Name: the c. elegans intestine as a model for intercellular lumen morphogenesis and in vivo polarized membrane biogenesis at the single-cell level: labeling by antibody staining, rnai loss-of-function analysis and imaging
Uploaded: 2017-10-03T13:00:00
Description: Watch this Scientific Journal Video about The C. elegans Intestine As a Model for Intercellular Lumen Morphogenesis and In Vivo Polarized Membrane Biogenesis at the Single-cell Level: Labeling by Anti

Wir danken Mario de Bono (MRC Laboratory of Molecular Biology, Cambridge, UK), Kenneth J. Kemphues (Cornell University, Ithaca, USA), Michel Labouesse (Institut de Biologie Paris Seine, Université Pierre et Marie Curie, Paris, Frankreich), Grégoire Michaux (Université deRennes 1, Rennes, Frankreich) und der CGC, gefördert vom NIH Büro Infrastruktur Forschungsprogramme (P40 OD010440), für Stämme und Antikörper. Diese Arbeit wurde unterstützt durch Zuschüsse des NIH GM078653, MGH ist 224570 und SAA-223809, V.G.

1. Kennzeichnung von C. Elegans Darm Hinweis: finden Sie im begleitende Paper von den Autoren auf die Analyse der Ausscheidungsorgane Canal Tubulogenesis 2 für den Bau von Gewebe spezifische fluoreszierenden Marker Plasmide und die Erzeugung gentechnisch veränderter Tiere, einschließlich Diskussionen über transkriptionelle und translationale Fusionsproteine (Letzteres für die subzelluläre Lokalisation der ein Molekül des Interesses erforderlich). Diese ...

