Name: sediment core extrusion method at millimeter resolution using a calibrated, threaded-rod
Uploaded: 2016-08-17T14:00:00
Duration: 6 min 6 s
Description: Watch this Scientific Journal Video about Sediment Core Extrusion Method at Millimeter Resolution Using a Calibrated, Threaded-rod at JoVE.com

Denne forskningen ble gjort mulig i en del av et stipend fra BP / The Gulf of Mexico Forskningsinitiativet, C-BILDE, DEEP-C og delvis av British Petroleum / Florida Institute of Oceanography (BP / FIO) -Gulf oljevernberedskap, Response og Recovery Grants Program. Forfatterne takker Nico Zenzola for hans innspill i utviklingen av denne prosedyren. Forfatterne også takke mannskapet på R / V Weatherbird II for deres hjelp under feltprogrammet. Data kan nås på GRIIDC webside: https://data.gulfresearchinitiative.org/ (data / R1.x135.119: 0004 /), (data / Y1.x031.000: 0003 /), (data / Y1. x031.000: 0006 /), (R1.x135.120: 0004).

1. Samle sedimentkjerner <ol><li> Samle vannsedimentkjerne ved hjelp av multi-core, boks kjerne, stempel kjerne, etc. 4,7,12,14. Sørg for at kjernen delen er en meter eller mindre. </li><li> Sett polykarbonat eller akryl pucken inn i bunnen av kjernen. Påse at pucken er konsistent med den indre diameter av kjernerøret. Sett en gummipakning på den ytterste diameteren på pucken for å beholde helheten av sedimentkjerne. </li><li> Ved henting av kjernen, ekstrudere umiddelbart eller pakke for transport og lagring (se trinn 1.4 gjennom 1.6 for lagring og transport). </li><li> Sette inn et skum eller akryl pucken inn i overflaten av kjernerøret og forsiktig trykk ned til skummet eller akryl er like over sedimentet grensesnitt for å opprettholde integriteten av sedimentet-vann-grenseflaten under transport og lagring. </li><li> Sett lokket på toppen av kjernerøret og forsegle med elektriske tape. Sett lokket på bunnen av kjernen rør og forsegle med Electrical tape. Merk toppen cap med nødvendig prosjekt og prøve identifikatorer. </li><li> Oppbevar kjerner på ønsket temperatur basert på ønsket analyse. NB: For eksempel kan kjernene som benyttes for organisk kjemisk analyse eller biologisk analyse fryses (-20 ° C), mens kortvarig radioisotop kjerner kan oppbevares ved romtemperatur (~ 20-25 ° C). </li></ol> 2. Forbered Sub-sample Fartøy og Verktøy <ol><li> Merk sub-sample fartøy (f.eks, bokser, poser eller begre) med prosjektnavn, core området og tilvekst (f.eks PROJECT NAME_CORE SITE_0 - 2 mm), sammen med annen relevant identifikasjonsinformasjon (for eksempel dato, core type). </li><li> Monter og sterilisere (metanol) nødvendige skjæreredskaper (f.eks akryl padleårer, kitt kniver, etc.) og personlig verneutstyr (f.eks hansker, lab strøk, etc.). Merk: Disse redskapene og deres sterilisering prosedyrer vil avhenge av hvilken typeav analyse som skal utføres på hver sub-prøve. For eksempel, er en forutsetning for organisk kjemisk analyse, mens akryl- og plast redskap (i motsetning til metall) må brukes for uorganisk sporelementanalyser ved bruk av metall og akryl redskap (i motsetning til plast). </li></ol> 3. Forbered sedimentkjerne for Extrusion <ol><li> Dersom kjernen har blitt lagret eller konservert, fjerne bunnhetten først. For å gjøre dette kuttet bunnen hetten med et barberblad og mulighet for topplokket for å opprettholde et vakuum, som holder sediment i røret ved overføring til ekstruder (ekstrudering pucken må allerede være satt inn i bunnen av de bevarte kjerner ) (figur 1). </li><li> Ved ekstrudering umiddelbart etter samling, sett ekstrudering pucken inn i bunnen av kjernen. Deretter forsiktig satt kjernerøret på stempelet og feste kjernen til ekstruderen ved hjelp av klemmer. </li><li> Sørg for at det er minst 5 cm av gjenværende kjerne rør above det øverste klemme for prøvetaking krage. </li><li> Fjern topplokket. </li><li> Plasser prøvetakingsrøret på toppen av kjernerøret. Sørge for at kragen sitter i flukt med den øvre utstrekning av kjernerøret for å unngå enhver prøve tap. </li><li> Eksempel (eller forkaste hvis ikke nødvendig) vannet over sedimentet på dette punktet ved hjelp av en sprøyte eller sug. </li><li> Etter ekstraksjon av vann, begynner å dreie stempelet for å justere overflate mest sediment med overflaten av prøvetagningsrøret. </li></ol> 4. Extrusion <ol><li> Snu stempelet til det ønskede samplings oppløsning (typisk 1-2 mm, en hel omdreining = 2 mm under-prøve) (figur 1). </li></ol><img alt="Figur 1" src="/files/ftp_upload/54363/54363fig1.jpg" /> Figur 1:. Fotografier av Extruder Fotografier av ekstruderen som definerer stempelet (1), kobling (2), gjengestang (3), basis ekstruder (4), klemmene (5), kjernerøret (6), sampling krage (7), og strikk (8). <a href="https://www.jove.com/files/ftp_upload/54363/54363fig1large.jpg" target="_blank">Klikk her for å se en større versjon av dette tallet.</a> <ol start="2"><li> Bruk akrylplaten (kuttes til den indre diameter av prøvetakingsrøret) for å gjøre den opprinnelige prøve kuttet. Deretter beveger den sub-prøven mot kanten av prøvetagningsrøret langsomt mens posisjonering av passende prøvetakingsbeholderen under munningen av prøvetakingsrøret. </li><li> Begynne å presse prøven inn i prøvebeholderen. Etter at det meste av prøven er i beholderen, med de små redskaper (som sparkel) for å bevege en hvilken som helst gjenværende prøve i prøvetagningsrøret til prøvetakingsbeholderen. </li><li> Bruke den mindre implementere for å rense de gjenværende mengde av prøven fra akrylplate og en annen samplings overflate inn i prøvebeholderen. </li><li> Når prøven er fullstendig overført fra prøvetagningsrøret til beholderen, rengjør prøvetakings tools med avionisert vann, laboratorie kluter og / eller annen steriliserende væske (for eksempel metanol). Rengjør prøvetaking kragen følgelig med laboratorie kluter, avionisert vann og andre steriliseringsløsning. </li><li> Tett prøven fartøyet og forberede neste prøve fartøy for ekstrudering. Gjenta trinn 4.1 til 4.5 for hver subsample. </li></ol> 5. Tilbakestille Extruder <ol><li> Tilbake ekstruderen manuelt. Bruke en drill og gummibånd for å fremskynde prosessen med å tilbakestilling av stempelet til bunnen av den gjengede-stang. </li><li> Plasser gummibånd rundt stempels nær bunnen for det meste stabilitet. </li><li> Strekk strikken rundt hodet av bore og angi retningen av bore å rotere stempelet nedover. </li><li> Rotere stempelet ved hjelp av en lav hastighet på bore til den når ønsket høyde over bunnen av ekstruderen. Merk: Denne høyde er basert på lengden av kjernen som skal ekstruderes og ønsket samplings height. </li></ol>

