Name: a hydroponic co-cultivation system for simultaneous and systematic analysis of plant/microbe molecular interactions and signaling
Uploaded: 2017-07-22T14:00:00
Description: Watch this Scientific Journal Video about A Hydroponic Co-cultivation System for Simultaneous and Systematic Analysis of Plant/Microbe Molecular Interactions and Signaling at JoVE.com

Мы хотели бы поблагодарить Брайана Веселовского и Александра У. Истмана за помощь и полезную дискуссию. Мы также хотели бы поблагодарить доктора. Юджин Нестер, Лингруй Чжан, Хайтао Шен, Юхай Цуй и Грег Торн за помощь, полезные обсуждения и критическое чтение рукописи. Это исследование было профинансировано сельским хозяйством и агропродовольственной Канадой, Growing Forward-AgriFlex (RBPI № 2555) и проектом «Рост вперед II» № 1670, проведенным авторами в рамках их обязанностей. Это исследование было также частично профинансировано Советом по исследованиям естественных наук и инженерных исследований Канады (NSERC) RGPIN-2015-06052, присуждаемым ZC Yuan.

1. Экспериментальное планирование <ol><li> Определите конкретные цели эксперимента. </li><li> Прочитайте весь протокол ниже. Определите, какие разделы имеют отношение к конкретным целям и должны ли быть сделаны какие-либо изменения. Ниже приведены примеры. <ol><li> Рассмотрим, будут ли ?...

Учитывая постепенный характер секреции корней, концентрация вызывающих вирулентность химических веществ, продуцируемых в planta, и их влияние на динамические взаимодействия растений и микробов происходят в пространственных и временных градиентах. В этой системе гидропонной совме...

