Name: quantitative 3d in silico modeling (q3dism) of cerebral amyloid-beta phagocytosis in rodent models of alzheimer's disease
Uploaded: 2016-12-26T13:00:00
Description: Watch this Scientific Journal Video about Quantitative 3D In Silico Modeling q3DISM of Cerebral Amyloid-beta Phagocytosis in Rodent Models of Alzheimer's Disease at JoVE.com

M-V.G-S. is supported by a BrightFocus Foundation Alzheimer's Disease Research Fellowship Award (A2015309F) and an Alzheimer's Association, California Southland Chapter Young Investigator Award. T.M.W. is supported by an ARCS Foundation and John Douglas French Alzheimer's Foundation Maggie McKnight Russell-JDFAF Memorial Postdoctoral Fellowship. This work was supported by the National Institute on Neurologic Disorders and Stroke (1R01NS076794-01, to T.T.), an Alzheimer's Association Zenith Fellows Award (ZEN-10-174633, to T.T.), and an American Federation of Aging Research/Ellison Medical Foundation Julie Martin Mid-Career Award in Aging Research (M11472, to T.T.). We are grateful for startup funds from the Zilkha Neurogenetic Institute, which helped to make this work possible. &#8195;

הצהרה של אתיקה של מחקר: כל הניסויים מעורבים בעלי חיים המפורטים כאן אושרו על ידי האוניברסיטה של טיפול בבעלי חיים מוסדיים דרום קליפורניה ועדת שימוש (IACUC) וביצע בהתאם קפדנית עם National Institutes of הנחיות בריאות והמלצות מהאגודה הערכה וההסמכה של מעבדה הבינלאומי טיפול בבעלי חיים. </p...

