Name: in vitro and in vivo detection of mitophagy in human cells, c. elegans, and mice
Uploaded: 2017-11-22T13:00:00
Description: Watch this Scientific Journal Video about In Vitro and In Vivo Detection of Mitophagy in Human Cells, C. Elegans, and Mice at JoVE.com

우리 박사 아츠 시 미 야와 키와 박사 리처드 J. Youle mt Keima 플라스 미드를 공유 하기 위한 감사 및 mt Keima 통합 Hela 세포. 우리는 원고의 중요 한 독서에 대 한 Raghavendra A. Shamanna와 박사 데보라 L. Croteau 감사합니다. 이 연구는 NIH (VAB)의 교내 연구 프로그램에 의해 지원 되었다, 노화, 2014-2015 년에 국립 연구소와 NIA 2016-2017 내부 실험실 (EFF, VAB) 부여 합니다. EFF HELSE 대단히 OST RHF에 의해 지원 되었다 (프로젝트 No: 2017056)와 노르웨이의 연구 위원회 (프로젝트 No: 262175).
작가 기부:
EFF는 원고를 설계 하 고 준비 초안; KP, NS, EMF, RDS, JSK, SAC, YH, 그리고에 드 쓴 다른 부분의 종이; NT, JP, HN, VAB 개정 원고와 전문성을 제공.

동물 (남성 및 여성 쥐)는 태어나 고 NIH 동물 관리 및 사용 위원회의 승인에 따라 공인된 동물 시설에서 사육 했다. 안락사 메서드는 모든 국가 및 기관의 규정에 일치 해야 합니다.
1입니다. 인간의 세포에 Mitophagy의 탐지
<ol><li>Mt Keima 플라스 미드를 사용 하 여 mitophagy의 검출 참고: mt-Keima, 서 간체 미토 콘 드리 아 대상 신호 융합 Keima 단백질 mitophagy 검색 비?...