Микроорганизмы, связанные с растениями, играют важную роль в биогеохимическом циклировании, биоремедиации, смягчении последствий изменения климата, роста растений и здоровья и устойчивости растений к биотическим и абиотическим стрессам. Микроорганизмы взаимодействуют с растениями как непосредственно через контакт стенки стенки растения, так и косвенно через химическую секрецию и сигнализацию 1 , 2 , 3 . В качестве сидячих организмов растения разработали прямые и косвенные механизмы противодействия инфекции патогенами. Прямые защитные средства включают структурную защиту и экспрессию защитных белков, тогда как косвенная защита включает в себя вторичное производство метаболитов растений и привлечение организмов, антагонистических к вторгающимся патогенам 4 , 5 . Вырожденные корневым экссудатом, выделениями, слизи, мусигелем и лизатами изменяют физико-химические свойства ризосферы для привлечения или отталкиванияМикробов к их хозяевам 6 . Химический состав секреции корней является видоспецифичным, тем самым выступая в качестве селективного фильтра, который позволяет некоторым микроорганизмам, способным распознавать такие соединения, процветать в ризосфере 6 . Таким образом, совместимые микробные виды могут стимулироваться для активации и усиления их ассоциаций либо в пользу, либо в ущерб хозяину растения 1 . Понимание взаимодействия растений и микробов в ризосфере является ключевым фактором повышения производительности растений и функционирования экосистем, поскольку большинство микробных и химических воздействий происходит в корневой структуре и почвенно-воздушном интерфейсе 2 , 6 , 7 , 8 . Тем не менее, изучение взаимодействия подземных растений и микробов и ответных реакций было проблемой из-за его интригующей<html> Сложный и динамичный характер и отсутствие подходящих экспериментальных моделей с естественной структурой корней и морфологией растений в условиях жестко контролируемого роста. В качестве одного из наиболее интенсивно изучали фитопатогенов, Agrobacterium заражает широкий ассортимент растений с сельскохозяйственной и садоводческой значение, в том числе вишни, яблони, груши, виноград и розы 9. Agrobacterium - важный модельный организм для понимания взаимодействия растений с патогенами и является мощным инструментом в трансформации растений и инженерии растений 10 , 11 , 12 , 13 , 14 . Молекулярное растение-взаимодействие Agrobacterium хорошо изучено в течение нескольких десятилетий, а современное понимание патогенности Agrobacterium обширно 9 ,F &quot;&gt; 11 , 15 , 16. Патогенность Agrobacterium в значительной степени объясняется его развитыми возможностями восприятия сигналов, полученных из растений, что приводит к тонкой модуляции его программы вирулентности и связи между клетками, так называемому восприятию кворума 17 . Программа вирулентности Agrobacterium регулируется несколькими сигналами, доступными в ризосфере, и включает в себя два набора 2-компонентных систем, систему ChvG / I и систему VirA / G. Кислотные условия в ризосфере активируют транскрипцию chvG / I , virA / G , И несколько других генов, участвующих в патогенезе Agrobacterium , включая virE0 , virE1 , virH1 , virH2 и гены системы секреции типа VI (T6SS) 18. Фенольные соединения растительного происхождения, включая ацетозиригон (4&#39;-гидрокси-3 &#39;, 5 &#39;-диметоксиацетофенон), активировать VIrA / G 2-компонентная система через механизмы сигнализации фосфорилирования 19 . Затем VirA / G активирует весь регулятор vir , что приводит к переносу и интеграции бактериального фрагмента ДНК размером 20 кБ, называемого передаточной ДНК (Т-ДНК) из его индуцирующей опухоль (Ti) плазмиды в ядро ​​растения 16 . Т-ДНК несет гены, ответственные за синтез растительных гормонов индол-3-уксусной кислоты (IAA) ( iaaM и iaaH ) и цитокинина ( ipt ), и один раз экспрессируется в растительных клетках, образуется большое количество этих фитогормонов. Это приводит к аномальной пролиферации тканей и развитию опухоли растений, известной как болезнь коронального желчного пузыря, что является хронической и нерегулярной проблемой для растений 9 , 11 , 20 . IAA также действует совместно с салициловой кислотой и гамма-аминомасляной кислотой, чтобы подавить вирулентность Agrobacterium или уменьшить Agrobacteriu<html> М кворум (QS) 17 , 21 , 22 . Чтобы противостоять этой репрессии, Т-ДНК также несет гены для биосинтеза опиона, который активирует чувствительность кворума Agrobacterium, чтобы способствовать патогенности Agrobacterium, а также служит источником питательных веществ для патогена 22 , 23 . Несмотря на полное глубокое понимание взаимодействия Agrobacterium- plant и результирующей передачи Т-ДНК в хозяин растения, сложные сигнальные события на начальной стадии взаимодействия менее понятны. Это частично связано с ограничениями обычных подходов к исследованию сигнализации