Name: detection and quantification of plasmodium falciparum in aqueous red blood cells by attenuated total reflection infrared spectroscopy and multivariate data analysis
Uploaded: 2018-11-02T13:30:00
Description: Watch this Scientific Journal Video about Detection and Quantification of Plasmodium falciparum in Aqueous Red Blood Cells by Attenuated Total Reflection Infrared Spectroscopy and Multivariate Data An

호주 연구 협의회에 의해 제공 된 저자에 게 자금 (BRW 미래 친목 FT120100926), 국가 건강 및 의료 연구 위원회의 호주 (프로그램 그랜트와 수석 연구 친목 JGB; 초기 경력 동호회 JSR; 연구 인프라 지원 체계 부여 버넷 연구소 연구소), 빅토리아 주 정부 운영 인프라 지원 버넷 연구소를 부여. 우리 경 음악 지원 씨 Finlay 정강이 인정합니다.

적절 한 물질 안전 데이터 시트 (MSDS)를 참조 하 고 적절 한 Biosafety 수준 2 (BSL-2) 훈련을 추구 하십시오. BSL-2 캐비닛 무 균 기술을 사용 하 여, 의미 오염 제거 단계, 바늘 지팡이 상해, 및 생물 학적 노출 및 감염에서 유해한 UV 방사선에 노출의 모험 경우에 모든 자란 단계를 완료 해야 합니다 기생충 문화 어떤 상해를 입력합니다. 또한, 혈액 은행에서 주식 혈액은 특정 질병 및 혈액 질병 부담을 확?...