<ol>
	<li>Bryant, D. M., Mostov, K. E. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/query.fcgi?db=PubMed&cmd=Search&doptcmdl=Citation&defaultField=Title+Word&term=From+cells+to+organs:+building+polarized+tissue.">From cells to organs: building polarized tissue.</a> Nat. Rev. Mol. Cell Biol. 9 (11), 887-901 (2008).</li><li>Zhang, N., Membreno, E., Raj, S., Zhang, H., Khan, L. A., Gobel, V. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/query.fcgi?db=PubMed&cmd=Search&doptcmdl=Citation&defaultField=Title+Word&term=The+C.+elegans+excretory+canal+as+a+model+for+intracellular+lumen+morphogenesis+and+in+vivo+polarized+membrane+biogenesis+in+a+single+cell.">The C. elegans excretory canal as a model for intracellular lumen morphogenesis and in vivo polarized membrane biogenesis in a single cell.</a> JoVE. , (2017).</li><li>Rodriguez-Boulan, E., Macara, I. G. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/query.fcgi?db=PubMed&cmd=Search&doptcmdl=Citation&defaultField=Title+Word&term=Organization+and+execution+of+the+epithelial+polarity+programme.">Organization and execution of the epithelial polarity programme.</a> Nat. Rev. Mol. Cell Biol. 15 (4), 225-242 (2014).</li><li>Mellman, I., Nelson, W. J. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/query.fcgi?db=PubMed&cmd=Search&doptcmdl=Citation&defaultField=Title+Word&term=Coordinated+protein+sorting,+targeting+and+distribution+in+polarized+cells.">Coordinated protein sorting, targeting and distribution in polarized cells.</a> Nat. Rev. Mol. Cell Biol. 9 (11), 833-845 (2008).</li><li>Nelson, W. J. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/query.fcgi?db=PubMed&cmd=Search&doptcmdl=Citation&defaultField=Title+Word&term=Adaptation+of+core+mechanisms+to+generate+cell+polarity.">Adaptation of core mechanisms to generate cell polarity.</a> Nature. 422, 766-774 (2003).</li><li>Goldstein, B., Macara, I. G. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/query.fcgi?db=PubMed&cmd=Search&doptcmdl=Citation&defaultField=Title+Word&term=The+PAR+Proteins:+Fundamental+Players+in+Animal+Cell+Polarization.">The PAR Proteins: Fundamental Players in Animal Cell Polarization.</a> Dev. Cell. 13 (5), 609-622 (2007).</li><li>Rodriguez-Boulan, E., Kreitzer, G., Musch, A. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/query.fcgi?db=PubMed&cmd=Search&doptcmdl=Citation&defaultField=Title+Word&term=Organization+of+vesicular+trafficking+in+epithelia.">Organization of vesicular trafficking in epithelia.</a> Nat. Rev. Mol. Cell Biol. 6 (3), 233-247 (2005).</li><li>Zegers, M. M., O'Brien, L. E., Yu, W., Datta, A., Mostov, K. E. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/query.fcgi?db=PubMed&cmd=Search&doptcmdl=Citation&defaultField=Title+Word&term=Epithelial+polarity+and+tubulogenesis+in+vitro.">Epithelial polarity and tubulogenesis in vitro.</a> Trends Cell Biol. 13 (4), 169-176 (2003).</li><li>Tepass, U. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/query.fcgi?db=PubMed&cmd=Search&doptcmdl=Citation&defaultField=Title+Word&term=The+apical+polarity+protein+network+in+Drosophila+epithelial+cells:+regulation+of+polarity,+junctions,+morphogenesis,+cell+growth,+and+survival.">The apical polarity protein network in Drosophila epithelial cells: regulation of polarity, junctions, morphogenesis, cell growth, and survival.</a> Annu. Rev. Cell Dev. Biol. 28, 655-685 (2012).</li><li>Shivas, J. M., Morrison, H. A., Bilder, D., Skop, A. R. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/query.fcgi?db=PubMed&cmd=Search&doptcmdl=Citation&defaultField=Title+Word&term=Polarity+and+endocytosis:+reciprocal+regulation.">Polarity and endocytosis: reciprocal regulation.</a> Trends Cell Biol. 20 (8), 445-452 (2010).</li><li>Bryant, D. M. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/query.fcgi?db=PubMed&cmd=Search&doptcmdl=Citation&defaultField=Title+Word&term=A+molecular+network+for+de+novo+generation+of+the+apical+surface+and+lumen.">A molecular network for de novo generation of the apical surface and lumen.</a> Nat. Cell Biol. 12 (11), 1035-1045 (2010).</li><li>Zhang, H. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/query.fcgi?db=PubMed&cmd=Search&doptcmdl=Citation&defaultField=Title+Word&term=Apicobasal+domain+identities+of+expanding+tubular+membranes+depend+on+glycosphingolipid+biosynthesis.">Apicobasal domain identities of expanding tubular membranes depend on glycosphingolipid biosynthesis.</a> Nat. Cell Biol. 13 (10), 1189-1201 (2011).</li><li>Zhang, H. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/query.fcgi?db=PubMed&cmd=Search&doptcmdl=Citation&defaultField=Title+Word&term=Clathrin+and+AP-1+regulate+apical+polarity+and+lumen+formation+during+C.+elegans+tubulogenesis.">Clathrin and AP-1 regulate apical polarity and lumen formation during C. elegans tubulogenesis.</a> Development. 139 (11), 2071-2083 (2012).</li><li>Asan, A., Raiders, S. A., Priess, J. R. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/query.fcgi?db=PubMed&cmd=Search&doptcmdl=Citation&defaultField=Title+Word&term=Morphogenesis+of+the+C.+elegans+Intestine+Involves+Axon+Guidance+Genes.">Morphogenesis of the C. elegans Intestine Involves Axon Guidance Genes.</a> PLoS Genet. 12 (4), e1005950 (2016).</li><li>Leung, B., Hermann, G. J., Priess, J. R. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/query.fcgi?db=PubMed&cmd=Search&doptcmdl=Citation&defaultField=Title+Word&term=Organogenesis+of+the+Caenorhabditis+elegans+intestine.">Organogenesis of the Caenorhabditis elegans intestine.</a> Dev. Biol. 216 (1), 114-134 (1999).</li><li>Altun, Z. F., Hall, D. H. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/query.fcgi?db=PubMed&cmd=Search&doptcmdl=Citation&defaultField=Title+Word&term=Alimentary+system,+intestine.">Alimentary system, intestine.</a> WormAtlas. , (2009).</li><li>Sulston, J. E., Horvitz, H. R. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/query.fcgi?db=PubMed&cmd=Search&doptcmdl=Citation&defaultField=Title+Word&term=Post-embryonic+cell+lineages+of+the+nematode,+Caenorhabditis+elegans.">Post-embryonic cell lineages of the nematode, Caenorhabditis elegans.</a> Dev. Biol. 56 (1), 110-156 (1977).</li><li>Rasmussen, J. P., English, K., Tenlen, J. R., Priess, J. R. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/query.fcgi?db=PubMed&cmd=Search&doptcmdl=Citation&defaultField=Title+Word&term=Notch+signaling+and+morphogenesis+of+single-cell+tubes+in+the+C.+elegans+digestive+tract.">Notch signaling and morphogenesis of single-cell tubes in the C. elegans digestive tract.</a> Dev. Cell. 14 (4), 559-569 (2008).</li><li>Maduro, M. F. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/query.fcgi?db=PubMed&cmd=Search&doptcmdl=Citation&defaultField=Title+Word&term=Gut+development+in+C.+elegans.">Gut development in C. elegans.</a> Seminars in cell &amp; developmental biology. , (2017).</li><li>McGhee, J. D. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/query.fcgi?db=PubMed&cmd=Search&doptcmdl=Citation&defaultField=Title+Word&term=The+Caenorhabditis+elegans+intestine.">The Caenorhabditis elegans intestine.