Name: act-presto: biological tissue clearing and immunolabeling methods for volume imaging
Uploaded: 2016-12-31T14:00:00
Duration: 7 min 46 s
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This research was supported by the Brain Research Program through the National Research Foundation (NRF) funded by the Korean Ministry of Science, ICT, and Future Planning (NRF-2015M3C7A1028790).

Gli esperimenti sugli animali devono essere conformi a tutte le normative governative e istituzionali competenti. 1. Preparazione dei reagenti <ol><li> Per la soluzione di idrogel monomero (A4P0): Aggiungere 20 g di acrilamide per 450 ml di 0.1x PBS (PBS) e regolare il volume a 500 ml con 0.1x PBS. ATTENZIONE: monomeri Acrylamide sono tossici. Eseguire tutte le procedure in una cappa aspirante con dispositivi di protezione individuale, tra cui una visiera, un camice da laboratorio, guanti e scarpe chiuse. <ol><li> Immediatamente prima dell&#39;uso, aggiungere 100 mg di 2,2&#39;-azobis [2- (2-imidazolin-2-il) propano] dicloridrato di 40 mL di soluzione di idrogel monomero (A4P0) in una provetta da 50 ml sotto cappa aspirante . </li></ol></li><li> Per la compensazione tessuto elettroforetica tampone (ETC): Aggiungere 40 g di sodio dodecil solfato (SDS) e 12,37 g di acido borico a 800 mL di H 2 O deionizzata (dH 2 O). Regolare il pH a 8,5 con NaOH e regolare il volume di1 L con l&#39;aggiunta di dH 2 O. ATTENZIONE: SDS è una sostanza chimica nociva; Pertanto, maneggiarlo con cura. </li><li> Per la soluzione CUBIC montaggio: Aggiungere 250 g di saccarosio, 125 g di urea, e 125 g di N, N, N &#39;, N&#39; -tetrakis (2-idrossipropil) etilendiammina a 150 ml di dH 2 O e portare il volume a 500 ml con dH 2 O. </li></ol> 2. Preparazione del campione &amp; Fixation <ol><li> L&#39;eutanasia del mouse. <ol><li> Preparare la alfaxalone (1 mg / kg) e xilazina (0,5 mg / kg) nella stessa siringa. </li><li> Intraperitoneale iniettare la miscela di alfaxalone e xilazina e consentono 3 min per il mouse per perdere conoscenza. </li><li> Attendere fino a quando il mouse anestetizzato non risponde più agli stimoli dolorosi, come un pizzico di coda, prima di procedere. ATTENZIONE: Seguire appropriate linee guida istituzionali per la gestione degli animali. </li></ol></li><li> Transcardially profumato il mouse con 100 ml di NaCl allo 0,9% (pH 7,4-7,5) soluzionecontenente eparina (100 U / ml) per Exsanguinate, seguito da 100 mL di 4% paraformaldeide (PFA) in PBS 1x (pH 7,4) 14. ATTENZIONE: soluzione PFA è tossico. La preparazione della soluzione PFA e tutte le successive manipolazioni deve essere condotta in una cappa aspirante e con dispositivi di protezione individuale. </li><li> Tagliare la testa del mouse, aprire la pelle, e rompere il cranio tra gli occhi con piccole forbici. </li><li> Rimuovere pezzi del cranio con piccoli, pinze curve. </li><li> Estrarre il cervello o organi desiderati. </li><li> Incubare il cervello e gli organi in post-fix 4% soluzione PFA a 4 ° C durante la notte. NOTA: Per regione specifica compensazione dei tessuti, sezionare la regione specifica o tagliare il tessuto dopo la fissazione dei tessuti. ATTENZIONE: soluzione PFA è tossico. La perfusione transcardial e tutte le successive manipolazioni del mouse devono essere condotte in una cappa aspirante e con dispositivi di protezione individuale. </li></ol> 3. Hydrogel monomero infusione e Polymerization <ol><li> Incubare gli organi fissi in soluzione idrogel monomero A4P0 a 4 ° C per 12-24 ore con un leggero scuotimento. </li><li> Idrogel monomero-infuso polimerizzazione dei tessuti. <ol><li> Trasferire il campione in una provetta a fondo rotondo da 10 ml con 5 ml di soluzione di idrogel monomero. Avvolgere la parte superiore del tubo a fondo rotondo con parafilm. </li><li> Rimuovere l&#39;ossigeno dal tubo a fondo rotondo contenente tutta topo campione cervello idrogel infuso facendo gorgogliare azoto attraverso il liquido per 1 min. Rapidamente e chiudere ermeticamente la provetta contenente. </li></ol></li><li> Trasferire la provetta in un bagnomaria (37 ° C) per 2 ore. </li><li> Lavare il campione polimerizzato brevemente con 0.1x PBS per rimuovere l&#39;eccesso idrogel. ATTENZIONE: monomeri idrogel sono tossici. Per evitare il contatto della pelle con idrogel monomero, eseguire tutte le procedure in una cappa aspirante e con dispositivi di protezione individuale, tra cui una visiera, un camice da laboratorio e guanti. NOTA: polimerizzati tessutipossono essere memorizzati in 0.1x PBS contenente sodio azide per più di 2 settimane a 4 ° C. ATTENZIONE: sodio azide è altamente e tossicità acuta. Eseguire tutte le procedure in una cappa aspirante e con dispositivi di protezione individuale, tra cui una visiera, un camice da laboratorio e guanti. </li></ol> 4. elettroforetico tessuto Clearing (ETC) <ol><li> Trasferire il campione polimerizzato ad un contenitore di tessuto e posizionare il contenitore tessuto nella camera ETC. </li><li> Riempire la camera