Name: synthesis of infectious bacteriophages in an e. coli-based cell-free expression system
Uploaded: 2017-08-17T15:00:00
Description: Watch this Scientific Journal Video about Synthesis of Infectious Bacteriophages in an E. coli-based Cell-free Expression System at JoVE.com

Dit materiaal is gebaseerd op werk gesteund door het Office of Naval Research award nummer N00014-13-1-0074 (V.N.), het Human Frontier Science Program toekennen nummer RGP0037/2015 (V.N.) en de Binationale Science Foundation toekennen 2014400 (V.N.).

Opmerking: de volgende stappen van de versterking en extractiemethode zijn grotendeels generaliseerbaar voor vele double-stranded DNA bacteriofaag, bijvoorbeeld bacteriofaag T7, enterobacteria faag T4 of enterobacteria faag λ (L). Ze worden voornamelijk gebruikt voor een bacteriofaag waarvan genoom niet beschikbaar voor aankoop uit commerciële bronnen is.
 1. versterking van phage Opmerking: de single-plaque, multi cycle (SPMC) faag productietechniek is g...

<ol>
	<li>Carlson, E. D., Gan, R., Hodgman, C. E., Jewett, M. C. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/query.fcgi?db=PubMed&cmd=Search&doptcmdl=Citation&defaultField=Title+Word&term=Cell-free+protein+synthesis:+Applications+come+of+age.">Cell-free protein synthesis: Applications come of age.</a> Biotechnol Adv. , (2011).</li><li>Hodgman, C. E., Jewett, M. C. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/query.fcgi?db=PubMed&cmd=Search&doptcmdl=Citation&defaultField=Title+Word&term=Cell-free+synthetic+biology:+Thinking+outside+the+cell.">Cell-free synthetic biology: Thinking outside the cell.</a> Metab Eng. , (2011).</li><li>Caschera, F., Noireaux, V. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/query.fcgi?db=PubMed&cmd=Search&doptcmdl=Citation&defaultField=Title+Word&term=Synthesis+of+2.3+mg/mL+of+protein+with+an+all+Escherichia+coli+cell-free+transcription-translation+system.">Synthesis of 2.3 mg/mL of protein with an all Escherichia coli cell-free transcription-translation system.</a> Biochimie. 99, 162-168 (2014).</li><li>Shin, J., Noireaux, V. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/query.fcgi?db=PubMed&cmd=Search&doptcmdl=Citation&defaultField=Title+Word&term=An+E.+coli+cell-free+expression+toolbox:+application+to+synthetic+gene+circuits+and+artificial+cells.">An E. coli cell-free expression toolbox: application to synthetic gene circuits and artificial cells.</a> ACS Synth Biol. 1 (1), 29-41 (2012).</li><li>Chemla, Y., Ozer, E., Schlesinger, O., Noireaux, V., Alfonta, L. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/query.fcgi?db=PubMed&cmd=Search&doptcmdl=Citation&defaultField=Title+Word&term=Genetically+expanded+cell-free+protein+synthesis+using+endogenous+pyrrolysyl+orthogonal+translation+system.">Genetically expanded cell-free protein synthesis using endogenous pyrrolysyl orthogonal translation system.</a> Biotechnol Bioeng. , (2015).</li><li>Hong, S. H., Kwon, Y. C., Jewett, M. C. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/query.fcgi?db=PubMed&cmd=Search&doptcmdl=Citation&defaultField=Title+Word&term=Non-standard+amino+acid+incorporation+into+proteins+using+Escherichia+coli+cell-free+protein+synthesis.">Non-standard amino acid incorporation into proteins using Escherichia coli cell-free protein synthesis.</a> Frontiers in Chemistry. 2, (2014).</li><li>Noireaux, V., Bar-Ziv, R., Libchaber, A. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/query.fcgi?db=PubMed&cmd=Search&doptcmdl=Citation&defaultField=Title+Word&term=Principles+of+cell-free+genetic+circuit+assembly.">Principles of cell-free genetic circuit assembly.</a> Proc Natl Acad Sci U S A. 100 (22), 12672-12677 (2003).</li><li>Sun, Z. Z., Yeung, E., Hayes, C. A., Noireaux, V., Murray, R. M. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/query.fcgi?db=PubMed&cmd=Search&doptcmdl=Citation&defaultField=Title+Word&term=Linear+DNA+for+Rapid+Prototyping+of+Synthetic+Biological+Circuits+in+an+Escherichia+coli+Based+TX-TL+Cell-Free+System.">Linear DNA for Rapid Prototyping of Synthetic Biological Circuits in an Escherichia coli Based TX-TL Cell-Free System.</a> Acs Synthetic Biology. 3 (6), 387-397 (2014).</li><li>Takahashi, M. K., et al. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/query.fcgi?db=PubMed&cmd=Search&doptcmdl=Citation&defaultField=Title+Word&term=Characterizing+and+prototyping+genetic+networks+with+cell-free+transcription-translation+reactions.">Characterizing and prototyping genetic networks with cell-free transcription-translation reactions.