<ol>
	<li>Hommel, M., Gilles, H., Collier, L., Balows, A., Sussman, M. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/query.fcgi?db=PubMed&cmd=Search&doptcmdl=Citation&defaultField=Title+Word&term=Chapter+20.">Chapter 20.</a> Topley &amp; Wilson's Microbiology and Microbial Infections. Vol. 5 Parasitology. , 361 (1998).</li><li>World Health Organization. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/query.fcgi?db=PubMed&cmd=Search&doptcmdl=Citation&defaultField=Title+Word&term=.">.</a> World Malaria Report 2016. , (2016).</li><li>Rogers, W., Murray, P., Baron, E., Pflaller, M., Tenover, F., Yolken, R. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/query.fcgi?db=PubMed&cmd=Search&doptcmdl=Citation&defaultField=Title+Word&term=Chapter+105.">Chapter 105.</a> Manual of Clinical Microbiology. , 1355 (1999).</li><li>White, N. J. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/query.fcgi?db=PubMed&cmd=Search&doptcmdl=Citation&defaultField=Title+Word&term=Chapter+9.">Chapter 9.</a> Manson's Tropical Infectious Diseases. 23, 532-600 (2014).</li><li>Lindblade, K. A., Steinhardt, L., Samuels, A., Kachur, S. P., Slutsker, L. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/query.fcgi?db=PubMed&cmd=Search&doptcmdl=Citation&defaultField=Title+Word&term=The+silent+threat:+asymptomatic+parasitemia+and+malaria+transmission.">The silent threat: asymptomatic parasitemia and malaria transmission.</a> Expert Rev Anti Infect Ther. 11 (6), 623-639 (2013).</li><li>Hanscheid, T., Grobusch, M. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/query.fcgi?db=PubMed&cmd=Search&doptcmdl=Citation&defaultField=Title+Word&term=How+useful+is+PCR+in+the+diagnosis+of+malaria.">How useful is PCR in the diagnosis of malaria.</a> Trends Parasitol. 18 (9), 395-398 (2002).</li><li>Joanny, F., L&#246;hr, S. J., Engleitner, T., Lell, B., Mordm&#252;ller, B. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/query.fcgi?db=PubMed&cmd=Search&doptcmdl=Citation&defaultField=Title+Word&term=Limit+of+blank+and+limit+of+detection+of+Plasmodium+falciparum+thick+blood+smear+microscopy+in+a+routine+setting+in+Central+Africa.">Limit of blank and limit of detection of Plasmodium falciparum thick blood smear microscopy in a routine setting in Central Africa.</a> Malar J. 13 (1), 234-241 (2014).</li><li>World Health Organisation. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/query.fcgi?db=PubMed&cmd=Search&doptcmdl=Citation&defaultField=Title+Word&term=.">.</a> Malaria Rapid Diagnostic Test Performance: results of WHO product testing of malaria RDTs: round 6 (2014-2015). , (2014).</li><li>Khoshmanesh, A., et al. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/query.fcgi?db=PubMed&cmd=Search&doptcmdl=Citation&defaultField=Title+Word&term=Detection+and+quantification+of+early-stage+malaria+parasites+in+laboratory+infected+erythrocytes+by+attenuated+total+reflectance+infrared+spectroscopy+and+multivariate+analysis.">Detection and quantification of early-stage malaria parasites in laboratory infected erythrocytes by attenuated total reflectance infrared spectroscopy and multivariate analysis.</a> Anal Chem. 86, 4379-4386 (2014).</li><li>Martin, M., et al. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/query.fcgi?db=PubMed&cmd=Search&doptcmdl=Citation&defaultField=Title+Word&term=The+effect+of+common+anticoagulants+in+detection+and+quantification+of+malaria+parasitemia+in+human+red+blood+cells+by+ATR-FTIR+spectroscopy.">The effect of common anticoagulants in detection and quantification of malaria parasitemia in human red blood cells by ATR-FTIR spectroscopy.</a> Anal. 142 (8), 1192-1199 (2017).</li><li>Fabian, H., M&#228;ntele, W. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/query.fcgi?db=PubMed&cmd=Search&doptcmdl=Citation&defaultField=Title+Word&term=.">.</a> Handbook of Vibrational Spectroscopy. , (2006).</li><li>Whelan, D., et al. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/query.fcgi?db=PubMed&cmd=Search&doptcmdl=Citation&defaultField=Title+Word&term=Monitoring+the+reversible+B+to+A-like+transition+of+DNA+in+eukaryotic+cells+using+Fourier+transform+infrared+spectroscoptMonitoring+the+reversible+B+to+A-like+transition+of+DNA+in+eukaryotic+cells+using+Fourier+transform+infrared+spectroscopy.">Monitoring the reversible B to A-like transition of DNA in eukaryotic cells using Fourier transform infrared spectroscoptMonitoring the reversible B to A-like transition of DNA in eukaryotic cells using Fourier transform infrared spectroscopy.</a> Nucleic Acid Res. 39 (13), 5439-5448 (2011).</li><li>Wood, B. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/query.fcgi?db=PubMed&cmd=Search&doptcmdl=Citation&defaultField=Title+Word&term=The+importance+of+hydration+and+DNA+conformation+in+interpreting+infrared+spectra+of+cells+and+tissues.">The importance of hydration and DNA conformation in interpreting infrared spectra of cells and tissues.</a> Chem Soc Rev. 45, 1980-1998 (1980).</li><li>Plyler, E. K. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/query.fcgi?db=PubMed&cmd=Search&doptcmdl=Citation&defaultField=Title+Word&term=Infrared+spectra+of+methanol,+ethanol,+and+rn-propanol.">Infrared spectra of methanol, ethanol, and rn-propanol.</a> J Res Natl Bur Stand. 48 (4), (1952).</li></ol>

PLS-R 모델은 Y 선형 관계를 찾는 감독된 복수 방법 = bX + E, 예측 변수 X 사이 (여기에서, 각 wavenumber에 흡 광도)와 연속 변수 Y (여기, parasitemia 수준). 모델 변수 x Y, X 상관에 차이 캡처 잠재 변수 (LVs)의 새로운 집합을 만들 결합 하 고 회귀 벡터 (b)를 계산 하는 즉, 새로운 스펙트럼 결과 y 값의 추정에 의해 하는. 모델의 강도 두 값에서 반입할 수 있습니다: R2 값과 평균 제곱근 오차의 교차 유?...