ETC ETC con il tampone usando pompa peristatic. </li><li> Impostare le condizioni di ETC ed eseguire il ETC. Utilizzare le seguenti impostazioni. <ol><li> Per le impostazioni ecc per organi interi, utilizzare le seguenti impostazioni: (1,5 amp), la temperatura (37 ° C), il tempo (6,0 h), la velocità della pompa (30 rpm) in esecuzione. </li><li> Per le impostazioni ecc per 1 a 2 mm di spessore fette di cervello del mouse, utilizzare le seguenti impostazioni: corrente (1,5 amp), la temperatura (37 ° C), il tempo (2,0 h), la velocità della pompa (30 rpm) in esecuzione. </li></ol></li><li> Trasferimento tsi schiarì campione ad un tubo conico da 50 ml con 45 ml di PBS 0.1x. Lavare più volte campione eliminato con 0.1x PBS fino a quando non si vedono bolle quando il tubo viene agitato brevemente (per confermare la rimozione completa del SDS). </li></ol> 5. immunomarcatura di tessuti ACT-lavorati <ol><li> Per topo intero cervello: incubare il campione in un volume di 3 ml di soluzione di anticorpo contenente PBS 1x, 6% di siero albumina bovina (BSA), 0,1% Triton X-100, e sodio azide 0,01% (Diluente anticorpo) con una diluizione fattore di 1/500 per tirosina idrossilasi (TH) anticorpo per 4 giorni a 37 ° C con agitazione delicata. Sostituire la soluzione di anticorpi a fine giornata 2. <ol><li> Lavare il campione in una provetta conica da 50 ml con 45 ml di PBS 0.1x per 3 - 5 h e modificare il buffer ogni ora. </li><li> Incubare il campione in un volume di 3 ml di soluzione di diluizione di anticorpo con un fattore di diluizione di 1/500 di asino anti-coniglio 488 anticorpo secondario per 4 giorni a 37 ° C con agitazione delicata. Replasso le soluzioni di anticorpi diluito su giorno 2. </li></ol></li><li> Per 1 a tessuto cerebrale a fette di spessore 2 mm: incubare il campione durante la notte o per un massimo di 1 giorno in una da 0,5 a 1 ml volume di soluzione di diluizione degli anticorpi con un fattore di diluizione di 1/500 di collagene di tipo IV anticorpo a 37 ° C con agitazione mite. <ol><li> Lavare il campione in una provetta conica da 15 ml con un volume di 12 mL di PBS 0.1x per 1-2 h. Modificare il buffer di ogni ora. </li><li> Incubare il campione in una da 0,5 a 1 mL di una soluzione di diluizione di anticorpo con un fattore di diluizione di 1/500 per Cy3-coniugato anti-coniglio anticorpo secondario durante la notte o fino a 1 giorno a 37 ° C con agitazione delicata. </li></ol></li><li> Lavare il campione in 0.1x PBS per 3-5 ore; modificare il buffer ogni ora. </li><li> Prima di imaging, incubare il campione in una quantità appropriata di soluzione cubi di montaggio per 1 ora a temperatura ambiente agitando delicatamente. Sostituire con soluzione fresca cubi di montaggio e incubare per un ulteriore 1 h. NOTA: </b&gt; 76 tipo di anticorpi ha funzionato bene nel topo tessuto ACT-Processing, tra cui 31 anticorpi monoclonali 14. Pre-marcato tessuto può essere combinato con il immunomarcatura di altri due fluorocromi nel tessuto ACT-trattati. </li></ol> 6. immunomarcatura di Dense tessuti (PRESTO) <ol><li> c-PRESTO NOTA: c-PRESTO è adatto per le piccole dimensioni dei campioni, come ad esempio tutta testicolo, tutto il rene, o piccole sezioni di organi più grandi. <ol><li> Trasferire il campione in una provetta da 1,5 mL, aggiungere 500 ml di soluzione di diluizione di anticorpo con un fattore di diluizione di 1/500 per anticorpi collagene di tipo IV e centrifugare la provetta a 600 g per 2 h. </li><li> Lavare il campione colorato con 0.1x PBS mediante centrifugazione a 600 g per 30 min. </li><li> Aggiungere 500 ml di soluzione di diluizione degli anticorpi con un fattore di diluizione di 1/500 per l&#39;anticorpo secondario anti-coniglio Cy3-coniugato e centrifugare a 600 g per 2 ore. </li><li> Lavare il campione colorato con 0.1x PBS mediante centrifugazione a 600 g per 30 min. </li></ol></li><li> s-PRESTO NOTA: s-PRESTO è adatto per i tessuti più grandi. <ol><li> Preparare una siringa (volume 30 ml) e collegarlo ad una valvola a 3 vie (Figura 1A). Colla la valvola con una pistola per colla per le condizioni di alta pressione (Figura 1B). </li><li> Trasferire il campione nella siringa a 3 vie valvola collegata in posizione di chiusura della valvola. </li><li> Aggiungere 5 - 7 mL di soluzione di diluizione anticorpo con un fattore di diluizione di 1/500 di collagene di tipo IV anticorpi. Rilasciare la soluzione di anticorpi nel campione aprendo la valvola. </li><li> Impostare il pistone della siringa alla posizione 17 mL per fornire spazio sufficiente per il movimento di infusione / ritiro. Questo può essere fatto in posizione di apertura della valvola. Chiudere la valvola a 3 vie dopo l&#39;impostazione della siringa è terminata. </li><li> Mettere la siringa contenente il campione in una pompa a siringa. Impostare le condizioni pompa siringa per un volume di soluzione / ritiro di 10 ml / min e un 4-min tempo di pausa in modalità ciclo continuo (Figura 1C). NOTA: La pompa infonde fino a