Name: application of granger causality analysis of the directed functional connection in alzheimer's disease and mild cognitive impairment
Uploaded: 2017-08-07T15:00:00
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Les auteurs remercient Gongjun JI pour soutien logiciel. Cette recherche a été partiellement financée par la Fondation nationale des sciences naturelles de Chine (n ° 81201156, 81271517) ; le Zhejiang Provincial Fondation sciences naturelles de Chine (no. LY16H180007, LY13H180016, 2013C33G1360236) et la Fondation de la Science de la Commission de la santé de la Province du Zhejiang (n ° 2013RCA001, 201522257).

This study was approved by the Ethics Committee of Zhejiang Provincial People&#39;s Hospital. Every enrolled subject signed a written informed consent.
1. Sample Classification and Screening
<ol>
	<li>Diagnose and divide 116 patients into AD and MCI groups. 
	NOTE: Use the 2011 National Institute of Neurological and Communicative Disorders and Stroke and the Alzheimer&#39;s Disease and Related Disorders Association (NINCDS-ADRDA) diagnostic criteria and the Mini-Mental State Examination...

<ol>
	<li>Delbeuck, X., Van der Linden, M., Collette, F. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/query.fcgi?db=PubMed&cmd=Search&doptcmdl=Citation&defaultField=Title+Word&term=Alzheimer's+disease+as+a+disconnection+syndrome?.">Alzheimer's disease as a disconnection syndrome?.</a> Neuropsychol Rev. 13 (2), 79-92 (2003).</li><li>Wang, K., et al. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/query.fcgi?db=PubMed&cmd=Search&doptcmdl=Citation&defaultField=Title+Word&term=Altered+functional+connectivity+in+early+Alzheimer's+disease:+a+resting-state+fMRI+study.">Altered functional connectivity in early Alzheimer's disease: a resting-state fMRI study.</a> Hum Brain Mapp. 28 (10), 967-978 (2007).</li><li>Zhong, Y., et al. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/query.fcgi?db=PubMed&cmd=Search&doptcmdl=Citation&defaultField=Title+Word&term=Altered+effective+connectivity+patterns+of+the+default+mode+network+in+Alzheimer's+disease:+an+fMRI+study.">Altered effective connectivity patterns of the default mode network in Alzheimer's disease: an fMRI study.</a> Neurosci Lett. 578, 171-175 (2014).</li><li>Gusnard, D. 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Y., et al. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/query.fcgi?db=PubMed&cmd=Search&doptcmdl=Citation&defaultField=Title+Word&term=Detection+of+PCC+functional+connectivity+characteristics+in+resting-state+fMRI+in+mild+Alzheimer's+disease.">Detection of PCC functional connectivity characteristics in resting-state fMRI in mild Alzheimer's disease.</a> Behav Brain Res. 197 (1), 103-108 (2009).</li><li>Deshpande, G., Hu, X., Stilla, R., Sathian, K. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/query.fcgi?db=PubMed&cmd=Search&doptcmdl=Citation&defaultField=Title+Word&term=Effective+connectivity+during+haptic+perception:+a+study+using+Granger+causality+analysis+of+functional+magnetic+resonance+imaging+data.">Effective connectivity during haptic perception: a study using Granger causality analysis of functional magnetic resonance imaging data.</a> NeuroImage. 40 (4), 1807-1814 (2008).</li><li>Bressler, S. L., Seth, A. 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Ce rapport présente un processus permettant de comparer la réalisé connectivité fonctionnelle de la PCC depuis tout le cerveau et le cerveau entier à la PCC entre AD, MCI et des groupes témoins. Par ailleurs, une étape clé dans ce processus est la classification et la sélection de l’échantillon avant l’expérience. Ainsi, la classification et critères de sélection sont cruciales car la précision des résultats peut être affectée si elles sont erronées. Comme indiqué dans le protocole, nous avons util...