</a> Wiley Interdiscip. Rev. Dev. Biol. 2 (3), 347-367 (2013).</li><li>Gobel, V., Barrett, P. L., Hall, D. H., Fleming, J. T. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/query.fcgi?db=PubMed&cmd=Search&doptcmdl=Citation&defaultField=Title+Word&term=Lumen+morphogenesis+in+C.+elegans+requires+the+membrane-cytoskeleton+linker+erm-1.">Lumen morphogenesis in C. elegans requires the membrane-cytoskeleton linker erm-1.</a> Dev. Cell. 6 (6), 865-873 (2004).</li><li>Fehon, R. G., McClatchey, A. I., Bretscher, A. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/query.fcgi?db=PubMed&cmd=Search&doptcmdl=Citation&defaultField=Title+Word&term=Organizing+the+cell+cortex:+the+role+of+ERM+proteins.">Organizing the cell cortex: the role of ERM proteins.</a> Nat. Rev. Mol. Cell Biol. 11 (4), 276-287 (2010).</li><li>Brenner, S. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/query.fcgi?db=PubMed&cmd=Search&doptcmdl=Citation&defaultField=Title+Word&term=The+genetics+of+Caenorhabditis+elegans.">The genetics of Caenorhabditis elegans.</a> Genetics. 77, 71-94 (1974).</li><li>Timmons, L., Court, D. L., Fire, A. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/query.fcgi?db=PubMed&cmd=Search&doptcmdl=Citation&defaultField=Title+Word&term=Ingestion+of+bacterially+expressed+dsRNAs+can+produce+specific+and+potent+genetic+interference+in+Caenorhabditis+elegans.">Ingestion of bacterially expressed dsRNAs can produce specific and potent genetic interference in Caenorhabditis elegans.</a> Gene. 263 (1-2), 103-112 (2001).</li><li>Shakes, D. C., Miller, D. M., Nonet, M. L. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/query.fcgi?db=PubMed&cmd=Search&doptcmdl=Citation&defaultField=Title+Word&term=Immunofluorescence+microscopy.">Immunofluorescence microscopy.</a> Methods Cell Biol. 107, 35-66 (2012).</li><li>Kamath, R. S., Martinezcampos, M., Zipperlen, P., Fraser, A. G., Ahringer, J. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/query.fcgi?db=PubMed&cmd=Search&doptcmdl=Citation&defaultField=Title+Word&term=Effectiveness+of+specific+RNA-mediated+interference+through+ingested+double-stranded+RNA+in+Caenorhabditis+elegans.">Effectiveness of specific RNA-mediated interference through ingested double-stranded RNA in Caenorhabditis elegans.</a> Genome Biol. 2 (1), RESEARCH0002 (2001).</li><li>Simmer, F. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/query.fcgi?db=PubMed&cmd=Search&doptcmdl=Citation&defaultField=Title+Word&term=Loss+of+the+Putative+RNA-Directed+RNA+Polymerase+RRF-3+Makes+C.+elegans+Hypersensitive+to+RNAi.">Loss of the Putative RNA-Directed RNA Polymerase RRF-3 Makes C. elegans Hypersensitive to RNAi.</a> Curr. Biol. 12 (15), 1317-1319 (2002).</li><li>Kennedy, S., Wang, D., Ruvkun, G. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/query.fcgi?db=PubMed&cmd=Search&doptcmdl=Citation&defaultField=Title+Word&term=A+conserved+siRNA-degrading+RNase+negatively+regulates+RNA+interference+in+C.+elegans.">A conserved siRNA-degrading RNase negatively regulates RNA interference in C. elegans.</a> Nature. 427 (6975), 645-649 (2004).</li><li>Maddox, A. S., Maddox, P. S. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/query.fcgi?db=PubMed&cmd=Search&doptcmdl=Citation&defaultField=Title+Word&term=High-resolution+imaging+of+cellular+processes+in+Caenorhabditis+elegans.">High-resolution imaging of cellular processes in Caenorhabditis elegans.</a> Methods Cell Biol. 107, 1-34 (2012).</li><li>Netherlands, S. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/query.fcgi?db=PubMed&cmd=Search&doptcmdl=Citation&defaultField=Title+Word&term=.">.</a> Nomarski Differential Interference Contrast Microscopy. , (2008).</li><li>Bates, M., Jones, S. A., Zhuang, X. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/query.fcgi?db=PubMed&cmd=Search&doptcmdl=Citation&defaultField=Title+Word&term=Stochastic+optical+reconstruction+microscopy+(STORM):+a+method+for+superresolution+fluorescence+imaging.">Stochastic optical reconstruction microscopy (STORM): a method for superresolution fluorescence imaging.</a> Cold Spring Harb. Protoc. 6, 498-520 (2013).</li><li>Jorgensen, E. M., Mango, S. E. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/query.fcgi?db=PubMed&cmd=Search&doptcmdl=Citation&defaultField=Title+Word&term=The+art+and+design+of+genetic+screens:+caenorhabditis+elegans.">The art and design of genetic screens: caenorhabditis elegans.</a> Nat. Rev. Genet. 3, 356-369 (2002).</li><li>Lee, Y. U., Son, M., Kim, J., Shim, Y. H., Kawasaki, I. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/query.fcgi?db=PubMed&cmd=Search&doptcmdl=Citation&defaultField=Title+Word&term=CDC-25.2,+a+C.+elegans+ortholog+of+cdc25,+is+essential+for+the+progression+of+intestinal+divisions.">CDC-25.2, a C. elegans ortholog of cdc25, is essential for the progression of intestinal divisions.</a> Cell Cycle. 15 (5), 654-666 (2016).</li><li>Hall, D. H., Hartwieg, E., Nguyen, K. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/query.fcgi?db=PubMed&cmd=Search&doptcmdl=Citation&defaultField=Title+Word&term=Modern+electron+microscopy+methods+for+C.+elegans.">Modern electron microscopy methods for C. elegans.</a> Methods Cell Biol. 107, 93-149 (2012).</li><li>Shi, A., Grant, B. D. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/query.fcgi?db=PubMed&cmd=Search&doptcmdl=Citation&defaultField=Title+Word&term=In+vivo+analysis+of+recycling+endosomes+in+Caenorhabditis+elegans.">In vivo analysis of recycling endosomes in Caenorhabditis elegans.</a> Methods Cell Biol. 130, 181-198 (2015).</li><li>. Transgeneome website Available from: <a target="_blank" href="https://transgeneome.mpi-cbg.de/transgeneomics/index.html">https://transgeneome.mpi-cbg.de/transgeneomics/index.html</a> (2017)</li><li>. National BioResource Project (NBRP)::C. elegans Available from: <a target="_blank" href="https://shigen.nig.ac.jp/c.elegans/">https://shigen.nig.ac.jp/c.elegans/</a> (2017)</li><li>Kamath, R. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/query.fcgi?db=PubMed&cmd=Search&doptcmdl=Citation&defaultField=Title+Word&term=Genome-wide+RNAi+screening+in+Caenorhabditis+elegans.">Genome-wide RNAi screening in Caenorhabditis elegans.</a> Methods. 30 (4), 313-321 (2003).</li><li>Kamath, R. S. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/query.fcgi?db=PubMed&cmd=Search&doptcmdl=Citation&defaultField=Title+Word&term=Systematic+functional+analysis+of+the+Caenorhabditis+elegans+genome+using+RNAi.">Systematic functional analysis of the Caenorhabditis elegans genome using RNAi.</a> Nature. 421 (6920), 231-237 (2003).</li><li>Rual, J. F. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/query.fcgi?db=PubMed&cmd=Search&doptcmdl=Citation&defaultField=Title+Word&term=Toward+improving+Caenorhabditis+elegans+phenome+mapping+with+an+ORFeome-based+RNAi+library.">Toward improving Caenorhabditis elegans phenome mapping with an ORFeome-based RNAi library.</a> Genome Res. 14 (10B), 2162-2168 (2004).</li></ol>