<ol>
	<li>Brookmeyer, R., et al. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/query.fcgi?db=PubMed&cmd=Search&doptcmdl=Citation&defaultField=Title+Word&term=National+estimates+of+the+prevalence+of+Alzheimer's+disease+in+the+United+States.">National estimates of the prevalence of Alzheimer's disease in the United States.</a> Alzheimers Dement. 7 (1), 61-73 (2011).</li><li>Selkoe, D. J. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/query.fcgi?db=PubMed&cmd=Search&doptcmdl=Citation&defaultField=Title+Word&term=Alzheimer's+disease.">Alzheimer's disease.</a> Cold Spring Harb Perspect Biol. 3 (7), (2011).</li><li>Heneka, M. T., Golenbock, D. T., Latz, E. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/query.fcgi?db=PubMed&cmd=Search&doptcmdl=Citation&defaultField=Title+Word&term=Innate+immunity+in+Alzheimer's+disease.">Innate immunity in Alzheimer's disease.</a> Nat Immunol. 16 (3), 229-236 (2015).</li><li>Mawuenyega, , et al. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/query.fcgi?db=PubMed&cmd=Search&doptcmdl=Citation&defaultField=Title+Word&term=Decreased+clearance+of+CNS+beta-amyloid+in+Alzheimer's+disease.">Decreased clearance of CNS beta-amyloid in Alzheimer's disease.</a> Science. 330 (6012), 1774 (2010).</li><li>Hickman, S. E., Allison, E. K., El Khoury, J. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/query.fcgi?db=PubMed&cmd=Search&doptcmdl=Citation&defaultField=Title+Word&term=Microglial+dysfunction+and+defective+beta-amyloid+clearance+pathways+in+aging+Alzheimer's+disease+mice.">Microglial dysfunction and defective beta-amyloid clearance pathways in aging Alzheimer's disease mice.</a> J Neurosci. 28 (33), 8354-8360 (2008).</li><li>Johnston, H., Boutin, H., Allan, S. M. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/query.fcgi?db=PubMed&cmd=Search&doptcmdl=Citation&defaultField=Title+Word&term=Assessing+the+contribution+of+inflammation+in+models+of+Alzheimer's+disease.">Assessing the contribution of inflammation in models of Alzheimer's disease.</a> Biochem Soc Trans. 39 (4), 886-890 (2011).</li><li>Gjoneska, E., et al. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/query.fcgi?db=PubMed&cmd=Search&doptcmdl=Citation&defaultField=Title+Word&term=Conserved+epigenomic+signals+in+mice+and+humans+reveal+immune+basis+of+Alzheimer's+disease.">Conserved epigenomic signals in mice and humans reveal immune basis of Alzheimer's disease.</a> Nature. 518 (7539), 365-369 (2015).</li><li>Reitz, C., Mayeux, R. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/query.fcgi?db=PubMed&cmd=Search&doptcmdl=Citation&defaultField=Title+Word&term=Alzheimer+disease:+epidemiology,+diagnostic+criteria,+risk+factors+and+biomarkers.">Alzheimer disease: epidemiology, diagnostic criteria, risk factors and biomarkers.</a> Biochem Pharmacol. 88 (4), 640-651 (2014).</li><li>Hazrati, L. -. N., et al. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/query.fcgi?db=PubMed&cmd=Search&doptcmdl=Citation&defaultField=Title+Word&term=Genetic+association+of+CR1+with+Alzheimer's+disease:+a+tentative+disease+mechanism.">Genetic association of CR1 with Alzheimer's disease: a tentative disease mechanism.</a> Neurobiol Aging. 33 (12), 2949 (2012).</li><li>Griciuc, A., et al. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/query.fcgi?db=PubMed&cmd=Search&doptcmdl=Citation&defaultField=Title+Word&term=Alzheimer's+Disease+Risk+Gene+CD33+Inhibits+Microglial+Uptake+of+Amyloid+Beta.">Alzheimer's Disease Risk Gene CD33 Inhibits Microglial Uptake of Amyloid Beta.</a> Neuron. , 1-13 (2013).</li><li>Li, X., Long, J., He, T., Belshaw, R., Scott, J. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/query.fcgi?db=PubMed&cmd=Search&doptcmdl=Citation&defaultField=Title+Word&term=Integrated+genomic+approaches+identify+major+pathways+and+upstream+regulators+in+late+onset+Alzheimer's+disease.">Integrated genomic approaches identify major pathways and upstream regulators in late onset Alzheimer's disease.</a> Scientific reports. 5, 12393 (2015).</li><li>Weitz, T. M., Town, T. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/query.fcgi?db=PubMed&cmd=Search&doptcmdl=Citation&defaultField=Title+Word&term=Microglia+in+Alzheimers+Disease:+"Its+All+About+Context".">Microglia in Alzheimers Disease: "Its All About Context".</a> Int J Alzheimers Dis. , 314185 (2012).</li><li>Guillot-Sestier, M. -. V., Doty, K. R., Town, T. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/query.fcgi?db=PubMed&cmd=Search&doptcmdl=Citation&defaultField=Title+Word&term=Innate+Immunity+Fights+Alzheimer's+Disease.">Innate Immunity Fights Alzheimer's Disease.</a> Trends Neurosci. 38 (11), 674-681 (2015).</li><li>Guillot-Sestier, M. -. V., Town, T. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/query.fcgi?db=PubMed&cmd=Search&doptcmdl=Citation&defaultField=Title+Word&term=Innate+immunity+in+Alzheimer's+disease:+a+complex+affair.">Innate immunity in Alzheimer's disease: a complex affair.</a> CNS Neurol Disord Drug Targets. 12 (5), 593-607 (2013).</li><li>Jankowsky, J. L., Slunt, H. H., Ratovitski, T., Jenkins, N. A., Copeland, N. G., Borchelt, D. R. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/query.fcgi?db=PubMed&cmd=Search&doptcmdl=Citation&defaultField=Title+Word&term=Co-expression+of+multiple+transgenes+in+mouse+CNS:+a+comparison+of+strategies.">Co-expression of multiple transgenes in mouse CNS: a comparison of strategies.</a> Biomol Eng. 17 (6), 157-165 (2001).</li><li>Guillot-Sestier, M. -. V., et al. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/query.fcgi?db=PubMed&cmd=Search&doptcmdl=Citation&defaultField=Title+Word&term=Il10+deficiency+rebalances+innate+immunity+to+mitigate+Alzheimer-like+pathology.">Il10 deficiency rebalances innate immunity to mitigate Alzheimer-like pathology.</a> Neuron. 85 (3), 534-548 (2015).</li><li>Cohen, R. M., et al. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/query.fcgi?db=PubMed&cmd=Search&doptcmdl=Citation&defaultField=Title+Word&term=A+transgenic+Alzheimer+rat+with+plaques,+tau+pathology,+behavioral+impairment,+oligomeric+a&#946;,+and+frank+neuronal+loss.">A transgenic Alzheimer rat with plaques, tau pathology, behavioral impairment, oligomeric a&#946;, and frank neuronal loss.</a> J Neurosci. 33 (15), 6245-6256 (2013).</li><li>Imai, Y., Ibata, I., Ito, D., Ohsawa, K., Kohsaka, S. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/query.fcgi?db=PubMed&cmd=Search&doptcmdl=Citation&defaultField=Title+Word&term=A+novel+gene+iba1+in+the+major+histocompatibility+complex+class+III+region+encoding+an+EF+hand+protein+expressed+in+a+monocytic+lineage.">A novel gene iba1 in the major histocompatibility complex class III region encoding an EF hand protein expressed in a monocytic lineage.</a> Biochem. Biophys. Res. Commun. 224 (3), 855-862 (1996).</li><li>Ohsawa, K., Imai, Y., Sasaki, Y., Kohsaka, S. