Name: modeling fast-scan cyclic voltammetry data from electrically stimulated dopamine neurotransmission data using qnsim1.0
Uploaded: 2017-06-05T12:30:00
Description: Watch this Scientific Journal Video about Modeling Fast-scan Cyclic Voltammetry Data from Electrically Stimulated Dopamine Neurotransmission Data Using QNsim1.0 at JoVE.com

Reconhecemos o Instituto de Reabilitação da UPMC para apoiar este trabalho.

1. Instalação, preparação de dados e lançamento QNsim1.0 <ol><li> Baixe &quot;QNsim1.0.zip&quot; (fornecido como um suplemento) e extraie-o para um diretório desejado. </li><li> Prepare dados de resposta de DA estimulados para modelagem com o programa de software organizando uma planilha em que cada coluna contém uma resposta DA temporária convertida em concentrações de μ MDA. Salve esse arquivo (.xlsx) no mesmo diretório que os arquivos do programa. Nota: A planilha pode conter várias res...

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	<li>Taylor, I. M., et al. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/query.fcgi?db=PubMed&cmd=Search&doptcmdl=Citation&defaultField=Title+Word&term=Kinetic+diversity+of+dopamine+transmission+in+the+dorsal+striatum.">Kinetic diversity of dopamine transmission in the dorsal striatum.</a> J Neurochem. 133 (4), 522-531 (2015).</li><li>Harun, R., Grassi, C. M., Munoz, M. J., Torres, G. E., Wagner, A. K. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/query.fcgi?db=PubMed&cmd=Search&doptcmdl=Citation&defaultField=Title+Word&term=Neurobiological+model+of+stimulated+dopamine+neurotransmission+to+interpret+fast-scan+cyclic+voltammetry+data.">Neurobiological model of stimulated dopamine neurotransmission to interpret fast-scan cyclic voltammetry data.</a> Brain Res. 1599, 67-84 (2015).</li><li>Taylor, I. M., Jaquins-Gerstl, A., Sesack, S. R., Michael, A. C. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/query.fcgi?db=PubMed&cmd=Search&doptcmdl=Citation&defaultField=Title+Word&term=Domain-dependent+effects+of+DAT+inhibition+in+the+rat+dorsal+striatum.">Domain-dependent effects of DAT inhibition in the rat dorsal striatum.</a> Journal of neurochemistry. 122 (2), 283-294 (2012).</li><li>Garris, P. A., Ciolkowski, E. L., Wightman, R. M. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/query.fcgi?db=PubMed&cmd=Search&doptcmdl=Citation&defaultField=Title+Word&term=Heterogeneity+of+evoked+dopamine+overflow+within+the+striatal+and+striatoamygdaloid+regions.">Heterogeneity of evoked dopamine overflow within the striatal and striatoamygdaloid regions.</a> Neuroscience. 59 (2), 417-427 (1994).</li><li>May, L. J., Wightman, R. 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A. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/query.fcgi?db=PubMed&cmd=Search&doptcmdl=Citation&defaultField=Title+Word&term=Determination+of+release+and+uptake+parameters+from+electrically+evoked+dopamine+dynamics+measured+by+real-time+voltammetry.">Determination of release and uptake parameters from electrically evoked dopamine dynamics measured by real-time voltammetry.</a> J Neurosci Methods. 112 (2), 119-133 (2001).</li></ol>

O uso de FSCV para estudar a neurotransmissão de DA estimulada in vivo originou-se na década de 1980 30 e continua a ser uma fonte rica de dados de neurotransmissão in vivo com resolução espacial e temporal incomparável. As respostas de DA estimuladas refletem um equilíbrio complexo da liberação e recaptação de DA que são moduladas pelos próprios estímulos elétricos. O modelo QN incorpora princípios da pesquisa contemporânea de n...

