Name: adherence of bacteria to plant surfaces measured in the laboratory
Uploaded: 2018-06-19T12:30:00
Duration: 7 min 7 s
Description: Watch this Scientific Journal Video about Adherence of Bacteria to Plant Surfaces Measured in the Laboratory at JoVE.com

Forfatteren tak Susan Whitfield for forberedelse af tal og Camille Martin og Hillary Samagaio for assistance med nogle af eksperimenterne.

<ol>
	<li>Heaton, J. C., Jones, K. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/query.fcgi?db=PubMed&cmd=Search&doptcmdl=Citation&defaultField=Title+Word&term=Microbial+contamination+of+fruit+and+vegetables+and+the+behaviour+of+enteropathogens+in+the+phyllosphere:+a+review.">Microbial contamination of fruit and vegetables and the behaviour of enteropathogens in the phyllosphere: a review.</a> J. Appl. Microbiol. 104, 613-626 (2008).</li><li>Beuchat, L. R. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/query.fcgi?db=PubMed&cmd=Search&doptcmdl=Citation&defaultField=Title+Word&term=Ecological+factors+influencing+survival+and+growth+of+human+pathogens+on+raw+fruit+and+vegetables.">Ecological factors influencing survival and growth of human pathogens on raw fruit and vegetables.</a> Microbes Infect. 4, 413-423 (2002).</li><li>Berger, C. N., et al. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/query.fcgi?db=PubMed&cmd=Search&doptcmdl=Citation&defaultField=Title+Word&term=Fresh+fruit+and+vegetables+as+vehicles+for+the+transmission+of+human+pathogens.">Fresh fruit and vegetables as vehicles for the transmission of human pathogens.</a> Environ. Microbiol. 12, 2385-2397 (2010).</li><li>Lugtenberg, B. J., Chin, A. W. T., Bloemberg, G. V. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/query.fcgi?db=PubMed&cmd=Search&doptcmdl=Citation&defaultField=Title+Word&term=Microbe-plant+interactions:+principles+and+mechanisms.">Microbe-plant interactions: principles and mechanisms.</a> Antonie Van Leeuwenhoek. 81, 373-383 (2002).</li><li>Preston, G. M., Haubold, B., Rainey, P. B. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/query.fcgi?db=PubMed&cmd=Search&doptcmdl=Citation&defaultField=Title+Word&term=Bacterial+genomics+and+adaptation+to+life+on+plants:+implications+for+the+evolution+of+pathogenicity+and+symbiosis.">Bacterial genomics and adaptation to life on plants: implications for the evolution of pathogenicity and symbiosis.</a> Curr. Opin. Microbiol. 1, 589-597 (1998).</li><li>Compant, S., Duffy, B., Nowak, J., Clement, C., Barka, E. A. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/query.fcgi?db=PubMed&cmd=Search&doptcmdl=Citation&defaultField=Title+Word&term=Use+of+Plant+Growth-Promoting+Bacteria+for+Biocontrol+of+Plant+Diseases:+Principles,+Mechanisms+of+Action,+and+Future+Prospects.">Use of Plant Growth-Promoting Bacteria for Biocontrol of Plant Diseases: Principles, Mechanisms of Action, and Future Prospects.</a> Appl. Environ. Microbiol. 71, 4951-4959 (2005).</li><li>Mathews, S. L., Smith, R. B., Matthysse, A. G. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/query.fcgi?db=PubMed&cmd=Search&doptcmdl=Citation&defaultField=Title+Word&term=A+comparison+of+the+retention+of+pathogenic+Escherichia+coli.+O157+by+sprouts,+leaves+and+fruits.">A comparison of the retention of pathogenic Escherichia coli. O157 by sprouts, leaves and fruits.</a> Microb. Biotechnol. 7, 570-579 (2014).</li><li>Fuqua, C., Matthysse, A. G. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/query.fcgi?db=PubMed&cmd=Search&doptcmdl=Citation&defaultField=Title+Word&term=Methods+for+studying+bacterial+biofilms+associated+with+plants.">Methods for studying bacterial biofilms associated with plants.</a> Methods Enzymol. 337, 3-18 (2001).</li><li>Torres, A. G., Jeter, C., Langley, W., Matthysse, A. G. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/query.fcgi?db=PubMed&cmd=Search&doptcmdl=Citation&defaultField=Title+Word&term=Differential+binding+of+Escherchia+coli.O157:H7+to+alfalfa,+human+epithelial+cells,+and+plastic+is+mediated+by+a+variety+of+surface+structures.">Differential binding of Escherchia coli.O157:H7 to alfalfa, human epithelial cells, and plastic is mediated by a variety of surface structures.</a> Appl. Environ. Microbiol. 71, 8008-8015 (2005).</li><li>Matthysse, A. G., Deora, R., Mishra, M., Torres, A. G. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/query.fcgi?db=PubMed&cmd=Search&doptcmdl=Citation&defaultField=Title+Word&term=Polysaccharides+cellulose,+poly-beta-1,6-n-acetyl-D-glucosamine,+and+colanic+acid+are+required+for+optimal+binding+of+Escherichia+coli+O157:H7+strains+to+alfalfa+sprouts+and+K-12+strains+to+plastic+but+not+for+binding+to+epithelial+cells.">Polysaccharides cellulose, poly-beta-1,6-n-acetyl-D-glucosamine, and colanic acid are required for optimal binding of Escherichia coli O157:H7 strains to alfalfa sprouts and K-12 strains to plastic but not for binding to epithelial cells.</a> Appl. Environ. Microbiol. 74, 2384-2390 (2008).</li><li>Matthysse, A. G., et al. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/query.fcgi?db=PubMed&cmd=Search&doptcmdl=Citation&defaultField=Title+Word&term=The+effect+of+cellulose+overproduction+on+binding+and+biofilm+formation+on+roots+by+Agrobacterium+tumefaciens.">The effect of cellulose overproduction on binding and biofilm formation on roots by Agrobacterium tumefaciens.</a> Mol. Plant Microbe Interact. 18, 1002-1010 (2005).</li><li>Matthysse, A. G., Kijne, J. W., Spaink, H. P., Kondorosi, A., Hooykaas, P. J. J. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/query.fcgi?db=PubMed&cmd=Search&doptcmdl=Citation&defaultField=Title+Word&term=Attachment+of+Rhizobiaceae+to+plant+cells.">Attachment of Rhizobiaceae to plant cells.</a> The Rhizobiaceae. , 235-249 (1998).</li><li>Matthysse, A. G. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/query.fcgi?db=PubMed&cmd=Search&doptcmdl=Citation&defaultField=Title+Word&term=Conditioned+medium+promotes+the+attachment+of+Agrobacterium+tumefaciens.strain+NT1+to+carrot+cells.">Conditioned medium promotes the attachment of Agrobacterium tumefaciens.strain NT1 to carrot cells.</a> Protoplasma. 183, 131-136 (1994).</li><li>Matthysse, A. G., McMahan, S. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/query.fcgi?db=PubMed&cmd=Search&doptcmdl=Citation&defaultField=Title+Word&term=The+effect+of+the+Agrobacterium+tumefaciens.+attR+mutation+on+attachment+and+root+colonization+differs+between+legumes+and+other+dicots.">The effect of the Agrobacterium tumefaciens. attR mutation on attachment and root colonization differs between legumes and other dicots.</a> Appl. Environ. Microbiol. 67, 1070-1075 (2001).</li><li>Jeter, C., Matthysse, A. G. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/query.fcgi?db=PubMed&cmd=Search&doptcmdl=Citation&defaultField=Title+Word&term=Characterization+of+the+binding+of+diarrheagenic+strains+of+E.+coli.to+plant+surfaces+and+the+role+of+curli+in+the+interaction+of+the+bacteria+with+alfalfa+sprouts.">Characterization of the binding of diarrheagenic strains of E. coli.to plant surfaces and the role of curli in the interaction of the bacteria with alfalfa sprouts.</a> Mol. Plant Microbe Interact. 18, 1235-1242 (2005).</li><li>Matthysse, A. G., McMahan, S. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/query.fcgi?db=PubMed&cmd=Search&doptcmdl=Citation&defaultField=Title+Word&term=Root+colonization+by+Agrobacterium+tumefaciens+is+reduced+in+cel,+attB,+attD,+and+attR+mutants.">Root colonization by Agrobacterium tumefaciens is reduced in cel, attB, attD, and attR mutants.</a> Appl. Environ. Microbiol. 64, 2341-2345 (1998).</li><li>Morton, E. R., Fuqua, C. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/query.fcgi?db=PubMed&cmd=Search&doptcmdl=Citation&defaultField=Title+Word&term=Phenotypic+analyses+of+Agrobacterium.">Phenotypic analyses of Agrobacterium.</a> Curr. Protoc. Microbiol. , (2012).</li><li>Brandl, M. T. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/query.fcgi?db=PubMed&cmd=Search&doptcmdl=Citation&defaultField=Title+Word&term=Plant+lesions+promote+the+rapid+multiplication+of+Escherichia+coli+O157:H7+on+postharvest+lettuce.">Plant lesions promote the rapid multiplication of Escherichia coli O157:H7 on postharvest lettuce.</a> Appl. Environ. Microbiol. 74, 5285-5289 (2008).</li><li>Franz, E., et al. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/query.fcgi?db=PubMed&cmd=Search&doptcmdl=Citation&defaultField=Title+Word&term=Quantification+of+contamination+of+lettuce+by+GFP-expressing+Escherichia+coli+O157:H7+and+Salmonella+enterica+serovar+Typhimurium.">Quantification of contamination of lettuce by GFP-expressing Escherichia coli O157:H7 and Salmonella enterica serovar Typhimurium.</a> Food Microbiol. 24, 106-112 (2007).</li><li>Morton, E. R., Fuqua, C. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/query.fcgi?db=PubMed&cmd=Search&doptcmdl=Citation&defaultField=Title+Word&term=Laboratory+maintenance+of+Agrobacterium.">Laboratory maintenance of Agrobacterium.</a> Curr. Protoc. Microbiol. , (2012).</li><li>Lugtenberg, B. J., Kravchenko, L. V., Simons, M. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/query.fcgi?db=PubMed&cmd=Search&doptcmdl=Citation&defaultField=Title+Word&term=Tomato+seed+and+root+exudate+sugars:+composition,+utilization+by+Pseudomonas+biocontrol+strains+and+role+in+rhizosphere+colonization.">Tomato seed and root exudate sugars: composition, utilization by Pseudomonas biocontrol strains and role in rhizosphere colonization.</a> Environ. Microbiol. 1, 439-446 (1999).</li><li>Murashige, T., Skoog, F. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/query.fcgi?db=PubMed&cmd=Search&doptcmdl=Citation&defaultField=Title+Word&term=A+Revised+Medium+for+Rapid+Growth+and+Bio+Assays+with+Tobacco+Tissue+Cultures.">A Revised Medium for Rapid Growth and Bio Assays with Tobacco Tissue Cultures.</a> Physiologia Plantarum. 15, 473-497 (1962).</li><li>Danhorn, T., Fuqua, C. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/query.fcgi?db=PubMed&cmd=Search&doptcmdl=Citation&defaultField=Title+Word&term=Biofilm+formation+by+plant-associated+bacteria.">Biofilm formation by plant-associated bacteria.</a> Annu. Rev. Microbiol. 61, 401-422 (2007).</li><li>Branda, S. S., Vik, S., Friedman, L., Kolter, R. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/query.fcgi?db=PubMed&cmd=Search&doptcmdl=Citation&defaultField=Title+Word&term=Biofilms:+the+matrix+revisited.">Biofilms: the matrix revisited.</a> Trends Microbiol. 13, 20-26 (2005).</li><li>O'Toole, G., Kaplan, H. B., Kolter, R. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/query.fcgi?db=PubMed&cmd=Search&doptcmdl=Citation&defaultField=Title+Word&term=Biofilm+formation+as+microbial+development.">Biofilm formation as microbial development.</a> Annu. Rev. Microbiol. 54, 49-79 (2000).</li><li>Charkowski, A. O., Barak, J. D., Sarreal, C. Z., Mandrell, R. E. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/query.fcgi?db=PubMed&cmd=Search&doptcmdl=Citation&defaultField=Title+Word&term=Differences+in+growth+of+Salmonella+enterica+and+Escherichia+coli+O157:H7+on+alfalfa+sprouts.">Differences in growth of Salmonella enterica and Escherichia coli O157:H7 on alfalfa sprouts.</a> Appl. Environ. Microbiol. 68, 3114-3120 (2002).</li><li>Loper, J., Suslow, T., Schroth, M. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/query.fcgi?db=PubMed&cmd=Search&doptcmdl=Citation&defaultField=Title+Word&term=Lognormal+distribution+of+bacterial+populations+in+the+rhizosphere.">Lognormal distribution of bacterial populations in the rhizosphere.</a> Phytopathology. 74, 1454-1460 (1984).</li><li>Matthysse, A. G. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/query.fcgi?db=PubMed&cmd=Search&doptcmdl=Citation&defaultField=Title+Word&term=Attachment+of+Agrobacterium+to+plant+surfaces.">Attachment of Agrobacterium to plant surfaces.</a> Front Plant Sci. 5, 252 (2014).</li><li>Douglas, C. J., Halperin, W., Nester, E. W. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/query.fcgi?db=PubMed&cmd=Search&doptcmdl=Citation&defaultField=Title+Word&term=Agrobacterium+tumefaciens+mutants+affected+in+attachment+to+plant+cells.">Agrobacterium tumefaciens mutants affected in attachment to plant cells.</a> J. Bacteriol. 152, 1265-1275 (1982).</li><li>Tomlinson, A. D., Fuqua, C. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/query.fcgi?db=PubMed&cmd=Search&doptcmdl=Citation&defaultField=Title+Word&term=Mechanisms+and+regulation+of+polar+surface+attachment+in+Agrobacterium+tumefaciens.">Mechanisms and regulation of polar surface attachment in Agrobacterium tumefaciens.</a> Curr. Opin. Microbiol. 12, 708-714 (2009).</li><li>Matthysse, A. G. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/query.fcgi?db=PubMed&cmd=Search&doptcmdl=Citation&defaultField=Title+Word&term=Attachment+of+Agrobacterium+to+plant+surfaces.">Attachment of Agrobacterium to plant surfaces.</a> Front Plant Sci. 5, (2014).</li><li>Wright, K. M., et al. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/query.fcgi?db=PubMed&cmd=Search&doptcmdl=Citation&defaultField=Title+Word&term=The+endophytic+lifestyle+of+Escherichia+coli+O157:H7:+quantification+and+internal+localization+in+roots.">The endophytic lifestyle of Escherichia coli O157:H7: quantification and internal localization in roots.</a> Phytopathology. 103, 333-340 (2013).</li><li>Berger, C. N., et al. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/query.fcgi?db=PubMed&cmd=Search&doptcmdl=Citation&defaultField=Title+Word&term=Fresh+fruit+and+vegetables+as+vehicles+for+the+transmission+of+human+pathogens.">Fresh fruit and vegetables as vehicles for the transmission of human pathogens.</a> Environ. Microbiol. 12, 2385-2397 (2010).</li><li>Erickson, M. C., et al. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/query.fcgi?db=PubMed&cmd=Search&doptcmdl=Citation&defaultField=Title+Word&term=Internalization+and+Fate+of+Escherichia+coli+O157:H7+in+Leafy+Green+Phyllosphere+Tissue+Using+Various+Spray+Conditions.">Internalization and Fate of Escherichia coli O157:H7 in Leafy Green Phyllosphere Tissue Using Various Spray Conditions.</a> J. Food Prot. 77, 713-721 (2014).</li><li>McKellar, R. C., et al. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/query.fcgi?db=PubMed&cmd=Search&doptcmdl=Citation&defaultField=Title+Word&term=Evaluation+of+different+approaches+for+modeling+Escherichia+coli+O157:H7+survival+on+field+lettuce.">Evaluation of different approaches for modeling Escherichia coli O157:H7 survival on field lettuce.</a> Int. J. Food Microbiol. 184, 75-85 (2014).</li><li>Wu, F. M., et al. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/query.fcgi?db=PubMed&cmd=Search&doptcmdl=Citation&defaultField=Title+Word&term=Factors+influencing+the+detection+and+enumeration+of+Escherichia+coli+O157:H7+on+alfalfa+seeds.">Factors influencing the detection and enumeration of Escherichia coli O157:H7 on alfalfa seeds.</a> Int. J. Food Microbiol. 71, 93-99 (2001).</li></ol>