Agrobacterium- plant. Культуры суспензии клеток растений и искусственное рандование, специфичное для конкретного участка, обычно используются для изучения молекулярных взаимодействий с микроорганизмами 24 ,Ef &quot;&gt; 26 , 27. Однако клеточные суспензии не имеют типичной морфологии растений, в частности, суспензионные клетки растений не имеют корневых структур и корневых экссудатов, которые очень важны для активации микробного хемотаксиса и вирулентности 28 , 29. Содержание морфологии растений И корневая структура была устранена искусственно ранившимися растениями, что облегчает сайт-специфическую инфекцию, что приводит к обнаружению индуцированных генов, связанных с защитой растений, в непосредственно инфицированной растительной ткани 30 , 31. Однако искусственное ранение значительно отличается от патогенной инфекции в природе , В частности, поскольку ранение приводит к накоплению жасмоновой кислоты (JA), которое системно препятствует передаче сигналов естественного растения и защите 26. Кроме того, синтетические химикаты обычно используются для искусственного стимулирования реакции хозяина растенийИли вирулентности патогена. Хотя возможно добавление таких химических соединений, отражающих концентрацию в плазме, такое добавление не учитывает диффузию корневых экссудатов постепенно в окружающую ризосферу, которая генерирует хемотаксический градиент, определяемый микробами 28 , 32 . Учитывая ограничения обычных подходов к изучению взаимодействий растений и микробов, точность и глубина полученных данных могут быть затруднены и ограничены, а знания, полученные из обычных подходов, могут не переводить непосредственно в planta . Многие аспекты сигнальной передачи растений - Agrobacterium еще не полностью поняты, особенно на ранней стадии взаимодействия, когда симптомы болезни еще не развиты. Чтобы изменить ограничения обычных подходов, эта работа представляет собой недорогую, жестко контролируемую и гибкую гидропонику cКоторая позволяет исследователям глубже проникнуть в сложные сигнальные и ответные пути на начальном этапе взаимодействия молекулярных растений с микробами. Гидропоника широко используется для изучения питательных веществ растений, корневых экссудатов, условий роста и воздействия металлической токсичности на растения 33 , 34 . Существует несколько преимуществ гидропонных моделей, в том числе небольшие пространственные требования, доступность различных растительных тканей, жесткий контроль над питательными / экологическими условиями и борьба с вредителями / болезнями. Гидропонические системы также менее ограничивают рост растений по сравнению с методами агара / фитогара, которые обычно ограничивают рост через 2-3 недели. Важно отметить, что содержание цельнозерновых структур способствует естественной корневой секреции, необходимой для микробного хемотаксиса и индукции вирулентности 8 , 29 . Система descriПостель здесь проще и менее трудоемко, чем альтернативы 33 , 34 . Он использует меньше деталей и не требует каких-либо инструментов, кроме стандартных ножниц. Он использует металлическую сетку (в отличие от нейлона 33 ) в качестве сильной поддержки роста растений и простой метод аэрации в стерильных условиях путем встряхивания для поддержки роста микроорганизмов. Кроме того, система может использовать металлическую сетку различных размеров для поддержки роста растений, в которой размещаются разнообразные виды растений, не ограничивая ширину их корней. В представленной здесь системе гидропонной кокультивации растения выращивают в стерильной гидропонной системе, где корни растений выделяют органические соединения, поддерживающие рост инокулированных бактерий. В этой системе кокультивации никакие искусственные химические вещества, такие как растительные гормоны, защитный элиситор или вызывающие вирулентность химические вещества, не дополняются, что отражает естественную клетку-сигнальный гомеостаз во время взаимодействия растений с микробами. С помощью этой гидропонной системы кокультивации можно было одновременно определить экспрессию гена в корневой ткани Arabidopsis thaliana Col-0 при инфицировании Agrobacterium , а также активацию генов Agrobacterium при кокультивации с Arabidopsis . Кроме того, было продемонстрировано, что эта система подходит для изучения присоединения Agrobacterium к корням растений, а также к профилю секреторного корня растения, при кокуляции (инфекции) Agrobacterium ( рис. 1 ). <img alt="Рисунок 1" class="xfigimg" src="/files/ftp_upload/55955/55955fig1.jpg" /> Рисунок 1: Обзор системы гидропонной кокультивации с анализом проб. Растения выращивают поверх сетки (побеги над сеткой), причем корни погружаются в гидропонную среду, которая затем инокулируется бактериями fИли сокультура. Затем растительные ткани и бактерии разделяют для одновременных экстракций и анализов. Эта цифра была изменена из ссылки 35 .

