipulator</td>
			<td style="width:348px;">Narishige</td>
			<td style="width:83px;">MWS-2</td>
			<td style="width:255px;">Three-axis Oil Hydraulic System; for 3D fine movement during injection</td>
		</tr>
		<tr height="42">
			<td height="42" style="height:42px;width:227px;">Injection holder</td>
			<td style="width:348px;">Narishige</td>
			<td style="width:83px;">1M-H1</td>
			<td style="width:255px;">For holding injection needles, entire system filled with mineral oil</td>
		</tr>
		<tr height="63">
			<td height="63" style="height:63px;width:227px;">All Glass Syringe</td>
			<td style="width:348px;">Walter Graf &#38; Co GmbH &#38; Co. KG&#160;</td>
			<td style="width:83px;">No. 95199.10427A4</td>
			<td style="width:255px;">10ml FortunaOptima; filled with mineral oil, for fine tuning of microinjection pressure&#160;</td>
		</tr>
		<tr height="21">
			<td height="21" style="height:21px;width:227px;">Morpholinos&#160;</td>
			<td style="width:348px;">GeneTools LLC, Pilomath, OR, USA</td>
			<td style="width:83px;"></td>
			<td style="width:255px;">Injection at 0.25-0.5mM</td>
		</tr>
		<tr height="21">
			<td height="21" style="height:21px;width:227px;">Capped mRNA</td>
			<td style="width:348px;">Ambion mMessage mMashine kit</td>
			<td style="width:83px;"></td>
			<td style="width:255px;">Injection at 0.05-0.5&#181;g/&#181;l&#160;</td>
		</tr>
		<tr height="21">
			<td height="21" style="height:21px;">Plasmid DNA</td>
			<td></td>
			<td></td>
			<td>Injection at 20 ng/&#181;l</td>
		</tr>
		<tr height="21">
			<td height="21" style="height:21px;">Recombination cloning kit</td>
			<td>Gateway BP Clonase Enzyme Mix Invitrogen</td>
			<td>11789-013</td>
			<td></td>
		</tr>
		<tr height="21">
			<td height="21" style="height:21px;">Recombination cloning kit</td>
			<td>Gateway LR Clonase Enzyme mix Invitrogen</td>
			<td>11791-019</td>
			<td></td>
		</tr>
	</tbody>
</table>

embryo microinjection and electroporation in the chordate ciona intestinalis

Simple model organisms are instrumental for in vivo studies of developmental and cellular differentiation processes. Currently, the evolutionary distance to man of conventional invertebrate model systems and the complexity of genomes in vertebrates are critical challenges to modeling human normal and pathological conditions. The chordate Ciona intestinalis is an invertebrate chordate that emerged from a common ancestor with the vertebrates and may represent features at the interface between invertebrates and vertebrates. A common body plan with much simpler cellular and genomic composition should unveil gene regulatory network (GRN) links and functional genomics readouts explaining phenomena in the vertebrate condition. The compact genome of Ciona, a fixed embryonic lineage with few divisions and large cells, combined with versatile community tools foster efficient gene functional analyses in this organism. Here, we present several crucial methods for this promising model organism, which belongs to the closest sister group to vertebrates. We present protocols for transient transgenesis by electroporation, along with microinjection-mediated gene knockdown, which together provide the means to study gene function and genomic regulatory elements. We extend our protocols to provide information on how community databases are utilized for in silico design of gene regulatory or gene functional experiments. An example study demonstrates how novel information can be gained on the interplay, and its quantification, of selected neural factors conserved between Ciona and man. Furthermore, we show examples of differential subcellular localization in embryonic cells, following DNA electroporation in Ciona zygotes. Finally, we discuss the potential of these protocols to be adapted for tissue specific gene interference with emerging gene editing methods. The in vivo approaches in Ciona overcome major shortcomings of classical model organisms in the quest of unraveling conserved mechanisms in the chordate developmental program, relevant to stem cell research, drug discovery, and subsequent clinical application.

Watch this Scientific Journal Video about Embryo Microinjection and Electroporation in the Chordate Ciona intestinalis at JoVE.com

Embryo Microinjection and Electroporation in the Chordate Ciona intestinalis

私たちは、 カタユウレイボヤにマイクロインジェクションやエレクトロポレーション技術を使用して、脊椎動物への脊索動物の姉妹グループを、一過性遺伝子導入および遺伝子ノックダウンを提示します。このような方法は、脊索とヘッド感覚上皮、およびヒト疾患関連遺伝子の多くのオルソログを含む脊椎動物の基本的な特性を備えています。この単純な無脊椎動物における機能ゲノミクスを容易にします。

脊索動物における胚のマイクロインジェクションやエレクトロポレーション<em&gt;カタユウレイボヤ</em

Simple model organisms are instrumental for in vivo studies of developmental and cellular differentiation processes. Currently, the evolutionary distance ...