raggiungere il volume bersaglio (10 mL), e quindi la direzione di flusso cambia dopo una breve pausa (4 min). </li><li> Far funzionare la pompa a siringa per 3 - 24 ore a temperatura ambiente (Figura 1F). </li><li> Aprire la valvola a 3 vie e sostituire la soluzione con 0.1x PBS. </li><li> Lavare il campione macchiato due volte con 0.1x PBS per 1 ora ogni volta usando la pompa a siringa. </li><li> Cambiare con la soluzione di diluizione di anticorpi contenente Cy3-coniugato anti-coniglio anticorpo secondario (fattore di diluizione di 1/500) e far funzionare la pompa a siringa per 3-24 ore. </li><li> Aprire la valvola a 3 vie e sostituire la soluzione con 0.1x PBS. </li></ol></li><li> Prima di imaging, incubare il campione macchiato in una quantità appropriata di soluzione cubi di montaggio per 1 ora a temperatura ambiente agitando delicatamente. Sostituire con soluzione fresca cubi di montaggio e incubare per un ulteriore 1 h. </li></ol> 7. IMaging <ol><li> Posizionare il tessuto etichettato in un piatto confocale e aggiungere CUBIC-mount soluzione fino a quando il tessuto è coperto. Collocare un coprioggetto sul tessuto. Utilizzare un microscopio confocale per l&#39;immagine del tessuto 14 sotto l&#39;obiettivo 10X. </li></ol>

<ol>
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Gli autori dichiarano di non avere interessi finanziari concorrenti.

Scadente fissaggio o immersione idrogel nei tessuti può causare la perdita di proteine ​​e la distorsione del tessuto durante il processo di compensazione del tessuto. L&#39;intero topo adulto cervello dovrebbe essere incubato in 4% paraformaldeide notte, seguito da immersione in un volume minimo di 20 mL di soluzione di monomero idrogel per 12 - 18 h agitando delicatamente. Per le grandi tessuti, tra cui i tessuti umani, come fettine di cervello e del midollo spinale, prolungato tempo immersi nella soluzione di idrogel monomero è necessaria. Il protocollo ACT è facilmente applicabile alla compensazione dei tessuti fissi, perché i passi di fissazione dei tessuti e infusione di polimero sono separati. Dopo compensazione dei tessuti, tessuti umani erano ben colorate con diversi anticorpi. Si noti che la tecnica ACT compensazione non è compatibile con fissativi alcool, quali etanolo e metanolo. La fase di polimerizzazione tessuto-idrogel è anche fondamentale per la produzione di tessuti di buona qualità a seguito del processo di compensazione. Perchéossigeno inibisce la polimerizzazione di acrilamide, dovrebbe essere rimosso mediante degasaggio della soluzione di tessuto contenente meno di un sistema di infusione di gas azoto. In alternativa, de-ossigenazione può essere eseguito utilizzando una camera a vuoto con un blocco di calore per 23 h. Il tasso di compensazione dipende da numerosi fattori, tra cui le dimensioni dell&#39;organo, il contenuto di lipidi o ECM proteine fibrose, la condizione di fissaggio, ecc maggior parte dei tessuti di topo adulto possono essere cancellati da ETC durante la notte. Tuttavia, vi è il rischio di inutile eccesso di compensazione e tumefazione dei tessuti; pertanto, le differenze nel tempo di compensazione sono di importante considerazione. condizioni del tessuto di sgombero dovrebbero essere empiricamente determinato. È importante sottolineare che il contenuto della ECM possono influenzare l&#39;aspetto del tessuto eliminato. Il colore dei tessuti rimane bianco o opaco, anche dopo l&#39;atto in buffer di ETC, perché ACT non cancella fibre proteiche dense. Tuttavia, quando questi organi sono stati immersi in soluzione corrispondenza RI, lay diventato trasparente. Il tasso di gonfiore tessuto sembra dipendere i contenuti ECM dei tessuti e organi molli, come il cervello, mostrano un maggior rapporto di rigonfiamento di organi densi. Perché aumento del tessuto gonfiore aiuterà la procedura di tessuti-clearing, ACT di routine utilizza distillato tampone a base di acqua nella maggior parte dei casi. In alcuni casi, quando gonfiore tessuto o deformità transitoria non è auspicabile, ad esempio negli embrioni, tampone contenente 0.1x PBS può essere applicato per immagini ad alta risoluzione. Va inoltre rilevato che elevate concentrazioni di sali nel buffer potrebbero causare il restringimento dei tessuti. Il metodo ACT può chiarire organi interi e anche tutto il corpo di un topo 14. Tuttavia, l&#39;imaging dei tessuti profondi del tessuto trasparente richiede microscopi e gli obiettivi speciali. Così, spessore tessuto cerebrale da 1 a 2 mm è più efficace per l&#39;imaging con un microscopio confocale convenzionale. Nelle nostre mani, rimozione dell&#39;etichettaanticorpi Ed da tessuti ACT-lavorati è anticorpo-dipendente, e non sono raccomandati giri di diversa etichettatura degli anticorpi. Diversi gli anticorpi, come TH e GFAP, ha lavorato particolarmente bene per tutto il cervello immunomarcatura 14. D&#39;altra parte, alcuni anticorpi, come TUJ1 o Map2, spesso etichettati solo la superficie dei tessuti. Questo