Name: detection and quantification of plasmodium falciparum in aqueous red blood cells by attenuated total reflection infrared spectroscopy and multivariate data analysis
Uploaded: 2018-11-02T13:30:00
Description: Watch this Scientific Journal Video about Detection and Quantification of Plasmodium falciparum in Aqueous Red Blood Cells by Attenuated Total Reflection Infrared Spectroscopy and Multivariate Data An

Finansiering af forfatterne blev leveret af det australske Forskningsråd (fremtid Fellowship FT120100926 til BRW), National sundhed og medicinsk forskning Rådet for Australien (Program grant og Senior Research Fellowship at BENTS; Tidlig karriere stipendier JSR; Infrastruktur for forskning institutter støtte ordningen tilskud til Burnet Institute), og den victorianske stats regering operationelle infrastruktur støtte Grant Burnet Institute. Vi anerkender Mr. Finlay Shanks for instrumental støtte.

Venligst kontakt passende materiale sikkerhedsdatablade (MSDS) og søge passende biosikkerhedsniveau 2 (BSL-2) uddannelse. Alle dyrkningsbaserede trin skal være udført i en BSL-2 kabinettet ved hjælp af aseptisk teknik, hvilket betyder, at der er en risiko for eksponering for skadelige UV-stråling fra dekontaminering trin, nål stick skader, og potentielle biologiske eksponering og infektion, hvis parasit kulturen træder nogen skader. Derudover er stock blod fra blodbanker er kun screenet for visse sygdomme og poten...