Dieses Protokoll beschreibt, wie Sie standard der Verlustfunktion genetische/RNAi und (Kennzeichnung und mikroskopische) Ansätze um die Vorteile des Darmepithels C. Elegans als Modell für die visuelle und molekulare Zerlegung des in-vivo imaging kombinieren polarisierte Membran und Lumen Biogenese.
Kennzeichnung
Dieses Protokoll konzentriert sich auf Antikörper Färbung. In Situ durch Antikörper labeling ist eine hochs...

Die Generation zellulärer und subzellulärer Asymmetrien, z. B. die Bildung von polarisierten Membrandomänen ist entscheidend für die Morphogenese und Funktion von Zellen, Geweben und Organen1. Studien über polarisierte Membran Biogenese in Epithelien bleiben eine technische Herausforderung, da mehrere aufeinander folgende und deckungsgleich extrazellulären und intrazellulären Signale Richtungsänderungen bei der Zuweisung von subzelluläre Komponenten abhängen, die schwer zu trennen, bei den meisten Modellen und stark abhängig von dem Modellsystem. Das Modell präsentiert hier - die einschichtige Caenorhabditis Elegans Darm - ist ein Gewebe von exquisite Einfachheit. Zusammen mit den einzelligen C. Elegans Ausscheidungsorgane canal (siehe begleitende Papier auf polarisierte Membran Biogenese in C. Elegans Ausscheidungsorgane Kanals)2, sondern bietet einige einzigartige Vorteile für die Identifizierung und Charakterisierung von Molekülen für polarisierte Membran Biogenese erforderlich. Die Erhaltung der molekulare Polarität Hinweise aus Hefe Mann machen dieses einfache Wirbellosen Organ eine ausgezeichnete"in Vivo Gewebe Kammer" Fragen von epithelialen Polarität, die von unmittelbarer Relevanz für das menschliche System sind die immer noch viel zu Hotel gelangen die visuelle Zerlegung dieser Ereignisse an der einzigen Zelle Ebene in Vivo.
Obwohl mehrere erhaltene Polarität Hinweise aus (1) die Extracelluar Matrix, (2) die Plasmamembran und Kreuzungen und (3) intrazellulären vesikuläre Menschenhandel identifiziert3, die zugrunde liegenden Prinzipien ihrer Integration in den Prozess der wurden polarisierten epithelialen Membran und Gewebe Biogenese ist schlecht verstandene4. Die klassische einzellige in-Vivo -Modelle (e.g.S. Cerevisiae und C. Elegans Zygote) haben maßgeblich bei der Festlegung der Grundsätze der polarisierten Zellteilung und anterior-posterioren Polarität und identifizierten kritischen membranassoziierten Polarität Determinanten (die kleinen GTPasen/CDC-42, die Partitionierung defekt PARs)5,6, aber sie hängen von einzigartiger Symmetrie brechen Cues (Knospe Narbe, Sperma-Eintrag) und keine Kreuzung gesichert Apicobasal Membrandomänen und vermutlich die entsprechende intrazelluläre Apicobasal Maschinen sortieren. Unsere aktuelle Kenntnisse über die Organisation des Handels mit polarisierten Epithelien, setzt jedoch in erster Linie auf Säugetier-2D Monokulturen7, fehlen die physiologischen extrazellulären und Entwicklungsstörungen Hinweise, die Positionen der Membran ändern können Domains und Richtungen der Menschenhandel Trajektorien (Umstellung von 2D auf 3D in-vitro- Kultur-Systeme allein genügt, um die Membran Polarität in MDCK (Madin Darby canine Kidney) Zellen zu invertieren)8. In Vivo Studien von epithelialen Polarität bei Wirbellosen Modellorganismen verliefen zunächst in flachen Epithelien, zum Beispiel in der Epidermis von Drosophila Melanogaster , wo sie die kritischen Beitrag identifiziert der Kreuzung Dynamik für polarisierte Zellwanderung und Zelle Blatt Satz9und endocytic Handel für Polarität Wartung10. 3D in Vitro und in Vivo Analyse der Lumen Morphogenese in röhrenförmigen Epithelien in MDCK-Zellen und im Darm C. Elegans haben bzw. vor kurzem das Erfordernis der intrazellulären Handel zum de identifiziert Novo (apikalen) Domäne und Lumen Biogenese und Positionierung11,12,13. Die Dicke der röhrenförmigen (im Gegensatz zu flach) Epithelzellen ist ein Vorteil für die 3D Analyse der subzellulären Asymmetrien da es eine überragende visuelle Unterscheidung der apikalen lumenal Membran, Apico-seitliche Abzweigungen, die seitlichen Membran ermöglicht und die Positionen der intrazellulären Organellen. Um diese visuellen Vorteile das C. Elegans Modell fügt in Vivo Einstellung, Entwicklungs-Achse, Transparenz, Einfachheit der Körper Plan, invariante und definierten Zelle Abstammung, analytische (genetische) und zusätzliche Vorteile beschrieben.
C. Elegans selbst ist ein Fadenwurm röhrenförmige Struktur, deren Transparenz und einfache Architektur ihre ebenso röhrenförmigen inneren Organe für die visuelle Analyse von Rohr- und Lumen Morphogenese direkt zugänglich machen. Die zwanzig Zellen der seinen Darm (21 oder 22 Zellen gelegentlich)14 stammen aus einer einzigen Stammvater Zelle (E) und entwickeln sich aus einem zweischichtigen Epithel durch Interkalation schrittweise in eine bilateral symmetrisch Tube neun INT Ringe (vier Zellen in der ersten Ring; Abbildung 1 schematische)14,15,16. Den Darm Abstammung und Gewebe Analyse, zunächst bestimmt durch Nomarski Optik über nukleare Identitäten17und anschließend durch Fluoreszenz-Mikroskopie über beschriftete Membranen, lieferte wichtige Einblicke in die Morphogenese, in insbesondere die Zelle-autonome und Zelle-nichtautonomen Anforderungen für seine gerichtete Zellteilungen und Bewegungen (z.B.Interkalation, rechts-links-Asymmetrien, vordere und hintere Röhre Drehung)14,18 . Frühe endodermische Zelle Spezifikation und Steuerung der Entwicklung dieses Organs klonalen Modell gen regulatorischen Netzwerk sind gut charakterisierten19,20. Hier konzentriert sich jedoch auf die Analyse der polarisierten Membran und Lumen Biogenese in röhrenförmigen Einzelzellen und die intrazellulären Asymmetrien des Zytoskeletts Strukturen, Endomembranes und Organellen, die diesen Prozess begleiten. Die Analyse wird durch die Einfachheit dieses Rohres erleichtert, wo alle apikale Membranen (auf der Ultrastrukturforschung Ebene zeichnen sich durch Mikrovilli) Gesicht das Lumen und alle basalen Membranen stellen die äußeren Rohroberfläche mit seitlichen Membranen Kontakt mit einander, durch Kreuzungen von der apikalen Membran getrennt (Abbildung 1 Schaltplan; siehe Referenzen (16,21) für C. Elegans-spezifische Organisation von engen und Adherens Junction Komponenten). Apikale Membran Biogenese ist also deckungsgleich mit Lumen Morphogenese. Darüber hinaus die Größe der Erwachsenen Darmzellen - die größten Zellen dieses kleinen Tieres (mit Ausnahme der Ausscheidungsorgane Zelle) - ungefähr die Größe einer Säugerzelle in Vivo visuelle Verfolgung der subzellulären Elemente, z. B. bei schönem Vesikel Bahnen, das ist in der Regel versucht in Vitro in der Kulturschale.
