Name: adherence of bacteria to plant surfaces measured in the laboratory
Uploaded: 2018-06-19T12:30:00
Duration: 7 min 7 s
Description: Watch this Scientific Journal Video about Adherence of Bacteria to Plant Surfaces Measured in the Laboratory at JoVE.com

Författaren tack Susan Whitfield för förberedelse av siffror och Camille Martin och Hillary Samagaio för hjälp med några av experiment.

<ol>
	<li>Heaton, J. C., Jones, K. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/query.fcgi?db=PubMed&cmd=Search&doptcmdl=Citation&defaultField=Title+Word&term=Microbial+contamination+of+fruit+and+vegetables+and+the+behaviour+of+enteropathogens+in+the+phyllosphere:+a+review.">Microbial contamination of fruit and vegetables and the behaviour of enteropathogens in the phyllosphere: a review.</a> J. Appl. Microbiol. 104, 613-626 (2008).</li><li>Beuchat, L. R. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/query.fcgi?db=PubMed&cmd=Search&doptcmdl=Citation&defaultField=Title+Word&term=Ecological+factors+influencing+survival+and+growth+of+human+pathogens+on+raw+fruit+and+vegetables.">Ecological factors influencing survival and growth of human pathogens on raw fruit and vegetables.</a> Microbes Infect. 4, 413-423 (2002).</li><li>Berger, C. N., et al. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/query.fcgi?db=PubMed&cmd=Search&doptcmdl=Citation&defaultField=Title+Word&term=Fresh+fruit+and+vegetables+as+vehicles+for+the+transmission+of+human+pathogens.">Fresh fruit and vegetables as vehicles for the transmission of human pathogens.</a> Environ. Microbiol. 12, 2385-2397 (2010).</li><li>Lugtenberg, B. J., Chin, A. W. T., Bloemberg, G. V. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/query.fcgi?db=PubMed&cmd=Search&doptcmdl=Citation&defaultField=Title+Word&term=Microbe-plant+interactions:+principles+and+mechanisms.">Microbe-plant interactions: principles and mechanisms.</a> Antonie Van Leeuwenhoek. 81, 373-383 (2002).</li><li>Preston, G. M., Haubold, B., Rainey, P. B. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/query.fcgi?db=PubMed&cmd=Search&doptcmdl=Citation&defaultField=Title+Word&term=Bacterial+genomics+and+adaptation+to+life+on+plants:+implications+for+the+evolution+of+pathogenicity+and+symbiosis.">Bacterial genomics and adaptation to life on plants: implications for the evolution of pathogenicity and symbiosis.</a> Curr. Opin. Microbiol. 1, 589-597 (1998).</li><li>Compant, S., Duffy, B., Nowak, J., Clement, C., Barka, E. A. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/query.fcgi?db=PubMed&cmd=Search&doptcmdl=Citation&defaultField=Title+Word&term=Use+of+Plant+Growth-Promoting+Bacteria+for+Biocontrol+of+Plant+Diseases:+Principles,+Mechanisms+of+Action,+and+Future+Prospects.">Use of Plant Growth-Promoting Bacteria for Biocontrol of Plant Diseases: Principles, Mechanisms of Action, and Future Prospects.</a> Appl. Environ. Microbiol. 71, 4951-4959 (2005).</li><li>Mathews, S. L., Smith, R. B., Matthysse, A. G. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/query.fcgi?db=PubMed&cmd=Search&doptcmdl=Citation&defaultField=Title+Word&term=A+comparison+of+the+retention+of+pathogenic+Escherichia+coli.+O157+by+sprouts,+leaves+and+fruits.">A comparison of the retention of pathogenic Escherichia coli. O157 by sprouts, leaves and fruits.</a> Microb. Biotechnol. 7, 570-579 (2014).</li><li>Fuqua, C., Matthysse, A. G. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/query.fcgi?db=PubMed&cmd=Search&doptcmdl=Citation&defaultField=Title+Word&term=Methods+for+studying+bacterial+biofilms+associated+with+plants.">Methods for studying bacterial biofilms associated with plants.</a> Methods Enzymol. 337, 3-18 (2001).</li><li>Torres, A. G., Jeter, C., Langley, W., Matthysse, A. G. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/query.fcgi?db=PubMed&cmd=Search&doptcmdl=Citation&defaultField=Title+Word&term=Differential+binding+of+Escherchia+coli.O157:H7+to+alfalfa,+human+epithelial+cells,+and+plastic+is+mediated+by+a+variety+of+surface+structures.">Differential binding of Escherchia coli.O157:H7 to alfalfa, human epithelial cells, and plastic is mediated by a variety of surface structures.</a> Appl. Environ. Microbiol. 71, 8008-8015 (2005).</li><li>Matthysse, A. G., Deora, R., Mishra, M., Torres, A. G. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/query.fcgi?db=PubMed&cmd=Search&doptcmdl=Citation&defaultField=Title+Word&term=Polysaccharides+cellulose,+poly-beta-1,6-n-acetyl-D-glucosamine,+and+colanic+acid+are+required+for+optimal+binding+of+Escherichia+coli+O157:H7+strains+to+alfalfa+sprouts+and+K-12+strains+to+plastic+but+not+for+binding+to+epithelial+cells.">Polysaccharides cellulose, poly-beta-1,6-n-acetyl-D-glucosamine, and colanic acid are required for optimal binding of Escherichia coli O157:H7 strains to alfalfa sprouts and K-12 strains to plastic but not for binding to epithelial cells.</a> Appl. Environ. Microbiol. 74, 2384-2390 (2008).</li><li>Matthysse, A. G., et al. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/query.fcgi?db=PubMed&cmd=Search&doptcmdl=Citation&defaultField=Title+Word&term=The+effect+of+cellulose+overproduction+on+binding+and+biofilm+formation+on+roots+by+Agrobacterium+tumefaciens.">The effect of cellulose overproduction on binding and biofilm formation on roots by Agrobacterium tumefaciens.</a> Mol. Plant Microbe Interact. 18, 1002-1010 (2005).</li><li>Matthysse, A. G., Kijne, J. W., Spaink, H. P., Kondorosi, A., Hooykaas, P. J. J. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/query.fcgi?db=PubMed&cmd=Search&doptcmdl=Citation&defaultField=Title+Word&term=Attachment+of+Rhizobiaceae+to+plant+cells.">Attachment of Rhizobiaceae to plant cells.</a> The Rhizobiaceae. , 235-249 (1998).</li><li>Matthysse, A. G. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/query.fcgi?db=PubMed&cmd=Search&doptcmdl=Citation&defaultField=Title+Word&term=Conditioned+medium+promotes+the+attachment+of+Agrobacterium+tumefaciens.strain+NT1+to+carrot+cells.">Conditioned medium promotes the attachment of Agrobacterium tumefaciens.strain NT1 to carrot cells.</a> Protoplasma. 183, 131-136 (1994).</li><li>Matthysse, A. G., McMahan, S. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/query.fcgi?db=PubMed&cmd=Search&doptcmdl=Citation&defaultField=Title+Word&term=The+effect+of+the+Agrobacterium+tumefaciens.+attR+mutation+on+attachment+and+root+colonization+differs+between+legumes+and+other+dicots.">The effect of the Agrobacterium tumefaciens. attR mutation on attachment and root colonization differs between legumes and other dicots.</a> Appl. Environ. Microbiol. 67, 1070-1075 (2001).</li><li>Jeter, C., Matthysse, A. G. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/query.fcgi?db=PubMed&cmd=Search&doptcmdl=Citation&defaultField=Title+Word&term=Characterization+of+the+binding+of+diarrheagenic+strains+of+E.+coli.to+plant+surfaces+and+the+role+of+curli+in+the+interaction+of+the+bacteria+with+alfalfa+sprouts.">Characterization of the binding of diarrheagenic strains of E. coli.to plant surfaces and the role of curli in the interaction of the bacteria with alfalfa sprouts.</a> Mol. Plant Microbe Interact. 18, 1235-1242 (2005).</li><li>Matthysse, A. G., McMahan, S. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/query.fcgi?db=PubMed&cmd=Search&doptcmdl=Citation&defaultField=Title+Word&term=Root+colonization+by+Agrobacterium+tumefaciens+is+reduced+in+cel,+attB,+attD,+and+attR+mutants.">Root colonization by Agrobacterium tumefaciens is reduced in cel, attB, attD, and attR mutants.</a> Appl. Environ. Microbiol. 64, 2341-2345 (1998).</li><li>Morton, E. R., Fuqua, C. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/query.fcgi?db=PubMed&cmd=Search&doptcmdl=Citation&defaultField=Title+Word&term=Phenotypic+analyses+of+Agrobacterium.">Phenotypic analyses of Agrobacterium.</a> Curr. Protoc. Microbiol. , (2012).</li><li>Brandl, M. T. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/query.fcgi?db=PubMed&cmd=Search&doptcmdl=Citation&defaultField=Title+Word&term=Plant+lesions+promote+the+rapid+multiplication+of+Escherichia+coli+O157:H7+on+postharvest+lettuce.">Plant lesions promote the rapid multiplication of Escherichia coli O157:H7 on postharvest lettuce.</a> Appl. Environ. Microbiol. 74, 5285-5289 (2008).</li><li>Franz, E., et al. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/query.fcgi?db=PubMed&cmd=Search&doptcmdl=Citation&defaultField=Title+Word&term=Quantification+of+contamination+of+lettuce+by+GFP-expressing+Escherichia+coli+O157:H7+and+Salmonella+enterica+serovar+Typhimurium.">Quantification of contamination of lettuce by GFP-expressing Escherichia coli O157:H7 and Salmonella enterica serovar Typhimurium.</a> Food Microbiol. 24, 106-112 (2007).</li><li>Morton, E. R., Fuqua, C. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/query.fcgi?db=PubMed&cmd=Search&doptcmdl=Citation&defaultField=Title+Word&term=Laboratory+maintenance+of+Agrobacterium.">Laboratory maintenance of Agrobacterium.</a> Curr. Protoc. Microbiol. , (2012).</li><li>Lugtenberg, B. J., Kravchenko, L. V., Simons, M. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/query.fcgi?db=PubMed&cmd=Search&doptcmdl=Citation&defaultField=Title+Word&term=Tomato+seed+and+root+exudate+sugars:+composition,+utilization+by+Pseudomonas+biocontrol+strains+and+role+in+rhizosphere+colonization.">Tomato seed and root exudate sugars: composition, utilization by Pseudomonas biocontrol strains and role in rhizosphere colonization.</a> Environ. Microbiol. 1, 439-446 (1999).</li><li>Murashige, T., Skoog, F. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/query.fcgi?db=PubMed&cmd=Search&doptcmdl=Citation&defaultField=Title+Word&term=A+Revised+Medium+for+Rapid+Growth+and+Bio+Assays+with+Tobacco+Tissue+Cultures.">A Revised Medium for Rapid Growth and Bio Assays with Tobacco Tissue Cultures.</a> Physiologia Plantarum. 15, 473-497 (1962).</li><li>Danhorn, T., Fuqua, C. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/query.fcgi?db=PubMed&cmd=Search&doptcmdl=Citation&defaultField=Title+Word&term=Biofilm+formation+by+plant-associated+bacteria.">Biofilm formation by plant-associated bacteria.</a> Annu. Rev. Microbiol. 61, 401-422 (2007).</li><li>Branda, S. S., Vik, S., Friedman, L., Kolter, R. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/query.fcgi?db=PubMed&cmd=Search&doptcmdl=Citation&defaultField=Title+Word&term=Biofilms:+the+matrix+revisited.">Biofilms: the matrix revisited.</a> Trends Microbiol. 13, 20-26 (2005).</li><li>O'Toole, G., Kaplan, H. B., Kolter, R. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/query.fcgi?db=PubMed&cmd=Search&doptcmdl=Citation&defaultField=Title+Word&term=Biofilm+formation+as+microbial+development.">Biofilm formation as microbial development.</a> Annu. Rev. Microbiol. 54, 49-79 (2000).</li><li>Charkowski, A. O., Barak, J. D., Sarreal, C. Z., Mandrell, R. E. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/query.fcgi?db=PubMed&cmd=Search&doptcmdl=Citation&defaultField=Title+Word&term=Differences+in+growth+of+Salmonella+enterica+and+Escherichia+coli+O157:H7+on+alfalfa+sprouts.">Differences in growth of Salmonella enterica and Escherichia coli O157:H7 on alfalfa sprouts.</a> Appl. Environ. Microbiol. 68, 3114-3120 (2002).</li><li>Loper, J., Suslow, T., Schroth, M. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/query.fcgi?db=PubMed&cmd=Search&doptcmdl=Citation&defaultField=Title+Word&term=Lognormal+distribution+of+bacterial+populations+in+the+rhizosphere.">Lognormal distribution of bacterial populations in the rhizosphere.</a> Phytopathology. 74, 1454-1460 (1984).</li><li>Matthysse, A. G. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/query.fcgi?db=PubMed&cmd=Search&doptcmdl=Citation&defaultField=Title+Word&term=Attachment+of+Agrobacterium+to+plant+surfaces.">Attachment of Agrobacterium to plant surfaces.</a> Front Plant Sci. 5, 252 (2014).</li><li>Douglas, C. J., Halperin, W., Nester, E. W. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/query.fcgi?db=PubMed&cmd=Search&doptcmdl=Citation&defaultField=Title+Word&term=Agrobacterium+tumefaciens+mutants+affected+in+attachment+to+plant+cells.">Agrobacterium tumefaciens mutants affected in attachment to plant cells.</a> J. Bacteriol. 152, 1265-1275 (1982).</li><li>Tomlinson, A. D., Fuqua, C. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/query.fcgi?db=PubMed&cmd=Search&doptcmdl=Citation&defaultField=Title+Word&term=Mechanisms+and+regulation+of+polar+surface+attachment+in+Agrobacterium+tumefaciens.">Mechanisms and regulation of polar surface attachment in Agrobacterium tumefaciens.</a> Curr. Opin. Microbiol. 12, 708-714 (2009).</li><li>Matthysse, A. G. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/query.fcgi?db=PubMed&cmd=Search&doptcmdl=Citation&defaultField=Title+Word&term=Attachment+of+Agrobacterium+to+plant+surfaces.">Attachment of Agrobacterium to plant surfaces.</a> Front Plant Sci. 5, (2014).</li><li>Wright, K. M., et al. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/query.fcgi?db=PubMed&cmd=Search&doptcmdl=Citation&defaultField=Title+Word&term=The+endophytic+lifestyle+of+Escherichia+coli+O157:H7:+quantification+and+internal+localization+in+roots.">The endophytic lifestyle of Escherichia coli O157:H7: quantification and internal localization in roots.</a> Phytopathology. 103, 333-340 (2013).</li><li>Berger, C. N., et al. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/query.fcgi?db=PubMed&cmd=Search&doptcmdl=Citation&defaultField=Title+Word&term=Fresh+fruit+and+vegetables+as+vehicles+for+the+transmission+of+human+pathogens.">Fresh fruit and vegetables as vehicles for the transmission of human pathogens.</a> Environ. Microbiol. 12, 2385-2397 (2010).</li><li>Erickson, M. C., et al. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/query.fcgi?db=PubMed&cmd=Search&doptcmdl=Citation&defaultField=Title+Word&term=Internalization+and+Fate+of+Escherichia+coli+O157:H7+in+Leafy+Green+Phyllosphere+Tissue+Using+Various+Spray+Conditions.">Internalization and Fate of Escherichia coli O157:H7 in Leafy Green Phyllosphere Tissue Using Various Spray Conditions.</a> J. Food Prot. 77, 713-721 (2014).</li><li>McKellar, R. C., et al. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/query.fcgi?db=PubMed&cmd=Search&doptcmdl=Citation&defaultField=Title+Word&term=Evaluation+of+different+approaches+for+modeling+Escherichia+coli+O157:H7+survival+on+field+lettuce.">Evaluation of different approaches for modeling Escherichia coli O157:H7 survival on field lettuce.</a> Int. J. Food Microbiol. 184, 75-85 (2014).</li><li>Wu, F. M., et al. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/query.fcgi?db=PubMed&cmd=Search&doptcmdl=Citation&defaultField=Title+Word&term=Factors+influencing+the+detection+and+enumeration+of+Escherichia+coli+O157:H7+on+alfalfa+seeds.">Factors influencing the detection and enumeration of Escherichia coli O157:H7 on alfalfa seeds.</a> Int. J. Food Microbiol. 71, 93-99 (2001).</li></ol>