potrebbe essere migliorata con altri metodi, come INTERRUTTORE 15. Un altro potenziale limitazione è che potrebbe essere difficile per conservare le strutture proteiche sottili nel tessuto ACT-trattati a causa del gonfiore dei tessuti e ritiro durante la fase di tessuto-compensazione. La tecnica PRESTO è applicabile ad un&#39;ampia varietà di tecniche tessuti etichettatura. Ad esempio, nei metodi di tessuto trasparente con tessuto pre-marcato, come SeeDB 4 e iDISCO 7, immunomarcatura di tessuto denso richiede periodi di incubazione più lunghi di diversi giorni o settimane. Tuttavia, PRESTO può abbreviare il tempo di incubazione a diverse ore, enabling il completamento dell&#39;intero processo entro un giorno con tessuto denso di spessore 1 mm. PRESTO può migliorare l&#39;efficacia di spessore profondo-etichettatura, i tessuti densi, o tessuti spessi anche non-eliminato. Poiché PRESTO utilizza una centrifuga da tavolo o pompa a siringa e non richiede particolari attrezzature, è relativamente facile da implementare questa tecnica con procedure di laboratorio di routine.

Una delle sfide nel campo delle neuroscienze è la visualizzazione di cablaggio del circuito neuronale e le cellule individuali all&#39;interno di tessuto cerebrale intatto. Fino a poco tempo, dimostrando le connessioni tra i neuroni in questo modo richiesto 1) sezionamento serie di tessuti; 2) l&#39;etichettatura molecolare di obiettivi specifici, come gli assoni o proteine; e 3) la visualizzazione per la ricostruzione 3D di tutto il cervello attraverso la registrazione di calcolo o l&#39;allineamento di immagini seriali 2D 1. Questi passaggi sono laboriosi, richiedono una grande quantità di tempo, e rischiano di perdere informazioni durante il sezionamento e l&#39;etichettatura, rendendo la mappatura della rete neuronale estremamente difficile. Tuttavia, sono stati sviluppati molti metodi che consentono la visualizzazione del tessuto intatto senza sezionamento. Tessuti biologici possono essere resi otticamente trasparente mediante tecniche tessuto sgombero 2-10. Uno dei principali metodi è quello di ridurre le differenze di indice di rifrazione tra il tessuto intatto e la soluzione di immersione in ordineper ridurre la dispersione della luce nel tessuto intatto, rendendo così il tessuto trasparente e consentire l&#39;osservazione delle strutture profonde. Alcuni tipi di soluzioni ad immersione hanno proprietà idrofobiche, che determinano quenching fluorescente veloce durante la procedura di disidratazione. Pertanto, tali metodi non sono compatibili con l&#39;imaging a fluorescenza per un lungo periodo di tempo 11,12. Invece di reagenti idrofobiche, altri metodi utilizzano reagenti idrofili per la compensazione dei tessuti, come ad esempio SeeDB 4 e Sca l e 6, che mantengono le informazioni strutturali e fluorescenza del 4,6,8 tessuto biologico. Tuttavia, macromolecole, compresi gli anticorpi, non possono raggiungere il nucleo di tessuto intatto sola diffusione. Pertanto, la pre-etichettatura delle molecole bersaglio in zone profonde dei tessuti densamente imballati è tecnicamente impegnativo. In un metodo tessuto-clearing recentemente sviluppato, CLARITY 3, a i tessuti biologici idrogel-embeddeds formate con acrilammide, e lipidi vengono rimossi mediante elettroforesi in sodio dodecil solfato (SDS) soluzione -contenenti. Il campione viene quindi immerso in una soluzione con un indice di riflessione di corrispondenza per ridurre la luce dispersione 3. Il sistema di rimozione dei lipidi è stato successivamente modificato in CHIAREZZA avanzate 13 e PACT (tecnica chiarezza passiva) 10. Dopo la polimerizzazione, catene di acrilammide reticolare con le proteine, formando idrogel-tessuto. componenti lipidici non può reticolare con acrilammide; pertanto, lipidi possono essere eliminati mediante elettroforesi in tampone SDS contenente. Attraverso l&#39;eliminazione attiva dei lipidi, tessuto cerebrale aumenta marcatamente in trasparenza 9. Tuttavia, questi metodi non affrontano l&#39;impossibilità di profonda etichettatura per diffusione libera. Per superare questa limitazione, sono necessarie tecniche di trasporto attivo di reagenti nelle parti più profonde dei tessuti spessi. Anche se CHIAREZZA permette compensazione dei tessuti e dei tessuti profondivisualizzazione, non è una procedura semplice e veloce. Si può richiedere diverse settimane per cancellare un intero 7,14 cervello di topo. compensazione rapida dei tessuti è essenziale per l&#39;applicazione di tali metodi per impostazioni di base o clinica di laboratorio per la ricerca delle scienze della vita o la diagnosi del volume. Il protocollo attuale prevede una procedura semplificata per la liquidazione tessuto biologico e l&#39;individuazione di proteine ​​successiva consegna da immuno-colorazione pressione assistita. È adatto per imaging volumetrico ad alta risoluzione di grandi depositato e 3D sistemi di elaborazione dei dati attraverso la combinazione con metodi di imaging.

