Name: an efficient in vitro transposition method by a transcriptionally regulated sleeping beauty system packaged into an integration defective lentiviral vector
Uploaded: 2018-01-12T13:00:00
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우리 교수 Zappavigna, 모 데 나 대학, 레지오 에밀리 아, 모 데 나, 이탈리아 pCCL PGKrtTA2S제공에 대 한 감사 합니다-m 2 플라스 미드. 우리 또한 pCMVSB100X 및 pT2/BH 플라스 미드에 대 한 교수 Z. Ivics (폴 Ehlrich 연구소, 랑겐, 독일)와 교수 Z. Izvak (Max Delbruck 센터 분자 의학, 베를린, 독일)를 인정합니다. 이 작품은 데 브라 국제 및 이탈리아어 정부 대학 및 연구에 의해 지원 되었다.

1입니다. 플라스 미드 고용
참고: 플라스 미드 pCCL-PGKrtTA2S-m 2는 친절 하 게 교수 Zappavigna (모 데 나 대학 및 레지오 에밀리 아, 모 데 나, 이탈리아)에 의해 제공. PCMVSB100X 플라스 미드 활동적인 transposase의 코딩 시퀀스를 들고와 pT2/BH transposon 플라스 미드 친절 하 게 제공한 교수 Z. Ivics (폴 Ehrlich 연구소, 랑겐, 독일)와 교수 Z. Izvak (Max Delbruck 센터 분자 의학, 베를린, 독일)입?...

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여기, 우리는 안정적으로 GOI 잠자는 미녀여 대상 세포의 게놈으로 통합 하는 광범위 하 게 액세스할 수 있는 방법론을 설명-이항 중재. SB 시스템 게놈 편집에 대 한 nonviral 방법을 제공 하기 위해 개발 되었습니다, 하지만 통합 기계 (transposase 및 T2 transposon)의 효율적인 제공은 필수입니다. 따라서, SB 시스템을 사용 하 여 거의 transfectable 1 차 셀에,에 SB 구성 요소의 바이러스 배달 최근 몇 년 ?...

T2 기반 transposon에 결합 된 활동적인 SB100X transposase 전 임상 유전자 치료 응용 프로그램1,2,3, 게놈 수정4,5에 이미 사용 되 고 유도 만능 줄기 세포 (iPSC) 프로그래밍6,7. 일반적으로, SB 구성 요소 정도 플라스 미드 transfection에 의해 제공 됩니다 및 강한 제정 발기인 드라이브는 transposase의 표현. 그러나, transfection의 향상 된 새로운 방법에도 불구 하 고 배달 두 구성 요소 시스템의 많은 응용 프로그램에 대 한 도전 남아 있습니다. 따라서, 새로운 배달 프로토콜의 개발 증가 관심이 있다. 플라스 미드8 및 mRNA9transfection 방법, 외 바이러스 배달 adenoviral10,11, adeno 관련 바이러스 (AAV)12, 잠재13, gammaretroviral14에 따라 및 lentiviral 벡터15 과거에 제안 되었습니다. 특히, 선택의 시스템에 바이러스 성 벡터의 통합 없이 SB 부품의 과도 납품을 보장 해야 합니다. 그럼에도 불구 하 고, transposase의 구성 식 안전 관심사는 transposon의 통제 rehopping의 위험으로 인해 발생 합니다.
따라서, 세련 된 Tet-켜 짐 시스템에 의해 SB100X의 transcriptional 규칙은 첫 번째 도전 이다. 포진 심 플렉스 바이러스 1 (HSV-1)16, Timidine 키 니 아 제 (TK) 유전자의 최소 발기인 (-81)과 함께 원래 개발 된 최소한의 세포 (CMV) 발기인을 대체 하 여 얻은 수정된 Tet 응답 발기인 복제의 상류는 SB100X cDNA (pTetOTKSB100X) 돌연변이 역-항생물질-transactivator rtTA2s-M217 다른 플라스 미드에 복제 강한 제정 발기인 (phosphoglycerate 발기인, PGK)의 통제 표현 된다 (pCCL-PGKrtTA2S-M2). 문화 매체에 추가, dox 바인딩합니다 rtTA2s-M2 변조기 tethers Tet 발기인 복잡 하거나, SB100X 식18단단히 규제 유도 결과 및.
두 번째 주요 과제는 여러 가지 물리적, 화학적 방법으로 인간의 1 차 셀의 비효율적인 transfection에서 발생합니다. 효율적으로 인간의 세포 transfection는 SB100X 및 rtTA2s에 transposase를 전달 하기 위해-M2 식 카세트 2 통합 결함이 lentiviral 벡터 (IDLVs)19으로 포장 된다: IDLVTKSB 및 IDLVrtTA2s- M2입니다. 바이러스 성 벡터는 HEK293T 셀20 에 Vescicular 구내 염 바이러스 (VSV-G), 광범위 한 감염을 수 여 하의 당단백질 G와 pseudotyped 제 3 세대 벡터로 정도 생산 된다. 벡터 입자 ultracentrifugation에 의해 집중 되며 p24 immunocapture V 1 개 그에 의해 적정. 셀 라인 및 1 차 셀 transduce를 벡터 입자 polybrene에 complexed 고 dox의 유무에서 대상 셀으로 알을 품. 불리고 셀에 SB100X 식의 약 의존 활성화 양적 RT-PCR (qRT-PCR)18에 의해 측정 됩니다.
Tet 규제 SB100X 식 시연, 일단 대상 세포 게놈으로 GOI (예를 들어, 녹색 형광 단백질, GFP)의 전위 명확 하 게 박 고 Mikkelsen21에 의해 도식화 분자 이벤트를 다음과 같습니다. 제 3 IDLV 벡터 GOI T2 transposon 국세청 (IDLVT2) 간의 복제에 대 한 식 카세트는 건설 하 고 위에서 언급 한 대로 포장 운반. 마지막으로, 3 개의 IDLV 벡터 효율적으로 인간의 세포 (예를 들어, 기본 keratinocytes) 시험관에 transduce doxycycline18존재 GOI 통합을 사용할 수 있습니다.