Författaren förklarar att hon har inga konkurrerande finansiella intressen.

Det är viktigt att vara medveten om alla de ytor som bakterier kan följa under experimentet. Således bakterier som kan binda till glas kan vara underskattad om livskraftiga blodkroppar görs med hjälp av glasrör och pipetter. Om växter odlas i agar eller jord och några av agar eller jord kvar på plantorna kan sedan bakterierna binda det vidhäftande materialet i stället för växterna. Däremot, tvätta växt ytan, särskilt när det gäller rötter, kan ta bort naturliga ytbeläggningar såsom slemhinnor och därmed förändra resultaten av följsamhet tester.
Det är viktigt att vara säker på att de bakterier som lagts till blandningen inkubation förbli vid liv under experimentet. Således göras rutinmässigt livskraftig blodkroppar av gratis samt bifogade bakterier. Vissa behandlingar eller bakteriell mutationer kan minska bakteriell tillväxt eller faktiskt orsaka döden av en bråkdel av den bakteriella populationen. Levande och döda bakterier kanske inte distinguishable i mikroskopet om inte speciella fläckar används. Det finns en användbar fläcken kit för live/dead bakterier som beror på uteslutandet av färgämnen från levande bakterier. Om en blandad befolkning av bakteriearter finns sedan livskraftig blodkroppar av arter av intresse är dock sannolikt att vara den enklaste metoden att bestämma om ruvningen har resulterat i bakteriell död.
Medium sammansättning kommer att påverka bakteriella överlevnad och tillväxt. Root exsudat och material släppt från såret och skär platser kommer att ge substrat för att stödja blygsamma bakterietillväxt. Fosfat, kväve och järn tenderar att vara begränsande i dessa villkor. Divalenta katjoner såsom kalcium och magnesium kan påverka vidhäftningen. I vissa fall kan kolkälla påverka vidhäftningen. pH frågor också. I allmänhet är odlingsbädden pH mellan 5,5 och 6,5.
Det är nödvändigt att vara försiktig i att använda bakterier markerade med antibiotikaresistens. De antibiotika som oftast används är rifampicin och nalidixic syra. Resistens mot dessa antibiotika är i allmänhet på grund av mutationer i kromosomala gener (RNA-polymeras och gyras, respektive) och således kan inte enkelt överföras till en annan stam under ruvningen. Även leder denna typ av resistens inte i nedbrytning eller modifiering av antibiotika. Markera bakterier med en plasmid-burna genen markör rekommenderas inte såvida inte plasmiden inte kan överföras till alla andra bakterier. Antibiotikaresistens måste inte vara på grund av nedbrytning eller kemisk modifiering av antibiotikummen som antibiotika känsliga bakterier kommer sedan att kunna växa på antibiotika tallrikar om de ligger nära de resistenta bakterierna.
De metoder som beskrivs i detta dokument är användbara för små urvalsstorlekar och/eller experiment där proverna måste finnas (exempelvis experiment med mänskliga patogener). För stor urvalsstorlek (över 100 g material eller mer än 50 växter) skulle andra metoder eller drastisk ändring av dessa metoder vara behövs10,19,32,19,33, 34 , 35 , 36. förekomsten av stora mängder mikroorganismer än de arter som studeras kan också innebära betydande problem. Möjliga lösningar inkluderar användning av bakterier som markerats med en fluorescerande protein eller antibiotikaresistens enligt beskrivningen i steg 6.1.2 och 7.3. När bakterierna av intresse är sällsynta individer i en stor population av andra mikroorganismer kan dessa markörer dock inte tillräcklig för att göra en entydig bedömning av antalet bakterier som studeras.
Alla de metoder som beskrivs här är baserat laboratoriemetoder. Mindre ändringar skulle behövas för växthusgaser studier. Fler större modifieringar sannolikt kommer att krävas för fältstudier där protozoer, insekter och andra djur predation och klimat variation komplicerar tillhandahållandet av definierade villkor för experiment. Dessa metoder kan framöver utökas med samspelet mellan två eller fler mikroorganismer på anläggningen ytan.

Mätning av bakteriell bindning att plantera ytor har blivit viktiga i tre skilda situationer. Den första situationen är granskningen av överföringen av mänskliga patogener på växt ytor1,2,3. Målet här är att förhindra bakteriell bindning eller att ta bort eller döda bundna bakterier och därmed att minska överföring av sjukdom av växtmaterial. Den andra situationen är undersökningen av bindningen av växten patogener att plantera ytor4. Än en gång målet här är att förhindra bindning eller att ta bort eller döda bundna bakterier och därmed att minska sjukdom. Den tredje situationen är undersökningen av bindningen av symbiotiska eller växt-tillväxt-främja bakterier5,6. Målet här är att främja bakterie bindande och därigenom öka växtskydd och gröda avkastning.
Teknikerna för mätning av bakteriell bindning att plantera ytor som beskrivs i denna artikel är billigt och relativt enkelt att utföra. De enda krav är ett mikroskop och material i allmänhet återfinns i ett laboratorium för bakteriologi. Ett bad någon sonikator är användbar för vissa tekniker. De tekniker som beskrivs är utformade för bindande experiment som genomförs med hjälp av relativt små urvalsstorlekar. Mätningar av bindande görs i laboratorium, även om det kan vara möjligt att ändra några av dessa tekniker för användning i växthuset eller i fältet.
Dessa tekniker har använts för att mäta bakteriell bindning till rötter, groddar, skurna blad, skär frukterna och intakt körsbärstomater i laboratoriet7,8,9,10,11, 12,13,14,15. De har också använts för att mäta rot koloniseringen av växter som växer i jord eller sand i laboratoriet16. Tekniker har använts med många bakteriearter inklusive Agrobacterium tumefaciens, Sinorhizobium meliloti, Escherichia coli, Salmonella enterica, och Pseudomonas fluorescens. En användbar Beskrivning av metoder för att bedöma samspelet mellan A. tumefaciens med ytor kan hittas i Morton och Fuqua (2012)17. I alla fall var inblandade urvalsstorlekarna små, vanligen mindre än 25-50 växter. De tekniker som beskrivs är lämplig för användning med mänskliga patogener som måste hållas innehöll under experimenten.

