Name: simple and rapid method to obtain high-quality tumor dna from clinical-pathological specimens using touch imprint cytology
Uploaded: 2018-03-21T13:00:00
Description: Watch this Scientific Journal Video about Simple and Rapid Method to Obtain High-quality Tumor DNA from Clinical-pathological Specimens Using Touch Imprint Cytology at JoVE.com

参加に同意すること、病院と患者のすべての医療および補助的なスタッフに感謝しますガブリエル白狼、エダンズ ・ グループ (www.edanzediting.com/ac) このレポートの下書きを編集してから、博士に感謝いたします。本研究は、ゲノム研究プロジェクト (容湖とミズーリ州) は、山梨県からの助成金から、安田医療財団 (容湖) 補助金によって支えられました。

1. TIC に備えて通常のガラスを使用して迅速に微視的評価スライドします。
<ol><li>臨床病理組織材料が利用可能は、TIC 準備をできるだけ早くを実行します。TIC 標本を準備すぐにことはできません、滅菌ガーゼに湿らせた生理食塩水で覆われている組織材料を維持し、組織の乾燥を防ぐために冷蔵庫に保管します。</li>
	<li>手術や内視鏡検査によって得られる臨床的に腫瘍 (例えば肝臓?...

<ol>
	<li>Vogelstein, B., Kinzler, K. W. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/query.fcgi?db=PubMed&cmd=Search&doptcmdl=Citation&defaultField=Title+Word&term=The+Path+to+Cancer+-+Three+Strikes+and+You're+Out.">The Path to Cancer - Three Strikes and You're Out.</a> N Engl J Med. 373 (20), 1895-1898 (2015).</li><li>Weinstein, J. N., et al. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/query.fcgi?db=PubMed&cmd=Search&doptcmdl=Citation&defaultField=Title+Word&term=The+cancer+genome+atlas+pan-cancer+analysis+project.">The cancer genome atlas pan-cancer analysis project.</a> Nat. Genet. 45 (10), 1113-1120 (2013).</li><li>Nagasaki, M., et al. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/query.fcgi?db=PubMed&cmd=Search&doptcmdl=Citation&defaultField=Title+Word&term=Rare+variant+discovery+by+deep+whole-genome+sequencing+of+1,070+Japanese+individuals.">Rare variant discovery by deep whole-genome sequencing of 1,070 Japanese individuals.</a> Nat Commun. 6 (8018), (2015).</li><li>Vogelstein, B., et al. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/query.fcgi?db=PubMed&cmd=Search&doptcmdl=Citation&defaultField=Title+Word&term=Cancer+genome+landscapes.">Cancer genome landscapes.</a> Science. 339 (6127), 1546-1558 (2013).</li><li>Zehir, A., et al. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/query.fcgi?db=PubMed&cmd=Search&doptcmdl=Citation&defaultField=Title+Word&term=Mutational+landscape+of+metastatic+cancer+revealed+from+prospective+clinical+sequencing+of+10,000+patients.">Mutational landscape of metastatic cancer revealed from prospective clinical sequencing of 10,000 patients.</a> Nat Med. 23 (6), 703-713 (2017).</li><li>Garraway, L. A., Lander, E. S. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/query.fcgi?db=PubMed&cmd=Search&doptcmdl=Citation&defaultField=Title+Word&term=Lessons+from+the+cancer+genome.">Lessons from the cancer genome.</a> Cell. 53 (1), 17-37 (2013).</li><li>Chalkley, R., Hunter, C. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/query.fcgi?db=PubMed&cmd=Search&doptcmdl=Citation&defaultField=Title+Word&term=Histone-histone+propinquity+by+aldehyde+fixation+of+chromatin.">Histone-histone propinquity by aldehyde fixation of chromatin.</a> Proc Natl Acad Sci U S A. 72 (4), 1304-1308 (1975).</li><li>Ben-Ezra, J., Johnson, D. A., Rossi, J., Cook, N., Wu, A. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/query.fcgi?db=PubMed&cmd=Search&doptcmdl=Citation&defaultField=Title+Word&term=Effect+of+fixation+on+the+amplification+of+nucleic+acids+from+paraffin-embedded+material+by+the+polymerase+chain+reaction.">Effect of fixation on the amplification of nucleic acids from paraffin-embedded material by the polymerase chain reaction.</a> J Histochem Cytochem. 39 (3), 351-354 (1991).</li><li>Srinivasan, M., Sedmak, D., Jewell, S. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/query.fcgi?db=PubMed&cmd=Search&doptcmdl=Citation&defaultField=Title+Word&term=Effect+of+fixatives+and+tissue+processing+on+the+content+and+integrity+of+nucleic+acids.">Effect of fixatives and tissue processing on the content and integrity of nucleic acids.</a> Am.J.Pathol. 161 (6), 1961-1971 (2002).</li><li>Adhya, A. K., Mohanty, R. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/query.fcgi?db=PubMed&cmd=Search&doptcmdl=Citation&defaultField=Title+Word&term=Utility+of+touch+imprint+cytology+in+the+preoperative+diagnosis+of+malignancy+in+low+resource+setting.">Utility of touch imprint cytology in the preoperative diagnosis of malignancy in low resource setting.</a> Diagn Cytopathol. 45 (6), 507-512 (2017).</li><li>Lumachi, F., Marino, F., Zanella, S., Chiara, G. B., Basso, S. M. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/query.fcgi?db=PubMed&cmd=Search&doptcmdl=Citation&defaultField=Title+Word&term=Touch+Imprint+Cytology+and+Frozen-section+Analysis+for+Intraoperative+Evaluation+of+Sentinel+Nodes+in+Early+Breast+Cancer.">Touch Imprint Cytology and Frozen-section Analysis for Intraoperative Evaluation of Sentinel Nodes in Early Breast Cancer.</a> Anticancer Research. 32 (8), 3523-3526 (2012).</li><li>Sumiyoshi, K., et al. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/query.fcgi?db=PubMed&cmd=Search&doptcmdl=Citation&defaultField=Title+Word&term=Usefulness+of+intraoperative+touch+smear+cytology+in+breast-conserving+surgery.">Usefulness of intraoperative touch smear cytology in breast-conserving surgery.