Name: detection and quantification of plasmodium falciparum in aqueous red blood cells by attenuated total reflection infrared spectroscopy and multivariate data analysis
Uploaded: 2018-11-02T13:30:00
Description: Watch this Scientific Journal Video about Detection and Quantification of Plasmodium falciparum in Aqueous Red Blood Cells by Attenuated Total Reflection Infrared Spectroscopy and Multivariate Data An

Midler til forfatterne ble gitt av den australske forskningsråd (fremtiden fellesskap FT120100926 til BRW), National Health og medisinsk forskning rådet i Australia (programmet grant og Senior Research Fellowship til JGB; Tidlig karriere stipend JSR; Infrastruktur for forskning institutter støtte ordningen Grant til Burnet Institute), og den viktorianske stat regjeringen operative infrastrukturen støtte Grant til Burnet Institute. Vi erkjenner Mr. Finlay Shanks instrumental støtte.

Vennligst kontakt riktig Material Safety Data ark (MSDS) og søke riktig grad 2 (BSL-2) trening. Alle culturing skritt må gjøres i en BSL-2 skap bruker steril teknikk, betyr det er en risiko for eksponering for skadelige UV-stråling fra dekontaminering skritt, nål-stick skader, og berøres av biologiske og infeksjon hvis parasitten kultur inn noen skader. Videre er lager blod fra blodbanker er bare vist for enkelte sykdommer og potensialet for spredning blod båret sykdommer en potensiell risiko. Oppsøk øyeblikkeli...