말라리아는 우리 시대의; 가장 치명적인 질병 중 하나입니다. 발병 지역에서 위험이 절반 이상의 인구가 살고 그리고 그것은 어울리지 않게 가난한1,2,,34짐. 문제의 큰 부분 무 증상 사업자 및 초기 단계 환자5모기 벡터 대 한 저수지 역할을 젖은 계절 중에 감염의 스파이크를 일으키는 원인이 되 고 지역 사회에서 계속 하 허용 이다. 말라리아는 가장 치명적인 질병2의 가장 심각한 형태를 일으키는 원인이 되는 P. falciparum 은 5 변형 체 기생충에 의해 발생 합니다.
현재, 말라리아의 진단 위한 기술을 완벽 미만입니다. 광학 현미경 검사 법, 현재 골드 표준만 사용 되는 방법6에 따라 62-88 기생충 / µ L를 검색할 수 있습니다. 많이 하 고 많은 지역 현미경 오진에서 요구 하는 높은 기술 때문에 또한, >의 경우 50%, 특히 그 낮은 parasitaemia 레벨2는 직접의 영역에 리소스 부족에 기 인할 수 있다 안티-말라리아 약의 오용입니다. 다른 2 주요 진단 메서드는 급속 한 진단 테스트 (RDTs), 검색 및 중 합 효소 연쇄 반응 (PCR) 분석 실험, 차별 하 고 계량 DNA에서 기생충에 대 한 항 체를 활용 하는. 현재, RDTs만 치료 되는 질병의 희귀 한 형태로 발생 하는 혈액의 적어도 100 기생충 / µ L의 P. vivax 그리고 P. falciparum 감지 수 있습니다. 7 , 8 반대로, PCR 분석 실험 차별 및 감도 0.0004-5의 변형 체 의 종 계량 기생충 / µ L의 혈액. 그러나, 그것은 비싼 시 약, 장비 및 기술, 필요 하 고 따라서 필드 응용 프로그램에 적합 하지 않습니다.
매우 민감한, 안정적이 고 저렴 한 기술 때 진단 시간을 따라서 환자 결과 개선 및 질병 제거를 가능 하 게 하 고 향상 시키기 위해 필수적 이다. 감쇠 총 반사 푸리에 변환 (ATR FTIR) 분광학이이 문제에 대 한 잠재적인 해결책을 제공합니다. 이전 작업으로 감지 하 고 고정 피 영화의 검출 한계를 달성 하는 메탄올에 P. falciparum 계량 가능 했다 나타났습니다 < 혈액의 1 기생 / µ L (< 0.0002 %parasitemia)9, PCR 방법에 비해. 최근 연구 결과 검출 및 계량 수성 샘플에서 기생충 따라서 정착 단계를 제거 하는 것으로 나타났습니다. 그러나, 수증기, 스펙트럼 잡음 및 데이터 처리 같은 요인 최적의 결과10고려 될 필요가 있다.
이 프로토콜 ATR FTIR 스펙트럼을 취득 하 고 수성 적혈구 (RBC) 샘플10 P. falciparum 에의 검출에 대 한 회귀 모델을 준비 하는 방법 새 사용자를 표시 하는 것을 목표로.