<ol>
	<li>Fang, E. F., et al. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/query.fcgi?db=PubMed&cmd=Search&doptcmdl=Citation&defaultField=Title+Word&term=Nuclear+DNA+damage+signalling+to+mitochondria+in+ageing.">Nuclear DNA damage signalling to mitochondria in ageing.</a> Nat Rev Mol Cell Biol. 17 (5), 308-321 (2016).</li><li>Scheibye-Knudsen, M., Fang, E. F., Croteau, D. L., Wilson, D. M., Bohr, V. A. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/query.fcgi?db=PubMed&cmd=Search&doptcmdl=Citation&defaultField=Title+Word&term=Protecting+the+mitochondrial+powerhouse.">Protecting the mitochondrial powerhouse.</a> Trends Cell Biol. 25 (3), 158-170 (2015).</li><li>Sun, N., Youle, R. J., Finkel, T. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/query.fcgi?db=PubMed&cmd=Search&doptcmdl=Citation&defaultField=Title+Word&term=The+Mitochondrial+Basis+of+Aging.">The Mitochondrial Basis of Aging.</a> Mol Cell. 61 (5), 654-666 (2016).</li><li>Shadel, G. S., Horvath, T. L. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/query.fcgi?db=PubMed&cmd=Search&doptcmdl=Citation&defaultField=Title+Word&term=Mitochondrial+ROS+signaling+in+organismal+homeostasis.">Mitochondrial ROS signaling in organismal homeostasis.</a> Cell. 163 (3), 560-569 (2015).</li><li>Palikaras, K., Lionaki, E., Tavernarakis, N. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/query.fcgi?db=PubMed&cmd=Search&doptcmdl=Citation&defaultField=Title+Word&term=Coordination+of+mitophagy+and+mitochondrial+biogenesis+during+ageing+in+C.+elegans.">Coordination of mitophagy and mitochondrial biogenesis during ageing in C. elegans.</a> Nature. 521 (7553), 525-528 (2015).</li><li>Lazarou, M., et al. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/query.fcgi?db=PubMed&cmd=Search&doptcmdl=Citation&defaultField=Title+Word&term=The+ubiquitin+kinase+PINK1+recruits+autophagy+receptors+to+induce+mitophagy.">The ubiquitin kinase PINK1 recruits autophagy receptors to induce mitophagy.</a> Nature. 524 (7565), 309-314 (2015).</li><li>Kerr, J. S., et al. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/query.fcgi?db=PubMed&cmd=Search&doptcmdl=Citation&defaultField=Title+Word&term=Mitophagy+and+Alzheimer's+Disease:+Cellular+and+Molecular+Mechanisms.">Mitophagy and Alzheimer's Disease: Cellular and Molecular Mechanisms.</a> Trends neurosci. 40 (3), 151-166 (2017).</li><li>Fivenson, E. M., et al. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/query.fcgi?db=PubMed&cmd=Search&doptcmdl=Citation&defaultField=Title+Word&term=Mitophagy+in+neurodegeneration+and+aging.">Mitophagy in neurodegeneration and aging.</a> Neurochem Int. , (2017).</li><li>Menzies, F. M., Fleming, A., Rubinsztein, D. C. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/query.fcgi?db=PubMed&cmd=Search&doptcmdl=Citation&defaultField=Title+Word&term=Compromised+autophagy+and+neurodegenerative+diseases.">Compromised autophagy and neurodegenerative diseases.</a> Nat Rev Neurosci. 16 (6), 345-357 (2015).</li><li>Rubinsztein, D. C., Shpilka, T., Elazar, Z. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/query.fcgi?db=PubMed&cmd=Search&doptcmdl=Citation&defaultField=Title+Word&term=Mechanisms+of+autophagosome+biogenesis.">Mechanisms of autophagosome biogenesis.</a> Curr Biol. 22 (1), R29-R34 (2012).</li><li>Kerr, J. S., et al. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/query.fcgi?db=PubMed&cmd=Search&doptcmdl=Citation&defaultField=Title+Word&term=Mitophagy+and+Alzheimer's+disease:+cellular+and+molecular+mechanisms.">Mitophagy and Alzheimer's disease: cellular and molecular mechanisms.</a> Trends neurosci. 40 (3), 151-166 (2017).</li><li>Menzies, F. M., Moreau, K., Puri, C., Renna, M., Rubinsztein, D. C. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/query.fcgi?db=PubMed&cmd=Search&doptcmdl=Citation&defaultField=Title+Word&term=Measurement+of+autophagic+activity+in+mammalian+cells.">Measurement of autophagic activity in mammalian cells.</a> Curr Protoc Cell Biol. , 16 (2012).</li><li>Katayama, H., Kogure, T., Mizushima, N., Yoshimori, T., Miyawaki, A. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/query.fcgi?db=PubMed&cmd=Search&doptcmdl=Citation&defaultField=Title+Word&term=A+sensitive+and+quantitative+technique+for+detecting+autophagic+events+based+on+lysosomal+delivery.">A sensitive and quantitative technique for detecting autophagic events based on lysosomal delivery.</a> Chem Biol. 18 (8), 1042-1052 (2011).</li><li>Sun, N., et al. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/query.fcgi?db=PubMed&cmd=Search&doptcmdl=Citation&defaultField=Title+Word&term=Measuring+In+Vivo+Mitophagy.">Measuring In Vivo Mitophagy.</a> Mol Cell. 60 (4), 685-696 (2015).