</a> Methods. , (2015).</li><li>Shin, J., Jardine, P., Noireaux, V. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/query.fcgi?db=PubMed&cmd=Search&doptcmdl=Citation&defaultField=Title+Word&term=Genome+Replication,+Synthesis,+and+Assembly+of+the+Bacteriophage+T7+in+a+Single+Cell-Free+Reaction.">Genome Replication, Synthesis, and Assembly of the Bacteriophage T7 in a Single Cell-Free Reaction.</a> ACS Synthetic Biology. 1 (9), 408-413 (2012).</li><li>Garamella, J., Marshall, R., Rustad, M., Noireaux, V. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/query.fcgi?db=PubMed&cmd=Search&doptcmdl=Citation&defaultField=Title+Word&term=The+All+E.+coli+TX-TL+Toolbox+2.0:+A+Platform+for+Cell-Free+Synthetic+Biology.">The All E. coli TX-TL Toolbox 2.0: A Platform for Cell-Free Synthetic Biology.</a> ACS Synth Biol. , (2016).</li><li>Karzbrun, E., Shin, J., Bar-Ziv, R. H., Noireaux, V. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/query.fcgi?db=PubMed&cmd=Search&doptcmdl=Citation&defaultField=Title+Word&term=Coarse-grained+dynamics+of+protein+synthesis+in+a+cell-free+system.">Coarse-grained dynamics of protein synthesis in a cell-free system.</a> Phys Rev Lett. 106 (4), 048104 (2011).</li><li>Daube, S. S., Arad, T., Bar-Ziv, R. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/query.fcgi?db=PubMed&cmd=Search&doptcmdl=Citation&defaultField=Title+Word&term=Cell-free+co-synthesis+of+protein+nanoassemblies:+tubes,+rings,+and+doughnuts.">Cell-free co-synthesis of protein nanoassemblies: tubes, rings, and doughnuts.</a> Nano Lett. 7 (3), 638-641 (2007).</li><li>Chen, X., et al. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/query.fcgi?db=PubMed&cmd=Search&doptcmdl=Citation&defaultField=Title+Word&term=An+immunoblot+assay+reveals+that+bacteriophage+T4+thymidylate+synthase+and+dihydrofolate+reductase+are+not+virion+proteins.">An immunoblot assay reveals that bacteriophage T4 thymidylate synthase and dihydrofolate reductase are not virion proteins.</a> J Virol. 69 (4), 2119-2125 (1995).</li><li>Sun, Z. Z., et al. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/query.fcgi?db=PubMed&cmd=Search&doptcmdl=Citation&defaultField=Title+Word&term=Protocols+for+implementing+an+Escherichia+coli+based+TX-TL+cell-free+expression+system+for+synthetic+biology.">Protocols for implementing an Escherichia coli based TX-TL cell-free expression system for synthetic biology.</a> J Vis Exp. (79), e50762 (2013).</li><li>Shin, J. N. V. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/query.fcgi?db=PubMed&cmd=Search&doptcmdl=Citation&defaultField=Title+Word&term=Efficient+cell-free+expression+with+the+endogenous+E.+coli+RNA+polymerase+and+sigma+factor+70.">Efficient cell-free expression with the endogenous E. coli RNA polymerase and sigma factor 70.</a> J Biol Eng. , (2010).</li><li>Caschera, F., Noireaux, V. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/query.fcgi?db=PubMed&cmd=Search&doptcmdl=Citation&defaultField=Title+Word&term=Preparation+of+amino+acid+mixtures+for+cell-free+expression+systems.">Preparation of amino acid mixtures for cell-free expression systems.</a> Biotechniques. 58 (1), 40-43 (2015).</li><li>Minton, A. P. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/query.fcgi?db=PubMed&cmd=Search&doptcmdl=Citation&defaultField=Title+Word&term=How+can+biochemical+reactions+within+cells+differ+from+those+in+test+tubes.">How can biochemical reactions within cells differ from those in test tubes.</a> J Cell Sci. 119, 2863-2869 (2006).</li><li>Minton, A. P. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/query.fcgi?db=PubMed&cmd=Search&doptcmdl=Citation&defaultField=Title+Word&term=Implications+of+macromolecular+crowding+for+protein+assembly.">Implications of macromolecular crowding for protein assembly.</a> Curr Opin Struct Biol. 10 (1), 34-39 (2000).</li><li>Zimmerman, S. B., Minton, A. P. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/query.fcgi?db=PubMed&cmd=Search&doptcmdl=Citation&defaultField=Title+Word&term=Macromolecular+crowding:+biochemical,+biophysical,+and+physiological+consequences.">Macromolecular crowding: biochemical, biophysical, and physiological consequences.</a> Annu Rev Biophys Biomol Struct. 22, 27-65 (1993).</li></ol>