<table border="0" cellpadding="0" cellspacing="0" style="width:731px;" width="731">
	<colgroup>
		<col />
		<col />
		<col />
		<col />
	</colgroup>
	<tbody>
		<tr height="56">
			<td height="56" style="height:56px;width:143px;">light microscope</td>
			<td style="width:164px;">any</td>
			<td style="width:125px;">N/A</td>
			<td style="width:299px;">phase contrast or Nomarski optics are helpful, for studies using fluorescent markers a fluorescence microscope is required.</td>
		</tr>
		<tr height="40">
			<td height="40" style="height:40px;width:143px;">seeds</td>
			<td style="width:164px;">any&#160;</td>
			<td style="width:125px;">N/A</td>
			<td style="width:299px;">make a note of the seed lot number and the cultivar</td>
		</tr>
		<tr height="40">
			<td height="40" style="height:40px;width:143px;">bleach</td>
			<td style="width:164px;">any</td>
			<td style="width:125px;">N/A</td>
			<td style="width:299px;"></td>
		</tr>
		<tr height="40">
			<td height="40" style="height:40px;width:143px;">bath sonicator</td>
			<td style="width:164px;">any scientific supply company</td>
			<td style="width:125px;">N/A</td>
			<td style="width:299px;"></td>
		</tr>
		<tr height="40">
			<td height="40" style="height:40px;width:143px;">Triton X-100</td>
			<td style="width:164px;">Sigma-Aldrich</td>
			<td style="width:125px;">T9284</td>
			<td style="width:299px;"></td>
		</tr>
		<tr height="40">
			<td height="40" style="height:40px;width:143px;">nutrient agar&#160;</td>
			<td style="width:164px;">Difco&#160;</td>
			<td style="width:125px;">001-01-8</td>
			<td style="width:299px;"></td>
		</tr>
		<tr height="40">
			<td height="40" style="height:40px;width:143px;">soytone</td>
			<td style="width:164px;">Difco&#160;</td>
			<td style="width:125px;">24360</td>
			<td style="width:299px;"></td>
		</tr>
		<tr height="40">
			<td height="40" style="height:40px;width:143px;">Sand</td>
			<td style="width:164px;">sea sand Fisher Scientific</td>
			<td style="width:125px;">S25</td>
			<td style="width:299px;"></td>
		</tr>
		<tr height="40">
			<td height="40" style="height:40px;width:143px;">sand</td>
			<td style="width:164px;">&#160;Sigma-Aldrich</td>
			<td style="width:125px;">S9887</td>
			<td style="width:299px;"></td>
		</tr>
		<tr height="40">
			<td height="40" style="height:40px;width:143px;">conetainers</td>
			<td style="width:164px;">Stuewe &#38; Sons, Inc.</td>
			<td style="width:125px;">Ray-Leach cone-tainers</td>
			<td style="width:299px;">many different sizes are available to suit the type of plant you wish to grow</td>
		</tr>
		<tr height="40">
			<td height="40" style="height:40px;width:143px;">parafilm</td>
			<td style="width:164px;">any scientific supply company</td>
			<td style="width:125px;">N/A</td>
			<td style="width:299px;"></td>
		</tr>
		<tr height="40">
			<td height="40" style="height:40px;width:143px;">MS salts</td>
			<td style="width:164px;">Sigma-Aldrich</td>
			<td style="width:125px;">M5524</td>
			<td style="width:299px;"></td>
		</tr>
		<tr height="40">
			<td height="40" style="height:40px;width:143px;">parrafin</td>
			<td style="width:164px;">any</td>
			<td style="width:125px;">N/A</td>
			<td style="width:299px;"></td>
		</tr>
		<tr height="40">
			<td height="40" style="height:40px;width:143px;">centrigfuge</td>
			<td style="width:164px;">any scientific company</td>
			<td style="width:125px;">N/A</td>
			<td style="width:299px;">to pellet most bacteri only a small centrifuge with a max force of 10,000 XG is needed</td>
		</tr>
		<tr height="40">
			<td height="40" style="height:40px;width:143px;">vortex mixer</td>
			<td style="width:164px;">any scientific company</td>
			<td style="width:125px;"></td>
			<td style="width:299px;"></td>
		</tr>
		<tr height="40">
			<td height="40" style="height:40px;width:143px;">micrometer</td>
			<td style="width:164px;">ACCU-SCOPE Accessories</td>
			<td style="width:125px;">A3145</td>
			<td style="width:299px;"></td>
		</tr>
		<tr height="40">
			<td height="40" style="height:40px;width:143px;">Sedgwick-rafter counting cell</td>
			<td style="width:164px;">Hauser Scientific</td>
			<td style="width:125px;">HS3800</td>
			<td style="width:299px;"></td>
		</tr>
		<tr height="40">
			<td height="40" style="height:40px;width:143px;">probe-clip press-seal incubatin chamber</td>
			<td style="width:164px;">Sigma-Aldrich</td>
			<td style="width:125px;">Z359483</td>
			<td style="width:299px;"></td>
		</tr>
		<tr height="40">
			<td height="40" style="height:40px;width:143px;">rifampicin</td>
			<td style="width:164px;">Sigma-Aldrich</td>
			<td style="width:125px;">R3501</td>
			<td style="width:299px;"></td>
		</tr>
		<tr height="40">
			<td height="40" style="height:40px;width:143px;">naladixic acid</td>
			<td style="width:164px;">Sigma-Aldrich</td>
			<td style="width:125px;">n8878</td>
			<td style="width:299px;"></td>
		</tr>
		<tr height="40">
			<td height="40" style="height:40px;width:143px;">Live/dead stain</td>
			<td style="width:164px;">In Vitrogen Molecular Bioprobes</td>
			<td style="width:125px;">L7007</td>
			<td style="width:299px;"></td>
		</tr>
	</tbody>
</table>

adherence of bacteria to plant surfaces measured in the laboratory

Detta manuskript beskriver en metod att mäta bakteriell bindning till axenic växt ytor i mikroskopet ljus och med hjälp av livskraftiga blodkroppar. Växtmaterial som används inkluderar rötter, skott, blad och skära frukter. De metoder som beskrivs är billig, lätt och lämplig för små urvalsstorlekar. Bindande mäts i laboratorium och en mängd inkubation media och villkor kan användas. Effekten av hämmare kan bestämmas. Situationer som främjar och hämma bindningen kan också bedömas. I vissa fall är det möjligt att särskilja huruvida olika villkor ändra bindning primärt på grund av deras effekter på anläggningen eller på bakterier.