<ol>
	<li>Hommel, M., Gilles, H., Collier, L., Balows, A., Sussman, M. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/query.fcgi?db=PubMed&cmd=Search&doptcmdl=Citation&defaultField=Title+Word&term=Chapter+20.">Chapter 20.</a> Topley &amp; Wilson's Microbiology and Microbial Infections. Vol. 5 Parasitology. , 361 (1998).</li><li>World Health Organization. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/query.fcgi?db=PubMed&cmd=Search&doptcmdl=Citation&defaultField=Title+Word&term=.">.</a> World Malaria Report 2016. , (2016).</li><li>Rogers, W., Murray, P., Baron, E., Pflaller, M., Tenover, F., Yolken, R. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/query.fcgi?db=PubMed&cmd=Search&doptcmdl=Citation&defaultField=Title+Word&term=Chapter+105.">Chapter 105.</a> Manual of Clinical Microbiology. , 1355 (1999).</li><li>White, N. J. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/query.fcgi?db=PubMed&cmd=Search&doptcmdl=Citation&defaultField=Title+Word&term=Chapter+9.">Chapter 9.</a> Manson's Tropical Infectious Diseases. 23, 532-600 (2014).</li><li>Lindblade, K. A., Steinhardt, L., Samuels, A., Kachur, S. P., Slutsker, L. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/query.fcgi?db=PubMed&cmd=Search&doptcmdl=Citation&defaultField=Title+Word&term=The+silent+threat:+asymptomatic+parasitemia+and+malaria+transmission.">The silent threat: asymptomatic parasitemia and malaria transmission.</a> Expert Rev Anti Infect Ther. 11 (6), 623-639 (2013).</li><li>Hanscheid, T., Grobusch, M. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/query.fcgi?db=PubMed&cmd=Search&doptcmdl=Citation&defaultField=Title+Word&term=How+useful+is+PCR+in+the+diagnosis+of+malaria.">How useful is PCR in the diagnosis of malaria.</a> Trends Parasitol. 18 (9), 395-398 (2002).</li><li>Joanny, F., L&#246;hr, S. J., Engleitner, T., Lell, B., Mordm&#252;ller, B. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/query.fcgi?db=PubMed&cmd=Search&doptcmdl=Citation&defaultField=Title+Word&term=Limit+of+blank+and+limit+of+detection+of+Plasmodium+falciparum+thick+blood+smear+microscopy+in+a+routine+setting+in+Central+Africa.">Limit of blank and limit of detection of Plasmodium falciparum thick blood smear microscopy in a routine setting in Central Africa.</a> Malar J. 13 (1), 234-241 (2014).</li><li>World Health Organisation. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/query.fcgi?db=PubMed&cmd=Search&doptcmdl=Citation&defaultField=Title+Word&term=.">.</a> Malaria Rapid Diagnostic Test Performance: results of WHO product testing of malaria RDTs: round 6 (2014-2015). , (2014).</li><li>Khoshmanesh, A., et al. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/query.fcgi?db=PubMed&cmd=Search&doptcmdl=Citation&defaultField=Title+Word&term=Detection+and+quantification+of+early-stage+malaria+parasites+in+laboratory+infected+erythrocytes+by+attenuated+total+reflectance+infrared+spectroscopy+and+multivariate+analysis.">Detection and quantification of early-stage malaria parasites in laboratory infected erythrocytes by attenuated total reflectance infrared spectroscopy and multivariate analysis.</a> Anal Chem. 86, 4379-4386 (2014).</li><li>Martin, M., et al. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/query.fcgi?db=PubMed&cmd=Search&doptcmdl=Citation&defaultField=Title+Word&term=The+effect+of+common+anticoagulants+in+detection+and+quantification+of+malaria+parasitemia+in+human+red+blood+cells+by+ATR-FTIR+spectroscopy.">The effect of common anticoagulants in detection and quantification of malaria parasitemia in human red blood cells by ATR-FTIR spectroscopy.</a> Anal. 142 (8), 1192-1199 (2017).</li><li>Fabian, H., M&#228;ntele, W. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/query.fcgi?db=PubMed&cmd=Search&doptcmdl=Citation&defaultField=Title+Word&term=.">.</a> Handbook of Vibrational Spectroscopy. , (2006).</li><li>Whelan, D., et al. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/query.fcgi?db=PubMed&cmd=Search&doptcmdl=Citation&defaultField=Title+Word&term=Monitoring+the+reversible+B+to+A-like+transition+of+DNA+in+eukaryotic+cells+using+Fourier+transform+infrared+spectroscoptMonitoring+the+reversible+B+to+A-like+transition+of+DNA+in+eukaryotic+cells+using+Fourier+transform+infrared+spectroscopy.">Monitoring the reversible B to A-like transition of DNA in eukaryotic cells using Fourier transform infrared spectroscoptMonitoring the reversible B to A-like transition of DNA in eukaryotic cells using Fourier transform infrared spectroscopy.</a> Nucleic Acid Res. 39 (13), 5439-5448 (2011).</li><li>Wood, B. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/query.fcgi?db=PubMed&cmd=Search&doptcmdl=Citation&defaultField=Title+Word&term=The+importance+of+hydration+and+DNA+conformation+in+interpreting+infrared+spectra+of+cells+and+tissues.">The importance of hydration and DNA conformation in interpreting infrared spectra of cells and tissues.</a> Chem Soc Rev. 45, 1980-1998 (1980).</li><li>Plyler, E. K. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/query.fcgi?db=PubMed&cmd=Search&doptcmdl=Citation&defaultField=Title+Word&term=Infrared+spectra+of+methanol,+ethanol,+and+rn-propanol.">Infrared spectra of methanol, ethanol, and rn-propanol.</a> J Res Natl Bur Stand. 48 (4), (1952).</li></ol>

PLS-R-model er en overvåget multivariat metode, der finder en lineær sammenhæng, Y = bX + E, mellem de prædiktive variabler X (her, absorbans ved hver wavenumber) og en kontinuerlig variabel Y (her, parasitemia niveauet). Kort sagt, modellen kombinerer variabler i X til at oprette et nyt sæt af latent variabler (LVs) at fange afvigelse på X korreleret med Y, og beregner en regression vektor (b) der ganges med en ny spektrum resultater i forbindelse med vurdering af y-værdi. Styrken af modellen kan tages fra to væ...

