Hela genomet sekvensering av Candida glabrata för detektion av markörer av svampdödande läkemedelsresistens
December 28th, 2017
•Chayanika Biswas1*, Sharon C-A. Chen1,2,3*, Catriona Halliday1,2, Elena Martinez1, Rebecca J. Rockett1, Qinning Wang1, Verlaine J. Timms1, Rajat Dhakal1, Rosemarie Sadsad1, Karina J. Kennedy4, Geoffrey Playford4,5, Deborah J. Marriott6, Monica A. Slavin7, Tania C. Sorrell1,3, Vitali Sintchenko1,2,3
1Centre for Infectious Diseases and Microbiology-Public Health, Westmead Hospital, 2Centre for Infectious Diseases and Microbiology Laboratory Services, ICPMR, 3Marie Bashir Institute for Infectious Diseases and Biosecurity, The University of Sydney, 4Department of Microbiology and Infectious Diseases, Canberra Hospital and Health Services, Australian National University Medical School, 5Infection Management Services, Australian National University Medical School, 6Department of Microbiology and Infectious Diseases, St. Vincent's Hospital, 7Department of Infectious Diseases, Peter MacCallum Cancer Centre
Denna studie genomförs hela Genomsekvensering för analys av mutationer i gener som ger resistens mot svampdödande läkemedel i Candida glabrata. C. glabrata isolat resistenta mot echinocandiner, azoler och 5-flucytosin, var sekvenserade för att illustrera metoden. Känslighet profiler av isolaten korrelerade med närvaro eller frånvaro av specifika mutation mönster i gener.
ABOUT JoVE
Copyright © 2024 MyJoVE Corporation. All rights reserved