<table>
	<tbody>
		<tr>
			<td>Dulbecco&#8217;s modified Eagle&#8217;s medium with 4.5g/L glucose w/o L-Glutamine</td>
			<td>Lonza</td>
			<td>BE12-614F</td>
			<td>Cell culture medium.</td>
		</tr>
		<tr>
			<td>HyClone Fetal Bovine Serum (U.S.), Characterized</td>
			<td>GE Healthcare Life Sciences</td>
			<td>SH30071.03</td>
			<td>Serum used HEK293T cell culture for lentiviral particle production.</td>
		</tr>
		<tr>
			<td>Penicillin 10.000 UI/ml Streptomycin 10.000 UI/ml</td>
			<td>Lonza</td>
			<td>DE17-602E</td>
			<td>Reagents for cell culture medium.</td>
		</tr>
		<tr>
			<td>L-Glutamine 200mM</td>
			<td>Lonza</td>
			<td>BE17-605E</td>
			<td>Reagent for cell culture medium.</td>
		</tr>
		<tr>
			<td>Sodium Chloride (NaCl)</td>
			<td>Sigma-Aldrich</td>
			<td>S7653</td>
			<td>Reagent for HBS 2X preparation.</td>
		</tr>
		<tr>
			<td>HEPES Buffer, 1M Stock in normal saline</td>
			<td>Lonza</td>
			<td>BE17-737E</td>
			<td>Reagent for HBS 2X preparation.</td>
		</tr>
		<tr>
			<td>Disodium hydrogen phosphate dihydrate (Na2HPO4&#183;2H2O), 99.5%</td>
			<td>Merck</td>
			<td>106580</td>
			<td>Reagent for HBS 2X preparation.</td>
		</tr>
		<tr>
			<td>Hydrochloric acid - ACS reagent 37% (HCl)</td>
			<td>Sigma-Aldrich</td>
			<td>320331</td>
			<td>Reagent for HBS 2X preparation.</td>
		</tr>
		<tr>
			<td>Sterile water for injection</td>
			<td>Fresenius Kabi</td>
			<td>-</td>
			<td>Reagent for HBS 2X preparation.</td>
		</tr>
		<tr>
			<td>0.45 &#181;m PESS filter</td>
			<td>Whatman</td>
			<td>10462100</td>
			<td>Filters used to remove cell debris from viral supernatant.</td>
		</tr>
		<tr>
			<td>Polyallomer Beckman tubes</td>
			<td>Beckman Coulter</td>
			<td>326823</td>
			<td>Tubes for concentrating IDLV vectors by ultracentrifugation.</td>
		</tr>
		<tr>
			<td>PBS-1X w/o Ca, Mg</td>
			<td>Lonza</td>
			<td>BE17-516F</td>
			<td>Buffer for cell wash and lentiviral particle resuspension.</td>
		</tr>
		<tr>
			<td>Bovine Serum Albumin (BSA)</td>
			<td>Sigma-Aldrich</td>
			<td>A2153</td>
			<td>(Optional) Buffer for lentiviral particle resuspension.</td>
		</tr>
		<tr>
			<td>HIV-1 Gag p24 immunocapture kit</td>
			<td>Perkin Elmer</td>
			<td>NEK50001KT</td>
			<td>Kit for IDLV particle titration.</td>
		</tr>
		<tr>
			<td>Polybrene</td>
			<td>Sigma-Aldrich</td>
			<td>107689</td>
			<td>Reagent to enhance transduction efficiency.</td>
		</tr>
		<tr>
			<td>Trypsin (10X) 2.5% in HBSS w/o Ca, Mg</td>
			<td>GIBCO</td>
			<td>BE17-160E</td>
			<td>Reagent to detach HeLa cells (stock solution, to be diluted).</td>
		</tr>
		<tr>
			<td>Ethylenediaminetetraacetic acid disodium salt (EDTA)</td>
			<td>100938B</td>
			<td>AnalaR BDH</td>
			<td>Reagent for trypsin working solution preparation.</td>
		</tr>
		<tr>
			<td>0.5% Trypsin-EDTA, no phenol red (10X)</td>
			<td>GIBCO</td>
			<td>15400-054</td>
			<td>Reagent to detach keratinocytes (stock solution, to be diluted).</td>
		</tr>
		<tr>
			<td>Donor Bovine Serum, New Zealand Origin</td>
			<td>GIBCO</td>
			<td>16030-074</td>
			<td>Serum for Swiss mouse 3T3-J2 cell culture (feeder layer).</td>
		</tr>
		<tr>
			<td>Ham&#8217;s F12 media</td>
			<td>GIBCO</td>
			<td>21765</td>
			<td>Medium for keratinocytes.</td>