</li><li>Fang, E. F., et al. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/query.fcgi?db=PubMed&cmd=Search&doptcmdl=Citation&defaultField=Title+Word&term=Defective+mitophagy+in+XPA+via+PARP-1+hyperactivation+and+NAD(+)/SIRT1+reduction.">Defective mitophagy in XPA via PARP-1 hyperactivation and NAD(+)/SIRT1 reduction.</a> Cell. 157 (4), 882-896 (2014).</li><li>Diot, A., et al. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/query.fcgi?db=PubMed&cmd=Search&doptcmdl=Citation&defaultField=Title+Word&term=A+novel+quantitative+assay+of+mitophagy:+Combining+high+content+fluorescence+microscopy+and+mitochondrial+DNA+load+to+quantify+mitophagy+and+identify+novel+pharmacological+tools+against+pathogenic+heteroplasmic+mtDNA.">A novel quantitative assay of mitophagy: Combining high content fluorescence microscopy and mitochondrial DNA load to quantify mitophagy and identify novel pharmacological tools against pathogenic heteroplasmic mtDNA.</a> Pharmacol Res. 100, 24-35 (2015).</li><li>Schiavi, A., et al. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/query.fcgi?db=PubMed&cmd=Search&doptcmdl=Citation&defaultField=Title+Word&term=Iron-Starvation-Induced+Mitophagy+Mediates+Lifespan+Extension+upon+Mitochondrial+Stress+in+C.+elegans.">Iron-Starvation-Induced Mitophagy Mediates Lifespan Extension upon Mitochondrial Stress in C. elegans.</a> Curr Biol. 25 (14), 1810-1822 (2015).</li><li>Rosado, C. J., Mijaljica, D., Hatzinisiriou, I., Prescott, M., Devenish, R. J. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/query.fcgi?db=PubMed&cmd=Search&doptcmdl=Citation&defaultField=Title+Word&term=Rosella:+a+fluorescent+pH-biosensor+for+reporting+vacuolar+turnover+of+cytosol+and+organelles+in+yeast.">Rosella: a fluorescent pH-biosensor for reporting vacuolar turnover of cytosol and organelles in yeast.</a> Autophagy. 4 (2), 205-213 (2008).</li><li>Sargsyan, A., et al. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/query.fcgi?db=PubMed&cmd=Search&doptcmdl=Citation&defaultField=Title+Word&term=Rapid+parallel+measurements+of+macroautophagy+and+mitophagy+in+mammalian+cells+using+a+single+fluorescent+biosensor.">Rapid parallel measurements of macroautophagy and mitophagy in mammalian cells using a single fluorescent biosensor.</a> Sci Rep. 5, 12397 (2015).</li><li>Altun, Z. F., Hall, D. H. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/query.fcgi?db=PubMed&cmd=Search&doptcmdl=Citation&defaultField=Title+Word&term=Introduction+to+C.+elegans+anatomy.">Introduction to C. elegans anatomy.</a> WormAtlas. , (2009).</li><li>Chaudhuri, J., Parihar, M., Pires-daSilva, A. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/query.fcgi?db=PubMed&cmd=Search&doptcmdl=Citation&defaultField=Title+Word&term=An+introduction+to+worm+lab:+from+culturing+worms+to+mutagenesis.">An introduction to worm lab: from culturing worms to mutagenesis.</a> J Vis Exp. (47), e2293 (2011).</li><li>Palikaras, K., Tavernarakis, N. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/query.fcgi?db=PubMed&cmd=Search&doptcmdl=Citation&defaultField=Title+Word&term=In+vivo+Mitophagy+Monitoring+in+Caenorhabditis+elegans+to+Determine+Mitochondrial+Homeostasis.">In vivo Mitophagy Monitoring in Caenorhabditis elegans to Determine Mitochondrial Homeostasis.</a> Bio Protoc. 7 (7), e2215 (2017).</li><li>Palikaras, K., Tavernarakis, N. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/query.fcgi?db=PubMed&cmd=Search&doptcmdl=Citation&defaultField=Title+Word&term=Assessing+Mitochondrial+Selective+Autophagy+in+the+Nematode+Caenorhabditis+elegans.">Assessing Mitochondrial Selective Autophagy in the Nematode Caenorhabditis elegans.</a> Methods Mol Biol. 1567, 349-361 (2017).</li><li>Sun, N., et al. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/query.fcgi?db=PubMed&cmd=Search&doptcmdl=Citation&defaultField=Title+Word&term=A+fluorescence-based+imaging+method+to+measure+in+vitro+and+in+vivo+mitophagy+using+mt-Keima.">A fluorescence-based imaging method to measure in vitro and in vivo mitophagy using mt-Keima.</a> Nat Protoc. 12 (8), 1576-1587 (2017).</li><li>Eiyama, A., Okamoto, K. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/query.fcgi?db=PubMed&cmd=Search&doptcmdl=Citation&defaultField=Title+Word&term=Assays+for+Mitophagy+in+Yeast.">Assays for Mitophagy in Yeast.</a> Methods Mol Biol. 1567, 337-347 (2017).</li><li>McWilliams, T. G., et al. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/query.fcgi?db=PubMed&cmd=Search&doptcmdl=Citation&defaultField=Title+Word&term=mito-QC+illuminates+mitophagy+and+mitochondrial+architecture+in+vivo.">mito-QC illuminates mitophagy and mitochondrial architecture in vivo.</a> J Cell Biol. 214 (3), 333-345 (2016).</li></ol>