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/query.fcgi?db=PubMed&cmd=Search&doptcmdl=Citation&defaultField=Title+Word&term=Microglia/macrophage-specific+protein+Iba1+binds+to+fimbrin+and+enhances+its+actin-bundling+activity.">Microglia/macrophage-specific protein Iba1 binds to fimbrin and enhances its actin-bundling activity.</a> J Neurochem. 88 (4), 844-856 (2004).</li><li>Bandyopadhyay, U., Nagy, M., Fenton, W. A., Horwich, A. L. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/query.fcgi?db=PubMed&cmd=Search&doptcmdl=Citation&defaultField=Title+Word&term=Absence+of+lipofuscin+in+motor+neurons+of+SOD1-linked+ALS+mice.">Absence of lipofuscin in motor neurons of SOD1-linked ALS mice.</a> Proc Natl Acad Sci U S A. 111 (30), 11055-11060 (2014).</li><li>Holness, C. L., Simmons, D. L. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/query.fcgi?db=PubMed&cmd=Search&doptcmdl=Citation&defaultField=Title+Word&term=Molecular+cloning+of+CD68,+a+human+macrophage+marker+related+to+lysosomal+glycoproteins.">Molecular cloning of CD68, a human macrophage marker related to lysosomal glycoproteins.</a> Blood. 81 (6), 1607-1613 (1993).</li><li>Connor, T., et al. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/query.fcgi?db=PubMed&cmd=Search&doptcmdl=Citation&defaultField=Title+Word&term=Phosphorylation+of+the+translation+initiation+factor+eIF2alpha+increases+BACE1+levels+and+promotes+amyloidogenesis.">Phosphorylation of the translation initiation factor eIF2alpha increases BACE1 levels and promotes amyloidogenesis.</a> Neuron. 60 (6), 988-1009 (2008).</li><li>Cai, D., et al. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/query.fcgi?db=PubMed&cmd=Search&doptcmdl=Citation&defaultField=Title+Word&term=Phospholipase+D1+corrects+impaired+betaAPP+trafficking+and+neurite+outgrowth+in+familial+Alzheimer's+disease-linked+presenilin-1+mutant+neurons.">Phospholipase D1 corrects impaired betaAPP trafficking and neurite outgrowth in familial Alzheimer's disease-linked presenilin-1 mutant neurons.</a> Proc Natl Acad Sci U S A. 103 (6), 1936-1940 (2006).</li><li>Marsh, S. E., et al. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/query.fcgi?db=PubMed&cmd=Search&doptcmdl=Citation&defaultField=Title+Word&term=The+adaptive+immune+system+restrains+Alzheimer's+disease+pathogenesis+by+modulating+microglial+function.">The adaptive immune system restrains Alzheimer's disease pathogenesis by modulating microglial function.</a> Proc Natl Acad Sci U S A. 113 (9), 1316-1325 (2016).</li><li>Lefterov, I., et al. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/query.fcgi?db=PubMed&cmd=Search&doptcmdl=Citation&defaultField=Title+Word&term=Apolipoprotein+A-I+deficiency+increases+cerebral+amyloid+angiopathy+and+cognitive+deficits+in+APP/PS1DeltaE9+mice.">Apolipoprotein A-I deficiency increases cerebral amyloid angiopathy and cognitive deficits in APP/PS1DeltaE9 mice.</a> J Biol. Chem. 285 (47), 36945-36957 (2010).</li><li>Blurton-Jones, M., et al. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/query.fcgi?db=PubMed&cmd=Search&doptcmdl=Citation&defaultField=Title+Word&term=Neural+stem+cells+improve+cognition+via+BDNF+in+a+transgenic+model+of+Alzheimer+disease.">Neural stem cells improve cognition via BDNF in a transgenic model of Alzheimer disease.</a> Proc Natl Acad Sci U S A. 106 (32), 13594-13599 (2009).</li><li>Stalder, M., Deller, T., Staufenbiel, M., Jucker, M. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/query.fcgi?db=PubMed&cmd=Search&doptcmdl=Citation&defaultField=Title+Word&term=3D-Reconstruction+of+microglia+and+amyloid+in+APP23+transgenic+mice:+no+evidence+of+intracellular+amyloid.">3D-Reconstruction of microglia and amyloid in APP23 transgenic mice: no evidence of intracellular amyloid.</a> Neurobiol Aging. 22 (3), 427-434 (2001).</li><li>Leinenga, G., G&#246;tz, J. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/query.fcgi?db=PubMed&cmd=Search&doptcmdl=Citation&defaultField=Title+Word&term=Scanning+ultrasound+removes+amyloid-&#946;+and+restores+memory+in+an+Alzheimer's+disease+mouse+model.">Scanning ultrasound removes amyloid-&#946; and restores memory in an Alzheimer's disease mouse model.</a> Sci Transl Med. 7 (278), 33 (2015).</li><li>Liarski, V. M., et al. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/query.fcgi?db=PubMed&cmd=Search&doptcmdl=Citation&defaultField=Title+Word&term=Cell+distance+mapping+identifies+functional+T+follicular+helper+cells+in+inflamed+human+renal+tissue.">Cell distance mapping identifies functional T follicular helper cells in inflamed human renal tissue.</a> Sci Transl Med. 6 (230), 46 (2014).</li><li>Nichols, L., Pike, V. W., Cai, L., Innis, R. B. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/query.fcgi?db=PubMed&cmd=Search&doptcmdl=Citation&defaultField=Title+Word&term=Imaging+and+in+vivo+quantitation+of+beta-amyloid:+an+exemplary+biomarker+for+Alzheimer's+disease.">Imaging and in vivo quantitation of beta-amyloid: an exemplary biomarker for Alzheimer's disease.</a> Biol Psychiatry. 59 (10), 940-947 (2006).</li><li>Skovronsky, D. M., Zhang, B., Kung, M. P., Kung, H. F., Trojanowski, J. Q., Lee, V. M. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/query.fcgi?db=PubMed&cmd=Search&doptcmdl=Citation&defaultField=Title+Word&term=In+vivo+detection+of+amyloid+plaques+in+a+mouse+model+of+Alzheimer's+disease.">In vivo detection of amyloid plaques in a mouse model of Alzheimer's disease.</a> Proc Natl Acad Sci U S A. 97 (13), 7609-7614 (2000).</li><li>Lian, H., Litvinchuk, A., Chiang, A. C. -. A., Aithmitti, N., Jankowsky, J. L., Zheng, H. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/query.fcgi?db=PubMed&cmd=Search&doptcmdl=Citation&defaultField=Title+Word&term=Astrocyte-Microglia+Cross+Talk+through+Complement+Activation+Modulates+Amyloid+Pathology+in+Mouse+Models+of+Alzheimer's+Disease.">Astrocyte-Microglia Cross Talk through Complement Activation Modulates Amyloid Pathology in Mouse Models of Alzheimer's Disease.</a> J Neurosci. 36 (2), 577-589 (2016).</li><li>Novotny, R., et al. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/query.fcgi?db=PubMed&cmd=Search&doptcmdl=Citation&defaultField=Title+Word&term=Conversion+of+Synthetic+A&#946;+to+In+Vivo+Active+Seeds+and+Amyloid+Plaque+Formation+in+a+Hippocampal+Slice+Culture+Model.">Conversion of Synthetic A&#946; to In Vivo Active Seeds and Amyloid Plaque Formation in a Hippocampal Slice Culture Model.</a> J Neurosci. 36 (18), 5084-5093 (2016).</li><li>Tartaro, K., et al. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/query.fcgi?db=PubMed&cmd=Search&doptcmdl=Citation&defaultField=Title+Word&term=Development+of+a+fluorescence-based+in+vivo+phagocytosis+assay+to+measure+mononuclear+phagocyte+system+function+in+the+rat.">Development of a fluorescence-based in vivo phagocytosis assay to measure mononuclear phagocyte system function in the rat.</a> J Immunotoxicol. 12 (3), 239-246 (2015).</li></ol>