A neurotransmissão de dopamina (DA) desempenha um papel essencial em várias funções cognitivas e comportamentais, e sua disfunção está implicada em várias doenças e distúrbios comuns. Como tal, é fundamental desenvolver métodos precisos de estudo quantitativo da neurotransmissão DA in vivo para avaliar como a neurotransmissão DA é alterada nos contextos de modelos de doenças e farmacologia de drogas. A voltametria cíclica de varredura rápida (FSCV) permite monitorizar a neurotransmissão DA DA in vivo com resolução espacial e temporal fina. Embora seja possível monitorizar a neurotransmissão de DA fisiológica em animais acordados, que se comportam livremente, a estimulação elétrica de caminhos dopaminérgicos ascendentes em animais anestesiados pode produzir respostas de DA robustas que são favoráveis ​​à análise cinética aprimorada da neurotransmissão DA. As respostas de DA estimuladas eletronicamente refletem uma interação dinâmica da liberação e recaptação de DA, e interpretaçõesDessas respostas usaram predominantemente um modelo simples de neurotransmissão de DA estimulada chamada modelo Michaelis-Menten (MM) 12 . O modelo de MM consiste em 3 variáveis ​​para descrever as respostas de DA em termos de uma taxa de liberação constante de DA e uma eficiência de recaptação constante ( ou seja, a relação entre a taxa de recaptação de DA e as concentrações extracelulares de DA), conforme descrito pela Equação 1 : <img alt="Equação 1" src="/files/ftp_upload/55595/55595eq1.jpg" /> (Liberação de DA) (recaptação de DA) Na Equação 1, f é a freqüência de estimulação; [DA] p é o aumento estimado da concentração DA por pulso de estimulação; V max representa a taxa de recaptação máxima estimada; E K m é a constante de MM estimada, que é teoricamente equivalente à concentração de DA extracelular que satura 50% de DAT, levando a uma taxa de recaptação de meio máximo. Essa diferençaA equação completa pode ser integrada para simular respostas experimentais de DA estimando os parâmetros [DA] p , V max e K m . Embora o modelo de MM tenha facilitado avanços significativos na compreensão da cinética de neurotransmissão de DA em vários contextos experimentais, o modelo de MM faz suposições fundamentais simplistas que limitam sua aplicabilidade ao modelar as respostas da DA suscitadas por estimulações suprafisiológicas 2 , 13 . Por exemplo, o modelo de MM só pode aproximar as formas de resposta de DA se aumentar de maneira convexa, mas não pode explicar as respostas crescentes graduais (côncavas) encontradas nas regiões estriadas dorsais 12 . Assim, os pressupostos do modelo MM não capturam com precisão os processos de liberação dinâmica e recaptação da neurotransmissão de DA estimulada. Para modelar as respostas de DA estimuladas de acordo com um quantum realistaO quadro quantitativo neurobiológico (QN) foi desenvolvido com base em princípios de cinética de neurotransmissão estimulada, derivados de pesquisas complementares e experimentação 2 . Várias linhas de pesquisa de neurotransmissão demonstram que (1) a liberação de neurotransmissor estimulada é um processo dinâmico que diminui na taxa ao longo da estimulação 14 , (2) a liberação continua na fase pós-estimulação com cinética de decomposição bifásica 15 e (3) DA A eficiência da recaptação é progressivamente inibida durante a duração da própria estimulação 2 , 16 . Esses três conceitos servem de base à estrutura do QN e as três equações consistindo em 12 parâmetros que descrevem a dinâmica da liberação e recaptação do DA ( Tabela 1 ). A estrutura de QN pode simular de forma precisa tipos de resposta de DA experimentais heterogêneos, bem como a pEfeitos redicados de manipulações experimentais de parâmetros de estimulação e administração de fármaco 2 , 6 . Embora seja necessária uma pesquisa adicional para refinar a abordagem de modelagem de dados, as experiências futuras podem se beneficiar grandemente dessa abordagem de modelagem neuroquimicamente fundamentada, o que aumenta significativamente as inferências extraídas do paradigma de neurotransmissão DA estimulado. <img alt="tabela 1" src="/files/ftp_upload/55595/55595tbl1.jpg" /> Tabela 1: Modelagem de Equações e Parâmetros . <a href="http://ecsource.jove.com/files/ftp_upload/55595/55595tbl1large.jpg" target="_blank">Clique aqui para ver uma versão maior desta figura.</a> Este tutorial descreve como modelar dados de resposta de DA estimulados para estimar a liberação de DA e a cinética de recaptação usando o QNsim 1.0. A coleção de dados experimental real e prO processamento não é descrito aqui e requer apenas dados de concentração de DA temporais. O suporte teórico e os fundamentos da estrutura QN foram amplamente descritos anteriormente 2 , mas uma perspectiva prática sobre a aplicação da estrutura QN para o modelo de dados de resposta DA é descrita abaixo. A estrutura de QN modela a interação dinâmica entre: 1) liberação de DA dinâmica, 2) recaptação de DA e 3) os efeitos de estimulações suprafisiológicas nesses processos para extrair informações cinéticas significativas de dados de resposta de DA. A estrutura QN é mais adequada para modelagem de dados FSCV adquiridos com estimulações altamente suprafisiológicas de longa duração ( por exemplo, 60 Hz, 10 s estimulações), que produzem respostas robustas DA que são passíveis de análise cinética. Seguindo a modelagem precisa dos processos subjacentes de liberação e recaptação, os parâmetros do modelo podem ser usados ​​para simular uma resposta DA que deve se aproximar da forma do exResposta de DA experimental. As equações