Na de techniek in Chen, et al.. 14 voor SPMC, een cruciale stap is bij het bepalen van de juiste voorwaarden voor superinfectie bereikt. De parameter waarmee een host-stam kunnen weerstaan superinfectie nauwst is vaak de beginconcentratie van de bacteriofaag infecteren. De gastheer cellen moeten in logaritmische groeifase vóór eerste infectie met een zeer kleine hoeveelheid phage. Uiteindelijk, de bacteriofaag logaritmische groei ook zullen bereiken en het doel is dat de nummers van de ...

In het afgelopen decennium, is de cel-vrije expressie-technologie ontworpen voor adres nieuwe toepassingen in de opkomende multidisciplinair onderzoek gebieden verband houden met synthetische en kwantitatieve biologie. Oorspronkelijk gebruikt om eiwitten onafhankelijk van een levend organisme, zijn nieuwe cel-vrije TXTL systemen ontwikkeld voor zowel fundamentele en toegepaste wetenschappen1,2, aanzienlijk uitbreiding van het toepassingsgebied van deze technologie. De nieuwe generatie van TXTL platforms is ontworpen als gebruikersvriendelijke, efficiënter (bereiken eiwitsynthese in batch mode32 mg/mL), meer veelzijdig op het niveau van transcriptie4en modulaire om gemakkelijk te integreren roman natuurlijke of synthetische functies die de mogelijkheden van de bestaande biologische systemen5,6uitbreiden. In het bijzonder, cel-vrije TXTL systemen geworden handig voor de rapid prototyping van genetische programma's, zoals regelgevende elementen of kleine genetische circuits7,8,9, door het verminderen van de ontwerp-bouw-test Fietsen naar een paar dagen. Opmerkelijk, de nieuwe TXTL systemen zijn ook geschikt voor de verwerking van grote DNA-programma's zoals de complete synthese van coliphages10,11, waaruit blijkt sterk genoeg optredens ter ondersteuning van de reconstitutie van actieve genomic DNA gecodeerd levende wezens.
TXTL systemen presenteren veel technische voordelen ten opzichte van traditionele in vitro constructieve biochemische tests. Het proces van genexpressie verbindt cel-vrije TXTL met het eindproduct in een beperkte en open omgeving, in tegenstelling tot het complexe cytoplasma van een levende cel. TXTL maakt gebruik van DNA te reconstrueren biochemische systemen in vitro, die met de moderne technieken van DNA vergadering, is betaalbaar en snel naast niet kieskeurig eiwit zuivering stappen vereist. Cel-vrije meningsuiting biedt directe toegang tot de meeste van de componenten in de biochemische reacties, waardoor een diepere dissectie van de moleculaire interacties12. In de reactie van een TXTL, kan een wijzigen de biochemische en biofysische instellingen wil, die bijna onmogelijk in een levende cel is. Gezien deze voordelen en recente verbeteringen, wordt de TXTL-technologie steeds meer en meer populair als een alternatief platform voor synthetische en kwantitatieve biologie. Hoewel de wetenschappelijke wereld met behulp van TXTL snel groeiende is en TXTL een standaardtechnologie in studierichtingen Bio-ingenieur wordt, is het essentieel om te begrijpen hoe met dergelijke platforms te ontwikkelen passende praktijken in verband met de uitvoering van TXTL reacties en de interpretatie van de resultaten.
In dit artikel beschrijven we hoe u met een al systeem van de TXTL van de E. coli synthetiseren, in één-pot-reacties, bacteriofagen van hun genoom11, zoals MS2 (RNA, 3.4 kb), ΦΧ174 (ssDNA, 5.4 kb), en T7 (dsDNA, 40 kb). We laten zien hoe het bedrag van bacteriofagen gesynthetiseerd wijzigingen met betrekking tot bepaalde biochemische-instellingen van de reacties (concentraties magnesium en kalium). Moleculaire verdringing, geëmuleerd via een scala van PEG 8000 concentraties, heeft een dramatisch effect op de bacteriofaag synthese over verschillende ordes van grootte. De realisatie van dergelijke grote biochemische systemen in één reageerbuis reacties die recapituleren gelijktijdig de processen van transcriptie, vertaling, en zelf-assemblage, is interessant voor het aanpakken van fundamentele kwesties in verband met biologie en biofysica 10 (genregulatie, zelf-assemblage), evenals voor ontwikkeling van toepassingen, zoals de herbestemming van phage functies om te bouwen van nieuwe nanostructuren13. Naast een praktische op TXTL voorzien we in methoden faag amplificatie, genoom extractie en zuivering en kwantificering van de bacteriofaag door de plaque-bepaling. De methoden die in dit manuscript gepresenteerd zijn geschikt voor onderzoekers die E. coli extract gebaseerd cel-vrije systemen gebruiken en zijn geïnteresseerd in bacteriofagen.
De protocollen gepresenteerd in dit werk kunnen worden samengevat als volgt: 1) Phage versterking (dag 1: bereiden van inoculatie cellen, dag 2: enkele plaque, meerdere faag groei, en concentratie en dag 3: zuivering van bacteriofaag), 2) Double-stranded genoom-DNA-extractie (fenol/chloroform extractie), en 3) cel-vrije faag reactie en titer experiment (dag 1: plaat van cellen van de gastheer en maak agar platen, dag 2: reactie cel-vrij en gastheer cel pre cultuur en dag 3: host cel cultuur en phage titer).