</a> Exp Ther Med. 1 (4), 641-645 (2012).</li><li>Amemiya, K., et al. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/query.fcgi?db=PubMed&cmd=Search&doptcmdl=Citation&defaultField=Title+Word&term=Touch+imprint+cytology+with+massively+parallel+sequencing+(TIC-seq):+a+simple+and+rapid+method+to+snapshot+genetic+alterations+in+tumors.">Touch imprint cytology with massively parallel sequencing (TIC-seq): a simple and rapid method to snapshot genetic alterations in tumors.</a> Cancer Med. 5 (12), 3426-3436 (2016).</li><li>Goto, T., et al. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/query.fcgi?db=PubMed&cmd=Search&doptcmdl=Citation&defaultField=Title+Word&term=Mutational+analysis+of+multiple+lung+cancers:+Discrimination+between+primary+and+metastatic+lung+cancers+by+genomic+profile.">Mutational analysis of multiple lung cancers: Discrimination between primary and metastatic lung cancers by genomic profile.</a> Oncotarget. 8 (19), 31133-31143 (2017).</li><li>Goto, T., et al. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/query.fcgi?db=PubMed&cmd=Search&doptcmdl=Citation&defaultField=Title+Word&term=Detection+of+tumor-derived+DNA+dispersed+in+the+airway+improves+the+diagnostic+accuracy+of+bronchoscopy+for+lung+cancer.">Detection of tumor-derived DNA dispersed in the airway improves the diagnostic accuracy of bronchoscopy for lung cancer.</a> Oncotarget. 8 (45), 79404-79413 (2017).</li><li>Hirotsu, Y., et al. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/query.fcgi?db=PubMed&cmd=Search&doptcmdl=Citation&defaultField=Title+Word&term=Targeted+and+exome+sequencing+identified+somatic+mutations+in+hepatocellular+carcinoma.">Targeted and exome sequencing identified somatic mutations in hepatocellular carcinoma.</a> Hepatol Res. 46 (11), 1145-1151 (2016).</li><li>Hirotsu, Y., et al. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/query.fcgi?db=PubMed&cmd=Search&doptcmdl=Citation&defaultField=Title+Word&term=Comparison+between+two+amplicon-based+sequencing+panels+of+different+scales+in+the+detection+of+somatic+mutations+associated+with+gastric+cancer.">Comparison between two amplicon-based sequencing panels of different scales in the detection of somatic mutations associated with gastric cancer.</a> BMC Genomics. 17 (1), 833 (2016).</li><li>Hirotsu, Y., et al. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/query.fcgi?db=PubMed&cmd=Search&doptcmdl=Citation&defaultField=Title+Word&term=Intrinsic+HER2+V777L+mutation+mediates+resistance+to+trastuzumab+in+a+breast+cancer+patient.">Intrinsic HER2 V777L mutation mediates resistance to trastuzumab in a breast cancer patient.</a> Med Oncol. 34 (1), 3 (2017).</li><li>Hirotsu, Y., et al. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/query.fcgi?db=PubMed&cmd=Search&doptcmdl=Citation&defaultField=Title+Word&term=Detection+of+BRCA1+and+BRCA2+germline+mutations+in+Japanese+population+using+next-generation+sequencing.">Detection of BRCA1 and BRCA2 germline mutations in Japanese population using next-generation sequencing.</a> Mol Genet Genomic Med. 3 (2), 121-129 (2015).</li><li>Hirotsu, Y., et al. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/query.fcgi?db=PubMed&cmd=Search&doptcmdl=Citation&defaultField=Title+Word&term=Multigene+panel+analysis+identified+germline+mutations+of+DNA+repair+genes+in+breast+and+ovarian+cancer.">Multigene panel analysis identified germline mutations of DNA repair genes in breast and ovarian cancer.</a> Mol Genet Genomic Med. 3 (5), 459-466 (2015).</li><li>Li&#232;vre, A., et al. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/query.fcgi?db=PubMed&cmd=Search&doptcmdl=Citation&defaultField=Title+Word&term=KRAS+mutation+status+is+predictive+of+response+to+cetuximab+therapy+in+colorectal+cancer.">KRAS mutation status is predictive of response to cetuximab therapy in colorectal cancer.</a> Cancer Res. 66 (8), 3992-3995 (2006).</li><li>Mok, T. S., et al. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/query.fcgi?db=PubMed&cmd=Search&doptcmdl=Citation&defaultField=Title+Word&term=Osimertinib+or+Platinum-Pemetrexed+in+EGFR+T790M-Positive+Lung+Cancer.">Osimertinib or Platinum-Pemetrexed in EGFR T790M-Positive Lung Cancer.</a> N Engl J Med. 376 (7), 629-640 (2017).</li><li>Wong, S. Q., et al. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/query.fcgi?db=PubMed&cmd=Search&doptcmdl=Citation&defaultField=Title+Word&term=Targeted-capture+massively-parallel+sequencing+enables+robust+detection+of+clinically+informative+mutations+from+formalin-fixed+tumours.">Targeted-capture massively-parallel sequencing enables robust detection of clinically informative mutations from formalin-fixed tumours.</a> Sci rep. 13 (3), 3493 (2013).</li><li>Wong, S. Q., et al. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/query.fcgi?db=PubMed&cmd=Search&doptcmdl=Citation&defaultField=Title+Word&term=Sequence+artefacts+in+a+prospective+series+of+formalin-fixed+tumours+tested+for+mutations+in+hotspot+regions+by+massively+parallel+sequencing.">Sequence artefacts in a prospective series of formalin-fixed tumours tested for mutations in hotspot regions by massively parallel sequencing.</a> BMC Med Genomics. 13 (7), 23 (2014).</li></ol>