<table border="0" cellpadding="0" cellspacing="0" width="663">
	<tbody>
		<tr height="42">
			<td height="42" style="height:42px;width:215px;">plant seeds (Arabidopsis thaliana Col-0)</td>
			<td style="width:163px;">Arabidopsis Biological Resource Centre</td>
			<td style="width:119px;">CS7000</td>
			<td style="width:167px;">https://abrc.osu.edu/order-stocks</td>
		</tr>
		<tr height="42">
			<td height="42" style="height:42px;width:215px;">bacteria (Agrobacterium tumefaciens C58)</td>
			<td style="width:163px;">University of Washington</td>
			<td style="width:119px;">N/A</td>
			<td style="width:167px;"></td>
		</tr>
		<tr height="42">
			<td height="42" style="height:42px;width:215px;">labeled bacteria</td>
			<td style="width:163px;">in-house</td>
			<td style="width:119px;"></td>
			<td style="width:167px;">optional, depends on downstream analyses</td>
		</tr>
		<tr height="21">
			<td height="21" style="height:21px;width:215px;">vortex</td>
			<td style="width:163px;">(various)</td>
			<td style="width:119px;"></td>
			<td style="width:167px;"></td>
		</tr>
		<tr height="21">
			<td height="21" style="height:21px;width:215px;">microcentrifuge tubes</td>
			<td style="width:163px;">(various)</td>
			<td style="width:119px;"></td>
			<td style="width:167px;"></td>
		</tr>
		<tr height="21">
			<td height="21" style="height:21px;width:215px;">microcentrifuge</td>
			<td style="width:163px;">(various)</td>
			<td style="width:119px;"></td>
			<td style="width:167px;"></td>
		</tr>
		<tr height="21">
			<td height="21" style="height:21px;width:215px;">5% sodium hypochlorite</td>
			<td style="width:163px;">(various)</td>
			<td style="width:119px;"></td>
			<td style="width:167px;"></td>
		</tr>
		<tr height="21">
			<td height="21" style="height:21px;width:215px;">double distilled water</td>
			<td style="width:163px;">(various)</td>
			<td style="width:119px;"></td>
			<td style="width:167px;"></td>
		</tr>
		<tr height="21">
			<td height="21" style="height:21px;width:215px;">autoclave</td>
			<td style="width:163px;">(various)</td>
			<td style="width:119px;"></td>
			<td style="width:167px;"></td>
		</tr>
		<tr height="21">
			<td height="21" style="height:21px;width:215px;">micropipette&#160;</td>
			<td style="width:163px;">(various)</td>
			<td style="width:119px;"></td>
			<td style="width:167px;"></td>
		</tr>
		<tr height="21">
			<td height="21" style="height:21px;width:215px;">70 % ethanol</td>
			<td style="width:163px;">(various)</td>
			<td style="width:119px;"></td>
			<td style="width:167px;"></td>
		</tr>
		<tr height="42">
			<td height="42" style="height:42px;width:215px;">Murashige and Skoog (MS) basal salts</td>
			<td style="width:163px;">Sigma-Aldrich</td>
			<td style="width:119px;">M5524</td>
			<td style="width:167px;"></td>
		</tr>
		<tr height="21">
			<td height="21" style="height:21px;width:215px;">sucrose</td>
			<td style="width:163px;">(various)</td>
			<td style="width:119px;"></td>
			<td style="width:167px;"></td>
		</tr>
		<tr height="21">
			<td height="21" style="height:21px;width:215px;">MES</td>
			<td style="width:163px;">(various)</td>
			<td style="width:119px;"></td>
			<td style="width:167px;"></td>
		</tr>
		<tr height="21">
			<td height="21" style="height:21px;width:215px;">B5 vitamin mix</td>
			<td style="width:163px;">Sigma-Aldrich</td>
			<td>G1019</td>
			<td style="width:167px;"></td>
		</tr>
		<tr height="21">
			<td height="21" style="height:21px;width:215px;">phytoagar</td>
			<td style="width:163px;">(various)</td>
			<td style="width:119px;"></td>
			<td style="width:167px;"></td>
		</tr>
		<tr height="21">
			<td height="21" style="height:21px;width:215px;">deep Petri dishes</td>
			<td style="width:163px;">(various)</td>
			<td style="width:119px;"></td>
			<td style="width:167px;"></td>
		</tr>
		<tr height="42">
			<td height="42" style="height:42px;width:215px;">stainless steel mesh</td>
			<td style="width:163px;">Ferrier Wire Goods Company Ltd</td>
			<td style="width:119px;">N/A</td>
			<td style="width:167px;">grade: 304; mesh count: 40 &#215; 40; wire DIA: 0.01</td>
		</tr>
		<tr height="21">
			<td height="21" style="height:21px;width:215px;">micropore tape, 1 inch</td>
			<td style="width:163px;">3M</td>
			<td style="width:119px;">1530-1</td>
			<td style="width:167px;"></td>
		</tr>
		<tr height="21">
			<td height="21" style="height:21px;width:215px;">diurnal growth chamber</td>
			<td style="width:163px;">(various)</td>
			<td style="width:119px;"></td>
			<td style="width:167px;"></td>
		</tr>
		<tr height="84">
			<td height="84" style="height:84px;width:215px;">cylindrical glass tanks, 100 &#215; 80 mm&#160;</td>
			<td style="width:163px;">Pyrex</td>
			<td style="width:119px;">3250</td>
			<td style="width:167px;">other sizes can be used, in which case liquid content may need adjustment</td>
		</tr>
		<tr height="21">
			<td height="21" style="height:21px;width:215px;">flow hood</td>
			<td style="width:163px;">(various)</td>
			<td style="width:119px;"></td>
			<td style="width:167px;"></td>
		</tr>
		<tr height="21">
			<td height="21" style="height:21px;width:215px;">forcepts</td>
			<td style="width:163px;">(various)</td>
			<td style="width:119px;"></td>
			<td style="width:167px;"></td>
		</tr>
		<tr height="21">
			<td height="21" style="height:21px;width:215px;">yeast extract</td>
			<td style="width:163px;">(various)</td>
			<td style="width:119px;"></td>
			<td style="width:167px;"></td>
		</tr>
		<tr height="21">
			<td height="21" style="height:21px;width:215px;">tryptone</td>
			<td style="width:163px;">(various)</td>
			<td style="width:119px;"></td>
			<td style="width:167px;"></td>
		</tr>
