Name: generation of escape variants of neutralizing influenza virus monoclonal antibodies
Uploaded: 2017-08-29T13:00:00
Duration: 7 min 55 s
Description: Watch this Scientific Journal Video about Generation of Escape Variants of Neutralizing Influenza Virus Monoclonal Antibodies at JoVE.com

Bu proje kısmen Ulusal Enstitüsü alerji ve enfeksiyon hastalıkları gelen federal fonları ile finanse edilmiştir, Ulusal Sağlık enstitüleri, bölümü sağlık ve insan Hizmetleri, CEIRS altında HHSN272201400008C (F.K.) sözleşme; NIH U19AI109946-01 (F.K.); ve P01AI097092-04S1 (P.E.L.).

<ol>
	<li>Shaw, M. L., Palese, P. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/query.fcgi?db=PubMed&cmd=Search&doptcmdl=Citation&defaultField=Title+Word&term=.">.</a> Orthomyxoviridae: the viruses and their replication. , (2013).</li><li>Nelson, M. I., Holmes, E. C. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/query.fcgi?db=PubMed&cmd=Search&doptcmdl=Citation&defaultField=Title+Word&term=The+evolution+of+epidemic+influenza.">The evolution of epidemic influenza.</a> Nat Rev Genet. 8 (3), 196-205 (2007).</li><li>Lauring, A. S., Andino, R. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/query.fcgi?db=PubMed&cmd=Search&doptcmdl=Citation&defaultField=Title+Word&term=Quasispecies+Theory+and+the+Behavior+of+RNA+Viruses.">Quasispecies Theory and the Behavior of RNA Viruses.</a> PLoS Pathog. 6 (7), e1001005 (2010).</li><li>Henry Dunand, C. J., Leon, P. E., et al. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/query.fcgi?db=PubMed&cmd=Search&doptcmdl=Citation&defaultField=Title+Word&term=Preexisting+human+antibodies+neutralize+recently+emerged+H7N9+influenza+strains.">Preexisting human antibodies neutralize recently emerged H7N9 influenza strains.</a> J Clin Invest. 125 (3), 1255-1268 (2015).</li><li>Dunand, C. J. H., Leon, P. E., et al. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/query.fcgi?db=PubMed&cmd=Search&doptcmdl=Citation&defaultField=Title+Word&term=Both+Neutralizing+and+Non-Neutralizing+Human+H7N9+Influenza+Vaccine-Induced+Monoclonal+Antibodies+Confer+Protection.">Both Neutralizing and Non-Neutralizing Human H7N9 Influenza Vaccine-Induced Monoclonal Antibodies Confer Protection.</a> Cell Host Microbe. 19 (6), 800-813 (2016).</li><li>Tan, G. S., Lee, P. S., et al. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/query.fcgi?db=PubMed&cmd=Search&doptcmdl=Citation&defaultField=Title+Word&term=Characterization+of+a+Broadly+Neutralizing+Monoclonal+Antibody+That+Targets+the+Fusion+Domain+of+Group+2+Influenza+A+Virus+Hemagglutinin.">Characterization of a Broadly Neutralizing Monoclonal Antibody That Targets the Fusion Domain of Group 2 Influenza A Virus Hemagglutinin.</a> J Virol. 88 (23), 13580-13592 (2014).</li><li>Tan, G. S., Leon, P. E., et al. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/query.fcgi?db=PubMed&cmd=Search&doptcmdl=Citation&defaultField=Title+Word&term=Broadly-Reactive+Neutralizing+and+Non-neutralizing+Antibodies+Directed+against+the+H7+Influenza+Virus+Hemagglutinin+Reveal+Divergent+Mechanisms+of+Protection.">Broadly-Reactive Neutralizing and Non-neutralizing Antibodies Directed against the H7 Influenza Virus Hemagglutinin Reveal Divergent Mechanisms of Protection.</a> PLoS Pathog. 12 (4), e1005578 (2016).</li><li>Smith, K., Garman, L., et al. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/query.fcgi?db=PubMed&cmd=Search&doptcmdl=Citation&defaultField=Title+Word&term=Rapid+generation+of+fully+human+monoclonal+antibodies+specific+to+a+vaccinating+antigen.">Rapid generation of fully human monoclonal antibodies specific to a vaccinating antigen.</a> Nat Protoc. 4 (3), 372-384 (2009).</li><li>Steel, J., Lowen, A. C., et al. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/query.fcgi?db=PubMed&cmd=Search&doptcmdl=Citation&defaultField=Title+Word&term=Influenza+virus+vaccine+based+on+the+conserved+hemagglutinin+stalk+domain.">Influenza virus vaccine based on the conserved hemagglutinin stalk domain.</a> mBio. 1 (1), (2010).</li><li>Krammer, F., Pica, N., Hai, R., Margine, I., Palese, P. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/query.fcgi?db=PubMed&cmd=Search&doptcmdl=Citation&defaultField=Title+Word&term=Chimeric+hemagglutinin+influenza+virus+vaccine+constructs+elicit+broadly+protective+stalk-specific+antibodies.">Chimeric hemagglutinin influenza virus vaccine constructs elicit broadly protective stalk-specific antibodies.</a> J Virol. 87 (12), 6542-6550 (2013).</li><li>Wang, T. T., Tan, G. S., et al. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/query.fcgi?db=PubMed&cmd=Search&doptcmdl=Citation&defaultField=Title+Word&term=Vaccination+with+a+synthetic+peptide+from+the+influenza+virus+hemagglutinin+provides+protection+against+distinct+viral+subtypes.">Vaccination with a synthetic peptide from the influenza virus hemagglutinin provides protection against distinct viral subtypes.</a> Proc Natl Acad Sci U S A. 107 (44), 18979-18984 (2010).</li><li>Impagliazzo, A., Milder, F., et al. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/query.fcgi?db=PubMed&cmd=Search&doptcmdl=Citation&defaultField=Title+Word&term=A+stable+trimeric+influenza+hemagglutinin+stem+as+a+broadly+protective+immunogen.">A stable trimeric influenza hemagglutinin stem as a broadly protective immunogen.</a> Science. 349 (6254), 1301-1306 (2015).</li><li>Krammer, F., Palese, P., Steel, J. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/query.fcgi?db=PubMed&cmd=Search&doptcmdl=Citation&defaultField=Title+Word&term=Advances+in+Universal+Influenza+Virus+Vaccine+Design+and+Antibody+Mediated+Therapies+Based+on+Conserved+Regions+of+the+Hemagglutinin.">Advances in Universal Influenza Virus Vaccine Design and Antibody Mediated Therapies Based on Conserved Regions of the Hemagglutinin.</a> Current Topics in Microbiology and Immunology. , (2014).</li><li>Wohlbold, T. J., Nachbagauer, R., Margine, I., Tan, G. S., Hirsh, A., Krammer, F. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/query.fcgi?db=PubMed&cmd=Search&doptcmdl=Citation&defaultField=Title+Word&term=Vaccination+with+soluble+headless+hemagglutinin+protects+mice+from+challenge+with+divergent+influenza+viruses.">Vaccination with soluble headless hemagglutinin protects mice from challenge with divergent influenza viruses.</a> Vaccine. 33 (29), 3314-3321 (2015).</li><li>Ekiert, D. C., Bhabha, G., et al. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/query.fcgi?db=PubMed&cmd=Search&doptcmdl=Citation&defaultField=Title+Word&term=Antibody+recognition+of+a+highly+conserved+influenza+virus+epitope.">Antibody recognition of a highly conserved influenza virus epitope.</a> Science. 324 (5924), 246-251 (2009).</li><li>Ekiert, D. C., Friesen, R. H. E., et al. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/query.fcgi?db=PubMed&cmd=Search&doptcmdl=Citation&defaultField=Title+Word&term=A+Highly+Conserved+Neutralizing+Epitope+on+Group+2+Influenza+A+Viruses.">A Highly Conserved Neutralizing Epitope on Group 2 Influenza A Viruses.</a> Science. 333 (6044), 843-850 (2011).</li><li>Dreyfus, C., Laursen, N. S., et al. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/query.fcgi?db=PubMed&cmd=Search&doptcmdl=Citation&defaultField=Title+Word&term=Highly+Conserved+Protective+Epitopes+on+Influenza+B+Viruses.">Highly Conserved Protective Epitopes on Influenza B Viruses.</a> Science. 337 (6100), 1343-1348 (2012).</li><li>Tran, E. E. H., Podolsky, K. A., et al. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/query.fcgi?db=PubMed&cmd=Search&doptcmdl=Citation&defaultField=Title+Word&term=Cryo-electron+Microscopy+Structures+of+Chimeric+Hemagglutinin+Displayed+on+a+Universal+Influenza+Vaccine+Candidate.">Cryo-electron Microscopy Structures of Chimeric Hemagglutinin Displayed on a Universal Influenza Vaccine Candidate.</a> mBio. 7 (2), e00257 (2016).</li><li>Wiley, D. C., Wilson, I. A., Skehel, J. J. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/query.fcgi?db=PubMed&cmd=Search&doptcmdl=Citation&defaultField=Title+Word&term=Structural+identification+of+the+antibody-binding+sites+of+Hong+Kong+influenza+haemagglutinin+and+their+involvement+in+antigenic+variation.">Structural identification of the antibody-binding sites of Hong Kong influenza haemagglutinin and their involvement in antigenic variation.</a> Nature. 289 (5796), 373-378 (1981).