本研究ではチックを使用して臨床病理標本から腫瘍 DNA を取得するための代替方法を提案します。TIC 準備非常にシンプルかつ FFPE のメソッドは、特別な楽器10の要件なしと比較してより少ない時間を必要があります。(図 1) 2 日以内は、DNA の抽出に TIC 準備からすべての手順を完了できます。このメソッド従って遺伝学的検査を行うため所要時間が短く?...

次世代シーケンシング技術提供している研究者の遺伝の変化、メンデルの病気、遺伝的素因、がん1,2,3 のゲノム情報を解析の飛躍的な発展.がんゲノム アトラス (TCGA) と国際がんゲノム コンソーシアム (ICGC) は、一般的な癌4のいくつかの種類の遺伝子変異の同定を追求してきた。何百もの重要なドライバー遺伝子は正常に識別されているといくつかこれらの分子の薬物開発1,5,6のターゲットにされています。
臨床場面における FFPE 標本は病理診断とがんを含むさまざまな病気の分子テストのため通常使用されます。ただし、ホルマリンで固定過程では、DNA 蛋白質または DNA のクロスリンクが発生した、DNA 断片化を誘導しました。したがって、FFPE DNA サンプルは常に遺伝学的解析に適した DNA7,8,9の低質と量のため。また、FFPE 標本を準備するまでに数日かかるし、技術的なスキルのセクションを正確に準備する必要があります。したがって、高品質そのままな DNA を求める簡便かつ迅速な手法を開発することをお勧めします。
細胞診、病理組織学的診断のための代替方法です。細胞サンプル準備は簡単、以下の FFPE 準備10と比較して高価で、かつ高速なアプローチです。TIC 手法は、センチネル リンパ節と周辺組織のいくつかの年11,12術中迅速診断乳がん患者に行われています。ただし、チックの標本から高品質の DNA を得ることができるかどうかを検討して、その後の遺伝学的解析のため使用するほとんどの報告がありません。細胞診標本が一般的パパニコロー (Pap) またはギムザ染色、染色し、我々 は以前報告量と TIC 標本 (特にギムザ染色サンプル) から抽出した DNA の品質は FFPE から採取した試料よりも優れて組織13。Pap 染色に比べると、少ない汚損プロシージャを必要とする利点を有するギムザ染色.Pap 染色の後、サンプルを固定されているし、ステンド グラス、彼らマウントしますする必要がある媒体 (例えばMalinol)、腫瘍細胞、正常細胞、炎症細胞を顕微鏡など、サンプルの内容を区別するためのマウント。Pap の標本は、取付手順なし準備だない試料を乾燥するために顕微鏡下で細胞を観察することはほとんど不可能。比較では、乾燥した状態で観察することができますギムザ染色、したがって、取り付け手順は迅速に携帯電話評価する必要ありません。レーザーマイクロダイ セクション、ギムザ染色より適切な乾燥標本が必要なため。
本報告では TIC ギムザ染色標本を準備するための簡易迅速法を導入し、チックが dna の FFPE 標本と比較してより良いソースであることを示す.