Malaria er blandt de mest ødelæggende sygdomme i vor tid; over halvdelen af befolkningen lever i fare i endemiske områder og det tynger uforholdsmæssigt fattige1,2,3,4. En stor del af problemet er asymptomatiske bærere og tidlige fase patienter der fungere som reservoirer for myg vektorer5, forårsager pigge af infektion i våde årstider og gør det muligt at persistere i Fællesskaber. Malaria forårsages af fem Plasmodium parasitter, den mest dødbringende som er P. falciparum , som forårsager den mest alvorlige form af sygdommen2.
Teknikker til diagnosticering af malaria er i øjeblikket mindre end perfekt. Optisk mikroskopi, den nuværende guld standard, kan kun registrere 62-88 parasitter/µL afhængigt af den anvendte metode6. Desuden, på grund af vækstens og høje kvalifikationer kræves, i mange regioner mikroskopi misdiagnoses > 50% af tilfældene, især dem med lavt parasitaemia niveauer2, der direkte kan henføres til manglen ressourcer i området og resultater i misbrug af malariamedicin. De andre 2 vigtigste diagnostiske metoder er hurtige diagnostiske test (RDTs), der anvender antistoffer til påvisning og Polymerase Chain Reaction (PCR) assays, der diskriminerer og kvantificere parasitter fra DNA. I øjeblikket, er RDTs kun i stand til at opdage P. falciparum og P. vivax af mindst 100 parasitter/µL af blod medførende sjældnere former af sygdommen er ubehandlet. 7 , 8 derimod PCR assays diskriminerer og kvantificere forskellige arter af Plasmodium på en følsomhed på 0,0004-5 parasitter/µL af blod. Men det kræver dyre reagenser, udstyr og tekniske færdigheder, og er således ikke egnet til programmet felt.
En meget følsom, pålidelig og overkommelig teknik er afgørende at forbedre diagnose gange, og dermed forbedre patienternes resultater, og gør sygdommen eliminering muligt. Svækket samlede refleksion Fourier transform (ATR-FTIR) spektroskopi tilbyder en mulig løsning på dette problem. Tidligere arbejde har vist, at det var muligt at detektere og kvantificere P. falciparum i methanol fast blod film opnå påvisningsgrænserne for < 1 parasit/µL af blod (< 0.0002% parasitemia)9, som er sammenlignelig med PCR metoder. Nylige undersøgelser har vist, at det er muligt at detektere og kvantificere parasitter i vandige prøver og dermed fjerne trinnet fiksering. Faktorer som vanddamp, spektrale støj og data behandling skal dog tages i betragtning for optimale resultater10.
Denne protokol har til formål at vise nye brugere hvordan til at erhverve ATR-FTIR spectra og forberede en regressionsmodel til påvisning af P. falciparum fra vandige røde blodlegemer (RBC) prøver10.

<table>
	<tbody>
		<tr>
			<td>Donor blood</td>
			<td>-</td>
			<td>-</td>
			<td>Must be collected by a trained medical practitioner</td>
		</tr>
		<tr>
			<td>Stock blood</td>
			<td>Australian Red Cross`</td>
			<td>-</td>
			<td></td>
		</tr>
		<tr>
			<td>3D7 Plasmodium falciparum</td>
			<td>The Burnet Institute</td>
			<td>-</td>
			<td>Laboratory strain wild type equivalent</td>
		</tr>
		<tr>
			<td>RPMI-1640 media with L-hepes without Sodium Bicarbonate</td>
			<td>Sigma Aldrich</td>
			<td>R6504</td>
			<td></td>
		</tr>
		<tr>
			<td>Albumax (Gibco)</td>
			<td>Thermofisher</td>
			<td>E003000PJ</td>
			<td>Aliquot into 50 mL falcon tubes and store in freezer</td>
		</tr>
		<tr>
			<td>Sodium Bicarbonate</td>
			<td>Sigma Aldrich</td>
			<td>S5761</td>
			<td></td>
		</tr>
		<tr>
			<td>Giemsa Stain</td>
			<td>Sigma Aldrich</td>
			<td>48900</td>
			<td></td>
		</tr>
		<tr>
			<td>Sorbitol</td>
			<td>Sigma Aldrich</td>
			<td>S1876</td>
			<td>Must be filtered before use in culture</td>
		</tr>
		<tr>
			<td>Blood collection tubes (Vacutainers)</td>
			<td>Becton, Dickonson and Company</td>
			<td>367671</td>
			<td></td>
		</tr>
		<tr>
			<td>Immersion Oil</td>
			<td>Thermofisher</td>
			<td>M3004</td>
			<td></td>
		</tr>
		<tr>
			<td>50 mL culture dishes</td>
			<td>Falcon</td>
			<td>353025</td>
			<td></td>
		</tr>
		<tr>
			<td>25mL pipette tips</td>
			<td>Falcon</td>
			<td>357515</td>
			<td></td>
		</tr>
		<tr>
			<td>10mL pipette tips</td>
			<td>Falcon</td>
			<td>357530</td>
			<td></td>
		</tr>
		<tr>
			<td>Microscope Slides</td>
			<td>Sigma Aldrich</td>
			<td>S8902</td>
			<td></td>
		</tr>
		<tr>
			<td>Centrifuge tubes 50 mL</td>
			<td>Sigma Aldrich</td>
			<td>T2318</td>
			<td></td>
		</tr>
		<tr>
			<td>Automated pipette controller</td>
			<td>Integra-biosciences</td>
			<td>155 015</td>
			<td></td>
		</tr>
		<tr>
			<td>Sorvall Legend X1R Centrifuge</td>
			<td>Thermofisher</td>
			<td>75004260</td>
			<td></td>
		</tr>
		<tr>
			<td>Forma&#8482; 310 Direct Heat CO2 Incubators</td>
			<td>Thermofisher</td>
			<td>310TS</td>
			<td></td>
		</tr>
		<tr>
			<td>Nikon Eclipse E-100 Binocular Microscope</td>
			<td>Nikon Instruments</td>
			<td>E100_2CE-MRTK-1</td>
			<td>When purchasing ensure that the 100x lens is an oil immersion lens</td>
		</tr>
		<tr>
			<td>Bruker Alpha Ft-IR Spectrometer with ATR Quick Snap Attachment</td>
			<td>Bruker</td>
			<td>9308-3700</td>
			<td>Be sure to request &#34;Eco-ATR&#34; attachment when purchasing</td>
		</tr>
		<tr>
			<td>Matlab</td>
			<td>Mathworks Inc</td>
			<td></td>
			<td>Multivariate data analysis software</td>
		</tr>
		<tr>
			<td>The Unscrambler X</td>
			<td>CAMO</td>
			<td></td>
			<td>Multivariate data analysis software</td>
		</tr>
		<tr>
			<td>PLS-Toolbox</td>
			<td>Mathworks, Inc.</td>
			<td></td>
			<td>GUI for Matlab</td>
		</tr>
	</tbody>
</table>