<ol>
	<li>Hommel, M., Gilles, H., Collier, L., Balows, A., Sussman, M. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/query.fcgi?db=PubMed&cmd=Search&doptcmdl=Citation&defaultField=Title+Word&term=Chapter+20.">Chapter 20.</a> Topley &amp; Wilson's Microbiology and Microbial Infections. Vol. 5 Parasitology. , 361 (1998).</li><li>World Health Organization. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/query.fcgi?db=PubMed&cmd=Search&doptcmdl=Citation&defaultField=Title+Word&term=.">.</a> World Malaria Report 2016. , (2016).</li><li>Rogers, W., Murray, P., Baron, E., Pflaller, M., Tenover, F., Yolken, R. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/query.fcgi?db=PubMed&cmd=Search&doptcmdl=Citation&defaultField=Title+Word&term=Chapter+105.">Chapter 105.</a> Manual of Clinical Microbiology. , 1355 (1999).</li><li>White, N. J. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/query.fcgi?db=PubMed&cmd=Search&doptcmdl=Citation&defaultField=Title+Word&term=Chapter+9.">Chapter 9.</a> Manson's Tropical Infectious Diseases. 23, 532-600 (2014).</li><li>Lindblade, K. A., Steinhardt, L., Samuels, A., Kachur, S. P., Slutsker, L. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/query.fcgi?db=PubMed&cmd=Search&doptcmdl=Citation&defaultField=Title+Word&term=The+silent+threat:+asymptomatic+parasitemia+and+malaria+transmission.">The silent threat: asymptomatic parasitemia and malaria transmission.</a> Expert Rev Anti Infect Ther. 11 (6), 623-639 (2013).</li><li>Hanscheid, T., Grobusch, M. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/query.fcgi?db=PubMed&cmd=Search&doptcmdl=Citation&defaultField=Title+Word&term=How+useful+is+PCR+in+the+diagnosis+of+malaria.">How useful is PCR in the diagnosis of malaria.</a> Trends Parasitol. 18 (9), 395-398 (2002).</li><li>Joanny, F., L&#246;hr, S. J., Engleitner, T., Lell, B., Mordm&#252;ller, B. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/query.fcgi?db=PubMed&cmd=Search&doptcmdl=Citation&defaultField=Title+Word&term=Limit+of+blank+and+limit+of+detection+of+Plasmodium+falciparum+thick+blood+smear+microscopy+in+a+routine+setting+in+Central+Africa.">Limit of blank and limit of detection of Plasmodium falciparum thick blood smear microscopy in a routine setting in Central Africa.</a> Malar J. 13 (1), 234-241 (2014).</li><li>World Health Organisation. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/query.fcgi?db=PubMed&cmd=Search&doptcmdl=Citation&defaultField=Title+Word&term=.">.</a> Malaria Rapid Diagnostic Test Performance: results of WHO product testing of malaria RDTs: round 6 (2014-2015). , (2014).</li><li>Khoshmanesh, A., et al. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/query.fcgi?db=PubMed&cmd=Search&doptcmdl=Citation&defaultField=Title+Word&term=Detection+and+quantification+of+early-stage+malaria+parasites+in+laboratory+infected+erythrocytes+by+attenuated+total+reflectance+infrared+spectroscopy+and+multivariate+analysis.">Detection and quantification of early-stage malaria parasites in laboratory infected erythrocytes by attenuated total reflectance infrared spectroscopy and multivariate analysis.</a> Anal Chem. 86, 4379-4386 (2014).</li><li>Martin, M., et al. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/query.fcgi?db=PubMed&cmd=Search&doptcmdl=Citation&defaultField=Title+Word&term=The+effect+of+common+anticoagulants+in+detection+and+quantification+of+malaria+parasitemia+in+human+red+blood+cells+by+ATR-FTIR+spectroscopy.">The effect of common anticoagulants in detection and quantification of malaria parasitemia in human red blood cells by ATR-FTIR spectroscopy.</a> Anal. 142 (8), 1192-1199 (2017).</li><li>Fabian, H., M&#228;ntele, W. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/query.fcgi?db=PubMed&cmd=Search&doptcmdl=Citation&defaultField=Title+Word&term=.">.</a> Handbook of Vibrational Spectroscopy. , (2006).</li><li>Whelan, D., et al. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/query.fcgi?db=PubMed&cmd=Search&doptcmdl=Citation&defaultField=Title+Word&term=Monitoring+the+reversible+B+to+A-like+transition+of+DNA+in+eukaryotic+cells+using+Fourier+transform+infrared+spectroscoptMonitoring+the+reversible+B+to+A-like+transition+of+DNA+in+eukaryotic+cells+using+Fourier+transform+infrared+spectroscopy.">Monitoring the reversible B to A-like transition of DNA in eukaryotic cells using Fourier transform infrared spectroscoptMonitoring the reversible B to A-like transition of DNA in eukaryotic cells using Fourier transform infrared spectroscopy.</a> Nucleic Acid Res. 39 (13), 5439-5448 (2011).</li><li>Wood, B. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/query.fcgi?db=PubMed&cmd=Search&doptcmdl=Citation&defaultField=Title+Word&term=The+importance+of+hydration+and+DNA+conformation+in+interpreting+infrared+spectra+of+cells+and+tissues.">The importance of hydration and DNA conformation in interpreting infrared spectra of cells and tissues.</a> Chem Soc Rev. 45, 1980-1998 (1980).</li><li>Plyler, E. K. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/query.fcgi?db=PubMed&cmd=Search&doptcmdl=Citation&defaultField=Title+Word&term=Infrared+spectra+of+methanol,+ethanol,+and+rn-propanol.">Infrared spectra of methanol, ethanol, and rn-propanol.</a> J Res Natl Bur Stand. 48 (4), (1952).</li></ol>

PLS-R-modellen er en veiledet multivariabel metode som finner en lineær sammenheng, Y = bX + E, mellom prediktiv variablene X (her, absorbans ved hver wavenumber) og en kontinuerlig variabel Y (her, hvilket parasitemia). Kort sagt, modellen kombinerer variablene i X for å opprette et nytt sett av latent variabler (LVs) som fange variansen på X korrelert med Y, og beregner en regresjon vektor (b) som ganges med en ny spektrum resulterer i estimering av y-verdien. Styrken på modellen kan bli tatt fra to verdier: R...