<table border="0" cellpadding="0" cellspacing="0" width="796">
	<tbody>
		<tr height="41">
			<td height="41" style="height:41px;width:283px;">FINE FROST white20 micro slide glass</td>
			<td style="width:191px;">Matsunami Glass ind, Ltd</td>
			<td style="width:143px;">SFF-011</td>
			<td style="width:180px;"></td>
		</tr>
		<tr height="41">
			<td height="41" style="height:41px;">Arcturus PEN Membrane Glass Slides&#160;</td>
			<td>Thermo Fisher Scientific</td>
			<td>LCM0522</td>
			<td></td>
		</tr>
		<tr height="41">
			<td height="41" style="height:41px;">Cyto Quick A solution</td>
			<td>Muto Pure Chemicals</td>
			<td>20571</td>
			<td></td>
		</tr>
		<tr height="41">
			<td height="41" style="height:41px;">Cyto Quick B solution</td>
			<td>Muto Pure Chemicals</td>
			<td>20581</td>
			<td></td>
		</tr>
		<tr height="41">
			<td height="41" style="height:41px;">May-Grunwald Solution</td>
			<td>Muto Pure Chemicals</td>
			<td>15053</td>
			<td></td>
		</tr>
		<tr height="41">
			<td height="41" style="height:41px;">Giemsa solution</td>
			<td>Muto Pure Chemicals</td>
			<td>15002</td>
			<td></td>
		</tr>
		<tr height="41">
			<td height="41" style="height:41px;">QIAamp DNA FFPE tissue kit</td>
			<td>Qiagen</td>
			<td>56404</td>
			<td></td>
		</tr>
		<tr height="41">
			<td height="41" style="height:41px;">TaqMan Fast Advanced Master Mix</td>
			<td>Thermo Fisher Scientific</td>
			<td>4444557</td>
			<td></td>
		</tr>
		<tr height="41">
			<td height="41" style="height:41px;">TaqMan RNase P Detection Reagents Kit&#160;</td>
			<td>Thermo Fisher Scientific</td>
			<td>4316831</td>
			<td></td>
		</tr>
		<tr height="41">
			<td height="41" style="height:41px;">TaqMan Assay from FFPE DNA QC Assay v2</td>
			<td>Thermo Fisher Scientific</td>
			<td>4324034</td>
			<td></td>
		</tr>
		<tr height="41">
			<td height="41" style="height:41px;">MicroAmp Fast Optical 96-Well Reaction Plate&#160;</td>
			<td>Thermo Fisher Scientific</td>
			<td>4346907</td>
			<td></td>
		</tr>
		<tr height="41">
			<td height="41" style="height:41px;width:283px;">MicroAmp optical Adhesive Film</td>
			<td style="width:191px;">Thermo Fisher Scientific</td>
			<td style="width:143px;">4311971</td>
			<td style="width:180px;"></td>
		</tr>
		<tr height="41">
			<td height="41" style="height:41px;width:283px;">MicroMixer E36</td>
			<td style="width:191px;">TITEC</td>
			<td style="width:143px;">0027765-000</td>
			<td style="width:180px;"></td>
		</tr>
		<tr height="41">
			<td height="41" style="height:41px;width:283px;">ViiA 7 Real-Time PCR System</td>
			<td style="width:191px;">Thermo Fisher Scientific</td>
			<td style="width:143px;">VIIA7-03</td>
			<td style="width:180px;"></td>
		</tr>
		<tr height="41">
			<td height="41" style="height:41px;width:283px;">Himac CF16RXII</td>
			<td style="width:191px;">Hitachi-koki</td>
			<td style="width:143px;">CF16RII</td>
			<td style="width:180px;"></td>
		</tr>
		<tr height="41">
			<td height="41" style="height:41px;width:283px;">Ion Library TaqMan Quantitation Kit</td>
			<td style="width:191px;">Thermo Fisher Scientific</td>
			<td style="width:143px;">4468802</td>
			<td style="width:180px;"></td>
		</tr>
		<tr height="41">
			<td height="41" style="height:41px;width:283px;">Ion AmpliSeq Cancer Hotspot Panel v2</td>
			<td style="width:191px;">Thermo Fisher Scientific</td>
			<td style="width:143px;">4475346</td>
			<td style="width:180px;"></td>
		</tr>
		<tr height="41">
			<td height="41" style="height:41px;width:283px;">Ion AmpliSeq Library Kit 2.0</td>
			<td style="width:191px;">Thermo Fisher Scientific</td>
			<td style="width:143px;">4480442</td>
			<td style="width:180px;"></td>
		</tr>
		<tr height="41">
			<td height="41" style="height:41px;width:283px;">Ion Xpress Barcode Adapters 1-16 Kit</td>