</li><li>Gerhard, W., Yewdell, J., Frankel, M. E., Webster, R. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/query.fcgi?db=PubMed&cmd=Search&doptcmdl=Citation&defaultField=Title+Word&term=Antigenic+structure+of+influenza+virus+haemagglutinin+defined+by+hybridoma+antibodies.">Antigenic structure of influenza virus haemagglutinin defined by hybridoma antibodies.</a> Nature. 290 (5808), 713-717 (1981).</li><li>Jackson, D. C., Murray, J. M., White, D. O., Gerhard, W. U. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/query.fcgi?db=PubMed&cmd=Search&doptcmdl=Citation&defaultField=Title+Word&term=Enumeration+of+antigenic+sites+of+influenza+virus+hemagglutinin.">Enumeration of antigenic sites of influenza virus hemagglutinin.</a> Infect Immun. 37 (3), 912-918 (1982).</li><li>Matsuzaki, Y., Sugawara, K., et al. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/query.fcgi?db=PubMed&cmd=Search&doptcmdl=Citation&defaultField=Title+Word&term=Epitope+Mapping+of+the+Hemagglutinin+Molecule+of+A/(H1N1)pdm09+Influenza+Virus+by+Using+Monoclonal+Antibody+Escape+Mutants.">Epitope Mapping of the Hemagglutinin Molecule of A/(H1N1)pdm09 Influenza Virus by Using Monoclonal Antibody Escape Mutants.</a> J Virol. 88 (21), 12364-12373 (2014).</li><li>Tan, G. S., Krammer, F., Eggink, D., Kongchanagul, A., Moran, T. M., Palese, P. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/query.fcgi?db=PubMed&cmd=Search&doptcmdl=Citation&defaultField=Title+Word&term=A+pan-H1+anti-hemagglutinin+monoclonal+antibody+with+potent+broad-spectrum+efficacy+in+vivo.">A pan-H1 anti-hemagglutinin monoclonal antibody with potent broad-spectrum efficacy in vivo.</a> J Virol. 86 (11), 6179-6188 (2012).</li><li>Geneva: World Health Organization. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/query.fcgi?db=PubMed&cmd=Search&doptcmdl=Citation&defaultField=Title+Word&term=.">.</a> WHO manual on animal influenza diagnosis and surveillance. , (2002).</li><li>Brauer, R., Chen, P. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/query.fcgi?db=PubMed&cmd=Search&doptcmdl=Citation&defaultField=Title+Word&term=Influenza+Virus+Propagation+in+Embryonated+Chicken+Eggs.">Influenza Virus Propagation in Embryonated Chicken Eggs.</a> J Vis Exp. (97), e52421 (2015).</li><li>Mart&#237;nez-Sobrido, L., Garc&#237;a-Sastre, A. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/query.fcgi?db=PubMed&cmd=Search&doptcmdl=Citation&defaultField=Title+Word&term=Generation+of+Recombinant+Influenza+Virus+from+Plasmid+DNA.">Generation of Recombinant Influenza Virus from Plasmid DNA.</a> J Vis Exp. (42), e2057 (2010).</li><li>Hoffmann, E., Stech, J., Guan, Y., Webster, R. G. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/query.fcgi?db=PubMed&cmd=Search&doptcmdl=Citation&defaultField=Title+Word&term=Universal+primer+set+for+the+full-length+amplification+of+all+influenza+A+viruses.">Universal primer set for the full-length amplification of all influenza A viruses.</a> ArchVirol. 146 (12), 2275-2289 (2001).</li><li>Zhou, B., Lin, X., et al. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/query.fcgi?db=PubMed&cmd=Search&doptcmdl=Citation&defaultField=Title+Word&term=Universal+Influenza+B+Virus+Genomic+Amplification+Facilitates+Sequencing,+Diagnostics,+and+Reverse+Genetics.">Universal Influenza B Virus Genomic Amplification Facilitates Sequencing, Diagnostics, and Reverse Genetics.</a> J Clin Microbiol. 52 (5), 1330-1337 (2014).</li><li>Sidhu, S. S., Kossiakoff, A. A. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/query.fcgi?db=PubMed&cmd=Search&doptcmdl=Citation&defaultField=Title+Word&term=Exploring+and+designing+protein+function+with+restricted+diversity.">Exploring and designing protein function with restricted diversity.</a> Curr Opin Chem Biol. 11, 347-354 (2007).</li><li>Chen, C. -. W., Chang, C. -. Y. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/query.fcgi?db=PubMed&cmd=Search&doptcmdl=Citation&defaultField=Title+Word&term=Peptide+Scanning-assisted+Identification+of+a+Monoclonal+Antibody-recognized+Linear+B-cell+Epitope.">Peptide Scanning-assisted Identification of a Monoclonal Antibody-recognized Linear B-cell Epitope.</a> J Vis Exp. (121), e55417 (2017).</li></ol>