AD est une maladie dégénérative du système nerveux central qui peut être diagnostiqué à l’aide de neuro-imagerie, électrophysiologie et histopathologie1. La DMN liés à la mémoire est un système vital l’interaction de régions du cerveau associées à AD, et sa fonction anormale est caractéristique de l’AD2,3. Le PCC est une région importante du réseau par défaut traditionnels dans l’état de repos et joue un rôle essentiel dans la mémoire épisodique, l’attention spatiale, auto-évaluation et autres fonctions cognitives4,5,6,7. En outre, il pourrait être un marqueur d’imagerie pour surveiller la progression de l’AD. À l’aide de GCA, Liao et al trouvé que le PCC est une région de plusieurs cytoarchitectonics avec plusieurs connexions et joue un rôle important dans la structure cérébrale fonctionnelle8. Zhong et coll. ont signalé que le PCC était un centre de convergence qui a reçu les interactions de la plupart des autres régions au sein de la DMN3. En outre, Miao et coll. ont démontré que dans les régions de moyeu DMN, le PCC a la plus grande relation effet causal avec les autres nœuds9. Ensemble, tous ce témoignage indique que la connexion dirigée de la SCP est précieuse dans la recherche de l’AD et le PCC doit encore être étudié approfondie comme une région vitale de la DMN.
Les études précédentes étaient limités à la connectivité entre le PCC et d’autres régions au sein de la DMN ; Cependant, l’évolution dirigée connectivité fonctionnelle entre les régions PCC et le cerveau à l’extérieur de la DMN, ainsi que leur influence sur les AD n’ont pas encore été explorées10. Notre étude examine encore cette connectivité fonctionnelle inexplorée dans témoins sains normaux, les patients avec MCI et les patients atteints de ma. En observant la connectivité dirigée entre le PCC et les régions de cerveau entier, nous avons cherché à élucider les changements fonctionnels dans le cerveau liés à la progression de l’AD et ainsi créer une nouvelle base objective pour évaluer la gravité de la maladie.
Connectivité fonctionnelle se réfère à une interaction interrégionale qui peut être représentée par les Fluctuations synchrones de basse fréquence (LFFs) dans le signal de l’IRMf niveau d’oxygène du sang dépendant (BOLD) cérébrale. Par conséquent, afin d’observer la connectivité fonctionnelle entre le PCC et d’autres régions du cerveau, nous avons analysé la connectivité fonctionnelle entre le PCC et le réseau de cerveau entier par IRMf avec GCA, le PCC comme la région d’intérêt (ROI). Cette technique dérive directement de la relation fondamentale de chaque nœud à l’aide de données obtenues de neuro-imagerie,11. Récemment, la GCA a été appliqué à l’électroencéphalogramme (EEG) et les études d’IRMf pour révéler les effets de causalité entre les régions de cerveau12. Toutes ces études indiquent que la technique de GCA pourrait être optimale pour la détection de la relation causale de chaque nœud dans le cerveau.

<table border="0" cellpadding="0" cellspacing="0" width="909">
	<tbody>
		<tr height="120">
			<td height="120" style="height:120px;width:192px;">116 patients</td>
			<td style="width:169px;">Zhejiang Provincial People&#8217;s hospital</td>
			<td style="width:207px;">-</td>
			<td style="width:341px;">This study was approved by the ethics committee of Zhejiang Provincial People&#8217;s hospital. Every enrolled subject signed a written informed consent form.</td>
		</tr>
		<tr height="153">
			<td height="153" style="height:153px;width:192px;">Siemens Trio 3.0 T MRI scanner</td>
			<td style="width:169px;">Siemens, Erlangen, Germany</td>
			<td style="width:207px;">20571</td>
			<td style="width:341px;">Equipped with AudioComfort that reduces acoustic noise up to 90%; Provides high performance at a low noise level; Ultra light-weight coil; Unique MRI sequence design; Supports up to 400 pounds without restrictions.</td>
		</tr>
		<tr height="201">
			<td height="201" style="height:201px;width:192px;">RESTplus</td>
			<td style="width:169px;">Hangzhou Normal University,Hangzhou,Zhejiang,China</td>
			<td style="width:207px;">20160122</td>
			<td style="width:341px;">RESTplus evolved from REST (Resting-State fMRI Data Analysis Toolkit), a convenient toolkit to calculate Functional Connectivity (FC), Regional Homogeneity(ReHo), Amplitude of Low-Frequency Fluctuation (ALFF), Fractional ALFF (fALFF), Gragner causality, degree centrality, voxel-mirrored homotopic connectivity (VMHC) and perform statistical analysis.</td>
		</tr>
		<tr height="220">
			<td height="220" style="height:220px;width:192px;">DPARSF</td>
			<td style="width:169px;">Hangzhou Normal University,Hangzhou,Zhejiang,China</td>
			<td style="width:207px;">130615</td>
			<td style="width:341px;">Data Processing Assistant for Resting-State fMRI (DPARSF) is a convenient plug-in software within DPABI, which is based on SPM. You just need to arrange your DICOM files, and click a few buttons to set parameters, DPARSF will then give all the preprocessed data, functional connectivity, ReHo, ALFF/fALFF, degree centrality, voxel-mirrored homotopic connectivity (VMHC) results.</td>
		</tr>
		<tr height="111">
			<td height="111" style="height:111px;width:192px;">SPSS</td>
			<td style="width:169px;">SPSS Inc., Chicago, IL, USA</td>
			<td style="width:207px;">-</td>
			<td style="width:341px;">SPSS offers detailed analysis options to look deeper into your data and spot trends that you might not have noticed.</td>
		</tr>
	</tbody>
</table>

application of granger causality analysis of the directed functional connection in alzheimer's disease and mild cognitive impairment