<table border="0" cellpadding="0" cellspacing="0" width="813">
	<tbody>
		<tr height="20">
			<td height="20" style="height:20px;width:247px;">4% Paraformaldehyde</td>
			<td style="width:175px;">Lugen SCI&#160;</td>
			<td style="width:201px;">LGB-1175-4B</td>
			<td style="width:191px;">sample fixation&#160;</td>
		</tr>
		<tr height="20">
			<td height="20" style="height:20px;width:247px;">Acrylamide</td>
			<td style="width:175px;">Affymetrix</td>
			<td style="width:201px;">75820</td>
			<td style="width:191px;">Hydrogel monomer solution&#160;</td>
		</tr>
		<tr height="40">
			<td height="40" style="height:40px;width:247px;">2,2&#8217;-Azobis[2-(2-imidazolin-2-yl) propane] dihydrochloride</td>
			<td style="width:175px;">Wako Pure Chemical Industries&#160;&#160;</td>
			<td style="width:201px;">VA-044</td>
			<td style="width:191px;">Hydrogel monomer solution&#160;</td>
		</tr>
		<tr height="20">
			<td height="20" style="height:20px;width:247px;">Boric acid</td>
			<td style="width:175px;">Affymetrix</td>
			<td style="width:201px;">76324</td>
			<td>ETC buffer</td>
		</tr>
		<tr height="20">
			<td height="20" style="height:20px;width:247px;">Sodium Dodecyl Sulfate (SDS)</td>
			<td style="width:175px;">Affymetrix</td>
			<td style="width:201px;">18220</td>
			<td>ETC buffer</td>
		</tr>
		<tr height="20">
			<td height="20" style="height:20px;width:247px;">Sodium hydroxide pellets</td>
			<td style="width:175px;">Junsei chemical</td>
			<td style="width:201px;">1310-73-2</td>
			<td>ETC buffer</td>
		</tr>
		<tr height="40">
			<td height="40" style="height:40px;width:247px;">Bovine Serum Albumin (BSA)</td>
			<td style="width:175px;">Santa Cruz Biotechnology</td>
			<td style="width:201px;">sc-2323A</td>
			<td>Immunolabeling</td>
		</tr>
		<tr height="20">
			<td height="20" style="height:20px;width:247px;">Triton X-100</td>
			<td style="width:175px;">Sigma-Aldrich</td>
			<td style="width:201px;">T8787</td>
			<td>Immunolabeling</td>
		</tr>
		<tr height="20">
			<td height="20" style="height:20px;width:247px;">Sodium azide</td>
			<td style="width:175px;">Sigma-Aldrich</td>
			<td style="width:201px;">S2002</td>
			<td>Immunolabeling</td>
		</tr>
		<tr height="20">
			<td height="20" style="height:20px;width:247px;">Collagen type &#8547;</td>
			<td style="width:175px;">Abcam</td>
			<td style="width:201px;">AB6586</td>
			<td>Antibody/immunolabeling</td>
		</tr>
		<tr height="21">
			<td height="21" style="height:21px;width:247px;">Tyrosine hydroxylase (TH)</td>
			<td style="width:175px;">Millipore</td>
			<td style="width:201px;">AB152</td>
			<td>Antibody/immunolabeling</td>
		</tr>
		<tr height="42">
			<td height="42" style="height:42px;width:247px;">Alexa Fluor Cy3 Donkey anti-Rabbit IgG (H+L)</td>
			<td style="width:175px;">Jackson ImmunoResearch</td>
			<td style="width:201px;">711-165-152</td>
			<td style="width:191px;">Secondary antibody/ immunolabeling</td>
		</tr>
		<tr height="40">
			<td height="40" style="height:40px;width:247px;">Alexa Fluor 488 Donkey anti-Rabbit IgG (H+L)</td>
			<td style="width:175px;">Life Technologies - Molecular Probes</td>
			<td>A21206</td>
			<td style="width:191px;">Secondary antibody/ immunolabeling</td>
		</tr>
		<tr height="20">
			<td height="20" style="height:20px;width:247px;">Confocal dish</td>
			<td style="width:175px;">SPL lifesciences</td>
			<td style="width:201px;">101350</td>
			<td>Imaging</td>
		</tr>
		<tr height="21">
			<td height="21" style="height:21px;width:247px;">Confocal microscope</td>
			<td style="width:175px;">Leica</td>
			<td style="width:201px;">SP8</td>
			<td>Imaging</td>
		</tr>
		<tr height="20">
			<td height="20" style="height:20px;width:247px;">Sucrose</td>
			<td style="width:175px;">Junsei chemical</td>
			<td style="width:201px;">31365-0301</td>
			<td>CUBIC-mount solution&#160;</td>
		</tr>
		<tr height="20">
			<td height="20" style="height:20px;width:247px;">Urea</td>
			<td style="width:175px;">Affymetrix</td>
			<td style="width:201px;">23036</td>
			<td>CUBIC-mount solution&#160;</td>
		</tr>
		<tr height="40">
			<td height="40" style="height:40px;width:247px;">N,N,N&#8217;,N&#8217;-tetrakis(2-hydroxypropyl)ethylenediamine</td>
			<td style="width:175px;">Sigma-Aldrich</td>