Yazarlar hiçbir çıkar çatışmaları bildirin.

Kaçış mutantların tespit artıkları çoğunluğu doğru olmasına rağmen bu yaklaşım önemli uyarılar nokta mutasyonlar kaçış versiyonlarının mutlaka moleküler ayak izi tarafından belirlenen antikor içinde eşleşmeyebilir ki biridir yapısal analiz. Bu konformasyon değişikliğine mutasyona uğramış kalıntı, allosteric efekti benzer konuma distal yeteneğini bir mutasyon belirli bir kalıntı, kaynaklanmaktadır. Bu yöntem yalnızca antikorları nötralize için uygulanabilir olduğunu başka bir kısıtlamadır; vitro seçici basınç eksikliği antikorlar mutantlar kaçmak için yol değil. Ancak, bu sınırlama bir panel tarafından daha önce karakterize nötralize antikorlar oluşturulan kaçış versiyonlarının kullanımı ile aşılabilir. Tan vd. H7N9 virüsü nötralize mAb bir kaçış türevi bir sigara nötralize antikor7epitope eşleştirmek için kullanılır.
Yine de, kaçış türevleri üretimi aracılığıyla antikorlar epitopları elucidating kristalografisi ve cryo-elektron mikroskobu, ikisi de ekipman geniş bir yatırım gerektiren bir alternatif sağlar. Alanin tarama veya peptid tarama/kesme mutantlar kullanarak mAbs en az bağlama bölgesinin belirlemek için diğer alternatifleri vardır. Mutagenesis tarama alanin peptid tarama doğrusal epitopları30ile sınırlı ise29, eleme sırasında çok sayıda değişik oluşturma çalışmalarında önemli miktarda gerektirebilir. Bu protokol için açıklanan yöntem hiçbir özel ekipman veya tekniği gerektirir ve hatta kaçış değişik-in ilgi antikorlar oluşturmak için değişikliğin varolan vitro nötralizasyon deneyleri kullanır.
İletişim kuralı için birden çok pasajlar (örneğin, SAP özel antikorlar) gerektiren üreten kaçış değişik yüksek antikor pasajda 0 başlangıç konsantrasyonu bağlıdır. Dikkatli yan tarafındaki err ve yarım günlük yarım maksimal inhibitör konsantrasyonu bir antikor düşük bir günlüğüne başında ve güçlü virüs büyümesi için izin vermek iyidir. Araştırmacı yüksek titresi virüs kültür düşük immünolojik basıncı varlığında viral topluluk içinde büyük bir genetik varyasyon olacak spekülasyon olabilir. Kaçış türevleri için aşağıdaki pasajlar antikor konsantrasyon yavaş yavaş artırarak seçilebilir. Önceki geçiş antikor konsantrasyon aynı miktarda koruyarak virüs büyüme azaltır olay bu viral süpernatant miktarı sonraki pasajda artırılabilir.
Evrensel grip aşıları çoğunluğu HA sapı bölgenin doğru sağlam antikor yanıtı temin için amaçtır. SAP özel antikorlar için kaçış versiyonlarının grip virüsü fitness ve immünolojik basıncı arasındaki ilişki tanımlamada önemli analizlerdir. İlginçtir, kaçış mutasyona uğramış virüs sapı özgü mAbs kaynaklanan tüm zayıflatılmış vivo içinde fare LD50 çalışmaları4' te edildi. Bu çalışmalar güçlü bir durumda aşı sapı tabanlı platformlar için sağlar. Ayrıca, bu protokol küçük molekül inhibitörleri gibi anti-yayılmacı diğer bileşikler için kaçış mutantların tanımlamak için kullanılabilir. Son olarak, bu metodoloji grip virüsü yüzey glikoproteinlerin için sınırlı değil, ama aynı zamanda daha çok diğer viral glikoproteinlerin epitopları belirlemek için uygulanabilir.

Benzer şekilde diğer RNA virüsleri, grip A virüs antijenik türevleri çok sayıda her yuvarlak çoğaltma1,2,3nesil için izin veren bir hataya polimeraz sahip. Bir virüs grip uyum ve ile antikor bağlama kaybına neden mutasyonlar yüzey glikoproteinlerin üzerinde bir birikimi yoluyla elde antijenik drift insan bağışıklık yanıtı kaçmasına hayret verici bir yeteneği var. Viral yüzey glikoproteinlerin, HA ve neuraminidase (NA), antijenik sürüklenme gerek reformulate ve aşı her yıl yönetmek gerektirir.
Teknolojik gelişmeler yalıtım ve antijen spesifik antikorların üretimi aşı indüklenen mAbs4,5,6,7,8sayısının yüksek vermiştir. Buna karşılık, geniş grip A virüsleri nötralize mAbs epitopları karakterizasyonu birkaç evrensel grip aşısı adayların9,10,11gelişimi büyük ölçüde destekli, 12,13,14. Antijenik ayak izi bir mAb elucidating nötralizasyon yapısal belirleyicileri ortaya çıkarır ve aşı tasarım bilinçli bir yaklaşım sağlar. Ancak, gerçekçi de yapısal olarak viral antijen15, epitopları eşlemek için mAbs x-ışını kristalografisi veya cryo-elektron mikroskobu aracılığıyla geniş panelleri ayırdetmek laboratuarlar için maliyet-etkin olmadığı 16 , 17 , 18.
X-ışını kristalografisi veya cryo-elektron mikroskobu pahalı donanımları, özel teknikler ve potansiyel olarak geniş bir veri oluşturmak için gereken saat miktarını gerektirir. Alternatif ve daha hızlı bir yaklaşım hataya RNA'ya bağımlı üzerinden çeşitli viral nüfus hızlı nesil kullanan RNA polimeraz epitopları mAbs19,20, belirlemek için kaçış mutantların oluşturmak için 21,22,23. Kaçış türevleri üretimi herhangi bir özel ekipman veya teknik gerektirmez ve geleneksel laboratuvar Kimyasalları ve ekipmanları ile gerçekleştirilebilir.
Burada, grip HA tanımak mAb bağlama için gerekli kritik artıkları eşleme için izin veren bir yöntem açıklanmaktadır.