<table width="899">
	<colgroup>
		<col style="width:162pt" width="216" />
		<col style="width:168pt" width="224" />
		<col style="width:219pt" width="292" />
		<col style="width:125pt" width="167" />
	</colgroup>
	<tbody>
		<tr height="21" style="height:15.75pt">
			<td class="xl21" height="21" style="width:162pt;height:15.75pt" width="216">Ultracentrifugation tubes</td>
			<td class="xl21" style="width:168pt" width="224">Beckman Coulter</td>
			<td class="xl21" style="width:219pt" width="292">344057</td>
			<td class="xl20" style="width:125pt" width="167"></td>
		</tr>
		<tr height="21" style="height:15.75pt">
			<td class="xl21" height="21" style="height:15.75pt">Conical tubes</td>
			<td class="xl22" style="width:168pt" width="224">Falcon</td>
			<td class="xl21">352070</td>
			<td class="xl20"></td>
		</tr>
		<tr height="21" style="height:15.75pt">
			<td class="xl21" height="21" style="height:15.75pt">Gradient maker</td>
			<td class="xl21">BioComp Gradient Master</td>
			<td class="xl22" style="width:219pt" width="292">see Anal Biochem. 1985 Jul;148(1):254-9.</td>
			<td class="xl20"></td>
		</tr>
		<tr height="21" style="height:15.75pt">
			<td class="xl21" height="21" style="height:15.75pt">Syringe and Blunt Cannula</td>
			<td class="xl21">Monoject</td>
			<td class="xl21">8881513918 and 888202017</td>
			<td class="xl20"></td>
		</tr>
		<tr height="21" style="height:15.75pt">
			<td class="xl21" height="21" style="height:15.75pt">Wide-bore pipette tips</td>
			<td class="xl21">Fischerbrand</td>
			<td class="xl21">02-707-134</td>
			<td class="xl20"></td>
		</tr>
		<tr height="21" style="height:15.75pt">
			<td class="xl21" height="21" style="height:15.75pt">Plaque counter</td>
			<td class="xl21">New Brunswik Scientific</td>
			<td class="xl21">Colony Counter Model C-110</td>
			<td class="xl20"></td>
		</tr>
		<tr height="21" style="height:15.75pt">
			<td class="xl21" height="21" style="height:15.75pt">Culture tubes</td>
			<td class="xl22" style="width:168pt" width="224">Fischerbrand</td>
			<td class="xl21">14-961-33</td>
			<td class="xl20"></td>
		</tr>
		<tr height="21" style="height:15.75pt">
			<td class="xl21" height="21" style="height:15.75pt">Cell-free system</td>
			<td class="xl22" style="width:168pt" width="224">Mycroarray Inc</td>
			<td class="xl22" style="width:219pt" width="292">Mytxtl</td>
			<td class="xl20"></td>
		</tr>
		<tr height="21" style="height:15.75pt">
			<td class="xl17" height="21" style="width:162pt;height:15.75pt" width="216">BioComp Gradient Master</td>
			<td class="xl17" style="width:168pt" width="224">BioComp Instruments</td>
			<td class="xl17" style="width:219pt" width="292">Model 105ME</td>
			<td class="xl20"></td>
		</tr>
		<tr height="21" style="height:15.75pt">
			<td class="xl17" height="21" style="width:162pt;height:15.75pt" width="216">LB agar plate recipe</td>
			<td class="xl20"></td>
			<td class="xl20"></td>
			<td class="xl24" style="width:512pt" width="683">25 g/L Luria-Bertani medium (LB Broth, Miller - Fisher BioReagents product number BP1426) and 15 g/L Bacto-Agar solid (Brenton, Dickenson and Company - product number 214010).</td>
		</tr>
	</tbody>
</table>