Für die Zwecke dieser Analyse zellulärer und subzellulärer ist eine entsprechende Kennzeichnung entscheidend. Intestinale Endo oder Plasmamembran Domänen, Kreuzungen, ZellskelettStrukturen, Kerne und andere subzellularen Organellen können visualisiert werden, indem Sie ihre spezifischen molekularen Komponenten beschriften. Viele dieser Komponenten wurden charakterisiert und entdeckt werden (Tabelle 1 zeigt ein paar Beispiele und bezieht sich auf Ressourcen). Beispielsweise wurden verschiedene Moleküle unterscheiden die röhrenförmigen und/oder vesikuläre Fächer des intestinalen Endomembrane Systems, von der ER, Golgi per Post-Golgi-Vesikel, die Plasmamembran identifizierten22. Die spezifische Proteine (sowie Lipide und Zucker) können entweder direkt oder indirekt beschriftet werden über verbindliche Proteine. Dieses Protokoll konzentriert sich auf die in Situ Antikörper Färbung des festen Proben, einer der beiden standard-Kennzeichnung-Techniken (siehe begleitende Papier auf Ausscheidungsorgane Kanal Tubulogenesis für eine Beschreibung der anderen Technik2 - Kennzeichnung in Vivo über fluoreszierende Protein Fusionen - die auf den Darm direkt anwendbar ist; Tabelle 2 enthält Beispiele für Darm-spezifische Promotoren, die verwendet werden können, Ausdruck von solchen Fusionsproteinen in den Darm zu fahren). Doppel- und mehrfache Beschriftung mit beiden Ansätzen oder mit einer Kombination aus beiden plus zusätzliche chemische Färbung, ermöglicht größere eingehende visuelle Auflösung und die Untersuchung der räumlichen und zeitlichen Veränderungen im Co Lokalisierung und Rekrutierung von spezifischen Moleküle oder subzelluläre Komponenten (Abbildung 2). Die Fixierung und Färbung in diesem Protokoll Unterstützung Erhaltung des grün fluoreszierenden Proteins (GFP) Kennzeichnung während Immunostaining Verfahren beschriebene Verfahren. Für die Bildgebung, wichtige Punkte der Detektion und Charakterisierung von Phänotypen über mikroskopische Standardverfahren (sezierenden und konfokale Fluoreszenzmikroskopie) sind Tubulogenesis beschrieben ()Abbildung 3, 4). Dies können zu höheren Auflösung imaging Ansätze für Instanz Superresolution Mikroskopie und Transmissionselektronenmikroskopie (hier nicht beschrieben) erweitert werden.
Eine wesentliche Stärke dieses Systems ist die Fähigkeit, Polarität in einzelnen Zellen in unterschiedlichen Entwicklungsstadien von Embryogenese bis ins Erwachsenenalter zu analysieren. Zum Beispiel kann apikale Membran Domain und Lumen Biogenese während der Entwicklung auf der Ebene der einzelligen nachverfolgt werden, über Etikettierung mit ERM-1, einer hoch konservierten Membran-Aktin-Linker der Ezrin-Radixin-Moesin Familie23,24 . ERM-1 visualisiert apikale Membran Biogenese (1) während der embryonalen Rohr Morphogenese, tritt es begleitend mit polarisierten Zellteilung und Migration (Zellen bewegen, apikal Lumen während Interkalation)15; (2) während der späten embryonale und larvale Rohrverlängerung, die in der Abwesenheit von Zellteilung oder Migration verläuft; (3) in den Erwachsenen Darm, wo polarisierte Membrandomänen (Abbildung 1 bestehen). In der expandierenden Post-mitotische Larven Epithel, de Novo Membran polarisiert Biogenese kann somit von polarisierten Gewebe Morphogenese, die nicht in den meisten in Vivo und in Vitro epithelialen Polarität Modellen möglich ist, getrennt werden einschließlich derjenigen mit einzelligen Auflösung (z. B. die 3D MDCK Zyste Modell8). Mit Kennzeichnung für andere Komponenten, diese Einstellung bietet die Möglichkeit (vor allem bei den L1 Larvenstadium wenn Zellen einen höheren Anteil von Zytoplasma/Kern haben), die intrazellulären Veränderungen zu unterscheiden, die speziell für polarisiert Membran Biogenese ( z.B. die Neuausrichtung der Menschenhandel Trajektorien) von denen begleitend für polarisierte Zellteilung und Migration erforderlich.
Die genetische Vielfalt von C. Elegans ist bekannt25und macht es ein leistungsfähiges Modell-System für die molekulare Analyse von biologischen Fragen. Eine Studie über die Morphogenese, kann zum Beispiel mit einem Wildtyp Stamm, eine transgene Sorte beginnen wo die Struktur von Interesse (z.B. eine Membran) mit einem fluoreszierenden Marker oder einen Verlust oder Gewinn-of-Function-Mutanten mit einem Defekt in diesem gekennzeichnet ist Struktur. Eine typische reverse genetische Studie kann eine Mutante, wo das gen des Interesses gelöscht wird, in die Keimbahn (z.B. durch eine gezielte Löschung), geändert durch Mutagenese (in der Regel produzieren Punktmutationen mit Verlust, Minderung oder Gewinn an Funktion generieren des Gens) oder wo seine Abschrift von RNAi reduziert. Die Leichtigkeit der RNAi durch Fütterung in C. Elegans26 eignet sich auch für die Gestaltung der gezielten Bildschirme, die eine größere Gruppe von Genen von Interesse zu untersuchen. Eine genetische Modellorganismus wohl größte Stärke ist die Fähigkeit, in Vivo vorwärts Bildschirme (z.B. Mutagenese, systematische oder genomweiten RNAi-Bildschirme) durchzuführen, die eine unvoreingenommene Untersuchung über die molekulare Ursache für ein Phänotyp der erlauben Interesse. Zum Beispiel eine unvoreingenommene visuelle C. Elegans RNAi Tubulogenesis Bildschirm, beginnend mit einer transgenen Tieres mit ERM-1 benannt apikalen Membranen, entdeckte eine faszinierende reversible Darm Polarität Konvertierung und ektopische Lumen Phänotyp, verwendet hier als Beispiel für diese Art der Analyse. Dieser Bildschirm identifiziert die Erschöpfung der Glykosphingolipide (GSLs; obligat Membranlipide, über ihre GLS-biosynthetischen Enzyme identifiziert) und Bestandteile des Vesikels Mantel Clathrin und die AP-1-Adapter als die spezifischen molekularen Defekte verursachen diese Polarität Konvertierung Phänotyp, Queues dadurch charakterisieren diesen Menschenhandel Moleküle als in Vivo für die apikale Membran Polarität und Lumen Positionierung12,13. Beim Starten mit einer bestimmten genetischen Mutation/Morphogenese Phänotyp können solche Bildschirme (oder einzelne genetische/RNAi Interaktion Experimente) auch funktionelle Interaktion zwischen zwei oder mehreren Genen von Interesse (siehe begleitende Papier auf die Ausscheidungsorgane untersuchen Kanal für ein Beispiel einer solchen Analyse)2. Dieses Protokoll konzentriert sich auf RNAi bietet, neben seiner Fähigkeit, das Gen direkt zu identifizieren, deren Verlust den Phänotyp in vorwärts-Bildschirme, verursacht, spezifische Vorteile für die Analyse der Morphogenese. Da Genprodukte Regie Morphogenese oft in einer Dosis-abhängigen Weise arbeiten, ist RNAi in der Regel erfolgreich bei der Generierung ein Spektrum von Phänotypen. Die Möglichkeit, informative teilweise Verlustfunktion Phänotypen erzeugen hilft auch zur Behebung des Problems, dass die Mehrheit der wichtigen Tubulogenesis Gene entscheidend sind und dass ihre Verluste Sterilität und frühen embryonalen Tödlichkeit verursachen. Dieses Protokoll enthält bedingte RNAi-Strategien, um diese Schwierigkeit zu überwinden und zeigt Wege zu einer Generation von einem breiteren Spektrum von Phänotypen, wie z. B. ein Allel Serie von Mutagenese zu optimieren.