			<td style="width:191px;">Thermo Fisher Scientific</td>
			<td>4471250</td>
			<td style="width:180px;"></td>
		</tr>
		<tr height="41">
			<td height="41" style="height:41px;width:283px;">Ion PGM Hi-Q View Sequencing Kit (200 base)</td>
			<td style="width:191px;">Thermo Fisher Scientific</td>
			<td style="width:143px;">A30044</td>
			<td style="width:180px;"></td>
		</tr>
		<tr height="41">
			<td height="41" style="height:41px;width:283px;">Ion Chef System</td>
			<td style="width:191px;">Thermo Fisher Scientific</td>
			<td>4484177</td>
			<td style="width:180px;"></td>
		</tr>
		<tr height="41">
			<td height="41" style="height:41px;width:283px;">Veriti 96-well Thermal Cycler</td>
			<td style="width:191px;">Thermo Fisher Scientific</td>
			<td>Veriti200</td>
			<td style="width:180px;"></td>
		</tr>
		<tr height="41">
			<td height="41" style="height:41px;width:283px;">Ion 318 Chip Kit v2 BC</td>
			<td style="width:191px;">Thermo Fisher Scientific</td>
			<td>4488150</td>
			<td style="width:180px;"></td>
		</tr>
		<tr height="41">
			<td height="41" style="height:41px;width:283px;">Ion PGM System</td>
			<td style="width:191px;">Thermo Fisher Scientific</td>
			<td>PGM11-001</td>
			<td style="width:180px;"></td>
		</tr>
		<tr height="41">
			<td height="41" style="height:41px;width:283px;">Ion PGM Wash 2 Bottle kit</td>
			<td style="width:191px;">Thermo Fisher Scientific</td>
			<td>A25591</td>
			<td style="width:180px;"></td>
		</tr>
		<tr height="41">
			<td height="41" style="height:41px;width:283px;">Agencourt&#8482; AMPure&#8482; XP Kit</td>
			<td style="width:191px;">Beckman Coulter</td>
			<td style="width:143px;">A63881</td>
			<td style="width:180px;"></td>
		</tr>
		<tr height="41">
			<td height="41" style="height:41px;width:283px;">16-position Magnetic Stand</td>
			<td style="width:191px;">Thermo Fisher Scientific</td>
			<td style="width:143px;">4457858</td>
			<td style="width:180px;"></td>
		</tr>
		<tr height="41">
			<td height="41" style="height:41px;width:283px;">Nonstick, RNase-free Microfuge Tubes, 1.5 mL (Low binding tube)</td>
			<td style="width:191px;">Thermo Fisher Scientific</td>
			<td style="width:143px;">AM12450</td>
			<td style="width:180px;"></td>
		</tr>
		<tr height="41">
			<td height="41" style="height:41px;width:283px;">Nuclease-free water</td>
			<td style="width:191px;">Thermo Fisher Scientific</td>
			<td style="width:143px;">AM9938</td>
			<td style="width:180px;"></td>
		</tr>
		<tr height="41">
			<td height="41" style="height:41px;width:283px;">MicroAmp&#8482; Optical 96-well Reaction Plates</td>
			<td style="width:191px;">Thermo Fisher Scientific</td>
			<td style="width:143px;">4306737</td>
			<td style="width:180px;"></td>
		</tr>
		<tr height="41">
			<td height="41" style="height:41px;width:283px;">MicroAmp&#8482; Clear Adhesive Film</td>
			<td style="width:191px;">Thermo Fisher Scientific</td>
			<td style="width:143px;">4306311</td>
			<td style="width:180px;"></td>
		</tr>
		<tr height="41">
			<td height="41" style="height:41px;width:283px;">Agencourt&#8482; AMPure&#8482; XP Kit</td>
			<td style="width:191px;">Beckman Coulter</td>
			<td style="width:143px;">A63881</td>
			<td style="width:180px;"></td>
		</tr>
		<tr height="41">
			<td height="41" style="height:41px;width:283px;">Ethanol(99.5)</td>
			<td style="width:191px;">Nacalai Tesque</td>
			<td style="width:143px;">08948-25</td>
			<td style="width:180px;"></td>
		</tr>
		<tr height="41">
			<td height="41" style="height:41px;width:283px;">Sodium hydroxide (10M)</td>
			<td style="width:191px;">Sigma</td>
			<td style="width:143px;">72068</td>
			<td style="width:180px;"></td>
		</tr>
		<tr height="41">
			<td height="41" style="height:41px;width:283px;">DTU-Neo</td>
			<td style="width:191px;">TAITEC</td>
			<td style="width:143px;">0063286-000</td>
			<td></td>