הפרוטוקול זה אנו מתארים בדוח זה כדי לכמת 3D אמיתי של phagocytosis Aβ in vivo על ידי פגוציטים mononuclear מסתמך על תיוג ספציפי של תאים סלולריים ו subcellular וכן פיקדונות Aβ. באופן ספציפי, אנו משתמשים Iba1 (מיונן בסידן כריכה מתאם המולקולה 1), חלבון כי הוא מעורב עלעול קרום phagocytosis על תא הפעלה ...

מחלת אלצהיימר (AD), דמנציה 1 הקשורה הגיל הנפוץ ביותר, מאופיין עמילואיד-β מוחין (Aβ) הצטברות כמו &quot;סנילי&quot; הפלאק β עמילואיד, neuroinflammation ברמה נמוכה כרונית, tauopathy, איבוד עצבי, והפרעה קוגניטיבית 2 . במוחות המטופל לספירה, neuroinflammation מיועד ידי תגובתי אסטרוציטים פגוציטים mononuclear (המכונה microglia, למרות המרכזי שלהם לעומת ממוצא הפריפריה עדיין לא ברור) שמסביב Aβ פיקדונות 3. כמו זקיפים החיסון המולדת של מערכת העצבים המרכזית, microglia ממוקמים מרכזי להצליל Aβ. עם זאת, גיוס microglial הפלאק Aβ מלווה מעט מאוד, אם בכלל, Aβ phagocytosis 4,5. אחת ההשערות היא כי microglia הם בתחילה נוירו ידי phagocytozing מכלולים קטנים של Aβ. עם זאת, בסופו של דבר תאים אלה הופכים הנוירו כמו נטל Aβ המכריע ו / או ד תפקודית כתוצאה מהזדקנותecline, מעורר microglia לתוך פנוטיפ מעודד דלקת מתפקדת, תורם לירידה ברעילות וקוגניטיביות 6. הגנום כולו אחרונים מחקרים אגודים (GWAS) זיהו מקבץ של אללים לסיכון לחלות באלצהיימר השייכים מסלולי חיסון מולדים ליבת 7 לווסת phagocytosis 8-11. כתוצאה מכך, התגובה החיסונית בתצהיר עמילואיד מוחין הפך אזור מרכזי של עניין, הן מבחינת הבנת האטיולוגיה לספירה לפיתוח גישות טיפוליות חדשות 12-14. עם זאת, יש צורך חיוני מתודולוגיה להערכת phagocytosis Aβ in vivo. כדי לתת מענה לצורך מסופקים זה, פיתחנו 3D כמותית בדוגמנות סיליקון (q3DISM) כדי לאפשר quantitation 3D אמיתי של phagocytosis Aβ מוחין ידי פגוציטים mononuclear במודלים של מכרסמים של מחלת אלצהיימר דמוי. מוגבל רק על ידי המידה שבה הם לשחזר מחלה, במודלים של בעלי החיים ישהוכח שלא יסולא בפז להבנה לספירה pathoetiology ולהערכה רפוי ניסיון. בשל העובדה כי מוטציות בגנים presenilin (PS) ו חלבון מקדים עמילואיד (APP) עצמאי לגרום לספירה אוטוזומלית דומיננטית, transgenes מוטציה אלה נעשה שימוש נרחב כדי ליצור מודלים מכרסם מהונדס. מהונדס APP / PS1 עכברים coexpressing זמנית &quot;שוודית&quot; APP האנושי מוטציה (swe APP) ו Δ אקסון 9 presenilin 1 אדם מוטציה (PS1ΔE9) הנוכחי עם עמילואידוזיס מוחין מואץ neuroinflammation 15,16. יתר על כן, יצרנו חולדות דו-מהונדס coinjected עם APP swe ובונה PS1ΔE9 (קו TgF344-AD, על רקע פישר 344). בניגוד למודלים עכבר מהונדס של עמילואידוזיס מוחין, חולדות TgF344-AD לפתח עמילואיד מוחין שמקדים tauopathy, אובדן אפופטוטיים של נוירונים, ו ליקוי התנהגותי 17. בדו&quot;ח זה, אנו מתארים פרוטוקול עבור IMMunostaining microglia, phagolysosomes ופיקדונות Aβ בסעיפי מוח מעכברי APP / PS1 וחולדות TgF344-AD, ורכישת תמונות confocal z-ממדי גדולות. נפרטנו בדור סיליקון וניתוח של שחזורי 3D אמיתיים ממערכות נתוני confocal המאפשרים לכמת ספיגת Aβ לתוך phagolysosomes microglial. באופן כללי יותר, מתודולוגיה נפרט כאן ניתן להשתמש כדי לכמת כמעט כל צורה של phagocytosis in vivo.