		<tr height="25">
			<td height="25" style="height:25px;width:215px;">MgSO4</td>
			<td style="width:163px;">(various)</td>
			<td style="width:119px;"></td>
			<td style="width:167px;"></td>
		</tr>
		<tr height="21">
			<td height="21" style="height:21px;width:215px;">shaking incubator</td>
			<td style="width:163px;">(various)</td>
			<td style="width:119px;"></td>
			<td style="width:167px;"></td>
		</tr>
		<tr height="21">
			<td height="21" style="height:21px;width:215px;">spectrophotometer</td>
			<td style="width:163px;">(various)</td>
			<td style="width:119px;"></td>
			<td style="width:167px;"></td>
		</tr>
		<tr height="21">
			<td height="21" style="height:21px;width:215px;">NaCl</td>
			<td style="width:163px;">(various)</td>
			<td style="width:119px;"></td>
			<td style="width:167px;"></td>
		</tr>
		<tr height="21">
			<td height="21" style="height:21px;width:215px;">shaker</td>
			<td style="width:163px;">(various)</td>
			<td style="width:119px;"></td>
			<td style="width:167px;"></td>
		</tr>
		<tr height="42">
			<td height="42" style="height:42px;width:215px;">scissors</td>
			<td style="width:163px;">(various)</td>
			<td style="width:119px;"></td>
			<td style="width:167px;">optional, depends on downstream analyses</td>
		</tr>
		<tr height="42">
			<td height="42" style="height:42px;width:215px;">fluorescence microscope</td>
			<td style="width:163px;">(various)</td>
			<td style="width:119px;"></td>
			<td style="width:167px;">optional, depends on downstream analyses</td>
		</tr>
		<tr height="42">
			<td height="42" style="height:42px;width:215px;">microscope slides and cover slips</td>
			<td style="width:163px;">(various)</td>
			<td style="width:119px;"></td>
			<td style="width:167px;">optional, depends on downstream analyses</td>
		</tr>
		<tr height="42">
			<td height="42" style="height:42px;width:215px;">nail polish</td>
			<td style="width:163px;">(various)</td>
			<td style="width:119px;"></td>
			<td style="width:167px;">optional, depends on downstream analyses</td>
		</tr>
		<tr height="42">
			<td height="42" style="height:42px;width:215px;">Bacterial RNA extraction kit</td>
			<td style="width:163px;">(various)</td>
			<td style="width:119px;"></td>
			<td style="width:167px;">optional, depends on downstream analyses</td>
		</tr>
		<tr height="42">
			<td height="42" style="height:42px;width:215px;">plant RNA extraction kit (RNeasy Plant Mini Kit)</td>
			<td style="width:163px;">Qiagen</td>
			<td>74903 or 74904</td>
			<td style="width:167px;">optional, depends on downstream analyses</td>
		</tr>
		<tr height="42">
			<td height="42" style="height:42px;width:215px;">material and equipment for RT-qPCR</td>
			<td style="width:163px;">(various)</td>
			<td style="width:119px;"></td>
			<td style="width:167px;">optional, depends on downstream analyses</td>
		</tr>
		<tr height="42">
			<td height="42" style="height:42px;width:215px;">material and equipment for microarray analysis</td>
			<td style="width:163px;">(various)</td>
			<td style="width:119px;"></td>
			<td style="width:167px;">optional, depends on downstream analyses</td>
		</tr>
		<tr height="42">
			<td height="42" style="height:42px;width:215px;">liquid nitrogen</td>
			<td style="width:163px;">(various)</td>
			<td style="width:119px;"></td>
			<td style="width:167px;">optional, depends on downstream analyses</td>
		</tr>
		<tr height="42">
			<td height="42" style="height:42px;width:215px;">mortar and pestle</td>
			<td style="width:163px;">(various)</td>
			<td style="width:119px;"></td>
			<td style="width:167px;">optional, depends on downstream analyses</td>
		</tr>
		<tr height="42">
			<td height="42" style="height:42px;width:215px;">0.2 &#181;m pore filter</td>
			<td style="width:163px;">(various)</td>
			<td style="width:119px;"></td>
			<td style="width:167px;">optional, depends on downstream analyses</td>
		</tr>
		<tr height="42">
			<td height="42" style="height:42px;width:215px;">50 mL conical tubes</td>
			<td style="width:163px;">(various)</td>
			<td style="width:119px;"></td>
			<td style="width:167px;">optional, depends on downstream analyses</td>
		</tr>
		<tr height="42">
			<td height="42" style="height:42px;width:215px;">freeze dryer</td>
			<td style="width:163px;">(various)</td>
			<td style="width:119px;"></td>
			<td style="width:167px;">optional, depends on downstream analyses</td>
		</tr>
		<tr height="42">
			<td height="42" style="height:42px;width:215px;">sealable test tubes</td>
			<td style="width:163px;">(various)</td>
			<td style="width:119px;"></td>
			<td style="width:167px;">optional, depends on downstream analyses</td>
		</tr>
		<tr height="42">
			<td height="42" style="height:42px;width:215px;">ethyl acetate</td>
			<td style="width:163px;">(various)</td>
			<td style="width:119px;"></td>
			<td style="width:167px;">optional, depends on downstream analyses</td>
		</tr>
		<tr height="42">
			<td height="42" style="height:42px;width:215px;">nitrogen gas</td>
			<td style="width:163px;">(various)</td>
			<td style="width:119px;"></td>
			<td style="width:167px;">optional, depends on downstream analyses</td>
		</tr>
		<tr height="42">
			<td height="42" style="height:42px;width:215px;">material and equipment for HPLC</td>
			<td style="width:163px;">(various)</td>
			<td style="width:119px;"></td>
			<td style="width:167px;">optional, depends on downstream analyses</td>
		</tr>
		<tr height="42">
			<td height="42" style="height:42px;width:215px;">material and equipment for ESI-TOF-MS</td>
			<td style="width:163px;">(various)</td>
			<td style="width:119px;"></td>
			<td style="width:167px;">optional, depends on downstream analyses</td>
		</tr>
	</tbody>
</table>