<table border="0" cellpadding="0" cellspacing="0" width="1159">
	<tbody>
		<tr height="21">
			<td height="21" style="height:21px;width:415px;">Falcon 96-well clear flat bottom TC-treated culture microplate with Lid</td>
			<td style="width:197px;">Corning, Inc.</td>
			<td align="right" style="width:119px;">353072</td>
			<td style="width:429px;">Assay plate use for the microneutralization assay</td>
		</tr>
		<tr height="21">
			<td height="21" style="height:21px;width:415px;">Falcon 96-well clear V-bottom plate</td>
			<td style="width:197px;">Corning, Inc.</td>
			<td align="right" style="width:119px;">353263</td>
			<td>Assay plate use for the hemagglutination inhibition assay</td>
		</tr>
		<tr height="21">
			<td height="21" style="height:21px;width:415px;">1X Minimal Essential Medium (MEM)</td>
			<td style="width:197px;">Gibco</td>
			<td align="right" style="width:119px;">11095080</td>
			<td>Infection medium</td>
		</tr>
		<tr height="26">
			<td height="26" style="height:26px;">Tosyl phenylalanyl chloromethyl (TPCK)-treated trypsin</td>
			<td>Sigma-Aldrich</td>
			<td style="width:119px;">T8802</td>
			<td>Cleaves immature HA0 to HA1 and HA2</td>
		</tr>
		<tr height="21">
			<td height="21" style="height:21px;width:415px;">Biotinylated anti-NP primary antibody (IAV)</td>
			<td>EMD Millipore</td>
			<td style="width:119px;">MAB8258B</td>
			<td>An antibody that recognizes the NP protein of influenza A viruses</td>
		</tr>
		<tr height="21">
			<td height="21" style="height:21px;width:415px;">Biotinylated anti-NP primary antibody (IBV)</td>
			<td style="width:197px;">EMD Millipore</td>
			<td style="width:119px;">MAB8260B-5</td>
			<td>An antibody that recognizes the NP protein of influenza B viruses</td>
		</tr>
		<tr height="21">
			<td height="21" style="height:21px;width:415px;">Streptavidin-HRP antibody</td>
			<td>EMD Millipore</td>
			<td style="width:119px;">18-152</td>
			<td>This is used as a secondary antibody for the biotinylated anti-NP antibody</td>
		</tr>
		<tr height="21">
			<td height="21" style="height:21px;width:415px;">HRP substrate (SIGMAFAST-OPD)</td>
			<td style="width:197px;">Sigma-Aldrich</td>
			<td style="width:119px;">P9187-5SET</td>
			<td>o-phenylenediamine dihydrochloride water soluble substrate for HRP</td>
		</tr>
		<tr height="21">
			<td height="21" style="height:21px;width:415px;">96-well V-bottom plate</td>
			<td style="width:197px;">Nunc</td>
			<td align="right" style="width:119px;">249662</td>
			<td>Assay plate used for the hemagglutination assay</td>
		</tr>
		<tr height="21">
			<td height="21" style="height:21px;width:415px;">Chicken red blood cells</td>
			<td>Lampire Biological Laboratories</td>
			<td align="right" style="width:119px;">7201403</td>
			<td>Used to assess the ability of influenza virus to agglutinate</td>
		</tr>
		<tr height="21">
			<td height="21" style="height:21px;width:415px;">TRIzol</td>
			<td style="width:197px;">Ambion</td>
			<td align="right" style="width:119px;">15596026</td>
			<td>Extraction of RNA</td>
		</tr>
		<tr height="21">
			<td height="21" style="height:21px;width:415px;">Superscript III</td>
			<td style="width:197px;">Invitrogen</td>
			<td align="right" style="width:119px;">12574018</td>
			<td>Reverse transcriptase</td>
		</tr>
		<tr height="21">
			<td height="21" style="height:21px;width:415px;">Gel Extraction Kit</td>
			<td style="width:197px;">Qiagen</td>
			<td align="right" style="width:119px;">28704</td>
			<td>Isolation of amplified PCR product</td>
		</tr>
		<tr height="21">
			<td height="21" style="height:21px;width:415px;">Lipofectamine 2000</td>
			<td style="width:197px;">Invitrogen</td>
			<td align="right" style="width:119px;">11668027</td>
			<td>Transfection reagent</td>
		</tr>
		<tr height="21">
			<td height="21" style="height:21px;width:415px;">Anti-human IgG (H+L) Alexa Fluor 488</td>
			<td style="width:197px;">Invitrogen</td>
			<td style="width:119px;">A-11013</td>
			<td>Fluorescent secondary antibody for human antibodies</td>
		</tr>
		<tr height="21">
			<td height="21" style="height:21px;width:415px;">Anti-mouse IgG (H+L) Alexa Fluor 488</td>
			<td style="width:197px;">Invitrogen</td>
			<td style="width:119px;">A-11001</td>
			<td>Fluorescent secondary antibody for murine antibodies</td>
		</tr>
		<tr height="21">
			<td height="21" style="height:21px;width:415px;">6-well polystyrene microplate</td>
			<td style="width:197px;">Corning, Inc.</td>
			<td align="right" style="width:119px;">353934</td>
			<td></td>
		</tr>
		<tr height="21">
			<td height="21" style="height:21px;width:415px;">UltraPure Agarose</td>
			<td style="width:197px;">Invitrogen</td>
			<td align="right" style="width:119px;">16500500</td>
			<td></td>
		</tr>
		<tr height="21">
			<td height="21" style="height:21px;width:415px;">Nalgene long term storage Cryo-tubes</td>
			<td style="width:197px;">ThermoFisher Scientific</td>
			<td style="width:119px;">5012-0020</td>
			<td>Freezing of viral culture supernatant</td>
		</tr>
		<tr height="21">
			<td height="21" style="height:21px;width:415px;">reassortant A/California/04/09 (H1)</td>
			<td style="width:197px;">Palese Laboratory</td>
			<td style="width:119px;"></td>
			<td>reassortant virus expressing the HA and NA of A/California/04/09 (H1N1) with the internal segments of A/Puerto Rico/8/34 (H1N1)</td>
		</tr>
		<tr height="21">
			<td height="21" style="height:21px;width:415px;">reassortant A/Shanghai/1/13 (H7)</td>
			<td style="width:197px;">Palese Laboratory</td>
			<td style="width:119px;"></td>
			<td>reassortant virus expressing the HA and NA of A/Shanghai/1/13 (H7N9) with the internal segments of A/Puerto Rico/8/34 (H1N1)</td>
		</tr>
		<tr height="21">
			<td height="21" style="height:21px;width:415px;">Bovine serum albumin solution (35%)</td>
			<td style="width:197px;">Sigma-Aldrich</td>
			<td style="width:119px;">A7979</td>
			<td></td>
		</tr>
		<tr height="21">
			<td height="21" style="height:21px;width:415px;">Qiagen gel extration kit</td>
			<td style="width:197px;">Qiagen</td>
			<td align="right" style="width:119px;">28704</td>
			<td>Silica-membrane-based purification of DNA fragments</td>
		</tr>
	</tbody>
</table>