detection and quantification of plasmodium falciparum in aqueous red blood cells by attenuated total reflection infrared spectroscopy and multivariate data analysis

Vi demonstrere en metode til kvantificering og påvisning af parasitter i vandig røde blodlegemer (RBC) ved hjælp af en simpel benchtop svækket samlede refleksion Fourier Transform infrarød (ATR-FTIR) spektrometer sammenholdt med multivariat dataanalyse ( MVDA). 3D 7 P. falciparum blev kultiveret til 10% parasitemia ring fase parasitter og bruges til spike frisk donor isoleret røde blodlegemer for at oprette en fortynding serien mellem 0 – 1%. 10 µL af hver prøve blev placeret på midten af vinduet ATR diamant til at erhverve spektret. Eksempeldata blev behandlet til at forbedre signal-støj-forholdet og fjerne bidrag af vand, og derefter den anden afledede blev anvendt til at løse spektrale egenskaber. Dataene blev derefter analyseret ved hjælp af to typer af MVDA: første Principal komponent analyse (PCA) til at afgøre enhver afvigende og derefter delvis mindste kvadraters Regression (PLS-R) til at bygge modellen kvantificering.

Delvis mindste kvadraters (PLS-R) plot og dens tilknyttede regression vektor, figur 1a og 1b henholdsvis, viser, at signalet fra parasitter er tydelig nok fra de røde blodlegemer, som de kan bruges til at danne en lineær regression model skal bruges til den forudsigelse af parasitter i fremtidige datasæt.
En robust, lineære PLS-R modellen blev genereret med en R-kvadreret værdi...

Watch this Scientific Journal Video about Detection and Quantification of Plasmodium falciparum in Aqueous Red Blood Cells by Attenuated Total Reflection Infrared Spectroscopy and Multivariate Data An

Detection and Quantification of Plasmodium falciparum in Aqueous Red Blood Cells by Attenuated Total Reflection Infrared Spectroscopy and Multivariate Data Analysis

Påvisningen og kvantificeringen af Plasmodium falciparum i vandig røde blodlegemer af svækket samlede refleksion infrarødspektroskopi og multivariat dataanalyse

Vi præsenterer her, en protokol til påvisning og kvantificering af Plasmodium falciparum i inficerede vandig røde blodlegemer ved hjælp af en svækket samlede refleksion infrarøde spektrometer og multivariat dataanalyse.