Malaria er blant de mest ødeleggende sykdommene i vår tid; over halvparten av befolkningen lever i faresonen i endemiske områder og det byrder uforholdsmessig dårlig1,2,3,4. En stor del av problemet er asymptomatisk bærere og tidlig stadium pasienter som reservoarer for mygg vektorer5, forårsaker pigger av infeksjon i våte sesonger og tillater den å vedvare i fellesskap. Malaria skyldes fem Plasmodium parasitter, den mest dødelige som er P. falciparum som forårsaker den strengeste formen av sykdom2.
Foreløpig er teknikker for diagnostisering av malaria mindre enn perfekt. Optisk mikroskopi, gjeldende gull standard, kan bare oppdage 62-88 parasitter/µL avhengig av oppfølgingsmetoden6. Videre, på grunn av sier og høye ferdigheter som kreves, i mange regioner mikroskopi misdiagnoses > 50% av tilfellene, spesielt de med lav parasitaemia nivå2, som kan direkte tilskrives mangel på ressurser i området og resultater i misbruk av anti-malarial medikamenter. De andre 2 viktigste diagnostiske metodene er rask diagnostiseringstester (RDTs), som utnytter antistoffer for deteksjon og Polymerase kjedereaksjon (PCR) analyser, som diskriminerer og kvantifisere parasitter fra DNA. Foreløpig er RDTs bare kjøpedyktig merker P. falciparum og P. Samsung av minst 100 parasitter/µL av blod som resulterer i sjeldne former av sykdommen som ubehandlet. 7 , 8 i kontrast, PCR analyser diskriminere og kvantifisere ulike arter av Plasmodium på en følsomhet på 0,0004-5 parasitter/µL av blod. Men det krever dyre reagenser, utstyr og tekniske ferdigheter, og dermed er ikke egnet for programmet feltet.
En svært følsom, pålitelig og rimelig teknikk er viktig å bedre diagnose ganger, og dermed bedre pasientens utfall og gjør sykdommen eliminering mulig. Dempes totale refleksjon Fourier transform (ATR-FTIR) spektroskopi tilbyr en mulig løsning på dette problemet. Tidligere arbeid har vist at det var mulig å oppdage og kvantifisere P. falciparum i metanol fast blod filmer å oppnå oppdagelsen grensene for < 1 parasitten/µL av blod (< 0.0002% parasitemia)9, som er sammenlignbare med PCR metoder. Nyere studier har vist at det er mulig å oppdage og kvantifisere parasitter i vandig prøver og dermed eliminerer fiksering trinnet. Faktorer som vanndamp, spectral støy og data behandling må imidlertid tas i betraktning for optimale resultater10.
Denne protokollen skal vise nye brukere hvordan du anskaffer ATR-FTIR spectra og forberede en regresjonsmodell for påvisning av P. falciparum vandig røde blodlegemer (RBC) prøver10.