generation of escape variants of neutralizing influenza virus monoclonal antibodies

Grip virüsleri uyum ve konak immün yanıt kaçmasına görmeyeteneği sergi. Virüsü yüzey glikoproteinlerin üzerinde antijenik yapılan değişiklikler aracılığıyla bir yoludur. Kaçış türevleri üretimi nasıl virüs bağışıklık algılama kaçış elucidating ve antikor bağlama için gerekli kritik artıkları belirlenmesinde güçlü bir yöntemdir. Burada, bir protokol nasıl grip A virüs kaçış türevleri viral hemagglutinin (HA) karşı yönettiği insan veya fare monoklonal antikorlar (mAbs) kullanarak oluşturmak açıklar. Bizim tekniğin kullanımı ile daha önce iki kafa veya roman kuş H7N9 HA SAP hedefleme antikorlar bağlama için gerekli kritik artıkları ile karakterizedir. İletişim kuralı diğer virüs sistemleri için kolayca adapte edilebilir. Analizleri kaçış versiyonlarının antijenik drift tek nükleotid polimorfizmleri (SNPs) conferring direnci ve virüs sağlık, belirlerken, modelleme ve aşılar ve/veya tedavi tasarımı önemlidir.

Biz daha önce kaçış türevleri için insan ve fare mAbs mevsimsel grip virüsü aşısı, H7N9 aşı veya sıralı DNA/rekombinant HA protein aşı4,5 tarafından indüklenen oluşturmak için bu yöntemi varyasyonları kullandık ,6,7. Yukarıda açıklandığı gibi antikorlar ilk bize sonraki4,5ile devam etmek için belirli hangi protokolü hakkında bilgilendirmek için HI ve microneutralization deneyleri kullanarak karakterize. Antikorlar 07-5D 03, 07-5F01, 07-5G 01, 07-4B03, 07-4E02 ve 07-4D 05 HI ve nötralizasyon kuş H7N9 virüs (A/Shanghai/1/2013) (Tablo 1) karşı olan bulunmuştur ve böylece Protokolü 1 (Adım 2.1) kullanılmıştır. MAbs etkisiz hale güvenmiyorlarsa 41-5E04, 045-051310-2B06, 042-100809-2F04 ve S6-B01 (Tablo 1), gibi HI aktivite ile Protokolü 2 (Adım 2.2) kaçış türevlerini oluşturmak için kullanılmıştır. Kaçış mutant eşleme antikorlar birçoğu viral HA4,5 (şekil 4) farklı yerlerde kritik artıkları tanımak ortaya koydu. Var HI-pozitif antikorlar çoğunluğu kaçış iken, H7 HA daha önce raporlanmış antijenik sitelere yakın mutant artıkları, HI-negatif antikorlar sapı bölge4' te,5 kaçış mutantların nokta mutasyonları ile oluşturulan .
<table border="1" fo:keep-together.within-page="1" fo:keep-with-next.within-page="always">
	<tbody>
		<tr>
			<td>Antikor</td>
			<td>Merhaba etkinliği</td>
			<td>NEUT aktivite</td>
		</tr>
		<tr>
			<td>07-5D 03</td>
			<td>+</td>
			<td>+</td>
		</tr>
		<tr>
			<td>07-5F01</td>
			<td>+</td>
			<td>+</td>
		</tr>
		<tr>
			<td>07-5G 01</td>
			<td>+</td>
			<td>+</td>
		</tr>
		<tr>
			<td>07-4B03</td>
			<td>+</td>
			<td>+</td>
		</tr>
		<tr>
			<td>07-4E02</td>
			<td>+</td>
			<td>+</td>
		</tr>
		<tr>
			<td>07-4D 05</td>
			<td>+</td>
			<td>+</td>
		</tr>
		<tr>
			<td>41-5E04</td>
			<td>-</td>
			<td>+</td>
		</tr>
		<tr>
			<td>045-051310-2B06</td>
			<td>-</td>
			<td>+</td>
		</tr>
		<tr>
			<td>042-100809-2F04</td>
			<td>-</td>
			<td>+</td>
		</tr>
		<tr>
			<td>S6-B01</td>
			<td>-</td>
			<td>+</td>
		</tr>
	</tbody>
</table>
Tablo 1: Antikor HI ve nötralizasyon etkinlik tablosunun. On H7 özel mAbs ile deneysel bir H7N9 aşı aşı bireyler izole farklı vitro antiviral faaliyetleri5sergi.
<table border="1" fo:keep-together.within-page="1" fo:keep-with-next.within-page="always">