<table border="0" cellpadding="0" cellspacing="0" width="912">
	<colgroup>
		<col />
		<col />
		<col />
		<col />
	</colgroup>
	<tbody>
		<tr height="40">
			<td height="40" style="height:40px;width:384px;">Isoflurane</td>
			<td style="width:152px;">Abbott</td>
			<td style="width:127px;">NDC 0044-5260-05</td>
			<td style="width:249px;"></td>
		</tr>
		<tr height="20">
			<td height="20" style="height:20px;width:384px;">Dissecting scissors</td>
			<td style="width:152px;">VWR</td>
			<td style="width:127px;">82027-582</td>
			<td></td>
		</tr>
		<tr height="20">
			<td height="20" style="height:20px;width:384px;">Dissecting scissors Blunt tip</td>
			<td style="width:152px;">VWR</td>
			<td style="width:127px;">82027-588</td>
			<td></td>
		</tr>
		<tr height="20">
			<td height="20" style="height:20px;width:384px;">Tweezers</td>
			<td style="width:152px;">VWR</td>
			<td>94024-408</td>
			<td></td>
		</tr>
		<tr height="20">
			<td height="20" style="height:20px;width:384px;">23G needle</td>
			<td style="width:152px;">VWR</td>
			<td>BD305145</td>
			<td></td>
		</tr>
		<tr height="20">
			<td height="20" style="height:20px;width:384px;">peristaltic pump FH10</td>
			<td style="width:152px;">Thermo Scientific</td>
			<td>72-310-010</td>
			<td></td>
		</tr>
		<tr height="20">
			<td height="20" style="height:20px;width:384px;">PBS 10X</td>
			<td style="width:152px;">Bioland Scientific</td>
			<td style="width:127px;">PBS01-02</td>
			<td>Working concentration 1X</td>
		</tr>
		<tr height="20">
			<td height="20" style="height:20px;width:384px;">Adult Mouse Brain Matrix, Coronal slices, Stainless Steel 1mm&#160;</td>
			<td style="width:152px;">Kent Scientific</td>
			<td>RBMS-200C</td>
			<td></td>
		</tr>
		<tr height="20">
			<td height="20" style="height:20px;width:384px;">Adult Rat Brain Matrix, Coronal slices, Stainless Steel 1mm&#160;</td>
			<td style="width:152px;">Kent Scientific</td>
			<td>RBMS-305C&#160;</td>
			<td></td>
		</tr>
		<tr height="20">
			<td height="20" style="height:20px;width:384px;">32% Paraformaldehyde aqueous solution</td>
			<td style="width:152px;">EMS</td>
			<td style="width:127px;">15714-S</td>
			<td>Caution: Toxic. Working concentration 4% in PBS</td>
		</tr>
		<tr height="20">
			<td height="20" style="height:20px;width:384px;">Ethanol</td>
			<td style="width:152px;">VWR</td>
			<td>89125-188</td>
			<td>Various concentrations, see protocol</td>
		</tr>
		<tr height="20">
			<td height="20" style="height:20px;width:384px;">Tissue-Tek Uni-cassettes Sakura</td>
			<td style="width:152px;">VWR</td>
			<td>25608-774</td>
			<td></td>
		</tr>
		<tr height="20">
			<td height="20" style="height:20px;width:384px;">Embedding and Infiltration Paraffin</td>
			<td style="width:152px;">VWR</td>
			<td>15147-839</td>
			<td></td>
		</tr>
		<tr height="20">
			<td height="20" style="height:20px;width:384px;">Microtome Leica RM2125</td>
			<td style="width:152px;">Leica Biosystems</td>
			<td style="width:127px;"></td>
			<td></td>
		</tr>
		<tr height="20">
			<td height="20" style="height:20px;width:384px;">Disposable Microtome Blades&#160;</td>
			<td style="width:152px;">VWR</td>
			<td style="width:127px;">25608-964</td>
			<td></td>
		</tr>
		<tr height="20">
			<td height="20" style="height:20px;width:384px;">Water bath Leica HI 1210</td>
			<td style="width:152px;">Leica Biosystems</td>
			<td style="width:127px;"></td>
			<td></td>
		</tr>
		<tr height="20">
			<td height="20" style="height:20px;width:384px;">Micro slide Superfrost plus</td>
			<td style="width:152px;">VWR</td>
			<td style="width:127px;">48311-703</td>
			<td></td>
		</tr>
		<tr height="20">
			<td height="20" style="height:20px;width:384px;">Xylene</td>
			<td style="width:152px;">Sigma-Aldrich</td>
			<td style="width:127px;">534056-4X4L</td>
			<td style="width:249px;">Caution: Toxic&#160;</td>
		</tr>
		<tr height="20">
			<td height="20" style="height:20px;width:384px;">Target Retrieval Solution 10X</td>
			<td style="width:152px;">DAKO</td>
			<td style="width:127px;">S1699</td>
			<td>Working concentration 1X</td>
		</tr>
		<tr height="21">
			<td height="21" style="height:21px;">KimWipes</td>
			<td style="width:152px;">VWR</td>
			<td>21905-026</td>
			<td></td>
		</tr>
		<tr height="20">
			<td height="20" style="height:20px;width:384px;">Hydrophobic PAP pen</td>
			<td style="width:152px;">VWR</td>
			<td style="width:127px;">95025-252</td>
			<td></td>
		</tr>
		<tr height="20">
			<td height="20" style="height:20px;width:384px;">Triton X-100</td>
			<td style="width:152px;">VWR</td>
			<td style="width:127px;">97062-208</td>
			<td></td>
		</tr>
		<tr height="20">
			<td height="20" style="height:20px;width:384px;">Normal Donkey Serum</td>
			<td style="width:152px;">Jackson Immuno</td>
			<td style="width:127px;">017-000-121</td>
			<td></td>
		</tr>
		<tr height="20">
			<td height="20" style="height:20px;width:384px;">Coverslips</td>
			<td style="width:152px;">VWR</td>
			<td style="width:127px;">48393081</td>
			<td></td>
		</tr>
		<tr height="20">
			<td height="20" style="height:20px;width:384px;">Prolong Gold antifade reagent with DAPI</td>
			<td style="width:152px;">Life Technologies</td>