			<td style="width:201px;">122262</td>
			<td>CUBIC-mount solution&#160;</td>
		</tr>
		<tr height="46">
			<td height="46" style="height:46px;width:247px;">ECT chamber</td>
			<td style="width:175px;">Logos Biosystems, Inc.</td>
			<td style="width:201px;">C10101</td>
			<td>ETC system</td>
		</tr>
		<tr height="20">
			<td height="20" style="height:20px;width:247px;">ECT chamber controller</td>
			<td style="width:175px;">Logos Biosystems, Inc.</td>
			<td style="width:201px;">C10201</td>
			<td>ETC system</td>
		</tr>
		<tr height="20">
			<td height="20" style="height:20px;width:247px;">Temperature probe</td>
			<td style="width:175px;">Logos Biosystems, Inc.</td>
			<td style="width:201px;">C12101</td>
			<td>ETC system</td>
		</tr>
		<tr height="60">
			<td height="60" style="height:60px;width:247px;">Peristatic pump</td>
			<td style="width:175px;">Baoding longer precision pump Co., Ltd</td>
			<td style="width:201px;">YZ1515X</td>
			<td>ETC system</td>
		</tr>
		<tr height="20">
			<td height="20" style="height:20px;width:247px;">Buffer reservoir</td>
			<td style="width:175px;">Logos Biosystems, Inc.</td>
			<td style="width:201px;">C10401</td>
			<td>ETC system</td>
		</tr>
		<tr height="20">
			<td height="20" style="height:20px;width:247px;">Tissue container&#160;</td>
			<td style="width:175px;">Logos Biosystems, Inc.</td>
			<td style="width:201px;">C12001</td>
			<td>ETC system</td>
		</tr>
		<tr height="40">
			<td height="40" style="height:40px;width:247px;">Container holder for 1 tissue container</td>
			<td style="width:175px;">Logos Biosystems, Inc.</td>
			<td style="width:201px;">C12002</td>
			<td>ETC system</td>
		</tr>
		<tr height="20">
			<td height="20" style="height:20px;width:247px;">Mouse brain slice holder</td>
			<td style="width:175px;">Logos Biosystems, Inc.</td>
			<td style="width:201px;">C12004</td>
			<td>ETC system</td>
		</tr>
		<tr height="20">
			<td height="20" style="height:20px;width:247px;">Whole rat brain holder</td>
			<td style="width:175px;">Logos Biosystems, Inc.</td>
			<td style="width:201px;">C12007</td>
			<td>ETC system</td>
		</tr>
		<tr height="20">
			<td height="20" style="height:20px;width:247px;">Peristaltic pump tubing</td>
			<td style="width:175px;">Logos Biosystems, Inc.</td>
			<td style="width:201px;">C12104</td>
			<td>ETC system</td>
		</tr>
		<tr height="40">
			<td height="40" style="height:40px;width:247px;">Tabletop-centrifuge</td>
			<td style="width:175px;">Hanil science industrial Co., Ltd</td>
			<td style="width:201px;">MICRO 12</td>
			<td>c-PRESTO</td>
		</tr>
		<tr height="60">
			<td height="60" style="height:60px;width:247px;">Syringe pump</td>
			<td style="width:175px;">Baoding longer precision pump Co., Ltd</td>
			<td style="width:201px;">LSP02-1B</td>
			<td>s-PRESTO</td>
		</tr>
		<tr height="40">
			<td height="40" style="height:40px;width:247px;">Syringe (20 ml)</td>
			<td style="width:175px;">Korea vaccine Co., Ltd.</td>
			<td style="width:201px;">KV-S20</td>
			<td>s-PRESTO</td>
		</tr>
		<tr height="40">
			<td height="40" style="height:40px;width:247px;">3-way stopcock</td>
			<td style="width:175px;">Hyupsung medical Co.,Ltd.</td>
			<td style="width:201px;">HS-T-01N</td>
			<td>s-PRESTO</td>
		</tr>
	</tbody>
</table>

act-presto: biological tissue clearing and immunolabeling methods for volume imaging

L&#39;identificazione e l&#39;esplorazione della organizzazione dettagliata di organi o di tutto il corpo a livello cellulare sono sfide fondamentali in biologia. metodi transitorie richiedono una notevole quantità di tempo e sforzi per ottenere un&#39;immagine 3D e comprendente sezionare il tessuto intatto, immunomarcatura e imaging dei tessuti serialmente sezionata, che produce una perdita di informazioni in ogni fase del processo. Negli approcci di recente sviluppo per l&#39;imaging ad alta risoluzione all&#39;interno del tessuto intatto, la caratterizzazione molecolare è stato limitato l&#39;etichettatura delle proteine. Tuttavia, i protocolli attualmente disponibili per la compensazione organo richiedono un tempo considerevolmente lungo processo, il che rende difficile implementare tecniche di tessuti di compensazione in laboratorio. Recentemente abbiamo stabilito un protocollo rapida e altamente riproducibili