<table>
	<tbody>
		<tr>
			<td>Donor blood</td>
			<td>-</td>
			<td>-</td>
			<td>Must be collected by a trained medical practitioner</td>
		</tr>
		<tr>
			<td>Stock blood</td>
			<td>Australian Red Cross`</td>
			<td>-</td>
			<td></td>
		</tr>
		<tr>
			<td>3D7 Plasmodium falciparum</td>
			<td>The Burnet Institute</td>
			<td>-</td>
			<td>Laboratory strain wild type equivalent</td>
		</tr>
		<tr>
			<td>RPMI-1640 media with L-hepes without Sodium Bicarbonate</td>
			<td>Sigma Aldrich</td>
			<td>R6504</td>
			<td></td>
		</tr>
		<tr>
			<td>Albumax (Gibco)</td>
			<td>Thermofisher</td>
			<td>E003000PJ</td>
			<td>Aliquot into 50 mL falcon tubes and store in freezer</td>
		</tr>
		<tr>
			<td>Sodium Bicarbonate</td>
			<td>Sigma Aldrich</td>
			<td>S5761</td>
			<td></td>
		</tr>
		<tr>
			<td>Giemsa Stain</td>
			<td>Sigma Aldrich</td>
			<td>48900</td>
			<td></td>
		</tr>
		<tr>
			<td>Sorbitol</td>
			<td>Sigma Aldrich</td>
			<td>S1876</td>
			<td>Must be filtered before use in culture</td>
		</tr>
		<tr>
			<td>Blood collection tubes (Vacutainers)</td>
			<td>Becton, Dickonson and Company</td>
			<td>367671</td>
			<td></td>
		</tr>
		<tr>
			<td>Immersion Oil</td>
			<td>Thermofisher</td>
			<td>M3004</td>
			<td></td>
		</tr>
		<tr>
			<td>50 mL culture dishes</td>
			<td>Falcon</td>
			<td>353025</td>
			<td></td>
		</tr>
		<tr>
			<td>25mL pipette tips</td>
			<td>Falcon</td>
			<td>357515</td>
			<td></td>
		</tr>
		<tr>
			<td>10mL pipette tips</td>
			<td>Falcon</td>
			<td>357530</td>
			<td></td>
		</tr>
		<tr>
			<td>Microscope Slides</td>
			<td>Sigma Aldrich</td>
			<td>S8902</td>
			<td></td>
		</tr>
		<tr>
			<td>Centrifuge tubes 50 mL</td>
			<td>Sigma Aldrich</td>
			<td>T2318</td>
			<td></td>
		</tr>
		<tr>
			<td>Automated pipette controller</td>
			<td>Integra-biosciences</td>
			<td>155 015</td>
			<td></td>
		</tr>
		<tr>
			<td>Sorvall Legend X1R Centrifuge</td>
			<td>Thermofisher</td>
			<td>75004260</td>
			<td></td>
		</tr>
		<tr>
			<td>Forma&#8482; 310 Direct Heat CO2 Incubators</td>
			<td>Thermofisher</td>
			<td>310TS</td>
			<td></td>
		</tr>
		<tr>
			<td>Nikon Eclipse E-100 Binocular Microscope</td>
			<td>Nikon Instruments</td>
			<td>E100_2CE-MRTK-1</td>
			<td>When purchasing ensure that the 100x lens is an oil immersion lens</td>
		</tr>
		<tr>
			<td>Bruker Alpha Ft-IR Spectrometer with ATR Quick Snap Attachment</td>
			<td>Bruker</td>
			<td>9308-3700</td>
			<td>Be sure to request &#34;Eco-ATR&#34; attachment when purchasing</td>
		</tr>
		<tr>
			<td>Matlab</td>
			<td>Mathworks Inc</td>
			<td></td>
			<td>Multivariate data analysis software</td>
		</tr>
		<tr>
			<td>The Unscrambler X</td>
			<td>CAMO</td>
			<td></td>
			<td>Multivariate data analysis software</td>
		</tr>
		<tr>
			<td>PLS-Toolbox</td>
			<td>Mathworks, Inc.</td>
			<td></td>
			<td>GUI for Matlab</td>
		</tr>
	</tbody>
</table>

detection and quantification of plasmodium falciparum in aqueous red blood cells by attenuated total reflection infrared spectroscopy and multivariate data analysis