A. tumefaciens colonizes rotytor. För att avgöra huruvida bakteriell produktion av cellulosa spelar en roll i roten kolonisation, effekterna av bakteriell mutationer som hindrar cellulosa syntes var undersökt16. Metoder som beskrivs i steg 1.3 och 7,1 användes. Tomat frön var ytan steriliseras och grodde i sterilt vatten. När rötterna var cirka 2 cm långa var de doppad i en suspension av 105 bakterier per mL och planterade i pastöriserad jord i behållare. Växterna har vuxit under 14 dagar vid 25 ° C på en 12 h ljus/12 h mörka cykel. Efter den angivna tider växterna togs bort från behållarna. Rötterna var tvättas och sonicated i ett bad någon sonikator ta bort bunden bakterier. Bakteriella nummer bestämdes med hjälp av livskraftiga blodkroppar. Figur 2 visar effekten av två olika cellulosa-minus mutationer på möjligheten för bakterierna att kolonisera tomat rötter. Trots standardavvikelserna för vissa mätningar var så hög som 0,9 log10 (ett vanligt problem med denna typ av mätning) minskningen i bindning av cellulosa-minus mutanter är tydligt och vi kan konstatera att bakteriell produktion av cellulosa hjälpmedel bakterierna koloniseringen av tomat rötter.
<img alt="Figure 2" class="xfigimg" src="/files/ftp_upload/56599/56599fig2.jpg"> Figur 2 : Root koloniseringen av vildtyp och cellulosa-minus mutanter av A. tumefaciens. Log10 totala antalet bakterier per cm rot längd återhämtat sig från tomat rötter inokuleras med vildtyp A. tumefaciens stam C58 och cellulosa-minus mutanter C58:1 och C58:A60. De nummer som visas är medel från minst fyra separata experiment. Staplarna visar standardavvikelser av hjälpmedlet. Rötterna var inokuleras genom att doppa dem i en suspension av 105 bakterier per mL för en min. Växterna har odlats i behållare och löst vidhäftande bakterierna togs bort genom att tvätta rötterna i tvätt buffert i en injektionsflaska av glas. Hårt fastsittande bakterier togs bort med hjälp av ett bad någon sonikator och resulterande upphängning förkromad för att fastställa livskraftiga blodkroppar16. Denna siffra har ändrats från Matthysse och McMahan. <a href="https://cloudflare.jove.com/files/ftp_upload/56599/56599fig2large.jpg" target="_blank">Klicka här för att se en större version av denna siffra.</a>
Rollen som exopolysaccharides i bindningen av E. coli och andra bakterier till alfalfagroddar undersöktes. Vissa utbrott av diarrheal sjukdom orsakad av E. coli O157: H7 har spårats till förorenade alfalfagroddar. Bindningen av vildtyp bakterier och mutanter inte göra olika exopolysaccharides mättes med hjälp av de metoder som beskrivs i steg 1.1, 5.1 och 7,2. Alfalfagroddar var ytan steriliseras och grodde för en dag i sterilt vatten vid 25 ° C i mörker. Fyra skott med bifogade frö rockar placerades i sterila plast rätter som innehåller 5 mL vatten. Bakterier som odlas i Luria buljong har lagts till en slutlig koncentration på cirka 5 x 103 per mL. Inokulerade bladen inkuberades vid 25 ° C i mörker i 3 dagar. Bladen var tvättas två gånger i 5 mL sterilt vatten i en injektionsflaska av kraftig inversion och homogeniseras i tvätt buffert med en motordriven Teflon glas Homogenisatorer. Tidigare experiment med bakterier märkt med en plasmid bära genen för GFP visade inga internaliserade bakterier även om ytan bakterier observerades enkelt. Resultaten redovisas i tabell 1. Två stammar av E. coli O157: H7 undersöktes. I båda stammar visades produktion av poly-β-1,6-glukuronsyra acid(PGA) att det största bidraget till bindningen av patogena E. coli att plantera ytor. Colonic syra spelade också en betydande roll i bindningen. Medan minskningen av bindning i cellulosa-minus mutanter var betydande var det inte så stor som för de andra två polysackarider.
<table fo:keep-together.within-page="1"><tbody>
<tr>
<td colspan="4">Effekter av mutationer i gener som Exopolysaccharide produktion på bindande av E. coli O157: H7 groddar och öppna frö rockar</td>
		</tr>
<tr>
<td rowspan="2">Bakteriestam</td>
			<td rowspan="2">Mutation eller genotyp (relevanta fenotyp)</td>
			<td colspan="2">Log10 antal bakterier bundna per spira eller utsäde päls</td>
		</tr>
<tr>
<td>Alfalfa groddarb
</td>
			<td>Öppna frö rockar</td>
		</tr>
<tr>
<td>86-24</td>
			<td>Ingen (vildtyp)</td>
			<td>4.7 ± 0,6</td>
			<td>5.6 ± 0,2</td>
		</tr>
<tr>
<td>8624N</td>
			<td>
yhjN (cellulosa-minus)</td>
			<td>2.9 ± 0,7c
</td>
			<td>3,5 ± 0,6c
</td>
		</tr>
<tr>
<td>8624C</td>
			<td>
wcaD (colonic syra-minus)</td>
			<td>1.8 ± 0,7c
</td>
			<td>2.4 ± 0,5c
</td>
		</tr>
<tr>
<td>8624P</td>
			<td>
pgaC (PGA-minus)</td>
			<td>< 1.0c
</td>
			<td>1,0 ± 1.0c
</td>
		</tr>
<tr>
<td>DEC4A</td>
			<td>Ingen (vildtyp)</td>
			<td>5.6 ± 0,2</td>
			<td>6.1 ± 0,3</td>
		</tr>
<tr>
<td>DEC4AN</td>
			<td>
yhjN (cellulosa-minus)</td>
			<td>4,8 ± 0,8d
</td>
			<td>4.1 ± 0,8d
</td>
		</tr>
<tr>
<td>DEC4AC</td>
			<td>
wcaD (colonic syra-minus)</td>
			<td>3,9 ± 0,5c
</td>
			<td>4,8 ± 0,8d
</td>
		</tr>
<tr>
<td>DEC4AP</td>
			<td>
pgaC (PGA-minus)</td>
			<td>< 1.0c
</td>
			<td>1.2 ± 0,7c
</td>
		</tr>
<tr>
<td colspan="4">ett medelvärde ± standardavvikelse för minst tre mätningar av antalet (log10) bakterier bundna efter 3 dagar.</td>
		</tr>
<tr>
<td colspan="4">b groddar spolades före mätning.</td>
		</tr>
<tr>
<td colspan="4">c avsevärt skiljer sig från den vilda typ: P < 0,01.</td>
		</tr>
<tr>
<td colspan="4">d avsevärt skiljer sig från den vilda typ: P < 0,05.</td>
		</tr>
<tr>
<td colspan="4">Den här tabellen har ändrats från Matthysse, Deora, Mishra och Torres10.</td>
		</tr>
</tbody></table>Tabell 1: effekter av mutationer i gener som exopolysaccharide produktion på bindningen av E. coli O157: H7 till groddar. För att avgöra betydelsen av olika exopolysaccharides och lipopolysackarid i bindningen av patogena E. coli O157: H7-stammar till alfalfagroddar, bindningen av en uppsättning av mutanter till groddar och öppna frö rockar undersöktes med hjälp av metoder beskrivs i steg 6. Resultaten visade att poly-ß-1, 6 -N-acetyl-D-glukosamin (PGA) verkar vara viktigt för bindning till groddar och det både cellulosa och colanic syran krävs för maximal bindning av E. coli O157. Den här tabellen har ändrats från Matthysse, Deora, Mishra och Torres10.