<table border="1" fo:keep-together.within-page="1" fo:keep-with-next.within-page="always">
	<tbody>
		<tr >
			<td>Antibody staining</td>
			<td></td>
			<td></td>
			<td></td>
		</tr>
		<tr >
			<td>poly-L-lysine</td>
			<td>Sigma</td>
			<td>P5899</td>
			<td></td>
		</tr>
		<tr >
			<td>Methanol</td>
			<td>Fisher Scientific</td>
			<td>A452-4</td>
			<td></td>
		</tr>
		<tr >
			<td>Acetone</td>
			<td>Fisher Scientific</td>
			<td>A949SK-4</td>
			<td></td>
		</tr>
		<tr >
			<td>Tween</td>
			<td>Fisher Scientific</td>
			<td>50-213-612</td>
			<td></td>
		</tr>
		<tr >
			<td>Permount</td>
			<td>Fisher Scientific</td>
			<td>SP15-100</td>
			<td></td>
		</tr>
		<tr >
			<td>Powdered milk</td>
			<td>Sigma</td>
			<td>MT409-1BTL</td>
			<td></td>
		</tr>
		<tr >
			<td>Primary antibodies</td>
			<td></td>
			<td></td>
			<td></td>
		</tr>
		<tr >
			<td>MH27 (mouse)</td>
			<td></td>
			<td></td>
			<td>Concentration: 1:20 Resources: Developmental Studies Hybridoma Bank.</td>
		</tr>
		<tr >
			<td>MH33 (mouse)</td>
			<td></td>
			<td></td>
			<td>Concentration: 1:10 Resources: Developmental Studies Hybridoma Bank.</td>
		</tr>
		<tr >
			<td>anti-ICB4 (rabbit)</td>
			<td></td>
			<td></td>
			<td>Concentration: 1:5 Resources: A gift from MariodeBono (Medical Research Council, England)</td>
		</tr>
		<tr >
			<td>anti-PAR-3 (rabbit)</td>
			<td></td>
			<td></td>
			<td>Concentration: 1:50 Resources: A gift from Kenneth J. Kemphues (Cornell University)</td>
		</tr>
		<tr >
			<td>Secondary antibodies</td>
			<td></td>
			<td></td>
			<td></td>
		</tr>
		<tr >
			<td>Alexa Floor 568 (anti-rabbit)</td>
			<td>ABCam</td>
			<td>AB175471</td>
			<td>Concentration: 1:200</td>
		</tr>
		<tr >
			<td>Cy5 (anti-mouse)</td>
			<td>Life technologies</td>
			<td>A10524</td>
			<td>Concentration: 1:200</td>
		</tr>
		<tr >
			<td>TRITC (anti-rabbit)</td>
			<td>Invitrogen</td>
			<td>T2769</td>
			<td>Concentration: 1:200</td>
		</tr>
		<tr >
			<td>FITC (anti-mouse)</td>
			<td>Sigma</td>
			<td>F9006</td>
			<td>Concentration: 1:100</td>
		</tr>
		<tr >
			<td>Labeled chemicals</td>
			<td></td>
			<td></td>
			<td></td>
		</tr>
		<tr >
			<td>Texas Red-Phalloidin</td>
			<td></td>
			<td></td>
			<td>Concentration: 1:100 Resources: Molecular Probes-T7471</td>
		</tr>
		<tr >
			<td>Materials</td>
			<td></td>
			<td></td>
			<td></td>
		</tr>
		<tr >
			<td>Vacuum Grease Silicone</td>
			<td>Beckman</td>
			<td>335148</td>
			<td></td>
		</tr>
		<tr >
			<td>Microscope slides</td>
			<td>Fisher Scientific</td>
			<td>4448</td>
			<td></td>
		</tr>
		<tr >
			<td>Microscope coverslips (22x22-1)</td>
			<td>Fisher Scientific</td>
			<td>12-542-B</td>
			<td></td>
		</tr>
		<tr >
			<td>C. elegans related</td>
			<td></td>
			<td></td>
			<td>see reference29 for standardC. elegans culture and maintenance procedures.</td>
		</tr>
		<tr >
			<td>LB Medium and plates</td>
			<td></td>
			<td></td>
			<td>see reference29 for protocols.</td>
		</tr>
		<tr >
			<td>Tryptone</td>
			<td>Acros Organics</td>
			<td>611845000</td>
			<td></td>
		</tr>
		<tr >
			<td>Yeast Extract</td>
			<td>BD Biosciences</td>
			<td>212750</td>
			<td></td>
		</tr>
		<tr >
			<td>NaCl</td>
			<td>Sigma</td>
			<td>S7653</td>
			<td></td>
		</tr>
		<tr >
			<td>Bacto Agar</td>
			<td>BD Biosciences</td>
			<td>214040</td>
			<td></td>
		</tr>
		<tr >
			<td>Ampicillin</td>
			<td>Sigma</td>
			<td>A0116</td>
			<td></td>
		</tr>
		<tr >
			<td>Tetracycline</td>
			<td>Fisher Scientific</td>
			<td>BP912</td>
			<td></td>
		</tr>
		<tr >
			<td>M9 Medium</td>
			<td></td>
			<td></td>
			<td>see reference29 for protocols.</td>
		</tr>
		<tr >
			<td>NaCl</td>
			<td>Sigma</td>
			<td>S7653</td>
			<td></td>
		</tr>
		<tr >
			<td>KH2PO4</td>
			<td>Sigma</td>
			<td>P0662</td>
			<td></td>
		</tr>
		<tr >
			<td>Na2HPO4</td>
			<td>Sigma</td>
			<td>S7907</td>
			<td></td>
		</tr>
		<tr >
			<td>MgSO4</td>
			<td>Sigma</td>
			<td>M2773</td>
			<td></td>
		</tr>
		<tr >
			<td>NGM plates</td>
			<td></td>
			<td></td>
			<td>see reference29 for protocols.</td>
		</tr>
		<tr >
			<td>NaCl</td>
			<td>Sigma</td>
			<td>S7653</td>
			<td></td>
		</tr>
		<tr >
			<td>Peptone</td>
			<td>BD Biosciences</td>
			<td>211677</td>
			<td></td>
		</tr>
		<tr >
			<td>Tryptone</td>
			<td>Acros Organics</td>
			<td>611845000</td>
			<td></td>
		</tr>
		<tr >
			<td>Bacto Agar</td>
			<td>BD Biosciences</td>
			<td>214040</td>
			<td></td>
		</tr>
		<tr >
			<td>MgSO4</td>
			<td>Sigma</td>
			<td>M2773</td>
			<td></td>
		</tr>
		<tr >
			<td>CaCl2</td>
			<td>Sigma</td>
			<td>C3881</td>
			<td></td>
		</tr>
		<tr >
			<td>Cholesterol</td>
			<td>Sigma</td>
			<td>C8667</td>
			<td></td>
		</tr>
		<tr >
			<td>K2HPO4</td>
			<td>Sigma</td>
			<td>P3786</td>
			<td></td>
		</tr>
		<tr >
			<td>KH2PO4</td>
			<td>Sigma</td>
			<td>P0662</td>
			<td></td>
		</tr>
		<tr >
			<td>RNAi plates</td>
			<td></td>
			<td></td>
			<td>see reference30 for protocols.</td>
		</tr>
		<tr >
			<td>NaCl</td>
			<td>Sigma</td>
			<td>S7653</td>
			<td></td>
		</tr>
		<tr >
			<td>Peptone</td>
			<td>BD Biosciences</td>
			<td>211677</td>
			<td></td>
		</tr>
		<tr >
			<td>Tryptone</td>
			<td>Acros Organics</td>
			<td>611845000</td>
			<td></td>
		</tr>
		<tr >
			<td>Bacto Agar</td>
			<td>BD Biosciences</td>
			<td>214040</td>
			<td></td>
		</tr>
		<tr >
			<td>MgSO4</td>
			<td>Sigma</td>
			<td>M2773</td>
			<td></td>
		</tr>
		<tr >
			<td>CaCl2</td>
			<td>Sigma</td>
			<td>C3881</td>
			<td></td>
		</tr>
		<tr >
			<td>Cholesterol</td>
			<td>Sigma</td>
			<td>C8667</td>
			<td></td>
		</tr>
		<tr >
			<td>K2HPO4</td>
			<td>Sigma</td>
			<td>P3786</td>
			<td></td>
		</tr>
		<tr >
			<td>KH2PO4</td>
			<td>Sigma</td>
			<td>P0662</td>
			<td></td>
		</tr>
		<tr >
			<td>IPTG</td>
			<td>US Biological</td>
			<td>I8500</td>
			<td></td>
		</tr>
		<tr >
			<td>Carbenicillin</td>
			<td>Fisher Scientific</td>
			<td>BP2648</td>
			<td></td>
		</tr>
		<tr >
			<td>NaOH</td>
			<td>Fisher Scientific</td>
			<td>SS266-1</td>
			<td></td>
		</tr>
		<tr >
			<td>Sodium hypochlorite</td>
			<td>Fisher Scientific</td>
			<td>50371500</td>
			<td></td>
		</tr>
		<tr >
			<td>Bacteria</td>
			<td></td>
			<td></td>
			<td></td>
		</tr>
		<tr >
			<td>OP50 bacteria</td>
			<td>CGC</td>
			<td></td>
			<td></td>
		</tr>
		<tr >
			<td>HT115 bacteria</td>
			<td>CGC</td>
			<td></td>
			<td></td>
		</tr>
		<tr >
			<td>Genome-wide RNAi libraries Ahringer genome-wide RNAi feeding library (ref 30,49,50)</td>
			<td>Source BioScience</td>
			<td></td>
			<td></td>
		</tr>
		<tr >
			<td>C. elegans ORF-RNAi feeding library (ref51)</td>
			<td>Source BioScience</td>
			<td></td>
			<td></td>
		</tr>
		<tr >
			<td>Imaging related</td>
			<td></td>
			<td></td>
			<td></td>
		</tr>
		<tr >
			<td>Sodium azide</td>
			<td>Fisher Scientific</td>
			<td>BP9221-500</td>
			<td></td>
		</tr>
		<tr >
			<td>Equipment</td>
			<td></td>
			<td></td>
			<td></td>
		</tr>
		<tr >
			<td>dissecting microscope</td>
			<td>Nikon</td>
			<td>SMZ-U</td>
			<td></td>
		</tr>
		<tr >
			<td>dissecting microscope equipped with a high-power stereo fluorescence attachment (Kramer Scientific), CCD camera with Q capture software and X-Cite fluorescent lamp (Photonic Solutions)</td>
			<td>Olympus</td>
			<td>SZX12</td>
			<td></td>
		</tr>
		<tr >
			<td>Laser-scanning confocal microscope</td>
			<td>Leica Microsystem</td>
			<td>TCS SL</td>
			<td></td>
		</tr>
		<tr >
			<td>laser-scanning confocal mounted on an ECLIPSE Ti-E inverted microscope</td>
			<td>Nikon</td>
			<td>C2</td>
			<td></td>
		</tr>
	</tbody>
</table>