<ol>
	<li>Abrahim, G. M. S., Parker, R. J. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/query.fcgi?db=PubMed&cmd=Search&doptcmdl=Citation&defaultField=Title+Word&term=Assessment+of+heavy+metal+enrichment+factors+and+the+degree+of+contamination+in+marine+sediments+from+Tamacki+Estuary,+Auchland,+New+Zealand.">Assessment of heavy metal enrichment factors and the degree of contamination in marine sediments from Tamacki Estuary, Auchland, New Zealand.</a> Env. Mon. and Assess. 136, 227-238 (2008).</li><li>Binford, M. W., Kahl, J. S., Norton, S. A. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/query.fcgi?db=PubMed&cmd=Search&doptcmdl=Citation&defaultField=Title+Word&term=Interpretation+of+210Pb+profiles+and+verification+of+the+CRS+dating+model+in+PIRLA+project+lake+sediment+cores.">Interpretation of 210Pb profiles and verification of the CRS dating model in PIRLA project lake sediment cores.</a> J. Paleolimnology. 9, 275-296 (1993).</li><li>Brenner, M., Schelske, C. L., Keenan, L. W. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/query.fcgi?db=PubMed&cmd=Search&doptcmdl=Citation&defaultField=Title+Word&term=Historical+rates+of+sediment+and+nutrient+accumulation+in+marshes+of+the+Upper+St.+Johns+River+Basin,+Florida.">Historical rates of sediment and nutrient accumulation in marshes of the Upper St. Johns River Basin, Florida.</a> J. Paleolimnology. 26, 241-257 (2001).</li><li>Brooks, G. R., et al. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/query.fcgi?db=PubMed&cmd=Search&doptcmdl=Citation&defaultField=Title+Word&term=Sediment+Pulse+in+the+NE+Gulf+of+Mexico+Following+the+2010+DWH+Blowout.">Sediment Pulse in the NE Gulf of Mexico Following the 2010 DWH Blowout.</a> PLoS ONE. 10 (7), 0132341 (2015).</li><li>Engstrom, D. R. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/query.fcgi?db=PubMed&cmd=Search&doptcmdl=Citation&defaultField=Title+Word&term=A+lightweight+extruder+for+accurate+sectioning+of+soft-bottom+lake+sediment+cores+in+the+field.">A lightweight extruder for accurate sectioning of soft-bottom lake sediment cores in the field.</a> Limno. and Oceano. 38 (8), 1796-1802 (1993).</li><li>Gordon, E., Go&#241;i, M. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/query.fcgi?db=PubMed&cmd=Search&doptcmdl=Citation&defaultField=Title+Word&term=Controls+on+the+distribution+and+accumulation+of+terrigenous+organic+matter+in+sediments+from+the+Mississippi+and+Atchafalaya+river+margin.">Controls on the distribution and accumulation of terrigenous organic matter in sediments from the Mississippi and Atchafalaya river margin.</a> Mar. Chem. 92, 331-352 (2004).</li><li>Hastings, D. W., et al. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/query.fcgi?db=PubMed&cmd=Search&doptcmdl=Citation&defaultField=Title+Word&term=Changes+in+sediment+redox+conditions+following+the+BP+DWH+Blowout+event.">Changes in sediment redox conditions following the BP DWH Blowout event.</a> Deep-Sea Res. II. , (2014).</li><li>Jones, P. D., et al. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/query.fcgi?db=PubMed&cmd=Search&doptcmdl=Citation&defaultField=Title+Word&term=High-resolution+palaeoclimatology+of+the+last+millennium+a+review+of+current+status+and+future+prospects.">High-resolution palaeoclimatology of the last millennium a review of current status and future prospects.</a> The Holocene. 1, 3-49 (2009).</li><li>Paris, C. B., et al. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/query.fcgi?db=PubMed&cmd=Search&doptcmdl=Citation&defaultField=Title+Word&term=Evolution+of+the+Macondo+Well+Blowout:+Simulating+the+Effects+of+the+Circulation+and+Synthetic+Dispersants+on+the+Subsea+Oil+Transport.">Evolution of the Macondo Well Blowout: Simulating the Effects of the Circulation and Synthetic Dispersants on the Subsea Oil Transport.</a> Env. Sci. &amp; Tech. 121203084426001, (2012).</li><li>Passow, U., Ziervogel, K., Aper, V., Diercks, A. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/query.fcgi?db=PubMed&cmd=Search&doptcmdl=Citation&defaultField=Title+Word&term=Marine+snow+formation+in+the+aftermath+of+the+Deepwater+Horizon+oil+spill+in+the+Gulf+of+Mexico.">Marine snow formation in the aftermath of the Deepwater Horizon oil spill in the Gulf of Mexico.</a> Env. Res. Letters. 7, 035301 (2012).</li><li>Radovi&#263;, J. R., Silva, R. C., Snowdon, R., Larter, S. R., Oldenburg, T. B. P. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/query.fcgi?db=PubMed&cmd=Search&doptcmdl=Citation&defaultField=Title+Word&term=Rapid+screening+of+glycerol+ether+lipid+biomarkers+in+recent+marine+sediment+using+APPI-P+FTICR-MS.">Rapid screening of glycerol ether lipid biomarkers in recent marine sediment using APPI-P FTICR-MS.</a> Anal. Chem. 88 (2), 1128-1137 (2016).</li><li>Romero, I. C., et al. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/query.fcgi?db=PubMed&cmd=Search&doptcmdl=Citation&defaultField=Title+Word&term=Hydrocarbons+in+Deep+Sea+Sediments+Following+the+2010+Deepwater+Horizon+Blowout+in+the+Northeast+Gulf+of+Mexico.">Hydrocarbons in Deep Sea Sediments Following the 2010 Deepwater Horizon Blowout in the Northeast Gulf of Mexico.</a> PLoS ONE. 10 (5), e0128371 (2015).</li><li>Santschi, P. H., Rowe, G. T. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/query.fcgi?db=PubMed&cmd=Search&doptcmdl=Citation&defaultField=Title+Word&term=Radiocarbon-derived+sedimentation+rates+in+the+Gulf+of+Mexico.">Radiocarbon-derived sedimentation rates in the Gulf of Mexico.</a> Deep-Sea Res. II. 55, 2572-2576 (2008).</li><li>Schwing, P. T., Romero, I. C., Brooks, G. R., Hastings, D. W., Larson, R. A., Hollander, D. J. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/query.fcgi?db=PubMed&cmd=Search&doptcmdl=Citation&defaultField=Title+Word&term=A+Decline+in+Deep-Sea+Benthic+Foraminifera+Following+the+Deepwater+Horizon+Event+in+the+Northeastern+Gulf+of+Mexico.">A Decline in Deep-Sea Benthic Foraminifera Following the Deepwater Horizon Event in the Northeastern Gulf of Mexico.</a> PLOSone. 10 (3), 0120565 (2015).</li><li>Valsangkar, A. B. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/query.fcgi?db=PubMed&cmd=Search&doptcmdl=Citation&defaultField=Title+Word&term=A+device+for+finer-scale+sub-sectioning+of+aqueous+sediments.">A device for finer-scale sub-sectioning of aqueous sediments.</a> Current Science. 92 (4), 5-8 (2007).</li><li>W&#246;rmer, L., Elvert, M., Fuchser, J., Lipp, J. S., Buttigieg, P. L., Zabel, M., Hinrichs, K. -. U. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/query.fcgi?db=PubMed&cmd=Search&doptcmdl=Citation&defaultField=Title+Word&term=Ultra-high-resolution+paleoenvironmental+records+via+direct+laser-based+analysis+of+lipid+biomarkers+in+sediment+core+samples.">Ultra-high-resolution paleoenvironmental records via direct laser-based analysis of lipid biomarkers in sediment core samples.</a> NAS Proceedings. 111 (44), 15669-15674 (2014).</li><li>Yeager, K. M., Santschi, P. H., Rowe, G. T. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/query.fcgi?db=PubMed&cmd=Search&doptcmdl=Citation&defaultField=Title+Word&term=Sediment+accumulation+and+radionuclide+inventories+(239,+240+Pu+,+210+Pb+and+234+Th+)+in+the+northern+Gulf+of+Mexico,+as+influenced+by+organic+matter+and+macrofaunal+density.">Sediment accumulation and radionuclide inventories (239, 240 Pu , 210 Pb and 234 Th ) in the northern Gulf of Mexico, as influenced by organic matter and macrofaunal density.</a> Marine Chemistry. 91, 1-14 (2004).</li><li>Ziervogel, K., et al. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/query.fcgi?db=PubMed&cmd=Search&doptcmdl=Citation&defaultField=Title+Word&term=Microbial+activities+and+dissolved+organic+matter+dynamics+in+oil-contaminated+surface+seawater+from+the+Deepwater+Horizon+oil+spill+site.">Microbial activities and dissolved organic matter dynamics in oil-contaminated surface seawater from the Deepwater Horizon oil spill site.</a> PLoS One. 7 (4), e34816 (2012).</li></ol>