För att avgöra om tillverkningen av PGA är tillräcklig för att orsaka bakteriell bindning att plantera ytor, en plasmid (pMM11) bär den klonade operon kodning gener krävs för PGA infördes produktion i två olika bakterier som inte skulle normalt kunna binda till tomat rötter10. A. tumefaciens A1045 är en mutant av vildtyp stammen C58 som underlåter att göra cykliska-β-1,2-glukan och underlåter också att binda för att plantera ytor29. Sinorhizobium meliloti 1021 som bildar roten knölar på alfalfa misslyckas att binda till icke-baljväxter inklusive tomat12. Metoder som beskrivs i steg 1.1, 5.1, 6.3 och 7,1 användes för att avgöra om förmågan att göra PGA generellt ökad bakteriell bindning till rotytor. Tomat frön var ytan steriliseras och grodde i sterilt vatten. Rötterna var skuren i segment 1 cm i längd och placeras i sterilt vatten och bakterier var vaccinerat. När dessa två arter av bakterier växer i olika takt, mättes bindande vid olika tidpunkter för ungefär lika mängder bakterietillväxt. Förekomsten av de plasmiden pMM11 orsakade en liknande betydande ökning i antalet bundna bakterier av båda arter (tabell 2)10. En betydande ökning av bindande sågs också i ljusmikroskop men bindningen var mycket olika för de två arterna (figur 3). A. tumefaciens A1045 bunden som enskilda bakterier till rotytan. S. meliloti bunden i stora kluster där endast några av bakterierna fästes direkt till roten och majoriteten av bakterierna fästes till andra bakterier. Detta exempel visar att enkelt analysera antalet bakterier bunden utan inklusive mikroskopiska observationer kan ge ett missvisande intryck av resultaten av ett experiment. Men båda metoderna (livskraftiga blodkroppar och mikroskopiska observationer) visar att pMM11 ökade bakteriell bindning till tomat rötter, var typen av bindning som orsakas av produktion av PGA olika för de två bakteriearter10.
<table fo:keep-together.within-page="1"><tbody>
<tr>
<td colspan="3">Effekten av de plasmiden pMM11 på bindning av bakterier till tomat rötter</td>
		</tr>
<tr>
<td>Bakteriestam</td>
			<td>Plasmid</td>
			<td>Antalet bakterier bunden per mm rot längd</td>
		</tr>
<tr>
<td>A. tumefaciens A1045en
</td>
			<td>ingen</td>
			<td>0,25 x 103 ± 0,25 x 103
</td>
		</tr>
<tr>
<td></td>
			<td>pBBR1mcs (vektor)</td>
			<td>0,25 x 103 ± 0,25 x 103
</td>
		</tr>
<tr>
<td></td>
			<td>pMM11 (PGA syntes)</td>
			<td>10 x 103 ± 0,25 x 103
</td>
		</tr>
<tr>
<td>S. meliloti 1021b
</td>
			<td>ingen</td>
			<td>ingen upptäckt</td>
		</tr>
<tr>
<td></td>
			<td>pBBR1mcs (vektor)</td>
			<td>ingen upptäckt</td>
		</tr>
<tr>
<td></td>
			<td>pMM11 (PGA syntes)</td>
			<td>50 x 103 ± 5 x 103
</td>
		</tr>
<tr>
<td colspan="3">en bakteriell bindning mättes efter 2 timmar</td>
		</tr>
<tr>
<td colspan="3">var b bakterie bindande åtgärd efter 18 timmar</td>
		</tr>
<tr>
<td colspan="3">Den här tabellen har ändrats från Matthysse, Deora, Mishra och Torres10.</td>
		</tr>
</tbody></table>Tabell 2: effekten av en plasmid bär gener för syntesen av PGA på bindningen av A. tumefaciens A1045 och S. meliloti 1021 till tomat rot segment. För att undersöka möjligheten av poly-β-1, 6 -N-acetyl-D-glukosamin (PGA) att främja bindning av bakterier att plantera rötter, effekten av en plasmid som ger möjlighet att göra PGA (pMM11) på bindningen av två bakteriestammar växt-associerade till tomat rötter undersöktes. Varken stam av bakterier visade signifikant bindning till tomat rötter i avsaknad av Plasmiden eller i närvaro av Plasmiden utan de gener som kodar PGA syntes (pBBR1mcs). Tillägg av Plasmiden bär PGA syntes gener ökad bindning av båda typer av bakterier. Eftersom A. tumefaciens växer snabbare än S. meliloti bindande mättes efter 2 h inkubation för A. tumefaciens och efter 18 h för S. meliloti. De tekniker som används är de som beskrivs i steg 7. Den här tabellen har ändrats från Matthysse, Deora, Mishra och Torres10.
<img alt="Figure 3" class="xfigimg" src="/files/ftp_upload/56599/56599fig3.jpg"> Figur 3 : Effekten av den plasmiden pMM11 bär PGA biosyntes generna på bindningen av A. tumefaciens A1045 och S. meliloti 1021 till tomat rothår. Bindning till tomat rothår a) A. tumefaciens A1045, B) A. tumefaciens A1045 pMM11, C) S. meliloti 1021 och D) S. meliloti 1021 pMM11. Även om ökningen i bindningen av de två bakteriearter är ungefär liknande är detaljer i bindningen som kan ses i mikroskopet ljus helt olika. De tekniker som används är de som beskrivs i steg 6. Denna siffra har ändrats från Matthysse, Deora, Mishra och Torres10. <a href="https://cloudflare.jove.com/files/ftp_upload/56599/56599fig3large.jpg" target="_blank">Klicka här för att se en större version av denna siffra.</a>
Det är ibland möjligt att använda bindning till icke-biologiska ytor till stöd i särskilja bidraget av bakterier och av växten i en särskild interaktion. Den unipolar polysaccharide(UPP) av A. tumefaciens har visat sig kunna medla bakteriell bindning till en mängd både biologiska och icke-biologiska ytor30. Kalcium observerades för att hämma bindningen av A. tumefaciens att plantera ytor medieras av de UPP28. För att bestämma huruvida hämning av kalciumjoner av bakteriell bindning att plantera ytor på grund av en effekt på bakterier eller på växten ytan, undersöktes bindning av bakterier till nylontrådar. Teknikerna som beskrivs i steg 8,2 användes. Tomat frön var ytan steriliseras och grodde i vatten som beskrivs i steg 1. Bakterierna har vuxit i minimal medium med sackaros och lagts till tomat rötter eller nylontrådar med en slutlig koncentration på cirka 105/ml enligt steg 5.1. Effekten av extra CaCl2 på bakteriell bindning till tomat rötter och nylontrådar undersöktes i mikroskopet. Figur 4 visar en liknande hämning av bindningen av kalcium använder antingen yta tyder på att effekten av kalcium är primärt på bakterier10.
<img alt="Figure 4" class="xfigimg" src="/files/ftp_upload/56599/56599fig4.jpg"> Figur 4 : Effekten av kalcium på bindningen av A. tumefaciens tomat rothår och nylontrådar. A. tumefaciens var inkuberas med tomat rötter (A och B) eller nylontrådar (C och D) för 24 h i en 1:10 utspädning av MS salter och en 1:20 utspädning av AB minimalmedium, 0,4% sackaros (A och C) eller i en 1:10 utspädning av MS salter och 1:20 utspädning av AB minimalmedium , 0.4% sackaros som innehåller 60 mM CaCl2 (B och D)31. Den tillagda CaCl2 hämmade bakteriell bindning till både rötter och nylontrådar som tyder på att hämning berodde främst på en effekt på bakterier i stället för på anläggningen ytan. <a href="https://cloudflare.jove.com/files/ftp_upload/56599/56599fig4large.jpg" target="_blank">Klicka här för att se en större version av denna siffra.</a>