<table>
	<tbody>
		<tr>
			<td>Donor blood</td>
			<td>-</td>
			<td>-</td>
			<td>Must be collected by a trained medical practitioner</td>
		</tr>
		<tr>
			<td>Stock blood</td>
			<td>Australian Red Cross`</td>
			<td>-</td>
			<td></td>
		</tr>
		<tr>
			<td>3D7 Plasmodium falciparum</td>
			<td>The Burnet Institute</td>
			<td>-</td>
			<td>Laboratory strain wild type equivalent</td>
		</tr>
		<tr>
			<td>RPMI-1640 media with L-hepes without Sodium Bicarbonate</td>
			<td>Sigma Aldrich</td>
			<td>R6504</td>
			<td></td>
		</tr>
		<tr>
			<td>Albumax (Gibco)</td>
			<td>Thermofisher</td>
			<td>E003000PJ</td>
			<td>Aliquot into 50 mL falcon tubes and store in freezer</td>
		</tr>
		<tr>
			<td>Sodium Bicarbonate</td>
			<td>Sigma Aldrich</td>
			<td>S5761</td>
			<td></td>
		</tr>
		<tr>
			<td>Giemsa Stain</td>
			<td>Sigma Aldrich</td>
			<td>48900</td>
			<td></td>
		</tr>
		<tr>
			<td>Sorbitol</td>
			<td>Sigma Aldrich</td>
			<td>S1876</td>
			<td>Must be filtered before use in culture</td>
		</tr>
		<tr>
			<td>Blood collection tubes (Vacutainers)</td>
			<td>Becton, Dickonson and Company</td>
			<td>367671</td>
			<td></td>
		</tr>
		<tr>
			<td>Immersion Oil</td>
			<td>Thermofisher</td>
			<td>M3004</td>
			<td></td>
		</tr>
		<tr>
			<td>50 mL culture dishes</td>
			<td>Falcon</td>
			<td>353025</td>
			<td></td>
		</tr>
		<tr>
			<td>25mL pipette tips</td>
			<td>Falcon</td>
			<td>357515</td>
			<td></td>
		</tr>
		<tr>
			<td>10mL pipette tips</td>
			<td>Falcon</td>
			<td>357530</td>
			<td></td>
		</tr>
		<tr>
			<td>Microscope Slides</td>
			<td>Sigma Aldrich</td>
			<td>S8902</td>
			<td></td>
		</tr>
		<tr>
			<td>Centrifuge tubes 50 mL</td>
			<td>Sigma Aldrich</td>
			<td>T2318</td>
			<td></td>
		</tr>
		<tr>
			<td>Automated pipette controller</td>
			<td>Integra-biosciences</td>
			<td>155 015</td>
			<td></td>
		</tr>
		<tr>
			<td>Sorvall Legend X1R Centrifuge</td>
			<td>Thermofisher</td>
			<td>75004260</td>
			<td></td>
		</tr>
		<tr>
			<td>Forma&#8482; 310 Direct Heat CO2 Incubators</td>
			<td>Thermofisher</td>
			<td>310TS</td>
			<td></td>
		</tr>
		<tr>
			<td>Nikon Eclipse E-100 Binocular Microscope</td>
			<td>Nikon Instruments</td>
			<td>E100_2CE-MRTK-1</td>
			<td>When purchasing ensure that the 100x lens is an oil immersion lens</td>
		</tr>
		<tr>
			<td>Bruker Alpha Ft-IR Spectrometer with ATR Quick Snap Attachment</td>
			<td>Bruker</td>
			<td>9308-3700</td>
			<td>Be sure to request &#34;Eco-ATR&#34; attachment when purchasing</td>
		</tr>
		<tr>
			<td>Matlab</td>
			<td>Mathworks Inc</td>
			<td></td>
			<td>Multivariate data analysis software</td>
		</tr>
		<tr>
			<td>The Unscrambler X</td>
			<td>CAMO</td>
			<td></td>
			<td>Multivariate data analysis software</td>
		</tr>
		<tr>
			<td>PLS-Toolbox</td>
			<td>Mathworks, Inc.</td>
			<td></td>
			<td>GUI for Matlab</td>
		</tr>
	</tbody>
</table>

detection and quantification of plasmodium falciparum in aqueous red blood cells by attenuated total reflection infrared spectroscopy and multivariate data analysis

Vi viser en metode for kvantifisering og påvisning av parasitter i vandig røde blodlegemer (RBCs) ved hjelp av en enkel Borstemmaskin dempes totale refleksjon Fourier transformere infrarød (ATR-FTIR) spectrometer sammen med multivariabel analyse ( MVDA). 3D 7 P. falciparum ble kultivert for 10% parasitemia ring scenen parasitter og brukes å pigge frisk donor isolert RBCs for å opprette en fortynning mellom 0-1%. 10 µL av hvert utvalg plassert på midten av vinduet ATR diamant å erverve spekteret. Eksempeldataene ble behandlet til å forbedre signal til støyforhold og fjerne bidrag av vann, og deretter den andre deriverte ble brukt til å løse spectral funksjoner. Dataene ble deretter analysert ved hjelp av to typer MVDA: første viktigste komponenten analyse (PCA) til å fastslå eventuelle outliers og deretter delvis minste kvadrater regresjon (PLS-R) å bygge kvantifisering modell.

Delvis minste kvadraters (PLS-R) plot og dens tilknyttede regresjon vektor, figur 1a og 1b henholdsvis vise at signalet fra parasitter er såpass fra RBCs som de kan brukes å danne en lineær regresjon modell som skal brukes for den prediksjon av parasitter i fremtidige datasett.
En robust, lineær PLS-R-modellen ble generert med en R-kvadrert verdi av 0.87 og en rot-betyr-squared ...

Watch this Scientific Journal Video about Detection and Quantification of Plasmodium falciparum in Aqueous Red Blood Cells by Attenuated Total Reflection Infrared Spectroscopy and Multivariate Data An

Detection and Quantification of Plasmodium falciparum in Aqueous Red Blood Cells by Attenuated Total Reflection Infrared Spectroscopy and Multivariate Data Analysis

Gjenkjennings- og kvantifisering av Plasmodium falciparum i vandig røde blodceller av dempes totale refleksjon infrarødspektroskopi og multivariabel analyse

Her presenterer vi en protokoll av kvantifisering av Plasmodium falciparum i infiserte vandig røde blodlegemer bruke dempes totale refleksjon infrarød spectrometer og multivariat dataanalyse.