Mitophagy의 정확한 측정은 기술적으로 요구 하 고 있다. 여기, 우리는 mitophagy의 질적 모두 검출 및 정량화의 가장 일반적인 실험실 실험 모델 mitophagy 수준에 대 한 허용 하는 여러 가지 강력한 기법 제시.
복제할 데이터를 얻기 위해 적어도 3 개의 생물 학적 반복 된 실험 설계는 필요 하다. 실험 및 분석에 관련 된 모든 연구 실험 그룹 id에 멀게 합니다. 또한, 필드 이미징 선택 되...

Mitophagy은 미토 콘 드리 아 유지 보수를 위해 필수적 이다. 미토 콘 드리 아 여러 세포 신호 경로 교차 하 고 보편적인 하위 세포 세포 세포 에너지 생산과 세포 물질 대사, 칼슘 항상성1,2,3, 에 대 한 책임은 4. 미토 콘 드리 아 끊임없이 경험 반응성 산소 종 (선생님)와 미토 콘 드리 아 이용과 같은 내 인 성 및 외 인 근원에서 과제 각각, "세"와 역 기능 mitochondria의 세대 이끌어 내는. 손상 된 미토 콘 드리 아의 축적 유해한 ROS의 양을 증가 하는 동안 ATP 생산의 효율성을 감소 하 고 대사 질환, 광고, 같은 나이 관련 된 질병에 연결 되었다 PD1,5,6 . 유도 미토 콘 드리 아 세포 역 기능을 방지 하기 위해 셀 필요가 특히 미토 콘 드리 아를 손상 인식 하 고 효율적으로 세포 과정을 통해 그들을 제거 미토 콘 드 리아 autophagy를 (mitophagy) 불린다. 이 mitophagy 건강에서의 중요성을 설명 하 고 질병 검색 mitophagy 정확 하 고 효율적인 방법에 대 한 필요성을 보여줍니다 모두 생체 외에서 그리고 vivo에서.
Mitophagy는 많은 단백질과 단백질 단지5,,78와 관련 된 여러 단계 프로세스입니다. 간단 하 게, 손상 된 mitochondrion 처음 인식 이며9,10플라즈마 멤브레인, 바인딩과 그물, 골 단지, 핵, 또는 mitochondrion 자체에서 발생 한 수 있습니다 더블 membraned phagophore에 의해 잠겼습니다. 구형 phagophore elongates 및 결국 미토 콘 드리 아 autophagosome (mitophagosome) 구성 안에 미토 콘 드리 아를 봉인. mitophagosome 다음 성능 저하, 형성 하는 autolysosome는 손상된 mitochondrion 저하 및 재활용7,8은 리소좀으로 퓨즈. 또한 mitophagy에 관련 된 주요 autophagic 단백질 포함: Autophagy 관련 7 (ATG7) 및 Beclin1 (개시), Microtubule-Associated 단백질 1A/1B-라이트 3 (LC3-II) ( C. elegans에서 하는지-1)과 p62 체인 (phagophore의 구성 요소), 그리고 관련 된 lysosomal 막 당단백질 2 (LAMP2)6,7. 또한, PTEN 유도 상 상속 키 니 아 제 1 (핑크-1), Parkin1, 핵 점 단백질 52 kDa (NDP52), optineurin, BCL2 상호 작용 단백질 3 처럼 (닉스/BNIP3L) (DCT-1 C. 선 충)를 포함 하 여 mitophagy에 고유한 여러 가지 필수적인 단백질은 다른 사람의 사이에서5,6,11.
Autophagy의 수준에서 변화를 감지 하는 일반적인 방법은 LC3-II/LC3-나의 LC3-II/말라 비율입니다. 그러나,이 메서드는 일반적인,이 비율 증가 증가 개시 또는 리소좀12mitophagosome의 장애인된 융합 반영 수 있습니다. 또 다른 방법은 없는 autophagy 마커 (예를 들어, LC3)와 미토 콘 드리 아 단백질 (예를 들어, Translocase의 외부 미토 콘 드리 아 막 20 (TOMM20, proteasomes에 의해 타락 될 수 있는)) 사이 colocalization를 평가 하는 것입니다. 그러나,이 수만 총 mitophagy 수준에서 변경 내용을 나타내고는 단계를 구별할 수 없습니다 어떤 막힘에 발생 합니다. 이 mitophagosomes의 축적을 병렬로 lysosomal 억제제 (예를 들어, E64d + Pepstatin A, EP에 게 불리는)를 사용 하 여 명백 하 게 될 수 있습니다. Mitophagosomes EP와 치료 다음과의 수와 초기에 mitophagosomes의 수의 차이 mitophagy를 나타낼 수 있습니다. 이러한 제한에는 소설 mitophagy 탐지 기술의 개발 라는 메시지가 있다. 인간의 질병의 넓은 스펙트럼에 mitophagy의 증가 관련성에 비추어 우리 연구원에 대 한 도움이 될 수 있습니다 몇 가지 강력한 mitophagy 탐지 기법 제시. 우리는 생체 외에서 그리고 vivo에서 기술을 커버 하 고 mitophagy의 변경 사항을 확인 하려면 여러 기술을 결합 하는 것이 좋습니다.