da estrutura de QN descrevem as taxas de liberação de DA e recaptação ao longo das respostas de DA estimuladas. A estrutura de QN descreve a taxa de liberação de DA estimulada como uma função do tempo desde o início da estimulação (t stim ), quando a taxa de liberação de DA diminui exponencialmente ao longo da estimulação. Isso é consistente com o esgotamento de um pool prontamente liberável, com uma taxa de liberação de DA de estado estável adicionada (DARss) para explicar o reabastecimento de vesículas, semelhante a outros relatórios ( Equação 2 ) 14 , 17 . <img alt="Equação 2" src="/files/ftp_upload/55595/55595eq2.jpg" /> Manipulações que aumentam a taxa de liberação de DA, como o aumento de Δ DAR, Δ DAR τ ou DARss, levam a amplitudes de resposta aumentadas em partos de DA versus tempo. Cada parameE contribui diferencialmente com as formas de resposta DA. Aumentar DARss e Δ DAR τ tornam a fase ascendente das respostas mais linear (menos convexa). Diminuir Δ DAR τ promove a convexidade, que é controlada pela magnitude de Δ DAR. Com base na experiência de modelagem, DARss geralmente é inferior a 1/5 de Δ DAR; Assim, Δ DAR é o parâmetro de lançamento que determina principalmente a amplitude de resposta global de uma resposta DA. A taxa de liberação de DA pós-estimulação é modelada pela Equação 3 como uma continuação da taxa estimada de liberação de DA desde o final da estimulação (DAR ES ) em função do tempo após a estimulação (t post ). A taxa de liberação de DA pós-estimulação segue um padrão de decaimento bifásico, como descrito anteriormente 15 , com uma rápida fase de decaimento exponencial e uma fase de decaimento linear prolongada para modelar dois caProcessos de liberação de neurotransmissores dependentes de cálcio. <img alt="Equação 4" src="/files/ftp_upload/55595/55595eq4.jpg" /> (Decadência exponencial rápida) (Decadência linear prolongada) Atualmente, não é possível determinar a quantidade de liberação de DA pós-estimulação. Essa limitação pode ser abordada minimizando sistematicamente as estimativas da liberação de DA pós-estimulação e validando os parâmetros do modelo em um conjunto de respostas de DA experimentais coletadas do mesmo local de gravação usando diferentes durações de estimulação. Essa minimização permite aos usuários fazer estimativas conservadoras de liberação e recaptação. Como as estimulações elétricas levam à acumulação de cálcio que promove a liberação pós-estimulação de neurotransmissores, a duração da estimulação influencia os neurotrans pós-estimulaçãoMitter Release parameters 18 , 19 . Com base na experiência de modelagem, verificou-se que, à medida que a duração da estimulação aumenta, τ R aumenta e X R diminui, consistente com os efeitos antecipados de maior acumulação de cálcio 20 . A Equação 4 descreve a taxa de recaptação de DA como uma extensão da estrutura de MM e incorpora um termo de K m dinâmico, que aumenta durante a estimulação para modelar uma eficiência de recaptação progressivamente decrescente causada pelas estimulações suprafisiológicas 2 , 16 . O K m após a estimulação é mantido constante no valor de K m no final da estimulação (K mES ). <img alt="Equação 5" src="/files/ftp_upload/55595/55595eq5.jpg" /> Onde, <img alT = &quot;Equação 6&quot; src = &quot;/ files / ftp_upload / 55595 / 55595eq6.jpg&quot; /&gt; (Durante a estimulação) (após a estimulação) As respostas de DA estimuladas, especialmente das regiões estriatares ventrais, são muitas vezes insensíveis às mudanças no valor inicial de K m (K mi ), o que torna a definição de um problema de K mi problemático. Assim, como a estrutura MM original, K mi é aproximado em 0,1-0,4 μ M para respostas DA coletadas de animais não tratados não tratados 12 . O termo Δ K m determina a extensão da mudança de eficiência da recaptação durante a estimulação, que da nossa experiência é de cerca de 2081; M ao longo de uma estimulação de 60 Hz, 10 s. Os valores de K e K minf determinam o modo como K m muda ao longo do tempo e o aumento de cada um destes termos promove a concavidade da fase ascendente. V max é a taxa de recaptação máxima que se relaciona parcialmente com a densidade do transportador DA local, que exibe um gradiente ventromedial para dorsolateral 21 . Por conseguinte, os valores de V max no estriado dorsal (D-Str) são geralmente superiores a 30 μ M / s, mas geralmente inferiores a 30 μ M / s nas regiões ventrais, como o núcleo accumbens (NAc) 6 . As diretrizes gerais acima podem auxiliar na modelagem de dados experimentais de resposta DA, mas gerar uma simulação que se aproxima da resposta DA experimental precisa ajustar os parâmetros do modelo iterativamente. A precisão dos parâmetros do modelo pode ser melhorada através da obtenção de respostas DA para estimulações suprafisiológicas que proporcionamUm substrato robusto para simulação, bem como através da obtenção e modelagem de múltiplas respostas de DA para estimulações de diferentes durações no mesmo local de gravação ( por exemplo, estimulações de 60 Hz, 5 e 10) para validar a precisão dos parâmetros ( Veja os dados da amostra). Para demonstrar, um conjunto de dados é incluído no pacote de software que contém respostas DA estimuladas regiospecificas coletadas no núcleo accumbens e em estriado dorsal, antes e depois de um desafio farmacológico que já foi modelado usando a estrutura QN. Por extensão, os usuários acharão que esta metodologia pode ser aplicada de forma semelhante para caracterizar a cinética da neurotransmissão DA em vários contextos de doenças e manipulações farmacológicas.