Forfatteren erklærer, at hun har ingen konkurrerende finansielle interesser.

Det er vigtigt at være opmærksom på alle overflader som bakterier kan overholde under eksperimentet. Dermed bakterier, som er i stand til at binde sig til glas kan være undervurderet hvis levedygtige celletal er gjort ved hjælp af glasrør og pipetter. Hvis planter dyrkes i agar eller jord og nogle af agaren eller jorden forbliver på planter kan så bakterier binde den vedhængende materiale i stedet for planterne. På den anden side vask plante overflade, især i forbindelse med rødder, kan fjerne naturlige overflade belægninger såsom slim og dermed ændre overholdelse af testresultater.
Det er vigtigt at være sikker på, at bakterierne tilføjet til inkubation blandingen forblive i live under eksperimentet. Således bør levedygtige celletal af gratis samt vedlagte bakterier rutinemæssigt gøres. Nogle behandlinger eller bakteriel mutationer kan mindske bakteriel vækst eller faktisk forårsage død af en brøkdel af den bakterielle befolkning. Levende og døde bakterier kan ikke skelnes i mikroskopet, medmindre særlige pletter bruges. Der er en nyttig pletten kit til live/døde bakterier, som afhænger af udelukkelsen af farvestoffer fra levende bakterier. Men hvis en blandet population af bakteriearter er til stede så levedygtige celletal af arter af interesse er tilbøjelige til at være den letteste metode til at bestemme, om inkubationen har resulteret i bakteriel død.
Medium sammensætning vil påvirke bakteriel overlevelse og vækst. Roden ekssudat og materialer udgivet fra sår og skære sites vil give substrat til støtte for beskedne bakterievækst. Phosphat-, kvælstof- og iron stræbe imod være begrænsende i disse betingelser. Divalent kationer såsom calcium og magnesium kan påvirke vedhæftning. I nogle tilfælde kan kulstof kilde påvirke vedhæftning. pH også spørgsmål. PH-værdien af rhizosfære er generelt mellem 5,5 og 6,5.
Det er nødvendigt at være forsigtig i ved hjælp af bakterier markeret med antibiotikaresistens. De antibiotika oftest anvendes er rifampicin og nalidixic syre. Resistens over for disse antibiotika er generelt på grund af mutationer i kromosomale gener (RNA polymerase og gyrase, henholdsvis) og således ikke kan nemt overføres til en anden stamme under inkubation. Denne type af modstand også medfører ikke forringelse eller ændring af antibiotika. Mærkning bakterier med plasmid-bårne gen markør anbefales ikke, medmindre plasmidet ikke kan overføres til andre bakterier. Antibiotisk resistens må ikke skyldes nedbrydning eller kemisk modifikation af antibiotika som antibiotika følsomme bakterier vil derefter kunne vokse på antibiotika plader, hvis de er placeret tæt på de resistente bakterier.
Metoderne beskrevet i denne hvidbog er nyttigt for små stikprøver og/eller eksperimenter hvor prøverne, der skal være indeholdt (for eksempel, eksperimenter, der involverer menneskelige patogener). For store stikprøver (over 100 g af materiale eller mere end 50 planter) vil andre metoder eller drastiske ændring af disse metoder være behov for10,19,32,19,33, 34 , 35 , 36. tilstedeværelsen af stort antal mikroorganismer end arter undersøges kan også udgøre væsentlige problemer. Mulige løsninger omfatter brug af bakterier mærket med en fluorescerende proteiner eller antibiotikaresistens, som beskrevet i trin 6.1.2 og 7.3. Men når bakterier af interesse er sjældne personer i en stor population af andre mikroorganismer disse markører kan ikke være tilstrækkelig til at muliggøre en utvetydig vurdering af antallet af bakterier ved at blive undersøgt.
Alle metoderne beskrevet her er baseret laboratoriemetoder. Mindre ændringer ville være nødvendige for drivhusgasser undersøgelser. Flere større ændringer er tilbøjelige til at være nødvendig for feltundersøgelser hvor protozoer, insekter og andre dyr underbud og klima variation komplicere leveringen af definerede betingelser for forsøgene. Disse metoder kan i fremtiden udvides til at omfatte samspillet mellem to eller flere mikroorganismer på plant underlag.

Måling af bakteriel bindende at plante flader er blevet vigtigt i tre forskellige situationer. Den første situation er undersøgelse af overførslen af menneskelige patogener på plante flader1,2,3. Målet her er at forhindre bakteriel bindende eller til at fjerne eller dræbe bundne bakterier og dermed at mindske overførsel af sygdomme af plantemateriale. Den anden situation er undersøgelsen af bindingen af plante patogener til at plante flader4. Endnu en gang mål her er at forhindre bindende eller at fjerne eller dræbe bundne bakterier og dermed til at reducere sygdom. Den tredje situation er undersøgelsen af bindingen af symbiotiske eller plante-vækst-fremme bakterier5,6. Målet her er at fremme bakteriel bindende og dermed at stigningen plantesundhed og afgrøde udbytter.
Teknikker til måling af bakteriel bindende at plante flader er beskrevet i denne artikel er billig og relativt let at gennemføre. Det eneste krav er et mikroskop og materialer generelt fundet i et laboratorium, bakteriologi. Nogle teknikker er en bad sonikator nyttig. De teknikker, der beskrives er designet til bindende eksperimenter udført ved hjælp af relativt små stikprøver. Målinger af bindende er lavet i laboratoriet, selv om det kan være muligt at ændre nogle af disse teknikker til brug i drivhuset eller i feltet.
Disse teknikker har været brugt til at måle bakteriel binding til rødder, spirer, skåret blade, skåret frugt og intakt cherrytomater i laboratoriet7,8,9,10,11, 12,13,14,15. De har også været brugt til at måle root kolonisering af planter, der vokser i jord eller sand i laboratoriet16. Teknikkerne har været brugt med mange bakteriearter herunder Agrobacterium tumefaciens, Sinorhizobium meliloti, Escherichia coli, Salmonella enterica, og Pseudomonas fluorescens. En nyttig beskrivelse af metoder til vurdering af samspillet mellem A. tumefaciens og overflader kan findes i Morton og Fuqua (2012)17. I alle tilfælde var prøvestørrelser involveret lille, generelt mindre end 25-50 planter. De teknikker, der beskrives er velegnet til brug med menneskelige patogener, som skal holdes indeholdt under forsøgene.