The authors have nothing to disclose.

Ekstruderen kan modifiseres for å romme flere diametere på kjernerøret. Dersom kjernediameteren forandres, da stempel, pucken, og diametre klem må justeres tilsvarende. Denne endringen gjør det mulig for brede programmer i lacustrine og marine sedimenter samling. De sedimentkjerner kan også ekstrudert i felten eller i laboratoriet. En vanlig modifisering for å lette transporten av dette ekstrudering systemet er å bygge den i to seksjoner; en nedre seksjon (base og stempel) kan deretter bli koblet til den øvre seksjon (klemmer). Det er noen begrensninger i denne ekstrudering metoden. Den første av disse er at hver kjerne eller kjerneseksjon, må kuttes til en meters lengde eller mindre. Som med en hvilken som helst metode ekstrudering, er det også uunngåelig noe komprimering. Imidlertid komprimering som følge av denne fremgangsmåte er minimal. Reproduserbarheten av flere poster ekstrudert på denne måten er innen 2-4 mm. Dette reproduserbarhet er beregnet på sammenligninger mellom ulikeposter (spormetall, organisk geokjemi, bentiske foraminiferer, sedimentologi) samlet på samme utplassering av en åtte kjerne flerkjernet system. Dette ekstrudering metoden er også best egnet for sedimenter som er hovedsakelig (&gt; 50%) silt og leire størrelse partikler. Sedimentere overveiende (&gt; 50%) bestående av sand størrelse-partikler har en tendens til å binde seg, utsettes for ekstra komprimering, på grunn av en høyere friksjonskoeffisient. Den endelige begrensning i forbindelse med denne fremgangsmåte er mengden av sediment er tilgjengelig fra hvert inkrement i millimeter-skala oppløsning. Denne fremgangsmåten gir omtrent 15-20 g våt masse og 3-10 g tørr masse ved 2 mm oppløsning, som kan være begrensende for noen analyseprotokoller. De sedimentære registreringer av Deepwater Horizon hendelsen i den nordlige delen av Mexicogolfen demonstrere effekten av millimeter-skala undersamplingen. Først av alt, 234 Th dating ville ikke vært mulig uten millimeter-skala undersamplingen. Dette dating method kan bare brukes under visse omstendigheter, som er nærmere omtalt 4. Pulsen på oljet-flocculent materiale etter Deepwater Horizon-hendelsen oppfylt disse forholdene, innskudd opp til 8 mm av materialet på visse steder i den nordlige delen av Mexicogolfen i 6-12 måneder. Uten mm skala prøvetaking, den geochronology av denne hendelsen ikke ville ha blitt løst på under årlige skala (tabell 2 og 3). I tillegg til de 234 Th poster, ville redoks-sensitive spormetaller, bentiske foraminiferal tetthet, og de ​​organiske geokjemi registreringer av denne hendelsen har vært begrenset til ett datapunkt i overflaten centimeter (tabell 3). I stedet bruker millimeter-skala sub sampling gitt en detaljert og robust (5-10 datapunkt) registrering av MOSSFA hendelsen. Spesielt en 4-dobling (n = 18) over forhåndsDeepWater Horizon-verdier i alt alifater hjelp mm skala delsampling ville ha blitt redusert til en to-foldøke, ved hjelp cm skala subsampling (n = 6). Følgelig, en nedgang i bunnlevende foraminiferal tetthet på 90% ved bruk mm skala delsampling ville ha blitt redusert til en nedgang på 60% ved bruk cm skala undersamplingen. Uten denne høye oppløsningen prøvetaking, ville diskrete doble toppene Mn oksid, samt endringer i sedimentære Re konsentrasjoner forbundet med ikke steady-state redoks endringene ikke løses. Alt i alt gir dette ekstrudering systemet evnen til å subsample sedimentkjerner i mm skala som tar vare på hele volumet av prøven, og kan bli modifisert for brede anvendelser i vannsedimentprøver. Fremtidige anvendelser av denne fremgangsmåte kan omfatte vurdering av tidligere oljesøl, på grunn av den mm stilt arrangement stratigrafi i forbindelse med underjordiske olje- utslipp. Andre programmer kan inkludere lacustrine registreringer av mm skala klimavariasjoner. Millimeter skala sub-sampling har vist seg effektiv i å karakterisere hendelsen stratigrafi i sammenheng med anthropogenically påvirketsystemer.

Sediment kjerneprøver fra lacustrine, estuarine, og marine (kontinentalsokkelen og skråningen) miljøer har gitt registreringer av saltholdighet, temperatur, organiske og uorganiske miljøgifter og mange andre miljøparametre på tiår til tusenårig tidsskalaer 1-3,6,8,13 , 17. I de fleste tilfeller er standard praksis er § disse kjernene på halv centimeter eller centimeter mellomrom 5,15. Denne oppløsningen er egnet for multi-år, dekadisk eller høyere skala oppløsning i de fleste tilfeller. Behovet for økt ekstrudering oppløsning er nylig blitt påvist i enkelte rapporter som detektert variasjon av sedimentære biomarkører / fullmakter på en fin skala langs den vertikale profil av sedimentkjerne 11,16. I tilfelle av siste sedimentering som opptrer på tidsskalaer på måneder til ett år, er det da nødvendig å anvende finere oppløsning subsampling metoder (f.eks mm skala). Dette er ofte utfordrende med vann sedimenter på grunn av than ukonsolidert natur av de overflatesedimenter. Vi presenterer en sedimentkjerne ekstrudering metode som gir mm skala sediment delprøvene. Vi bruker da denne ekstrudering metoden til sedimentene i den nordlige delen av Mexicogolfen etter Deepwater Horizon (DWH) hendelse. Dette programmet viser effekten av millimeter-skala delsampling karakterisere under årlig arrangement stratigraphy relatert til anthropogenically påvirket avsetningssystemer. Månedlig eller sub-årlige skala oppløsning i sedimentære postene er spesielt fordelaktig når karakterisere forbigående fenomen stratigrafi. Miljøvurderinger ved hjelp av sub-årlige vedtak er i stand til å fullt ut karakter anthropogenically indusert sedimenterings hendelser. Sedimenter i den nordlige delen av Mexicogolfen som ble rammet av Deepwater Horizon olje hendelsen er et eksempel på arrangement stratigrafi fullstendig karakterisert ved hjelp millimeter (sub-årlig) scale oppløsning prøvetaking. Etter Deepwater Horizon (DWH) hendelse i 2010, kontinentalskråningen sedimenter av den nordøstlige delen av Mexicogolfen (Ngom) kom i kontakt med hydrokarboner gjennom en størrelsesorden økning i flocculent hydrokarbon deponering 4,9,10,12,14,18. Økningen i sedimentering ble forårsaket av en Marine Oil Snø Sedimentasjon og flocculent Oppsamling (MOSSFA) hendelse 4,9,10,12,14,18. Dette resulterte i ca 6-10 mm av sediment akkumulering i en 6-12 måneders periode fra midten av 2010 til begynnelsen av 2011 fire. Det var nødvendig å sub-sample disse sedimentkjerner på millimeter-skala til fullt karakter inngangene, priser av sedimente og post-avsetningsprosesser.