		</tr>
		<tr>
			<td>Fetal bovine serum</td>
			<td>Lonza</td>
			<td>DE14-801F</td>
			<td>Serum for HeLa cell culture medium.</td>
		</tr>
		<tr>
			<td>Fetal Bovine Serum, qualified, Australia Origin</td>
			<td>GIBCO</td>
			<td>10099-141</td>
			<td>Serum for human primary keratinocyte culture medium.</td>
		</tr>
		<tr>
			<td>Insulin from bovine pancreas</td>
			<td>Sigma-Aldrich</td>
			<td>I5500</td>
			<td>Reagents for keratinocyte growth.</td>
		</tr>
		<tr>
			<td>Adenine</td>
			<td>VWR</td>
			<td>1152-25</td>
			<td>Reagents for keratinocyte growth.</td>
		</tr>
		<tr>
			<td>Hydrocortisone</td>
			<td>VWR</td>
			<td>3867-1</td>
			<td>Reagents for keratinocyte growth.</td>
		</tr>
		<tr>
			<td>Cholera Toxin from Vibrio cholerae</td>
			<td>Sigma-Aldrich</td>
			<td>C8052</td>
			<td>Reagents for keratinocyte growth.</td>
		</tr>
		<tr>
			<td>Triiodothyronine</td>
			<td>Sigma-Aldrich</td>
			<td>T5516</td>
			<td>Reagents for keratinocyte growth.</td>
		</tr>
		<tr>
			<td>Human EGF</td>
			<td>Austral Biological</td>
			<td>GF-010-9</td>
			<td>Reagents for keratinocyte growth.</td>
		</tr>
		<tr>
			<td>Mouse monoclonal APC-conjugated Anti-Feeder antibody</td>
			<td>Miltenyi Biotech</td>
			<td>130-096-099</td>
			<td>To label feeder layer.</td>
		</tr>
		<tr>
			<td>RNeasy Plus Mini Kit</td>
			<td>Qiagen</td>
			<td>74134</td>
			<td>RNA purification kit.</td>
		</tr>
		<tr>
			<td>SuperScript III Reverse Transcriptase</td>
			<td>Life Technologies</td>
			<td>18080051</td>
			<td>Reverse transcriptase kit.</td>
		</tr>
		<tr>
			<td>Deoxynucleotide Mix, 10 mM (dNTP)</td>
			<td>Sigma-Aldrich</td>
			<td>D7295</td>
			<td>Reagent for semi-quantitative PCR.</td>
		</tr>
		<tr>
			<td>UltraPure DNase/RNase-Free Distilled Water</td>
			<td>(any)</td>
			<td>-</td>
			<td>Reagent for semi-quantitative PCR and for qRT-PCR.</td>
		</tr>
		<tr>
			<td>GoTaq G2 Hot Start Polymerase</td>
			<td>Promega</td>
			<td>M740B</td>
			<td>Taq polymerase.</td>
		</tr>
		<tr>
			<td>Agarose, for molecular biology</td>
			<td>Sigma-Aldrich</td>
			<td>A9539</td>
			<td>Reagent for agarose gel electrophoresis.</td>
		</tr>
		<tr>
			<td>UltraPure TBE Buffer, 10X</td>
			<td>Invitrogen</td>
			<td>15581028</td>
			<td>Reagent for agarose gel electrophoresis, to be dilute (1X) in ddH2O.</td>
		</tr>
		<tr>
			<td>Ethidium bromide</td>
			<td>Sigma-Aldrich</td>
			<td>E1510</td>
			<td>Reagent for agarose gel electrophoresis.</td>
		</tr>
		<tr>
			<td>Doxycycline</td>
			<td>Sigma-Aldrich</td>
			<td>D-9891</td>
			<td>drug to induce transposase expression in HeLa cells and in keratinocytes</td>
		</tr>
		<tr>
			<td>TaqMan Universal PCR Master Mix</td>
			<td>Applied Biosystem</td>
			<td>4304437</td>
			<td>TaqMan Universal PCR Master Mix including primers and probe.</td>
		</tr>
		<tr>
			<td>15mL High Clarity polypropylene Centrifuge Tube, Conical Bottom, with Dome Seal Screw Cap, Sterile</td>
			<td>Falcon Corning</td>
			<td>352096</td>
			<td>Tubes for cell collection and vector dilution preparation.</td>
		</tr>
		<tr>
			<td>150 mm TC-Treated Cell Culture Dish with 20 mm Grid, Sterile</td>
			<td>Falcon Corning</td>
			<td>353025</td>