<table border="0" cellpadding="0" cellspacing="0" style="width:731px;" width="731">
	<colgroup>
		<col />
		<col />
		<col />
		<col />
	</colgroup>
	<tbody>
		<tr height="56">
			<td height="56" style="height:56px;width:143px;">light microscope</td>
			<td style="width:164px;">any</td>
			<td style="width:125px;">N/A</td>
			<td style="width:299px;">phase contrast or Nomarski optics are helpful, for studies using fluorescent markers a fluorescence microscope is required.</td>
		</tr>
		<tr height="40">
			<td height="40" style="height:40px;width:143px;">seeds</td>
			<td style="width:164px;">any&#160;</td>
			<td style="width:125px;">N/A</td>
			<td style="width:299px;">make a note of the seed lot number and the cultivar</td>
		</tr>
		<tr height="40">
			<td height="40" style="height:40px;width:143px;">bleach</td>
			<td style="width:164px;">any</td>
			<td style="width:125px;">N/A</td>
			<td style="width:299px;"></td>
		</tr>
		<tr height="40">
			<td height="40" style="height:40px;width:143px;">bath sonicator</td>
			<td style="width:164px;">any scientific supply company</td>
			<td style="width:125px;">N/A</td>
			<td style="width:299px;"></td>
		</tr>
		<tr height="40">
			<td height="40" style="height:40px;width:143px;">Triton X-100</td>
			<td style="width:164px;">Sigma-Aldrich</td>
			<td style="width:125px;">T9284</td>
			<td style="width:299px;"></td>
		</tr>
		<tr height="40">
			<td height="40" style="height:40px;width:143px;">nutrient agar&#160;</td>
			<td style="width:164px;">Difco&#160;</td>
			<td style="width:125px;">001-01-8</td>
			<td style="width:299px;"></td>
		</tr>
		<tr height="40">
			<td height="40" style="height:40px;width:143px;">soytone</td>
			<td style="width:164px;">Difco&#160;</td>
			<td style="width:125px;">24360</td>
			<td style="width:299px;"></td>
		</tr>
		<tr height="40">
			<td height="40" style="height:40px;width:143px;">Sand</td>
			<td style="width:164px;">sea sand Fisher Scientific</td>
			<td style="width:125px;">S25</td>
			<td style="width:299px;"></td>
		</tr>
		<tr height="40">
			<td height="40" style="height:40px;width:143px;">sand</td>
			<td style="width:164px;">&#160;Sigma-Aldrich</td>
			<td style="width:125px;">S9887</td>
			<td style="width:299px;"></td>
		</tr>
		<tr height="40">
			<td height="40" style="height:40px;width:143px;">conetainers</td>
			<td style="width:164px;">Stuewe &#38; Sons, Inc.</td>
			<td style="width:125px;">Ray-Leach cone-tainers</td>
			<td style="width:299px;">many different sizes are available to suit the type of plant you wish to grow</td>
		</tr>
		<tr height="40">
			<td height="40" style="height:40px;width:143px;">parafilm</td>
			<td style="width:164px;">any scientific supply company</td>
			<td style="width:125px;">N/A</td>
			<td style="width:299px;"></td>
		</tr>
		<tr height="40">
			<td height="40" style="height:40px;width:143px;">MS salts</td>
			<td style="width:164px;">Sigma-Aldrich</td>
			<td style="width:125px;">M5524</td>
			<td style="width:299px;"></td>
		</tr>
		<tr height="40">
			<td height="40" style="height:40px;width:143px;">parrafin</td>
			<td style="width:164px;">any</td>
			<td style="width:125px;">N/A</td>
			<td style="width:299px;"></td>
		</tr>
		<tr height="40">
			<td height="40" style="height:40px;width:143px;">centrigfuge</td>
			<td style="width:164px;">any scientific company</td>
			<td style="width:125px;">N/A</td>
			<td style="width:299px;">to pellet most bacteri only a small centrifuge with a max force of 10,000 XG is needed</td>
		</tr>
		<tr height="40">
			<td height="40" style="height:40px;width:143px;">vortex mixer</td>
			<td style="width:164px;">any scientific company</td>
			<td style="width:125px;"></td>
			<td style="width:299px;"></td>
		</tr>
		<tr height="40">
			<td height="40" style="height:40px;width:143px;">micrometer</td>
			<td style="width:164px;">ACCU-SCOPE Accessories</td>
			<td style="width:125px;">A3145</td>
			<td style="width:299px;"></td>
		</tr>
		<tr height="40">
			<td height="40" style="height:40px;width:143px;">Sedgwick-rafter counting cell</td>
			<td style="width:164px;">Hauser Scientific</td>
			<td style="width:125px;">HS3800</td>
			<td style="width:299px;"></td>
		</tr>
		<tr height="40">
			<td height="40" style="height:40px;width:143px;">probe-clip press-seal incubatin chamber</td>
			<td style="width:164px;">Sigma-Aldrich</td>
			<td style="width:125px;">Z359483</td>
			<td style="width:299px;"></td>
		</tr>
		<tr height="40">
			<td height="40" style="height:40px;width:143px;">rifampicin</td>
			<td style="width:164px;">Sigma-Aldrich</td>
			<td style="width:125px;">R3501</td>
			<td style="width:299px;"></td>
		</tr>
		<tr height="40">
			<td height="40" style="height:40px;width:143px;">naladixic acid</td>
			<td style="width:164px;">Sigma-Aldrich</td>
			<td style="width:125px;">n8878</td>
			<td style="width:299px;"></td>
		</tr>
		<tr height="40">
			<td height="40" style="height:40px;width:143px;">Live/dead stain</td>
			<td style="width:164px;">In Vitrogen Molecular Bioprobes</td>
			<td style="width:125px;">L7007</td>
			<td style="width:299px;"></td>
		</tr>
	</tbody>
</table>

adherence of bacteria to plant surfaces measured in the laboratory

Dette manuskript beskriver en metode til at måle bakteriel binding til axenic plante flader i den lysmikroskop og anvendelse af levedygtige celletal. Anvendte vegetabilske materialer omfatter rødder, spirer, blade, og skære frugt. De beskrevne metoder er billig, nem og velegnet til små stikprøver. Bindende måles i laboratoriet og en række inkubation media og betingelser kan bruges. Effekten af hæmmere kan bestemmes. Situationer, der fremmer og hæmmer bindende kan også vurderes. I nogle tilfælde er det muligt at skelne mellem om forskellige forhold ændre bindende primært på grund af deres virkninger på anlægget eller bakterier.