<table>
	<tbody>
		<tr>
			<td>mt-Keima mouse</td>
			<td>Jackson Laboratory</td>
			<td></td>
			<td></td>
		</tr>
		<tr>
			<td>Lipofectamine 2000 DNA transfection reagent</td>
			<td>Thermofisher</td>
			<td>#11668027</td>
			<td></td>
		</tr>
		<tr>
			<td>Opti-MEM medium (Gibco)</td>
			<td>Thermofisher</td>
			<td>#31985062</td>
			<td>serum-free medium</td>
		</tr>
		<tr>
			<td>mtKemia plasmid: pCHAC-mt-mKeima</td>
			<td>addgene</td>
			<td>#72342</td>
			<td></td>
		</tr>
		<tr>
			<td>COXII antibody (mouse)</td>
			<td>abcam</td>
			<td>#ab110258</td>
			<td></td>
		</tr>
		<tr>
			<td>LAMP2 antibody (rabbit)</td>
			<td>NOVUS</td>
			<td>#CD107b</td>
			<td></td>
		</tr>
		<tr>
			<td>goat-anti-rabbit with wavelength 568 nm of red fluorescent protein (RFP)</td>
			<td>Thermofisher</td>
			<td>#Z25306</td>
			<td>Alexa Fluor 568 dye</td>
		</tr>
		<tr>
			<td>goat-anti-mouse with wavelength 488 nm of green fluorescent protein (GFP)</td>
			<td>Thermofisher</td>
			<td>#Z25002</td>
			<td>Alexa Fluor 488 dye</td>
		</tr>
		<tr>
			<td>prolong gold antifade with DAPI</td>
			<td>Invitrogen</td>
			<td>#P36931</td>
			<td></td>
		</tr>
		<tr>
			<td>6-well plate</td>
			<td>SIGMA 
			Corning Costar</td>
			<td>#CLS3516</td>
			<td></td>
		</tr>
		<tr>
			<td>4-well chamber slide</td>
			<td>THermofisher, Nunc Lab-Tek</td>
			<td>#171080</td>
			<td></td>
		</tr>
		<tr>
			<td>Nunc F 96-well plate</td>
			<td>Thermofisher</td>
			<td>#152038</td>
			<td></td>
		</tr>
		<tr>
			<td>LC3B antibody rabbit</td>
			<td>NOVUS</td>
			<td>#NB100-2220</td>
			<td></td>
		</tr>
		<tr>
			<td>DNA antibody</td>
			<td>Progen Biotechnik</td>
			<td>#anti-DNA mouse monoclonal, AC-30-10</td>
			<td></td>
		</tr>
		<tr>
			<td>DAPI</td>
			<td>Thermofisher</td>
			<td>#D1306</td>
			<td>antifade mounting medium with DAPI</td>
		</tr>
		<tr>
			<td>IN Cell analyzer (fluorescent reader )</td>
			<td>GE Healthcare Life Sciences</td>
			<td>#IN Cell analyzer 2200</td>
			<td></td>
		</tr>
		<tr>
			<td>Eclipse TE-2000e confocal microscope</td>
			<td>Nikon</td>
			<td>#TE-2000e</td>
			<td></td>
		</tr>
		<tr>
			<td>Colocalization software</td>
			<td>Volocity</td>
			<td>#Volocity 6.3</td>
			<td>alternative Zeiss ZEN 2012 software</td>
		</tr>
		<tr>
			<td>IN Cell Investigator Software</td>
			<td>GE Healthcare Life Sciences</td>
			<td>#28408974</td>
			<td></td>
		</tr>
		<tr>
			<td>cell culture medium</td>
			<td>Thermofisher</td>
			<td>#DMEM&#8211;Dulbecco&#39;s Modified Eagle Medium</td>
			<td></td>
		</tr>
		<tr>
			<td>Penicillin-Streptomycin (10,000 U/mL)</td>
			<td>Thermofisher</td>
			<td>#15140122</td>
			<td></td>
		</tr>
		<tr>
			<td>Fetal Bovine Serum</td>
			<td>Sigma-Aldrich</td>
			<td>#12003C-1000ML</td>
			<td></td>
		</tr>
		<tr>
			<td>Cell culture Incubator</td>
			<td>Thermofisher</td>
			<td>#Thermo Forma 3110 CO2 Water Jacketed Incubator</td>
			<td></td>
		</tr>
		<tr>
			<td>epifluorescence microscope</td>
			<td>Zeiss</td>
			<td></td>
			<td>Zeiss Axio Imager Z2</td>
		</tr>
		<tr>
			<td>camera</td>
			<td>Olympus</td>
			<td></td>
			<td>Olympus DP71</td>
		</tr>
		<tr>
			<td>confocal microscope</td>
			<td>Zeiss</td>
			<td></td>
			<td>Zeiss Axio Observer Z1</td>
		</tr>
		<tr>
			<td>confocal software</td>
			<td>Zeiss</td>
			<td></td>
			<td>ZEN 2012</td>
		</tr>
		<tr>
			<td>image analysis software</td>
			<td>Image J</td>
			<td>colocalization analysis, etc</td>
			<td>https://imagej.nih.gov/ij/</td>