			<td>Cell culture dish for viral production.</td>
		</tr>
		<tr>
			<td>6 Well Clear Flat Bottom TC-Treated Multiwell Cell Culture Plate, with Lid, Individually Wrapped, Sterile</td>
			<td>Falcon Corning</td>
			<td>353046</td>
			<td>Cell culture plate for HeLa and human primary keratinocyte transduction.</td>
		</tr>
		<tr>
			<td>Safe-Lock microcentrifuge tubes, volume 1.5 mL</td>
			<td>Eppendorf</td>
			<td>0030 120.086</td>
			<td>Tubes for dilution preparation.</td>
		</tr>
		<tr>
			<td>Safe-Lock microcentrifuge tubes, volume 2 mL</td>
			<td>Eppendorf</td>
			<td>0030 120.094</td>
			<td>Tubes for dilution preparation.</td>
		</tr>
		<tr>
			<td>0.2ml PCR Tubes with flat caps, RNase, DNase, DNA and PCR Inhibitor free</td>
			<td>(any)</td>
			<td>-</td>
			<td>Tubes for semi-quantitative PCR.</td>
		</tr>
		<tr>
			<td>MicroAmp Fast Optical 96-Well Reaction Plate with Barcode, 0.1 mL</td>
			<td>Applied Biosystem</td>
			<td>4346906</td>
			<td>96-well for qRT-PCR.</td>
		</tr>
		<tr>
			<td>5mL Round Bottom Polystyrene Tube, without Cap</td>
			<td>BD Falcon</td>
			<td>352052</td>
			<td>Tubes for flow cytometry acquisition.</td>
		</tr>
		<tr>
			<td>Disposable Serological Pipets, Polystyrene, Individually Wrapped, Sterile (different volumes)</td>
			<td>(any)</td>
			<td>-</td>
			<td>Pipettes for sterile tissue culture applications.</td>
		</tr>
		<tr>
			<td>Filter Tips, Sterile, and RNase, DNase, DNA and Pyrogen free (different volumes)</td>
			<td>(any)</td>
			<td>-</td>
			<td>Filter tips for sterile tissue colture and molecular biology applications.</td>
		</tr>
		<tr>
			<td>pH meter</td>
			<td>(any)</td>
			<td>-</td>
			<td>Equipment for measurement of HBS 2X pH.</td>
		</tr>
		<tr>
			<td>PCR Thermal cycler</td>
			<td>(any)</td>
			<td>-</td>
			<td>Equipment for semi-quantitative PCR.</td>
		</tr>
		<tr>
			<td>Agarose gel electrophoresis equipment</td>
			<td>(any)</td>
			<td>-</td>
			<td>Equipment for agarose gel electrophoresis of semi-quantitative PCR.</td>
		</tr>
		<tr>
			<td>BD FACS Canto II 2LSR 4/2</td>
			<td>BD</td>
			<td>-</td>
			<td>Flow cytometer.</td>
		</tr>
		<tr>
			<td>7900HT Fast Real-Time PCR system</td>
			<td>Applied Biosystem</td>
			<td>7900HT</td>
			<td>Equipment for qRT-PCR.</td>
		</tr>
		<tr>
			<td>Benchtop centrifuges for efficient sample processing in cell culture applications, refrigerated, with microplate buckets.</td>
			<td>(any)</td>
			<td>-</td>
			<td>Centrifuge for cell culture processing and spinoculation.</td>
		</tr>
		<tr>
			<td>Optima L-90K Ultracentrifuge equipped with SW32TI rotor</td>
			<td>Beckman Coulter</td>
			<td>-</td>
			<td>Ultracentrifuge for lentiviral particle production.</td>
		</tr>
		<tr>
			<td colspan="4">Equipment for cell culture and molecular biology laboratory (e.g., Class II laminar flow hood designed for work involving BSL2 materials, cell culture incubator,refrigerators and freezers (+4 &#176;C, -20 &#176;C, -80 &#176;C), micropipettes and pipet-aid).</td>
		</tr>
		<tr>
			<td colspan="4">Protective laboratory coats, gloves, face protection in accordance with Institute rules and regulations, in particular for lentiviral particle production and transduction.</td>
		</tr>
	</tbody>
</table>