synthesis of infectious bacteriophages in an e. coli-based cell-free expression system

Een nieuwe generatie van cel-vrije transcriptie-vertaling (TXTL) systemen, ontworpen om een grotere veelzijdigheid en modulariteit, bieden nieuwe mogelijkheden voor het uitvoeren van fundamentele en toegepaste wetenschappen in reageerbuis reacties. In het afgelopen decennium, cel-vrije TXTL geworden tot een krachtige techniek voor een breed scala aan roman multidisciplinair onderzoek gebieden gerelateerd aan kwantitatieve en synthetische biologie. De nieuwe TXTL-platforms zijn vooral handig om te bouwen en ondervragen biochemische systemen middels het uitvoeren van synthetische of natuurlijke gene circuits. In vitro TXTL heeft bewezen handig om snel een prototype regelgevende elementen en biologische netwerken alsmede over recapituleren moleculaire zelf-assemblage mechanismen gevonden in levende systemen. In dit artikel beschrijven we hoe besmettelijk bacteriofagen, zoals MS2 (RNA), ΦΧ174 (ssDNA), en T7 (dsDNA), volledig worden gesynthetiseerd uit hun genoom in één-pot reacties met behulp van een alle Escherichia coli, cel-vrije TXTL systeem. Synthese van de drie coliphages is gekwantificeerd aan de hand van de bepaling van de plaque. Laten we zien hoe de opbrengst van gesynthetiseerde bacteriofaag hangt af van de biochemische instellingen van de reacties. Moleculaire verdringing, geëmuleerd door middel van een gecontroleerde concentratie van PEG 8000, beïnvloedt de hoeveelheid gesynthetiseerde bacteriofagen bij beschikkingen van grootheden. Ook beschrijven we hoe de bacteriofagen versterken en hoe om te zuiveren van hun genoom. De set van protocollen en resultaten gepresenteerd in dit werk moet van belang zijn voor multidisciplinaire onderzoekers die betrokken zijn in de cel-vrij van synthetische biologie en studierichtingen Bio-ingenieur.

Laten we vier representatieve resultaten. In Figuur 1, presenteren wij een aantal negatieve controles om ervoor te zorgen dat de TXTL cel-vrij systeem en de phage DNA voorraden niet worden verontreinigd met levende cellen van E. coli . Wij verifiëren dat de TXTL cel-vrij systeem vrij van intact E. coli is cel besmetting door plating beide een leegte van genomic DNA (Figuur 1A en <strong class="...

Watch this Scientific Journal Video about Synthesis of Infectious Bacteriophages in an E. coli-based Cell-free Expression System at JoVE.com

Synthesis of Infectious Bacteriophages in an E. coli-based Cell-free Expression System

Synthese van besmettelijke bacteriofagen in een e-coli -gebaseerd systeem van cel-vrije expressie

Een nieuwe generatie van cel-vrije transcriptie-vertaling platforms is ontworpen voor de bouw van biochemische systemen in vitro middels het uitvoeren van gene circuits. In dit artikel beschrijven we hoe bacteriofagen, zoals MS2, ΦΧ174 en T7, worden gesynthetiseerd uit hun genoom met behulp van een alle E. coli cel-vrije TXTL systeem.