		</tr>
		<tr>
			<td>statistical analysis software</td>
			<td>GraphPad Software Inc., San Diego, USA</td>
			<td></td>
			<td>GraphPad Prism software package</td>
		</tr>
		<tr>
			<td>material to make a worm pick</td>
			<td>Surepure Chemetals</td>
			<td>#4655</td>
			<td>The pick is made of 30 gauge 90% platinum 10% iridium wire</td>
		</tr>
		<tr>
			<td>IR: N2;Ex[pmyo-3 TOMM-20::Rosella]</td>
			<td>Material inquiry to Tavernarakis Nektarios</td>
			<td></td>
			<td>Maintain transgenic animals at 20 &#176;C</td>
		</tr>
		<tr>
			<td>IR: N2; Ex[pdct-1 DCT-1::GFP; pmyo-3 DsRed::LGG-1]</td>
			<td>Material inquiry to Tavernarakis Nektarios</td>
			<td></td>
			<td></td>
		</tr>
		<tr>
			<td>pmyo-3 TOMM-20::Rosella</td>
			<td>Material inquiry to Tavernarakis Nektarios</td>
			<td></td>
			<td></td>
		</tr>
		<tr>
			<td>pdct-1 DCT-1::GFP</td>
			<td>Material inquiry to Tavernarakis Nektarios</td>
			<td></td>
			<td></td>
		</tr>
		<tr>
			<td>pmyo-3 DsRed::LGG-1</td>
			<td>Material inquiry to Tavernarakis Nektarios</td>
			<td></td>
			<td></td>
		</tr>
		<tr>
			<td>Paraquat solution</td>
			<td>see supplementary data for preparation</td>
			<td></td>
			<td></td>
		</tr>
		<tr>
			<td>M9 buffer</td>
			<td>see supplementary data for preparation</td>
			<td></td>
			<td></td>
		</tr>
		<tr>
			<td>M9-levamisole buffer</td>
			<td>see supplementary data for preparation</td>
			<td></td>
			<td></td>
		</tr>
		<tr>
			<td>Glass Microscope Slides and Coverslips</td>
			<td>Fisher Scientific</td>
			<td>#B9992000</td>
			<td></td>
		</tr>
		<tr>
			<td>Surgical forceps</td>
			<td>STERIS Animal Health</td>
			<td>19 Piece Canine Spay Pack Economy</td>
			<td></td>
		</tr>
		<tr>
			<td>Surgical scissors</td>
			<td>STERIS Animal Health</td>
			<td>19 Piece Canine Spay Pack Economy</td>
			<td></td>
		</tr>
		<tr>
			<td>1x PBS</td>
			<td>Thermofisher</td>
			<td>#AM9625</td>
			<td>10x PBS needs to be diluted to 1x PBS by using ddH2O</td>
		</tr>
		<tr>
			<td>shaker</td>
			<td>Fisher Scientific</td>
			<td>#11-676-178</td>
			<td>Thermo Scientific MaxQ HP Tabletop Orbital Small Open Air Platform Shaker Package A</td>
		</tr>
		<tr>
			<td>2% agarose pad</td>
			<td>see supplementary data for preparation</td>
			<td></td>
			<td></td>
		</tr>
		<tr>
			<td>Vibroslice blades</td>
			<td>World precision instruments</td>
			<td>#BLADES-2</td>
			<td>single-edge blade</td>
		</tr>
		<tr>
			<td>metal plate</td>
			<td>MSC</td>
			<td>#78803988</td>
			<td>0.012 in thick x 6 in wide x 12 in long, 430 Stainless Steel Sheet</td>
		</tr>
		<tr>
			<td>Triton X-100</td>
			<td></td>
			<td></td>
			<td>detergent</td>
		</tr>
		<tr>
			<td>Methyl viologen dichloride hydrate</td>
			<td>Sigma-Aldrich</td>
			<td>#856177</td>
			<td>paraquat</td>
		</tr>
		<tr>
			<td>Incubator for nematodes</td>
			<td>AQUALYTIC</td>
			<td></td>
			<td>Incubator to maintain 20 &#176;C</td>
		</tr>
		<tr>
			<td>Dissecting stereomicroscope</td>
			<td>Olympus</td>
			<td>SMZ645</td>
			<td></td>
		</tr>
		<tr>
			<td>Confocal microscope</td>
			<td>Zeiss</td>
			<td>AxioObserver Z1</td>
			<td>For nematodes (step 2)</td>
		</tr>
		<tr>
			<td>epifluorescence microscope</td>
			<td>Zeiss</td>
			<td>AxioImager Z2</td>
			<td>For nematodes (step 2)</td>
		</tr>
		<tr>
			<td>UV crosslinker</td>
			<td>Vilber Lourmat</td>
			<td>BIO-LINK &#8211; BLX-E365</td>
			<td>UV light source; 356 nm</td>
		</tr>
	</tbody>
</table>