A. tumefaciens koloniserer root overflader. For at afgøre, om bakteriel produktion af cellulose spiller en rolle i rod kolonisering, virkningerne af bakteriel mutationer, som forhindrer cellulose syntese var undersøgt16. De teknikker, der beskrives i trin 1.3 og 7.1 blev brugt. Tomatfrø var overfladen steriliseret og spiret i sterilt vand. Når rødderne var ca 2 cm lange blev de dyppet i en suspension af 105 bakterier pr. mL og plantet i pasteuriseret jord i containere. Planterne blev dyrket i 14 dage ved 25 ° C på en 12-timers lys/12 h mørke cyklus. Når den angivne tid planterne blev fjernet fra beholderne. Rødderne blev vasket og sonicated i et badekar sonikator at fjerne bundet bakterier. Bakteriel numre blev bestemt ved hjælp af levedygtige celletal. Figur 2 viser effekten af to forskellige cellulose-minus mutationer på evnen af bakterier til at kolonisere tomat rødder. Selv om standardafvigelser af nogle målinger var så højt som 0,9 log10 (et fælles problem med denne form for måling) reduktion i bindingen af cellulose-minus mutanter er tydeligt og vi kan konkludere at bakteriel produktion af cellulose aids bakterier i kolonisering af tomat rødder.
<img alt="Figure 2" class="xfigimg" src="/files/ftp_upload/56599/56599fig2.jpg"> Figur 2 : Root kolonisering af vildtype og cellulose-minus mutanter af A. tumefaciens. Log10 samlede antal bakterier pr. cm rod længde inddrives fra tomat rødder podet med vildtype A. tumefaciens stamme C58 og cellulose-minus mutanter C58:1 og C58:A60. Numrene er midler fra et minimum af fire separate eksperimenter. Angiver standardafvigelser af midlerne. Rødder blev podet ved at dyppe dem i en suspension af 105 bakterier pr. mL i ét minut. Planterne blev dyrket i containere og løst vedhængende bakterier blev fjernet ved at vaske rødder i vask buffer i et hætteglas. Stramt vedhængende bakterier blev fjernet ved hjælp af et badekar sonikator og den resulterende suspension belagt for at bestemme levedygtige celle tæller16. Dette tal er blevet ændret fra Matthysse og McMahan. <a href="https://cloudflare.jove.com/files/ftp_upload/56599/56599fig2large.jpg" target="_blank">Venligst klik her for at se en større version af dette tal.</a>
Rollen som exopolysaccharides i bindingen af E. coli og andre bakterier til lucernespirer blev undersøgt. Nogle udbrud af diarré sygdom på grund af E. coli O157: H7 er blevet sporet til forurenet lucernespirer. Binding af wild-type bakterier og mutanter afskåret fra skabe forskellige exopolysaccharides blev målt ved hjælp af metoderne i trin 1.1, 5.1 og 7.2. Lucernespirer var overfladen steriliseret og spiret til en dag i sterilt vand ved 25 ° C i mørke. Fire spirer med vedlagte frø frakker blev placeret i sterilt plastik skåle, som indeholder 5 mL vand. Bakterier dyrket i Luria bouillon blev føjet til en endelig koncentration på ca 5 x 103 pr. mL. De podede spirer blev inkuberet ved 25 ° C i mørke i 3 dage. Spirer blev vasket to gange i 5 mL sterilt vand i et hætteglas af energisk inversion og homogeniseret i vask buffer ved hjælp af en motordreven Teflon glas homogeniseringsapparat. Tidligere eksperimenter ved hjælp af bakterier er markeret med et plasmid, bærer normal god landbrugspraksis gen viste ingen internaliseret bakterier, selvom overflade bakterier var let observeret. Resultaterne er vist i tabel 1. To stammer af E. coli O157: H7 blev undersøgt. I begge stammer syntes produktionen af poly-β-1,6-glucuronsyre acid(PGA) at yde det største bidrag til binding af sygdomsfremkaldende E. coli at plante flader. Colon syre også spillet en betydelig rolle i bindende. Reduktion i bindende i cellulose-minus mutanter var betydelige men det var ikke så stor som for de andre to polysaccharider.
<table fo:keep-together.within-page="1"><tbody>
<tr>
<td colspan="4">Virkninger af mutationer i Exopolysaccharide produktion gener på bindende af E. coli O157: H7 spirer og åbne frø frakker</td>
		</tr>
<tr>
<td rowspan="2">Bakteriel stamme</td>
			<td rowspan="2">Mutation eller genotype (relevante fænotype)</td>
			<td colspan="2">Log10 antal bakterier bundet pr. spire eller frø frakke</td>
		</tr>
<tr>
<td>Lucerne spirerb
</td>
			<td>Åben frø frakker</td>
		</tr>
<tr>
<td>86-24</td>
			<td>Ingen (vildtype)</td>
			<td>4.7 ± 0,6</td>
			<td>5.6 ± 0,2</td>
		</tr>
<tr>
<td>8624N</td>
			<td>
yhjN (cellulose-minus)</td>
			<td>2.9 ± 0,7c
</td>
			<td>3,5 ± 0,6c
</td>
		</tr>
<tr>
<td>8624C</td>
			<td>
wcaD (Colon syre-minus)</td>
			<td>1.8 ± 0,7c
</td>
			<td>2.4 ± 0,5c
</td>
		</tr>
<tr>
<td>8624 PEDERSEN</td>
			<td>
pgaC (PGA-minus)</td>
			<td>< 1.0c
</td>
			<td>1,0 ± 1,0c
</td>
		</tr>
<tr>
<td>DEC4A</td>
			<td>Ingen (vildtype)</td>
			<td>5.6 ± 0,2</td>
			<td>6.1 ± 0,3</td>
		</tr>
<tr>
<td>DEC4AN</td>
			<td>
yhjN (cellulose-minus)</td>
			<td>4,8 ± 0,8d
</td>
			<td>4.1 ± 0,8d
</td>
		</tr>
<tr>
<td>DEC4AC</td>
			<td>
wcaD (Colon syre-minus)</td>
			<td>3,9 ± 0,5c
</td>
			<td>4,8 ± 0,8d
</td>
		</tr>
<tr>
<td>DEC4AP</td>
			<td>
pgaC (PGA-minus)</td>
			<td>< 1.0c
</td>
			<td>1.2 ± 0,7c
</td>
		</tr>
<tr>
<td colspan="4">en gennemsnit ± standardafvigelse for et minimum af tre målinger af (log10) antal og bakterier bundet efter 3 dage.</td>
		</tr>
<tr>
<td colspan="4">b spirer blev vasket før måling.</td>
		</tr>
<tr>
<td colspan="4">c afviger betydeligt fra den vilde type: P < 0,01.</td>
		</tr>
<tr>
<td colspan="4">d adskiller sig væsentligt fra den vilde type: P < 0,05.</td>
		</tr>
<tr>
<td colspan="4">Denne tabel er ændret fra Matthysse, Deora, Mishra og Torres10.</td>
		</tr>
</tbody></table>Tabel 1: virkningerne af mutationer i exopolysaccharide produktion gener på bindingen af E. coli O157: H7 at spirer. For at bestemme forskellige exopolysaccharides og LPS i bindingen af patogene rolle E. coli O157: H7 stammer til lucernespirer, vil bindingen af et sæt af mutanter spirer og åbne frø frakker blev undersøgt ved hjælp af metoderne, der beskrevet i trin 6. Resultaterne viste, at poly-β-1, 6 -N-acetyl-D-Glukosamin (PGA) synes at være afgørende for binding til spirer og at både cellulose og colanic syre er nødvendige for maksimal binding af E. coli O157. Denne tabel er ændret fra Matthysse, Deora, Mishra og Torres10.