A new generation of cell-free transcription-translation (TXTL) systems, engineered to have a greater versatility and modularity, provide novel ...

Research

JoVE Journal

Bioengineering

Synthesis of Infectious Bacteriophages in an E. coli-based Cell-free Expression System

Bacterial Detection &amp; Identification Using Electrochemical Sensors

Bacterial Detection & Identification Using Electrochemical Sensors

Bacteriële Detection &amp; Identification gebruiken elektrochemische sensoren

Electrochemical  sensors are widely used for rapid and accurate measurement of blood glucose and  can be adapted for detection of a wide variety of ...

Synthesis of an Intein-mediated Artificial Protein Hydrogel

Synthese van een inteïne gemedieerde Kunstmatige Protein Hydrogel

We present the synthesis of a highly stable protein hydrogel mediated by a split-intein-catalyzed protein trans-splicing reaction. The building blocks of ...

An In Vitro Organ Culture Model of the Murine Intervertebral Disc

An In Vitro Organ Culture Model of the Murine Intervertebral Disc

Een<em&gt; In Vitro</em&gt; Organ Culture Model van het Muizen tussenwervelschijf

Intervertebral disc (IVD) degeneration is a significant contributor to low back pain. The IVD is a fibrocartilaginous joint that serves to transmit and ...

An Orbital Shaking Culture of Mammalian Cells in O-shaped Vessels to Produce Uniform Aggregates

Een cultuur van zoogdiercellen schudden in O-vormige schepen tot uniforme aggregaten orbitaal

Suspension cultures of mammalian cell aggregates are required for various applications in medical and biotechnological fields. The disposable bag-based ...

A Novel Surgical Technique As a Foundation for In Vivo Partial Liver Engineering in Rat

A Novel Surgical Technique As a Foundation for In Vivo Partial Liver Engineering in Rat

Een nieuwe chirurgische techniek als een fundament voor In Vivo gedeeltelijke lever Engineering in Rat

Organ engineering is a novel strategy to generate liver organ substitutes that can potentially be used in transplantation. Recently, in vivo liver ...

Live Cell Analysis of Shear Stress on Pseudomonas aeruginosa Using an Automated Higher-Throughput Microfluidic System

Live Cell Analysis of Shear Stress on Pseudomonas aeruginosa Using an Automated Higher-Throughput Microfluidic System

Cel analyse van Shear Stress voortleven Pseudomonas aeruginosa met behulp van een geautomatiseerde hoger-Throughput Microfluidic systeem

A higher-throughput microfluidic in vitro bioreactor coupled with fluorescence microscopy has been used to study bacterial biofilm growth and morphology, ...

Cell-free Protein Expression Using the Rapidly Growing Bacterium Vibrio natriegens

Cell-free Protein Expression Using the Rapidly Growing Bacterium Vibrio natriegens

Cel-vrije eiwit expressie met behulp van de snel groeiende bacterie Vibrio natriegens

The marine bacterium Vibrio natriegens has garnered considerable attention as an emerging microbial host for biotechnology due to its fast growth rate. A ...

A Multilayer Microfluidic Platform for the Conduction of Prolonged Cell-Free Gene Expression

Een Multilayer microfluidic platform voor de geleiding van langdurige cel-vrije genexpressie

The limitations of cell-based synthetic biology are becoming increasingly apparent as researchers aim to develop larger and more complex synthetic genetic ...

High-Throughput Identification of Resistance to Pseudomonas syringae pv. Tomato in Tomato using Seedling Flood Assay

High-Throughput Identification of Resistance to Pseudomonas syringae pv. Tomato in Tomato using Seedling Flood Assay

High-Throughput Identificatie van resistentie tegen Pseudomonas syringae pv. Tomaat in Tomaat met seedling Flood Assay

Tomato is an agronomically important crop that can be infected by Pseudomonas syringae, a Gram-negative bacterium, resulting in bacterial speck disease. ...

An In vitro System to Gauge the Thrombolytic Efficacy of Histotripsy and a Lytic Drug

Een in vitro systeem om de trombolytische werkzaamheid van histotripsie en een lytisch medicijn te meten

Deep vein thrombosis (DVT) is a global health concern. The primary approach to achieve vessel recanalization for critical obstructions is ...