복수 데이터 분석 (와 함께에서 간단한 벤치탑 감쇠 총 반사 푸리에 변환 적외선 (ATR FTIR) 분석기를 사용 하 여 정량화 하는 방법 및 수성 적혈구 (Rbc)에 기생충의 탐지 설명 MVDA)입니다. 3D 7 P. falciparum 10 %parasitemia 링 무대 기생충에 교양 있었다 및 시리즈를 만들 희석 0-1 사이의 절연 신선한 기증자 Rbc 스파이크 사용 %. 10 µ L 각 샘플의 스펙트럼을 얻으려고 ATR 다이아몬드 윈도우의 중앙에 배치 했다. 샘플 데이터 취급 신호 대 잡음 비를 개선 하 고 물의 기여를 제거 하 고 두 번째 파생 스펙트럼 기능 해결에 적용 했다. 데이터 다음 MVDA의 두 종류를 사용 하 여 분석 했다: 어떤 outliers 그리고 부분 최소 제곱 회귀 (PLS-R) 정량화 모델 확인 첫 번째 주요 구성 요소 분석 (PCA).

부분 최소 제곱 (PLS-R) 플롯 및 그것의 관련 된 회귀 벡터, 그림 1a 및 1b 각각 기생충에서 신호는 충분히 Rbc 양식에 사용 되는 선형 회귀 모델에 사용할 수 있는 다른 표시는 미래의 데이터 세트에서 기생충 예측
강력 하 고, 선형 PLS-R 모델 0.87의 R-제곱 값이 생성 하 고 루트 평균 제곱 <strong class...

Watch this Scientific Journal Video about Detection and Quantification of Plasmodium falciparum in Aqueous Red Blood Cells by Attenuated Total Reflection Infrared Spectroscopy and Multivariate Data An

Detection and Quantification of Plasmodium falciparum in Aqueous Red Blood Cells by Attenuated Total Reflection Infrared Spectroscopy and Multivariate Data Analysis

검색 및 변형 체 falciparum 에 수성 적혈구 총 반사 적외선 분광학 감쇠 및 복수 데이터 분석의 정량화

여기, 선물이 탐지 및 정량화의 변형 체 falciparum 감염 수성 적혈구 감쇠 총 반사 적외선 분석기 및 다변량 데이터 분석을 사용 하는 프로토콜.

We demonstrate a method of quantification and detection of parasites in aqueous red blood cells (RBCs) by using a simple benchtop Attenuated Total ...