			<td style="width:127px;">P36935</td>
			<td></td>
		</tr>
		<tr height="20">
			<td height="20" style="height:20px;width:384px;">Glass Slide Rack</td>
			<td style="width:152px;">VWR</td>
			<td style="width:127px;">100492-942</td>
			<td></td>
		</tr>
		<tr height="20">
			<td height="20" style="height:20px;width:384px;">Iba1 antibody (polyclonal, rabbit)</td>
			<td style="width:152px;">Wako</td>
			<td style="width:127px;">019-19741&#160;</td>
			<td>Working concentration 1:200</td>
		</tr>
		<tr height="20">
			<td height="20" style="height:20px;width:384px;">Iba1 antibody (polyclonal, goat)</td>
			<td style="width:152px;">LifeSpan Bioscience</td>
			<td style="width:127px;">LS-B2645</td>
			<td>Working concentration 1:200</td>
		</tr>
		<tr height="20">
			<td height="20" style="height:20px;width:384px;">rat CD68 [KP1] antibody (monoclonal, mouse)</td>
			<td style="width:152px;">Abcam</td>
			<td style="width:127px;">ab955</td>
			<td>Working concentration 1:200</td>
		</tr>
		<tr height="20">
			<td height="20" style="height:20px;width:384px;">mouse CD68 [FA-11] antibody (monoclonal, rat)</td>
			<td style="width:152px;">Abcam</td>
			<td style="width:127px;">ab53444</td>
			<td>Working concentration 1:200</td>
		</tr>
		<tr height="20">
			<td height="20" style="height:20px;width:384px;">mouse CD107a (LAMP1) antibody (monoclonal, rat)</td>
			<td style="width:152px;">Affymetrix</td>
			<td style="width:127px;">14-1071</td>
			<td>Working concentration 1:100</td>
		</tr>
		<tr height="20">
			<td height="20" style="height:20px;width:384px;">Beta-Amyloid, 17-24 (4G8) antibody (monoclonal, mouse)</td>
			<td style="width:152px;">Covance</td>
			<td style="width:127px;">SIG-39220</td>
			<td>Working concentration 1:200</td>
		</tr>
		<tr height="20">
			<td height="20" style="height:20px;width:384px;">Beta-Amyloid, 1-16 (6E10) antibody (monoclonal, mouse)</td>
			<td style="width:152px;">Covance</td>
			<td style="width:127px;">SIG-39320</td>
			<td>Working concentration 1:200</td>
		</tr>
		<tr height="20">
			<td height="20" style="height:20px;width:384px;">OC antibody (polyclonal, rabbit)</td>
			<td colspan="2">Gifted by D. H. Cribbs and C. G. Glabe (UC Irvine)</td>
			<td>Working concentration 1:200</td>
		</tr>
		<tr height="20">
			<td height="20" style="height:20px;width:384px;">Alexa Fluor 488&#160; mouse secondary antibody</td>
			<td style="width:152px;">Invitrogen</td>
			<td style="width:127px;">A-11001</td>
			<td>Working concentration 1:1000</td>
		</tr>
		<tr height="20">
			<td height="20" style="height:20px;width:384px;">Alexa Fluor 488&#160; rat secondary antibody</td>
			<td style="width:152px;">Invitrogen</td>
			<td>A-11006</td>
			<td>Working concentration 1:1000</td>
		</tr>
		<tr height="20">
			<td height="20" style="height:20px;width:384px;">Alexa Fluor 594 rabbit secondary antibody</td>
			<td style="width:152px;">Invitrogen</td>
			<td>A-11037</td>
			<td>Working concentration 1:1000</td>
		</tr>
		<tr height="20">
			<td height="20" style="height:20px;width:384px;">Alexa Fluor 594 goat secondary antibody</td>
			<td style="width:152px;">Invitrogen</td>
			<td>A-11080</td>
			<td>Working concentration 1:1000</td>
		</tr>
		<tr height="20">
			<td height="20" style="height:20px;width:384px;">Alexa Fluor 647 mouse secondary antibody</td>
			<td style="width:152px;">Invitrogen</td>
			<td>A-21235</td>
			<td>Working concentration 1:1000</td>
		</tr>
		<tr height="20">
			<td height="20" style="height:20px;width:384px;">Alexa Fluor 647 rabbit secondary antibody</td>
			<td style="width:152px;">Invitrogen</td>
			<td>A-21443</td>
			<td>Working concentration 1:1000</td>
		</tr>
		<tr height="20">
			<td height="20" style="height:20px;width:384px;">Immersion oil</td>
			<td style="width:152px;">Nikon&#160;</td>
			<td style="width:127px;"></td>
			<td></td>
		</tr>
		<tr height="20">
			<td height="20" style="height:20px;width:384px;">A1 Confocal microscope</td>
			<td style="width:152px;">Nikon&#160;</td>
			<td style="width:127px;"></td>
			<td></td>
		</tr>
		<tr height="20">
			<td height="20" style="height:20px;width:384px;">NIS Elements Advanced Research software</td>
			<td style="width:152px;">Nikon&#160;</td>
			<td style="width:127px;"></td>
			<td></td>
		</tr>
		<tr height="20">
			<td height="20" style="height:20px;width:384px;">Imaris:Bitplane software version 7.6</td>
			<td style="width:152px;">Bitplane</td>
			<td style="width:127px;"></td>
			<td>&#34;coloc&#34; and &#34;supass&#34; modules are used.&#160;Alternatively, the open-source freeware&#160;ImageJ can be used for colocalization&#160;analysis of confocal z-stacks datasets.</td>
		</tr>
		<tr height="20">
			<td height="20" style="height:20px;"></td>
			<td style="width:152px;"></td>
			<td style="width:127px;"></td>
			<td></td>
		</tr>
		<tr height="20">
			<td height="20" style="height:20px;width:384px;"></td>
			<td style="width:152px;"></td>
			<td style="width:127px;"></td>
			<td></td>
		</tr>
		<tr height="20">
			<td height="20" style="height:20px;width:384px;"></td>
			<td style="width:152px;"></td>
			<td style="width:127px;"></td>
			<td></td>
		</tr>
	</tbody>
</table>