La connectivité fonctionnelle ayant une déficience dans le réseau de Mode par défaut (DMN) peut-être être impliquée dans la progression de la maladie d’Alzheimer (ma). Le Cortex cingulaire postérieur (PCC) est un marqueur potentiel d’imagerie pour surveiller la progression de la ma. Des études antérieures ne sont pas axé sur la connectivité fonctionnelle entre le PCC et les nœuds dans les régions à l’extérieur de la DMN, mais notre étude est un effort pour explorer ces connexions fonctionnelles négligées. Pour la collecte des données, nous avons utilisé l’imagerie de résonance magnétique fonctionnelle (IRMf) et analyse de causalité de Granger (GCA). IRMf fournit une méthode non invasive pour étudier les interactions dynamiques entre les différentes régions du cerveau. GCA est un test d’hypothèse statistique pour déterminer si la série unique est utile pour la prévision à l’autre. En termes simples, il est jugé en comparant la « connu de toutes les informations sur le dernier moment, la distribution de la probabilité de X en ce moment » et le « connu de toutes les informations sur le dernier moment sauf Y, la distribution de la probabilité de X en ce moment », afin de déterminer s’il existe une relation causale entre Y et X. Cette définition s’inspire de la source d’information complète et la séquence chronologique stationnaire. La principale étape de cette analyse consiste à utiliser des X et Y pour établir l’équation de régression et de dessiner un lien de causalité hypothétique test. Depuis GCA peut mesurer des effets de causalité, nous avons utilisé pour enquêter sur l’anisotropie de la connectivité fonctionnelle et d’explorer la fonction de plaque tournante de la SCP. Ici, nous avons projeté 116 participants pour IRM et après prétraitement des données obtenues à partir de neuro-imagerie, nous avons utilisé la GCA pour dériver la relation causale de chaque nœud. Enfin, nous avons conclu que la connexion dirigée est significativement différente entre les groupes de déficience Cognitive légère (DCL) et AD, le PCC à tout le cerveau et le cerveau entier pour le PCC.

Demographic information
Table 1 presents the characteristics of the subjects. All the subjects had an education level of junior school or above. Age, gender, and education level were similar between the three groups (P &#62;0.05), while the MMSE scores were significantly different (p &#60;0.01).
Directed brain functional connectivity
<p...

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Application of Granger Causality Analysis of the Directed Functional Connection in Alzheimer's Disease and Mild Cognitive Impairment

Application de l’analyse de causalité de Granger de la connexion fonctionnelle dirigée dans la maladie d’Alzheimer et des troubles cognitifs légers

Se fondant sur l’état de repos imagerie fonctionnelle par résonance magnétique avec analyse de causalité de Granger, nous avons étudié les altérations dans la connectivité fonctionnelle dirigée entre le cortex cingulaire postérieur et le cerveau de patients atteints de la maladie d’Alzheimer (ma), patients souffrant de déficience Cognitive légère (DCL) et témoins sains.

Impaired functional connectivity in the Default Mode Network (DMN) may be involved in the progression of Alzheimer&#39;s Disease (AD). The Posterior ...

Research

JoVE Journal

Medicine

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Collecte de salive et de mesure du cortisol salivaire et l&#39;alpha-amylase dans Frail communautaires résidant personnes âgées par les aidants familiaux

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Lésion Explorer: Un Protocole de vidéo-guidée standardisé pour Volumetrics IRM dérivées exactes et fiables dans la maladie d&#39;Alzheimer et normale personnes âgées

Obtaining in vivo human brain tissue volumetrics from MRI is often complicated by various technical and biological issues. These challenges are ...

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3D quantitative<em&gt; In Silico</em&gt; Modélisation (q3DISM) de Cerebral bêta-amyloïde phagocytose dans les modèles rongeurs de la maladie d&#39;Alzheimer

Neuroinflammation is now recognized as a major etiological factor in neurodegenerative disease. Mononuclear phagocytes are innate immune cells responsible ...