We demonstrate a method of quantification and detection of parasites in aqueous red blood cells (RBCs) by using a simple benchtop Attenuated Total ...

Det overordnede mål med denne procedure er at opbygge en regression model for forudsigelse af malaria parasitæmi ved hjælp af ATR-FTIR spektroskopi med multivariate dataanalyse. Denne metode kan hjælpe med at fremskynde point-of-care diagnostik, som kan bidrage til at forbedre patientens resultater i fremtiden. Den største fordel ved denne teknik er, at mens modellen kan tage lidt tid at bygge, det er meget bærbare, brugervenlige, meget følsomme, og billige.Selv om denne metode gør det muligt kvantificering af malaria parasitter, det kan også bruges til at observere fænotopypiske reaktion på miljømæssige ændringer såsom ændringer i parasit sammensætning på grund af antimikrobielle stoffer. Ideen udviklede sig fra arbejde, vi gjorde på den australske Synchrotron på malaria-inficerede celler. Det var på encellet niveau.Derfra besluttede vi at bruge ATR-FTIR spektroskopi til rent faktisk at udvikle den diagnostiske test. Før synkroniseringsproceduren påbegyndes, skal der anvendes 30 milliliter 3D7-stamme af Plasmodium falciparum-parasitter som beskrevet i tekstprotokollen. Ved hjælp af en automatiseret pipette, resuspend kulturen og overføre den til en 50-milliliter konisk rør.Centrifuge kulturen ved 300 til 400 gange g under standard laboratorieforhold i fem minutter. Fjern supernatanten ved at trække den op med en automatiseret pipette uden at forstyrre pellet. Kassér affaldsmediet i en 10% blegemiddelopløsning.Tilsæt langsomt 12 til 15 milliliter af en 4% sorbitolopløsning til pellets og bland kulturen ved at lægge loft over og vende røret, indtil kulturen er homogen. Inkuber kulturen ved 37 grader Celsius i 15 minutter. Efter 15 minutter centrifuger kulturen i fem minutter.Brug en automatiseret pipette til at fjerne supernatanten uden at forstyrre pellet. Der tilsættes 10 til 15 milliliter 0,9 % saltvand til pellets og opløsningen blandes ved at lægge rør til et loft og vendes, indtil kulturen er homogen. Centrifugerings- og saltvandsopløsningen vaskes to gange mere for at fjerne alle rester af sorbitol.For at begynde denne procedure, centrifuge bestanden røde blodlegemer, eller RBCs. Fjern supernatant og vask med 0,9% saltvand i alt tre gange. Centrifuge bestanden RBCs og kulturen på 300 til 400 gange g i fem minutter og kassér supernatant fra hvert rør.Mærke otte mikrocentrifuge rør som angivet. Brug derefter en 0,2 til 20 mikroliterpipette til at tilføje en passende mængde kultur til hvert rør. Dernæst tilsættes den passende mængde af lager RBCs til hvert rør for at opnå den ønskede parasitæmi fortynding.Centrifuge det friske donorblod, der er indsamlet i antikoagulerende rør ved 1, 200 gange g og standardlaboratoriebetingelser i 10 minutter. Fjern plasmaet ved at trække det op med en pipette og kassere det i en 10% blegemiddel opløsning. Tilsæt 900 mikroliter af isolerede donor RBC'er i hvert mikrocentrifugerør og bland grundigt ved at vende 10 gange.En simpel benchtop Dæmpet Total Reflection Fourier Transform Infrared, eller ATR-FTIR spektrometer vil blive brugt til at erhverve spektret. Forbered og rengør krystallen ved hjælp af fnugfrie klude, der er fugtet med ultra rent vand, så krystallen forsigtigt skrubbes i en cirkulær bevægelse. Brug derefter en anden fnugfri tørre til grundigt at tørre krystallen.Tag en baggrundsmåling af luften ved at klikke på Baggrundsmåling. Rengør krystallen hvert 20. Åbn livevisningen ved at klikke på Eksempel.Overhold en flad, vandret grundlinje, der angiver, at krystallen er ren. Pipette 10 mikroliter deioniseret vand direkte på midten af krystallen og klik på Målprøve. Tør krystallen med en fnugfri