	<tbody>
		<tr>
			<td></td>
			<td colspan="4">İleri astar (5'-3')</td>
			<td colspan="4">Astar (5'-3') ters</td>
			<td colspan="2">Thermocylcer koşulları</td>
		</tr>
		<tr>
			<td>IAV</td>
			<td colspan="4">TATTCGTCTCAGGGAGCAAAAGCAGGGG</td>
			<td colspan="4">ATATCGTCTCGTATTAGTAGAAACAAGGGTGTTTT</td>
			<td colspan="2">60 dk 42 ºC, 94 ° C'nin 2 dk/5 döngüsü için 20 94 ° C'nin s, 30 50 ºC s ve 3 dk 30 sn için 68 ° C'nin 40 devredir 20 94 ºC takiben s, 30 58 ° C'nin s ve 3 dk 30 sn ile 68 ºC 10 min için bir son uzantısı saat için 68 ºC</td>
		</tr>
		<tr>
			<td>IBV</td>
			<td colspan="4">GGGGGGAGCAGAAGCAGAGC</td>
			<td colspan="4">CCGGGTTATTAGTAGTAACAAGAGC</td>
			<td colspan="2">60 dk, 30 dk 55 ºC, 94 ° C'nin 2 dk/5 döngüsü için 20 94 ° C'nin 45 ºC s, 30 40 ºC 40 devredir 20 94 ºC tarafından takip için 3 dk 30 sn, 68 ºC ve s s , 30 58 ° C'nin s ve 3 dk 30 sn ile 68 ºC 10 min için bir son uzantısı saat için 68 ºC</td>
		</tr>
	</tbody>
</table>
Tablo 2: evrensel grip virüsü astar. Grip A27 ve B28 virüsleri ve onların anılan sıraya göre thermocycler koşulları astar çift HA kesimleri amplifikasyon için.
<img alt="Figure 1" class="xfigimg" src="/files/ftp_upload/56067/56067fig1.jpg"> 
Şekil 1: HI tahlil. (A) A şematik bir HI tahlil kurmak iki fare H1 özgü mAbs 7B2 (kafa özgü) ve 6F12 (SAP-özel bir 96-şey V-alt plaka ve (B) bir HI tahlil23sonuçlarını örneği kullanarak) etkinliğini test etmek için. <a href="//ecsource.jove.com/files/ftp_upload/56067/56067fig1large.jpg" target="_blank">Bu rakam daha büyük bir versiyonunu görüntülemek için buraya tıklayınız.</a>
<img alt="Figure 2" class="xfigimg" src="/files/ftp_upload/56067/56067fig2.jpg"> 
Resim 2: Microneutralization tahlil. İki insan mAbs 4 d 055 ve CR911417etkinliğini test etmek bir microneutralization tahlil ayarlamak için bir şema. <a href="//ecsource.jove.com/files/ftp_upload/56067/56067fig2large.jpg" target="_blank">Bu rakam daha büyük bir versiyonunu görüntülemek için buraya tıklayınız.</a>
<img alt="Figure 3" class="xfigimg" src="/files/ftp_upload/56067/56067fig3.jpg"> 
Şekil 3: üretimi kaçış mutantların. Önerilen metodoloji HI ve antikor tarafından sergilenen microneutralization aktivite bağımlı olacaktır. (B) nötralize HI-negatif antikor antikor miktarlarda artan ile birden çok pasajlar içerebilir(a)karşı kaçış mutantların üretimi nötralize HI-pozitif antikorlar yumurta, tek bir pasajda gerektirir hücre doku kültürü. <a href="//ecsource.jove.com/files/ftp_upload/56067/56067fig3large.jpg" target="_blank">Bu rakam daha büyük bir versiyonunu görüntülemek için buraya tıklayınız.</a>
<img alt="Figure 4" class="xfigimg" src="/files/ftp_upload/56067/56067fig4.jpg"> 
Şekil 4: bir epitope Haritası roman kuş H7N9 kaçış mutant türevleri ile oluşturulan HA örneği. Aşı indüklenen antikorlar H7N9 grip aşı kaçış mutant varyantlarını oluşturmak için kullanılan bir aday ile aşı bireyler izole. Her kalıntı kırmızı temsil kritik amino asitler bir mAb verimli bağlama için gerekli konumunu belirtti. Veri Dunand-Henry ve ark., 20154adapte edildi. <a href="//ecsource.jove.com/files/ftp_upload/56067/56067fig4large.jpg" target="_blank">Bu rakam daha büyük bir versiyonunu görüntülemek için buraya tıklayınız.</a>