a hydroponic co-cultivation system for simultaneous and systematic analysis of plant/microbe molecular interactions and signaling

Экспериментальная разработка, имитирующая естественные взаимодействия с растениями-микробами, очень важна для определения сложных процессов передачи сигналов микроорганизмов растений. Arabidopsis thaliana - Agrobacterium tumefaciens Обеспечивает отличную модельную систему для изучения бактериального патогенеза и взаимодействия растений. Предыдущие исследования взаимодействия растений -Агробактерий в значительной степени опирались на культуры суспензий растительных клеток, искусственное ранение растений или искусственную индукцию микробных факторов вирулентности или защиту растений синтетическими химическими веществами. Однако эти методы отличаются от естественной сигнализации в planta , где растения и микробы распознают и реагируют в пространственных и временных манерах. В этой работе представлена ​​гидропонная система кокультивации, в которой интактные растения поддерживаются сетками из металлической сетки и кокультивируются Agrobacterium . В этой системе кокультивации нет синтетического фитогормона или химического вещества, которое индуцирует micrБожественная вирулентность или защита растений дополняются. Гидропонная система кокультивации очень похожа на естественные взаимодействия растений и микробов и сигнализирует гомеостаз в пласте . Корни растений можно отделить от среды, содержащей Agrobacterium , и сигналы и реакции как хозяев растений, так и взаимодействующих микробов можно исследовать одновременно и систематически. В любой момент времени / интервал растительные ткани или бактерии могут собираться отдельно для различных анализов «омикшей», демонстрируя силу и эффективность этой системы. Гидропонная система кокультивации может быть легко адаптирована для изучения: 1) обратная сигнализация различных систем растений-микробов, 2) сигнализация между хозяином растения и несколькими видами микроорганизмов ( т.е. микробными консорциумами или микробиомами), 3) как связаны питательные вещества и химические вещества В сигнале растений-микробов и 4) как микробы взаимодействуют с хозяевами растений и способствуют устойчивости растений к биотическому oR абиотические стрессы.