<table border="1" fo:keep-together.within-page="1" fo:keep-with-next.within-page="always">
	<tbody>
		<tr>
			<td>Extruder</td>
			<td>Custom Fabrication</td>
			<td></td>
			<td>Aluminum base and clamps, steel threaded rod&#160;</td>
		</tr>
		<tr>
			<td>Piston</td>
			<td>Custom Fabrication</td>
			<td></td>
			<td>PVC tubing with acrylic cap</td>
		</tr>
		<tr>
			<td>Polycarbonate Core Tube</td>
			<td>SABIC Poymershapes</td>
			<td>68374192</td>
			<td></td>
		</tr>
		<tr>
			<td>Acrylic puck/Rubber Gasket</td>
			<td>Custom Fabrication</td>
			<td></td>
			<td></td>
		</tr>
		<tr>
			<td>Acrylic sampling collar</td>
			<td>Custom Fabrication</td>
			<td></td>
			<td></td>
		</tr>
		<tr>
			<td>Acrylic plate</td>
			<td>Custom Fabrication</td>
			<td></td>
			<td>One edge bevelled at 45 degree angle</td>
		</tr>
		<tr>
			<td>Putty knife</td>
			<td>Fisher Scientific</td>
			<td><a href="https://www.fishersci.com/shop/products/ampco-safety-putty-knives-4/19166432">19-166-432</a></td>
			<td></td>
		</tr>
		<tr>
			<td>Steel/Acrylic Plates</td>
			<td>Custom Fabrication</td>
			<td></td>
			<td></td>
		</tr>
		<tr>
			<td>Electrical tape</td>
			<td>McMaster Carr</td>
			<td>76455A28</td>
			<td></td>
		</tr>
		<tr>
			<td>Siphon or Syringe</td>
			<td>Fisher Scientific</td>
			<td>14-176-227, 14-823-2A</td>
			<td></td>
		</tr>
		<tr>
			<td>Razor blade</td>
			<td>Fisher Scientific</td>
			<td>12-640</td>
			<td></td>
		</tr>
		<tr>
			<td>Drill</td>
			<td>Ryobi</td>
			<td>P-882</td>
			<td></td>
		</tr>
		<tr>
			<td>Thick rubber band</td>
			<td>Staples</td>
			<td>831636</td>
			<td>2-3 cm in width, larger diameter than piston</td>
		</tr>
		<tr>
			<td>Personal protection equipment</td>
			<td>Fisher Scientific</td>
			<td>Gloves-19-058-801C, 
			lab coat- 17-100-850, 
			Goggles-19-181-501</td>
			<td>e.g. gloves, lab coat, goggles</td>
		</tr>
		<tr>
			<td>Sample labels</td>
			<td>Fisher Scientific</td>
			<td><a href="https://www.fishersci.com/shop/products/fisherbrand-patient-id-labels-addressograph-2/15920">15920</a></td>
			<td></td>
		</tr>
		<tr>
			<td>Sample vessels</td>
			<td>Fisher Scientific</td>
			<td>Whirlpak- 01-812-3, 
			&#160;Jar- 02-911-791</td>
			<td>e.g.whirlpak bags, jars, etc.</td>
		</tr>
		<tr>
			<td>Laboratory wipes</td>
			<td>Fisher Scientific</td>
			<td>06-666-11</td>
			<td>e.g. kim wipes</td>
		</tr>
		<tr>
			<td>Methanol</td>
			<td>Fisher Scientific</td>
			<td>BP1105-1</td>
			<td></td>
		</tr>
		<tr>
			<td>Deionized water</td>
			<td></td>
			<td></td>
			<td></td>
		</tr>
	</tbody>
</table>

sediment core extrusion method at millimeter resolution using a calibrated, threaded-rod

Aquatic sedimentkjerne delsampling vanligvis utføres på cm eller halv cm oppløsning. Avhengig av senkningsreaksjon og avsetningsmiljø, gir dette vedtaket rekordene den årlige til dekadisk skala, i beste fall. En ekstruderingsmetode, ved hjelp av en kalibrert, gjengestang er presentert her, noe som gjør det mulig for millimeter skala subsampling av vannsedimentkjerner av varierende diametre. Millimeter skala delsampling åpner for sub-årlig til månedlig analyse av sedimentære posten, en størrelsesorden høyere enn vanlig prøvetakingsordninger. Ekstruderen består av en 2 m aluminiumsramme og base, to kjerne slangeklemmer, en gjengestang, og en en m stempel. Sedimentet kjerne er plassert over stempelet og festet til rammen. En akryl prøvetakingsrøret er festet til de øverste 5 cm av kjernerøret og tilveiebringer en plattform for å trekke ut sub-sampler. Stempelet roteres rundt gjengestangen på kalibrerte intervaller og skyver forsiktig sedimentet ut tilp av kjernerøret. Sedimentet blir deretter isolert inn i prøvetakingsrøret og plassert i en passende prøvebeholder (f.eks, krukke eller pose). Denne metoden bevarer også den ikke-konsoliderte prøver (dvs. høy pore vanninnhold) på overflaten, og gir en konsistent samplingsvolum. Denne mm skala ekstrudering metoden ble brukt til kjerner som samles i den nordlige delen av Mexicogolfen etter Deepwater Horizon ubåten olje utgivelse. Tyder på at det er nødvendig å ta prøver på mm skala for å fullkarakterisere hendelser som skjer på den månedlige tidsskala for kontinentalskråningen sedimenter.