		</tr>
		<tr height="41">
			<td height="41" style="height:41px;width:283px;">E-36&#160;</td>
			<td style="width:191px;">TAITEC</td>
			<td>0027765-000</td>
			<td style="width:180px;"></td>
		</tr>
		<tr height="41">
			<td height="41" style="height:41px;width:283px;">ECLIPSE Ci-L</td>
			<td style="width:191px;">Nikon</td>
			<td style="width:143px;">704354</td>
			<td style="width:180px;"></td>
		</tr>
		<tr height="41">
			<td height="41" style="height:41px;">Pipet-Lite LTS Pipette L-2XLS+</td>
			<td>METTLER TOLEDO</td>
			<td>17014393</td>
			<td style="width:180px;"></td>
		</tr>
		<tr height="41">
			<td height="41" style="height:41px;">Pipet-Lite LTS Pipette L-10XLS+</td>
			<td>METTLER TOLEDO</td>
			<td>17014388</td>
			<td style="width:180px;"></td>
		</tr>
		<tr height="41">
			<td height="41" style="height:41px;">Pipet-Lite LTS Pipette L-20XLS+</td>
			<td>METTLER TOLEDO</td>
			<td>17014392</td>
			<td style="width:180px;"></td>
		</tr>
		<tr height="41">
			<td height="41" style="height:41px;">Pipet-Lite LTS Pipette L-100XLS+</td>
			<td>METTLER TOLEDO</td>
			<td>17014384</td>
			<td style="width:180px;"></td>
		</tr>
		<tr height="41">
			<td height="41" style="height:41px;">Pipet-Lite LTS Pipette L-200XLS+</td>
			<td>METTLER TOLEDO</td>
			<td>17014391</td>
			<td style="width:180px;"></td>
		</tr>
		<tr height="41">
			<td height="41" style="height:41px;">Pipet-Lite LTS Pipette L-1000XLS+</td>
			<td>METTLER TOLEDO</td>
			<td>17014382</td>
			<td style="width:180px;"></td>
		</tr>
		<tr height="41">
			<td height="41" style="height:41px;">petit-change</td>
			<td>WAKEN</td>
			<td>MODEL8864</td>
			<td style="width:180px;">Mini centrifuge</td>
		</tr>
		<tr height="41">
			<td height="41" style="height:41px;">petit-incubator</td>
			<td>WAKEN</td>
			<td>WKN-2290</td>
			<td style="width:180px;">Air incubator</td>
		</tr>
		<tr height="41">
			<td height="41" style="height:41px;width:283px;">SensiCare Powder-free Nitrile Exam Gloves</td>
			<td style="width:191px;">MEDLINE</td>
			<td>SEM486802</td>
			<td style="width:180px;"></td>
		</tr>
		<tr height="41">
			<td height="41" style="height:41px;width:283px;">Sterile gauze</td>
			<td style="width:191px;">Osaki</td>
			<td style="width:143px;">11138</td>
			<td style="width:180px;"></td>
		</tr>
		<tr height="41">
			<td height="41" style="height:41px;width:283px;">Refrigerator MediCool</td>
			<td style="width:191px;">SANYO</td>
			<td style="width:143px;">MPR-312DCN-PJ</td>
			<td style="width:180px;"></td>
		</tr>
		<tr height="41">
			<td height="41" style="height:41px;width:283px;">FEATHER TRIMMING BLAD</td>
			<td style="width:191px;">FEATHER</td>
			<td style="width:143px;">No.130</td>
			<td style="width:180px;"></td>
		</tr>
		<tr height="41">
			<td height="41" style="height:41px;width:283px;">FEATHER TRIMMING BLAD</td>
			<td style="width:191px;">FEATHER</td>
			<td style="width:143px;">No.260</td>
			<td style="width:180px;"></td>
		</tr>
		<tr height="41">
			<td height="41" style="height:41px;width:283px;">FEATHER&#160; S</td>
			<td style="width:191px;">FEATHER</td>
			<td style="width:143px;">FA-10</td>
			<td style="width:180px;"></td>
		</tr>
		<tr height="41">
			<td height="41" style="height:41px;width:283px;">Vortex Genius 3</td>
			<td style="width:191px;">IKA</td>
			<td>41-0458&#160;</td>
			<td style="width:180px;">Vortex mixer</td>
		</tr>
		<tr height="41">
			<td height="41" style="height:41px;width:283px;">Pincette</td>
			<td style="width:191px;">NATSUME</td>
			<td style="width:143px;">A-5</td>
			<td style="width:180px;"></td>
		</tr>
		<tr height="41">
			<td height="41" style="height:41px;width:283px;">1.5 mL microtube</td>
			<td style="width:191px;">BIOBIK</td>
			<td style="width:143px;">RC-0150</td>
			<td style="width:180px;"></td>
		</tr>
	</tbody>
</table>