Research

JoVE Journal

Developmental Biology

Embryo Microinjection and Electroporation in the Chordate Ciona intestinalis

Microbead Implantation in the Zebrafish Embryo

ゼブラフィッシュ胚におけるマイクロビーズの移植

The zebrafish has emerged as a valuable genetic model system for the study of developmental biology and disease. Zebrafish share a high degree of genomic ...

Imaging Subcellular Structures in the Living Zebrafish Embryo

リビングゼブラフィッシュ胚における細胞内構造のイメージング

In vivo imaging provides unprecedented access to the dynamic behavior of cellular and subcellular structures in their natural context. Performing such ...

Technique to Target Microinjection to the Developing Xenopus Kidney

Technique to Target Microinjection to the Developing Xenopus Kidney

開発にターゲットマイクロインジェクションのテクニック<em&gt;アフリカツメガエル</em&gt;腎臓

The embryonic kidney of Xenopus&#160;laevis (frog), the pronephros, consists of a single nephron, and can be used as a model for kidney disease. Xenopus ...

Gene Transfer into the Chicken Auditory Organ by In Ovo Micro-electroporation

Gene Transfer into the Chicken Auditory Organ by In Ovo Micro-electroporation

チキン聴覚器官への遺伝子導入によって、<em&gt;卵内</em&gt;マイクロエレクト​​ロポレーション

Chicken embryos are ideal model systems for studying embryonic development as manipulations of gene function can be conducted with relative ease in ovo. ...

In Ovo Electroporation in the Chicken Auditory Brainstem

In Ovo Electroporation in the Chicken Auditory Brainstem

鶏の聴覚脳幹における卵の電気穿孔

Electroporation is a method that introduces genes of interest into biologically relevant organisms like the chicken embryo. It is long established that ...

AFM and Microrheology in the Zebrafish Embryo Yolk Cell

原子間力顕微鏡とゼブラフィッシュ胚の卵黄細胞のレオロジー

Elucidating the factors that direct the spatio-temporal organization of evolving tissues is one of the primary purposes in the study of development. ...

Effectiveness of the Air Stripping in Two Salmonid Fish, Rainbow Trout (Oncorhynchus Mykiss) and Brown Trout (Salmo Trutta Morpha fario)

Effectiveness of the Air Stripping in Two Salmonid Fish, Rainbow Trout Oncorhynchus Mykiss and Brown Trout Salmo Trutta Morpha fario

2 つのサケ科の魚で空気除去の有効性 (オンコルヒュンクス) レインボー ・ トラウトやブラウン ・ トラウト (タイセイヨウサケMorpha fario)

Egg collection is one of the most crucial procedures during fish reproduction in salmonid hatcheries. Classic methods involve the use of hand massage on ...

Minimally Invasive Embryo Transfer and Embryo Vitrification at the Optimal Embryo Stage in Rabbit Model

ウサギモデルにおける最適胚期における低侵襲胚移植と胚ガラス化

Assisted reproductive techniques (ARTs), such as in vitro embryo culture or embryo cryopreservation, affect natural development patterns with perinatal ...

Microinjection-based System for In Vivo Implantation of Embryonic Cardiomyocytes in the Avian Embryo

鳥胚胚心筋細胞の生体内注入にマイクロインジェクション ベース システム

Interpreting the relative impact of cell autonomous patterning versus extrinsic microenvironmental influence on cell lineage determination represents a ...

In Vitro Reconstitution of Spatial Cell Contact Patterns with Isolated Caenorhabditis elegans Embryo Blastomeres and Adhesive Polystyrene Beads

In Vitro Reconstitution of Spatial Cell Contact Patterns with Isolated Caenorhabditis elegans Embryo Blastomeres and Adhesive Polystyrene Beads

単離されたカエノラブディティス・エレガンス胚ブラストミアと接着剤ポリスチレンビーズを用いた空間細胞接触パターンのインビトロ再構成

In multicellular systems, individual cells are surrounded by the various physical and chemical cues coming from neighboring cells and the environment. ...