We demonstrate a method of quantification and detection of parasites in aqueous red blood cells (RBCs) by using a simple benchtop Attenuated Total ...

Det overordnede målet med denne prosedyren er å bygge en regresjonsmodell for prediksjon av malariaparasittmi ved hjelp av ATR-FTIR spektroskopi med multivariatdataanalyse. Denne metoden kan bidra til å fremskynde point-of-care diagnostikk som kan bidra til å forbedre pasientutfall i fremtiden. Den største fordelen med denne teknikken er at mens modellen kan ta litt tid å bygge, er den svært bærbar, brukervennlig, svært følsom og rimelig.Selv om denne metoden muliggjør kvantifisering av malariaparasitter, kan den også brukes til å observere fenotypisk respons på miljøendringer som endringer i parasittsammensetning på grunn av antimikrobielle midler. Ideen utviklet seg fra arbeid vi gjorde på den australske Synchrotron på malaria-infiserte celler. Dette var på encellenivå.Derfra bestemte vi oss for å bruke ATR-FTIR spektroskopi for å faktisk utvikle diagnostisk test. Før synkroniseringsprosedyren startet, kultur 30 milliliter 3D7 stamme Plasmodium falciparum parasitter som beskrevet i tekstprotokollen. Bruk en automatisert pipette til å bruke kulturen på nytt og overføre den til et konisk rør på 50 milliliter.Sentrifuger kulturen på 300 til 400 ganger g under standard laboratorieforhold i fem minutter. Fjern det overnaturlige ved å tegne den opp med en automatisert pipette uten å forstyrre pelleten. Kast avfallsmediet i en 10% blekemiddelløsning.Tilsett sakte 12 til 15 milliliter av en 4% sorbitolløsning til pelleten og bland kulturen ved å kappe og invertere røret til kulturen er homogen. Inkuber kulturen ved 37 grader Celsius i 15 minutter. Etter 15 minutter sentrifugerer kulturen i fem minutter.Bruk en automatisert pipette til å fjerne supernatanten uten å forstyrre pelleten. Tilsett 10 til 15 milliliter 0,9% saltvann til pelleten og bland løsningen ved å kappe og invertere røret til kulturen er homogen. Gjenta sentrifugering og saltvannsløsning vask to ganger til for å fjerne alle rester av sorbitol.For å starte denne prosedyren, sentrifugere lager røde blodlegemer, eller RBCs. Fjern supernatant og vask med 0,9% saltvann totalt tre ganger. Sentrifuge lager RBC og kulturen på 300 til 400 ganger g i fem minutter og kast supernatant fra hvert rør.Merk åtte mikrocentrifugerør som angitt. Bruk deretter en 0,2 til 20 mikroliter pipette for å legge til riktig mengde kultur til hvert rør. Deretter legger du til riktig mengde lager RBC-er til hvert rør for å oppnå ønsket parasitemia fortynning.Sentrifuger det friske donorblodet som samles inn i antikoagulerende rør ved 1, 200 ganger g og standard laboratorieforhold i 10 minutter. Fjern plasmaet ved å tegne det opp med en pipette og kast det til en 10% blekemiddelløsning. Tilsett 900 mikroliter isolerte donor-RBC-er i hvert mikrocentrifugerør og bland godt ved å invertere 10 ganger.En enkel benkeplate Attenuated Total Reflection Fourier Transform Infrared, eller ATR-FTIR spektrometer vil bli brukt til å skaffe spekteret. Forbered og rengjør krystallen ved hjelp av lofrie kluter fuktet med ultra-rent vann for å forsiktig skrubbe krystallen i en sirkulær bevegelse. Deretter bruker du en annen lofri klut for å tørke krystallen grundig.Ta en bakgrunnsmåling av luften ved å klikke på Bakgrunnsmåling. Hvert 20. minutt rengjør du krystallen og gjentar denne målingen. Åpne den direktesendte visningen ved å klikke Forhåndsvisning.Vær oppmerksom på en flat, horisontal grunnlinje som indikerer at krystallen er ren. Pipette 10 mikroliter av deionisert vann rett på midten av krystallen og klikk På målprøven. Tørk krystallen med en lofri tørk