이 절차의 전반적인 목표는 다변량 데이터 분석을 가진 ATR-FTIR 분광법을 사용하여 말라리아 기생충증의 예측을 위한 회귀 모형을 구축하는 것입니다. 이 방법은 미래에 환자 결과를 개선하는 데 도움이 될 수있는 치료 시점 진단을 신속하게 하는 데 도움이 될 수 있습니다. 이 기술의 주요 장점은 모델이 구축하는 데 시간이 걸릴 수 있지만 휴대성이 뛰어나고 사용자 친화적이며 매우 민감하며 비용이 낮다는 것입니다.이 방법은 말라리아 기생충의 정량화를 가능하게 하지만, 항균제로 인한 기생충 조성의 변화와 같은 환경 변화에 대한 현상적 반응을 관찰하는 데도 사용될 수 있다. 아이디어는 우리가 말라리아 감염한 세포에 호주 싱크로트론에서 한 일에서 개발했습니다. 이것은 단세포 수준에 있었습니다.거기에서, 우리는 실제로 진단 시험을 개발하기 위하여 ATR-FTIR 분광기를 사용하기로 결정했습니다. 동기화 절차를 시작하기 전에, 텍스트 프로토콜에 설명된 바와 같이 3D7 균주 플라스모듐 팔시파룸 기생충의 문화 30 밀리리터. 자동 파이펫을 사용하여 문화를 다시 중단하고 50밀리리터 원유형 튜브로 전송합니다.원심 분리는 5 분 동안 표준 실험실 조건하에서 300 ~ 400 배 g에서 배양합니다. 펠릿을 방해하지 않고 자동화된 파이펫으로 그려서 상체를 제거합니다. 폐기물 미디어를 10% 표백액으로 폐기합니다.펠릿에 4%의 소르돌 용액의 12~15밀리리터를 천천히 추가하고 문화가 균일해질 때까지 튜브를 캡핑하고 반전시켜 배양을 혼합합니다. 15분 동안 섭씨 37도에서 문화를 배양합니다. 15분 후, 원심분리기를 5분간 양해합니다.자동 파이펫을 사용하여 펠릿을 방해하지 않고 상체를 제거합니다. 펠릿에 0.9%의 식염수 10~15밀리리터를 넣고 배양이 균일해질 때까지 튜브를 캡핑하고 반전시켜 용액을 혼합합니다. 원심분리및식염액을 두 번 더 씻어 서 소르비톨의 모든 잔해를 제거한다.이 절차를 시작하려면, 재고 적혈구 또는 RbC. 상체를 제거하고 총 3 번 0.9 %의 식염수로 씻어. 주식 RBC와 문화를 5분 동안 300~400회 g로 원심분리하고 각 튜브에서 상퍼를 폐기합니다.표시된 대로 8개의 미세원심분리기 튜브에 라벨을 붙입니다. 그런 다음 0.2 ~ 20 마이크로 리터 파이펫을 사용하여 각 튜브에 적절한 양의 배양을 추가하십시오. 다음으로, 원하는 기생충 희석을 얻기 위해 각 튜브에 적절한 양의 스톡 RBC를 추가한다.10 분 동안 1, 200 배 g 및 표준 실험실 조건에서 항응고관에서 수집 된 신선한 기증자 혈액 원심 분리. 파이펫으로 플라즈마를 제거하고 10 % 표백제 용액으로 폐기하십시오. 각 마이크로센심분리기 튜브에 900마이크로리터의 마이크로리터를 추가하고 10번 반전하여 철저히 섞습니다.간단한 벤치탑 감쇠 총 반사 푸아로 변환 적외선, 또는 ATR-FTIR 분광계스펙트럼을 획득하는 데 사용됩니다. 초순수물로 감쇠된 보풀이 없는 물티슈를 사용하여 크리스탈을 원형 으로 부드럽게 닦아 크리스탈을 준비하고 청소합니다. 그런 다음 다른 보풀이없는 닦기를 사용하여 크리스탈을 완전히 건조시하십시오.배경 측정을 클릭하여 공기의 배경 측정을 수행합니다. 20분마다 크리스탈을 청소하고 이 측정을 반복합니다. 미리 보기를 클릭하여 라이브 뷰를 엽니다.결정이 깨끗하다는 것을 나타내는 평평한 수평 기준선을 관찰합니다. 파이펫 10 마이크로리터의 탈이온화된 물은 크리스탈 의 중앙에 직접 정수및 측정 샘플을 클릭합니다. 보풀이 없는 와이프와 부드러운 원형 동작으로 크리스탈을 건조시다.파이프 10 마이크로리터의 샘플은 결정의 중간에 측정 샘플을 클릭합니다. 샘플 사이에 결정을 청소합니다. 