<table border="0" cellpadding="0" cellspacing="0" width="750">
	<tbody>
		<tr height="21">
			<td height="21" style="height:21px;width:216px;">MATLAB R2016a for Mac&#160;</td>
			<td style="width:99px;">Mathworks</td>
			<td style="width:119px;"></td>
			<td style="width:317px;"></td>
		</tr>
		<tr height="63">
			<td height="63" style="height:63px;width:216px;">QNsim1.0</td>
			<td style="width:99px;">In house software package</td>
			<td style="width:119px;"></td>
			<td>Software to model FSCV data using the QN framework</td>
		</tr>
	</tbody>
</table>

modeling fast-scan cyclic voltammetry data from electrically stimulated dopamine neurotransmission data using qnsim1.0

As vias dopaminérgicas do meio (DAergic) central têm um papel importante em uma ampla gama de funções, como atenção, motivação e movimento. A dopamina (DA) está implicada em doenças e distúrbios, incluindo transtorno de déficit de atenção e hiperatividade, doença de Parkinson e lesão cerebral traumática. Assim, a neurotransmissão DA e os métodos para estudá-la são de intenso interesse científico. A voltamperografia cíclica de rápida varredura in vivo (FSCV) é um método que permite monitorar seletivamente as mudanças de concentração DA com resolução temporal e espacial fina. Esta técnica é comumente usada em conjunção com estimulações elétricas de caminhos díngicos ascendentes para controlar o fluxo de impulso da neurotransmissão da dopamina. Embora o paradigma de neurotransmissão de DA estimulado possa produzir respostas de DA robustas com morfologias claras, tornando-as passíveis de análise cinética, ainda há muito debate sobre como interpretar as respostas em termos de liberação de DA e ClearanComponentes. Para abordar esta preocupação, uma estrutura neurobiológica quantitativa (QN) de neurotransmissão DA estimulada foi recentemente desenvolvida para modelar de forma realista a dinâmica de liberação e recaptação de DA ao longo de uma resposta de DA estimulada. Os fundamentos deste modelo baseiam-se em dados experimentais de neurotransmissão de DA estimulada e em princípios de neurotransmissão adotados em várias linhas de pesquisa. O modelo de QN implementa 12 parâmetros relacionados à liberação de DA estimulada e dinâmica de recaptação para modelar as respostas DA. Este trabalho descreve como simular as respostas da DA usando QNsim1.0 e também detalha os princípios que foram implementados para discernir sistematicamente as alterações na liberação de dopamina estimulada e na dinâmica da recaptação.