Рост в гидропонной системе совместного культивирования Кривая роста A. tumefaciens C58 продемонстрировала значительную лаг-фазу в первые 16 ч кокультивации, а затем очень стабильный рост при совместном культивировании с A. thaliana Col-0 до ...

Watch this Scientific Journal Video about A Hydroponic Co-cultivation System for Simultaneous and Systematic Analysis of Plant/Microbe Molecular Interactions and Signaling at JoVE.com

A Hydroponic Co-cultivation System for Simultaneous and Systematic Analysis of Plant/Microbe Molecular Interactions and Signaling

Описанная гидропонная система кокультивации поддерживает интактные растения с металлическими сетчатыми экранами и кокультивирует их бактериями. Растительные ткани, бактерии и секретируемые молекулы затем могут быть отдельно собраны для последующих анализов, одновременно позволяя исследовать молекулярные реакции как хозяев растений, так и взаимодействующих микробов или микробиомов.

Система гидропонной совместной культивации для одновременного и систематического анализа молекулярных взаимодействий растений и микробов и сигнализации

An experimental design mimicking natural plant-microbe interactions is very important to delineate the complex plant-microbe signaling processes. ...

Research

Education

JoVE Journal

JoVE Core

Biology

Plant Biology

Plant Reproduction

SCIENTISTS IN ACTION

A Neuronal and Astrocyte Co-Culture Assay for High Content Analysis of Neurotoxicity

Нейронов и астроцитов сотрудничеству культуры Пробирной высоких Анализ содержания Нейротоксичность

High Content Analysis (HCA) assays combine cells and detection reagents with automated imaging and powerful image analysis algorithms, allowing ...