Kjerner fra nettstedet DSH08 ble samlet i desember 2010 (29 ° 7,25 &#39;N, 87 ° 51.93&#39; W, 1143 m dyp) ved hjelp av en Ocean Instruments MC-800 multicorer. Disse kjernene ble ekstrudert ved 2 mm for surficial 15 cm (eller flere) ved anvendelse av protokollen ovenfor. Den pre-DWH (før 2010) og post-DWH (2010) intervaller på kjernen ble bestemt ved hjelp av en sammenkoblet kortvarig radioisotop (234 Th og 210 Pb) geochronology 4. Flere andre analyser ble utført for å begrense de sedimentære innganger, deponering priser, og post-avsetningsprosesser på dette nettstedet etter Deepwater Horizon-hendelsen. I tillegg til kortvarig radioisotop analyse, total alifatiske konsentrasjon 12, redoks sensitive metaller (mangan, rhenium) 7, og total bunnlevende foraminiferal tetthet 14 ble kvantifisert. En sammenligning av hver av disse parametre ved skalaen mm og cm skala ble utført (tabell2 og 3, figur 2). Centimeter skala data ble komponert av integrerte, mener mm Vekt data. <table border="1" fo:keep-together.within-page="1" fo:keep-with-next.within-page="always"><tbody><tr><td> Topp Dybde (mm) </td><td> overflødig Pb-210 (dpm / g) </td><td> overflødig Th-234 (dpm / g) </td><td> Th-234 og Pb-210 Sammenslåtte Age modell (år) </td><td> Total Foraminiferal tetthet (indiv./cm 3) </td><td> [Re] (ng / g) </td><td> [Mn] (mg / g) </td><td> Total Alifater (ng / g) </td></tr><tr><td> 0 </td><td> 71,81 </td><td> 6,19 </td><td> 2010,9 </td><td> 1 </td><td></td><td></td><td> 336922,6 </td></tr><tr><td> 2 </td><td> 71,81 </td><td> 5.14 </td><td> 2010,9 </td><td> 3 </td><td> 0.69 </td><td> 10.2 </td><td> 53701,4 </td></tr><tr><td> 4 </td><td> 69,91 </td><td> 2,72 </td><td> 2010,8 </td><td> 2 </td><td> 0,53 </td><td> 15.9 </td><td> 77081,2 </td></tr><tr><td> 6 </td><td> 70.32 </td><td> 1,57 </td><td> 2010,8 </td><td> 6 </td><td> 0,57 </td><td> 12.1 </td><td> 48057,4 </td></tr><tr><td> 8 </td><td> 69.67 </td><td> 1.15 </td><td> 2010,7 </td><td> 10 </td><td> 0,61 </td><td> 11.3 </td><td> 42888,0 </td></tr><tr><td> 10 </td><td> 61.39 </td><td> 0,29 </td><td> 2009,6 </td><td> 10 </td><td> 0,73 </td><td> 8.30 </td><td> 50786,4 </td></tr><tr><td> 12 </td><td> 56.50 </td><td> 0,64 </td><td> 2008,5 </td><td> 12 </td><td> 0,75 </td><td> 7.1 </td><td> 51582,9 </td></tr><tr><td> 14 </td><td> 63.31 </td><td> 0,00 </td><td> 2007,5 </td><td> 11 </td><td></td><td></td><td> 52126,8 </td></tr> &lt;tr&gt; <td> 16 </td><td> 51.55 </td><td> 0,00 </td><td> 2006,5 </td><td> 11 </td><td> 0,79 </td><td> 6.9 </td><td> 59046,6 </td></tr><tr><td> 18 </td><td> 51.69 </td><td> 0,00 </td><td> 2005,6 </td><td> 10 </td><td> 0,77 </td><td> 7.1 </td><td> 48384,8 </td></tr><tr><td> 26 </td><td> 44.26 </td><td></td><td> 2000,7 </td><td> 9 </td><td></td><td></td><td> 31774,7 </td></tr><tr><td> 32 </td><td> 38.25 </td><td></td><td> 1997,2 </td><td> 9 </td><td> 0,83 </td><td> 8.3 </td><td> 37128,4 </td></tr><tr><td> 34 </td><td> 41.57 </td><td></td><td> 1996,0 </td><td> 12 </td><td></td><td></td><td> 25849,4 </td></tr><tr><td> 38 </td><td> 39.11 </td><td></td><td> 1993,1 </td><td></td><td></td><td></td><td> 29901,6 </td></tr><tr><td> 42 </td><td> 35.18 </td><td></td><td> 1990,1 </td><td> 10 </td><td> 0,89 </td><td> 8.0 </td><td> 257300,4 </td></tr><tr><td> 46 </td><td> 38.80 </td><td></td><td> 1987,0 </td><td> 12 </td><td></td><td></td><td> 23159,6 </td></tr><tr><td> 48 </td><td> 32,58 </td><td></td><td> 1985,3 </td><td></td><td></td><td></td><td> 21387,0 </td></tr><tr><td> 50 </td><td> 26.71 </td><td></td><td> 1983,3 </td><td> 9 </td><td> 0,94 </td><td> 5.3 </td><td> 15331,0 </td></tr><tr><td> 70 </td><td> 17.32 </td><td></td><td> 1965,8 </td><td> 11 </td><td> 1,33 </td><td> 2.2 </td><td></td></tr><tr><td> 90 </td><td> 10.32 </td><td></td><td> 1945,9 </td><td></td><td> 2.04 </td><td> 1.3 </td><td></td></tr><tr><td> 110 </td><td> 5,36 </td><td></td><td> 1923,3 </td><td></td><td> 2.12 </td><td> 1.2 </td><td></td></tr><tr><td> 130 </td><td> 2,21 </td><td></td><td> 1899,1 </td><td></td><td></td><td></td><td></td></tr><tr><td> 140 </td><td> 1.71 </td><td></td><td> 1888,5 </td><td></td><td></td><td></td><td></td></tr></tbody></table> Tabell 1: Millimeter-skala Oppløsning av data fra Kjernen nettstedet DSH08 kortlivede radioisotop aktiviteter, geochronology, bunn foraminiferal tetthet, solid-fase Redox sensitive metallkonsentrasjoner (Mn, Re), og totale alifatiske konsentrasjons postene for kjerne nettstedet DSH08 samlet i desember. 