og en mild sirkulær bevegelse.Pipette 10 mikroliter prøve på midten av krystallen og klikk På målprøven. Rengjør krystallen mellom prøvene. I denne demonstrasjonen vil multivariatdataanalyse bli utført ved hjelp av MATLAB.For å starte databehandling, inndataanalyse i kommandovinduet for å åpne det grafiske brukergrensesnittet. Høyreklikk X-boksen for å finne Importer data. Velg filtypen for analyse.Importer prøve-, vann- og basisspektra som datasett til arbeidsplassen ved å velge alle spektra i hvert sett separat, klikke Åpne og gi hvert sett et kort navn. Klikk Ny variabel i kommandovinduet og gi vektoren navnet Parasitemia. Skriv inn Parasitemia av hver prøve.Høyreklikk X-boksen for å finne Plottdata. Klikk På Tegnedata-ikonet for å tegne inn dataene. Inspiser spektra for vanndampeffekter ved å klikke Zoom og zoome inn på 1, 800 til 1, 400 per centimeter, mest tydelig observert som korte, skarpe, smale topper langs bakkene til Amide I og Amide II-båndene.I tilfeller av ekstrem vanndamp åpner du kategorien Rediger forhåndsprosessdata og velger Utjevning. Reduser støy og/eller sterke vanndampbidrag ved å glatte ut prøven og vannflekken. Etter videre databehandling som beskrevet i tekstprotokollen, åpner du kategorien Rediger data, og i kolonnevariabler velger du 2980 til 2800 per centimeter og 1750 til 850 per centimeter ved å sørge for at bare boksene deres er krysset av.Dataene er nå klare for analyse. Hvis du vil utføre hovedkomponentanalyse eller PCA, klikker du Analysefornedbrytning og velger PCA. Klikk på Bygg modell.Vær oppmerksom på 95%konfidensgrensen, den stiplede ringen, på poengplottet mellom PC 1 og PC 2. Bruk Select Spectra-verktøyet til å merke eksempelspektraet med poengsummer som skjer utenfor grensen som potensielle avvik. Hvis du vil utføre delvis regresjon av minst kvadrater eller PLSR, klikker du Analyseregresjon og velger PLSR.Høyreklikk Y-blokken og velg vektoren Parasitemia bygge modell. Analyser regresjonsmodellen og regresjonsvektoren og identifiser de biologiske båndene. En delvis minst kvadrater regresjon plot av RBCs spiked mellom null til en prosent Parasitemia generert en R-kvadrert verdi på 0,87 og en rot gjennomsnittlig kvadrert kryssvalidering feil på 0,13% Parasitemia.Dette demonstrerer modellens evne til å forutsi Parasitemia i hver prøve med den kjente Parasitemia på x-aksen og den forventede Parasitemia på y-aksen. Den tilknyttede regresjonskoeffisienten beskriver bidraget fra hvert bånd til modellens prediktive evne. Jo mer intens bandet er, jo mer bidrar det til modellen, og dermed endrer parasitten blodets kjemiske sammensetning.Resultatene viser at signalet fra parasitter er forskjellige nok fra RBCene at de kan brukes til å danne en lineær regresjonsmodell for prediksjon av parasitter i fremtidige datasett. Når mestret, denne teknikken kan ta mindre enn tre minutter per prøve hvis utført riktig. Mens du prøver denne prosedyren, er det viktig å huske å rengjøre ATR krystaller av alle rester.Etter denne prosedyren kan andre malariaarter som P vivax og P malariae modelleres for å svare på slike spørsmål som, Er ATR-FTIR spektroskopi følsom nok til å skille mellom arter? Etter utviklingen banet denne teknikken vei for forskere innen biospektroskopi for å utforske deteksjon og kvantifiseringer av andre blodbårne patogener og til og med analysere i blodet som glukose og urea. Etter å ha sett denne videoen, bør du ha en god forståelse av ATR-FTIR spektroskopi og NVDA analyse for å bygge en regresjonsmodell.Ikke glem at det å arbeide med pasientblod- og malariaprøver kan være farlig, og passende biosikkerhetsnivåtrening og inneslutning bør alltid gjøres når du prøver denne prosedyren.