simple and rapid method to obtain high-quality tumor dna from clinical-pathological specimens using touch imprint cytology

管理およびがん患者のための特定の分子標的薬の治療前にがんの突然変異の状態を確認する重要です。臨床設定では、ホルマリン固定パラフィン包埋 (FFPE) 組織は、遺伝学的検査のため活躍しています。ただし、FFPE の DNA は、ホルマリン固定過程における断片化や破損は、一般的に。したがって、FFPE DNA は時々 低品質と量の DNA のための遺伝学的検査の適切ではないです。顕微鏡下で観察することができますタッチ捺印細胞診がん細胞からゲノム DNA を取得する (TIC) の方法をご紹介します。細胞形態と癌細胞数は、チックの標本を使用して評価できます。さらに、2 日以内 TIC サンプルからゲノム DNA の抽出を完了ことができます。合計金額、このメソッドを使用して得られた TIC DNA の品質 FFPE DNA のそれよりも高かった。この迅速かつ簡単な方法では、研究者 (例えば、次世代シーケンス解析、デジタル PCR および量的なリアルタイム PCR) 遺伝学的検査の高品質 DNA を取得し、結果をレポートのターンアラウンド時間を短縮することができます。

図 1は、DNA の抽出に TIC 標本作製から全体のプロセスを示しています。特に、TIC サンプルからゲノム DNA を取得するのみ 2 日間を要します。スライド処理の前に腫瘍ストレージの効果を評価しました。組織検体はすぐにスライドに触れられたとき、および組織は、生理食塩水湿らせた滅菌・ ガーゼ 1 h (図 2) のために保たれ...

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Simple and Rapid Method to Obtain High-quality Tumor DNA from Clinical-pathological Specimens Using Touch Imprint Cytology

腫瘍組織から高品質 DNA を取得は、次世代シーケンシングによる遺伝子の変異を分析するための重要な第一歩です。この記事では腫瘍細胞を豊かにし、押印細胞診標本のタッチから無傷の DNA を取得する簡単かつ迅速な方法を提案する.

タッチ捺印細胞診を用いた臨床病理標本から質の高い腫瘍 DNA を取得する簡易法

It is critical to determine the mutational status in cancer before administration and treatment of specific molecular targeted drugs for cancer patients. ...