Watch this Scientific Journal Video about Adherence of Bacteria to Plant Surfaces Measured in the Laboratory at JoVE.com

Adherence of Bacteria to Plant Surfaces Measured in the Laboratory

En enkel metod för att mäta och karaktärisera bakteriell vidhäftning till växter, särskilt rötter och groddar, beskrivs i denna artikel.

Följsamhet av bakterier att plantera ytor uppmätta i laboratorium

This manuscript describes a method to measure bacterial binding to axenic plant surfaces in the light microscope and through the use of viable cell ...

Research

JoVE Journal

Environment

A New Application of the Electrical Penetration Graph (EPG) for Acquiring and Measuring Electrical Signals in Phloem Sieve Elements

A New Application of the Electrical Penetration Graph EPG for Acquiring and Measuring Electrical Signals in Phloem Sieve Elements

En ny ansökan av elektriska penetration Graph (EPG) för att förvärva och mäta elektriska signaler i floem sikt Elements

Electrophysiological properties of cells are often studied in vitro, after dissociating them from their native environments. However, the study of ...

Laboratory Simulation of an Iron(II)-rich Precambrian Marine Upwelling System to Explore the Growth of Photosynthetic Bacteria

Laboratory Simulation of an IronII-rich Precambrian Marine Upwelling System to Explore the Growth of Photosynthetic Bacteria

Laboratorium Simulering av en järn (II) -rik Precambrian Marine uppvällningsområdet att utforska tillväxt av foto bakterier

A conventional concept for the deposition of some Precambrian Banded Iron Formations (BIF) proceeds on the assumption that ferrous iron [Fe(II)] upwelling ...

Procedures of Laboratory Fumigation for Pest Control with Nitric Oxide Gas

Förfaranden av laboratoriet gasning för skadedjursbekämpning med kväveoxid Gas

Nitric oxide (NO) is a newly discovered fumigant for postharvest pest control. This paper provides detailed protocols for conducting NO fumigation on ...

Experimental Methods of Dust Charging and Mobilization on Surfaces with Exposure to Ultraviolet Radiation or Plasmas

Experimentella metoder av damm laddning och mobilisering på ytor med exponering för ultraviolett strålning eller plasmor

Electrostatic dust transport has been hypothesized to explain a number of observations of unusual planetary phenomena. Here, it is demonstrated using ...

Ecosystem Fabrication (EcoFAB) Protocols for The Construction of Laboratory Ecosystems Designed to Study Plant-microbe Interactions

Ecosystem Fabrication EcoFAB Protocols for The Construction of Laboratory Ecosystems Designed to Study Plant-microbe Interactions

Ekosystemet Fabrication (EcoFAB) protokoll för byggandet av laboratoriet ekosystem för att studera växt-mikrobinteraktioner

Beneficial plant-microbe interactions offer a sustainable biological solution with the potential to boost low-input food and bioenergy production. A ...

Double-stranded RNA Oral Delivery Methods to Induce RNA Interference in Phloem and Plant-sap-feeding Hemipteran Insects

Dubbelsträngat RNA Oral leveransmetoder att framkalla RNA-interferens i floem och växt-sap-utfodring Ditropis insekter

Phloem and plant sap feeding insects invade the integrity of crops and fruits to retrieve nutrients, in the process damaging food crops. Hemipteran ...

Self-standing Electrochemical Set-up to Enrich Anode-respiring Bacteria On-site

Fristående elektrokemiska uppställning att berika anod-respiring bakterier på plats

Anaerobic respiration coupled with electron transport to insoluble minerals (referred to as extracellular electron transport [EET]) is thought to be ...

The Plant Infection Test: Spray and Wound-Mediated Inoculation with the Plant Pathogen Magnaporthe Grisea

The Plant Infection Test: Spray and Wound-Mediated Inoculation with the Plant Pathogen Magnaporthe Grisea

Den växt infektion testet: Spray och sår-medierad inympning med den växt patogen Magnaporthe länkar

Plants possess a powerful system to defend themselves against potential threats by pathogenic fungi. For agriculturally important plants, however, current ...

A Flexible Low Cost Hydroponic System for Assessing Plant Responses to Small Molecules in Sterile Conditions

En flexibel lågpris hydroponiska System för bedömning av anläggningen Svaren till små molekyler i sterila förhållanden

A wide range of studies in plant biology are performed using hydroponic cultures. In this work, an in vitro hydroponic growth system designed for ...

An Optimized Rhizobox Protocol to Visualize Root Growth and Responsiveness to Localized Nutrients

Ett optimerat Rhizobox protokoll att visualisera rottillväxt och lyhördhet för lokaliserade näringsämnen

Roots are notoriously difficult to study. Soil is both a visual and mechanical barrier, making it difficult to track roots in situ without destructive ...