chiamato ACT-PRESTO (un ctive c rità t echnique- p ressione r euforico e sere sufficienti e tavolo s t rasferimentodi macromolecole in o rgans), che consente di attestazione tessuto entro alcune ore. Inoltre, ACT-PRESTO consente un rapido immunomarcatura con metodi convenzionali e accelera la penetrazione degli anticorpi nel profondo strato di densamente-formate, i campioni di spessore applicando una pressione o convezione flusso. Descriviamo come preparare i tessuti, come cancellare dalla rimozione dei lipidi mediante elettroforesi, e come immuno-macchia per una consegna a pressione assistita. La rapidità e la coerenza del protocollo sarà accelerare il compimento di ricerche istologiche 3D e diagnosi in base al volume.

Clearing ACT-tessuto Un fattore importante che influenza compensazione dei tessuti è la fissazione dei tessuti. PFA fissazione e infusione di acrilamide sono fasi distinte in questo protocollo. Dopo la fase di polimerizzazione dei tessuti-idrogel, la soluzione A4P0 libero non è polimerizzato, sebbene idrogel di tessuto-infuso sono reticolato con macromolecole endogene. Pertanto, nessun gel deve formare all&#39;esterno del tessuto (Figura 2A). I risultati della procedura di ACT a meno cross-linking tra proteine ​​e acrilamide rispetto al protocollo di chiarezza. Di conseguenza, il campione di tessuto-idrogel è più poroso. Questa caratteristica consente l&#39;estrazione rapida di lipidi e la diffusione di macromolecole. Le sezioni di cervello di topo da 1 a 2 mm di spessore sono stati sufficientemente liquidati entro 1 - 2 h (Figura 2B), e 5 - 6 h di ETC era sufficiente per clearance di cervelli di topo interi (Figura 2C). Idrogel mediata compensazione tessuto indotto l&#39;espansione del tessuto dopo la fase ETC, ma il tessuto riportata alla sua dimensione originale in soluzione index-matched riflettente. Il campione di tessuto-idrogel formata nel procedimento ACT è altamente porosa, e quindi, piccoli composti e macromolecole può penetrare in modo efficiente e diffondere facilmente (Figura 3). Dopo 2 ore di incubazione delle fettine cerebrali 1 mm con tirosina idrossilasi (TH) e collagene tipo anticorpi IV, una successiva 2 h di incubazione con un anticorpo secondario era sufficiente per etichettare i neuroni dopaminergici a una profondità di 500 micron (Figura 3) . Immunomarcatura PRESTO-tessuto organi Dense hanno generalmente alte concentrazioni di fibre ECM, che colpisce la penetrazione di anticorpi nei tessuti. Così, gli anticorpi Penetvalutazione ad una profondità di soli 20-30 micron di tessuti densi, come il tessuto renale, dopo 12 ore di incubazione. Per superare questa limitazione, abbiamo progettato metodi penetrazione macromolecola attivi che consentono l&#39;erogazione dei reagenti nei tessuti profondi, cioè PRESTO (pressione correlato trasferimento efficiente e stabile di macromolecole in organi) (Figura 4). Rispetto alla incubazione statica del tessuto renale ACT-trattati con soluzioni di anticorpi, l&#39;applicazione di forze centrifughe (600 xg) con una centrifuga da tavolo (PRESTO centrifuga, c-PRESTO) notevolmente migliorato consegna anticorpi in tessuti profondi (Figura 5). Quando abbiamo applicato la procedura di c-PRESTO ai tessuti densi, 3 ore di incubazione era sufficiente per etichettare 250 a strutture profonde di 300 micron. Per migliorare la distorsione dei tessuti senza significative danni ai tessuti, abbiamo anche progettato una macchina che fornisce il flusso di convezione con una pompa a siringa (siringhe PRESTO, s-Presto). Questo processo simile migliorato pe anticorpinetration rispetto a diffusione passiva (Figura 5). <img alt="Figura 1" src="/files/ftp_upload/54904/54904fig1.jpg" /> Figura 1. Preparazione dell&#39;apparecchiatura s-PRESTO. A. Una siringa (30 ml) e tre vie rubinetto. B. La valvola a tre vie collegata e incollato alla siringa. C. La siringa contenente la soluzione campione e l&#39;anticorpo, e la siringa posto sulla pompa a siringa. D. La pompa a siringa e di lavoro di installazione condizione. E. La pompa infonde una soluzione contenente i reagenti di etichettatura nel campione. Quando il volume designato è raggiunto, i cambi di direzione di pompaggio e ritira la soluzione dopo un determinato periodo di tempo. <a href="http://ecsource.jove.com/files/ftp_upload/54904/54904fig1large.jpg" target="_blank">Clicca qui per vedere una versione più grande di questa figura.