Research

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Cancer Research

A Mimic of the Tumor Microenvironment: A Simple Method for Generating Enriched Cell Populations and Investigating Intercellular Communication

濃縮細胞集団を生成し、細胞間コミュニケーションを調べるための簡単​​な方法：腫瘍微小環境のミミック

Understanding the early heterotypic interactions between cancer cells and the surrounding non-cancerous stroma is important in elucidating the events ...

Characterization of Tumor Cells Using a Medical Wire for Capturing Circulating Tumor Cells: A 3D Approach Based on Immunofluorescence and DNA FISH

循環腫瘍細胞を取り込むため医療用ワイヤー線を用いた腫瘍細胞の特性解析: 蛍光抗体法や DNA 魚に基づく 3 D アプローチ

Circulating tumor cells (CTCs) are associated with poor survival in metastatic cancer. Their identification, phenotyping, and genotyping could lead to a ...

Using 22C3 Anti-PD-L1 Antibody Concentrate on Biopsy and Cytology Samples from Non-small Cell Lung Cancer Patients

アンチ PD L1 抗体は生検で非小細胞肺癌患者からの細胞のサンプル集中 22 3 を使用して

Pembrolizumab monotherapy has been approved for the first- and second-line treatment of patients with PD-L1-expressing advanced non-small cell lung cancer ...

Digital Polymerase Chain Reaction Assay for the Genetic Variation in a Sporadic Familial Adenomatous Polyposis Patient Using the Chip-in-a-tube Format

チップ チューブ形式を使用して散発的な家族性大腸腺腫症患者の遺伝的変異のデジタル ポリメラーゼ連鎖反応分析

The quantitative analysis of human genetic variation is crucial for understanding the molecular characteristics of serious medical conditions, such as ...

Detection and Monitoring of Tumor Associated Circulating DNA in Patient Biofluids

患者の生体流体における腫瘍関連循環DNAの検出とモニタリング

Complications associated with upfront and repeat surgical tissue sampling present the need for minimally invasive platforms capable of molecular ...

Establishment and Analysis of Three-Dimensional (3D) Organoids Derived from Patient Prostate Cancer Bone Metastasis Specimens and their Xenografts

Establishment and Analysis of Three-Dimensional 3D Organoids Derived from Patient Prostate Cancer Bone Metastasis Specimens and their Xenografts

患者前立腺癌骨転移標本及びその異種移植片に由来する3次元(3D)オルガノイドの確立と解析

Three-dimensional (3D) culture of organoids from tumor specimens of human patients and patient-derived xenograft (PDX) models of prostate cancer, referred ...

Rapid Optical Clearing for Semi-High-Throughput Analysis of Tumor Spheroids

腫瘍スフェロイドの半ハイスループット分析のための迅速な光学的クリアリング

Tumor spheroids are fast becoming commonplace in basic cancer research and drug development. Obtaining data regarding protein expression within the ...

Culture and Imaging of Ex Vivo Organotypic Pseudomyxoma Peritonei Tumor Slices from Resected Human Tumor Specimens

Culture and Imaging of Ex Vivo Organotypic Pseudomyxoma Peritonei Tumor Slices from Resected Human Tumor Specimens

切除されたヒト腫瘍標本からの ex vivo 器官型偽粘液腫腹膜腫瘍スライスの培養とイメージング

Pseudomyxoma peritonei (PMP) is a rare condition that results from the dissemination of a mucinous primary tumor and the resultant accumulation of ...

Quantifying Telomere Length Using Non-Radioactive Chemiluminescence Detection

Optimization of Performance Parameters of the TAGGG Telomere Length Assay

Optimization of Performance Parameters of the TAGGG Telomere Length Assay (Video) | JoVE 

TAGGGテロメア長アッセイの性能パラメータの最適化

Telomeres are repetitive sequences which are present at chromosomal ends; their shortening is a characteristic feature of human somatic cells. Shortening ...

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Pancreatic Cancer-Derived Tumor Organoids and Fibroblasts from Fresh Tissue

Establishment of Pancreatic Cancer-Derived Tumor Organoids and Fibroblasts From Fresh Tissue

Establishment of Pancreatic Cancer-Derived Tumor Organoids and Fibroblasts From Fresh Tissue (Video) | JoVE 

膵臓癌由来腫瘍オルガノイドおよび線維芽細胞の新鮮組織からの樹立

Tumor organoids are three-dimensional (3D) ex vivo tumor models that recapitulate the biological key features of the original primary tumor tissues. ...