이 데모에서는 MATLAB을 사용하여 다변량 데이터 분석을 수행합니다.데이터 처리를 시작하려면 명령 창에 입력 분석을 입력하여 그래픽 사용자 인터페이스를 엽니다. X 상자를 마우스 오른쪽 단추로 클릭하여 가져오기 데이터를 찾습니다. 분석을 위해 파일 유형을 선택합니다.샘플, 물 및 기준 스펙트럼을 각 집합의 모든 스펙트럼을 별도로 선택하고 열기를 클릭하고 각 집합에 짧은 이름을 지정하여 데이터 집합으로 데이터 집합으로 가져옵니다. 명령 창에서 새 변수를 클릭하고 벡터에게 파라사이트미아라는 이름을 지정합니다. 각 샘플의 기생충증을 입력합니다.X 상자를 마우스 오른쪽 단추로 클릭하여 플롯 데이터를 찾습니다. 데이터 플롯 아이콘을 클릭하여 데이터를 플롯합니다. 확대/축소를 클릭하고 1, 800에서 1, 400센티미터를 확대하여 수증기 효과에 대한 스펙트럼을 검사하며, 가장 명확하게 아미드 I 와 Amide II 대역의 경사면을 따라 짧고 날카롭고 좁은 봉우리로 관찰됩니다.극단적인 수증기의 경우 사전 처리 편집 데이터 탭을 열고 스무딩을 선택합니다. 시료 및 수분 스펙트럼을 부드럽게 하여 소음 및/또는 강력한 수증기 기여도를 줄입니다. 텍스트 프로토콜에 설명된 대로 추가 데이터 처리 후 데이터 편집 탭을 열고 열 변수에서 상자만 체크하여 2980~2800cm 및 1750~850cm를 선택합니다.이제 데이터가 분석을 위해 준비되었습니다. 주 성분 분석 또는 PCA를 수행하려면 분석 분해를 클릭하고 PCA를 선택합니다. 모델 빌드를 클릭합니다.PC 1과 PC 2 사이의 점수 플롯에 95 %의 신뢰 도면, 파선 링을 관찰합니다. 스펙트럼 선택 도구를 사용하여 한도 외부에서 발생하는 점수와 샘플 스펙트럼을 잠재적 이상값으로 표시합니다. 부분 최소 제곱 회귀 또는 PLSR을 수행하려면 분석 회귀를 클릭하고 PLSR을 선택합니다.Y 블록을 마우스 오른쪽 단추로 클릭하고 벡터 Parasitemia 빌드 모델을 선택합니다. 회귀 모델 및 회귀 벡터를 분석하고 생물학적 대역을 식별한다. RBC의 부분 최소 사각형 회귀 플롯은 0에서 1% 사이로 급증하여 R-제곱 값0.87및 루트 평균 제곱 교차 유효성 검사 오류 0.13%의 파라사이트미아를 생성했습니다.이는 x축에 알려진 기생충증과 y축의 예측된 기생충증을 가진 각 샘플에서 기생충증을 예측하는 모델의 능력을 보여줍니다. 관련 회귀 계수는 모델의 예측 능력에 대한 각 밴드의 기여도를 설명합니다. 밴드가 더 강렬할수록 모델에 더 많이 기여하며, 따라서 기생충이 혈액의 화학 적 조성을 어떻게 변화시키는지.결과는 기생충의 신호가 향후 데이터 집합에서 기생충의 예측을 위한 선형 회귀 모델을 형성하는 데 사용할 수 있는 RBC와 충분히 구별된다는 것을 보여줍니다. 일단 마스터되면, 이 기술은 제대로 수행하면 샘플 당 3 분 미만 걸릴 수 있습니다. 이 절차를 시도하는 동안 모든 잔류물의 ATR 결정을 청소하는 것을 기억하는 것이 중요합니다.이 절차에 따라, P vivax와 P 말라리아 와 같은 그밖 말라리아 종은 종을 구별하기에 충분히 민감한 ATR-FTIR 분광기같이 대답하기 위하여 모델링될 수 있습니다? 개발 후, 이 기술은 생체 분화 분야의 연구원들이 다른 혈액 매개 병원체의 검출 및 정량화를 탐구하고 포도당및 우레아와 같은 혈액에서 분석할 수 있는 길을 열었습니다. 이 비디오를 시청한 후에는 회귀 모델을 구축하기 위해 ATR-FTIR 분광및 NVDA 분석을 잘 이해해야 합니다.환자 혈액 및 말라리아 샘플로 작업하는 것은 위험할 수 있으며 적절한 생체 안전 수준 훈련 및 봉쇄는 이 절차를 시도할 때 항상 수행해야 한다는 것을 잊지 마십시오.