an efficient in vitro transposition method by a transcriptionally regulated sleeping beauty system packaged into an integration defective lentiviral vector

잠자는 미녀 (SB) transposon는 유전자 이동 및 기능 유전체학에 대 한 입증 된 효능 비 바이러스 성 통합 시스템입니다. SB transposon 기계를 최적화 하려면 transcriptionally 규제 활동적인 transposase (SB100X) 및 T2 기반 transposon 고용 됩니다. 일반적으로, transposase와 transposon 제공한 정도 플라스 미드 transfection 그리고 SB100X 식 제정 발기인에 의해 구동 됩니다. 여기, 우리는 여러 가지 물리적, 화학적 transfection 방법 SB100X 식 제어 통합 하 고 안정적으로 "잘라내기 및 붙여넣기" SB 통해 관심 (GOI)의 유전자에는 인간의 세포에 SB 구성 요소를 제공 하는 효율적인 방법 설명 메커니즘입니다. 활동적인 transposase의 식은 단단히 Tet에 시스템, 1992 년부터 유전자 발현 제어를 널리 의해 제어 됩니다. 관심사의 유전자는 T2 transposon의 거꾸로 반복 (IR)에 의해 측면 이다. 두 SB 부품 결함이 lentiviral 벡터 뚜렷이 HEK293T 세포에서 생산 하는 통합에 포장 됩니다. 인간 세포, 세포 선 또는 인간 직물에서 1 차 셀에 체 외에 바이러스 성 벡터와 정도 불리고 있습니다. 문화 매체에 doxycycline (dox, 항생물질 아날로그)의 추가, 시 transposase 식의 미세 조정 측정 되 고 긴-지속적인 통합 치료 세포의 게놈의 유전자의 결과. 이 방법은 효율적이 고 셀 라인 (예를 들어, HeLa 세포) 및 1 차 셀 (예를 들어, 인간의 기본 keratinocytes)에 적용 되 고 따라서 유전 공학 및 유전자 치료 이동에 대 한 유용한 도구를 나타냅니다.