the c. elegans intestine as a model for intercellular lumen morphogenesis and in vivo polarized membrane biogenesis at the single-cell level: labeling by antibody staining, rnai loss-of-function analysis and imaging

Vielzellige Röhren, Grundeinheiten der alle inneren Organe bestehen aus polarisierten epithelialen oder endothelialen Zellen mit apikalen Membranen Futter die Lumen und basolateralen Membranen Kontakt mit einander und/oder die extrazelluläre Matrix. Wie diese unverwechselbare Membran Asymmetrie ist eingerichtet und unterhalten während Orgel Morphogenese ist immer noch eine ungelöste Frage der Zellbiologie. Dieses Protokoll beschreibt den Darm C. Elegans als Modell für die Analyse von polarisierten Membran Biogenese während Rohr Morphogenese, mit Betonung der apikalen Membran und Lumen Biogenese. C. Elegans zwanzig-Zellen einschichtig Darmepithels ist in ein einfaches bilateral symmetrisch Rohr, schönem Analyse auf eine einzelne Zelle angeordnet. Polarisierung der Membran tritt begleitend mit polarisierten Zellteilung und Migration während der frühen Embryogenese, aber de Novo polarisiert Membran Biogenese während Larven Wachstums fortgesetzt wird, wenn die Zellen nicht mehr vermehren und bewegen. Diese Einstellung erlaubt es, subzelluläre Veränderungen zu trennen, die gleichzeitig diese verschiedenen polarisierende Prozesse, schwierig vermitteln, bei den meisten Modellen der Polarität zu unterscheiden. Apikalen-basolateralen Membran-, Knoten-, Zellskelett- und Endomembrane Komponenten können beschriftet und während der gesamten Entwicklung von Fusionsproteinen GFP verfolgt oder von in Situ Antikörper Färbung bewertet. Zusammen mit den Organismus genetische Vielseitigkeit bietet C. Elegans Darm somit eine einzigartige in Vivo Modell für die visuelle, Entwicklungs-, und molekulare genetische Analyse der polarisierten Membran und Rohr Biogenese. Die spezifische (alle standard) hier beschriebenen Methoden umfassen wie: beschriften Sie Darm subzelluläre Komponenten durch Antikörper Färbung; Gene, die im polarisierten Membran Biogenese Verlustfunktion-Studien, die in der Regel wesentlich Tubulogenesis Gene angepasst zu analysieren; Polarität Mängel während der verschiedenen Entwicklungsphasen zu beurteilen; Phänotypen durch Epifluoreszenz, differential Interferenz-Kontrast (DIC) und konfokalen Mikroskopie zu interpretieren; optische Mängel zu quantifizieren. Dieses Protokoll kann jeder der Beteiligten oft hoch konservierte Moleküle zu analysieren in epithelialen Polarität, Membran Biogenese, Rohr- und Lumen Morphogenese angepasst werden.