2010, delutvalgt på to millimeter trinn 4,7,12,14. <table border="1" fo:keep-together.within-page="1" fo:keep-with-next.within-page="always"><tbody><tr><td> Topp Dybde (mm) </td><td> overflødig Pb-210 (dpm / g) </td><td> overflødig Th-234 (dpm / g) </td><td> Th-234 og Pb-210 Sammenslåtte Age modell (år) </td><td> Total Foraminiferal tetthet (indiv./cm 3) </td><td> [Re] (ng / g) </td><td> [Mn] (mg / g) </td><td> Total Alifater (ng / g) </td></tr><tr><td> 0 </td><td> 70,70 </td><td> N / A </td><td> 2010 </td><td> 4 </td><td> 0,60 </td><td> 12.4 </td><td> 111730,1 </td></tr><tr><td> 1 </td><td> 56.89 </td><td></td><td> 2006,2 </td><td> 11 </td><td> 0,76 </td><td> 7.3 </td><td> 52385,5 </td></tr><tr><td> 2 </td><td> 44.26 </td><td></td><td> 2000,5 </td><td> 9 </td><td> 0,00 </td><td></td><td> 31774,7 </td></tr><tr><td> 3 </td><td> 39.65 </td><td></td><td> 1995,5 </td><td> 12 </td><td> 0,83 </td><td> 8.3 </td><td> 30959,8 </td></tr><tr><td> 4 </td><td> 35.52 </td><td></td><td> 1989,7 </td><td> 11 </td><td> 0,89 </td><td> 8.0 </td><td> 22273,3 </td></tr><tr><td>5 </td><td> 26.71 </td><td></td><td> 1981,9 </td><td> 9 </td><td> 0,94 </td><td> 5.3 </td><td> 15331,0 </td></tr><tr><td> 6 </td><td></td><td></td><td></td><td></td><td></td><td></td><td></td></tr><tr><td> 7 </td><td> 17.32 </td><td></td><td> 1967,1 </td><td> 11 </td><td> 1,33 </td><td> 2.2 </td><td></td></tr><tr><td> 8 </td><td></td><td></td><td></td><td></td><td></td><td></td><td></td></tr><tr><td> 9 </td><td> 10.32 </td><td></td><td> 1945,2 </td><td></td><td> 2.04 </td><td> 1.3 </td><td></td></tr><tr><td> 10 </td><td></td><td></td><td></td><td></td><td></td><td></td><td></td></tr><tr><td> 11 </td><td> 5,36 </td><td></td><td> 1917,6 </td><td></td><td> 2.12 </td><td> 1.2 </td><td></td></tr><tr><td> 12 </td><td></td><td></td><td></td><td></td><td></td> &lt;td&gt; </td><td></td></tr><tr><td> 1. 3 </td><td> 2,21 </td><td></td><td></td><td></td><td></td><td></td><td></td></tr><tr><td> 14 </td><td> 1.71 </td><td></td><td></td><td></td><td></td><td></td><td></td></tr></tbody></table> Tabell 2: Centimeter -s cale Oppløsning av data fra Kjernen nettstedet DSH08 kortlivede radioisotop aktiviteter, geochronology, bunn foraminiferal tetthet, solid-fase Redox sensitive metallkonsentrasjoner (Mn, Re), og totale alifatiske konsentrasjons postene for kjerne nettstedet DSH08 samlet inn i. desember 2010, integrert i én centimeter trinn 4,7,12,14. <img alt="Figur 2" src="/files/ftp_upload/54363/54363fig2.jpg" /> Figur 2: Grafisk fremstilling av Millimeter og Centimeter-skala Oppløsning data. Kortlivede radioisotop activteter, alder modell, bentiske foraminiferal tetthet, solid-fase Redox sensitive metallkonsentrasjoner (Mn, Re), og totale alifatiske konsentrasjons poster for kjerne nettstedet DSH08 samlet i desember 2010, delutvalgt på to millimeter trinn (blå diamanter) og trinn på én centimeter (røde firkanter) 4,7,11,13. <a href="https://www.jove.com/files/ftp_upload/54363/54363fig2large.jpg" target="_blank">klikk her for å se en større versjon av dette tallet.</a> Millimeter skala subsampling (og sedimentære betingelser, se 4) er tillatt for 234 Th å bli brukt som et kronometer på sub-årlig skala (n = 7). Ved cm skala, ville dette ikke være levedyktig for fremstilling av en geochronology fordi overflaten centimeter ville bli redusert til en måling (n = 1). Totalt alifatiske konsentrasjoner økte fra 36,322.3 ng / g dw (pre-DWH) til 336,922.6 ng / g dw (post-DWH) i henhold til de mm skala poster, mens the post-DWH økning i henhold til centimeter skala integrert middel var 111,730.1 ng / g dw. Totalt fastsittende foraminiferal densitet ble redusert fra pre-DWH (gjennomsnitt = 11 indiv./cm 3) for å legge inn-DWH (gjennomsnitt = 1 indiv./cm 3) på skalaen mm (n = 17) og fra pre-DWH (gjennomsnitt = 10 indiv./cm 3) til post-DWH (gjennomsnitt = 4 indiv./cm 3) på cm skalaen (n = 7). Den subtile Økningen i rhenium i surficial 2 mm, noe som er en indikasjon på reduksjonsbetingelser, ville heller ikke løses ved centimeter oppløsning.