Incluído com o programa de software são dados de neurotransmissão da DA de amostra obtidos a partir do estriado dorsal do rato (Estudo 1) e do núcleo accumbens (Estudo 2) que são compilados em &quot;Sample.xlsx&quot;. A planilha contém os dados de concentração de DA das respostas de linha de base para estimulações de 60 Hz, 10 s e 5 s e uma resposta a uma estimulação de 60 Hz, 5 s 35 min após a administração do metilfenidato de inibidor de transporte DA (MPH) (10 mg / Kg, ip). Os dados de resposta de DA e...

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Modeling Fast-scan Cyclic Voltammetry Data from Electrically Stimulated Dopamine Neurotransmission Data Using QNsim1.0

A voltametria cíclica de varredura rápida pode monitorar neurotransmissão de dopamina in vivo no contexto de drogas, doenças e outras manipulações experimentais. Este trabalho descreve a implementação do QNsim1.0, um software para modelar respostas de dopamina estimuladas eletricamente de acordo com o modelo neurobiológico quantitativo para quantificar estimativas de liberação de dopamina e dinâmica de recaptação.

Modelagem de Dados de Voltammetria Cíclica de Dados Rápidos de Dados de Neurotransmissão de Dopamina Estimulados Eletricamente Usando QNsim1.0

Central dopaminergic (DAergic) pathways have an important role in a wide range of functions, such as attention, motivation, and movement. Dopamine (DA) is ...

Research

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Neuroscience

High Density Event-related Potential  Data Acquisition in Cognitive Neuroscience

Evento relacionados com alta densidade de Aquisição de Dados Potencial em Neurociência Cognitiva

Functional magnetic resonance imaging (fMRI) is currently the standard method of evaluating brain function in the field of Cognitive Neuroscience, in part ...

Neurociência

Basics of Multivariate Analysis in Neuroimaging Data

Fundamentos da Análise Multivariada em Dados de neuroimagem

Multivariate analysis techniques for neuroimaging data have recently received increasing attention as they have many attractive features that cannot be ...

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Pré-sináptica de dopamina Dynamics em fatias de cérebro estriado com Fast-scan voltametria cíclica

Extensive research has focused on the neurotransmitter dopamine because of its importance in the mechanism of action of drugs of abuse (e.g. cocaine and ...

Voltage Biasing, Cyclic Voltammetry, &amp; Electrical Impedance Spectroscopy for Neural Interfaces

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Tensão de polarização, voltametria cíclica, espectroscopia de impedância elétrica e para Interfaces Neurais

Electrical impedance spectroscopy (EIS) and cyclic voltammetry (CV) measure properties of the electrode-tissue interface without additional invasive ...

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Extraindo potenciais evocados visuais de dados EEG gravado durante fMRI-guiada Estimulação Magnética Transcraniana

Transcranial Magnetic Stimulation (TMS) is an effective method for establishing a causal link between a cortical area and cognitive/neurophysiological ...

Analyzing Synaptic Modulation of Drosophila melanogaster Photoreceptors after Exposure to Prolonged Light

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Analisando Synaptic Modulação da<em&gt; Drosophila melanogaster</em&gt; Fotorreceptores após exposição à luz prolongada

The nervous system has the remarkable ability to adapt and respond to various stimuli. This neural adjustment is largely achieved through plasticity at ...

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Analisando a atividade Neural e conectividade usando dados de EEG intracraniano com SPM Software

Measuring neural activity and connectivity associated with cognitive functions at high spatial and temporal resolutions is an important goal in cognitive ...

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Infusão e Estimulação Combinada com Voltammetry Cíclica de Varredura Rápida (CIS-FSCV) para avaliar a regulação do receptor da área tegmental ventral da dopamina fástica

Phasic dopamine (DA) release from the ventral tegmental area (VTA) to the nucleus accumbens plays a pivotal role in reward processing and reinforcement ...