Dieses Protokoll beschreibt die Molekular Analyse und Visualisierung von polarisierten Membran Biogenese und Lumen Morphogenese in C. Elegans Darm, auf die einzelne Zelle und subzellulärer Ebene. Die zwanzig-Zellen einschichtig C. Elegans Darm wird durch gezielte Zellteilung und Migration in der Mitte Embryogenese gebildet. In dieser Zeit, polarisierte Membran, die Domänen etabliert, doch de Novo polarisierte Membran Biogenese setzt sich in den Reifen aber Aus...

Watch this Scientific Journal Video about The C. elegans Intestine As a Model for Intercellular Lumen Morphogenesis and In Vivo Polarized Membrane Biogenesis at the Single-cell Level: Labeling by Anti

The C. elegans Intestine As a Model for Intercellular Lumen Morphogenesis and In Vivo Polarized Membrane Biogenesis at the Single-cell Level: Labeling by Antibody Staining, RNAi Loss-of-function Analy

Die transparente C. Elegans Darm kann als eine"in-Vivo Gewebe Kammer" für das Studium Apicobasal Membran und Lumen Biogenese einzellige und subzellulärer Ebene bei mehrzelligen Tubulogenesis dienen. Dieses Protokoll beschreibt die Standardbeschriftung kombinieren, Verlust der Funktion genetische/RNAi und mikroskopische Ansätze, diese Prozesse auf molekularer Ebene zu zergliedern.

C. Elegans Darm als ein Modell für die interzelluläre Lumen Morphogenese und In Vivo polarisiert Membrane Biogenesis Ebene der einzelligen: Kennzeichnung durch Antikörper Färbung, RNAi Verlustfunktion Analyse und Bildgebung

Multicellular tubes, fundamental units of all internal organs, are composed of polarized epithelial or endothelial cells, with apical membranes lining the ...

Research

JoVE Journal

Developmental Biology

The C. elegans Intestine As a Model for Intercellular Lumen Morphogenesis and In Vivo Polarized Membrane Biogenesis at the Single-cell Level: Labeling by Antibody Staining, RNAi Loss-of-function Analysis and Imaging

Tracking Cells in GFP-transgenic Zebrafish Using the Photoconvertible PSmOrange System

Tracking-Zellen in GFP-transgenen Zebrafisch Mit dem Photokonvertierbare PSmOrange-System

The rapid development of transparent zebrafish embryos (Danio rerio) in combination with fluorescent labelings of cells and tissues allows visualizing ...

Forschung

Entwicklungsbiologie

Imaging Cleared Embryonic and Postnatal Hearts at Single-cell Resolution

Imaging Gelöscht Embryonale und postnatale Hearts bei Einzelzell-Auflösung

Single clonal tracing and analysis at the whole-heart level can determine cardiac progenitor cell behavior and differentiation during cardiac development, ...

Methods to Examine the Lymph Gland and Hemocytes in Drosophila Larvae

Methods to Examine the Lymph Gland and Hemocytes in Drosophila Larvae

Methoden, um die Lymphdrüsen und Blutzellen zu prüfen, die in<em&gt; Drosophila</em&gt; Larvae

Many parallels exist between the Drosophila and mammalian hematopoietic systems, even though Drosophila lack the lymphoid lineage that characterize ...

Spatial and Temporal Analysis of Active ERK in the C. elegans Germline

Spatial and Temporal Analysis of Active ERK in the C. elegans Germline

Räumliche und zeitliche Analyse von Active ERK in der<em&gt; C. elegans</em&gt; Germline

The evolutionarily conserved&#160;extracellular signal transducing RTK-RAS-ERK pathway is an important kinase-signaling cascade that controls multiple ...

The C. elegans Excretory Canal as a Model for Intracellular Lumen Morphogenesis and In Vivo Polarized Membrane Biogenesis in a Single Cell: labeling by GFP-fusions, RNAi Interaction Screen and Imaging

The C. elegans Excretory Canal as a Model for Intracellular Lumen Morphogenesis and In Vivo Polarized Membrane Biogenesis in a Single Cell: labeling by GFP-fusions, RNAi Interaction Screen and Imaging

C. Elegans Excretory Kanal als Modell für die intrazelluläre Lumen Morphogenese und In Vivo polarisiert Membrane Biogenesis in einer einzelnen Zelle: Kennzeichnung von GFP-Fusionen, RNAi Interaktion Bildschirm und Imaging

The four C. elegans excretory canals are narrow tubes extended through the length of the animal from a single cell, with almost equally far extended ...

Dissection and Immunofluorescent Staining of Mushroom Body and Photoreceptor Neurons in Adult Drosophila melanogaster Brains

Dissection and Immunofluorescent Staining of Mushroom Body and Photoreceptor Neurons in Adult Drosophila melanogaster Brains

Dissektion, Immunofluorescent Färbung der Pilz Körper und Photorezeptor Neuronen im Gehirn Erwachsener Taufliege melanogaster

Nervous system development involves a sequential series of events that are coordinated by several signaling pathways and regulatory networks. Many of the ...

Application of RNAi and Heat-shock-induced Transcription Factor Expression to Reprogram Germ Cells to Neurons in C. elegans

Application of RNAi and Heat-shock-induced Transcription Factor Expression to Reprogram Germ Cells to Neurons in C. elegans

Anwendung von RNAi und Hitze-Schock-induzierte Transkription Faktor Ausdruck zu programmieren Keimzellen Neuronen in C. elegans

Studying the cell biological processes during converting the identities of specific cell types provides important insights into mechanism that maintain ...

CRISPR-mediated Loss of Function Analysis in Cerebellar Granule Cells Using In Utero Electroporation-based Gene Transfer

CRISPR-mediated Loss of Function Analysis in Cerebellar Granule Cells Using In Utero Electroporation-based Gene Transfer

CRISPR-vermittelten Verlust der Funktionsanalyse in zerebelläre Untermodul Zellen mit In Utero Elektroporation-basierte Gentransfer

Brain malformation is often caused by genetic mutations. Deciphering the mutations in patient-derived tissues has identified potential causative factors ...

Assessing Lysosomal Alkalinization in the Intestine of Live Caenorhabditis elegans

Assessing Lysosomal Alkalinization in the Intestine of Live Caenorhabditis elegans

Beurteilung der lysosomalen Alkalisierung in den Darm von Leben Caenorhabditis elegans

The nematode Caenorhabditis elegans (C. elegans) is a model system that is widely used to study longevity and developmental pathways. Such studies are ...

Cell Cycle Analysis in the C. elegans Germline with the Thymidine Analog EdU

Cell Cycle Analysis in the C. elegans Germline with the Thymidine Analog EdU

Cell Cycle Analysis in C. Elegans Keimbahn mit Thymidin-Analog-EdU

Cell cycle analysis in eukaryotes frequently utilizes chromosome morphology, expression and/or localization of gene products required for various phases ...