tørre og en blid cirkulær bevægelse.Pipette 10 mikroliter af prøve på midten af krystallen og klik på Mål prøve. Rengør krystallen mellem prøverne. I denne demonstration vil multivariat dataanalyse blive udført ved hjælp af MATLAB.Hvis du vil starte databehandlingen, skal du indtaste analyse i kommandovinduet for at åbne den grafiske brugergrænseflade. Højreklik på X-feltet for at finde Importér data. Vælg filtypen til analyse.Importer eksempel, vand og baseline spektre som datasæt på arbejdspladsen ved at vælge alle spektre i hvert sæt separat, klikke på Åbn og give hvert sæt et kort navn. Klik på Ny variabel i kommandovinduet, og giv vektoren navnet Parasitæmi. Input parasitten af hver prøve.Højreklik på X-feltet for at finde Afbild data. Klik på ikonet Afbild data for at afbilde dataene. Undersøg spektre for vanddamp effekter ved at klikke på Zoom og zoome ind på 1, 800 til 1, 400 per centimeter, mest tydeligt observeret som korte, skarpe, smalle toppe langs skråningerne af Amide I og Amide II bands.I tilfælde af ekstrem vanddamp skal du åbne fanen Rediger forbehandlingsdata og vælge Udjævning. Reducer støj- og/eller stærkt vanddampbidrag ved at udjævne prøven og vandspektre. Efter yderligere databehandling som beskrevet i tekstprotokollen skal du åbne fanen Rediger data og i kolonnevariabler vælge 2980 til 2800 pr. centimeter og 1750 til 850 pr. centimeter ved at sikre, at kun deres bokse er markeret.Dataene er nu klar til analyse. Hvis du vil udføre hovedkomponentanalyse eller PCA, skal du klikke på Analysenedbvising og vælge PCA. Klik på Byg model.Overhold 95%-konfidensgrænsen, den stiplede ring, på scoreplottet mellem PC 1 og PC 2. Brug værktøjet Vælg spectra til at markere prøvespektre med scorer, der forekommer uden for grænsen, som potentielle afvigende værdier. Hvis du vil udføre delvise mindste kvadrater regression, eller PLSR, skal du klikke på Analyse Regression og vælge PLSR.Højreklik på Y-blokken, og vælg vektorparasæmimodellen. Analysér regressionsmodellen og regressionsvektoren, og identificer de biologiske bånd. En delvis mindst kvadrater regression plot af RBCs spiked mellem nul til en procent Parasitæmi genereret en R-kvadreret værdi på 0,87 og en rod gennemsnitlig kvadreret krydsvalidering fejl på 0,13% Parasitæmi.Dette viser modellens evne til at forudsige parasitmien i hver prøve med den kendte parasitæmi på x-aksen og den forudsagte parasitæmi på y-aksen. Den tilknyttede regressionskoefficient beskriver hvert bånds bidrag til modellens prædiktive evne. Jo mere intens bandet, jo mere det bidrager til modellen, og dermed, hvordan parasitten ændrer den kemiske sammensætning af blodet.Resultaterne viser, at signalet fra parasitter er adskilt nok fra RBCs, at de kan bruges til at danne en lineær regression model for forudsigelse af parasitter i fremtidige datasæt. Når mastered, kan denne teknik tage mindre end tre minutter pr prøve, hvis de udføres korrekt. Under forsøg på denne procedure, er det vigtigt at huske at rense ATR krystaller af alle rester.Efter denne procedure, andre malaria arter såsom P vivax og P malaria kan modelleres med henblik på at besvare sådanne spørgsmål som, Er ATR-FTIR spektroskopi følsom nok til at skelne mellem arter? Efter sin udvikling, denne teknik banede vejen for forskere inden for biospektroroskopi at udforske påvisning og kvantificeringer af andre blodbårne patogener og endda analysere i blodet såsom glukose og urinstof. Efter at have set denne video, bør du have en god forståelse af ATR-FTIR spektroskopi og NVDA analyse for at opbygge en regression model.Glem ikke, at arbejde med patientblod og malaria prøver kan være farligt, og passende biosikkerhed niveau uddannelse og indeslutning bør altid ske, når du forsøger denne procedure.