quantitative 3d in silico modeling (q3dism) of cerebral amyloid-beta phagocytosis in rodent models of alzheimer's disease

Neuroinflammation מוכרת כיום כגורם אטיולוגי מרכזי למחלות ניווניות. פגוציטים mononuclear הם תאי מולד חיסוניים אחראים phagocytosis ופינוי פסול שאריות. תאים אלה כוללים מקרופאגים CNS-תושב המכונה microglia, ואת phagocytes mononuclear שחדר מהפריפריה. במיקרוסקופ אור כבר משמש בדרך כלל כדי לחזות phagocytosis ב מכרסמים או דגימות מוח אנושי. עם זאת, שיטות איכותיות לא ספקו ראיות מוחלטות של in vivo phagocytosis. כאן אנו מתארים 3D כמותית בדוגמנות סיליקון (q3DISM), שיטה חזקה המאפשרת לכמת 3D אמיתי של עמילואיד-β (Aβ) phagocytosis ידי פגוציטים mononuclear במחלת מכרסם אלצהיימר (AD) מודלים. השיטה כרוכה fluorescently חזותי Aβ כמוסה בתוך phagolysosomes בסעיפי מוח מכרסם. מערכי נתונים confocal z-ממדי גדולים אז 3D המשוחזר כדי לכמת את A &amp;# 946; מרחבית colocalized בתוך phagolysosome. אנו מדגימים את היישום המוצלח של q3DISM כדי מוח עכבר וחולדה, אבל מתודולוגיה זו ניתן להרחיב כמעט כל אירוע phagocytic בכל רקמה.

באמצעות מתודולוגיה רב שלבית עבור q3DISM שפורטו לעיל, אנו מסוגלים לכמת ספיגת Aβ לתוך phagolysosomes מונוציטים במוחם של עכברים APP / PS1 (איור 1) וחולדות TgF344-AD (איור 2). לכן, המתודולוגיה q3DISM אפשרה ניתוח פגוציטים mononuclear במודלים של עכברים וחולדה של AD. מ?...