Watch this Scientific Journal Video about Sediment Core Extrusion Method at Millimeter Resolution Using a Calibrated, Threaded-rod at JoVE.com

Sediment Core Extrusion Method at Millimeter Resolution Using a Calibrated, Threaded-rod

En ekstrudering ved anvendelse av en kalibrert gjengestang er presentert, som tillater mm skala subsampling av vannsedimentkjerner. Millimeter-skala prøvetaking er nødvendig for å fullkarakterisere nylig hendelse stratigrafi i sediment poster.

Sedimentkjerne Extrusion Method på Millimeter oppløsning ved hjelp av en kalibrert, Gjenget-stang

Aquatic sediment core subsampling is commonly performed at cm or half-cm resolution. Depending on the sedimentation rate and depositional environment, ...

Research

JoVE Journal

Chemistry

Untargeted Metabolomics from Biological Sources Using Ultraperformance Liquid Chromatography-High Resolution Mass Spectrometry (UPLC-HRMS)

Untargeted Metabolomics from Biological Sources Using Ultraperformance Liquid Chromatography-High Resolution Mass Spectrometry UPLC-HRMS

Vilkårlige Metabolomics fra biologiske kilder Bruke UltraPerformance væskekromatografi-High Resolution massespektrometri (UPLC-HRMS)

Here we present a workflow to analyze the metabolic profiles for biological samples of interest including; cells, serum, or tissue. The sample is first ...

Covalent Binding of BMP-2 on Surfaces Using a Self-assembled Monolayer Approach

Covalent Binding av BMP-2 på overflater Bruke en Self-montert med ett lag Approach

Bone morphogenetic protein 2 (BMP-2) is a growth factor embedded in the extracellular matrix of bone tissue. BMP-2 acts as trigger of mesenchymal cell ...

Exploring the Radical Nature of a Carbon Surface by Electron Paramagnetic Resonance and a Calibrated Gas Flow

Exploring the Radical Nature av en Carbon Surface av Electron Para Resonance og en kalibrert Gas Flow

While the first Electron Paramagnetic Resonance (EPR) studies regarding the effects of oxidation on the structure and stability of carbon radicals date ...

Synthesis, Characterization, and Functionalization of Hybrid Au/CdS and Au/ZnS Core/Shell Nanoparticles

Syntese, karakterisering og funksjon av Hybrid Au / CDer og Au / ZnS Kjerne / Shell Nanopartikler

Plasmonic nanoparticles are an attractive material for light harvesting applications due to their easily modified surface, high surface area and large ...

A Simple Method for the Size Controlled Synthesis of Stable Oligomeric Clusters of Gold Nanoparticles under Ambient Conditions

En enkel metode for størrelsen Kontrollert Syntese av Stabile Oligomere Klynger av gull nanopartikler under omgivelses

Reducing dilute aqueous HAuCl4 with sodium thiocyanate (NaSCN) under alkaline conditions produces 2 to 3 nm diameter nanoparticles. Stable grape-like ...

Generation of Zerovalent Metal Core Nanoparticles Using n-(2-aminoethyl)-3-aminosilanetriol

Generation of Zerovalent Metal Core Nanoparticles Using n-2-aminoethyl-3-aminosilanetriol

Generering av Zerovalent Kjerne nanopartikler ved anvendelse av N- (2-aminoetyl) -3-aminosilanetriol

In this work, a facile one-pot reaction for the formation of metal nanoparticles in a water solution through the use of ...

Rapid High-throughput Species Identification of Botanical Material Using Direct Analysis in Real Time High Resolution Mass Spectrometry

Rapid Høy throughput Arter Identifikasjon av Botanisk Material Bruke direkte analyse i Real Time High Resolution massespektrometri

We demonstrate that direct analysis in real time-high resolution mass spectrometry can be used to produce mass spectral profiles of botanical material, ...

Synthesis of Core-shell Lanthanide-doped Upconversion Nanocrystals for Cellular Applications

Syntese av Core-shell transisjonsmetall-dopet Upconversion nanokrystaller for mobil-programmer

Lanthanide-doped upconversion nanocrystals (UCNs) have attracted much attention in recent years based on their promising and controllable optical ...

Preparation of Functional Silica Using a Bioinspired Method

Utarbeidelse av funksjonelle Silica bruke en Bioinspired

The goal of the protocols described herein is to synthesize bioinspired silica materials, perform enzyme encapsulation therein, and partially or totally ...

A New Straightforward Method for Lipophilicity (logP) Measurement using 19F NMR Spectroscopy

A New Straightforward Method for Lipophilicity logP Measurement using 19F NMR Spectroscopy

En ny grei metode for lipofile stoffer (LoggP) måling med 19F NMR spektroskopi

Fluorination has become an effective tool to optimize physicochemical properties of bioactive compounds. One of the applications of fluorine introduction ...