여기, 제시 된 절차를 사용 하 여 레 귤 레이트 된 SB 부품을 운반 하는 3 개의 IDLV 벡터 (SB100X, rtTA2S-m 2와 t 2-GFP transposon) 포장 하 고 효율적으로 제공 하 고 밀접 하 게 인간의 세포에서 SB 시스템을 조절 하는 데 사용 했다. 그림 1A 는 생체 외에서 변환 HeLa 세포 ( 표 2에 보고 된) 두 IDLV 벡터의 좋은 복용량 조합으로 SB transposase...

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An Efficient In Vitro Transposition Method by a Transcriptionally Regulated Sleeping Beauty System Packaged into an Integration Defective Lentiviral Vector

효율적인 체 외에서 이항 메서드인 Transcriptionally 규제 자 아름다움 시스템 통합 결함이 Lentiviral 벡터에 포장 하 여

이 프로토콜 transcriptionally 규제 잠자는 미녀 시스템에 의해 인간 게놈에 관심사의 유전자의 안정적인 통합을 달성 하는 방법을 설명 합니다. 결함이 lentiviral 벡터, 인간의 세포, 생체 외에서 변환 및 불리고 세포에 분자 분석 결과의 통합의 준비 보고 됩니다.

The Sleeping Beauty (SB) transposon is a non-viral integrating system with proven efficacy for gene transfer and functional genomics. To optimize the SB ...

Research

JoVE Journal

Biology

An Efficient In Vitro Transposition Method by a Transcriptionally Regulated Sleeping Beauty System Packaged into an Integration Defective Lentiviral Vector

Production of Replication-Defective Retrovirus by Transient Transfection of 293T cells

293T 세포의 과도 Transfection하여 복제 - 결함이 레트로 바이러스의 생산

Our lab studies human myeloproliferative diseases induced by such oncogenes as Bcr-Abl or growth factor receptor-derived oncogenes (ZNF198-FGFR1, ...

연구

생물학

Homemade Site Directed Mutagenesis of Whole Plasmids

전체 Plasmids의 수제 사이트 감독 돌연변이 유발

Site directed mutagenesis of whole plasmids is a simple way to create slightly different variations of an original plasmid. With this method the cloned ...

Reprogramming Human Somatic Cells into Induced Pluripotent Stem Cells (iPSCs) Using Retroviral Vector with GFP

Reprogramming Human Somatic Cells into Induced Pluripotent Stem Cells iPSCs Using Retroviral Vector with GFP

GFP와 Retroviral 벡터를 사용하여 유도 Pluripotent 줄기 세포 (iPSCs)로 인간 체세포를 프로그래밍

Human embryonic stem cells (hESCs) are pluripotent and an invaluable cellular sources for in vitro disease modeling and regenerative medicine1. It has ...

A Step-by-step Method for the Reconstitution of an ABC Transporter into Nanodisc Lipid Particles

Nanodisc 지질 입자로 ABC의 전송의 Reconstitution을위한 단계별 방법

The nanodisc is a discoidal particle (~ 10-12 nm large) that trap membrane proteins into a small patch of phospholipid bilayer. The nanodisc is a ...

High-throughput Screening for Chemical Modulators of Post-transcriptionally Regulated Genes

후 전사적으로 규제 유전자의 화학 변조기에 대한 높은 처리량 검사

Both transcriptional and post-transcriptional regulation have a profound impact on genes expression. However, commonly adopted cell-based screening assays ...

Hybrid-Cut: An Improved Sectioning Method for Recalcitrant Plant Tissue Samples

하이브리드 컷 : 난 분해성 식물 조직 샘플에 대한 개선 단면 방법

Maintaining plant section integrity is essential for studying detailed anatomical structures at the cellular, tissue, or even organ level. However, some ...

An In Vitro Model for Studying Cellular Transformation by Kaposi Sarcoma Herpesvirus

An In Vitro Model for Studying Cellular Transformation by Kaposi Sarcoma Herpesvirus

공부 하는 Kaposi 육 종 Herpesvirus에 의해 세포 변환에 대 한 생체 외에서 모델

Kaposi sarcoma (KS) is an unusual tumor composed of proliferating spindle cells that is initiated by infection of endothelial cells (EC) with KSHV, and ...

An Efficient and Flexible Cell Aggregation Method for 3D Spheroid Production

3D 회전 타원체 생산을위한 효율적이고 유연한 셀 집계 방법

Monolayer cell culture does not adequately model the in vivo behavior of tissues, which involves complex cell-cell and cell-matrix interactions. ...

IR-TEx: An Open Source Data Integration Tool for Big Data Transcriptomics Designed for the Malaria Vector Anopheles gambiae

IR-TEx: An Open Source Data Integration Tool for Big Data Transcriptomics Designed for the Malaria Vector Anopheles gambiae

IR-TEx: 말라리아 벡터 아노펠레스 감비아를 위해 설계된 빅 데이터 전사학을 위한 오픈 소스 데이터 통합 도구

IR-TEx is an application written in Shiny (an R package) that allows exploration of the expression of (as well as assigning functions to) transcripts ...