Watch this Scientific Journal Video about Generation of Escape Variants of Neutralizing Influenza Virus Monoclonal Antibodies at JoVE.com

Generation of Escape Variants of Neutralizing Influenza Virus Monoclonal Antibodies

Biz bir yöntem tarafından grip A virüs viral hemagglutinin hedef insan veya fare monoklonal antikorlar bağlama için gerekli kritik artıkları tanımlamak açıklar. İletişim kuralı diğer virüs yüzey glikoproteinlerin ve onların karşılık gelen nötralize antikorlar için adapte edilebilir.

Grip virüsü monoklonal antikorları nötralize kaçış türevleri üretimi

Influenza viruses exhibit a remarkable ability to adapt and evade the host immune response. One way is through antigenic changes that occur on the surface ...

Research

JoVE Journal

Immunology and Infection

Generation of Recombinant Influenza Virus from Plasmid DNA

Plazmid DNA Rekombinant Grip Virüsü Üretimi

Efforts by a number of influenza research groups have been pivotal in the development and improvement of influenza A virus reverse genetics. Originally ...

Isolation of Fidelity Variants of RNA Viruses and Characterization of Virus Mutation Frequency

Virüs mutasyon Frekans RNA Virüsler ve Karakterizasyonu Fidelity Varyantlar izolasyonu

RNA viruses use RNA dependent RNA polymerases to replicate their genomes. The intrinsically high error rate of these enzymes is a large contributor to the ...

High-throughput Detection Method for Influenza Virus

Gribi için yüksek verimlilik Tespit Yöntemi

Influenza virus is a respiratory pathogen that causes a high degree of morbidity and mortality every year in multiple parts of the world. Therefore, ...

Influenza Virus Propagation in Embryonated Chicken Eggs

Embriyone Tavuk Yumurta Grip Virüsü Yayılım

Influenza infection is associated with about 36,000 deaths and more than 200,000 hospitalizations every year in the United States. The continuous ...

Generation of Recombinant Human IgG Monoclonal Antibodies from Immortalized Sorted B Cells

Ölümsüzleştirilmiştir Sıralama B hücrelerinden Rekombinant İnsan IgG Monoklonal Antikorlarının Üretimi

Finding new methods for generating human monoclonal antibodies is an active research field that is important for both basic and applied sciences, ...

Generation of Murine Monoclonal Antibodies by Hybridoma Technology

Hibridoma teknolojisi ile murin monoklonal antikorlar üretilmesi

Monoclonal antibodies are universal binding molecules and are widely used in biomedicine and research. Nevertheless, the generation of these binding ...

Influenza A Virus Studies in a Mouse Model of Infection

Grip A virüs enfeksiyonu bir fare modeli çalışmalarda

Influenza viruses cause over 500,000 deaths worldwide1 and are associated with an annual cost of 12 - 14 billion USD in the United States alone ...

Measuring Influenza Neutralizing Antibody Responses to A(H3N2) Viruses in Human Sera by Microneutralization Assays Using MDCK-SIAT1 Cells

Measuring Influenza Neutralizing Antibody Responses to AH3N2 Viruses in Human Sera by Microneutralization Assays Using MDCK-SIAT1 Cells

MDCK-SIAT1 hücreleri kullanarak antikor yanıt için Microneutralization tarafından insan Sera A(H3N2) virüsleri nötralize grip ölçme deneyi

Neutralizing antibodies against hemagglutinin (HA) of influenza viruses are considered the main immune mechanism that correlates with protection for ...

Generation of Discriminative Human Monoclonal Antibodies from Rare Antigen-specific B Cells Circulating in Blood

Kanda dolaşan nadir antijen spesifik B hücreleri Discriminative insan monoklonal antikorların üretimi

Monoclonal antibodies (mAbs) are powerful tools useful for both fundamental research and in biomedicine. Their high specificity is indispensable when the ...

Generation of Monoclonal Antibodies Against Natural Products

Doğal ürünler karşı monoklonal antikorların üretimi

The analysis of the bioactive components present in foods and natural products has become a popular area of study in many fields, including traditional ...