Research

JoVE Journal

Chemistry

Detection and Quantification of Plasmodium falciparum in Aqueous Red Blood Cells by Attenuated Total Reflection Infrared Spectroscopy and Multivariate Data Analysis

In Situ SIMS and IR Spectroscopy of Well-defined Surfaces Prepared by Soft Landing of Mass-selected Ions

In Situ SIMS and IR Spectroscopy of Well-defined Surfaces Prepared by Soft Landing of Mass-selected Ions

대량 선택 이온 소프트 랜딩에 의해 준비 잘 정의 된 표면의 제자리 SIMS 및 IR 분광법

Soft landing of mass-selected ions onto surfaces is a powerful approach for the highly-controlled preparation of materials that are inaccessible using ...

연구

화학

Radiolabeling and Quantification of Cellular Levels of Phosphoinositides by High Performance Liquid Chromatography-coupled Flow Scintillation

고성능 액체 크로마토 그래피 결합 흐름 섬광에 의한 방사성 표지 및 Phosphoinositides의 세포 수준의 정량화

Phosphoinositides (PtdInsPs) are essential signaling lipids responsible for recruiting specific effectors and conferring organelles with molecular ...

Construction of Models for Nondestructive Prediction of Ingredient Contents in Blueberries by Near-infrared Spectroscopy Based on HPLC Measurements

HPLC 측​​정을 바탕으로 근적외선 분광법에 의한 블루 베리의 성분 내용의 비파괴 예측을위한 모델의 건설

Nondestructive prediction of ingredient contents of farm products is useful to ship and sell the products with guaranteed qualities. Here, near-infrared ...

In Situ Detection and Single Cell Quantification of Metal Oxide Nanoparticles Using Nuclear Microprobe Analysis

In Situ Detection and Single Cell Quantification of Metal Oxide Nanoparticles Using Nuclear Microprobe Analysis

제자리에서 검색 및 핵 현미경 분석을 사용 하 여 금속 산화물 나노 입자의 단일 셀 정량화

Micro-analytical techniques based on chemical element imaging enable the localization and quantification of chemical composition at the cellular level. ...

Electrochemical Impedance Spectroscopy as a Tool for Electrochemical Rate Constant Estimation

전기 화학 임피던스 분 광 전기 화학 속도 상수 추정을 위한 도구로

Electrochemical impedance spectroscopy (EIS) was used for advanced characterization of organic electroactive compounds along with cyclic voltammetry (CV). ...

DNA-magnetic Particle Binding Analysis by Dynamic and Electrophoretic Light Scattering

역동적이 고 전기 이동 산란 분석 바인딩 DNA-마그네틱 입자

Isolation of DNA using magnetic particles is a field of high importance in biotechnology and molecular biology research. This protocol describes the ...

Total Internal Reflection Absorption Spectroscopy (TIRAS) for the Detection of Solvated Electrons at a Plasma-liquid Interface

Total Internal Reflection Absorption Spectroscopy TIRAS for the Detection of Solvated Electrons at a Plasma-liquid Interface

총 내부 반사 흡수 분광학 (TIRAS) 플라즈마 액체 인터페이스에서 Solvated 전자의 탐지

The total internal reflection absorption spectroscopy (TIRAS) method presented in this article uses an inexpensive diode laser to detect solvated ...

Elemental-sensitive Detection of the Chemistry in Batteries through Soft X-ray Absorption Spectroscopy and Resonant Inelastic X-ray Scattering

소프트 x 선 흡수 분광학 및 공명 탄력 x 선 산란을 통해 배터리에 화학의 원소 구분 검색

Energy storage has become more and more a limiting factor of today's sustainable energy applications, including electric vehicles and green electric grid ...

Characterizing Lewis Pairs Using Titration Coupled with In Situ Infrared Spectroscopy

Lewis acid-activation of carbonyl-containing substrates is a fundamental basis for facilitating transformations in organic chemistry. Historically, ...

Covalent Attachment of Single Molecules for AFM-based Force Spectroscopy

AFM 기반 힘 분광학을 위한 단일 분자의 공유 부착

Atomic force microscopy (AFM)-based single molecule force spectroscopy is an ideal tool for investigating the interactions between a single polymer and ...