Watch this Scientific Journal Video about Quantitative 3D In Silico Modeling q3DISM of Cerebral Amyloid-beta Phagocytosis in Rodent Models of Alzheimer's Disease at JoVE.com

Quantitative 3D In Silico Modeling q3DISM of Cerebral Amyloid-beta Phagocytosis in Rodent Models of Alzheimer's Disease

פיתחנו מתודולוגיה 3D כמותית בדוגמנות סיליקון (q3DISM) של-β עמילואיד מוחין (Aβ) phagocytosis ידי פגוציטים mononuclear במודלים של מכרסמים של מחלת אלצהיימר. שיטה זו ניתן להכליל עבור quantitation של כמעט כל אירוע phagocytic in vivo.

3D כמוני<em&gt; סיליקו</em&gt; דוגמנות (q3DISM) של Phagocytosis עמילואיד-ביתא מוחין במודלים של מכרסמים של מחלת אלצהיימר

Neuroinflammation is now recognized as a major etiological factor in neurodegenerative disease. Mononuclear phagocytes are innate immune cells responsible ...

Research

JoVE Journal

Medicine

Quantitative 3D In Silico Modeling (q3DISM) of Cerebral Amyloid-beta Phagocytosis in Rodent Models of Alzheimer's Disease

Examining the Characteristics of Episodic Memory using Event-related Potentials in Patients with Alzheimer's Disease

בחינת מאפייני זיכרון אפיזודי באמצעות פוטנציאל הקשור לאירוע &#39;בחולים עם מחלת אלצהיימר

Our laboratory uses event-related EEG potentials (ERPs) to understand and support behavioral investigations of episodic memory in patients with amnestic ...

Quantitative Analysis of Chromatin Proteomes in Disease

ניתוח הכמות של Proteomes הכרומטין במחלות

In the nucleus reside the proteomes whose functions are most intimately linked with gene regulation. Adult mammalian cardiomyocyte nuclei are unique due ...

Gene-environment Interaction Models to Unmask Susceptibility Mechanisms in Parkinson's Disease

מודלים לאינטראקציה בין סביבת גנים כדי לחשוף מנגנוני רגישות במחלת פרקינסון

Lipoxygenase (LOX) activity has been implicated in neurodegenerative disorders such as Alzheimer&#39;s disease, but its effects in Parkinson&#39;s disease ...

Modeling Stroke in Mice: Permanent Coagulation of the Distal Middle Cerebral Artery

דוגמנות שבץ בעכברים: קרישה קבועה של עורקי דיסטלי התיכון מוחין

Stroke is the third most common cause of death and a main cause of acquired adult disability in developed countries. Only very limited therapeutical ...

Multi-electrode Array Recordings of Human Epileptic Postoperative Cortical Tissue

הקלטות מערך רב-אלקטרודה של רקמה האנושית אפילפטיים לאחר הניתוח בקליפת המוח

Epilepsy, affecting about 1% of the population, comprises a group of neurological disorders characterized by the periodic occurrence of seizures, which ...

Use of Ultra-high Field MRI in Small Rodent Models of Polycystic Kidney Disease for In Vivo Phenotyping and Drug Monitoring

Use of Ultra-high Field MRI in Small Rodent Models of Polycystic Kidney Disease for In Vivo Phenotyping and Drug Monitoring

שימוש ב- MRI שדה Ultra-גבוה במודלים של מכרסמים קטנים של מחלת כליות פוליציסטיות ל<em&gt; In vivo</em&gt; ניטור phenotyping ותרופות

Several in vivo pre-clinical studies in Polycystic Kidney Disease (PKD) utilize orthologous rodent models to identify and study the genetic and molecular ...

Ex Vivo Intestinal Sacs to Assess Mucosal Permeability in Models of Gastrointestinal Disease

Ex Vivo Intestinal Sacs to Assess Mucosal Permeability in Models of Gastrointestinal Disease

Sacs Ex Vivo המעיים להעריך חדירות ריריות מודלים של מחלות במערכת העיכול

The epithelial barrier is the first innate defense of the gastrointestinal tract and selectively regulates transport from the lumen to the underlying ...

Hemodynamic Characterization of Rodent Models of Pulmonary Arterial Hypertension

אפיון המודינמי של מודלים מכרסמים של יתר לחץ דם ריאתי עורקי

Pulmonary arterial hypertension (PAH) is a rare disease of the pulmonary vasculature characterized by endothelial cell apoptosis, smooth muscle ...

Neurodegeneration in an Animal Model of Chronic Amyloid-beta Oligomer Infusion Is Counteracted by Antibody Treatment Infused with Osmotic Pumps

מוחיים במודל חיה של עמילואיד-ביתא כרונית oligomer העירוי נוטרלה על ידי נוגדן טיפול חדורי משאבות אוסמוטי

Decline in hippocampal-dependent explicit memory (memory for facts and events) is one of the earliest clinical symptom of Alzheimer&#39;s disease (AD). It ...

Application of Granger Causality Analysis of the Directed Functional Connection in Alzheimer's Disease and Mild Cognitive Impairment

היישום של גריינג'ר ניתוח סיבתיות של חיבור פונקציונלי מכוונת מחלת אלצהיימר, ליקוי קוגנטיבי מתון

Impaired functional connectivity in the Default Mode Network (DMN) may be involved in the progression of Alzheimer&#39;s Disease (AD). The Posterior ...