Research

JoVE Journal

Chemistry

Detection and Quantification of Plasmodium falciparum in Aqueous Red Blood Cells by Attenuated Total Reflection Infrared Spectroscopy and Multivariate Data Analysis

In Situ SIMS and IR Spectroscopy of Well-defined Surfaces Prepared by Soft Landing of Mass-selected Ions

In Situ SIMS and IR Spectroscopy of Well-defined Surfaces Prepared by Soft Landing of Mass-selected Ions

In situ SIMS og IR spektroskopi av godt definerte overflater som er Soft Landing av Mass-utvalgte ioner

Soft landing of mass-selected ions onto surfaces is a powerful approach for the highly-controlled preparation of materials that are inaccessible using ...

Radiolabeling and Quantification of Cellular Levels of Phosphoinositides by High Performance Liquid Chromatography-coupled Flow Scintillation

Radiomerking og Kvantifisering av Cellular Nivåer av Phosphoinositides ved HPLC-coupled Flow Scintillation

Phosphoinositides (PtdInsPs) are essential signaling lipids responsible for recruiting specific effectors and conferring organelles with molecular ...

Construction of Models for Nondestructive Prediction of Ingredient Contents in Blueberries by Near-infrared Spectroscopy Based on HPLC Measurements

Bygging av Modeller for destruktiv Prediksjon av bestanddeler Innhold i Blåbær av nær-infrarød spektroskopi Basert på HPLC Målinger

Nondestructive prediction of ingredient contents of farm products is useful to ship and sell the products with guaranteed qualities. Here, near-infrared ...

In Situ Detection and Single Cell Quantification of Metal Oxide Nanoparticles Using Nuclear Microprobe Analysis

In Situ Detection and Single Cell Quantification of Metal Oxide Nanoparticles Using Nuclear Microprobe Analysis

In Situ Gjenkjennings- og enkeltcelle kvantifisering av metalloksid nanopartikler kjernefysiske Microprobe analyse

Micro-analytical techniques based on chemical element imaging enable the localization and quantification of chemical composition at the cellular level. ...

Electrochemical Impedance Spectroscopy as a Tool for Electrochemical Rate Constant Estimation

Elektrokjemiske impedans spektroskopi som et verktøy for elektrokjemiske Rate konstant estimering

Electrochemical impedance spectroscopy (EIS) was used for advanced characterization of organic electroactive compounds along with cyclic voltammetry (CV). ...

DNA-magnetic Particle Binding Analysis by Dynamic and Electrophoretic Light Scattering

DNA-magnetiske partikler bindende analyse av dynamisk og Electrophoretic lysspredning

Isolation of DNA using magnetic particles is a field of high importance in biotechnology and molecular biology research. This protocol describes the ...

Total Internal Reflection Absorption Spectroscopy (TIRAS) for the Detection of Solvated Electrons at a Plasma-liquid Interface

Total Internal Reflection Absorption Spectroscopy TIRAS for the Detection of Solvated Electrons at a Plasma-liquid Interface

Total intern refleksjon absorpsjon spektroskopi (TIRAS) for påvisning av Solvated tenner elektroner på en Plasma-flytende-grensesnitt

The total internal reflection absorption spectroscopy (TIRAS) method presented in this article uses an inexpensive diode laser to detect solvated ...

Elemental-sensitive Detection of the Chemistry in Batteries through Soft X-ray Absorption Spectroscopy and Resonant Inelastic X-ray Scattering

Elemental-sensitive påvisning av kjemien i batterier gjennom myk X-ray absorpsjon spektroskopi og Resonant uelastisk X-ray spredning

Energy storage has become more and more a limiting factor of today's sustainable energy applications, including electric vehicles and green electric grid ...

Characterizing Lewis Pairs Using Titration Coupled with In Situ Infrared Spectroscopy

Karakterisere Lewis par ved hjelp av titrering kombinert med i Situ infrarød spektroskopi

Lewis acid-activation of carbonyl-containing substrates is a fundamental basis for facilitating transformations in organic chemistry. Historically, ...

Covalent Attachment of Single Molecules for AFM-based Force Spectroscopy

Kovalent vedlegg av enkeltmolekyler for AFM-basert Force Spectroscopy

Atomic force microscopy (AFM)-based single molecule force spectroscopy is an ideal tool for investigating the interactions between a single polymer and ...