For at afgøre, om produktion af PGA er tilstrækkeligt til at forårsage bakteriel bindende at plante flader, et plasmid (pMM11) transporterer den klonede operon kodning gener kræves for PGA blev produktion indført i to forskellige bakterier, som ikke ville normalt være i stand til at binde til tomat rødder10. A. tumefaciens A1045 er en mutant af vildtype stamme C58, som undlader at foretage cyklisk-β-1,2 glucan og også undlader at binde for at plante flader29. Sinorhizobium meliloti 1021, som danner rod knuder på Lucerne undlader at binde til ikke-bælgplanter herunder tomat12. De teknikker, der beskrives i trin 1.1, 5.1, 6.3 og 7.1 blev brugt til at bestemme, hvis evne til at gøre PGA generelt øget bakteriel binding til roden overflader. Tomatfrø var overfladen steriliseret og spiret i sterilt vand. Rødder blev skåret i segmenter 1 cm i længden og placeret i sterilt vand og bakterier blev podet. Da disse to arter af bakterier vokser i forskellige tempi, blev bindende målt på forskellige tidspunkter at tillade nogenlunde lige store mængder af bakterievækst. Tilstedeværelsen af plasmidet pMM11 forårsagede en lignende betydelig stigning i antallet af bundne bakterier af begge arter (tabel 2)10. En betydelig stigning i binding blev også set i det lys mikroskop, men bindingen var meget forskelligt for de to arter (figur 3). A. tumefaciens A1045 bundet som enkelte bakterier til roden overfladen. S. meliloti bundet i store klynger, hvor kun et par af bakterierne var direkte knyttet til roden og fleste af bakterier blev knyttet til andre bakterier. Dette eksempel viser, at blot analysere antallet af bakterier bundet uden herunder mikroskopisk observationer kan give et misvisende indtryk af resultaterne af et eksperiment. Selvom begge metoder (levedygtige celletal og mikroskopiske observationer) viser, at pMM11 øget bakteriel binding til tomat rødder, var typen af bindende forårsaget af produktionen af PGA forskellige for de to bakteriearter10.
<table fo:keep-together.within-page="1"><tbody>
<tr>
<td colspan="3">Effekten af plasmidet pMM11 på bindende af bakterier til tomat rødder</td>
		</tr>
<tr>
<td>Bakteriel stamme</td>
			<td>Plasmid</td>
			<td>Antallet af bakterier bundet pr. mm root længde</td>
		</tr>
<tr>
<td>A. tumefaciens A1045en
</td>
			<td>ingen</td>
			<td>0,25 x 103 ± 0,25 x 103
</td>
		</tr>
<tr>
<td></td>
			<td>pBBR1mcs (vektor)</td>
			<td>0,25 x 103 ± 0,25 x 103
</td>
		</tr>
<tr>
<td></td>
			<td>pMM11 (PGA syntese)</td>
			<td>10 x 103 ± 0,25 x 103
</td>
		</tr>
<tr>
<td>S. meliloti 1021b
</td>
			<td>ingen</td>
			<td>ingen fundet</td>
		</tr>
<tr>
<td></td>
			<td>pBBR1mcs (vektor)</td>
			<td>ingen fundet</td>
		</tr>
<tr>
<td></td>
			<td>pMM11 (PGA syntese)</td>
			<td>50 x 103 ± 5 x 103
</td>
		</tr>
<tr>
<td colspan="3">en bakteriel bindende blev målt efter 2 timer</td>
		</tr>
<tr>
<td colspan="3">b bakteriel bindende var foranstaltning efter 18 timer</td>
		</tr>
<tr>
<td colspan="3">Denne tabel er ændret fra Matthysse, Deora, Mishra og Torres10.</td>
		</tr>
</tbody></table>Tabel 2: effekten af en plasmid udoever binding af gener syntesen af PGA A. tumefaciens A1045 og S. meliloti 1021 til tomat root segmenter. For at undersøge muligheden af poly-β-1, 6 -N-acetyl-D-Glukosamin (PGA) at fremme binding af bakterier til at plante rødder, effekten af et plasmid, giver mulighed for at foretage PGA (pMM11) for bindingen af to bakteriestammer plante-forbundet til tomat rødder blev undersøgt. Hverken stamme af bakterier viste betydelig binding til tomat rødder i mangel af plasmidet eller tilstedeværelse af plasmidet uden gener kodning PGA syntese (pBBR1mcs). Tilsætning af plasmid transporterer PGA syntese gener forøget binding af begge typer af bakterier. Fordi A. tumefaciens vokser hurtigere end S. meliloti bindende blev målt efter 2 h af inkubation i A. tumefaciens og 18 h for S. meliloti. De anvendte teknikker er disse beskrevet i trin 7. Denne tabel er ændret fra Matthysse, Deora, Mishra og Torres10.
<img alt="Figure 3" class="xfigimg" src="/files/ftp_upload/56599/56599fig3.jpg"> Figur 3 : Effekt af plasmidet pMM11 transporterer PGA biosyntesen gener for bindingen af A. tumefaciens A1045 og S. meliloti 1021 til tomat rodtråde. Binding til tomat rodtråde a) A. tumefaciens A1045, B) A. tumefaciens A1045 pMM11, C) S. meliloti 1021, og D) S. meliloti 1021 pMM11. Selv om stigningen i bindingen af de to bakteriearter er nogenlunde samme er detaljerne i bindende som set i det lys mikroskop helt anderledes. De anvendte teknikker er disse beskrevet i trin 6. Dette tal er blevet ændret fra Matthysse, Deora, Mishra og Torres10. <a href="https://cloudflare.jove.com/files/ftp_upload/56599/56599fig3large.jpg" target="_blank">Venligst klik her for at se en større version af dette tal.</a>
Det er nogle gange muligt at bruge binding til ikke-biologiske overflader til at støtte skelne bidrag af bakterier og plante i en bestemt interaktion. De unipolære polysaccharide(UPP) af A. tumefaciens har vist sig at være i stand til at mægle bakteriel binding til en bred vifte af både biologiske og ikke-biologiske overflader30. Calcium blev observeret for at hæmme bindingen af A. tumefaciens at plante flader medieret af UPP28. For at afgøre, om hæmning af calciumioner af bakteriel bindende at plante flader er på grund af en effekt på bakterierne eller på plant underlag, undersøgtes bindingen af bakterier til nylon tråde. Teknikkerne, der beskrives i trin 8.2 blev brugt. Tomatfrø var overfladen steriliseret og spiret i vand som beskrevet i trin 1. Bakterier var vokset i minimal medium med saccharose og tilføjet til tomat rødder eller nylon tråde i en endelig koncentration på ca 105/mL som beskrevet i trin 5.1. Effekten af ekstra CaCl2 på bakteriel binding til tomat rødder og nylon tråde blev undersøgt i mikroskop. Figur 4 viser en lignende hæmning af bindingen af calcium ved hjælp af enten overflade, tyder på, at effekten af calcium er primært på bakterier10.
<img alt="Figure 4" class="xfigimg" src="/files/ftp_upload/56599/56599fig4.jpg"> Figur 4 : Effekten af calcium på bindingen af A. tumefaciens til tomat rodtråde og nylon tråde. A. tumefaciens blev inkuberet med tomat rødder (A og B) eller nylon tråde (C og D) i 24 timer i en 1:10 fortynding af MS salte og 1:20 fortynding af AB minimal medium, 0,4% saccharose (A og C) eller i en 1:10 fortynding af MS salte og 1:20 fortynding af AB minimal medium , 0,4% saccharose indeholdende 60 mM CaCl2 (B og D)31. Den tilføjede CaCl2 hæmmede bakteriel binding til både rødder og nylon tråde tyder på, at hæmning var primært på grund af en effekt på bakterierne ikke på plant underlag. <a href="https://cloudflare.jove.com/files/ftp_upload/56599/56599fig4large.jpg" target="_blank">Venligst klik her for at se en større version af dette tal.</a>