</a> Figura 2. ATTO tessuto compensazione di cervello di topo. A. Dopo la polimerizzazione, soluzioni A4P0 liberi non sono polimerizzati; idrogel di tessuto-infuso sono gelated da cross-linking con macromolecole endogene. B. 1 a 2 mm di spessore fettine cerebrali sono state autorizzate per 1 - 2 h, e il grado di espansione e recupero dimensione in indice di riflessione (RI) soluzione -matching sono stati registrati. C. Lo spessore di tutto il cervello di topo è di circa 0,8 cm, e 5 - 6 h di ETC è stato sufficiente a cancellare completamente il cervello. Dopo 3 h di ETC, c&#39;è stata una notevole quantità di tessuto non compensate. Con 6 h di ETC, tuttavia, si era verificato compensazione di tutto il cervello. Il colore dei tessuti dopo l&#39;ACT nel buffer di ETC è bianco o opaco. Con la regolazione del RI, i tessuti diventano trasparenti. <a href="http://ecsource.jove.com/files/ftp_upload/54904/54904fig2large.jpg" target="_blank">Si prega di cliccare il suo</a>e per vedere una versione più grande di questa figura. <img alt="Figura 3" src="/files/ftp_upload/54904/54904fig3.jpg" /> Figura 3. immunomarcatura con il tessuto di cervello di topo ACT-eliminato. Immagini di 1 mm fettine di cervello di topo ACT-elaborati che mostrano la corteccia cerebrale del mouse macchiato con un anticorpo di collagene di tipo IV e parte del mesencefalo macchiato di un anticorpo per la tirosina idrossilasi (TH). barra della scala, 100 micron. <a href="http://ecsource.jove.com/files/ftp_upload/54904/54904fig3large.jpg" target="_blank">Clicca qui per vedere una versione più grande di questa figura.</a> <img alt="Figura 4" src="/files/ftp_upload/54904/54904fig4.jpg" /> Figura metodi immunomarcatura 4. PRESTO. Gli anticorpi non possono penetrare nei tessuti densi di diffusione. metodi PRESTO immunomarcatura sono stati progettati per infondere attivamente macromolecole e di consegnare i reagenti intessuti densi. L&#39;applicazione di forze centrifughe utilizzando una centrifuga da tavolo standard (PRESTO centrifuga, c-PRESTO) notevolmente facilitato la consegna di anticorpi. Applicando il flusso di convezione con una pompa a siringa (siringhe PRESTO, s-PRESTO) migliore penetrazione degli anticorpi. <a href="http://ecsource.jove.com/files/ftp_upload/54904/54904fig4large.jpg" target="_blank">Clicca qui per vedere una versione più grande di questa figura.</a> <img alt="Figura 5" src="/files/ftp_upload/54904/54904fig5.jpg" /> Figura 5. PRESTO immunomarcatura di tessuto denso ACT-eliminato. Per c-PRESTO, tessuti sono stati centrifugati a 600 xg per 3 h usando un tavolo centrifuga standard per accelerare la penetrazione degli anticorpi primari e secondari. Per s-PRESTO, una pompa a siringa è stato usato per fornire anticorpi. organi mouse, come i reni e il fegato, sono stati etichettati con collagene di tipo IV. Rispetto ai metodi convenzionali, 3 h diC o s-PRESTO migliora notevolmente la profondità di etichettatura. Nel rene ed il fegato, la profondità Z raggiunge i 300 - 350 micron o più in profondità nei campioni Presto (destra), mentre i campioni di controllo sono etichettati a una profondità di soli 40 - 50 micron (a sinistra). Una immagine ricostruita 3D è stata ottenuta con un microscopio confocale. barra della scala, 100 micron. <a href="http://ecsource.jove.com/files/ftp_upload/54904/54904fig5large.jpg" target="_blank">Clicca qui per vedere una versione più grande di questa figura.</a>

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ACT-PRESTO: Biological Tissue Clearing and Immunolabeling Methods for Volume Imaging

ACT-PRESTO (attivo chiarezza tecnica pressione legati trasferimento efficiente e stabile delle macromolecole in organi) consente una rapida, efficace, ma poco costoso compensazione dei tessuti e la penetrazione degli anticorpi rapida nei tessuti liberata da diffusione passiva o la consegna a pressione assistita. Utilizzando questo metodo, una vasta gamma di tessuti può essere cancellato, immunolabeled da più anticorpi e volume-ripreso.

ACT-PRESTO: Biological Clearing tessuti e Metodi immunomarcatura per Volume Imaging

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