Virus-induced Gene Silencing (VIGS) in Nicotiana benthamiana and Tomato

Virus-induced Gene Silencing VIGS in Nicotiana benthamiana and Tomato

Вирус-индуцированные генов (VIGS) в Nicotiana benthamiana И томатный

RNA interference (RNAi) is a highly specific gene-silencing phenomenon triggered by dsRNA1. This silencing mechanism uses two major classes of RNA ...

Split-Ubiquitin Based Membrane Yeast Two-Hybrid (MYTH) System: A Powerful Tool For Identifying Protein-Protein Interactions

Split-Ubiquitin Based Membrane Yeast Two-Hybrid MYTH System: A Powerful Tool For Identifying Protein-Protein Interactions

Сплит-Убиквитин основе дрожжей Мембрана два-Hybrid (МИФ) Система: Мощный инструмент для выявления белок-белковых взаимодействий

The fundamental biological and clinical importance of integral membrane proteins prompted the development of a yeast-based system for the high-throughput ...

A System for ex vivo Culturing of Embryonic Pancreas

A System for ex vivo Culturing of Embryonic Pancreas

Система<em&gt; Бывших естественных условиях</em&gt; Культивирования эмбриональных поджелудочной железы

The pancreas controls vital functions of our body,  including the production of digestive enzymes and regulation of blood sugar  levels1. Although in the ...

A Chemical Screening Procedure for Glucocorticoid Signaling with a Zebrafish Larva Luciferase Reporter System

Процедура Скрининг Обработка глюкокортикоидных сигнализации с корреспондентом системе данио рерио Личинка люциферазы

Glucocorticoid stress hormones and their artificial derivatives are widely used drugs to treat inflammation, but long-term treatment with glucocorticoids ...

Mechanical Stimulation-induced Calcium Wave Propagation in Cell Monolayers: The Example of Bovine Corneal Endothelial Cells

Механическое раздражение индуцированных кальция Распространение волн в монослоев клеток: Пример бычьего эндотелиальных клеток роговицы

Intercellular communication is essential for the coordination of physiological processes between cells in a variety of organs and tissues, including the ...

Metabolic Labeling and Membrane Fractionation for Comparative Proteomic Analysis of Arabidopsis thaliana Suspension Cell Cultures

Metabolic Labeling and Membrane Fractionation for Comparative Proteomic Analysis of Arabidopsis thaliana Suspension Cell Cultures

Метаболический Маркировка и мембраны фракционирования для сравнительного Proteomic Анализ<em&gt; Арабидопсис</em&gt; Подвеска Клеточные культуры

Plasma membrane microdomains are features based on the physical properties of the lipid and sterol environment and have particular roles in signaling ...

High-throughput CRISPR Vector Construction and Characterization of DNA Modifications by Generation of Tomato Hairy Roots

Высокая пропускная способность CRISPR Конструирование вектора и характеристика ДНК Модификации генерацией Томатный волосистых корней

Targeted DNA mutations generated by vectors with clustered regularly interspaced short palindromic repeats (CRISPR)/Cas9 technology have proven useful for ...

Laboratory Protocol for Genetic Gut Content Analyses of Aquatic Macroinvertebrates Using Group-specific rDNA Primers

Лаборатория протокол для генетических кишки содержание анализа водных макробеспозвоночных использование конкретных групп рДНК грунтовки

Analyzing food webs is essential for a better understanding of ecosystems. For example, food web interactions can undergo severe changes caused by the ...

Molecular Analysis of Endothelial-mesenchymal Transition Induced by Transforming Growth Factor-&#946; Signaling

Molecular Analysis of Endothelial-mesenchymal Transition Induced by Transforming Growth Factor-ÃƒÆ’Ã…Â½Ãƒâ€šÃ‚Â² Signaling

Молекулярный анализ эндотелиальной мезенхимальных перехода, вызванных преобразования сигналов фактор роста β

Phenotypic plasticity of endothelial cells underlies cardiovascular system development, cardiovascular diseases, and various conditions associated with ...