in vitro and in vivo detection of mitophagy in human cells, c. elegans, and mice

미토 콘 드리 아 셀의 강국입니다 그리고 ATP의 형태로 세포 에너지를 생산. 미토 콘 드 리아 기능 장애는 생물학적 노화 및 질환 대사 질환, 조기 노화 증후군, Alzheimer의 질병 (광고) 및 파 킨 슨 병 (PD)와 같은 신경 퇴행 성 질환 등의 다양 한에 기여 한다. 미토 콘 드리 아 건강의 유지 보수는 미토 콘 드리 아 속 mitophagy 통해 역 기능 mitochondria의 효율적 허가에 따라 다릅니다. 정확 하 게 감지 하 autophagy/mitophagy, 특히 동물 모델 실험 방법 개발에 도전 있다. Mitophagy의 분자 메커니즘의 이해로 최근 진행은 소설 mitophagy 탐지 기술 개발을 활성화 하 고 있다. 여기, 인간의 세포, 꼬마 선 충 mitophagy 모니터 여러 다양 한 기법 소개 (예를 들어, 윈저 DCT-1 / 하는지 1 긴장), 마우스 (mt Keima). 간 종 평가 포함 하 여 이러한 mitophagy 탐지 기술의 조합 mitophagy 측정의 정확도 개선 하 고 mitophagy 건강과 질병에서의 역할의 더 나은 이해로 이어질.

인간 세포에 Mitophagy의 검출:
여기에 제시 된 절차를 사용 하 여, 인간 헬러 세포 mt Keima 플라스 미드와 페 했다. 건강 한 세포는 잘 조직 된 미토 콘 드 리아 네트워크 시연 (GFP, 488 nm)와 mitophagy의 몇 가지 부각 (RFP, 561 nm). 그러나, 세포는 미토 콘 드리 아 uncoupler FCCP와 청소용 (3 h 30 µ M) mitophagy 발생 (그림 1A)에?...

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In Vitro and In Vivo Detection of Mitophagy in Human Cells, C. Elegans, and Mice

생체 외에서 그리고 Vivo에서 인간 세포, C. 선 충, 쥐에서 Mitophagy의 검출

Mitophagy, 개간 손상 된 미토 콘 드리 아의 과정은 미토 콘 드 리아 항상성 및 건강 유지 관리를 위해 필요 합니다. 이 문서는 최신 mitophagy의 일부 인간 세포, 꼬마 선 충, 및 마우스 감지 방법을 선물 한다.