Watch this Scientific Journal Video about Adherence of Bacteria to Plant Surfaces Measured in the Laboratory at JoVE.com

Adherence of Bacteria to Plant Surfaces Measured in the Laboratory

En nem metode til måling og karakterisering af bakteriel adhæsion til planter, især rødder og spirer, der beskrives i denne artikel.

Overholdelse af bakterier til at plante flader målt i laboratoriet

This manuscript describes a method to measure bacterial binding to axenic plant surfaces in the light microscope and through the use of viable cell ...

Research

JoVE Journal

Environment

A New Application of the Electrical Penetration Graph (EPG) for Acquiring and Measuring Electrical Signals in Phloem Sieve Elements

A New Application of the Electrical Penetration Graph EPG for Acquiring and Measuring Electrical Signals in Phloem Sieve Elements

En ny anvendelse af elektrisk Penetration Graph (EPG) for at erhverve og måling af elektriske signaler i Phloem Sieve Elements

Electrophysiological properties of cells are often studied in vitro, after dissociating them from their native environments. However, the study of ...

Laboratory Simulation of an Iron(II)-rich Precambrian Marine Upwelling System to Explore the Growth of Photosynthetic Bacteria

Laboratory Simulation of an IronII-rich Precambrian Marine Upwelling System to Explore the Growth of Photosynthetic Bacteria

Laboratorium Simulering af en jern (II) -rig Prækambrium Marine Upwelling System til udforske Vækst af fotosyntetiske bakterier

A conventional concept for the deposition of some Precambrian Banded Iron Formations (BIF) proceeds on the assumption that ferrous iron [Fe(II)] upwelling ...

Procedures of Laboratory Fumigation for Pest Control with Nitric Oxide Gas

Procedurer for laboratoriet gasning for skadedyrsbekæmpelse med nitrogenoxid Gas

Nitric oxide (NO) is a newly discovered fumigant for postharvest pest control. This paper provides detailed protocols for conducting NO fumigation on ...

Experimental Methods of Dust Charging and Mobilization on Surfaces with Exposure to Ultraviolet Radiation or Plasmas

Eksperimentelle metoder til støv opladning og mobilisering på overflader med eksponering for Ultraviolet stråling eller plasmaer

Electrostatic dust transport has been hypothesized to explain a number of observations of unusual planetary phenomena. Here, it is demonstrated using ...

Ecosystem Fabrication (EcoFAB) Protocols for The Construction of Laboratory Ecosystems Designed to Study Plant-microbe Interactions

Ecosystem Fabrication EcoFAB Protocols for The Construction of Laboratory Ecosystems Designed to Study Plant-microbe Interactions

Økosystem fabrikation (EcoFAB) protokoller for byggeri Laboratory økosystemers designet til at studere plante-mikrobe interaktioner

Beneficial plant-microbe interactions offer a sustainable biological solution with the potential to boost low-input food and bioenergy production. A ...

Double-stranded RNA Oral Delivery Methods to Induce RNA Interference in Phloem and Plant-sap-feeding Hemipteran Insects

Dobbelt-strenget RNA Oral leveringsmetoder til at fremkalde RNA-interferens i Phloem og plante-sap-fodring Hemipteran insekter

Phloem and plant sap feeding insects invade the integrity of crops and fruits to retrieve nutrients, in the process damaging food crops. Hemipteran ...

Self-standing Electrochemical Set-up to Enrich Anode-respiring Bacteria On-site

Selvstændigt elektrokemiske Set-up til at berige Anode-respiring bakterier på stedet

Anaerobic respiration coupled with electron transport to insoluble minerals (referred to as extracellular electron transport [EET]) is thought to be ...

The Plant Infection Test: Spray and Wound-Mediated Inoculation with the Plant Pathogen Magnaporthe Grisea

The Plant Infection Test: Spray and Wound-Mediated Inoculation with the Plant Pathogen Magnaporthe Grisea

Plante infektion Test: Spray og sår-medieret podning med plante patogen Magnaporthe Grisea

Plants possess a powerful system to defend themselves against potential threats by pathogenic fungi. For agriculturally important plants, however, current ...

A Flexible Low Cost Hydroponic System for Assessing Plant Responses to Small Molecules in Sterile Conditions

En fleksibel lavpris hydroponiske System til vurdering af plante svar til små molekyler i Sterile forhold

A wide range of studies in plant biology are performed using hydroponic cultures. In this work, an in vitro hydroponic growth system designed for ...

An Optimized Rhizobox Protocol to Visualize Root Growth and Responsiveness to Localized Nutrients

En optimeret Rhizobox protokol til at visualisere rodvækst og lydhørhed over for lokaliserede næringsstoffer

Roots are notoriously difficult to study. Soil is both a visual and mechanical barrier, making it difficult to track roots in situ without destructive ...