Research

JoVE Journal

Chemistry

Detection and Quantification of Plasmodium falciparum in Aqueous Red Blood Cells by Attenuated Total Reflection Infrared Spectroscopy and Multivariate Data Analysis

In Situ SIMS and IR Spectroscopy of Well-defined Surfaces Prepared by Soft Landing of Mass-selected Ions

In Situ SIMS and IR Spectroscopy of Well-defined Surfaces Prepared by Soft Landing of Mass-selected Ions

In Situ SIMS og IR-spektroskopi veldefinerede Overflader Udarbejdet af Soft Landing af Mass udvalgte ioner

Soft landing of mass-selected ions onto surfaces is a powerful approach for the highly-controlled preparation of materials that are inaccessible using ...

Radiolabeling and Quantification of Cellular Levels of Phosphoinositides by High Performance Liquid Chromatography-coupled Flow Scintillation

Radioaktiv mærkning og kvantificering af cellulære niveauer af phosphoinositider af højtryksvæskekromatografi-koblede Flow Scintillation

Phosphoinositides (PtdInsPs) are essential signaling lipids responsible for recruiting specific effectors and conferring organelles with molecular ...

Construction of Models for Nondestructive Prediction of Ingredient Contents in Blueberries by Near-infrared Spectroscopy Based on HPLC Measurements

Konstruktion af Modeller for destruktiv Forudsigelse af indholdsstof Indhold i Blåbær ved Near-infrarød spektroskopi Baseret på HPLC Målinger

Nondestructive prediction of ingredient contents of farm products is useful to ship and sell the products with guaranteed qualities. Here, near-infrared ...

In Situ Detection and Single Cell Quantification of Metal Oxide Nanoparticles Using Nuclear Microprobe Analysis

In Situ Detection and Single Cell Quantification of Metal Oxide Nanoparticles Using Nuclear Microprobe Analysis

In Situ Påvisning og enkelt celle kvantificering af Metal metaloxid bruger nukleare Microprobe analyse

Micro-analytical techniques based on chemical element imaging enable the localization and quantification of chemical composition at the cellular level. ...

Electrochemical Impedance Spectroscopy as a Tool for Electrochemical Rate Constant Estimation

Elektrokemiske impedans spektroskopi som et redskab for elektrokemisk sats konstant estimering

Electrochemical impedance spectroscopy (EIS) was used for advanced characterization of organic electroactive compounds along with cyclic voltammetry (CV). ...

DNA-magnetic Particle Binding Analysis by Dynamic and Electrophoretic Light Scattering

DNA-magnetiske partikel bindende analyse af dynamiske og elektroforese lysspredning

Isolation of DNA using magnetic particles is a field of high importance in biotechnology and molecular biology research. This protocol describes the ...

Total Internal Reflection Absorption Spectroscopy (TIRAS) for the Detection of Solvated Electrons at a Plasma-liquid Interface

Total Internal Reflection Absorption Spectroscopy TIRAS for the Detection of Solvated Electrons at a Plasma-liquid Interface

Total interne Reflection Absorption spektroskopi (TIRAS) til påvisning af Solvated elektroner på en Plasma-flydende Interface

The total internal reflection absorption spectroscopy (TIRAS) method presented in this article uses an inexpensive diode laser to detect solvated ...

Elemental-sensitive Detection of the Chemistry in Batteries through Soft X-ray Absorption Spectroscopy and Resonant Inelastic X-ray Scattering

Elemental-følsomme påvisning af kemi i batterier gennem bløde X-ray Absorption spektroskopi og Resonant uelastisk X-ray spredning

Energy storage has become more and more a limiting factor of today's sustainable energy applications, including electric vehicles and green electric grid ...

Characterizing Lewis Pairs Using Titration Coupled with In Situ Infrared Spectroscopy

Tegnpå Lewis Pairs Ved hjælp af titrering kombineret med In Situ Infrarød spektroskopi

Lewis acid-activation of carbonyl-containing substrates is a fundamental basis for facilitating transformations in organic chemistry. Historically, ...

Covalent Attachment of Single Molecules for AFM-based Force Spectroscopy

Kovalent fastgørelse af enkelte molekyler til AFM-baseret kraftspektroskopi

Atomic force microscopy (AFM)-based single molecule force spectroscopy is an ideal tool for investigating the interactions between a single polymer and ...