Mitochondria are the powerhouses of cells and produce cellular energy in the form of ATP. Mitochondrial dysfunction contributes to biological aging and a ...

Research

JoVE Journal

Medicine

In Vitro and In Vivo Detection of Mitophagy in Human Cells, C. Elegans, and Mice

Establishment and Propagation of Human Retinoblastoma Tumors in Immune Deficient Mice

면역 결함 마우스의 확립과 인간 Retinoblastoma 종양의 전파

Culturing retinoblastoma tumor cells in defined stem cell media gives rise to primary tumorspheres that can be grown and maintained for only a limited ...

연구

의학

Stem Cell Transplantation in an in vitro Simulated Ischemia/Reperfusion Model

Stem Cell Transplantation in an in vitro Simulated Ischemia/Reperfusion Model

에서 간세포 이식 체외에서 시뮬레이션 국소 빈혈 / Reperfusion 모델

Stem cell transplantation protocols are finding their way into clinical practice1,2,3. Getting better results, making the protocols more robust, and ...

Carotid Artery Infusions for Pharmacokinetic and Pharmacodynamic Analysis of Taxanes in Mice

마우스의 탁산의 약동학 및 약력 학적 분석을위한 경동맥 팅크

When proposing the use of a drug, drug combination, or drug delivery into a novel system, one must assess the pharmacokinetics of the drug in the study ...

Evaluating the Effectiveness of Cancer Drug Sensitization In Vitro and In Vivo

Evaluating the Effectiveness of Cancer Drug Sensitization In Vitro and In Vivo

암 약물 과민 반응의 효과를 평가<em&gt; 체외</em&gt; 및<em&gt; 생체</em

Due to the high level of heterogeneity and mutations inherent in human cancers, single agent therapies, or combination regimens which target the same ...

Intrauterine Telemetry to Measure Mouse Contractile Pressure In Vivo

Intrauterine Telemetry to Measure Mouse Contractile Pressure In Vivo

자궁 원격 측정은 마우스 수축 압력을 측정하는<em&gt; 생체</em

A complex integration of molecular and electrical signals is needed to transform a quiescent uterus into a contractile organ at the end of pregnancy. ...

Studying Pancreatic Cancer Stem Cell Characteristics for Developing New Treatment Strategies

췌장암 새로운 치료 전략을 개발하기위한 전지 특성 줄기 공부

Pancreatic ductal adenocarcinoma (PDAC) contains a subset of exclusively tumorigenic cancer stem cells (CSCs) which have been shown to drive tumor ...

Generation of Microtumors Using 3D Human Biogel Culture System and Patient-derived Glioblastoma Cells for Kinomic Profiling and Drug Response Testing

Kinomic 프로파일 의약품 응답 테스트를위한 3D 인간의를 Biogel 문화 시스템을 사용 Microtumors 및 환자 유래 아교 모세포종 세포의 생성

The use of patient-derived xenografts for modeling cancers has provided important insight into cancer biology and drug responsiveness. However, they are ...

Depletion of Mouse Cells from Human Tumor Xenografts Significantly Improves Downstream Analysis of Target Cells

인간 종양 이종 이식에서 마우스 세포의 고갈은 크게 대상 세포의 다운 스트림 분석을 향상

The use of in vitro cell line models for cancer research has been a useful tool. However, it has been shown that these models fail to reliably mimic ...

Optimized Analysis of In Vivo and In Vitro Hepatic Steatosis

Optimized Analysis of In Vivo and In Vitro Hepatic Steatosis

의 최적화 분석<em&gt; 생체</em&gt; 및<em&gt; 체외</em&gt; 간 지방증

Establishing a system of procedures to qualitatively and quantitatively characterize in vivo and in vitro hepatic steatosis is important for metabolic ...

In Vivo Photolabeling of Cells in the Colon to Assess Migratory Potential of Hematopoietic Cells in Neonatal Mice

In Vivo Photolabeling of Cells in the Colon to Assess Migratory Potential of Hematopoietic Cells in Neonatal Mice

Vivo에서 Photolabeling 신생아 쥐에 있는 조 혈 모 세포의 이동성 잠재력을 평가 하는 콜론에 셀의

Enteric bacterial communities are established early in life and influence immune cell development and function. The neonatal microbiota is susceptible to ...